VÝZKUMNÝ ÚSTAV ŽIVOČIŠNÉ VÝROBY,

Rozměr: px

Začít zobrazení ze stránky:

Download "VÝZKUMNÝ ÚSTAV ŽIVOČIŠNÉ VÝROBY,"

Zdeněk Esterka
před 4 lety
Počet zobrazení:

1 VÝZKUMNÝ ÚSTAV ŽIVOČIŠNÉ VÝROBY, Praha Uhříněves TDM METODIKA PRO PRAXI

3 VÝZKUMNÝ ÚSTAV ŽIVOČIŠNÉ VÝROBY, Praha Uhříněves doc. ing. Josef Bouška, CSc. ředitel METODIKA odhadu plemenných hodnot dojných koz v ČR pomocí Test-Day Animal Modelu (TDM) METODIKA PRO PRAXI výstup k projektu MZe ČR QC 1235 Ing. Gabriel Ciappesoni, PhD. Ing. Michal Milerski, Ph.D. Technická spolupráce Božena Hofmanová 2004

5 OBSAH Úvod 3 Preevaluační část 3 Zdroje dat 3 Hodnocené vlastnosti 3 Úpravy dat 3 Zohledněné systematické vlivy 4 Evaluační část 5 Metoda odhadu plemenných hodnot 5 Modelové rovnice 5 Program pro odhady plemenných hodnot 5 Variance a kovariance 5 Závěr 6 Příloha 7

7 ÚVOD TDM umožňuje porovnání denní užitkovosti zvířete s ostatními kozami ve stádě ve dni kontroly, což umožňuje provádět odhady plemenných hodnot zvířat dříve a přesněji v porovnání s hodnocením celých uzavřených laktací. Tento systém dále umožňuje rovněž provést optimalizaci počtu a načasování kontrolních měření. Výzkumy v Kanadě (Chesnais a Sullivan, 1994) dokázali že odhad PH mléčné užitkovosti na základě získaných údajů z 3 kontrol (TD) dosáhli 95% přesnosti odhadu na základě 10 TD. Tato skutečnost by mohla umožnit snížit počet kontrol a náklady na kontrolu užitkovosti, případně zvýšit počet testovaných zvířat, což by mělo celkově větší vliv na šlechtění populace než malá ztráta přesností u jednotlivých zvířat. POSTUP ODHADŮ PLEMENNÝCH HODNOT 1. Preevaluační část A) Zdroje dat Základem pro odhady plemenných hodnot jsou údaje z databáze KU. informace obsažené v následujících databázových souborech. Chm(rok).dbf - záznamy z kontrolních dnů Chr(rok).dbf - datum okozlení, počet kůzlat ve vrhu Chd(rok).dbf - datum narození kozy, plemeno Chmatka.dbf - rodokmen Chotec.dbf - rodokmen Jsou využity B) Hodnocené vlastnosti Denní nádoj mléka v kg Procentický obsah tuku v mléce v % Procentický obsah bílkovin v mléce v % 3

8 C) Úpravy dat Kontrola dat z KU je prováděná s cílem vyloučení logicky nebo biologicky nehodnověrných údajů. Zhrnuje následující podmínky: Kritéria Jednotka Min. Max. Denní nádoj Kg Tuk % % Bílkoviny % % Dny laktace (DIM) Dny Věk kozy roky Věk při 1. okozlení Dny 275 Poznámka: zvýšenou pozornost je potřeba věnovat označování koz podle vyhlášky 154/2000 Sb., č. 166/99 s cílem omezení chybných původů a duplicit čísel. D) Zohledněné systematické vlivy 1. Plemeno odhady jsou prováděny zvlášť pro Bílou krátkosrstou kozu a Hnědou krátkosrstou kozu. 2. Pořadí laktace chybí záznamy v databázi, proto se určuje se na základě věku kozy. Byly vyčleněny 4 kategorie - 1 rok, 2 roky, 3 roky, 4 a více let. 3. Počet kůzlat ve vrhu. 3 kategorie 1, 2, 3 a více kůzlat. 4. Efekt kontrolního dne v daném stádě (test day) 5. Efekt období okozlení 5 kategorií prosinec a leden - únor - březen - duben - květen až listopad Pro úpravy a přečíslování dat jsou použity programy SAS a RENUM. (viz. Příloha 1) 4

9 2. Evaluační část A) Metoda odhadu plemenných hodnot Multitrait Test-Day Animal Model s pevnou regresí pomocí legenrových polynomialů na DIM uvnitř kategorií zvířat. B) Modelová rovnice y ijklmo = htd i + kid k + s lj + a m + p m + e ijklmo kde: y ijklmo - naměřená užitkovost htd i - kontrolní den (náhodný vliv) kid k -počet kůzlat ve vrhu (pevný efekt) s lj a m p m e ijklmo - pevná regrese na dny laktace uvnitř pořadí laktace a období okozlení - individuální genetický efekt jedince (plemenná hodnota náhodný efekt) - trvalý efekt prostředí jedince (náhodný efekt) - náhodná chyba s lj = a. p0 + b. p1+ c. p2 + d. p3 p0 = 1 p1 = z p2= 0.5 (3z 2-1) p3 = 0.5 (5z 3-3z) z =( 2(DIM-10)/290) -1 C) Program pro odhady plemenných hodnot BLUPF90 D) Variance a kovariance Poznámka: denní nádoje mléka byly násobeny * 10 a obsahy mléčných složek * 100 Náhodné reziduální variance a kovariance ml tuk bílk ml tuk bílk Variance a kovariance Kontrolní den ml tuk bílk ml tuk bílk

10 Variance a kovariance trvalý efekt prostředí ml tuk bílk ml tuk bílk Variance a kovariance individuální genetický efekt jedince ml tuk bílk ml tuk bílk (Poznámka: tato údaje budou dále aktualizovány) ZÁVĚR Metodika byla zpracována v rámci řešení Projektu MZe č. QC Je určená pro Svaz chovatelů ovcí a koz c ČR. 6

11 Příloha 1: Pořadí činnosti při odhadech genetických parametrů a plemenných hodnot. KU dojných koz P R O G R A M Y Svaz chovatelů ovcí a koz ChmYEAR.dbf ChrYEAR.dbf ChdYEAR.dbf ChlYEAR.dbf Chmatka.dbf Chotec.dbf SAS proc import merge proc export production.sas variable.sas permanent.sas production.txt variable.txt permanent.txt SAS proc import merge proc means TOTAL.sas No_prod.txt oldped.txt SAS proc GLM total.txt GLM.sas pedigree.sas ped.txt SAS proc import freq prepreml.sas prepblup.sas prodwg.prn pedwg.prn prodwg.prn pedwg.prn RENUMMAT REMLF90 renum_ped.prn renum_prod.prn coments solutions renum_prod.prn renum_ped.prn Genetické parametry BLUPF90 coments PH solutions 7

13 Vydal: Výzkumný ústav živočišné výroby Přátelství 815, Praha Uhříněves Název: Metodika odhadu plemenných hodnot dojných koz v ČR pomocí Test-Day Animal Modelu (TDM). Autor: Ing. Gabriel Ciappesoni, PhD. Ing. Michal Milerski, Ph.D. Vydáno bez jazykové úpravy. METODIKA vychází z výsledků řešení projektu MZe ČR QC 1235 Výzkumný ústav živočišné výroby, Praha Uhříněves

Podobné dokumenty

Popis modelu pro odhady PH mléčné užitkovosti

Popis modelu pro odhady PH mléčné užitkovosti Zvířata zařazená do hodnocení V modelu plemene H jsou hodnoceny krávy s podílem krve H nebo 75% a výše. V modelu plemene C jsou hodnoceny krávy s podílem krve