IDENTIFIKACE A TYPIZACE STAFYLOKOKŮ METODOU (GTG) 5 -PCR

Rozměr: px
Začít zobrazení ze stránky:

Download "IDENTIFIKACE A TYPIZACE STAFYLOKOKŮ METODOU (GTG) 5 -PCR"

Transkript

1 IDENTIFIKACE A TYPIZACE STAFYLOKOKŮ METODOU (GTG) 5 -PCR Nováková Dana Česká sbírka mikroorganismů, Masarykova universita, Brno

2 ÚVODEM O REP-PCR PCR = mnohonásobné zmnožení úseků obsahujících fragment komplementární s primerem rep-pcr: amplifikace úseků mezi repetitivními sekvencemi směs amplikonů o různé velikosti jedinečný profil (GTG) 5 laktobacily, enterokoky, ERIC (Enterobacterial repetitive intergenic consensus) G-tyčky, BOX elementy G+ koky (streptokoky) Výhody: rychlost, snadné provedení, levné (mimo přístrojové a softwarové vybavení) vhodná především tam, kde jsou již zavedeny jiné amplifikační metody malé vstupní množství kultury (i několikadenní kultura) výsledek za 48 hod. srovnatelné s konvenčními metodami

3 MATERIÁL A PROVEDENÍ Všech 50 validně popsaných taxonů stafylokoků (celkem 123 izolátů) Typová kultura izoláty, rozmanitý zdroj izolace Kultivace, izolace DNA (alkalická lyze, 20 min) Primer (GTG) 5, tj. tandemově opakovaná polynukleotidová sekvence 5'-GTG GTG GTG GTG GTG-3' Počáteční denaturace 7 min / 95 C 30 cyklů: 1 min / 94 C + 1 min / 40 C + 8 min / 65 C konečná elongace 16 min / 65 C (doba procesu 6 hod) Elektroforéza (1,5% agaróza, 16 hod, přes noc), digitalizace, vyhodnocení (BioNumerics, GelCompar, )

4 VÝSLEDKY ANALÝZY 45 z 50 taxonů (90%) vytvářelo druhově specifické shluky PCR profilů = identifikace do druhu (včetně všech klinicky významných taxonů) hominis, schleiferi, cohnii a capitis poddruhově specifické profily = možná identifikace do poddruhu intermedius, hyicus, kloosii, sciuri subsp. sciuri a carnosus subsp. utilis 2 typy PCR profilů Vnitrodruhová variabilita 40 89% ( aureus a lugdunensis resp.) U všech izolátů prokázán jedinečný PCR profil = různé kmeny

5 ANALÝZA(GTG) 5 - PCR PROFILŮ Podobnost (%) CCM 3834 T CCM 4532 CCM 4313 T CCM 4315 CCM 2271 kloosii kloosii schleiferi subsp. coagulans schleiferi subsp. coagulans schleiferi CCM 4070 T schleiferi subsp. schleiferi CCM 4072 schleiferi subsp. schleiferi CCM 2736 T cohnii subsp. cohnii CCM 2605 cohnii subsp. cohnii CCM 2726 cohnii subsp. cohnii CCM 4770 felis CCM 4198 felis CCM 4196 T felis CCM 2618 intermedius CCM 4710 intermedius CCM 7278 T equorum subsp. linens CCM 7301 equorum CCM 3832 T equorum subsp. equorum CCM 7302 equorum CCM 4068 lugdunensis CCM 4069 lugdunensis CCM 4064 T lugdunensis CCM 4436 lugdunensis CCM 2738 T xylosus CCM 4822 xylosus CCM 2128 xylosus CCM 4657 T sciuri subsp. rodentium CCM 4743 sciuri subsp. rodentium CCM 7041 sciuri subsp. sciuri CCM 4835 T sciuri subsp. carnaticus CCM 4232 sciuri subsp. sciuri CCM 2994 hyicus CCM 2995 hyicus CCM 7521 pettenkoferi CCM 7495 T pettenkoferi CCM 4752 carnosus subsp. utilis CCM 3473 T sciuri subsp. sciuri CCM 2730 T warneri CCM 2604 warneri CCM 2445 warneri CCM 3572 T gallinarum CCM 4506 gallinarum CCM 7221 epidermidis CCM 4505 epidermidis CCM 2124 T epidermidis

6 CCM 3474 T CCM 2732 CCM 2733 CCM 4786 T CCM 4747 CCM 4748 CCM 7194 T CCM 7313 CCM 7314 CCM 7157 T CCM 7230 CCM 7229 CCM 7213 T CCM 3991 T CCM 3992 CCM 883 T CCM 2682 CCM 4410 T CCM 2728 CCM 7045 T CCM 7317 CCM 2433 CCM 3830 T CCM 3831 CCM 2705 T CCM 4938 CCM 3583 CCM 4411 CCM 3472 T CCM 2599 CCM 2436 CCM 3835 CCM 4345 T CCM 4346 CCM 4753 T CCM 4789 CCM 5757 CCM 4890 CCM 2286 CCM 3823 T CCM 3824 CCM 885 T hominis subsp. hominis hominis subsp. hominis hominis subsp. hominis hominis subsp. novobiosepticus hominis subsp. novobiosepticus hominis subsp. novobiosepticus succinus subsp. casei succinus subsp. casei succinus succinus subsp. succinus simiae simiae simiae auricularis auricularis saprophyticus subsp. saprophyticus saprophyticus subsp. saprophyticus saprophyticus subsp. bovis saprophyticus subsp. saprophyticus nepalensis nepalensis nepalensis arlettae arlettae simulans simulans simulans simulans lentus lentus lentus kloosii piscifermentans piscifermentans condimenti piscifermentans aureus aureus subsp. anaerobius subsp. anaerobius

7 CCM 885 CCM 5739 T CCM 4681 T CCM 4115 T CCM 4184 CCM 3385 CCM 3386 CCM 3387 T CCM 7315 T CCM 4539 CCM 2110 CCM 4295 CCM 4294 T CCM 4389 T CCM 4788 CCM 4390 CCM 7101 CCM 2368 T CCM 4511 T CCM 4481 CCM 4894 CCM 7296 CCM 2729 CCM 2737 T CCM 4175 T CCM 4176 CCM 4178 CCM 4838 T CCM 4579 CCM 7085 CCM 3539 CCM 6144 CCM 2734 T CCM 2735 CCM 4291 T CCM 4293 CCM 4922 T intermedius lutrae delphini delphini chromogenes chromogenes chromogenes pseudintermedius pseudintermedius cohnii subsp. urealyticum cohnii subsp. urealyticum cohnii subsp. urealyticum pasteuri pasteuri pasteuri vitulinus hyicus vitulinus vitulinus haemolyticus haemolyticus haemolyticus haemolyticus muscae muscae muscae carnosus subsp. carnosus carnosus subsp. carnosus carnosus subsp. utilis saccharolyticus saccharolyticus capitis subsp. capitis capitis subsp. capitis capitis subsp. ureolyticus capitis subsp. ureolyticus fleurettii

8 SHRNUTÍ 1. Na základě podobnosti (GTG) 5 -PCR profilů lze stafylokoky identifikovat do druhu -Tvoří dobře odlišitelné shluky CCM 2736 T CCM 2605 CCM 2726 CCM 4770 CCM 4198 CCM 4196 T cohnii subsp. cohnii cohnii subsp. cohnii cohnii subsp. cohnii felis felis felis

9 SHRNUTÍ 2. U některých taxonů zařazení až do poddruhu -Tvoří poddruhově specifické, dobře rozlišitelné shluky CCM 2734 T CCM 2735 CCM 4291 T CCM 4293 capitis subsp. capitis capitis subsp. capitis capitis subsp. ureolyticus capitis subsp. ureolyticus

10 SHRNUTÍ 3. Umožňuje typizaci kmenů Výhoda oproti konvenčním metodám -je kmen identický s dřívějším nálezem pacienta? (opakovaný nález?, skryté ložisko?, více pacientů s totožným kmenem?) CCM 5757 CCM 4890 CCM 2286

11 SHRNUTÍ 4. V případě, že jeden taxon vytváří více vizuálně odlišných typů profilů, nutno doplnit dalšími testy, posoudit správnost dřívější identifikace

12 ZÁVĚR (GTG) 5 -PCR je vhodná jak pro identifikaci většiny stafylokoků (včetně všech klinicky významných druhů), tak pro typizaci kmenů Spolehlivost identifikace je podmíněna kvalitou databáze (čím Spolehlivost identifikace je podmíněna kvalitou databáze (čím více dobře charakterizovaných referenčních kmenů obsahuje, tím lépe)

13 Děkuji za pozornost Práce byla podpořena projektem MSM Metodika vychází z publikací: Gevers et al., Applicability of rep-pcr fingerprinting for identification of Lactobacillus species. FEMS Microbiology Letters 205, Švec et al., Evaluation of (GTG) 5 -PCR for rapid identification of Streptococcus mutans. Antoine Van Leeuwenhoak, 94,

Identifikace stafylokoků pomocí komerčních souprav STAPHYtest 24 a API Staph

Identifikace stafylokoků pomocí komerčních souprav STAPHYtest 24 a API Staph Identifikace stafylokoků pomocí komerčních souprav STAPHYtest 24 a API Staph Ivo Sedláček 1, Petr Petráš 2, Eva Plíšková 3, Tereza Škapová 4, Jana Jančová 4, Petr Ježek 5 1 Česká sbírka mikroorganismů,

Více

Identifikace stafylokoků prostřednictvím sekvenování konzervativních genů

Identifikace stafylokoků prostřednictvím sekvenování konzervativních genů Identifikace stafylokoků prostřednictvím sekvenování konzervativních genů Roman Pantůček, Pavel Švec, Ivo Sedláček Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity Ústav experimentální biologie M A SA RYKOVA

Více

MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE ČESKÁ SBÍRKA MIKROORGANISMŮ

MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE ČESKÁ SBÍRKA MIKROORGANISMŮ MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE ČESKÁ SBÍRKA MIKROORGANISMŮ S. aureus S. simiae (D83357) (AY727530) S. hominis (X66101) S. haemolyticus (D83367) S. stepanoicii

Více

Ing. Růžena Seydlová. Základní ukazatele z chovu dojnic

Ing. Růžena Seydlová. Základní ukazatele z chovu dojnic JAKÁ JE HYGIENICKÁ KVALITA MLÉKA PRVOTELEK V ČR? Ing. Růžena Seydlová MILCOM a.s. Praha Listopad 2016 Základní ukazatele z chovu dojnic rok stavy dojnic dojnice/stáj průměrná laktace 1. Laktace (% ) mléčná

Více

GENOTYPOVÁ REKLASIFIKACE KMENŮ Staphylococcus intermedius jako Staphylococcus pseudintermedius

GENOTYPOVÁ REKLASIFIKACE KMENŮ Staphylococcus intermedius jako Staphylococcus pseudintermedius Konzultační den NRL pro stafylokoky, SZÚ Praha, 3.11.2010 GENOTYPOVÁ REKLASIFIKACE KMENŮ Staphylococcus intermedius jako Staphylococcus pseudintermedius Pavel Švec 1, Roman Pantůček 2, Petr Petráš 3 1

Více

ZDRAVOTNÍ STAV MLÉČNÉ ŽLÁZY PRVOTELEK V ČESKÉ REPUBLICE. Ing. Růžena Seydlová, PhD. MILCOM a.s. Praha duben 2015

ZDRAVOTNÍ STAV MLÉČNÉ ŽLÁZY PRVOTELEK V ČESKÉ REPUBLICE. Ing. Růžena Seydlová, PhD. MILCOM a.s. Praha duben 2015 ZDRAVOTNÍ STAV MLÉČNÉ ŽLÁZY PRVOTELEK V ČESKÉ REPUBLICE Ing. Růžena Seydlová, PhD. MILCOM a.s. Praha duben 2015 Základní ukazatele z chovu dojnic rok stavy dojnic dojnice/stáj průměrná laktace 1. laktace

Více

Zubní kaz v časném dětství a mikrobiální flóra. I. Sedláček, L. Žáčková, M. Kukletová, L. Klapušová, J. Kuklová, D. Nováková, P.

Zubní kaz v časném dětství a mikrobiální flóra. I. Sedláček, L. Žáčková, M. Kukletová, L. Klapušová, J. Kuklová, D. Nováková, P. Zubní kaz v časném dětství a mikrobiální flóra projekt 1M0021622409 I. Sedláček, L. Žáčková, M. Kukletová, L. Klapušová, J. Kuklová, D. Nováková, P. Švec Bakteriální mikroflóra zubů průkaz druhové diverzity

Více

Polyfázová identifikace kmenů Aeromonas encheleia

Polyfázová identifikace kmenů Aeromonas encheleia Polyfázová identifikace kmenů Aeromonas encheleia D. Nováková, A. Vávrová, P. Švec a I. Sedláček Česká sbírka mikroorganismů Charakterizace aeromonád G-, pohyblivé tyčky, kokotyčky, čeleď Aeromonadaceae

Více

Dezinfekce rukou a přehled výskytu mikrobiální flory na rukou nemocničního personálu

Dezinfekce rukou a přehled výskytu mikrobiální flory na rukou nemocničního personálu Dezinfekce rukou a přehled výskytu mikrobiální flory na rukou nemocničního personálu Eva Padevětová MVDr. Petr Ježek Mikrobiologické oddělení E-mail: micvrch@onp.cz 30..2006 Úvod průzkum proběhl v Oblastní

Více

Využití rep-pcr v bakteriální taxonomii

Využití rep-pcr v bakteriální taxonomii Využití rep-pcr v bakteriální taxonomii Pavel Švec Česká sbírka mikroorganismů Přírodovědecká fakulta MU rep-pcr založeny na shlukové analýze PCR produktů získaných s primery komplementárními k rozptýleným

Více

ORIDES orientační identifikace koaguláza negativních stafylokoků verze 2010

ORIDES orientační identifikace koaguláza negativních stafylokoků verze 2010 INFORMACE Z NRL A ODBORNÝCH PRACOVIŠŤ SZÚ ORIDES orientační identifikace koaguláza negativních stafylokoků verze 2010 ORIDES presumptive identification of coagulase-negative staphylococci version 2010

Více

L. acidophilus_(psmm _ TIDE):

L. acidophilus_(psmm _ TIDE): L. acidophilus_(psmm _ TIDE): 2010-04-06 Ivo Sedláček a Pavel Švec Česká sbírka mikroorganismů Přírodovědecká fakulta MU Tvrdého 14, 602 00 Brno Projekt FI-IM5/205 problematika taxonomie Polyfázová taxonomie

Více

L. acidophilus_(psmm _ TIDE): 2010-04-06

L. acidophilus_(psmm _ TIDE): 2010-04-06 _(PSMM _ TIDE): 2010-04-06 Ivo Sedláček a Pavel Švec Česká sbírka mikroorganismů Přírodovědecká fakulta MU Tvrdého 14, 602 00 Brno Projekt FI-IM5/205 problematika taxonomie Polyfázová taxonomie - taxonomie

Více

izolovaných z hemokultur

izolovaných z hemokultur Identifikace mléčných bakterií izolovaných z hemokultur P. Švec 1, A. Ševčíková 2, M. Vancanneyt 3, I. Sedláček 1 1 Česká sbírka mikroorganismů, PřF MU, Brno 2 Fakultní nemocnice Brno 3 BCCM/LMG Bacteria

Více

Původci mastitid skotu

Původci mastitid skotu Původci mastitid skotu Z pracoval: M V D r. Jaroslav B Z D IL, Ph.D., SV Ú O lom ouc, Jakoubka za Stříbra 1, 77900 Olom ouc. Tel.: 585557223, E -m ail: vetm ed@ seznam.cz 1 Rozdělení patogenů mléčné žlázy

Více

Stafylokoky v současné době patří mezi důležité bakteriální patogeny. Např. u nozokomiálních infekcí krevního řečiště jsou spolu s enterokoky

Stafylokoky v současné době patří mezi důležité bakteriální patogeny. Např. u nozokomiálních infekcí krevního řečiště jsou spolu s enterokoky Grampozitivní bakterie Rod Staphylococcus Stafylokoky v současné době patří mezi důležité bakteriální patogeny. Např. u nozokomiálních infekcí krevního řečiště jsou spolu s enterokoky etiologickým agens

Více

ORIDES orientační identifikace koaguláza-negativních stafylokoků verze 2018

ORIDES orientační identifikace koaguláza-negativních stafylokoků verze 2018 INFORMACE Z NRL A ODBORNÝCH PRACOVIŠŤ SZÚ ORIDES orientační identifikace koaguláza-negativních stafylokoků verze 2018 ORIDES presumptive identification of coagulase-negative staphylococci version 2018

Více

Využití analýzy celkových buněčných proteinů pomocí SDS-PAGE při charakterizaci fluorescentních pseudomonád izolovaných ze speleotém

Využití analýzy celkových buněčných proteinů pomocí SDS-PAGE při charakterizaci fluorescentních pseudomonád izolovaných ze speleotém Využití analýzy celkových buněčných proteinů pomocí SDS-PAGE při charakterizaci fluorescentních pseudomonád izolovaných ze speleotém Mgr. Marcel Kosina Česká sbírka mikroorganismů Masarykova univerzita,

Více

ORIDES orientační identifikace koaguláza negativních stafylokoků verze 2015

ORIDES orientační identifikace koaguláza negativních stafylokoků verze 2015 ZPRÁVY CENTRA EPIDEMIOLOGIE A MIKROBIOLOGIE (SZÚ, PRAHA) 2015; 24(10) ORIDES orientační identifikace koaguláza negativních stafylokoků verze 2015 ORIDES presumptive identification of coagulase-negative

Více

Bakalářská práce. Zdravotní problematika rodu Staphylococcus

Bakalářská práce. Zdravotní problematika rodu Staphylococcus JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH ZEMĚDĚLSKÁ FAKULTA Katedra veterinárních disciplín a kvality produktů Studijní program: B4131 Zemědělství Studijní obor: Trvale udržitelné systémy hospodaření

Více

M. Laichmanová NOVINKY V NABÍDCE KONTROLNÍCH KMENŮ ČESKÉ SBÍRKY MIKROORGANISMŮ

M. Laichmanová NOVINKY V NABÍDCE KONTROLNÍCH KMENŮ ČESKÉ SBÍRKY MIKROORGANISMŮ M. Laichmanová NOVINKY V NABÍDCE KONTROLNÍCH KMENŮ ČESKÉ SBÍRKY MIKROORGANISMŮ držitel certifikátu Kompletní nabídku referenčních mikroorganizmů tvoří 157 kontrolních kmenů bakterií vláknitých hub kvasinek

Více

Staphylococcus petrasii, nový druh stafylokoka z České republiky

Staphylococcus petrasii, nový druh stafylokoka z České republiky ZPRÁVY CENTRA EPIDEMIOLOGIE A MIKROBIOLOGIE (SZÚ, PRAHA) 2013; 22(8) Staphylococcus petrasii, nový druh stafylokoka z České republiky Staphylococcus petrasii, a novel staphylococcal species from the Czech

Více

PSMM _ TIDE

PSMM _ TIDE PSMM _ TIDE 2010-02-19 Ivo Sedláček Česká sbírka mikroorganismů Přírodovědecká fakulta MU Tvrdého 14, 602 00 Brno mikrobiální biosféra není statická dorozumívací jazyk Prokaryota mohou, a také to dělají,

Více

Využití DNA sekvencování v

Využití DNA sekvencování v Využití DNA sekvencování v taxonomii prokaryot Mgr. Pavla Holochová, doc. RNDr. Ivo Sedláček, CSc. Česká sbírka mikroorganismů Ústav experimentální biologie Přírodovědecká fakulta Masarykova univerzita,

Více

PCR pozitivních hemokultur v systému BacT/ALERT 3D soupravou GenoType BC Lazarová Z., Fischerová L., Karasová H.

PCR pozitivních hemokultur v systému BacT/ALERT 3D soupravou GenoType BC Lazarová Z., Fischerová L., Karasová H. PCR pozitivních hemokultur v systému BacT/ALERT 3D soupravou GenoType BC Lazarová Z., Fischerová L., Karasová H. Zdravotní ústav se sídlem v Ostravě, Centrum klinických laboratoří Proč použít PCR v diagnostice

Více

GRAMPOZITIVNÍ KOKY. Čeleď: STAPHYLOCOCCACEAE. Rod: Staphylococcus

GRAMPOZITIVNÍ KOKY. Čeleď: STAPHYLOCOCCACEAE. Rod: Staphylococcus GRAMPOZITIVNÍ KOKY Společnou charakteristikou baktérií této skupiny jsou především morfologie buněk (koky) a fyziologické vlastnosti (mezofilie a organofilie). Za základní znaky používané k rozlišení jednotlivých

Více

MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE

MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE Česká sbírka mikroorganismů () DOPORUČENÉ KONTROLNÍ KMENY PRO IDENTIFIKAČNÍ TESTY V KLINICKÉ MIKROBIOLOGII - Bakteriologie K ověření kvality identifikačních souprav a testů používaných v klinické mikrobiologii

Více

Výskyt a typizace mléčných bakterií v baleném mase

Výskyt a typizace mléčných bakterií v baleném mase Výskyt a typizace mléčných bakterií v baleném mase 1 Štegnerová, H., 2 Nápravníková, E., 2 Steinhauserová, I., 1 Švec, P. 1 MU PřF, Česká sbírka mikroorganismů (CCM) 2 VFU, FVHE, Ústav hygieny a technologie

Více

Film-Utile D. Přípravek s kyselinou mléčnou pro dezinfekci struků po dojení. Popis. Přednosti. Vlastnosti. Legislativa

Film-Utile D. Přípravek s kyselinou mléčnou pro dezinfekci struků po dojení. Popis. Přednosti. Vlastnosti. Legislativa Film-Utile D Popis Přípravek s kyselinou mléčnou pro dezinfekci struků po dojení Přednosti Vlastnosti Vlastnosti účinných látek v přípravku Film-Utile D zajišťují dobrou účinnost při namáčení struků po

Více

MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE

MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE MASARYKOVA UNIVERZITA PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ BIOLOGIE Česká sbírka mikroorganismů (CCM) tel.: +420 549 491 430 fax +420 549 498 289 e-mail: ccm@sci.muni.cz http://www.sci.muni.cz/ccm

Více

Blu-Gard N Dip D. Přípravek s kyselinou mléčnou pro dezinfekci struků po dojení. Popis. Přednosti. Vlastnosti. Legislativa

Blu-Gard N Dip D. Přípravek s kyselinou mléčnou pro dezinfekci struků po dojení. Popis. Přednosti. Vlastnosti. Legislativa Blu-Gard N Dip D Popis Přednosti Vlastnosti Přípravek s kyselinou mléčnou pro dezinfekci struků po dojení Vlastnosti, které dodává účinná látka obsažená v přípravku Blu-Gard N Dip D, zajišťují účinnost

Více

Nové technologie v mikrobiologické diagnostice a jejich přínos pro pacienty v intenzivní péči

Nové technologie v mikrobiologické diagnostice a jejich přínos pro pacienty v intenzivní péči B I O M E D I C AL Nové technologie v mikrobiologické diagnostice a jejich přínos pro pacienty v intenzivní péči Jaroslav Hrabák CHARLES UNIVERSITY IN PRAGUE Obsah prezentace ČSIM 2016 Mikrobiologická

Více

Zkušenosti s diagnostikou sepse pomocí testu SeptiFast Test M GRADE. Zdeňka Doubková Klinická mikrobiologie a ATB centrum VFN Praha

Zkušenosti s diagnostikou sepse pomocí testu SeptiFast Test M GRADE. Zdeňka Doubková Klinická mikrobiologie a ATB centrum VFN Praha Zkušenosti s diagnostikou sepse pomocí testu SeptiFast Test M GRADE Zdeňka Doubková Klinická mikrobiologie a ATB centrum VFN Praha Definice: Sepse je definována jako syndrom systémové zánětlivé odpovědi

Více

CVIČENÍ II. IZOLACE DNA, DETEKCE GENŮ METODOU PCR, STANOVENÍ PŘÍBUZNOSTI IZOLÁTŮ METODOU ERIC PCR

CVIČENÍ II. IZOLACE DNA, DETEKCE GENŮ METODOU PCR, STANOVENÍ PŘÍBUZNOSTI IZOLÁTŮ METODOU ERIC PCR CVIČENÍ II. PŘEDMĚT ANTIBIOTICKÁ REZISTENCE IZOLACE DNA, DETEKCE GENŮ METODOU PCR, STANOVENÍ PŘÍBUZNOSTI IZOLÁTŮ METODOU ERIC PCR Bakterie řadíme mezi prokaryotické organizmy, které nesou genetickou informaci

Více

NOVINKY V NABÍDCE KONTROLNÍCH KMENŮ ČESKÉ SBÍRKY MIKROORGANISMŮ

NOVINKY V NABÍDCE KONTROLNÍCH KMENŮ ČESKÉ SBÍRKY MIKROORGANISMŮ M. Laichmanová a S. Karpíšková Česká sbírka mikroorganismů, Ústav experimentální biologie, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita, Tvrdého 14, 602 00 Brno NOVINKY V NABÍDCE KONTROLNÍCH KMENŮ ČESKÉ

Více

Laboratorní diagnostika v NRL pro stafylokoky CEM SZÚ v roce 2018

Laboratorní diagnostika v NRL pro stafylokoky CEM SZÚ v roce 2018 Laboratorní diagnostika v NRL pro stafylokoky CEM SZÚ v roce 2018 Laboratory diagnostics in the National Reference Laboratory for Staphylococci, Centre for Epidemiology and Microbiology, National Institute

Více

Identifikace a klasifikace mikroorganismů založená na shlukové analýze MALDI-MS protein/peptidových profilů

Identifikace a klasifikace mikroorganismů založená na shlukové analýze MALDI-MS protein/peptidových profilů Identifikace a klasifikace mikroorganismů založená na shlukové analýze MALDI-MS protein/peptidových profilů 4000 6000 8000 10000 m /z MALDI-TOF MS = Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization - - Time

Více

PASTOREX STAPH-PLUS 1 x x Latexový aglutinační test pro identifikaci Staphylococcus aureus

PASTOREX STAPH-PLUS 1 x x Latexový aglutinační test pro identifikaci Staphylococcus aureus PASTOREX STAPH-PLUS 1 x 50 56356 5 x 50 56353 Latexový aglutinační test pro identifikaci Staphylococcus aureus 881175 2015/01 1- POUŽITÍ PASTOREX STAPH-PLUS je rychlý aglutinační test pro souběžnou detekci

Více

BD MacConkey II Agar / Columbia CNA Agar Improved II with 5% Sheep Blood (Biplate)

BD MacConkey II Agar / Columbia CNA Agar Improved II with 5% Sheep Blood (Biplate) NÁVOD K POUŽITÍ MÉDIA NA MISCE URČENÁ K OKAMŽITÉMU POUŽITÍ PA-257574.02 Rev.: Sept. 2015 BD MacConkey II Agar / Columbia CNA Agar Improved II with 5% Sheep Blood (Biplate) ÚČEL POUŽITÍ Médium BD MacConkey

Více

Mikrobiální identifikace

Mikrobiální identifikace Mikrobiální identifikace ANAEROtest 23 rutinní identifikace anaerobních bakterií vyskytujících se v klinickém materiálu 40 stanovení 23 biochemických reakcí umístěných na trojstripu dělené mikrotitrační

Více

Diagnostika moru včelího plodu a epizootologická situace v ČR

Diagnostika moru včelího plodu a epizootologická situace v ČR Diagnostika moru včelího plodu a epizootologická situace v ČR Zpracoval: MVDr. Jaroslav Bzdil, Ph.D., SVÚ Olomouc, Jakoubka ze Stříbra 1, 779 00 Olomouc Tel.: 585557223, e.mail: vetmed@seznam.cz Původce

Více

Akreditované zkoušky prováděné v Laboratořích CEM

Akreditované zkoušky prováděné v Laboratořích CEM Strana č.: 1 Nahrazuje stranu: 1 Akreditované zkoušky prováděné v Laboratořích CEM EIA - stanovení protilátek HIV-1/2, HIV-1 p24 antigenu a současné stanovení protilátek HIV-1/2 a HIV-1 p24 antigenu SOP-NRL/AIDS-01-01

Více

Sou asné mo nosti laboratorní diagnostiky stafylokokových infekcí

Sou asné mo nosti laboratorní diagnostiky stafylokokových infekcí Jiho eská univerzita v eských Bud jovicích Zdravotn sociální fakulta Sou asné mo nosti laboratorní diagnostiky stafylokokových infekcí Bakalá ská práce Autor práce: Studijní program: Studijní obor: Lucie

Více

LÉČBA A ATB PROFYLAXE INFEKČNÍ ENDOKARDITIDY (nové doporučené postupy) Jiří Beneš Infekční klinika 3. LF UK Nemocnice Na Bulovce, Praha

LÉČBA A ATB PROFYLAXE INFEKČNÍ ENDOKARDITIDY (nové doporučené postupy) Jiří Beneš Infekční klinika 3. LF UK Nemocnice Na Bulovce, Praha LÉČBA A ATB PROFYLAXE INFEKČNÍ ENDOKARDITIDY (nové doporučené postupy) Jiří Beneš Infekční klinika 3. LF UK Nemocnice Na Bulovce, Praha Hradec Králové, 25.2.2016 Patogeneze IE, důsledky pro léčbu bakteriémie

Více

DNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH. Michaela Nesvadbová

DNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH. Michaela Nesvadbová DNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH Michaela Nesvadbová Význam identifikace živočišných druhů v krmivu a potravinách povinností každého výrobce je řádně a pravdivě označit

Více

Vykazování pro zdravotní pojišťovny a zákonné požadavky pro genetická vyšetření

Vykazování pro zdravotní pojišťovny a zákonné požadavky pro genetická vyšetření Vykazování pro zdravotní pojišťovny a zákonné požadavky pro genetická vyšetření Hana Feixová Komplement laboratoří ÚHKT, Praha WWW.UHKT.CZ Novela SZV k 1. 1. 2017 Vyhláška č. 421/2016 Sb. Vyhláška, kterou

Více

Úloha protein-nekódujících transkriptů ve virulenci patogenních bakterií

Úloha protein-nekódujících transkriptů ve virulenci patogenních bakterií Téma bakalářské práce: Úloha protein-nekódujících transkriptů ve virulenci patogenních bakterií Nové odvětví molekulární biologie se zabývá RNA molekulami, které se nepřekládají do proteinů, ale slouží

Více

FAKULTA CHEMICKÁ ÚSTAV CHEMIE POTRAVIN A BIOTECHNOLOGIÍ

FAKULTA CHEMICKÁ ÚSTAV CHEMIE POTRAVIN A BIOTECHNOLOGIÍ VYSOKÉ UČENÍ TECHNICKÉ V BRNĚ BRNO UNIVERSITY OF TECHNOLOGY FAKULTA CHEMICKÁ ÚSTAV CHEMIE POTRAVIN A BIOTECHNOLOGIÍ FACULTY OF CHEMISTRY INSTITUTE OF FOOD SCIENCE AND BIOTECHNOLOGY MOLEKULÁRNÍ TYPIZACE

Více

Determinanty lokalizace nukleosomů

Determinanty lokalizace nukleosomů METODY STUDIA CHROMATINU Topologie DNA a nukleosomů Struktura nukleosomu 1.65-1.8 otáčky Struktura nukleosomu 10.5 nt 1.8 otáčky 10n, 10n + 5 146 nt Determinanty lokalizace nukleosomů mechanické vlastnosti

Více

Polyfázová identifikace enterokoků z prostředí

Polyfázová identifikace enterokoků z prostředí Polyfázová identifikace enterokoků z prostředí Ivo Sedláček, Pavel Švec, Marcel Kosina a Pavla Holochová Česká sbírka mikroorganismů Přírodovědecká fakulta MU Tvrdého 14, 602 00 Brno Erba Lachema, Mikulov,

Více

Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci. reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci. reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/ Implementace laboratorní medicíny do systému vzdělávání na Univerzitě Palackého v Olomouci reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0088 Hybridizační metody v diagnostice Mgr. Gabriela Kořínková, Ph.D. Laboratoř molekulární

Více

VYSOKÉ UČENÍ TECHNICKÉ V BRNĚ BRNO UNIVERSITY OF TECHNOLOGY

VYSOKÉ UČENÍ TECHNICKÉ V BRNĚ BRNO UNIVERSITY OF TECHNOLOGY VYSOKÉ UČENÍ TECHNICKÉ V BRNĚ BRNO UNIVERSITY OF TECHNOLOGY FAKULTA CHEMICKÁ ÚSTAV CHEMIE POTRAVIN A BIOTECHNOLOGIÍ FACULTY OF CHEMISTRY INSTITUTE OF FOOD SCIENCE AND BIOTECHNOLOGYOGY IZOLACE DNA V KVALITĚ

Více

VYUŽITÍ SYSTÉMU DIVERSILAB PRO DRUHOVOU IDENTIFIKACI BIFIDOBAKTERIÍ

VYUŽITÍ SYSTÉMU DIVERSILAB PRO DRUHOVOU IDENTIFIKACI BIFIDOBAKTERIÍ a RAPD k charakterizaci výše uvedených bakteriálních druhů vyžaduje další ověření. Tato práce byla podporována grantem č. 2B08070 poskytnutým MŠMT ČR. Literatura BOYER S. L., FLECHTNER V. R., JOHANSEN

Více

SeptiFast. rychlá detekce sepse. Olga Bálková Roche s.r.o., Diagnostics Division

SeptiFast. rychlá detekce sepse. Olga Bálková Roche s.r.o., Diagnostics Division SeptiFast rychlá detekce sepse Olga Bálková Roche s.r.o., Diagnostics Division Požadavky kliniků Rychlá detekce a identifikace patogenů způsobujících sepsi Rychlé výsledky Výsledky do několika hodin Jednoznačné

Více

Mastitidy. MVDr. Jana Štossová Eurofarm systems s. r. o.

Mastitidy. MVDr. Jana Štossová Eurofarm systems s. r. o. Mastitidy MVDr. Jana Štossová Eurofarm systems s. r. o. Zánět mléčné žlázy MASTITIS Zánět mléčné žlázy nemůžeme považovat za jednotnou nosologickou jednotku, protože při jejím vzniku se uplatňují tři biosystémy

Více

Změny sazebníku výkonů pro mikrobiologické obory

Změny sazebníku výkonů pro mikrobiologické obory Změny sazebníku výkonů pro mikrobiologické obory Ing. Hana Hrbáčková LTK CEM SZÚ 2011 - Původní návrh MZ Grant Evropského fondu pro regionální rozvoj Vítěznou nabídku na řešení Kultivace Seznamu zdravotních

Více

Skupina bakterií se společnou vlastností tvorby kyseliny mléčné při fermentaci cukrů Součást mikroflóry DÚ, GIT, vaginy Potraviny, prostředí

Skupina bakterií se společnou vlastností tvorby kyseliny mléčné při fermentaci cukrů Součást mikroflóry DÚ, GIT, vaginy Potraviny, prostředí Klinický význam mléčných bakterií izolovaných z hemokultur Alena Ševčíková OKM, FN Brno Pavel Švec CCM MU Brno Mléčné bakterie (LAB - lactic acid bacteria) Skupina bakterií se společnou vlastností tvorby

Více

Externí kontrola kvality sekvenačních analýz

Externí kontrola kvality sekvenačních analýz Externí kontrola kvality sekvenačních analýz Radka Bolehovská 1, Lenka Plíšková 2, Kateřina Hrochová 2 Úsek molekulární biologie, 1 Ústav klinické mikrobiologie 2 Ústav klinické biochemie a diagnostiky

Více

Optimalizace metody PCR pro její využití na vzorky KONTAMINOVANÝCH PITNÝCH VOD

Optimalizace metody PCR pro její využití na vzorky KONTAMINOVANÝCH PITNÝCH VOD Optimalizace metody PCR pro její využití na vzorky KONTAMINOVANÝCH PITNÝCH VOD Dana Vejmelková, Milan Šída, Kateřina Jarošová, Jana Říhová Ambrožová VODÁRENSKÁ BIOLOGIE, 1. 2. 2017 ÚVOD Sledované parametry,

Více

laboratorní technologie

laboratorní technologie Využití real-time PCR v urgentní diagnostice bakteriálních meningitid J. Mrázek Bakteriální meningitidy Bakteriální meningitidy patří k nejzávažnějším akutním infekčním onemocněním. Průběh bakteriální

Více

Původce Metoda Cena [Kč]

Původce Metoda Cena [Kč] Původce Metoda Cena [Kč] Gastrointestinální soustava Escherichia coli Kultivace 90 Stanovení patogenních faktorů Salmonella spp. Kultivace 70-270 Serotypizace 730 Clostridium perfringens Kultivace 130

Více

Konečná zpráva hodnocení různých způsobů přípravy vzorků pro AMPLICOR HPV test firmy Roche

Konečná zpráva hodnocení různých způsobů přípravy vzorků pro AMPLICOR HPV test firmy Roche Konečná zpráva hodnocení různých způsobů přípravy vzorků pro AMPLICOR HPV test firmy Roche Charakteristika testu: Set AMPLICOR HPV vyráběný firmou Roche je určený pro detekci vysoko-rizikových typů lidských

Více

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU Úvod IntellMed, s.r.o., Václavské náměstí 820/41, 110 00 Praha 1 DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU Jednou z nejvhodnějších metod pro detekci minimální

Více

PŮVODCI INFEKČNÍ ENDOKARDITIDY. Jiří Beneš Infekční klinika 3. LF UK Nemocnice Na Bulovce, Praha

PŮVODCI INFEKČNÍ ENDOKARDITIDY. Jiří Beneš Infekční klinika 3. LF UK Nemocnice Na Bulovce, Praha PŮVODCI INFEKČNÍ ENDOKARDITIDY Jiří Beneš Infekční klinika 3. LF UK Nemocnice Na Bulovce, Praha Hradec Králové 25.2.2016 Valvular endothelium Patogeneze IE trauma, turbulence, metabolic changes Platelet-fibrin

Více

Diagnostika streptokoků

Diagnostika streptokoků Lékařská orální mikrobiologie Téma P - Diagnostika streptokoků Tabulka pro souhrn výsledků úkolů až 6 (k postupnému vyplnění) Kmen K L M N P Q R S T Gramovo barvení úkol č. Kataláza úkol a Slanetz-Bartley

Více

STAPHYtest 16. Doporučený pracovní postup pro STAPHYtest 16. Dodržujte zásady pro práci s infekčním materiálem! Pro mikrobiologii. Kat. č.

STAPHYtest 16. Doporučený pracovní postup pro STAPHYtest 16. Dodržujte zásady pro práci s infekčním materiálem! Pro mikrobiologii. Kat. č. CZ Kat. č.: 10003378 Pro mikrobiologii Souprava je určena pro identifikaci zástupců rodu Staphylococcus i dalších grampozitivních kataláza pozitivních koků. Souprava umožňuje provést identifikaci šedesáti

Více

kontaminovaných operačních výkonů, ale i u čistých operací, při kterých dochází k aplikaci

kontaminovaných operačních výkonů, ale i u čistých operací, při kterých dochází k aplikaci ANTIMIKROBNÍ PROFYLAXE Antibiotická profylaxe je aplikace vybraných antibakteriálních léčiv s cílem snížit výskyt infekcí v místě operačního výkonu. Použití profylaxe je indikováno nejen u kontaminovaných

Více

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KARCINOMU PANKREATU

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KARCINOMU PANKREATU Úvod IntellMed, s.r.o., Václavské náměstí 820/41, 110 00 Praha 1 DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KARCINOMU PANKREATU Jednou z nejvhodnějších metod pro detekci minimální reziduální

Více

Seznam protokolů 2012

Seznam protokolů 2012 Seznam protokolů 0. Protokol Danone 9..0 CPM Wilkins-Chalgren Agar M7 - Streptococcus thermophilus rod Bifidobacterium Wilkins-Chalgren Agar + mupirocin rod Lactobacillus Rogosa Agar Lactobacillus casei

Více

Polymerázová řetězová reakce

Polymerázová řetězová reakce Polymerázová řetězová reakce doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D. bartosm@vfu.cz Přírodovědecká fakulta MU, 2013 Obsah přednášky 1) Co je to PCR, princip, jednotlivé kroky 2) Technické provedení PCR 3) Fyzikální

Více

Automatizace v klinické mikrobiologii

Automatizace v klinické mikrobiologii Automatizace v klinické mikrobiologii 1Jaroslav Hrabák, 2Pavel Dřevínek 1Ústav mikrobiologie, Biomedicínské centrum, Lékařská fakulta a Fakultní nemocnice v Plzni, Univerzita Karlova 2Ústav lékařské mikrobiologie,

Více

BD BBL CHROMagar MRSA*

BD BBL CHROMagar MRSA* NÁVOD K POUŽITÍ MÉDIA NA MISCE URČENÁ K OKAMŽITÉMU POUŽITÍ PA-257308.01 Rev: Dec 2005 BD BBL CHROMagar MRSA* ÚČEL POUŽITÍ BBL CHROMagar MRSA je selektivní a diferenciační médium používané primárně pro

Více

Nové technologie v mikrobiologické laboratoři, aneb jak ovlivnit čas k získání klinicky relevantního výsledku

Nové technologie v mikrobiologické laboratoři, aneb jak ovlivnit čas k získání klinicky relevantního výsledku B I O M E D I C AL Nové technologie v mikrobiologické laboratoři, aneb jak ovlivnit čas k získání klinicky relevantního výsledku Jaroslav Hrabák CHARLES UNIVERSITY Obsah prezentace Historie, vývoj a trendy

Více

Analýza pohybu plicních ložisek: faktory, které ovlivňují přesné vymezení ITV. Lukáš Knybel Lukáš Molenda Jakub Cvek

Analýza pohybu plicních ložisek: faktory, které ovlivňují přesné vymezení ITV. Lukáš Knybel Lukáš Molenda Jakub Cvek Analýza pohybu plicních ložisek: faktory, které ovlivňují přesné vymezení ITV Lukáš Knybel Lukáš Molenda Jakub Cvek Cíle práce Vyhodnocení míry pohybů plicních ložisek Snaha o nalezení závislosti v mezi

Více

Málo obvyklé nemocniční nákazy

Málo obvyklé nemocniční nákazy Málo obvyklé nemocniční nákazy MUDr Věra Kůrková Ambulance v terénu Zubní ordinace Léčebny dlouhodobě nemocných Hospic Priony Virové NN Bakteriální NN Mykotické NN Parazitární NN Priony Jacob-Creutzfeldt

Více

INFEKČNÍ ENDOKARDITIDA. Jiří Beneš Klinika infekčních nemocí 3. LF UK Nemocnice Na Bulovce, Praha

INFEKČNÍ ENDOKARDITIDA. Jiří Beneš Klinika infekčních nemocí 3. LF UK Nemocnice Na Bulovce, Praha INFEKČNÍ ENDOKARDITIDA Jiří Beneš Klinika infekčních nemocí 3. LF UK Nemocnice Na Bulovce, Praha Praha, 27.11.2014 Incidence Epidemiologie 20. století: 1,5-4,5 /100.000 obyv./rok přelom století: 5-6 /100.000

Více

Přehledy citlivostí k antibiotikům r

Přehledy citlivostí k antibiotikům r Přehledy citlivostí k antibiotikům r. 2012-2013 Přehledy dle druhů materiálu: I. Přehledy citlivostí k nejčastějším respiračním patogenů II. Přehledy citlivostí k močovým patogenů III. Přehledy citlivostí

Více

Mykologická analýza potravin

Mykologická analýza potravin Mykologická analýza potravin a. Souhrn V roce 2010 byl zahájen druhý dvouletý cyklus nově uspořádaného Monitoringu dietární expozice člověka a tím i pozměněného projektu "MYKOMON". Vzhledem k detailnějšímu

Více

APLIKACE METAGENOMIKY PRO HODNOCENÍ PRŮBĚHU SANAČNÍHO ZÁSAHU NA LOKALITÁCH KONTAMINOVANÝCH CHLOROVANÝMI ETHYLÉNY

APLIKACE METAGENOMIKY PRO HODNOCENÍ PRŮBĚHU SANAČNÍHO ZÁSAHU NA LOKALITÁCH KONTAMINOVANÝCH CHLOROVANÝMI ETHYLÉNY APLIKACE METAGENOMIKY PRO HODNOCENÍ PRŮBĚHU SANAČNÍHO ZÁSAHU NA LOKALITÁCH KONTAMINOVANÝCH CHLOROVANÝMI ETHYLÉNY Monika Stavělová 1, Jakub Rídl 2, Maria Brennerová 3, Hana Kosinová 1, Jan Pačes 2 1 AECOM

Více

Problematika molekulárněmikrobiologické diagnostiky

Problematika molekulárněmikrobiologické diagnostiky Problematika molekulárněmikrobiologické diagnostiky Jaroslav Hrabák Téma jednání 1. Nepodkročitelná minima vybavení molekulárněmikrobiologické laboratoře Schválení dokumentu 1. Vzdělávání v molekulární

Více

ZDRAVOTNÍ NEZÁVADNOST POTRAVIN

ZDRAVOTNÍ NEZÁVADNOST POTRAVIN ZDRAVOTNÍ NEZÁVADNOST POTRAVIN Možnosti stanovení Listeria monocytogenes popis metod a jejich princip Mária Strážiková Aleš Holfeld Obsah Charakteristika Listeria monocytogenes Listerióza Metody detekce

Více

SOUHRN ÚDAJŮ O PŘÍPRAVKU

SOUHRN ÚDAJŮ O PŘÍPRAVKU sp.zn.sukls66153/2015 SOUHRN ÚDAJŮ O PŘÍPRAVKU 1. NÁZEV PŘÍPRAVKU Bactroban Nasal 20 mg/g nosní mast 2. KVALITATIVNÍ A KVANTITATIVNÍ SLOŽENÍ Mupirocinum calcicum 0,0645 g (což odpovídá mupirocinum 0,06

Více

Surveillance invazivního pneumokokového onemocnění v České republice 2013

Surveillance invazivního pneumokokového onemocnění v České republice 2013 Surveillance invazivního pneumokokového onemocnění v České republice 2013 Kozáková Jana NRL pro streptokokové nákazy Státní zdravotní ústav, Praha 26. Pečenkovy epidemiologické dny, 2014 Rok 2013 - Sedmý

Více

sepse = syndrom systémové zánětlivé odpovědi (SIRS) při infekci (SCCM/ACCP Consensus Conference 1992)

sepse = syndrom systémové zánětlivé odpovědi (SIRS) při infekci (SCCM/ACCP Consensus Conference 1992) Sepse sepse = syndrom systémové zánětlivé odpovědi (SIRS) při infekci (SCCM/ACCP Consensus Conference 1992) sepse = přítomnost ložiska bakteriální infekce v těle, ze kterého se uvolňují bakterie vyvolávající

Více

Sepse a infekční endokarditida Michal Holub

Sepse a infekční endokarditida Michal Holub Sepse a infekční endokarditida Michal Holub Klinika infekčních nemocí 1.LF UK a ÚVN Definice sepse a septického šoku (Sepsis-3) sepse = život ohrožující orgánová dysfunkce způsobená aberantní odpovědí

Více

Význam sekvenační analýzy v mikrobiologické diagnostice

Význam sekvenační analýzy v mikrobiologické diagnostice Význam sekvenační analýzy v mikrobiologické diagnostice Plíšková L., Kutová R., Bolehovská R., Ryšková L. ÚKBD, ÚKM FN Hradec Králové FONS 2012 Široké použití v mikrobiologii Identifikace mikroorganizmů

Více

Mikrobiologické diagnostické metody. MUDr. Pavel Čermák, CSc.

Mikrobiologické diagnostické metody. MUDr. Pavel Čermák, CSc. Mikrobiologické diagnostické metody MUDr. Pavel Čermák, CSc. Princip identifikace soubor ZNAKŮ s rozdílnou separační hodnotou S HODNOTA S: S 1 S 2 S 3 Základní problémy Minimum morfologických znaků Podobná

Více

Prezentace školy. 00216224 Masarykova univerzita Žerotínovo nám. 9, Brno, Jihomoravský kraj. Veřejná vysoká škola

Prezentace školy. 00216224 Masarykova univerzita Žerotínovo nám. 9, Brno, Jihomoravský kraj. Veřejná vysoká škola Prezentace školy 00216224 Masarykova univerzita Žerotínovo nám. 9, Brno, Jihomoravský kraj Veřejná vysoká škola Spolupráce MU s podniky Spolupráce s podniky Výzkum a vývoj Studenti Další vzdělávání Ostatní

Více

M KR K O R BI B OLO L GA

M KR K O R BI B OLO L GA SEPSE Z POHLEDU MIKROBIOLOGA Milan Kolář Ústav mikrobiologie LF UP a FNOL Sepse patří k nejzávažnějším infekčním onemocněním a nadále představuje velký terapeutický problém. Sepsi lze definovat jako systémovou

Více

MYKOLOGICKÁ ANALÝZA POTRAVIN

MYKOLOGICKÁ ANALÝZA POTRAVIN MYKOLOGICKÁ ANALÝZA POTRAVIN a. Souhrn V roce 2011 byl ukončen druhý dvouletý cyklus nově uspořádaného Monitoringu dietární expozice člověka a tím i pozměněného projektu "MYKOMON". Vzhledem k detailnějšímu

Více

Mikroskopie versus kultivace, kdy, komu a proč? Jan Kestřánek PGK, FNHK

Mikroskopie versus kultivace, kdy, komu a proč? Jan Kestřánek PGK, FNHK Mikroskopie versus kultivace, kdy, komu a proč? Jan Kestřánek PGK, FNHK Vulvovaginální dyskomfort Akutní vulvovaginální dyskomfort (AVD): obtíže v oblasti zevního genitálu a pochvy jako je výtok, svědění

Více

Filozofie validace. Je validace potřebná? Mezinárodní doporučení pro provádění validací ve forenzně genetických laboratořích

Filozofie validace. Je validace potřebná? Mezinárodní doporučení pro provádění validací ve forenzně genetických laboratořích INVESTICE DO ROZVOJE VZDĚLÁVÁNÍ Vzdělávání v oblasti forenzní genetiky reg. č. CZ.1.07/2.3.00/09.0080 Mezinárodní doporučení pro provádění validací ve forenzně genetických laboratořích INVESTICE DO ROZVOJE

Více

MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÉ METODY V ENVIRONMENTÁLNÍ MIKROBIOLOGII. Martina Nováková, VŠCHT Praha

MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÉ METODY V ENVIRONMENTÁLNÍ MIKROBIOLOGII. Martina Nováková, VŠCHT Praha MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÉ METODY V ENVIRONMENTÁLNÍ MIKROBIOLOGII Martina Nováková, VŠCHT Praha MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE V BIOREMEDIACÍCH enumerace FISH průtoková cytometrie klonování produktů PCR sekvenování

Více

DETEKCE A IDENTIFIKACE FYTOPATOGENNÍCH BAKTERIÍ METODOU PCR-RFLP

DETEKCE A IDENTIFIKACE FYTOPATOGENNÍCH BAKTERIÍ METODOU PCR-RFLP DETEKCE A IDENTIFIKACE FYTOPATOGENNÍCH BAKTERIÍ METODOU PCR-RFLP Polymerázová řetězová reakce (PCR) je in vitro metoda pro enzymatickou syntézu definované sekvence DNA. Reakce využívá dvou oligonukleotidových

Více

AKTUÁLNÍ DOPORUČENÍ MIKROBIOLOGICKÉ DIAGNOSTIKY A ANTIBIOTICKÉ LÉČBY INFEKČNÍ ENDOKARDITIDY 21ST COLOURS OF SEPSIS, OSTRAVA

AKTUÁLNÍ DOPORUČENÍ MIKROBIOLOGICKÉ DIAGNOSTIKY A ANTIBIOTICKÉ LÉČBY INFEKČNÍ ENDOKARDITIDY 21ST COLOURS OF SEPSIS, OSTRAVA AKTUÁLNÍ DOPORUČENÍ MIKROBIOLOGICKÉ DIAGNOSTIKY A ANTIBIOTICKÉ LÉČBY INFEKČNÍ ENDOKARDITIDY 21ST COLOURS OF SEPSIS, OSTRAVA Jiří Sagan Klinika infekčního lékařství FN Ostrava a LF OU Aktuální doporučení

Více

ODLIŠENÍ ODRŮD PŠENICE OBECNÉ TRITICUM AESTIVUM L. METODOU RAPD

ODLIŠENÍ ODRŮD PŠENICE OBECNÉ TRITICUM AESTIVUM L. METODOU RAPD ODLIŠENÍ ODRŮD PŠENICE OBECNÉ TRITICUM AESTIVUM L. METODOU RAPD Distinguishing of Wheat Varieties (Tritium aestivum L.) by Method RAPD Zuzana Kohutová, Zuzana Kocourková, Hana Vlastníková, Petr Sedlák

Více

ACTA UNIVERSITATIS AGRICULTURAE ET SILVICULTURAE MENDELIANAE BRUNENSIS SBORNÍK MENDELOVY ZEMĚDĚLSKÉ A LESNICKÉ UNIVERZITY V BRNĚ

ACTA UNIVERSITATIS AGRICULTURAE ET SILVICULTURAE MENDELIANAE BRUNENSIS SBORNÍK MENDELOVY ZEMĚDĚLSKÉ A LESNICKÉ UNIVERZITY V BRNĚ ACTA UNIVERSITATIS AGRICULTURAE ET SILVICULTURAE MENDELIANAE BRUNENSIS SBORNÍK MENDELOVY ZEMĚDĚLSKÉ A LESNICKÉ UNIVERZITY V BRNĚ Ročník LV 1 Číslo 2, 2007 Identifikace a charakterizace bakterií rodu Enterococcus

Více

Molekulárně biologické a cytogenetické metody

Molekulárně biologické a cytogenetické metody Molekulárně biologické a cytogenetické metody Molekulárně biologickému vyšetření obvykle předchází na rozdíl od všech předcházejících izolace nukleových kyselin, což je ve většině případů DNA jako nositelka

Více

,,Příloha č. 1 k vyhlášce č. 381/2007 Sb.

,,Příloha č. 1 k vyhlášce č. 381/2007 Sb. ,,Příloha č. 1 k vyhlášce č. 381/2007 Sb. Částka 125 Sbírka zákonů č. 387 / 2008 Strana 6003 Strana 6004 Sbírka zákonů č. 387 / 2008 Částka 125 Částka 125 Sbírka zákonů č. 387 / 2008 Strana 6005 Strana

Více

Indikace přípravku Zetamac v ordinaci praktického lékaře

Indikace přípravku Zetamac v ordinaci praktického lékaře Indikace přípravku Zetamac v ordinaci praktického lékaře MUDr. Igor Karen 13.10. 2009 Zetamac léková forma azithromycinum 2g granule s prodlouženým uvolňováním pro přípravu perorální suspenze s příchutí

Více