Manuál laboratorních vyšetření

Transkript

1 OBSAH 1. KLINICKÁ MIKROBIOLOGIE INFORMACE O VYŠETŘENÍCH SÉROLOGIE INFORMACE O VYŠETŘENÍCH VYŠETŘENÍ ZAJIŠŤOVANÁ V EXTERNÍCH LABORATOŘÍCH KLINICKÁ MIKROBIOLOGIE INFORMACE O VYŠETŘENÍCH Legenda k tabulkám: odběr stručný popis získání vzorku adjustace popis odběrového materiálu (položka uvedená v tabulce kurzívou znamená alternativu optimálnímu postupu) výtěrovka sterilní výtěrovka (výtěrový tampón na plastové tyčince) výtěrovka d sterilní výtěrovka na drátě (výtěrový tampón na drátě) výtěrovka -TP sterilní výtěrovka ve zkumavce s transportní půdou výtěrovka d-tp sterilní výtěrovka na drátě ve zkumavce s transportní půdou tampon FLOQ sterilní nylonový tampon v papírovém obalu (pro vyšetření Chlamydia trachomatis a/nebo Neisseria gonorrhoeae z uretry nebo spojivkového vaku místo kartáčku přiloženého k odběrové soupravě OS-chlam/GO/HPV) kontejner P sterilní kontejner z průhledné umělé hmoty se šroubovacím víčkem kontejner O sterilní kontejner z průhledné umělé hmoty s odsávací výměnnou zátkou anaer S jednorázová sterilní injekční stříkačka po vytlačení vzduchu a s nasazenou sterilní záslepkou (stopper) lahvička FA aerobní hemokultivační lahvička (zelená nebo modrá - SA) lahvička FN anerobní hemokultivační lahvička (oranžová nebo fialová - SN) OS-mycoplasma odběrová souprava pro vyšetření urogenitálních mykoplasmat OS-chlam/GO/HPV odběr. souprava pro vyšetření Chlamydia trachomatis a/nebo Neisseria gonorrhoeae a/nebo lidských papillomavirů (HPV) genetickou sondou OS-trichomonas odběrová souprava pro kultivaci Trichomonas vaginalis uchovávání způsob uchovávání vzorku před transportem (pouze pokud není možný okamžitý transport na příjem KMAS) Č (čas): maximální délka transportu (h - hodiny, m - minuty) T (teplota): pt (pokojová teplota: C), cht (chladničková teplota: 2 8 C) transport podmínky transportu Č (čas): maximální délka transportu (h - hodiny, m - minuty) T (teplota): pt (pokojová teplota: C), cht (chladničková teplota: 2 8 C); chb (chlazený přepravní box: teplota 2 20 C) pt/chb - v rámci NNH je vzorek transportován při pt, od externích klientů při chb (chlazené přepravní boxy s monitorováním teploty) čas - N nejkratší čas pro sdělení konečného negativního výsledku od dodání do laboratoře (d - dny, h - hodiny, m - minuty) čas - P průměrný časový interval pro sdělení pozitivního výsledku od dodání do laboratoře (d - dny, h - hodiny, m - minuty) Verze:01,02/2017 Stránka 1 z 12

2 Horní cesty dýchací výtěru výtěr z krku (patrové oblouky, výtěrovka-tp z krku tonsily, hltan) /chb Kultivační vyšetření výtěru z krku pro výtěr z krku (patrové oblouky, výtěrovka surveillance v intenzivní péči tonsily, hltan) Cílený kultivační průkaz Arcanobacterium výtěr z krku (patrové oblouky, výtěrovka-tp haemolyticum z výtěru z krku tonsily, hltan) /chb Cílený kultivační průkaz Neisseria výtěr z krku (patrové oblouky, výtěrovka-tp gonorrhoae z výtěru z krku tonsily, hltan) /chb Cílený kultivační průkaz Staphylococcus výtěr z krku (patrové oblouky, výtěrovka aureus z výtěru z krku tonsily, hltan) výtěrovka-tp Cílený kultivační průkaz Staphylococcus výtěr z krku (patrové oblouky, výtěrovka aureus MRSA z výtěru z krku tonsily, hltan) výtěrovka-tp výtěru z nosohltanu výtěr ze zadní stěny nosohltanu výtěrovka d-tp /chb výtěru výtěr z nosního vchodu a výtěrovka z nosu z nosní dutiny výtěrovka-tp /chb Kultivační vyšetření výtěru z nosu pro hluboký výtěr z nosu výtěrovka surveillance v intenzivní péči výtěrovka-tp Cílený kultivační průkaz Staphylococcus výtěr z nosního vchodu výtěrovka aureus z výtěru z nosu výtěrovka-tp /chb Cílený kultivační průkaz Staphylococcus aureus MRSA z výtěru z nosu výtěr z nosního vchodu výtěrovka výtěrovka-tp /chb tekutina získaná punkcí nebo anaer S 2 d 2-6 d klinického materiálu z paranazálních dutin odsátím z paranazální dutiny /chb Dolní cesty dýchací sputa sputum získané vykašláním kontejner P /chb endotracheálního aspirátu endotracheální aspirát získaný odsátím z intubace / tracheostomie kontejner O /chb Verze:01,02/2017 Stránka 2 z 12

3 bronchiálního aspirátu bronchoalveolární laváže výtěru z tracheostomie Mikroskopický průkaz acidorezistentních baktérií aspirát z bronchů získaný kontejner O bronchoskopicky BAL kontejner P kontejner O výtěr z tracheostomie výtěrovka výtěrovka-tp sekret z dolních cest dýchacích kontejner P kontejner O /chb /chb Č: 3h /chb 2 h 2 h Ucho výtěru výtěr ze zevního zvukovodu výtěrovka-tp ze zevního zvukovodu /chb tekutina ze středouší získaná výtěrovka d-tp klinického materiálu ze středního ucha punkcí nebo po paracentéze, zachycená asepticky na tampon /chb Oko výtěru ze spojivkového vaku výtěr ze spojivkového vaku výtěrovka-tp /chb Průkaz Chlamydia trachomatis ve výtěru ze razantní výtěr ze spojivkového OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d 1-7 d 1-7 d spojivkového vaku genetickou sondou vaku se zachycením buněk epitelu tampon FLOQ / pt /chb výtěru výtěr z rohovkového vředu výtěrovka-tp z rohovkového vředu klinického materiálu z nitroočního prostoru tekutina z nitroočního prostoru získaná punkcí nebo peroperač. anaer S výtěrovka-tp /chb /chb 2 d 2-6 d Zažívací ústrojí Základní kultivační vyšetření stolice výtěr z rekta výtěrovka výtěrovka-tp /chb Cílený kultivační průkaz Campylobacter spp. ze stolice výtěr z rekta výtěrovka-tp /chb 3 d 3-5 d Verze:01,02/2017 Stránka 3 z 12

4 Cílený kultivační průkaz Escherichia coli O157 ze stolice výtěr z rekta výtěrovka-tp výtěrovka Cílený kultivační průkaz patogenních vibrií výtěr z rekta výtěrovka-tp ze stolice Cílený kultivační průkaz Yersinia spp. ze výtěr z rekta výtěrovka-tp stolice Průkaz toxinu Clostridium difficile ve stolici stolice kontejner P Kultivační vyšetření stolice pro surveillance výtěr z rekta výtěrovka v intenzivní péči výtěrovka-tp Základní kultivační vyšetření obsahu žlučových cest obsah žlučových cest získaný punkcí či aspirací, peroperačně, při ERCP, případně z drenáže anaer S kontejner P výtěrovka-tp /chb /chb /chb /chb /chb 21 d d 3-4 h 3-4 h statim statim 2 d 2-6 d Močové ústrojí moči střední proud moči, cévkovaná kontejner P 1 d 2-5 d moč, moč z permanentního katétru (5ml, min. 1 ml) /chb Průkaz urogenitálních mykoplasmat z moči střední proud moči, cévkovaná moč, moč z permanentního katétru kontejner P Základní kultivační vyšetření výtěru z uretry hluboký výtěr z uretry výtěrovka d-tp Průkaz urogenitálních mykoplasmat hluboký výtěr z uretry OS-mycoplasma Č:48 h T:pt z výtěru z uretry nebo 72h cht Průkaz Chlamydia trachomatis z výtěru hluboký výtěr z uretry s abrazí OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d z uretry genetickou sondou buněk epitelu tampon FLOQ /pt Průkaz Neisseria gonorrhoae z výtěru hluboký výtěr z uretry s abrazí OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d z uretry genetickou sondou buněk epitelu tampon FLOQ / pt Cílený kultivační průkaz Trichomonas hluboký výtěr z uretry OS-trichomonas vaginalis z výtěru z uretry chb /chb /chb /chb /chb /chb 1-7 d 1-7 d 1-7 d 1-7 d 2 d 2-3 d Verze:01,02/2017 Stránka 4 z 12

5 Pohlavní ústrojí muže sekretu výtěr z uretry po masáži výtěrovka-tp prostaty prostaty per rectum /chb Průkaz urogenitálních mykoplasmat v sekretu prostaty výtěr z uretry po masáži prostaty per rectum OS mycoplasma Č:48 h T:pt nebo 72h cht /chb Průkaz Chlamydia trachomatis v sekretu výtěr z uretry po masáži OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d 1-7 d 1-7 d prostaty genetickou sondou prostaty per rectum / pt /chb Průkaz Neisseria gonorrhoae v sektretu prostaty genetickou sondou výtěr z uretry po masáži prostaty per rectum OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d / pt /chb 1-7 d 1-7 d ejakulát získaný masturbací kontejner P ejakulátu /chb Průkaz urogenitálních mykoplasmat v ejakulátu ejakulát získaný masturbací OS mycoplasma Č:48 h T:pt nebo 72h cht /chb Průkaz Chlamydia trachomatis v ejakulátu ejakulát získaný masturbací OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d 1-7 d 1-7 d genetickou sondou / pt /chb Průkaz Neisseria gonorrhoae v ejakulátu genetickou sondou ejakulát získaný masturbací OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d / pt /chb 1-7 d 1-7 d Pohlavní ústrojí ženy Mikroskopický obraz poševní poševní sekret zachycený na výtěrovku a válivým pohybem podložní sklo v krabici pro Č: 48 h /chb 1-4 d statim 1-4 d statim rozetřený na podložní sklo mikrosk. preparáty výtěru výtěr z pochvy výtěrovka-tp z pochvy /chb Průkaz urogenitálních mykoplasmat ve výtěr z pochvy OS mycoplasma Č:48 h T:pt výtěru z pochvy nebo 72h cht /chb Cílený kultivační průkaz Trichomonas výtěr z pochvy OS trichomonas vaginalis ve výtěru z pochvy /chb výtěru z děložního hrdla výtěr z děložního hrdla výtěrovka-tp /chb Průkaz urogenitálních mykoplasmat ve výtěru z děložního hrdla výtěr z děložního hrdla s abrazí buněk epitelu OS mycoplasma Č:48 h T:pt nebo 72h cht Č: 3h /chb Verze:01,02/2017 Stránka 5 z 12

6 Průkaz Chlamydia trachomatis ve výtěru výtěr z děložního hrdla s abrazí OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d 1-7 d 1-7 d z děložního hrdla genetickou sondou buněk epitelu / pt /chb Průkaz Neisseria gonorrhoae ve výtěru výtěr z děložního hrdla s abrazí OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d 1-7 d 1-7 d z děložního hrdla genetickou sondou buněk epitelu / pt /chb sekretu tekutina z Bartholinské žlázy anaer S 2 d 2-6 d z Bartholinské žlázy získaná punkcí /chb tekutiny tekutina z adnex získaná při anaer S 2 d 2-6 d z adnex invazivním výkonu v malé pánvi /chb Průkaz urogenitálních mykoplasmat z tekutiny z adnex tekutina z adnex získaná při invazivním výkonu v malé pánvi OS mycoplasma Č:48 h T:pt nebo Č:72h /chb 2 d 2-4 d Průkaz Chlamydia trachomatis z tekutiny tekutina z adnex získaná při OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d 1-7 d 1-7 d z adnex genetickou sondou invazivním výkonu v malé pánvi / pt /chb Průkaz Neisseria gonorrhoae z tekutiny z adnex genetickou sondou tekutina z adnex získaná při invazivním výkonu v malé pánvi OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d / pt /chb 1-7 d 1-7 d intauterinního tělíska intrauterinní tělísko kontejner P nevhodné /chb 7 d 7-10 d Kůže stěr z kožní léze výtěrovka-tp 2 d 2-6 d klinického materiálu z kožní léze /chb Rány a hluboké defekty výtěr z rány výtěrovka-tp 2 d 2-6 d klinického materiálu z rány /chb klinického materiálu z hlubokého defektu výtěr z hlubokého defektu výtěrovka-tp /chb 2 d 2-6 d Centrální nervový systém mozkomíšního moku lumbální punkce kontejner P /chb 2-5 d 2-5 d Verze:01,02/2017 Stránka 6 z 12

7 Mikrobiologické vyšetření mozkomíšního moku v kultivačním analyzátoru Mikrobiologické vyšetření mozkomíšního moku při monitorování zevních drenáží CNS lumbální punkce lahvička FA lahvička FN likvor z drenáže kontejner P 5-7 d 2-10 d Krev (hemokultura) Hemokultivační vyšetření (odebírají se vždy nejméně dva odběry aseptická venepunkce (standardní odběr) lahvička FA (5ml ) 5-7 d 2-10 d hemokultur po 10ml, každý odběr 5 ml odběr z cévního katétru (při lahvička FN (nebo 37 C) do aerobní a 5 ml do anaerobní lahvičky) podezření na katétrovou infekci) viz Lab. příručka (5ml ) Hnis a obsah patologických dutin hnisu punkce abscesu nebo anaer S 2-7 d 2-10 d nebo obsahu patologické dutiny patologické dutiny (lahvička FA/FN) /chb tkáně z patologické dutiny excize pyogenní membrány, atp. kontejner P nevhodné /chb 2-7 d 2-10 d Primárně sterilní tělesné tekutiny punkce pleurálního prostoru anaer S 5 d 2-7 d pleurální tekutiny (1-5ml) Mikrobiologické vyšetření pleurální punkce pleurálního prostoru lahvička FA 5-7 d 2-10 d tekutiny v kultivačním analyzátoru (1-5 ml) lahvička FN punkce peritoneálního anaer S 5 d 2-7 d peritoneální tekutiny prostoru (1-5ml) Mikrobiologické vyšetření peritoneální punkce peritoneálního lahvička FA 5-7 d 2-10 d tekutiny v kultivačním analyzátoru prostoru (1-5ml) lahvička FN ascitu punkce ascitu (1-5ml) anaer S 5 d 2-7 d Mikrobiologické vyšetření ascitu v kultivačním analyzátoru punkce ascitu (1-5ml) lahvička FA lahvička FN 5-7 d 2-10 d Verze:01,02/2017 Stránka 7 z 12

8 punkce perikardiálního anaer S 5 d 2-7 d perikardiální tekutiny prostoru (1-5ml) Mikrobiologické vyšetření perikardiální tekutiny v kultivačním analyzátoru punkce perikardiálního prostoru (1-5ml) lahvička FA lahvička FN 5-7 d 2-10 d kloubní punkce kloubu (1-5ml) anaer S 5 d 2-7 d tekutiny /chb Mikrobiologické vyšetření kloubní tekutiny punkce kloubu (1-5ml) lahvička FA 5-7 d 2-10 d v kultivačním analyzátoru lahvička FN tekutiny punkce Douglasova prostoru anaer S 5 d 2-7 d z Douglasova prostoru (1-5ml) Mikrobiologické vyšetření tekutiny z Douglasova prostoru v kultivačním analyzátoru punkce Douglasova prostoru (1-5ml) lahvička FA lahvička FN 5-7 d 2-10 d aspirát peritoneálního dialyzátu anaer S 5 d 2-7d peritoneálního dialyzátu Mikrobiologické vyšetření peritoneálního dialyzátu v kultivačním analyzátoru (5ml) aspirát peritoneálního dialyzátu (5ml) lahvička FA lahvička FN 5-7 d 2-10d Tkáně tkáně část tkáně kontejner P /chb 2-5 d 2-10 d srdeční část chlopně kontejner P 10 d 2-14 d chlopně Cizorodý materiál (cévní katétry, elektrody, drény, implantáty) Mikrobiologické vyšetření cévních katétrů odstřižení 5cm špičky vyjmutého katétru kontejner P - Mikrobiologické vyšetření odstřižení 5cm koncové části kontejner P - 5 d 5-10 d kardiostimulačních elektrod elektrody Mikrobiologické vyšetření elektrod z centrálního nervového sytému odstřižení 5cm koncové části elektrody kontejner P - 5 d 5-10 d Verze:01,02/2017 Stránka 8 z 12

9 Mikrobiologické vyšetření chirurgických drénů odstřižení 5cm koncové části drenu kontejner P - Mikrobiologické vyšetření drénů odstřižení 5cm koncové části kontejner P - z centrálního nervového systému drenu Mikrobiologické vyšetření likvorových odstřižení jedné nebo více částí kontejner P - shuntů shuntu podle lokalizace infekce Mikrobiologické vyšetření umělých operační vyjmutí náhrady kontejner P - chlopenních náhrad Mikrobiologické vyšetření biologických operační vyjmutí náhrady kontejner P - chlopenních náhrad Mikrobiologické vyšetření cévních protéz odstřižení části protézy kontejner P - Mikrobiologické vyšetření čidel pro měření vyjmutí intrakraniální části čidla kontejner P - nitrolebního tlaku 5 d 5-7 d 10 d 2-14 d 10 d 2-14 d 10 d 2-14 d Speciální vyšetření Průkaz antigenu Legionella pneumophila v moči enzymovou imunoanalýzou střední proud moči, cévkovaná kontejner P moč, moč z permanentního /chb 3-5 h statim 3-5 h statim Průkaz antigenu Streptococcus pneumoniae v moči enzymovou imunoanalýzou Průkaz lidských onkogenních papilomavirů genetickou sondou katétru střední proud moči, cévkovaná moč, moč z permanentního katétru abraze buněk děložního hrdla kontejner P OS-chlam/GO/HPV Č: 14 d /chb /chb 3-5 h statim 3-5 h statim 1-28 d 1-28 d Verze:01,02/2017 Stránka 9 z 12

10 2. SÉROLOGIE INFORMACE O VYŠETŘENÍCH Legenda k tabulkám: odběr adjustace uchovávání transport stručný popis získání vzorku popis odběrového materiálu způsob uchovávání vzorku před transportem (pouze pokud není možný okamžitý transport na příjem KMAS) Č (čas): maximální délka transportu (h - hodiny, m - minuty) T (teplota): pt (pokojová teplota: C), cht (chladničková teplota: 2 8 C) podmínky transportu Č (čas): maximální délka transportu (h - hodiny, m - minuty) T (teplota): pt (pokojová teplota: C), cht (chladničková teplota: 2-8 C); chb (chlazený přepravní box: teplota 5 20 C) pt/chb - v rámci NNH je vzorek transportován při pt, od externích klientů při chb (chlazené přepravní boxy s monitorováním teploty) Vyšetření odběr adjustace uchovávání transport dostupnost Kvantitativní stanovení Antistreptolysinu O [Antistreptolysin O] /chb 2x týdně Kvantitativní stanovení revmatoidního faktoru [Revmatoidní faktor] Kvantitativní stanovení C-reaktivního proteinu [C-reaktivní protein] Průkaz povrchového antigenu HBsAg viru hepatitidy B chemiluminiscenční imunoanalýzou [Hepatitis B - HBsAg] Průkaz protilátek proti povrchovému antigenu (antihbs) viru hepatitidy B chemiluminiscenční imunoanalýzou [Hepatitis B - antihbs protilátky kvantitativně] Průkaz antigenu HIV p24 a protilátek proti viru HIV 1+2 chemiluminiscenční imunoanalýzou [HIV 1+2 protilátky] /chb denně* / chb denně* /chb denně* /chb Verze:01,02/2017 Stránka 10 z 12 denně* /chb denně*

11 Vyšetření odběr adjustace uchovávání transport dostupnost Průkaz protilátek proti Treponema pallidum chemiluminiscenční imunoanalýzou /chb denně* [Lues základní sérologie: Treponema pallidum protilátky] Průkaz anti-kardiolipinových protilátek flokulačním testem - RPR [Lues - základní serologie: VDRL] Průkaz protilátek IgM proti viru hepatitidy A chemiluminiscenční imunoanalýzou [Hepatitis A anti HAV protilátky IgM] Průkaz protilátek IgG proti viru hepatitidy A chemiluminiscenční imunoanalýzou [Hepatitis A anti HAV protilátky IgG] Průkaz protilátek proti viru hepatitidy C chemiluminiscenční imunoanalýzou [Hepatitis C anti HCV protilátky] Průkaz heterofilních protilátek proti EBV- IM test [EBV heterofilní protilátky (IM test)] Vysvětlivky: * sérologická vyšetření se během víkendu a svátků neprovádějí, vzorky se uchovávají při chladničkové teplotě /chb denně* /chb denně* /chb denně* /chb denně* /chb denně* Verze:01,02/2017 Stránka 11 z 12

12 3. VYŠETŘENÍ ZAJIŠŤOVANÁ V EXTERNÍCH LABORATOŘÍCH Informace o prováděných vyšetřeních a podrobné kontakty na externí laboratoře naleznete na jejich internetových stránkách (viz tabulka): laboratoř zaměření adresa konzultanti (kontakt) kontakty VIDIA Diagnostika Laboratoř parazitologická Zdravotní ústav se sídlem Ústí nad Labem Laboratoř mykologická Zdravotní ústav se sídlem Ústí nad Labem Odd. klinické mikrobiologie FN Bulovka Odd. klinické mikrobiologie FN Bulovka Odd. klinické mikrobiologie FN Bulovka Ústav imunologie a mikrobiologie NRL pro tkáňové helmintózy virologie parazitologie mykologie (dermatofyta a vláknité houby) tuberkulosa mykobakteriologie pneumocystóza autovakcíny tropické parazitární infekce vyvolané helminty, trichinelóza, cysticerkóza a alveolární hydatidóza Poliklinika Černý Most Generála Janouška Praha 14 Sokolovská Praha 8 Sokolovská Praha 8 Budínova Praha 8 Budínova Praha 8 Budínova Praha 8 Studničkova Praha 2 MUDr. Dana Hrubá tel.: hruba@vidia-diagnostika.cz RNDr. Zuzana Hůzová tel.: zuzana.huzova@zuusti.cz RNDr. Pavlína Lysková tel.: pavlina.lyskova@zuusti.cz MUDr. Katarina Petrlová tel.: ; , 2524 katarina.petrlova@bulovka.cz Mgr. Lenka Richterová tel.: , 2323 lenka.richterová@bulovka.cz MUDr. Hana Voříšková tel.: , 2413 hana.voriskova@bulovka.cz prof. RNDr. Libuše Kolářová, CSc. tel.: parazit@vfn.cz telefony-laboratoř: web: telefony-laboratoř: web: telefony-laboratoř: , web: telefony-laboratoř: web: telefony-laboratoř: , 304 web: telefony-laboratoř: web: telefony-laboratoř web: uim.lf1.cuni.cz Verze:01,02/2017 Stránka 12 z 12