Evropská databáze typizačních znaků biologických agens. Libor Píša Ústřední vojenský zdravotní ústav Praha

Rozměr: px

Začít zobrazení ze stránky:

Download "Evropská databáze typizačních znaků biologických agens. Libor Píša Ústřední vojenský zdravotní ústav Praha"

Věra Králová
před 8 lety
Počet zobrazení:

1 Evropská databáze typizačních znaků biologických agens Libor Píša Ústřední vojenský zdravotní ústav Praha

2 Obsah prezentace 2 Cíle projektu Evropské obranné agentury (EDA) Řešitelé projektu Studované bakteriální druhy Použité typizační metody Tvorba databáze BioNumerics Výsledky projektu Navazující EDA projekt Závěr

bakteriální druhy Použité typizační metody Tvorba

3 3 Establishment and Management of a Common Database of B-agents - A European Biodefence Laboratory Network Cíle projektu shromáždění identifikačních a typizačních dat vybraných vysoce rizikových či rizikových biologických agens do formy použitelné databáze navázání spolupráce mezi laboratořemi a vytvoření sítě biolaboratoří zkvalitnění reakce relevantních složek (civilních i vojenských) na biologické hrozby Projekt obranného výzkumu MO Biodefence Označení EDA projektu: B-0060-ESM4-GC ( )

použitelné databáze navázání spolupráce mezi laboratořemi a vytvoření sítě biolaboratoří zkvalitnění reakce relevantních

4 European Biodefence Laboratory Network 4 Členský stát Organizace Zástupce Belgie Univ. Catholique de Louvain à Louvain-La-Neuve Jean-Luc GALA Česká republika FVZ UO Hradec Králové, ÚVZÚ Praha, SÚJCHBO Kamenná Aleš MACELA Finsko Centre for Military Medicine, Helsinki Simo NIKKARI Francie Ministère de la Défense, DGA_MNRBC, Vert le Petit/DGA_MRIS, Bagneux, Gilles VERGNAUD Itálie Army Medical Research Center, Roma Florigio LISTA Německo Bundeswehr Institute of Microbiology, München Wolf SPLETTSTÖESSER Nizozemí TNO Defence, Security and Safety, Delft Hugo-Jan JANSEN Norsko Norwegian Defence Research Establishment Jaran OLSEN Polsko Military Institute of Hygiene and Epidemiology, Pulawy Marcin NIEMCEWICZ Rakousko BMLV/ARWT/ABCUT, Mödling Adelheid OBWALLER Španělsko La Maranosa Technological Center, Ministry of Defence, Madrid Ricela SELEK CANO Švédsko Swedish Defence Research Agency, FOI, Umeå, Mats FORSMAN

Francie Ministère de la Défense, DGA_MNRBC, Vert le Petit/DGA_MRIS, Bagneux, Gilles VERGNAUD Itálie Army Medical Research Center, Roma Florigio LISTA Německo Bundeswehr Institute of Microbiology,

5 Studované bakteriální taxony 5 Bacillus anthracis (IT) Bacillus cereus group (NO) Brucella species (FR & IT) Burkholderia species (GE) Francisella tularensis (SE) Yersinia pestis (FR) Yersinia pseudotuberculosis (FI) Coxiella burnetii (GE) Clostridium botulinum (NO) Legionella pneumophila (AT) Vibrio cholerae (PL) V závorce koordinátorská země

Yersinia pestis (FR) Yersinia pseudotuberculosis (FI) Coxiella burnetii (GE)

6 Použité identifikační metody 6 Genotypické 16S rrna 23S rrna MLVA SNPs MLST celogenomové sekvenování Fenotypické Kultivace Biochemické API Vitek Biolog MS (MALDI TOF, SRM)

7 Postup tvorby databáze 7 VRC verified reference collection ověřená referenční sbírka RCU reference collection upgrade nástavba referenční sbírka

8 8

9 9 Databáze BioNumerics

10 Srovnání rozlišovací schopnosti metod 10 16S rrna 23S rrna Biolog MLST MLVA MALDI-TOF

11 11 Evropská databáze typizačních znaků biologických agens výsledky projektu shromáždění identifikačních a typizačních dat vybraných biologických agens vytvoření databáze: výběr vhodné identifikační metody pro daný druh a validace nových identifikačních kitů/metod na přesně definovaném panelu referenčních kmenů nástroj k určení neznámého agens a určení původu identifikovaného agens (zdroj, přirozený výskyt vs. bioterorismus ) fylogenetické studie (určení příbuznosti, evoluční vzdálenosti) vytvoření sítě biolaboratoří

kitů/metod na přesně definovaném panelu referenčních kmenů nástroj k určení neznámého agens a určení původu identifikovaného agens

12 Navazující EDA projekt EBLN II 12 předložen a schválen návrh projektu zahrnuje pokračování v budování databáze rozšíření o viry především postaven na celogenomovém sekvenování stejné konsorcium účast ČR?

13 Význam projektu pro ČR 13 spolupráce vojenských a civilních laboratoří biologické ochrany v rámci ČR projekt umožnil komunikaci se zahraničními pracovišti projekt umožnil přístup ČR k unikátní databázi vznikající v rámci projektu EDA rozvoj nových technik a metodik typizace (MLST, SRM, imunologie)

pracovišti projekt umožnil přístup ČR k unikátní databázi vznikající v

14 Oficiální závěr EDA projektu (Executive summary of the EDA project Database B ) 14 The most important achievement in this project is the design and construction of a shared database with reference typing data and definition of reference strain panels that can be used for validation of diagnostic tests, identification methods and biodefence instruments or technologies. In addition, the project has led to increased integration of EU biodefence laboratories, increased reach-back capability and support to the BIOEDEP program, improved tools for B-DIM and epidemiological investigation, improved microbiological forensic capability, increased understanding on possibilities and limitations with different microbiological analysis methods and many publications in peer reviewed scientific journals.

In addition, the project has led to increased integration of EU biodefence laboratories, increased reach-back capability and support to the BIOEDEP program, improved tools for B-DIM and

Fakulta vojenského zdravotnictví, Univerzita obrany, Hradec Králové, CZ: Martin Hubálek Aleš Macela Lenka Hernychová Klára Kubelková Poděkování ÚVZÚ, Praha, CZ:

Umea, SE: Mats Forsman Per Wikstrom TNO, Rijswijk, NL: Armand Pauw 15 DĚKUJI ZA POZORNOST Prezentace zpracována s podporou POV Spektrometrie OVUVZU2010001

15 Fakulta vojenského zdravotnictví, Univerzita obrany, Hradec Králové, CZ: Martin Hubálek Aleš Macela Lenka Hernychová Klára Kubelková Poděkování ÚVZÚ, Praha, CZ: Jiří Dresler, Věra Neubauerová, Veronika Formánková SÚJCHBO, Kamenna,CZ: Michal Dřevínek, Hanka Placáková, Jitka Kalíková MIHE, PL: Marcin Niemczevicz, FOI, Umea, SE: Mats Forsman Per Wikstrom TNO, Rijswijk, NL: Armand Pauw 15 DĚKUJI ZA POZORNOST Prezentace zpracována s podporou POV Spektrometrie OVUVZU Applied Math, Sin-Martins- Latem, BE: Koen Jansen, Bruno Pot Bundeswehr Institute of Microbiology, Munich, GE: Wolf Spletstoesser, Eric Seibold, Julia Riehm, Holger Scholz

Podobné dokumenty

Svalová dystrofie. Prezentace technologických řešení registru Petr Brabec

Svalová dystrofie. Prezentace technologických řešení registru Petr Brabec Svalová dystrofie Prezentace technologických řešení registru Petr Brabec ABOUT IBA MU About IBA Academic institute -> Established in 2001 -> 45 employees -> 65 scientific projects Structure -> Data analysis