Mikroskopie živé neznačené buňky: Mikroskop jako informační kanál

Rozměr: px
Začít zobrazení ze stránky:

Download "Mikroskopie živé neznačené buňky: Mikroskop jako informační kanál"

Transkript

1 Mikroskopie živé neznačené buňky: Mikroskop jako informační kanál Dalibor Štys Škola komplexních systémů Nové Hrady

2 Akademické a univerzitní centrum Nové Hrady Academic and university center Nové Hrady Founded 2000 by a group led by vice-president of Weizman institute Avigdor Scherz Currently one unsuccessfull application to European Research Council grant Instiitute of Science and Technology Austria in Klosterneuburg Founded by a group led by former president of Weizman institute Haim Harari Currently 10 grants awarded by European Research Council

3 Poděkování studentům letních škol, kteří bývají sponzorováni řadou různých projektů strukturálních fondů EU

4 Živé systémy jsou nejzjevnějším příkladem samoorganizující komplexních systémů a jsou založené na chemo-mechanických jevech. Podobné problémy jsou řešeny při popisu samoorganizujících technických systémů jako jsou sítě, počítačové sémantické struktury apod. Společným problémem při jejich studiu je otázka jak měřit experimentálně pozorovatelnou samoorganizaci?

5 Systémová biologie Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Současná systémová biologie se snaží kvantifikovat co nejvíce látek ve studovaném biologickém objektu. Biologické objekty ale nejsou pytlíky s chemikáliemi, mají svou trojrozměrnou strukturu. Struktura biologických objektů je udržována dynamickými ději. Biologické objekty jsou sobě podobné a Ljapunovovsky / asymptoticky (?) stabilní. Cílem mikroskopie živé buňky kvantitativního zobrazování - (z pohledu termodynamiky) je hledání makroskopických proměnných v chemomechanickém prostoru, které buňku nebo její části správně charakterizují. KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes Urban J., Vaněk J., Soukup J. and Štys D., Expertomica Metabolite Profiling: Getting more information from LC- MS using the stochastic systems theory approach, (2009) Bioinformatics 25, Urban J, Hrouzek P. and Štys D., Time alignmnent in HPLC-MS 2012 Lambert Academic Publishing, ISBN:

6 Systémová biologie Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita

7 Systémová biologie Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita

8 Systémová biologie Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita

9 Mikroskopie živé buňky zvětšení 18 století 19 století Airy difrakční disk Abbe koncept kondenzoru, difrakční limit Koch barvení buněk 1934 Zernike Mikroskopie s fázovým kontrastem Konfokální mikroskop mechanické omezení budícího svazku 1969 Reynolds - mikroskopie s videozesílením 1990 současnost: mnoho druhů mikroskopů se superrozlišením, zejména pro fluorescenčně značené vzorky 2012 Sub-mikroskop nanoskop pro neznačené živé buňky Mikroskopie živé buňky velikost pozorovaného pole Popis optického chování mikroskopu 1942 Nijboer Zernike integrál 1951 Toraldo di Francia optická mikroskopie nemá teoretický limit rozlišení Rozlišení 1990 současnost: teoretický popis optické mikroskopie se superrozlišením 2000 současnost: digitální kamery 2009 mikroskop jako informační kanál Mikroskopie mrtvé buňky 1590 Jansen 10x 1665 Hook 1820 Mikrotomie 1837 Purkyně 1900 Barvení 1931 Elektronový mikroskop x zvětšení

10 Skutečná zobrazovací funkce mikroskopu - point spread function

11 Skutečná zobrazovací funkce mikroskopu - point spread function

12 Mikroskopie živé buňky Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Mikroskopický experiment, konstrukce a funkce nového mikroskopu HeLa buňky hlavní model pro lidské tkáňové kultury

13 Skutečný záznam z primární kultury pacienta s rakovinu tlustého střeva Experimenty jsou dlouhodobé a vznikají tisíce obrázků, které se v současné době zpracovávají ručně. Prvotní motivací bylo automatické zpracování obrazu. Za praxe vyplynula nutnost pochopení vzniku mikroskopického obrazu nad rámec dostupných popisů a pochopení vzniku principiálních zákonistostí vzniku struktur uvnitř živé buňky.

14 Buněčný cyklus Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Buněčný cyklus je nejzjevnější událost v životě buňky. Během ní se buňka rozdělí na dvě a více buněk. Předpokládá se, že počet dělení odráží stupeň integrace buňky do tkáně. Proto se počet dělení v čase používá, například, v akreditovaných laboratořích pro hodnocení biokompatibility a toxicity. Buněčný cyklus se skládá z fází stavů.

15 Software e-cell Dalibor Štys, School of Complex Systems FFPW USB Czech Republic Software: software Manuální vyhodnocení vývoje buněk, anotační nástroj Expertomica Hela Cells 3.03 RC Expertomica Ecell Publikace: Levitner T, Timr S, Stys D., Expertomica Cells: analysis of cell monolayer development, (2010) Bioinformatics, 26,

16 Buněčné události pohled z hlediska obecné teorie systémů Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Analýza dává jen malý počet dokončených buněčných cyklů je třeba zvětšit zorné pole a automatizovat analýzu. Levitner T, Timr S, Stys D., Expertomica Cells: analysis of cell monolayer development, (2010) Bioinformatics, 26,

17 Buněčné události pohled z hlediska obecné teorie systémů Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Stochastické chování živé buňky není primárně způsobeno fluktuacemi popisovaným rovnovážnou termodynamikou Rozdělení pravděpodobností v chování živých systémů závisí na počtu signálů, které si buňky vymění Levitner T, Timr S, Stys D., Expertomica Cells: analysis of cell monolayer development, (2010) Bioinformatics, 26,

18 Mikroskopický experiment, konstrukce a funkce nového mikroskopu. Technické požadavky na nový experimentální mikroskop - Snadné a rychlé zahájení experimentu za kontrolovaných podmínek teplota, vlhkost, CO 2 - Nízký celkový světelný výkon dopadající na buňku a odpovídající snímání kamerou - Skenování ve všech třech osách, kontrola pozice s přesností 1 pixel (cca 20 nm při 80x zvětšení) - Řízení založené na počítačové analýze obrazu Vypsali jsme veřejnou soutěž v níž zvítězilo konsorcium českých firem Compotech a Optax

19 Mikroskopie fázového kontrastu poskytuje informaci o celém obsahu buňky Image taken from Nikon

20 Principy mikroskopie s videozesílením Mizushima, Y., (1980) Detectivity limit of very small objects by videoenhanced microscopy. Applied Optics, 27, Mikroskopie s videozesílením je moderní variantou mikroskopie v temném poli Mizushima, Y., (1980) Image taken from Nikon

21 Principy mikroskopie s videozesílením Image taken from Nikon Van Haver S., The extended Nijboer Zernike Theory and its Applications, PhD. Thesis 2010 Výpočet zobrazení pozorovaného objektu (bod, jednoduchý tvar) v různé vzdálenosti od ohniska při různých vlastnostech (vadách) čočky Braat, Jansen a spol

22 Principy mikroskopie s videozesílením Lipson S.G., Why is super-resolution so inefficient? Micron 34, pp Při vysoké intenzitě světla velkém počtu současně dopadajících fotonů - má čočka vysoké teoretické rozlišení za zachování velkého zorného pole Lipson S.G., 2003 Image taken from Nikon

23 Skutečná zobrazovací funkce mikroskopu - point spread function 1000mA 1250mA 1500mA 1750mA 2000mA 2250mA 2500mA 2750mA 3000mA

24 Optické schéma nového mikroskopu

25 2000 ma Při zobrazování živé nebarvené buňky nehledáme nejvyšší rozlišení, ale nejlépe zpracovatelnou a reprezentativní informaci o dané buňce v daném čase. 200 ma

26 Pozorování živé, neznačené, buňky Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Karusel s výměnou metod optického kontrastování Karusel pro výměnu barevných filtrů Sub-mikroskop - nanoskop Řízený zdroj světla vysoké intenzity založený na LED technologii Kamera s vysokou rychlostí snímání a ukládání neredukovaných dat (200 f/s, 2000x1100 bodů) Kamera s velkým počtem bodů na čipu (kinofilmová velikost), 4500x3000 bodů Optický stůl z kompozitních materiálů Stolek s přesným xy pohybem Karusel s automatizovanou výměnou objektivů a přesným z-pohybem Sejmuta po dobu testování byla plexisklová klimatizovaná skříň

27 Informační příspěvek bodu - point information gain (PIG, ΔI x,y,α ) počítáme pro každý bod v obrazu ve třech barevných kanálech pomocí Rényiho entropie. Stys D., Urban J., Vanek J., Císar P. Analysis of biological time-lapse microscopic experiment from the point of view of the information theory. Micron. 2011a, 42, Epub 2010 Feb 12. Stys, D., Vanek, J., Nahlik, T., Urban, J., Cisar, P.: The cell monolayer trajectory from the system state point of view. Mol. BioSyst. 7, (2011)

28 2000mA

29 2000 ma

30 Nevyloučili jsme, že jsme schopni rozlišit objekty jejichž velikost je menší než nejmenší objekt, který jsme schopni promítat na kameru

31 No. of points No. of points Modely PIG pro různá alfa normální rozdělení No. of points No. of points

32 Stys D., Jizba P., Papacek S., Nahlik T., and Cisar P., On measurement of internal variables of komplex self-organized systems and their relation to multifractal spectra, 2012, IWSOS 2012, LCNS 7166, pp , Kuipers and Heegaard eds. Springer: Heidelberg Dordrecht London New York, ISBN Entropie informačního příspěvku bodu Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Existuje unikátní makroskopický (v termodynamickém smyslu) identifikátor obrazu buňky? Lze pro strukturované systémy zavést něco jako Gibbsova energie pro nestrukturované systémy? Zavedli jsme veličiny entropie informačního příspěvku bodu - point information gain entropy (PIE, ΔI α ) a hustota entropie informačního příspěvku bodu point - information gain entropy density (PIE/points, ΔI α.r ) Sada hodnot PIE nebo PIE/points je unikátním identifikátorem obrazu. Rényiho entropie je základem pro zobecněnou dimenzi, která charakterizuje multifraktální objekty jako jsou chaotické atraktory a jiné samoorganizující systémy.

33 Stavová trajektorie v prostoru PIE a PIE/points Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita V prostoru 3x13 souřadnic tvořených hodnotami PIE/points pro hodnoty parametru α = 0,1; 0,3; 0,5; 0,7; 1; 1,3; 1,5; 1,7; 2,0; 2,5; 3,0; 3,5; 4,0 jsme provedli multivariantní analýzu a analýzu klastrů Stys D., Jizba P., Papacek S., Nahlik T., and Cisar P., On measurement of internal variables of komplex self-organized systems and their relation to multifractal spectra, 2012, IWSOS 2012, LCNS 7166, pp , Kuipers and Heegaard eds. Springer: Heidelberg Dordrecht London New York, ISBN

34 Provedli jsme analýzu hlavní komponenty pro 39 hodnot PIE/point jako stavových proměnných a analýzu klastrů. Byli jsme schopni detekovat další tvary nad rámec expertní klasifikace.

35 Jednoúčelová zařízení embryoview pro kliniky reprodukční medicíny Řízený zdroj světla vysoké intenzity založený na LED technologii Z-scan embrya Kamera s ukládáním neredukovaných dat + řízení snímání Přesný z-pohyb Embryoview pro kliniky reprodukční medicíny (Prague Fertility Center)

36 Odvozená jednoúčelová zařízení Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Jednoúčelová zařízení scanovací polarizační mikroskop pro Bosch Karusel s výměnou metod optického kontrastování Polarizační mikroskop pro kontrolu kvality plastů (firma Robert Bosch) Stolek s přesným xy pohybem Kamera s velkým počtem bodů na čipu (kinofilmová velikost)

37 Porovnání záznamu z modrého kanálu a přepočtené obrazové entropie při α= ma

38 Problémy automatické detekce stavů buňky Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Momentální problémy použití PIG pro automatickou klasifikaci stavů buněk z časosběrné mikroskopie: Neexistuje dobrá metoda automatizace oddělení buňky od pozadí

39 Problémy automatické detekce stavů buňky Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Dobrá metoda automatizace oddělení buňky od pozadí

40 Využití vlastností point spread function výpočet point divergence gain 1500 ma

41 Využití vlastností point spread function výpočet point divergence gain 1500 ma

42 Využití vlastností point spread function výpočet point divergence gain 1500 ma

43 Popis stavu buněčné kultury a) definice fenomenologických proměnných pro danou buňku - PIE ( V i,ϕ ) b) definice informačních vazeb mezibuněčné interakce a jejich klasifikace ( C i ) c) nalezení funkce rozdělení pravděpodobností buněčných osudů událostí ( P i ) Vytvoření stochastického modelu dynamiky živé buňky i, V i, i T, C PCS, C, P Zampa P., The principle of causality and new approach to system theory, In: Cybernetics and Systems, 2004, pp. 3-8, ISBN Žampa P Habilitační práce, Západočeská univerzita v Plzni

44 čas/min α 0,1 0, , , , , , , , , , ,3 0, , , , , , , , , , ,5 0, , , , , , , , , , ,7 0, , , , , , , , , , , , , , , , , , , , ,3-0, , ,1066-0, , , , , , , ,5-0, , , , , , , , , , ,7-0, ,0398-0, , , , , , , , , , , , , , , , , , ,5-0, , , , , , , , , , , , , , , , ,0188-0, , , ,5-0, , , , , , ,0167-0, , , , , , , , , ,0152-0, , ,02147 Popis stavu buněčné kultury Teorie stochastických systémů ilustrována pomocí skutečně naměřených hodnot PIE 3 3, 2 T V2, T, V C T, V C, 1 1, C 2 PCS, C, P 3 T, V C 4 4, 1 4 T, V C 5 5, T, V C 6 6, T V7, 8 8,, C P 2 7 čas/min α 0,1 0, , , , ,3 0, , , , ,5 0, , , , ,7 0, , , , , , , ,0209 1,3-0, , , , ,5-0, , , , ,7-0, , , , , , , , ,5-0, , , ,02546 čas/min , , , ,02116 α 3,5-0, , , , ,1 0, , , , , , , , ,3 0, , , , ,5 0, , , , ,7 0, , , , , , , , ,3-0,0941-0, , , ,5-0, , , , ,7-0, ,0598-0, , , , , , ,5-0, , , , , , , , ,5-0, , , , , , , ,01503 T, V C čas/min α 0,1 0, , , , ,3 0, , , , ,5 0, , , , ,7 0, , , , ,0192 0, , , ,3-0, , , , ,5-0,0574-0, ,0576-0, ,7-0,0446-0, , , , ,0259-0, , ,5-0, , , , , , , , ,5-0, , , , ,0245-0, ,0153-0,

45 Má využití hodnoty PIE/points oporu v teorii? Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Existuje unikátní makroskopický (v termodynamickém smyslu) identifikátor obrazu buňky? Zle pro strukturované systémy zavést něco jako Gibbsova energie pro nestrukturované systémy? Zavedli jsme veličiny entropie informačního bodu - point information gain entropy (PIE) a hustota entropie informačního bodu point information gain entropy density (PIE/points) Sada hodnot PIE nebo PIE/points je unikátním identifikátorem obrazu. Rényiho entropie je základem pro zobecněnou dimenzi D α, která charakterizuje multifraktální objekty jako jsou chaotické atraktory a jiné samoorganizující systémy. Jako všechny dimenze, předpokládá se nalezení limity v přiblížení k nulové délce měřítka r

46 Chaotický atraktor jako nástroj k diskuzi o vhodném modelu Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Model samoorganizujícího systému Lorenzův atraktor Ortogonální proměnné v Lorenzově atraktoru jsou vztaženy ke konkrétnímu experimentu tzv. Bénardově cele. Jsou to: x celkový tok hmoty y rozdíl teplot horní a dolní plochy z maximální odchylka gradientu teploty od linearity Kaneko K. (2006). Life: An Introduction to Complex Systems Biology. Springer Grassberger,P., Procaccia,P.: Measuring the strangeness of strange attractors. Physica D 9, (1983)

47 Chaotický atraktor jako nástroj k diskuzi o vhodném modelu Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Měříme jeden bod, skupinu bodů, celou doménu atraktoru nebo celý atraktor. Jen v posledním případě můžeme rozumně interpretovat fraktální dimenzi.

48 Jaký by měl být tvar hlavní variety v ortogonálních souřadnicích získaných multivariantní analýzou? Jak by měla vypadat stavová funkce buněčné kultury?

49 Aktivity školy komplexních systémů ve vztahu k tématu Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Škola komplexních systémů Laboratoř aplikované systémové biologie a Laboratoř tkáňových kultur Návrh a konstrukce přístrojů Software pro systémovou biologii Návrh a analýza experimentu Mezinárodní letní školy Jindřichův Hradec České Budějovice Technologie pro buněčnou biologii: Automatizovaná analýzy signálu LC-MS Analýza 2D gelů pro proteomiku Analýza buněčných osudů na základě teorie stochastických systémů Zesílení obrazu založené na výpočtu entropie a objektivní analýza buněčné trajektorie Sub-mikroskop, nanoskop

50 Děkuji všem spolupracovníkům, zejména Petrovi Císařovi, Petrovi Jizbovi, Vítěžslavu Březinovi, Janu Urbanovi, Jiřímu Soukupovi, Janu Vaňkovi, Tomáši Náhlíkovi, Tomáši Levitnerovi, Jindřichu Soukupovi, Karině Romanové, Anně Zhyrové, Štěpánu Papáčkovi a též Aliaxandru Pautsinovi, technikům z laboratoře Aplikované systémové biologie a Laboratoře tkáňových kultur ŠKS FROV JU a pracovníkům spolupracujících firem. Hlavní granty: Jihočeské centrum akvakultury a biodiverzity hydrocenóz CENAKVA (CZ.1.05/2.1.00/ ) EEA funds sub-projekt HTCFOOD (A/CZ0046/1/0008) Innovation 4 Welfare projekt sponzorovaný programem Interreg IVC Programme

51 Děkuji za laskavou pozornost

52 A model relevant to cellular metabolism: The Belousov Zhabotinsky reaction

53 Sémantická a syntaktická informace v statistice rozdělení bodu v obrazu

54 Konstrukce stavové trajektorie pomocí PCA sémantická informace PC % PC % PC % PC % PC %

55

56 Konstrukce stavové trajektorie s využitím sémantické informace PC % PC % PC % PC % PC %

57

58 A model relevant to cellular metabolism: The Belousov Zhabotinsky reaction Extraction of image statistics: TO BE ADDED cross statistics

59 Závislost kovariance jednotlivých PIE pro různá alfa s různými hlavními osami - celá trajektorie 0,31 PC1-red PC1-green PC1-blue 0,26 PC2-red PC2-green PC2-blue PC3-red PC3-green PC3-blue 0,21 0,16 0,11 0,06 0,01 0 0,5 1 1,5 2 2,5 3 3,5 4-0,04

60 Klastrová analýzy trajektorie

61 Závislost kovariance PIE pro různá alfa s hlavními osami pro první klastr 0,4 PC1-red PC1-green 0,35 PC1-blue PC2-red PC2-green 0,3 PC2-blue PC3-red PC3-green 0,25 PC3-blue 0,2 0,15 0,1 0, ,5 1 1,5 2 2,5 3 3,5 4-0,05

62 Typická rozdělení PIG pro různá alfa 0,4 PC1-blue PC2-blue 0,35 PC3-blue 0,3 0,25 0,2 0,15 0,1 0, ,5 1 1,5 2 2,5 3 3,5 4

63 Rozdíly mezi syntaktickou a sémantickou informací

64 Závislost PIE na alfa pro normální rozdělení 1,60E-02 1,40E-02 1,20E-02 1,00E-02 PIE /points 8,00E-03 6,00E-03 4,00E-03 2,00E-03 PIE 0,00E+00 0,00E+00 1,00E+00 2,00E+00 3,00E+00 4,00E+00-2,00E-03 α -4,00E-03

Technické a teoretické aspekty mikroskopie živé buňky

Technické a teoretické aspekty mikroskopie živé buňky Technické a teoretické aspekty mikroskopie živé buňky Dalibor Štys Škola komplexních systémů Nové Hrady Ţivé systémy jsou nejzjevnějším příkladem samoorganizující komplexních systémů a jsou zaloţené na

Více

Technická specifikace předmětu veřejné zakázky

Technická specifikace předmětu veřejné zakázky předmětu veřejné zakázky Příloha č. 1c Zadavatel požaduje, aby předmět veřejné zakázky, resp. přístroje odpovídající jednotlivým částem veřejné zakázky splňovaly minimálně níže uvedené parametry. Část

Více

Nové NIKON centrum excelence pro super-rezoluční mikroskopii v Ústavu molekulární genetiky Akademie věd ČR

Nové NIKON centrum excelence pro super-rezoluční mikroskopii v Ústavu molekulární genetiky Akademie věd ČR Nové NIKON centrum excelence pro super-rezoluční mikroskopii v Ústavu molekulární genetiky Akademie věd ČR Společnost NIKON ve spolupráci s Ústavem molekulární genetiky AV ČR zahájila v úterý 21. ledna

Více

Zobrazování s využitím prostorového modulátoru světla

Zobrazování s využitím prostorového modulátoru světla Zobrazování s využitím prostorového modulátoru světla Technický seminář Centra digitální optiky vedoucí balíčku (PB4): prof. RNDr. Radim Chmelík, Ph.D. Řešitelské organizace: Pracovní balíček Zobrazování

Více

příloha C zadávací dokumentace pro veřejnou zakázku malého rozsahu Mikroskopy pro LF MU TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace)

příloha C zadávací dokumentace pro veřejnou zakázku malého rozsahu Mikroskopy pro LF MU TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace) příloha C zadávací dokumentace pro veřejnou zakázku malého rozsahu Mikroskopy pro LF MU TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace) Část 1 Stereomikroskop s digitální kamerou : - Konstrukce optiky CMO (Common

Více

Příloha C. zadávací dokumentace pro podlimitní veřejnou zakázku Mikroskopy pro LF MU 2013. TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace)

Příloha C. zadávací dokumentace pro podlimitní veřejnou zakázku Mikroskopy pro LF MU 2013. TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace) Příloha C zadávací dokumentace pro podlimitní veřejnou zakázku Mikroskopy pro LF MU 2013 TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace) 1. část VZ: Laboratorní mikroskop s digitální kamerou a PC Položka č.1

Více

Fluorescenční mikroskopie

Fluorescenční mikroskopie Fluorescenční mikroskopie Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii Ctirad Hofr 1 VYUŽITÍ FLUORESCENCE, PŘÍMÁ FLUORESCENCE, PŘÍMÁ A NEPŘÍMA IMUNOFLUORESCENCE, BIOTIN-AVIDINOVÁ METODA IMUNOFLUORESCENCE

Více

EM, aneb TEM nebo SEM?

EM, aneb TEM nebo SEM? EM, aneb TEM nebo SEM? Jiří Šperka Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita, Brno 2. únor 2011 / Prezentace pro studentský seminář Jiří Šperka (Masarykova univerzita) SEM a TEM 2. únor 2011 1 / 21

Více

Interní norma č. 22-102-01/01 Průměr a chlupatost příze

Interní norma č. 22-102-01/01 Průměr a chlupatost příze Předmluva Text vnitřní normy byl vypracován v rámci Výzkumného centra Textil LN00B090 a schválen oponentním řízením dne 7.12.2004. Předmět normy Tato norma stanoví postup měření průměru příze a celkové

Více

MIKROSKOPIE JAKO NÁSTROJ STUDIA MIKROORGANISMŮ

MIKROSKOPIE JAKO NÁSTROJ STUDIA MIKROORGANISMŮ Mikroskopické techniky MIKROSKOPIE JAKO NÁSTROJ STUDIA MIKROORGANISMŮ Slouží k vizualizaci mikroorganismů Antoni van Leeuwenhoek (1632-1723) Čočka zvětšující 300x Různé druhy mikroskopů, které se liší

Více

Ústav molekulární a translační medicíny LF UP holografický transmisní mikroskop

Ústav molekulární a translační medicíny LF UP holografický transmisní mikroskop ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY ve smyslu ust. 156 zákona č. 137/2006 Sb., ve znění pozdějších předpisů (dále jen zákon ) a v souladu s ust. 2 až 8 vyhlášky č. č. 232/2012 Sb. (dále jen vyhláška) VEŘEJNÁ ZAKÁZKA

Více

FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP

FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP na gymnáziu Pierra de Coubertina v Táboře Pavla Trčková, kabinet Biologie, GPdC Tábor Co je fluorescence Fluorescence je jev spočívající v tom, že některé látky (fluorofory) po

Více

Základy mikroskopie. Úkoly měření: Použité přístroje a pomůcky: Základní pojmy, teoretický úvod: Úloha č. 10

Základy mikroskopie. Úkoly měření: Použité přístroje a pomůcky: Základní pojmy, teoretický úvod: Úloha č. 10 Úloha č. 10 Základy mikroskopie Úkoly měření: 1. Seznamte se základní obsluhou třech typů laboratorních mikroskopů: - biologického - metalografického - stereoskopického 2. Na výše jmenovaných mikroskopech

Více

Tento materiál byl vytvořen v rámci projektu Operačního programu Vzdělávání pro konkurenceschopnost.

Tento materiál byl vytvořen v rámci projektu Operačního programu Vzdělávání pro konkurenceschopnost. Tento materiál byl vytvořen v rámci projektu Operačního programu Vzdělávání pro konkurenceschopnost. Projekt MŠMT ČR Číslo projektu Název projektu školy Šablona III/2 EU PENÍZE ŠKOLÁM CZ.1.07/1.4.00/21.2146

Více

Mikroskopie, zobrazovací technika. Studentská 1402/2 461 17 Liberec 1 tel.: +420 485 353 006 cxi.tul.cz

Mikroskopie, zobrazovací technika. Studentská 1402/2 461 17 Liberec 1 tel.: +420 485 353 006 cxi.tul.cz Mikroskopie, zobrazovací technika Vizualizační technika Systém pro přímé sledování dějů ve spalovacím motoru AVL VISIOSCOPE, součástí zařízení je optické měřící zařízení pro měření teplot (VISIOFEM Temperature

Více

CEITEC a jeho IT požadavky. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.

CEITEC a jeho IT požadavky. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D. CEITEC a jeho IT požadavky RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D. Co je CEITEC? CEITEC je projekt výstavby středoevropského vědecko-výzkumného centra excelence v Brně Zaměření projektu: základní i aplikovaný

Více

Technický boroskop zařízení na monitorování spalovacích procesů

Technický boroskop zařízení na monitorování spalovacích procesů Technický boroskop zařízení na monitorování spalovacích procesů Katedra experimentální fyziky PřF UP Olomouc Doc. Ing. Luděk Bartoněk, Ph.D. Zvyšování účinnosti spalovacích procesů v různých odvětvích

Více

Optická konfokální mikroskopie a mikrospektroskopie. Pavel Matějka

Optická konfokální mikroskopie a mikrospektroskopie. Pavel Matějka Optická konfokální mikroskopie a Pavel Matějka 1. Konfokální mikroskopie 1. Princip metody - konfokalita 2. Instrumentace metody zobrazování 3. Analýza obrazu 2. Konfokální 1. Luminiscenční 2. Ramanova

Více

M I K R O S K O P I E

M I K R O S K O P I E Inovace předmětu KBB/MIK SVĚTELNÁ A ELEKTRONOVÁ M I K R O S K O P I E Rozvoj a internacionalizace chemických a biologických studijních programů na Univerzitě Palackého v Olomouci CZ.1.07/2.2.00/28.0066

Více

CLP ANALYSIS OF MOLECULAR MARKERS DIGITAL IMAGE ANALYSIS OF ELECTROPHOEROGRAMS CZECH VERSION

CLP ANALYSIS OF MOLECULAR MARKERS DIGITAL IMAGE ANALYSIS OF ELECTROPHOEROGRAMS CZECH VERSION CLP ANALYSIS OF MOLECULAR MARKERS DIGITAL IMAGE ANALYSIS OF ELECTROPHOEROGRAMS CZECH VERSION DIGITÁLNÍ OBRAZOVÁ ANALÝZA ELEKTROFORETICKÝCH GELŮ *** Vyhodnocování získaných elektroforeogramů: Pro vyhodnocování

Více

Optika pro mikroskopii materiálů I

Optika pro mikroskopii materiálů I Optika pro mikroskopii materiálů I Jan.Machacek@vscht.cz Ústav skla a keramiky VŠCHT Praha +42-0- 22044-4151 Osnova přednášky Základní pojmy optiky Odraz a lom světla Interference, ohyb a rozlišení optických

Více

Rozdělení přístroje zobrazovací

Rozdělení přístroje zobrazovací Optické přístroje úvod Rozdělení přístroje zobrazovací obraz zdánlivý subjektivní přístroje lupa mikroskop dalekohled obraz skutečný objektivní přístroje fotoaparát projekční přístroje přístroje laboratorní

Více

Počítačová grafika a vizualizace I

Počítačová grafika a vizualizace I Počítačová grafika a vizualizace I PŘENOSOVÁ MÉDIA - KABELÁŽ Mgr. David Frýbert david.frybert@gmail.com SKENERY princip Předlohu pro digitalizaci ozařuje zdroj světla a odražené světlo je vedeno optickým

Více

OBRAZOVÁ ANALÝZA. Speciální technika a měření v oděvní výrobě

OBRAZOVÁ ANALÝZA. Speciální technika a měření v oděvní výrobě OBRAZOVÁ ANALÝZA Speciální technika a měření v oděvní výrobě Prostředky pro snímání obrazu Speciální technika a měření v oděvní výrobě 2 Princip zpracování obrazu matice polovodičových součástek, buňky

Více

Vypracoval: Martin Paúr. 27. Června 2014 1 / 14

Vypracoval: Martin Paúr. 27. Června 2014 1 / 14 Vypracoval: Martin Paúr 27. Června 2014 1 / 14 Motivace 1 Navrhnutí optické sestavy pro měření rovinných ploch Návrh optické sestavy v programu OSLO Navrhnutí mechanické sestavy experimentu 2 Sestavení

Více

Buněčné automaty a mřížkové buněčné automaty pro plyny. Larysa Ocheretna

Buněčné automaty a mřížkové buněčné automaty pro plyny. Larysa Ocheretna Buněčné automaty a mřížkové buněčné automaty pro plyny Larysa Ocheretna Obsah Buněčný automat: princip modelu, vymezení pojmů Mřížkový buněčný automat pro plyny Příklady aplikace principů mřížkových buněčných

Více

STUDIUM SKLOKERAMICKÝCH POVLAKŮ V BIOLOGICKÉM PROSTŘEDÍ

STUDIUM SKLOKERAMICKÝCH POVLAKŮ V BIOLOGICKÉM PROSTŘEDÍ STUDIUM SKLOKERAMICKÝCH POVLAKŮ V BIOLOGICKÉM PROSTŘEDÍ Ing. Vratislav Bártek e-mail: vratislav.bartek.st@vsb.cz doc. Ing. Jitka Podjuklová, CSc. e-mail: jitka.podjuklova@vsb.cz Ing. Tomáš Laník e-mail:

Více

Princip rastrovacího konfokálního mikroskopu

Princip rastrovacího konfokálního mikroskopu Konfokální mikroskop Obsah: Konfokální mikroskop... 1 Princip rastrovacího konfokálního mikroskopu... 1 Rozlišovací schopnost... 2 Pozorování povrchů ve skutečných barvách... 2 Konfokální mikroskop Olympus

Více

VY_32_INOVACE_06_UŽITÍ ČOČEK_28

VY_32_INOVACE_06_UŽITÍ ČOČEK_28 VY_32_INOVACE_06_UŽITÍ ČOČEK_28 Autor: Mgr. Pavel Šavara Škola: Základní škola Slušovice, okres Zlín, příspěvková organizace Název projektu: Zkvalitnění ICT ve slušovské škole Anotace Materiál (DUM digitální

Více

Kalibrační proces ve 3D

Kalibrační proces ve 3D Kalibrační proces ve 3D FCC průmyslové systémy společnost byla založena v roce 1995 jako součást holdingu FCC dodávky komponent pro průmyslovou automatizaci integrace systémů kontroly výroby, strojového

Více

Bioinformatika a výpočetní biologie KFC/BIN. I. Přehled

Bioinformatika a výpočetní biologie KFC/BIN. I. Přehled Bioinformatika a výpočetní biologie KFC/BIN I. Přehled RNDr. Karel Berka, Ph.D. Univerzita Palackého v Olomouci Definice bioinformatiky (Molecular) bio informatics: bioinformatics is conceptualising biology

Více

Studentská 1402/2 461 17 Liberec 1 tel.: +420 485 353 006 cxi.tul.cz

Studentská 1402/2 461 17 Liberec 1 tel.: +420 485 353 006 cxi.tul.cz Pokročilé simulace pro komplexní výzkum a optimalizace Ing. Michal Petrů, Ph.D. Studentská 1402/2 461 17 Liberec 1 tel.: +420 485 353 006 cxi.tul.cz Stránka: 2 Modelové simulace pro komplexní výzkum Mechanických

Více

Základy mikroskopování

Základy mikroskopování Gymnázium a Střední odborná škola pedagogická, Čáslav, Masarykova 248 M o d e r n í b i o l o g i e reg. č.: CZ.1.07/1.1.32/02.0048 TENTO PROJEKT JE SPOLUFINANCOVÁN EVROPSKÝM SOCIÁLNÍM FONDEM A STÁTNÍM

Více

2D MANUAL. ložiscích, která umožňuje velmi rychlé a přesné bezkontaktní měření v rozsahu 400 mm 300 mm.

2D MANUAL. ložiscích, která umožňuje velmi rychlé a přesné bezkontaktní měření v rozsahu 400 mm 300 mm. vision systems 2D MANUAL VuMaster je manuální optický 2D měřicí přístroj přinášející VuMaster novou patentovanou technologii odměřování Colourmap. VuMaster nepoužívá tradiční stolek nebo enkodéry, ale

Více

Fotokroužek 2009/2010

Fotokroužek 2009/2010 Fotokroužek 2009/2010 První hodina Úvod do digitální fotografie Druhy fotoaparátů Diskuse Bc. Tomáš Otruba, 2009 Pouze pro studijní účely žáků ZŠ Slovanské náměstí Historie fotografie Za první fotografii

Více

Viková, M. : MIKROSKOPIE V Mikroskopie V M. Viková

Viková, M. : MIKROSKOPIE V Mikroskopie V M. Viková Mikroskopie V M. Viková LCAM DTM FT TU Liberec, martina.vikova@tul.cz Hloubka ostrosti problém m velkých zvětšen ení tloušťka T vrstvy vzorku kolmé k optické ose, kterou vidíme ostře zobrazenou Objektiv

Více

Statistické metody v digitálním zpracování obrazu. Jindřich Soukup 3. února 2012

Statistické metody v digitálním zpracování obrazu. Jindřich Soukup 3. února 2012 Statistické metody v digitálním zpracování obrazu Jindřich Soukup 3. února 2012 Osnova Úvod (Neparametrické) odhady hustoty pravděpodobnosti Bootstrap Použití logistické regresi při klasifikaci Odhady

Více

Digitální fotografie. Mgr. Milana Soukupová Gymnázium Česká Třebová

Digitální fotografie. Mgr. Milana Soukupová Gymnázium Česká Třebová Digitální fotografie Mgr. Milana Soukupová Gymnázium Česká Třebová Téma sady didaktických materiálů Číslo a název šablony Číslo didaktického materiálu Druh didaktického materiálu Téma didaktického materiálu

Více

Fotogrammetrické 3D měření deformací dálničních mostů typu TOM

Fotogrammetrické 3D měření deformací dálničních mostů typu TOM Fotogrammetrické 3D měření deformací dálničních mostů typu TOM Ing. Karel Vach CSc., s.r.o. Archeologická 2256, 155 00 Praha 5 http://www.eurogv.cz 1 Objekt SO 208 2 Technické zadání: - provést zaměření

Více

Laboratorní úloha č. 6 - Mikroskopie

Laboratorní úloha č. 6 - Mikroskopie Laboratorní úloha č. 6 - Mikroskopie Úkoly měření: 1. Seznamte se s ovládáním stereoskopického mikroskopu, digitálního mikroskopu a fotoaparátu. 2. Studujte pod mikroskopem různé preparáty. Vyberte vhodný

Více

ANALYTICKÝ PRŮZKUM / 1 CHEMICKÉ ANALÝZY DROBNÝCH KOVOVÝCH OZDOB Z HROBU KULTURY SE ZVONCOVÝMI POHÁRY Z HODONIC METODOU SEM-EDX

ANALYTICKÝ PRŮZKUM / 1 CHEMICKÉ ANALÝZY DROBNÝCH KOVOVÝCH OZDOB Z HROBU KULTURY SE ZVONCOVÝMI POHÁRY Z HODONIC METODOU SEM-EDX / 1 ZPRACOVAL Mgr. Martin Hložek TMB MCK, 2011 ZADAVATEL David Humpola Ústav archeologické památkové péče v Brně Pobočka Znojmo Vídeňská 23 669 02 Znojmo OBSAH Úvod Skanovací elektronová mikroskopie (SEM)

Více

Písemná zpráva zadavatele

Písemná zpráva zadavatele Písemná zpráva zadavatele o veřejné zakázce zadávané dle zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách, v platném znění (dále jen ZVZ ). Veřejná zakázka Název: Dokumentační systémy Druh veřejné zakázky:

Více

Digitální video mikroskop navržený pro flexibilní kontrolu, řízení jakosti, měření a digitální záznam.

Digitální video mikroskop navržený pro flexibilní kontrolu, řízení jakosti, měření a digitální záznam. dodavatel vybavení provozoven firem www.abetec.cz ESD digitální kamera Flexia OP-019 193 Obj. číslo: 106000633 Výrobce: Optilia Popis Digitální video mikroskop navržený pro flexibilní kontrolu, řízení

Více

Základní pojmy. Je násobkem zvětšení objektivu a okuláru

Základní pojmy. Je násobkem zvětšení objektivu a okuláru Vznik obrazu v mikroskopu Mikroskop se skládá z mechanické části (podstavec, stojan a stolek s křížovým posunem), osvětlovací části (zdroj světla, kondenzor, clona) a optické části (objektivy a okuláry).

Více

Numerické řešení proudění stupněm experimentální vzduchové turbíny a budících sil na lopatky

Numerické řešení proudění stupněm experimentální vzduchové turbíny a budících sil na lopatky Konference ANSYS 2009 Numerické řešení proudění stupněm experimentální vzduchové turbíny a budících sil na lopatky J. Štěch Západočeská univerzita v Plzni, Katedra energetických strojů a zařízení jstech@kke.zcu.cz

Více

Technické podmínky systému měření ojetí kolejnic OK-02

Technické podmínky systému měření ojetí kolejnic OK-02 Technické podmínky systému měření ojetí kolejnic OK-02 ROT-HSware s.r.o. Mezi Mosty 176 530 03 Pardubice 3 www.rothsware.cz Březen, 2004 www.rothsware.cz 1/7 1. Úvod Systém OK-02 slouží k měření příčného

Více

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Závěrečná zpráva o řešení grantového projektu

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Závěrečná zpráva o řešení grantového projektu JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH Závěrečná zpráva o řešení grantového projektu Interní grant JU 1.Název Registrační číslo: 091/2008/P (04-091) projektu: Fluxes of information entropy in time

Více

Využití magneticko-rezonanční tomografie v měřicí technice. Ing. Jan Mikulka, Ph.D. Ing. Petr Marcoň

Využití magneticko-rezonanční tomografie v měřicí technice. Ing. Jan Mikulka, Ph.D. Ing. Petr Marcoň Využití magneticko-rezonanční tomografie v měřicí technice Ing. Jan Mikulka, Ph.D. Ing. Petr Marcoň Osnova Podstata nukleární magnetické rezonance (MR) Historie vývoje MR Spektroskopie MRS Tomografie MRI

Více

ANALÝZA MĚŘENÍ TVARU VLNOPLOCHY V OPTICE POMOCÍ MATLABU

ANALÝZA MĚŘENÍ TVARU VLNOPLOCHY V OPTICE POMOCÍ MATLABU ANALÝZA MĚŘENÍ TVARU VLNOPLOCHY V OPTICE POMOCÍ MATLABU J. Novák, P. Novák Katedra fyziky, Fakulta stavební, České vysoké učení technické v Praze Abstrakt V práci je popsán software pro počítačovou simulaci

Více

ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH Projekt ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH PŘIHLÁŠKA STUDENTSKÉHO PROJEKTU Název projektu: Návrh a implementace procesu zpracování dat, formát MzXML Uchazeč Hlavní řešitel

Více

dokumentu: Proceedings of 27th International Conference Mathematical Methods in

dokumentu: Proceedings of 27th International Conference Mathematical Methods in 1. Empirical Estimates in Stochastic Optimization via Distribution Tails Druh výsledku: J - Článek v odborném periodiku, Předkladatel výsledku: Ústav teorie informace a automatizace AV ČR, v. v. i., Dodavatel

Více

Využití technologie GIS a prostorových databází při výpočtu fragmentace krajiny. Miroslav Kopecký, Tomáš Soukup

Využití technologie GIS a prostorových databází při výpočtu fragmentace krajiny. Miroslav Kopecký, Tomáš Soukup Využití technologie GIS a prostorových databází při výpočtu fragmentace krajiny Miroslav Kopecký, Tomáš Soukup Geoinformace pro praxi, Brno 27.6.-28.6.2009 Řešitelé Projekt je řešen za podpory EEA v rámci

Více

Multimediální systémy

Multimediální systémy Multimediální systémy Jan Outrata KATEDRA INFORMATIKY UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI přednášky Literatura Havaldar P., Medioni G.: Multimedia Systems: Algorithms, Standards, and Industry Practices. Course

Více

OPTICKÁ (světelná) MIKROSKOPIE

OPTICKÁ (světelná) MIKROSKOPIE OPTICKÁ (světelná) MIKROSKOPIE Alexandra Karasová, Andra Nistor Úvod Optická (světelná) mikroskopie je jednoduchá zobrazovací metoda, která nachází široké uplatnění v průmyslových, výzkumných, ale i klinických

Více

Data x Informace x Znalosti

Data x Informace x Znalosti Ing. Jan Král Jak to vidíme Program MS Excel je rozšířen a běžně dostupný bez dalších nákladů na převážné většině pracovišť, i pracovišť zabývajících se řízením jakosti a spolehlivosti, zpracovávajících

Více

DODATEČNÉ INFORMACE dle 49 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách

DODATEČNÉ INFORMACE dle 49 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách DODATEČNÉ INFORMACE dle 49 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách Zadavatel tímto poskytuje dodavatelům v souladu s 49 odst. 4 zákona o veřejných zakázkách dodatečné informace k veřejné zakázce

Více

NOVÁ METODIKA PŘÍPRAVY 1 MM FÓLIÍ PRO TEM ANALÝZU AUSTENITICKÝCH OCELÍ OZÁŘENÝCH NEUTRONY. Kontaktní e-mail: bui@cvrez.cz

NOVÁ METODIKA PŘÍPRAVY 1 MM FÓLIÍ PRO TEM ANALÝZU AUSTENITICKÝCH OCELÍ OZÁŘENÝCH NEUTRONY. Kontaktní e-mail: bui@cvrez.cz NOVÁ METODIKA PŘÍPRAVY 1 MM FÓLIÍ PRO TEM ANALÝZU AUSTENITICKÝCH OCELÍ OZÁŘENÝCH NEUTRONY Petra Bublíková 1, Vít Rosnecký 1, Jan Michalička 1, Eliška Keilová 2, Jan Kočík 2, Miroslava Ernestová 2 1 Centrum

Více

7. Geografické informační systémy.

7. Geografické informační systémy. 7. Geografické informační systémy. 154GEY2 Geodézie 2 7.1 Definice 7.2 Komponenty GIS 7.3 Možnosti GIS 7.4 Datové modely GIS 7.5 Přístup k prostorovým datům 7.6 Topologie 7.7 Vektorové datové modely 7.8

Více

Ing. Petr Knap Carl Zeiss spol. s r.o., Praha

Ing. Petr Knap Carl Zeiss spol. s r.o., Praha METROTOMOGRAFIE JAKO NOVÝ NÁSTROJ ZAJIŠŤOVÁNÍ JAKOSTI VE VÝROBĚ Ing. Petr Knap Carl Zeiss spol. s r.o., Praha ÚVOD Společnost Carl Zeiss Industrielle Messtechnik GmbH již dlouhou dobu sleduje vývoj v poměrně

Více

Systém pro správu experimentálních dat a metadat. Petr Císař, Antonín Bárta 2014 Ústav komplexních systémů, FROV, JU

Systém pro správu experimentálních dat a metadat. Petr Císař, Antonín Bárta 2014 Ústav komplexních systémů, FROV, JU Systém pro správu experimentálních dat a metadat Petr Císař, Antonín Bárta 2014 Ústav komplexních systémů, FROV, JU BioWes Systém pro správu experimentálních dat a meta Hlavní cíl Vytvoření systému usnadňujícího

Více

Stereomikroskop. Stativ pro dopadající světlo

Stereomikroskop. Stativ pro dopadající světlo Stereomikroskop Konstrukční typ Greenough Apochromaticky korigovaná optika Zoomovací poměr min. 8:1 Rozsah celkového zvětšení 10x 80x nebo větší (včetně uvedených hodnot, s 10x okuláry, bez předsádky)

Více

Metoda Live/Dead aneb využití fluorescenční mikroskopie v bioaugmentační praxi. Juraj Grígel Inovativní sanační technologie ve výzkumu a praxi

Metoda Live/Dead aneb využití fluorescenční mikroskopie v bioaugmentační praxi. Juraj Grígel Inovativní sanační technologie ve výzkumu a praxi Metoda Live/Dead aneb využití fluorescenční mikroskopie v bioaugmentační praxi Juraj Grígel Inovativní sanační technologie ve výzkumu a praxi Co je to vlastně ta fluorescence? Některé látky (fluorofory)

Více

Ústav experimentální medicíny AV ČR úspěšně rozšířil přístrojové vybavení pro vědce z peněz evropských fondů

Ústav experimentální medicíny AV ČR úspěšně rozšířil přístrojové vybavení pro vědce z peněz evropských fondů Ústav experimentální medicíny AV ČR úspěšně rozšířil přístrojové vybavení pro vědce z peněz evropských fondů Ústav úspěšně dokončil realizaci dvou investičních projektů s využitím prostředků z Operačního

Více

Bioscience Imaging Centre

Bioscience Imaging Centre Bioscience Imaging Centre (Středisko mikroskopie) zajišťujeme moderní mikroskopické zařízení a softwary pro analýzu obrazu poradíme s plánováním experimentů (histologie, detekce proteinů a mrna) pomůžeme

Více

Meo S-H: software pro kompletní diagnostiku intenzity a vlnoplochy

Meo S-H: software pro kompletní diagnostiku intenzity a vlnoplochy Centrum Digitální Optiky Meo S-H: software pro kompletní diagnostiku intenzity a vlnoplochy Výzkumná zpráva projektu Identifikační čí slo výstupu: TE01020229DV003 Pracovní balíček: Zpracování dat S-H senzoru

Více

PROTOKOL TECHNOLOGICKÁ LABORATOŘ. Ateliér obnovy a konzervace historických staveb Váš dopis č. j. / ze dne: 29. 5. 2009

PROTOKOL TECHNOLOGICKÁ LABORATOŘ. Ateliér obnovy a konzervace historických staveb Váš dopis č. j. / ze dne: 29. 5. 2009 002-10 SHaZ Bečov, západní parkán u Horního hradu podklad pro projektovou dokumentaci PROTOKOL TECHNOLOGICKÁ LABORATOŘ Zadavatel: GIRSA AT s.r.o. Ateliér obnovy a konzervace historických staveb Váš dopis

Více

Robust 2014, 19. - 24. ledna 2014, Jetřichovice

Robust 2014, 19. - 24. ledna 2014, Jetřichovice K. Hron 1 C. Mert 2 P. Filzmoser 2 1 Katedra matematické analýzy a aplikací matematiky Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého, Olomouc 2 Department of Statistics and Probability Theory Vienna University

Více

Fyzikální sekce přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity v Brně FYZIKÁLNÍ PRAKTIKUM. Praktikum z pevných látek (F6390)

Fyzikální sekce přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity v Brně FYZIKÁLNÍ PRAKTIKUM. Praktikum z pevných látek (F6390) Fyzikální sekce přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity v Brně FYZIKÁLNÍ PRAKTIKUM Praktikum z pevných látek (F6390) Zpracoval: Michal Truhlář Naměřeno: 13. března 2007 Obor: Fyzika Ročník: III Semestr:

Více

Geometrická optika. Optické přístroje a soustavy. převážně jsou založeny na vzájemné interakci světelného pole s látkou nebo s jiným fyzikálním polem

Geometrická optika. Optické přístroje a soustavy. převážně jsou založeny na vzájemné interakci světelného pole s látkou nebo s jiným fyzikálním polem Optické přístroje a soustav Geometrická optika převážně jsou založen na vzájemné interakci světelného pole s látkou nebo s jiným fzikálním polem Důsledkem této t to interakce je: změna fzikáln lních vlastností

Více

Služby ÚVT pro VaV & IT pro CEITEC. David Antoš

Služby ÚVT pro VaV & IT pro CEITEC. David Antoš Služby ÚVT pro VaV & IT pro CEITEC David Antoš Služby ÚVT pro vědce a výzkumníky Trocha historie záznamy přednášek http://www.video.muni.cz/ úložiště dat historikové z FF, dermatopatologický atlas doc.

Více

Aplikace multifraktální geometrie na finančních trzích

Aplikace multifraktální geometrie na finančních trzích Aplikace multifraktální geometrie na finančních trzích 5. studentské kolokvium a letní škola matematické fyziky Stará Lesná Fakulta jaderná a fyzikálně inženýrská ČVUT, Praha 1. 9. 2011 Úvod náhodné procesy

Více

Metody automatického texturování 3D modelu měst s využitím internetových fotoalb 3D town model for internet application

Metody automatického texturování 3D modelu měst s využitím internetových fotoalb 3D town model for internet application Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích Katedra informatiky Pedagogické fakulty Metody automatického texturování 3D modelu měst s využitím internetových fotoalb 3D town model for internet application

Více

CENTRUM ROZVOJE STROJÍRENSKÉHO VÝZKUMU LIBEREC

CENTRUM ROZVOJE STROJÍRENSKÉHO VÝZKUMU LIBEREC CENTRUM ROZVOJE STROJÍRENSKÉHO VÝZKUMU LIBEREC 1 ZÁKLADNÍ ÚDAJE O PROJEKTU CRSV Registrační číslo: CZ.1.05/2.1.00/03.0096 Zahájení projektu: 01.01.2009 Ukončení projektu: 31.12.2012 Celková dotace: Cíl

Více

Nejistota měření. Thomas Hesse HBM Darmstadt

Nejistota měření. Thomas Hesse HBM Darmstadt Nejistota měření Thomas Hesse HBM Darmstadt Prof. Werner Richter: Výsledek měření bez určení nejistoty měření je nejistý, takový výsledek je lépe ignorovat" V podstatě je výsledek měření aproximací nebo

Více

Measurement of fiber diameter by laser diffraction Měření průměru vláken pomocí laserové difrakce

Measurement of fiber diameter by laser diffraction Měření průměru vláken pomocí laserové difrakce Progres in textile science and technology TUL Liberec 24 Pokroky v textilních vědách a technologiích TUL v Liberci 24 Sec. 9 Sek. 9 Measurement of fiber diameter by laser diffraction Měření průměru vláken

Více

ROZDĚLENÍ SNÍMAČŮ, POŽADAVKY KLADENÉ NA SNÍMAČE, VLASTNOSTI SNÍMAČŮ

ROZDĚLENÍ SNÍMAČŮ, POŽADAVKY KLADENÉ NA SNÍMAČE, VLASTNOSTI SNÍMAČŮ ROZDĚLENÍ SNÍMAČŮ, POŽADAVKY KLADENÉ NA SNÍMAČE, VLASTNOSTI SNÍMAČŮ (1.1, 1.2 a 1.3) Ing. Pavel VYLEGALA 2014 Rozdělení snímačů Snímače se dají rozdělit podle mnoha hledisek. Základním rozdělení: Snímače

Více

Principy a instrumentace

Principy a instrumentace Průtoková cytometrie Principy a instrumentace Ing. Antonín Hlaváček Úvod Průtoková cytometrie je moderní laboratorní metoda měření a analýza fyzikálních -chemických vlastností buňky během průchodu laserovým

Více

Vliv komy na přesnost měření optických přístrojů. Antonín Mikš Katedra fyziky, FSv ČVUT, Praha

Vliv komy na přesnost měření optických přístrojů. Antonín Mikš Katedra fyziky, FSv ČVUT, Praha Vliv komy na přesnost měření optických přístrojů Antonín Mikš Katedra fyziky, FSv ČVUT, Praha V práci je vyšetřován vliv meridionální komy na přesnost měření optickými přístroji a to na základě difrakční

Více

Mikroskop včera a dnes a jeho využití ve fyzikálním praktiku

Mikroskop včera a dnes a jeho využití ve fyzikálním praktiku Mikroskop včera a dnes a jeho využití ve fyzikálním praktiku JIŘÍ TESAŘ 1, VÍT BEDNÁŘ 2 Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích 1, Západočeská univerzita v Plzni 2 Abstrakt Úvodní část příspěvku je

Více

SOFTWARE PRO ANALÝZU LABORATORNÍCH MĚŘENÍ Z FYZIKY

SOFTWARE PRO ANALÝZU LABORATORNÍCH MĚŘENÍ Z FYZIKY SOFTWARE PRO ANALÝZU LABORATORNÍCH MĚŘENÍ Z FYZIKY P. Novák, J. Novák, A. Mikš Katedra fyziky, Fakulta stavební, České vysoké učení technické v Praze Abstrakt V rámci přechodu na model strukturovaného

Více

Příloha P.1 Mapa větrných oblastí

Příloha P.1 Mapa větrných oblastí Příloha P.1 Mapa větrných oblastí P.1.1 Úvod Podle metodiky Eurokódů se velikost zatížení větrem odvozuje z výchozí hodnoty základní rychlosti větru, definované jako střední rychlost větru v intervalu

Více

Odborně-pedagogický koncept

Odborně-pedagogický koncept Odborně-pedagogický koncept Škola SPŠCH Brno (CZ) Oblast Odborné vzdělávání Odborná zaměření 1. Aplikovaná chemie Analytická chemie Farmaceutické substance Ochrana životního prostředí 2. Analýza potravin

Více

vede sice ke zvýšení kontrastu, zároveň se ale snižuje rozlišení a ostrost obrazu (Obr. 46).

vede sice ke zvýšení kontrastu, zároveň se ale snižuje rozlišení a ostrost obrazu (Obr. 46). 4. cvičení Metody zvýšení kontrastu obrazu (1. část) 1. Přivření kondenzorové clony nebo snížení kondenzoru vede sice ke zvýšení kontrastu, zároveň se ale snižuje rozlišení a ostrost obrazu (Obr. 46).

Více

ANALYTICKÝ PRŮZKUM / 1 CHEMICKÉ ANALÝZY ZLATÝCH A STŘÍBRNÝCH KELTSKÝCH MINCÍ Z BRATISLAVSKÉHO HRADU METODOU SEM-EDX. ZPRACOVAL Martin Hložek

ANALYTICKÝ PRŮZKUM / 1 CHEMICKÉ ANALÝZY ZLATÝCH A STŘÍBRNÝCH KELTSKÝCH MINCÍ Z BRATISLAVSKÉHO HRADU METODOU SEM-EDX. ZPRACOVAL Martin Hložek / 1 ZPRACOVAL Martin Hložek TMB MCK, 2011 ZADAVATEL PhDr. Margaréta Musilová Mestský ústav ochrany pamiatok Uršulínska 9 811 01 Bratislava OBSAH Úvod Skanovací elektronová mikroskopie (SEM) Energiově-disperzní

Více

Teoretický úvod: [%] (1)

Teoretický úvod: [%] (1) Vyšší odborná škola a Střední průmyslová škola elektrotechnická Božetěchova 3, Olomouc Laboratoře elektrotechnických měření Název úlohy Číslo úlohy ZESILOVAČ OSCILÁTOR 101-4R Zadání 1. Podle přípravku

Více

1. Teorie mikroskopových metod

1. Teorie mikroskopových metod 1. Teorie mikroskopových metod A) Mezi první mikroskopové metody patřilo barvení biologických preparátů vhodnými barvivy, což způsobilo ovlivnění amplitudy světla prošlého preparátem, který pak byl snadno

Více

ZM 1 BOX - Školní mikroskop včetně plastového kufříku

ZM 1 BOX - Školní mikroskop včetně plastového kufříku ZM 1 BOX - Školní mikroskop včetně plastového kufříku Velmi oblíbený žákovský mikroskop. Náklopné rameno umožní pohodlné pozorování. Zvětšení se provádí výměnou objektivů pomocí revolverového měniče, zaostřování

Více

Dynamické kritické jevy

Dynamické kritické jevy Dynamické kritické jevy statické vs. dynamické Ve statické situaci je kritické chování určeno: i. dimenzí parametru uspořádání ii. dimenzí fyzikálního prostoru každý obor začíná nejprve statickými jevy

Více

Moderní metody rozpoznávání a zpracování obrazových informací 15

Moderní metody rozpoznávání a zpracování obrazových informací 15 Moderní metody rozpoznávání a zpracování obrazových informací 15 Hodnocení transparentních materiálů pomocí vizualizační techniky Vlastimil Hotař, Ondřej Matúšek Katedra sklářských strojů a robotiky Fakulta

Více

GEOMETRICKÁ OPTIKA. Znáš pojmy A. 1. Znázorni chod význačných paprsků pro spojku. Čočku popiš a uveď pro ni znaménkovou konvenci.

GEOMETRICKÁ OPTIKA. Znáš pojmy A. 1. Znázorni chod význačných paprsků pro spojku. Čočku popiš a uveď pro ni znaménkovou konvenci. Znáš pojmy A. Znázorni chod význačných paprsků pro spojku. Čočku popiš a uveď pro ni znaménkovou konvenci. Tenká spojka při zobrazování stačí k popisu zavést pouze ohniskovou vzdálenost a její střed. Znaménková

Více

ZKUŠENOSTI S POUŽITÍM MĚŘIČE AKTIVITY ATOMLAB 500

ZKUŠENOSTI S POUŽITÍM MĚŘIČE AKTIVITY ATOMLAB 500 ZKUŠENOSTI S POUŽITÍM MĚŘIČE AKTIVITY ATOMLAB 500 Jiří Štěpán KNM FN Brno a LF MU 33. Pracovní dny sekce radiofarmacie, 1. - 3. 6. 2011 - Rožnov pod Radhoštěm Charakteristiky důležité pro praktické použití

Více

DIGITÁLNÍ FOTOGRAFIE

DIGITÁLNÍ FOTOGRAFIE DIGITÁLNÍ FOTOGRAFIE Petr Vaněček, katedra informatiky a výpočetní techniky Fakulta aplikovaných věd, Západočeská univerzita v Plzni 19. listopadu 2009 1888, Geroge Eastman You press the button, we do

Více

Lupa a mikroskop příručka pro učitele

Lupa a mikroskop příručka pro učitele Obecné informace Lupa a mikroskop příručka pro učitele Pro vysvětlení chodu světelných paprsků lupou a mikroskopem je nutno navázat na znalosti o zrcadlech a čočkách. Hodinová dotace: 1 vyučovací hodina

Více

Optická mikroskopie a spektroskopie nanoobjektů. Nanoindentace. Pavel Matějka

Optická mikroskopie a spektroskopie nanoobjektů. Nanoindentace. Pavel Matějka Optická mikroskopie a spektroskopie nanoobjektů Nanoindentace Pavel Matějka Optická mikroskopie a spektroskopie nanoobjektů 1. Optická mikroskopie blízkého pole 1. Princip metody 2. Instrumentace 2. Optická

Více

Studentská tvůrčí a odborná činnost STOČ 2012

Studentská tvůrčí a odborná činnost STOČ 2012 Studentská tvůrčí a odborná činnost STOČ 2012 MIKROVLNNÁ SKENOVACÍ MIKROSKOPIE Josef KUDĚLKA, Tomáš MARTÍNEK Univerzita Tomáše Bati ve Zlíně Fakulta aplikované informatiky Nad Stráněmi 4511 760 05 Zlín

Více

MONITOR. Helena Kunertová

MONITOR. Helena Kunertová MONITOR Helena Kunertová Úvod O monitorech Historie a princip fungování CRT LCD PDP Nabídka na trhu Nabídka LCD na trhu Monitor Výstupní elektronické zařízení sloužící k zobrazování textových a grafických

Více

Spektrální analyzátor Ocean optics

Spektrální analyzátor Ocean optics Anna Kapchenko, Václav Dajčar, Jan Zmelík 4.3.21 1. Zadání: Spektrální analyzátor Ocean optics Získat praktické zkušenosti s měřením spektrálních charakteristik pomocí spektrálního analyzátoru Ocean Optics

Více

Životopis. Osobní údaje. Vzdělání. Zaměstnání. Pedagogická činnost na VŠE v Praze. Vysoká škola ekonomická v Praze

Životopis. Osobní údaje. Vzdělání. Zaměstnání. Pedagogická činnost na VŠE v Praze. Vysoká škola ekonomická v Praze Vysoká škola ekonomická v Praze Osobní údaje Mgr. Ing. Pavel Král, Ph.D., 31. leden 1978 bydliště Přestavlky 5, 25791 Sedlec-Prčice (Přestavlky) Vzdělání 2002 Ing. VŠE, Fakulta managementu Ekonomika a

Více

ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY

ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY s názvem MIKROSKOPY PRO CEITEC MU - ČÁST 8 vyhotovené podle 156 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách, 1. ODŮVODNĚNÍ ÚČELNOSTI VEŘEJNÉ ZAKÁZKY v platném znění (dále jen

Více

ÚVOD DO PROBLEMATIKY PIV

ÚVOD DO PROBLEMATIKY PIV ÚVOD DO PROBLEMATIKY PIV Jiří Nožička, Jan Novotný ČVUT v Praze, Fakulta strojní, Ú 207.1, Technická 4, 166 07, Praha 6, ČR 1. Základní princip PIV Particle image velocity PIV je měřící technologie, která

Více