Mikroskopie živé neznačené buňky: Mikroskop jako informační kanál

Rozměr: px
Začít zobrazení ze stránky:

Download "Mikroskopie živé neznačené buňky: Mikroskop jako informační kanál"

Transkript

1 Mikroskopie živé neznačené buňky: Mikroskop jako informační kanál Dalibor Štys Škola komplexních systémů Nové Hrady

2 Akademické a univerzitní centrum Nové Hrady Academic and university center Nové Hrady Founded 2000 by a group led by vice-president of Weizman institute Avigdor Scherz Currently one unsuccessfull application to European Research Council grant Instiitute of Science and Technology Austria in Klosterneuburg Founded by a group led by former president of Weizman institute Haim Harari Currently 10 grants awarded by European Research Council

3 Poděkování studentům letních škol, kteří bývají sponzorováni řadou různých projektů strukturálních fondů EU

4 Živé systémy jsou nejzjevnějším příkladem samoorganizující komplexních systémů a jsou založené na chemo-mechanických jevech. Podobné problémy jsou řešeny při popisu samoorganizujících technických systémů jako jsou sítě, počítačové sémantické struktury apod. Společným problémem při jejich studiu je otázka jak měřit experimentálně pozorovatelnou samoorganizaci?

5 Systémová biologie Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Současná systémová biologie se snaží kvantifikovat co nejvíce látek ve studovaném biologickém objektu. Biologické objekty ale nejsou pytlíky s chemikáliemi, mají svou trojrozměrnou strukturu. Struktura biologických objektů je udržována dynamickými ději. Biologické objekty jsou sobě podobné a Ljapunovovsky / asymptoticky (?) stabilní. Cílem mikroskopie živé buňky kvantitativního zobrazování - (z pohledu termodynamiky) je hledání makroskopických proměnných v chemomechanickém prostoru, které buňku nebo její části správně charakterizují. KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes Urban J., Vaněk J., Soukup J. and Štys D., Expertomica Metabolite Profiling: Getting more information from LC- MS using the stochastic systems theory approach, (2009) Bioinformatics 25, Urban J, Hrouzek P. and Štys D., Time alignmnent in HPLC-MS 2012 Lambert Academic Publishing, ISBN:

6 Systémová biologie Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita

7 Systémová biologie Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita

8 Systémová biologie Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita

9 Mikroskopie živé buňky zvětšení 18 století 19 století Airy difrakční disk Abbe koncept kondenzoru, difrakční limit Koch barvení buněk 1934 Zernike Mikroskopie s fázovým kontrastem Konfokální mikroskop mechanické omezení budícího svazku 1969 Reynolds - mikroskopie s videozesílením 1990 současnost: mnoho druhů mikroskopů se superrozlišením, zejména pro fluorescenčně značené vzorky 2012 Sub-mikroskop nanoskop pro neznačené živé buňky Mikroskopie živé buňky velikost pozorovaného pole Popis optického chování mikroskopu 1942 Nijboer Zernike integrál 1951 Toraldo di Francia optická mikroskopie nemá teoretický limit rozlišení Rozlišení 1990 současnost: teoretický popis optické mikroskopie se superrozlišením 2000 současnost: digitální kamery 2009 mikroskop jako informační kanál Mikroskopie mrtvé buňky 1590 Jansen 10x 1665 Hook 1820 Mikrotomie 1837 Purkyně 1900 Barvení 1931 Elektronový mikroskop x zvětšení

10 Skutečná zobrazovací funkce mikroskopu - point spread function

11 Skutečná zobrazovací funkce mikroskopu - point spread function

12 Mikroskopie živé buňky Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Mikroskopický experiment, konstrukce a funkce nového mikroskopu HeLa buňky hlavní model pro lidské tkáňové kultury

13 Skutečný záznam z primární kultury pacienta s rakovinu tlustého střeva Experimenty jsou dlouhodobé a vznikají tisíce obrázků, které se v současné době zpracovávají ručně. Prvotní motivací bylo automatické zpracování obrazu. Za praxe vyplynula nutnost pochopení vzniku mikroskopického obrazu nad rámec dostupných popisů a pochopení vzniku principiálních zákonistostí vzniku struktur uvnitř živé buňky.

14 Buněčný cyklus Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Buněčný cyklus je nejzjevnější událost v životě buňky. Během ní se buňka rozdělí na dvě a více buněk. Předpokládá se, že počet dělení odráží stupeň integrace buňky do tkáně. Proto se počet dělení v čase používá, například, v akreditovaných laboratořích pro hodnocení biokompatibility a toxicity. Buněčný cyklus se skládá z fází stavů.

15 Software e-cell Dalibor Štys, School of Complex Systems FFPW USB Czech Republic Software: software Manuální vyhodnocení vývoje buněk, anotační nástroj Expertomica Hela Cells 3.03 RC Expertomica Ecell Publikace: Levitner T, Timr S, Stys D., Expertomica Cells: analysis of cell monolayer development, (2010) Bioinformatics, 26,

16 Buněčné události pohled z hlediska obecné teorie systémů Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Analýza dává jen malý počet dokončených buněčných cyklů je třeba zvětšit zorné pole a automatizovat analýzu. Levitner T, Timr S, Stys D., Expertomica Cells: analysis of cell monolayer development, (2010) Bioinformatics, 26,

17 Buněčné události pohled z hlediska obecné teorie systémů Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Stochastické chování živé buňky není primárně způsobeno fluktuacemi popisovaným rovnovážnou termodynamikou Rozdělení pravděpodobností v chování živých systémů závisí na počtu signálů, které si buňky vymění Levitner T, Timr S, Stys D., Expertomica Cells: analysis of cell monolayer development, (2010) Bioinformatics, 26,

18 Mikroskopický experiment, konstrukce a funkce nového mikroskopu. Technické požadavky na nový experimentální mikroskop - Snadné a rychlé zahájení experimentu za kontrolovaných podmínek teplota, vlhkost, CO 2 - Nízký celkový světelný výkon dopadající na buňku a odpovídající snímání kamerou - Skenování ve všech třech osách, kontrola pozice s přesností 1 pixel (cca 20 nm při 80x zvětšení) - Řízení založené na počítačové analýze obrazu Vypsali jsme veřejnou soutěž v níž zvítězilo konsorcium českých firem Compotech a Optax

19 Mikroskopie fázového kontrastu poskytuje informaci o celém obsahu buňky Image taken from Nikon

20 Principy mikroskopie s videozesílením Mizushima, Y., (1980) Detectivity limit of very small objects by videoenhanced microscopy. Applied Optics, 27, Mikroskopie s videozesílením je moderní variantou mikroskopie v temném poli Mizushima, Y., (1980) Image taken from Nikon

21 Principy mikroskopie s videozesílením Image taken from Nikon Van Haver S., The extended Nijboer Zernike Theory and its Applications, PhD. Thesis 2010 Výpočet zobrazení pozorovaného objektu (bod, jednoduchý tvar) v různé vzdálenosti od ohniska při různých vlastnostech (vadách) čočky Braat, Jansen a spol

22 Principy mikroskopie s videozesílením Lipson S.G., Why is super-resolution so inefficient? Micron 34, pp Při vysoké intenzitě světla velkém počtu současně dopadajících fotonů - má čočka vysoké teoretické rozlišení za zachování velkého zorného pole Lipson S.G., 2003 Image taken from Nikon

23 Skutečná zobrazovací funkce mikroskopu - point spread function 1000mA 1250mA 1500mA 1750mA 2000mA 2250mA 2500mA 2750mA 3000mA

24 Optické schéma nového mikroskopu

25 2000 ma Při zobrazování živé nebarvené buňky nehledáme nejvyšší rozlišení, ale nejlépe zpracovatelnou a reprezentativní informaci o dané buňce v daném čase. 200 ma

26 Pozorování živé, neznačené, buňky Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Karusel s výměnou metod optického kontrastování Karusel pro výměnu barevných filtrů Sub-mikroskop - nanoskop Řízený zdroj světla vysoké intenzity založený na LED technologii Kamera s vysokou rychlostí snímání a ukládání neredukovaných dat (200 f/s, 2000x1100 bodů) Kamera s velkým počtem bodů na čipu (kinofilmová velikost), 4500x3000 bodů Optický stůl z kompozitních materiálů Stolek s přesným xy pohybem Karusel s automatizovanou výměnou objektivů a přesným z-pohybem Sejmuta po dobu testování byla plexisklová klimatizovaná skříň

27 Informační příspěvek bodu - point information gain (PIG, ΔI x,y,α ) počítáme pro každý bod v obrazu ve třech barevných kanálech pomocí Rényiho entropie. Stys D., Urban J., Vanek J., Císar P. Analysis of biological time-lapse microscopic experiment from the point of view of the information theory. Micron. 2011a, 42, Epub 2010 Feb 12. Stys, D., Vanek, J., Nahlik, T., Urban, J., Cisar, P.: The cell monolayer trajectory from the system state point of view. Mol. BioSyst. 7, (2011)

28 2000mA

29 2000 ma

30 Nevyloučili jsme, že jsme schopni rozlišit objekty jejichž velikost je menší než nejmenší objekt, který jsme schopni promítat na kameru

31 No. of points No. of points Modely PIG pro různá alfa normální rozdělení No. of points No. of points

32 Stys D., Jizba P., Papacek S., Nahlik T., and Cisar P., On measurement of internal variables of komplex self-organized systems and their relation to multifractal spectra, 2012, IWSOS 2012, LCNS 7166, pp , Kuipers and Heegaard eds. Springer: Heidelberg Dordrecht London New York, ISBN Entropie informačního příspěvku bodu Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Existuje unikátní makroskopický (v termodynamickém smyslu) identifikátor obrazu buňky? Lze pro strukturované systémy zavést něco jako Gibbsova energie pro nestrukturované systémy? Zavedli jsme veličiny entropie informačního příspěvku bodu - point information gain entropy (PIE, ΔI α ) a hustota entropie informačního příspěvku bodu point - information gain entropy density (PIE/points, ΔI α.r ) Sada hodnot PIE nebo PIE/points je unikátním identifikátorem obrazu. Rényiho entropie je základem pro zobecněnou dimenzi, která charakterizuje multifraktální objekty jako jsou chaotické atraktory a jiné samoorganizující systémy.

33 Stavová trajektorie v prostoru PIE a PIE/points Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita V prostoru 3x13 souřadnic tvořených hodnotami PIE/points pro hodnoty parametru α = 0,1; 0,3; 0,5; 0,7; 1; 1,3; 1,5; 1,7; 2,0; 2,5; 3,0; 3,5; 4,0 jsme provedli multivariantní analýzu a analýzu klastrů Stys D., Jizba P., Papacek S., Nahlik T., and Cisar P., On measurement of internal variables of komplex self-organized systems and their relation to multifractal spectra, 2012, IWSOS 2012, LCNS 7166, pp , Kuipers and Heegaard eds. Springer: Heidelberg Dordrecht London New York, ISBN

34 Provedli jsme analýzu hlavní komponenty pro 39 hodnot PIE/point jako stavových proměnných a analýzu klastrů. Byli jsme schopni detekovat další tvary nad rámec expertní klasifikace.

35 Jednoúčelová zařízení embryoview pro kliniky reprodukční medicíny Řízený zdroj světla vysoké intenzity založený na LED technologii Z-scan embrya Kamera s ukládáním neredukovaných dat + řízení snímání Přesný z-pohyb Embryoview pro kliniky reprodukční medicíny (Prague Fertility Center)

36 Odvozená jednoúčelová zařízení Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Jednoúčelová zařízení scanovací polarizační mikroskop pro Bosch Karusel s výměnou metod optického kontrastování Polarizační mikroskop pro kontrolu kvality plastů (firma Robert Bosch) Stolek s přesným xy pohybem Kamera s velkým počtem bodů na čipu (kinofilmová velikost)

37 Porovnání záznamu z modrého kanálu a přepočtené obrazové entropie při α= ma

38 Problémy automatické detekce stavů buňky Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Momentální problémy použití PIG pro automatickou klasifikaci stavů buněk z časosběrné mikroskopie: Neexistuje dobrá metoda automatizace oddělení buňky od pozadí

39 Problémy automatické detekce stavů buňky Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Dobrá metoda automatizace oddělení buňky od pozadí

40 Využití vlastností point spread function výpočet point divergence gain 1500 ma

41 Využití vlastností point spread function výpočet point divergence gain 1500 ma

42 Využití vlastností point spread function výpočet point divergence gain 1500 ma

43 Popis stavu buněčné kultury a) definice fenomenologických proměnných pro danou buňku - PIE ( V i,ϕ ) b) definice informačních vazeb mezibuněčné interakce a jejich klasifikace ( C i ) c) nalezení funkce rozdělení pravděpodobností buněčných osudů událostí ( P i ) Vytvoření stochastického modelu dynamiky živé buňky i, V i, i T, C PCS, C, P Zampa P., The principle of causality and new approach to system theory, In: Cybernetics and Systems, 2004, pp. 3-8, ISBN Žampa P Habilitační práce, Západočeská univerzita v Plzni

44 čas/min α 0,1 0, , , , , , , , , , ,3 0, , , , , , , , , , ,5 0, , , , , , , , , , ,7 0, , , , , , , , , , , , , , , , , , , , ,3-0, , ,1066-0, , , , , , , ,5-0, , , , , , , , , , ,7-0, ,0398-0, , , , , , , , , , , , , , , , , , ,5-0, , , , , , , , , , , , , , , , ,0188-0, , , ,5-0, , , , , , ,0167-0, , , , , , , , , ,0152-0, , ,02147 Popis stavu buněčné kultury Teorie stochastických systémů ilustrována pomocí skutečně naměřených hodnot PIE 3 3, 2 T V2, T, V C T, V C, 1 1, C 2 PCS, C, P 3 T, V C 4 4, 1 4 T, V C 5 5, T, V C 6 6, T V7, 8 8,, C P 2 7 čas/min α 0,1 0, , , , ,3 0, , , , ,5 0, , , , ,7 0, , , , , , , ,0209 1,3-0, , , , ,5-0, , , , ,7-0, , , , , , , , ,5-0, , , ,02546 čas/min , , , ,02116 α 3,5-0, , , , ,1 0, , , , , , , , ,3 0, , , , ,5 0, , , , ,7 0, , , , , , , , ,3-0,0941-0, , , ,5-0, , , , ,7-0, ,0598-0, , , , , , ,5-0, , , , , , , , ,5-0, , , , , , , ,01503 T, V C čas/min α 0,1 0, , , , ,3 0, , , , ,5 0, , , , ,7 0, , , , ,0192 0, , , ,3-0, , , , ,5-0,0574-0, ,0576-0, ,7-0,0446-0, , , , ,0259-0, , ,5-0, , , , , , , , ,5-0, , , , ,0245-0, ,0153-0,

45 Má využití hodnoty PIE/points oporu v teorii? Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Existuje unikátní makroskopický (v termodynamickém smyslu) identifikátor obrazu buňky? Zle pro strukturované systémy zavést něco jako Gibbsova energie pro nestrukturované systémy? Zavedli jsme veličiny entropie informačního bodu - point information gain entropy (PIE) a hustota entropie informačního bodu point information gain entropy density (PIE/points) Sada hodnot PIE nebo PIE/points je unikátním identifikátorem obrazu. Rényiho entropie je základem pro zobecněnou dimenzi D α, která charakterizuje multifraktální objekty jako jsou chaotické atraktory a jiné samoorganizující systémy. Jako všechny dimenze, předpokládá se nalezení limity v přiblížení k nulové délce měřítka r

46 Chaotický atraktor jako nástroj k diskuzi o vhodném modelu Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Model samoorganizujícího systému Lorenzův atraktor Ortogonální proměnné v Lorenzově atraktoru jsou vztaženy ke konkrétnímu experimentu tzv. Bénardově cele. Jsou to: x celkový tok hmoty y rozdíl teplot horní a dolní plochy z maximální odchylka gradientu teploty od linearity Kaneko K. (2006). Life: An Introduction to Complex Systems Biology. Springer Grassberger,P., Procaccia,P.: Measuring the strangeness of strange attractors. Physica D 9, (1983)

47 Chaotický atraktor jako nástroj k diskuzi o vhodném modelu Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Měříme jeden bod, skupinu bodů, celou doménu atraktoru nebo celý atraktor. Jen v posledním případě můžeme rozumně interpretovat fraktální dimenzi.

48 Jaký by měl být tvar hlavní variety v ortogonálních souřadnicích získaných multivariantní analýzou? Jak by měla vypadat stavová funkce buněčné kultury?

49 Aktivity školy komplexních systémů ve vztahu k tématu Dalibor Štys, Škola komplexních systémů, Fakulta rybářství a ochrany vod, Jihočeská univerzita Škola komplexních systémů Laboratoř aplikované systémové biologie a Laboratoř tkáňových kultur Návrh a konstrukce přístrojů Software pro systémovou biologii Návrh a analýza experimentu Mezinárodní letní školy Jindřichův Hradec České Budějovice Technologie pro buněčnou biologii: Automatizovaná analýzy signálu LC-MS Analýza 2D gelů pro proteomiku Analýza buněčných osudů na základě teorie stochastických systémů Zesílení obrazu založené na výpočtu entropie a objektivní analýza buněčné trajektorie Sub-mikroskop, nanoskop

50 Děkuji všem spolupracovníkům, zejména Petrovi Císařovi, Petrovi Jizbovi, Vítěžslavu Březinovi, Janu Urbanovi, Jiřímu Soukupovi, Janu Vaňkovi, Tomáši Náhlíkovi, Tomáši Levitnerovi, Jindřichu Soukupovi, Karině Romanové, Anně Zhyrové, Štěpánu Papáčkovi a též Aliaxandru Pautsinovi, technikům z laboratoře Aplikované systémové biologie a Laboratoře tkáňových kultur ŠKS FROV JU a pracovníkům spolupracujících firem. Hlavní granty: Jihočeské centrum akvakultury a biodiverzity hydrocenóz CENAKVA (CZ.1.05/2.1.00/ ) EEA funds sub-projekt HTCFOOD (A/CZ0046/1/0008) Innovation 4 Welfare projekt sponzorovaný programem Interreg IVC Programme

51 Děkuji za laskavou pozornost

52 A model relevant to cellular metabolism: The Belousov Zhabotinsky reaction

53 Sémantická a syntaktická informace v statistice rozdělení bodu v obrazu

54 Konstrukce stavové trajektorie pomocí PCA sémantická informace PC % PC % PC % PC % PC %

55

56 Konstrukce stavové trajektorie s využitím sémantické informace PC % PC % PC % PC % PC %

57

58 A model relevant to cellular metabolism: The Belousov Zhabotinsky reaction Extraction of image statistics: TO BE ADDED cross statistics

59 Závislost kovariance jednotlivých PIE pro různá alfa s různými hlavními osami - celá trajektorie 0,31 PC1-red PC1-green PC1-blue 0,26 PC2-red PC2-green PC2-blue PC3-red PC3-green PC3-blue 0,21 0,16 0,11 0,06 0,01 0 0,5 1 1,5 2 2,5 3 3,5 4-0,04

60 Klastrová analýzy trajektorie

61 Závislost kovariance PIE pro různá alfa s hlavními osami pro první klastr 0,4 PC1-red PC1-green 0,35 PC1-blue PC2-red PC2-green 0,3 PC2-blue PC3-red PC3-green 0,25 PC3-blue 0,2 0,15 0,1 0, ,5 1 1,5 2 2,5 3 3,5 4-0,05

62 Typická rozdělení PIG pro různá alfa 0,4 PC1-blue PC2-blue 0,35 PC3-blue 0,3 0,25 0,2 0,15 0,1 0, ,5 1 1,5 2 2,5 3 3,5 4

63 Rozdíly mezi syntaktickou a sémantickou informací

64 Závislost PIE na alfa pro normální rozdělení 1,60E-02 1,40E-02 1,20E-02 1,00E-02 PIE /points 8,00E-03 6,00E-03 4,00E-03 2,00E-03 PIE 0,00E+00 0,00E+00 1,00E+00 2,00E+00 3,00E+00 4,00E+00-2,00E-03 α -4,00E-03

Technické a teoretické aspekty mikroskopie živé buňky

Technické a teoretické aspekty mikroskopie živé buňky Technické a teoretické aspekty mikroskopie živé buňky Dalibor Štys Škola komplexních systémů Nové Hrady Ţivé systémy jsou nejzjevnějším příkladem samoorganizující komplexních systémů a jsou zaloţené na

Více

Technická specifikace předmětu veřejné zakázky

Technická specifikace předmětu veřejné zakázky předmětu veřejné zakázky Příloha č. 1c Zadavatel požaduje, aby předmět veřejné zakázky, resp. přístroje odpovídající jednotlivým částem veřejné zakázky splňovaly minimálně níže uvedené parametry. Část

Více

Technické a teoretické aspekty mikroskopie živé buňky

Technické a teoretické aspekty mikroskopie živé buňky Dalibor Štys : Technické a teoretické aspekty mikroskopie živé buňky Technické a teoretické aspekty mikroskopie živé buňky D. Štys, J. Urban, T. Náhlík, J. Vaněk, P. Císař Jihočeská univerzita v Českých

Více

Nové NIKON centrum excelence pro super-rezoluční mikroskopii v Ústavu molekulární genetiky Akademie věd ČR

Nové NIKON centrum excelence pro super-rezoluční mikroskopii v Ústavu molekulární genetiky Akademie věd ČR Nové NIKON centrum excelence pro super-rezoluční mikroskopii v Ústavu molekulární genetiky Akademie věd ČR Společnost NIKON ve spolupráci s Ústavem molekulární genetiky AV ČR zahájila v úterý 21. ledna

Více

Zobrazování s využitím prostorového modulátoru světla

Zobrazování s využitím prostorového modulátoru světla Zobrazování s využitím prostorového modulátoru světla Technický seminář Centra digitální optiky vedoucí balíčku (PB4): prof. RNDr. Radim Chmelík, Ph.D. Řešitelské organizace: Pracovní balíček Zobrazování

Více

Konstrukční varianty systému pro nekoherentní korelační zobrazení

Konstrukční varianty systému pro nekoherentní korelační zobrazení Konstrukční varianty systému pro nekoherentní korelační zobrazení Technický seminář Centra digitální optiky Vedoucí balíčku (PB4): prof. RNDr. Radim Chmelík, Ph.D. Zpracoval: Petr Bouchal Řešitelské organizace:

Více

příloha C zadávací dokumentace pro veřejnou zakázku malého rozsahu Mikroskopy pro LF MU TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace)

příloha C zadávací dokumentace pro veřejnou zakázku malého rozsahu Mikroskopy pro LF MU TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace) příloha C zadávací dokumentace pro veřejnou zakázku malého rozsahu Mikroskopy pro LF MU TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace) Část 1 Stereomikroskop s digitální kamerou : - Konstrukce optiky CMO (Common

Více

Příloha C. zadávací dokumentace pro podlimitní veřejnou zakázku Mikroskopy pro LF MU 2013. TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace)

Příloha C. zadávací dokumentace pro podlimitní veřejnou zakázku Mikroskopy pro LF MU 2013. TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace) Příloha C zadávací dokumentace pro podlimitní veřejnou zakázku Mikroskopy pro LF MU 2013 TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace) 1. část VZ: Laboratorní mikroskop s digitální kamerou a PC Položka č.1

Více

Rozhodnutí děkana č. 37/2015 Uvádění adresy na publikacích, děkování projektům a jednorázové odměny za výsledky zaměstnanců FROV JU

Rozhodnutí děkana č. 37/2015 Uvádění adresy na publikacích, děkování projektům a jednorázové odměny za výsledky zaměstnanců FROV JU čj. 09/0511/15 Vodňany, 14.12.2015 Rozhodnutí děkana č. 37/2015 Uvádění adresy na publikacích, děkování projektům a jednorázové odměny za výsledky zaměstnanců FROV JU dosažené podle RIVu 1) Uvádění adresy

Více

Ústav molekulární a translační medicíny LF UP holografický transmisní mikroskop

Ústav molekulární a translační medicíny LF UP holografický transmisní mikroskop ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY ve smyslu ust. 156 zákona č. 137/2006 Sb., ve znění pozdějších předpisů (dále jen zákon ) a v souladu s ust. 2 až 8 vyhlášky č. č. 232/2012 Sb. (dále jen vyhláška) VEŘEJNÁ ZAKÁZKA

Více

EM, aneb TEM nebo SEM?

EM, aneb TEM nebo SEM? EM, aneb TEM nebo SEM? Jiří Šperka Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita, Brno 2. únor 2011 / Prezentace pro studentský seminář Jiří Šperka (Masarykova univerzita) SEM a TEM 2. únor 2011 1 / 21

Více

Fluorescenční mikroskopie

Fluorescenční mikroskopie Fluorescenční mikroskopie Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii Ctirad Hofr 1 VYUŽITÍ FLUORESCENCE, PŘÍMÁ FLUORESCENCE, PŘÍMÁ A NEPŘÍMA IMUNOFLUORESCENCE, BIOTIN-AVIDINOVÁ METODA IMUNOFLUORESCENCE

Více

MIKROSKOPIE JAKO NÁSTROJ STUDIA MIKROORGANISMŮ

MIKROSKOPIE JAKO NÁSTROJ STUDIA MIKROORGANISMŮ Mikroskopické techniky MIKROSKOPIE JAKO NÁSTROJ STUDIA MIKROORGANISMŮ Slouží k vizualizaci mikroorganismů Antoni van Leeuwenhoek (1632-1723) Čočka zvětšující 300x Různé druhy mikroskopů, které se liší

Více

FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP

FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP na gymnáziu Pierra de Coubertina v Táboře Pavla Trčková, kabinet Biologie, GPdC Tábor Co je fluorescence Fluorescence je jev spočívající v tom, že některé látky (fluorofory) po

Více

Optické metody a jejich aplikace v kompozitech s polymerní matricí

Optické metody a jejich aplikace v kompozitech s polymerní matricí Optické metody a jejich aplikace v kompozitech s polymerní matricí Doc. Ing. Eva Nezbedová, CSc. Polymer Institute Brno Ing. Zdeňka Jeníková, Ph.D. Ústav materiálového inženýrství, Fakulta strojní, ČVUT

Více

Interní norma č. 22-102-01/01 Průměr a chlupatost příze

Interní norma č. 22-102-01/01 Průměr a chlupatost příze Předmluva Text vnitřní normy byl vypracován v rámci Výzkumného centra Textil LN00B090 a schválen oponentním řízením dne 7.12.2004. Předmět normy Tato norma stanoví postup měření průměru příze a celkové

Více

Potlačování šumu v mikroskopických snímcích pomocí adaptivního non-local means filtru

Potlačování šumu v mikroskopických snímcích pomocí adaptivního non-local means filtru Potlačování šumu v mikroskopických snímcích pomocí adaptivního non-local means filtru Jarní škola 2013 Krušné hory, Mariánská 28. května 2013 Motivace Časosběrná fluorescenční mikroskopie detekce částic

Více

Tento materiál byl vytvořen v rámci projektu Operačního programu Vzdělávání pro konkurenceschopnost.

Tento materiál byl vytvořen v rámci projektu Operačního programu Vzdělávání pro konkurenceschopnost. Tento materiál byl vytvořen v rámci projektu Operačního programu Vzdělávání pro konkurenceschopnost. Projekt MŠMT ČR Číslo projektu Název projektu školy Šablona III/2 EU PENÍZE ŠKOLÁM CZ.1.07/1.4.00/21.2146

Více

Mikroskopie, zobrazovací technika. Studentská 1402/2 461 17 Liberec 1 tel.: +420 485 353 006 cxi.tul.cz

Mikroskopie, zobrazovací technika. Studentská 1402/2 461 17 Liberec 1 tel.: +420 485 353 006 cxi.tul.cz Mikroskopie, zobrazovací technika Vizualizační technika Systém pro přímé sledování dějů ve spalovacím motoru AVL VISIOSCOPE, součástí zařízení je optické měřící zařízení pro měření teplot (VISIOFEM Temperature

Více

Lekce 4 Statistická termodynamika

Lekce 4 Statistická termodynamika Lekce 4 Statistická termodynamika Osnova 1. Co je statistická termodynamika 2. Mikrostav, makrostav a Gibbsův soubor 3. Příklady Gibbsových souborů 4. Souborové střední hodnoty 5. Časové střední hodnoty

Více

CEITEC a jeho IT požadavky. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.

CEITEC a jeho IT požadavky. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D. CEITEC a jeho IT požadavky RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D. Co je CEITEC? CEITEC je projekt výstavby středoevropského vědecko-výzkumného centra excelence v Brně Zaměření projektu: základní i aplikovaný

Více

TECHNICKÁ UNIVERZITA V LIBERCI

TECHNICKÁ UNIVERZITA V LIBERCI TECHNICKÁ UNIVERZITA V LIBERCI Fakulta mechatroniky, informatiky a mezioborových studií Základní pojmy diagnostiky a statistických metod vyhodnocení Učební text Ivan Jaksch Liberec 2012 Materiál vznikl

Více

ZKUŠEBNÍ PROTOKOLY. B1M15PPE / část elektrické stroje cvičení 1

ZKUŠEBNÍ PROTOKOLY. B1M15PPE / část elektrické stroje cvičení 1 ZKUŠEBNÍ PROTOKOLY B1M15PPE / část elektrické stroje cvičení 1 1) Typy testů 2) Zkušební laboratoře 3) Dokumenty 4) Protokoly o školních měřeních 2/ N TYPY TESTŮ PROTOTYPOVÉ TESTY (TYPOVÁ ZKOUŠKA) KUSOVÉ

Více

Základy mikroskopie. Úkoly měření: Použité přístroje a pomůcky: Základní pojmy, teoretický úvod: Úloha č. 10

Základy mikroskopie. Úkoly měření: Použité přístroje a pomůcky: Základní pojmy, teoretický úvod: Úloha č. 10 Úloha č. 10 Základy mikroskopie Úkoly měření: 1. Seznamte se základní obsluhou třech typů laboratorních mikroskopů: - biologického - metalografického - stereoskopického 2. Na výše jmenovaných mikroskopech

Více

Optická konfokální mikroskopie a mikrospektroskopie. Pavel Matějka

Optická konfokální mikroskopie a mikrospektroskopie. Pavel Matějka Optická konfokální mikroskopie a Pavel Matějka 1. Konfokální mikroskopie 1. Princip metody - konfokalita 2. Instrumentace metody zobrazování 3. Analýza obrazu 2. Konfokální 1. Luminiscenční 2. Ramanova

Více

Optika pro mikroskopii materiálů I

Optika pro mikroskopii materiálů I Optika pro mikroskopii materiálů I Jan.Machacek@vscht.cz Ústav skla a keramiky VŠCHT Praha +42-0- 22044-4151 Osnova přednášky Základní pojmy optiky Odraz a lom světla Interference, ohyb a rozlišení optických

Více

M I K R O S K O P I E

M I K R O S K O P I E Inovace předmětu KBB/MIK SVĚTELNÁ A ELEKTRONOVÁ M I K R O S K O P I E Rozvoj a internacionalizace chemických a biologických studijních programů na Univerzitě Palackého v Olomouci CZ.1.07/2.2.00/28.0066

Více

Nelineární systémy a teorie chaosu

Nelineární systémy a teorie chaosu Martin Duspiva KOIF2-2007/2008 Definice Lineární systém splňuje podmínky linearita: f (x + y) = f (x) + f (y) aditivita: f (αx) = αf (x) Každý systém, který nesplňuje jednu z předchozích podmínek nazveme

Více

Vypracoval: Martin Paúr. 27. Června 2014 1 / 14

Vypracoval: Martin Paúr. 27. Června 2014 1 / 14 Vypracoval: Martin Paúr 27. Června 2014 1 / 14 Motivace 1 Navrhnutí optické sestavy pro měření rovinných ploch Návrh optické sestavy v programu OSLO Navrhnutí mechanické sestavy experimentu 2 Sestavení

Více

ZPRACOVÁNÍ OBRAZU přednáška 3

ZPRACOVÁNÍ OBRAZU přednáška 3 ZPRACOVÁNÍ OBRAZU přednáška 3 Vít Lédl vit.ledl@tul.cz TECHNICKÁ UNIVERZITA V LIBERCI Fakulta mechatroniky, informatiky a mezioborových studií Tento materiál vznikl v rámci projektu ESF CZ.1.07/2.2.00/07.0247,

Více

Rozdělení přístroje zobrazovací

Rozdělení přístroje zobrazovací Optické přístroje úvod Rozdělení přístroje zobrazovací obraz zdánlivý subjektivní přístroje lupa mikroskop dalekohled obraz skutečný objektivní přístroje fotoaparát projekční přístroje přístroje laboratorní

Více

Předmluva 9 Obsah knihy 9 Typografické konvence 10 Informace o autorovi 10 Poděkování 10

Předmluva 9 Obsah knihy 9 Typografické konvence 10 Informace o autorovi 10 Poděkování 10 Obsah Předmluva 9 Obsah knihy 9 Typografické konvence 10 Informace o autorovi 10 Poděkování 10 KAPITOLA 1 Úvod 11 Dostupná rozšíření Matlabu 13 Alternativa zdarma GNU Octave 13 KAPITOLA 2 Popis prostředí

Více

Konfokální mikroskop vybavený FLIM modulem pro detekci interakce molekul u živých buněk

Konfokální mikroskop vybavený FLIM modulem pro detekci interakce molekul u živých buněk Písemná zpráva zadavatele zpracovaná podle ust. 85 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách, ve znění pozdějších předpisů Veřejná zakázka na dodávky, ev. č. 527942 zadávaná podle 21 odst. 1 písm.

Více

Analýza vrstev pomocí elektronové spektroskopie a podobných metod

Analýza vrstev pomocí elektronové spektroskopie a podobných metod 1/23 Analýza vrstev pomocí elektronové a podobných metod 1. 4. 2010 2/23 Obsah 3/23 Scanning Electron Microscopy metoda analýzy textury povrchu, chemického složení a krystalové struktury[1] využívá svazek

Více

Defektoskopie a defektometrie

Defektoskopie a defektometrie Defektoskopie a defektometrie Aplikace počítačového vidění Karel Horák Skupina počítačového ového vidění Ústav automatizace a měřicí techniky Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií Vysoké

Více

3. Vlastnosti skla za normální teploty (mechanické, tepelné, optické, chemické, elektrické).

3. Vlastnosti skla za normální teploty (mechanické, tepelné, optické, chemické, elektrické). PŘEDMĚTY KE STÁTNÍM ZÁVĚREČNÝM ZKOUŠKÁM V BAKALÁŘSKÉM STUDIU SP: CHEMIE A TECHNOLOGIE MATERIÁLŮ SO: MATERIÁLOVÉ INŽENÝRSTVÍ POVINNÝ PŘEDMĚT: NAUKA O MATERIÁLECH Ing. Alena Macháčková, CSc. 1. Souvislost

Více

Základy mikroskopování

Základy mikroskopování Gymnázium a Střední odborná škola pedagogická, Čáslav, Masarykova 248 M o d e r n í b i o l o g i e reg. č.: CZ.1.07/1.1.32/02.0048 TENTO PROJEKT JE SPOLUFINANCOVÁN EVROPSKÝM SOCIÁLNÍM FONDEM A STÁTNÍM

Více

2D MANUAL. ložiscích, která umožňuje velmi rychlé a přesné bezkontaktní měření v rozsahu 400 mm 300 mm.

2D MANUAL. ložiscích, která umožňuje velmi rychlé a přesné bezkontaktní měření v rozsahu 400 mm 300 mm. vision systems 2D MANUAL VuMaster je manuální optický 2D měřicí přístroj přinášející VuMaster novou patentovanou technologii odměřování Colourmap. VuMaster nepoužívá tradiční stolek nebo enkodéry, ale

Více

Fotokroužek 2009/2010

Fotokroužek 2009/2010 Fotokroužek 2009/2010 První hodina Úvod do digitální fotografie Druhy fotoaparátů Diskuse Bc. Tomáš Otruba, 2009 Pouze pro studijní účely žáků ZŠ Slovanské náměstí Historie fotografie Za první fotografii

Více

Technický boroskop zařízení na monitorování spalovacích procesů

Technický boroskop zařízení na monitorování spalovacích procesů Technický boroskop zařízení na monitorování spalovacích procesů Katedra experimentální fyziky PřF UP Olomouc Doc. Ing. Luděk Bartoněk, Ph.D. Zvyšování účinnosti spalovacích procesů v různých odvětvích

Více

Moderní vizualizační nástroje pro elektrochemickou detekci iontů těžkých kovů

Moderní vizualizační nástroje pro elektrochemickou detekci iontů těžkých kovů Název: Školitel: Moderní vizualizační nástroje pro elektrochemickou detekci iontů těžkých kovů Renáta Kenšová, Marie Konečná Datum: 11. 9. 2013 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.3.00/20.0148 Název projektu: Mezinárodní

Více

Fotogrammetrické 3D měření deformací dálničních mostů typu TOM

Fotogrammetrické 3D měření deformací dálničních mostů typu TOM Fotogrammetrické 3D měření deformací dálničních mostů typu TOM Ing. Karel Vach CSc., s.r.o. Archeologická 2256, 155 00 Praha 5 http://www.eurogv.cz 1 Objekt SO 208 2 Technické zadání: - provést zaměření

Více

Techniky mikroskopie povrchů

Techniky mikroskopie povrchů Techniky mikroskopie povrchů Elektronové mikroskopie Urychlené elektrony - šíření ve vakuu, ovlivnění dráhy elektrostatickým nebo elektromagnetickým polem Nepřímé pozorování elektronového paprsku TEM transmisní

Více

Viková, M. : MIKROSKOPIE V Mikroskopie V M. Viková

Viková, M. : MIKROSKOPIE V Mikroskopie V M. Viková Mikroskopie V M. Viková LCAM DTM FT TU Liberec, martina.vikova@tul.cz Hloubka ostrosti problém m velkých zvětšen ení tloušťka T vrstvy vzorku kolmé k optické ose, kterou vidíme ostře zobrazenou Objektiv

Více

Moderní nástroje pro zobrazování biologicky významných molekul pro zajištění zdraví. René Kizek

Moderní nástroje pro zobrazování biologicky významných molekul pro zajištění zdraví. René Kizek Moderní nástroje pro zobrazování biologicky významných molekul pro zajištění zdraví René Kizek 12.04.2013 Fluorescence je fyzikálně chemický děj, který je typem luminiscence. Luminiscence se dále dělí

Více

Počítačová grafika a vizualizace I

Počítačová grafika a vizualizace I Počítačová grafika a vizualizace I PŘENOSOVÁ MÉDIA - KABELÁŽ Mgr. David Frýbert david.frybert@gmail.com SKENERY princip Předlohu pro digitalizaci ozařuje zdroj světla a odražené světlo je vedeno optickým

Více

OBRAZOVÁ ANALÝZA. Speciální technika a měření v oděvní výrobě

OBRAZOVÁ ANALÝZA. Speciální technika a měření v oděvní výrobě OBRAZOVÁ ANALÝZA Speciální technika a měření v oděvní výrobě Prostředky pro snímání obrazu Speciální technika a měření v oděvní výrobě 2 Princip zpracování obrazu matice polovodičových součástek, buňky

Více

Společná laboratoř optiky. Skupina nelineární a kvantové optiky. Představení vypisovaných témat. bakalářských prací. prosinec 2011

Společná laboratoř optiky. Skupina nelineární a kvantové optiky. Představení vypisovaných témat. bakalářských prací. prosinec 2011 Společná laboratoř optiky Skupina nelineární a kvantové optiky Představení vypisovaných témat bakalářských prací prosinec 2011 O naší skupině... Zařazení: UP PřF Společná laboratoř optiky skupina nelin.

Více

Statistické metody v digitálním zpracování obrazu. Jindřich Soukup 3. února 2012

Statistické metody v digitálním zpracování obrazu. Jindřich Soukup 3. února 2012 Statistické metody v digitálním zpracování obrazu Jindřich Soukup 3. února 2012 Osnova Úvod (Neparametrické) odhady hustoty pravděpodobnosti Bootstrap Použití logistické regresi při klasifikaci Odhady

Více

CLP ANALYSIS OF MOLECULAR MARKERS DIGITAL IMAGE ANALYSIS OF ELECTROPHOEROGRAMS CZECH VERSION

CLP ANALYSIS OF MOLECULAR MARKERS DIGITAL IMAGE ANALYSIS OF ELECTROPHOEROGRAMS CZECH VERSION CLP ANALYSIS OF MOLECULAR MARKERS DIGITAL IMAGE ANALYSIS OF ELECTROPHOEROGRAMS CZECH VERSION DIGITÁLNÍ OBRAZOVÁ ANALÝZA ELEKTROFORETICKÝCH GELŮ *** Vyhodnocování získaných elektroforeogramů: Pro vyhodnocování

Více

Zobrazovací systémy v transmisní radiografii a kvalita obrazu. Kateřina Boušková Nemocnice Na Františku

Zobrazovací systémy v transmisní radiografii a kvalita obrazu. Kateřina Boušková Nemocnice Na Františku Zobrazovací systémy v transmisní radiografii a kvalita obrazu Kateřina Boušková Nemocnice Na Františku Rentgenové záření Elektromagnetické záření o λ= 10-8 10-13 m V lékařství obvykle zdrojem rentgenová

Více

Princip rastrovacího konfokálního mikroskopu

Princip rastrovacího konfokálního mikroskopu Konfokální mikroskop Obsah: Konfokální mikroskop... 1 Princip rastrovacího konfokálního mikroskopu... 1 Rozlišovací schopnost... 2 Pozorování povrchů ve skutečných barvách... 2 Konfokální mikroskop Olympus

Více

VY_32_INOVACE_06_UŽITÍ ČOČEK_28

VY_32_INOVACE_06_UŽITÍ ČOČEK_28 VY_32_INOVACE_06_UŽITÍ ČOČEK_28 Autor: Mgr. Pavel Šavara Škola: Základní škola Slušovice, okres Zlín, příspěvková organizace Název projektu: Zkvalitnění ICT ve slušovské škole Anotace Materiál (DUM digitální

Více

Kalibrační proces ve 3D

Kalibrační proces ve 3D Kalibrační proces ve 3D FCC průmyslové systémy společnost byla založena v roce 1995 jako součást holdingu FCC dodávky komponent pro průmyslovou automatizaci integrace systémů kontroly výroby, strojového

Více

STUDIUM SKLOKERAMICKÝCH POVLAKŮ V BIOLOGICKÉM PROSTŘEDÍ

STUDIUM SKLOKERAMICKÝCH POVLAKŮ V BIOLOGICKÉM PROSTŘEDÍ STUDIUM SKLOKERAMICKÝCH POVLAKŮ V BIOLOGICKÉM PROSTŘEDÍ Ing. Vratislav Bártek e-mail: vratislav.bartek.st@vsb.cz doc. Ing. Jitka Podjuklová, CSc. e-mail: jitka.podjuklova@vsb.cz Ing. Tomáš Laník e-mail:

Více

ANALYTICKÝ PRŮZKUM / 1 CHEMICKÉ ANALÝZY DROBNÝCH KOVOVÝCH OZDOB Z HROBU KULTURY SE ZVONCOVÝMI POHÁRY Z HODONIC METODOU SEM-EDX

ANALYTICKÝ PRŮZKUM / 1 CHEMICKÉ ANALÝZY DROBNÝCH KOVOVÝCH OZDOB Z HROBU KULTURY SE ZVONCOVÝMI POHÁRY Z HODONIC METODOU SEM-EDX / 1 ZPRACOVAL Mgr. Martin Hložek TMB MCK, 2011 ZADAVATEL David Humpola Ústav archeologické památkové péče v Brně Pobočka Znojmo Vídeňská 23 669 02 Znojmo OBSAH Úvod Skanovací elektronová mikroskopie (SEM)

Více

Laboratorní úloha č. 6 - Mikroskopie

Laboratorní úloha č. 6 - Mikroskopie Laboratorní úloha č. 6 - Mikroskopie Úkoly měření: 1. Seznamte se s ovládáním stereoskopického mikroskopu, digitálního mikroskopu a fotoaparátu. 2. Studujte pod mikroskopem různé preparáty. Vyberte vhodný

Více

Digitální video mikroskop navržený pro flexibilní kontrolu, řízení jakosti, měření a digitální záznam.

Digitální video mikroskop navržený pro flexibilní kontrolu, řízení jakosti, měření a digitální záznam. dodavatel vybavení provozoven firem www.abetec.cz ESD digitální kamera Flexia OP-019 193 Obj. číslo: 106000633 Výrobce: Optilia Popis Digitální video mikroskop navržený pro flexibilní kontrolu, řízení

Více

ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH Projekt ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH PŘIHLÁŠKA STUDENTSKÉHO PROJEKTU Název projektu: Návrh a implementace procesu zpracování dat, formát MzXML Uchazeč Hlavní řešitel

Více

dodavatel vybavení provozoven firem ESD digitální systém pro kontrolu BGA, Standard OP Obj. číslo: Popis

dodavatel vybavení provozoven firem  ESD digitální systém pro kontrolu BGA, Standard OP Obj. číslo: Popis dodavatel vybavení provozoven firem www.abetec.cz ESD digitální systém pro kontrolu BGA, Standard OP019 155 Obj. číslo: 106000855 Výrobce: Optilia Popis Optický inspekční systém pro kontrolu BGA. HD kamera

Více

Základní pojmy. Je násobkem zvětšení objektivu a okuláru

Základní pojmy. Je násobkem zvětšení objektivu a okuláru Vznik obrazu v mikroskopu Mikroskop se skládá z mechanické části (podstavec, stojan a stolek s křížovým posunem), osvětlovací části (zdroj světla, kondenzor, clona) a optické části (objektivy a okuláry).

Více

Využití magneticko-rezonanční tomografie v měřicí technice. Ing. Jan Mikulka, Ph.D. Ing. Petr Marcoň

Využití magneticko-rezonanční tomografie v měřicí technice. Ing. Jan Mikulka, Ph.D. Ing. Petr Marcoň Využití magneticko-rezonanční tomografie v měřicí technice Ing. Jan Mikulka, Ph.D. Ing. Petr Marcoň Osnova Podstata nukleární magnetické rezonance (MR) Historie vývoje MR Spektroskopie MRS Tomografie MRI

Více

dokumentu: Proceedings of 27th International Conference Mathematical Methods in

dokumentu: Proceedings of 27th International Conference Mathematical Methods in 1. Empirical Estimates in Stochastic Optimization via Distribution Tails Druh výsledku: J - Článek v odborném periodiku, Předkladatel výsledku: Ústav teorie informace a automatizace AV ČR, v. v. i., Dodavatel

Více

CÍLE CHEMICKÉ ANALÝZY

CÍLE CHEMICKÉ ANALÝZY ANALYTICKÉ METODY CÍLE CHEMICKÉ ANALÝZY Získat maximum informací dostupným přírodovědným průzkumem o památce. Posoudit poruchy a poškození materiálů. Navrhnout nejvhodnější technologii restaurování. Určit

Více

Bioinformatika a výpočetní biologie KFC/BIN. I. Přehled

Bioinformatika a výpočetní biologie KFC/BIN. I. Přehled Bioinformatika a výpočetní biologie KFC/BIN I. Přehled RNDr. Karel Berka, Ph.D. Univerzita Palackého v Olomouci Definice bioinformatiky (Molecular) bio informatics: bioinformatics is conceptualising biology

Více

Grafika na počítači. Bc. Veronika Tomsová

Grafika na počítači. Bc. Veronika Tomsová Grafika na počítači Bc. Veronika Tomsová Proces zpracování obrazu Proces zpracování obrazu 1. Snímání obrazu 2. Digitalizace obrazu převod spojitého signálu na matici čísel reprezentující obraz 3. Předzpracování

Více

Digitální fotografie. Mgr. Milana Soukupová Gymnázium Česká Třebová

Digitální fotografie. Mgr. Milana Soukupová Gymnázium Česká Třebová Digitální fotografie Mgr. Milana Soukupová Gymnázium Česká Třebová Téma sady didaktických materiálů Číslo a název šablony Číslo didaktického materiálu Druh didaktického materiálu Téma didaktického materiálu

Více

ANALÝZA MĚŘENÍ TVARU VLNOPLOCHY V OPTICE POMOCÍ MATLABU

ANALÝZA MĚŘENÍ TVARU VLNOPLOCHY V OPTICE POMOCÍ MATLABU ANALÝZA MĚŘENÍ TVARU VLNOPLOCHY V OPTICE POMOCÍ MATLABU J. Novák, P. Novák Katedra fyziky, Fakulta stavební, České vysoké učení technické v Praze Abstrakt V práci je popsán software pro počítačovou simulaci

Více

DODATEČNÉ INFORMACE dle 49 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách

DODATEČNÉ INFORMACE dle 49 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách DODATEČNÉ INFORMACE dle 49 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách Zadavatel tímto poskytuje dodavatelům v souladu s 49 odst. 4 zákona o veřejných zakázkách dodatečné informace k veřejné zakázce

Více

Numerické řešení proudění stupněm experimentální vzduchové turbíny a budících sil na lopatky

Numerické řešení proudění stupněm experimentální vzduchové turbíny a budících sil na lopatky Konference ANSYS 2009 Numerické řešení proudění stupněm experimentální vzduchové turbíny a budících sil na lopatky J. Štěch Západočeská univerzita v Plzni, Katedra energetických strojů a zařízení jstech@kke.zcu.cz

Více

Analýza časového vývoje 3D dat v nukleární medicíně

Analýza časového vývoje 3D dat v nukleární medicíně Diplomová práce Analýza časového vývoje 3D dat v nukleární medicíně Jan Kratochvíla Prezentováno Seminář lékařských aplikací 12. prosince 2008 Vedoucí: Mgr. Jiří Boldyš, PhD., ÚTIA AV ČR Konzultant: Ing.

Více

Teorie měření a regulace

Teorie měření a regulace Ústav technologie, mechanizace a řízení staveb CW01 Teorie měření a regulace Praxe názvy 1. ZS 2015/2016 2015 - Ing. Václav Rada, CSc. OBECNÝ ÚVOD - praxe Elektrotechnická měření mohou probíhat pouze při

Více

NOVÁ METODIKA PŘÍPRAVY 1 MM FÓLIÍ PRO TEM ANALÝZU AUSTENITICKÝCH OCELÍ OZÁŘENÝCH NEUTRONY. Kontaktní e-mail: bui@cvrez.cz

NOVÁ METODIKA PŘÍPRAVY 1 MM FÓLIÍ PRO TEM ANALÝZU AUSTENITICKÝCH OCELÍ OZÁŘENÝCH NEUTRONY. Kontaktní e-mail: bui@cvrez.cz NOVÁ METODIKA PŘÍPRAVY 1 MM FÓLIÍ PRO TEM ANALÝZU AUSTENITICKÝCH OCELÍ OZÁŘENÝCH NEUTRONY Petra Bublíková 1, Vít Rosnecký 1, Jan Michalička 1, Eliška Keilová 2, Jan Kočík 2, Miroslava Ernestová 2 1 Centrum

Více

Principy a instrumentace

Principy a instrumentace Průtoková cytometrie Principy a instrumentace Ing. Antonín Hlaváček Úvod Průtoková cytometrie je moderní laboratorní metoda měření a analýza fyzikálních -chemických vlastností buňky během průchodu laserovým

Více

Rozhodnutí děkana č. 12/2016 k zajištění a využití pokusných zvířat na Fakultě rybářství a ochrany vod, Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích

Rozhodnutí děkana č. 12/2016 k zajištění a využití pokusných zvířat na Fakultě rybářství a ochrany vod, Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích č. j. 09/0436/16 Vodňany, 25. 7. 2016 Rozhodnutí děkana č. 12/2016 k zajištění a využití pokusných zvířat na Fakultě rybářství a ochrany vod, Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích S odkazem na platnou

Více

Studentská 1402/2 461 17 Liberec 1 tel.: +420 485 353 006 cxi.tul.cz

Studentská 1402/2 461 17 Liberec 1 tel.: +420 485 353 006 cxi.tul.cz Pokročilé simulace pro komplexní výzkum a optimalizace Ing. Michal Petrů, Ph.D. Studentská 1402/2 461 17 Liberec 1 tel.: +420 485 353 006 cxi.tul.cz Stránka: 2 Modelové simulace pro komplexní výzkum Mechanických

Více

Ústav experimentální medicíny AV ČR úspěšně rozšířil přístrojové vybavení pro vědce z peněz evropských fondů

Ústav experimentální medicíny AV ČR úspěšně rozšířil přístrojové vybavení pro vědce z peněz evropských fondů Ústav experimentální medicíny AV ČR úspěšně rozšířil přístrojové vybavení pro vědce z peněz evropských fondů Ústav úspěšně dokončil realizaci dvou investičních projektů s využitím prostředků z Operačního

Více

Úvod. OLYMPUS Stream Rychlý návod k obsluze

Úvod. OLYMPUS Stream Rychlý návod k obsluze Upozornění * Podívejte se prosím na on-line nápovědu v návodu (help) softwaru, nastavení softwaru, kalibraci systému a podrobná nastavení.. *Tento návod k obsluze obsahuje základní funkce verze SW Start

Více

Stereomikroskop. Stativ pro dopadající světlo

Stereomikroskop. Stativ pro dopadající světlo Stereomikroskop Konstrukční typ Greenough Apochromaticky korigovaná optika Zoomovací poměr min. 8:1 Rozsah celkového zvětšení 10x 80x nebo větší (včetně uvedených hodnot, s 10x okuláry, bez předsádky)

Více

Moderní aplikace statistické fyziky II - TMF050

Moderní aplikace statistické fyziky II - TMF050 Moderní aplikace statistické fyziky II - TMF050 Body 2, E-Kredity 3, 2/0 Zk - LS Miroslav Kotrla a František Slanina kotrla@fzu.cz slanina@fzu fzu.cz kmenově: externě: ÚTF UK FZÚ AV ČR, v.v.i. oddělení

Více

Buněčné automaty a mřížkové buněčné automaty pro plyny. Larysa Ocheretna

Buněčné automaty a mřížkové buněčné automaty pro plyny. Larysa Ocheretna Buněčné automaty a mřížkové buněčné automaty pro plyny Larysa Ocheretna Obsah Buněčný automat: princip modelu, vymezení pojmů Mřížkový buněčný automat pro plyny Příklady aplikace principů mřížkových buněčných

Více

Systém pro správu experimentálních dat a metadat. Petr Císař, Antonín Bárta 2014 Ústav komplexních systémů, FROV, JU

Systém pro správu experimentálních dat a metadat. Petr Císař, Antonín Bárta 2014 Ústav komplexních systémů, FROV, JU Systém pro správu experimentálních dat a metadat Petr Císař, Antonín Bárta 2014 Ústav komplexních systémů, FROV, JU BioWes Systém pro správu experimentálních dat a meta Hlavní cíl Vytvoření systému usnadňujícího

Více

Meo S-H: software pro kompletní diagnostiku intenzity a vlnoplochy

Meo S-H: software pro kompletní diagnostiku intenzity a vlnoplochy Centrum Digitální Optiky Meo S-H: software pro kompletní diagnostiku intenzity a vlnoplochy Výzkumná zpráva projektu Identifikační čí slo výstupu: TE01020229DV003 Pracovní balíček: Zpracování dat S-H senzoru

Více

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Závěrečná zpráva o řešení grantového projektu

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Závěrečná zpráva o řešení grantového projektu JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH Závěrečná zpráva o řešení grantového projektu Interní grant JU 1.Název Registrační číslo: 091/2008/P (04-091) projektu: Fluxes of information entropy in time

Více

Bioscience Imaging Centre

Bioscience Imaging Centre Bioscience Imaging Centre (Středisko mikroskopie) zajišťujeme moderní mikroskopické zařízení a softwary pro analýzu obrazu poradíme s plánováním experimentů (histologie, detekce proteinů a mrna) pomůžeme

Více

Nejistota měření. Thomas Hesse HBM Darmstadt

Nejistota měření. Thomas Hesse HBM Darmstadt Nejistota měření Thomas Hesse HBM Darmstadt Prof. Werner Richter: Výsledek měření bez určení nejistoty měření je nejistý, takový výsledek je lépe ignorovat" V podstatě je výsledek měření aproximací nebo

Více

Písemná zpráva zadavatele

Písemná zpráva zadavatele Písemná zpráva zadavatele o veřejné zakázce zadávané dle zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách, v platném znění (dále jen ZVZ ). Veřejná zakázka Název: Dokumentační systémy Druh veřejné zakázky:

Více

Sylabus předmětu: Metodologie kvantitativního výzkumu

Sylabus předmětu: Metodologie kvantitativního výzkumu Sylabus předmětu: Metodologie kvantitativního výzkumu Centrum adiktologie PK VFN 1. lékařská fakulta Univerzita Karlova v Praze Ke Karlovu 11, 120 00 Praha 2 www.adiktologie.cz Název oboru: Číslo předmětu:

Více

Význam měřm. Mgr. Anna Borovcová doc. Ing. Alena Buchalcevová, Ph.D. VŠE Praha

Význam měřm. Mgr. Anna Borovcová doc. Ing. Alena Buchalcevová, Ph.D. VŠE Praha Význam měřm ěření v testování softwaru Mgr. Anna Borovcová doc. Ing. Alena Buchalcevová, Ph.D VŠE Praha Motivace The Standish Group reporty za roky 1994 2009 1994 1996 1998 2000 2002 2004 2006 2009 Úspěšných

Více

Měření optických vlastností materiálů

Měření optických vlastností materiálů E Měření optických vlastností materiálů Úkoly : 1. Určete spektrální propustnost vybraných materiálů různých typů stavebních skel a optických filtrů pomocí spektrofotometru 2. Určete spektrální odrazivost

Více

Aplikace multifraktální geometrie na finančních trzích

Aplikace multifraktální geometrie na finančních trzích Aplikace multifraktální geometrie na finančních trzích 5. studentské kolokvium a letní škola matematické fyziky Stará Lesná Fakulta jaderná a fyzikálně inženýrská ČVUT, Praha 1. 9. 2011 Úvod náhodné procesy

Více

Data x Informace x Znalosti

Data x Informace x Znalosti Ing. Jan Král Jak to vidíme Program MS Excel je rozšířen a běžně dostupný bez dalších nákladů na převážné většině pracovišť, i pracovišť zabývajících se řízením jakosti a spolehlivosti, zpracovávajících

Více

MĚŘENÍ ABSOLUTNÍ VLHKOSTI VZDUCHU NA ZÁKLADĚ SPEKTRÁLNÍ ANALÝZY Measurement of Absolute Humidity on the Basis of Spectral Analysis

MĚŘENÍ ABSOLUTNÍ VLHKOSTI VZDUCHU NA ZÁKLADĚ SPEKTRÁLNÍ ANALÝZY Measurement of Absolute Humidity on the Basis of Spectral Analysis MĚŘENÍ ABSOLUTNÍ VLHKOSTI VZDUCHU NA ZÁKLADĚ SPEKTRÁLNÍ ANALÝZY Measurement of Absolute Humidity on the Basis of Spectral Analysis Ivana Krestýnová, Josef Zicha Abstrakt: Absolutní vlhkost je hmotnost

Více

Vliv komy na přesnost měření optických přístrojů. Antonín Mikš Katedra fyziky, FSv ČVUT, Praha

Vliv komy na přesnost měření optických přístrojů. Antonín Mikš Katedra fyziky, FSv ČVUT, Praha Vliv komy na přesnost měření optických přístrojů Antonín Mikš Katedra fyziky, FSv ČVUT, Praha V práci je vyšetřován vliv meridionální komy na přesnost měření optickými přístroji a to na základě difrakční

Více

Measurement of fiber diameter by laser diffraction Měření průměru vláken pomocí laserové difrakce

Measurement of fiber diameter by laser diffraction Měření průměru vláken pomocí laserové difrakce Progres in textile science and technology TUL Liberec 24 Pokroky v textilních vědách a technologiích TUL v Liberci 24 Sec. 9 Sek. 9 Measurement of fiber diameter by laser diffraction Měření průměru vláken

Více

Optoelektronické senzory. Optron Optický senzor Detektor spektrální koherence Senzory se CCD prvky Foveon systém

Optoelektronické senzory. Optron Optický senzor Detektor spektrální koherence Senzory se CCD prvky Foveon systém Optoelektronické senzory Optron Optický senzor Detektor spektrální koherence Senzory se CCD prvky Foveon systém Optron obsahuje generátor světla (LED) a detektor optické prostředí změna prostředí změna

Více

OPTICKÁ (světelná) MIKROSKOPIE

OPTICKÁ (světelná) MIKROSKOPIE OPTICKÁ (světelná) MIKROSKOPIE Alexandra Karasová, Andra Nistor Úvod Optická (světelná) mikroskopie je jednoduchá zobrazovací metoda, která nachází široké uplatnění v průmyslových, výzkumných, ale i klinických

Více

SOFTWARE PRO ANALÝZU LABORATORNÍCH MĚŘENÍ Z FYZIKY

SOFTWARE PRO ANALÝZU LABORATORNÍCH MĚŘENÍ Z FYZIKY SOFTWARE PRO ANALÝZU LABORATORNÍCH MĚŘENÍ Z FYZIKY P. Novák, J. Novák, A. Mikš Katedra fyziky, Fakulta stavební, České vysoké učení technické v Praze Abstrakt V rámci přechodu na model strukturovaného

Více

METODY FARMACEUTICKÉ TECHNOLOGIE ČL 2009, D PharmDr. Zdenka Šklubalová, Ph.D

METODY FARMACEUTICKÉ TECHNOLOGIE ČL 2009, D PharmDr. Zdenka Šklubalová, Ph.D METODY FARMACEUTICKÉ TECHNOLOGIE ČL 2009, D 2010 PharmDr. Zdenka Šklubalová, Ph.D. 10.6.2010 ZMĚNY D 2010 (harmonizace beze změn v textu) 2.9.1 Zkouška rozpadavosti tablet a tobolek 2.9.3 Zkouška disoluce

Více

GEOMETRICKÁ OPTIKA. Znáš pojmy A. 1. Znázorni chod význačných paprsků pro spojku. Čočku popiš a uveď pro ni znaménkovou konvenci.

GEOMETRICKÁ OPTIKA. Znáš pojmy A. 1. Znázorni chod význačných paprsků pro spojku. Čočku popiš a uveď pro ni znaménkovou konvenci. Znáš pojmy A. Znázorni chod význačných paprsků pro spojku. Čočku popiš a uveď pro ni znaménkovou konvenci. Tenká spojka při zobrazování stačí k popisu zavést pouze ohniskovou vzdálenost a její střed. Znaménková

Více