Raritní infekce identifikované soupravami ErbaLachema v ONP Příbram

Transkript

1 Raritní infekce identifikované soupravami ErbaLachema v ONP Příbram Petr Ježek Oblastní nemocnice Příbram,a.s. Spoluautoři: Petr PetrášNRL pro stafylokoky,szú Praha Pavel ŠvecCCM,MU Brno Josef ScharfenNRL pro patogenní aktinomycety, Oblastní nemocnice a.s. Trutnov

2 Úvod Zvyšující se výskyt podmíněně patogenních nebo nových druhů mikroorganismů 1. Zavedení molekulárně biologických metod taxonomické změny 2. Zlepšující se diagnostika rutinních laboratoří 3. Pokroky v medicíněvyšší přežívání pacientů 4. Zvyšující se výskyt imunosuprimovaných pacientů 5. Stále se zvyšující věk populace Lednice 6/2012 2

3 1.Helcococcus kunzii Pacient č.1 žena,53 let,v III/2007 operace plochonoží na PDK,vytvořen pakloub a t.r. ještě reoperace. Po té řada reoperací až do VI/2011kdy:výrazný otok s defektem cca 30x30mm na dorzut.č. ještě bez ATB Bez mikrobiol.vyšetření a bez ATB v VIII/2011 přijata na CHIR dle RTG = susp.osteomyelitis Hnis na mikrobiolog.vyš. = Kl.oxytoca Ko za týdenvyjmutí uvolněného K drátu Mikrobiol.. VyšetřeníK K drát redon Empiricky cotrimoxazol 2x 960mg,potom koaminopnc 2x1.2g bez výrazného efektu Lednice 6/2012 3

4 1.Helcococcus kunzii Mikrobiol.nález.nález=Kl. =Kl.oxyto ca,st.,st.pseudinter medius,h.kunzii Dle výsledku citlivosti nasazen klindamycin 4x300mg po dobu 25 dní Doplňující léčba:iruxol a Askina krytí Defekt vyléčen a pac. dosud bez obtíží Foto P.Čapek Lednice 6/2012 4

5 Mikrobiologický nález Nález Rána 21.8 Rána Redon Klebsiella oxytoca Staphylococcus pseudintermedius Helcoccus kunzii Lednice 6/2012 5

6 1.Helcococcus kunzii Pacient č.2muž,83 let,se zhnisaným ateromem v oblasti zad Ambulantně excize stěr na mikrobiol.vyš. Pacient zhojen p.p. bez ATB Mikrobiol.. nález:h.kunzii H.kunziiSt. St.epidermidis Lednice 6/2012 6

7 Mikrobiologie M.D.Colins a kol.(1993) G,CAT,fakultativně anaerobní koky v párech event. hloučcích Kolonie transparentní nehemolytické(event.sla bě α) Typické testy:pyr,lap PYR,LAP Výskyt:dolní extremity s poruchou krvení Etiolog.účast:nen ast:není plně objasněna na Kultura H.kunzii na KA. Foto P.Ježek Lednice 6/2012 7

8 8 Identifikace Streptotest24 Identifikace Streptotest24ErbaLachema ErbaLachema S06 S06 PHS PHS ARG ARG aga aga CAT CAT PUL PUL bga bga VPT VPT LAC LAC bgl bgl SOE SOE RIB RIB GLR GLR TRE TRE MLB MLB bmn bmn RAF RAF SOR SOR LAP LAP MLT MLT MAN MAN NAG NAG TGT TGT INU INU NT NT HIP HIP AMG AMG ESL ESL PYR PYR Pac Pac.2.2 Pac Pac.1.1 Pac Pac.2.2 Pac Pac.1.1 Pac Pac.2.2 Pac Pac.1.1

9 Identifikace:Streptotest24ErbaLachema Pacient č.1 Identif.skóre Tindex Pacient č.2 Identif.skóre Tindex Helcococcus kunzii 89, Helcococcus kunzii 89, Abiotrophia adiacens 8, Abiotrophia adiacens 8, Alloiococcus otitis 2, Alloiococcus otitis 2, Pacient č.1:neidentifikováno Pacient č.2:neidentifikováno Lednice 6/2012 9

10 Identifikace dalšími metodami Metoda Pacient 1 Pacient 2 Hmotnostní spektrofotometrie Helcococcus kunzii Helcococcus kunzii reppcr (GTG) 5 Helcococcus kunzii NT Lednice 6/

11 2.Oligella urethralis Pacient:žena,56 letv v gynekologické ambulancicysta cysta labia velikosti cca 2x1cm v oblasti mediální strany pravého labia major Přítomnost cca 10 letbez klinických ani subjektivních obtíží Provedena hysteroskopie,frakcionovaná kyretáž exstirpace cysty Okolí klidné,obsah cysty nažloutlé barvy Hojení p.p. bez ATB Lednice 6/

12 Mikrobiologie Lautrop a kol.(1970) Moraxella like org. Později M.urethralis uveřejněný popis odpovídá popisu deborda (1942)řadí ji do č.mimae Rossau a kol.(1987)=samostat samostatný druh a rod r.oligella řazen do č.alcaligenaceae Kultura O.urethralis na KA.Foto P.Ježek Lednice 6/

13 Mikrobiologie G drobné koky nebo kokobacily ve dvojicích Růst:Aerobní,nenáročné na KA i MC Kolonie:KAžlutavé, mazlavé,nehemolytic nehemolytické Biochemicky málo aktivní OXI a většinou i CAT Výskyt:urogenitální aparát a moč Patogenita:zřejmě nízká O.urethralis,barvení Gram,zvětšeno 1000x.Foto P.Ježek Lednice 6/

14 Identifikace NEFERMTest24ErbaLachema ErbaLachema Taxon Oligella urethralis Comamonas testosteroni Moraxella canis Alcaligenes faecalis Moraxella caprae Bordetella hinzii Identifikační skóre 95,11 3,08 0,87 0,23 0,15 0,15 Tindex 0,65 0,41 0,45 0,23 0,33 0,20 Velmi dobrá identifikace 14

15 15 15 Identifikace NEFERMTest24 Identifikace NEFERMTest24 ErbaLachema ErbaLachema NO NO 2 SUC SUC NO NO 3 INO INO 42 C 42 C GAL GAL FRU FRU 37 C 37 C CEL CEL GLU GLU SCI SCI XYL XYL LYS LYS TRE TRE MAN MAN URE URE MLT MLT NAG NAG ARG ARG LAC LAC bgl bgl IND IND GGT GGT bga bga CAT CAT ESL ESL PHS PHS OXI OXI

16 Identifikace dalšími metodami Hmotnostní spektrofotometrie Oligella urethralis reppcr neprovedeno Lednice 6/

17 3.Campylobacter fetus ssp.. fetus Pacient:muž,75 let,přijat na INT pro bolesti na hrudi a dyspnoické problémy A:ICHS,stav po IM,těžká dysfunkce levé komory,kardiostimulátor,dm,chron chron.ren.selhání v predialyzačním stadiu Při přijetí:dyspnoe dyspnoe,bolest v oblasti sterna a epigastria,suchý kašel,bez T,normotenzní,při námaze dušnost, dehydrován,vpravo bazálně s chrůpky RTGobjemný levostranný fluidothorax, Laboratoř:FW82/h,CRP208, CRP208,PCT PCT 1,6µg/l,leu12,4x10 9 /l Mikrobiologie:3xHEmoč,sputum,sputumnelze ATB:ampicilin/sulbactam4,5g/d a klarithromycin 1g/d Lednice 6/

18 3.Campylobacter fetus ssp.. fetus Druhý den: klin.stav bez vývoje, Laboratoř:CRP 346,leu 11,9x10 9 /l,ostatní bez pohybu Provedena hrudní pce:cca 60ml slámově žluté zakalené tekutiny,ukončena pro nespolupráci pacientaodesláno na mikrobiologii(aerobně!) Třetí den:exitus exitus v ranních hodinách Mikrobiologie: v HE Campylobacter fetus ssp. fetus post mortem Lednice 6/

19 Mikrobiologie McFadyean a Stockman (1909)z hovězího dobytka Vinzent a kol.(1947) poprvé u člověka (septikémie) = Vibrio fetus Véron a Chatelain(1973) a Simbert (1974) revize taxonomického postavení = Campylobacter fetus Lednice 6/

20 Mikrobiologie Campylobacter fetus 2 poddruhy ssp.fetus ssp.venerealis Význam:veterinární medicínainfekční infekční zmetání skotu a ovcí a infekční infertilita skotu Člověk:septikémie,infikované aneurysma, celulitida,endokarditida,spondylodiscitida spondylodiscitida,osteo myelitida,cns infekce,potraty aj. Reptilelike like kmeny u plazů,epidemiologicky zřejmě nevýznamné Lednice 6/

21 Mikrobiologie Vyšetření:v HE po 5 dnech GG spirálovité drobné tyčky,z anaerobní kultivace na Schaedler.a. Punktát DH=negativní Moč = negativní Koloniedrobné, transparentní,bez hemolýzy,růst i mikroarofilně Biochemie = chudá C.f.ssp.fetus,barvení gram,zvětšeno 1000x.Foto P.Ježek Lednice 6/

22 22 22 Identifikace Anaerotest23 Identifikace Anaerotest23 ErbaLachema ErbaLachema MNS MNS URE URE 42 C 42 C ESL ESL MLZ MLZ R k. k.nalidixová nalidixová bgl bgl LAC LAC R metronidazol metronidazol NAG NAG GAL GAL R cefoperazon cefoperazon RHA RHA FRU FRU SOR SOR MAN MAN MLT MLT ARA ARA TRE TRE GLU GLU XYL XYL SAL SAL IND IND CEL CEL SUC SUC OXI OXI RAF RAF NIT NIT CAT CAT Test Test Test Test Test Test

23 Identifikace Anaerotest23 ErbaLachema Taxon Campylobacter gracilis Bacteroides ureolyticus Veilonella parvula Eubacterium lentum Fusobacterium nucleatum Porphyromonas asacharolytica Identifikační skóre 95,08 3,38 1,31 0,16 0,04 0,01 Velmi dobrá identifikace Tindex 1,0 0,78 0,69 0,55 0,45 0,37 Lednice 6/

24 Identifikace dalšími metodami Hmotnostní spektrofotometrie reppcr s primerem (GTG) 5 Campylobacter fetus bez zařazení do ssp. Lednice 6/

25 Shluková analýza reppcr s primerem (GTG) 5 Podobnost (%) CCM 5682 CCM 6213 CCM 5993 CCM 3951 T CCM 5681 CCM 5683 CCM 6210 HE 119 CCM 5992 C. fetus subsp. fetus C. fetus subsp. fetus C. fetus venerealis subsp. C. fetus subsp. venerealis C. fetus subsp. venerealis C. fetus subsp. fetus C. fetus subsp. fetus C. fetus subsp. venerealis p.švecccm,přf MU Brno Lednice 6/

26 4.Varibaculum cambriense Pacient:muž,68 let,dlouhodobě léčen pro acne rosacea s chronickým zánětem víček na ORL ambulanci s otokem tváře a víček vpravo po vymáčknutí furunkulutuhý infiltrát Incizemalé množství sanquinolentní tekutiny a bělavá hmota Stěr na mikrobiolog.vyšetření Sutura s drénem(24 hod.) Terapie:ko koaminopnc 2x1,2g Rána zhojena p.p.,pacient bez obtíží Lednice 6/

27 Mikrobiologie V.Hall a kol.(2003)jediný druh rodu Varibaculum Taxonomie: č.actinomycetaceae Fylogenetická příbuznost: r.actinomyces Actinomyces, r.arcanobacterium Arcanobacterium,r.,r.Actinobaculum, r.mobiluncus Lednice 6/

28 Mikrobiologie G rovné nebo difteroidní tyčky rostoucí anaerobně obvykle za 48 hod. Kolonie:malé,konvex konvex ní,transparentní a nehemolytické (Schaedler agar) CAT,GLU,SAC,RIB Výskyt:vzácně v abscesech s různou lokalizací a IUD Přirozený výskyt není znám V.cambriense,barvení Gram,zvětšeno 1000x.Foto P.Ježek Lednice 6/

29 29 29 Identifikace ANAEROTest23 Identifikace ANAEROTest23 ErbaLachema ErbaLachema SOR SOR NAG NAG MLZ MLZ ARA ARA RHA RHA LAC LAC XYL XYL MAN MAN GAL GAL CEL CEL TRE TRE FRU FRU RAF RAF SAL SAL / / MLT MLT / / MNS MNS SUC SUC GLU GLU ESL ESL NIT NIT IND IND bgl bgl URE URE CAT CAT

30 Identifikace ANAEROTest23 ErbaLachema Taxon Actinomyces odontolyticus Actinomyces meyeri Clostridium botulinum b.a Atopobium minutum Peptostreptococcus anaerobius Prevotella disens Identifikační skóre 99,53 0,35 0,04 0,03 0,02 0,01 Tindex 0,75 0,33 0,16 0,19 0,05 0,00 Velmi dobrá identifikace 30

31 Identifikace dalšími metodami NRL pro patogenní aktinomycety Sekvenace genu 16Sr RNA Varibaculum cambriense Lednice 6/

32 32 32 Závěr Závěr doplnit doplnit neidentifikován neidentifikován není není Varibaculum Varibaculum cambriense cambriense doplnit doplnit neidentifikován neidentifikován není není Campylobacter Campylobacter fetus fetus ssp ssp. fetus. fetus žádné žádné identifikován identifikován ano ano Oligella urethralis Oligella urethralis?????? identifikován identifikován ano ano Helcococcus Helcococcus kunzii kunzii doporučení doporučení výsledek výsledek identifikace identifikace databáze databáze taxon taxon

33 Závěr Pravděpodobnost zvyšujícího se výskytu raritních či méně často vyskytujících nebo nových druhů mikroorganismů v klinickém materiále Potřebnost pravidelného doplňování databází v diagnostických soupravách Využívání jiných metod identifikace 33

34 34