Cysteinové adukty globinu jako potenciální biomarkery expozice styrenu

Rozměr: px
Začít zobrazení ze stránky:

Download "Cysteinové adukty globinu jako potenciální biomarkery expozice styrenu"

Transkript

1 Cysteinové adukty globinu jako potenciální biomarkery expozice styrenu J. Mráz, I. Hanzlíková, Š. Dušková, E. Frantík, V. Stránský Státní zdravotní ústav Praha 1

2 Biomarkery expozice cizorodým látkám výchozí látka v moči polární metabolity v moči (biomarkery expozice styrenu: kys. mandlová a kys. fenylglyoxylová) výchozí látka v krvi těkavá výchozí látka ve vydechovaném vzduchu kovalentní adukty s biologickými makromolekulami (DNA, proteiny) (reaktivní metabolit styrenu: styrenoxid SO) adukty s globinem 2

3 Globinové adukty cizorodých látek dlouhá doba života v organismu odpovídající době života erythrocytů (u člověka 120 dnů) snadná dostupnost globinu v dostatečném množství (~140 mg/ml krve) vhodné analytické postupy pro stanovení 3

4 Reaktivní skupiny aminokyselin CH(CH 3 ) 2 CH 2 SH (CH 2 ) 4 NH 2 H 2 N C H CO HN C H CO HN C H CO Val Cys Lys N NH CH 2 CH 2 HN C H CO HN C H CO His Tyr 4

5 O * * S S NH (1) 2 (2) NH 2 O SO-Cys NH 2 H * * N N H O (3) (4) O NH 2 SO-Lys N O NH 2 * * N N NH 2 O N (5) (6) O N NH 2 * * N N N NH 2 O (7) (8) SO-His 5

6 Adukty cizorodých látek s globinem: Struktura Val Leu His Phe Pro Lys Gly Cys Ile Gln Arg cizorodá látka reaktivní aminokyselina Gly Cys Trp Leu Phe Gly Gly Asp Tyr Lys His Gly Glu Ile Pro Met Gln Cys 6

7 Adukty cizorodých látek s globinem: Metody analýzy (1) Val Leu His Phe Pro Lys Gly Cys Ile Gln kyselá nebo alkalická hydrolýza Arg Gly Cys Trp Leu Phe Gly Gly Asp Tyr Lys His Gly Glu Ile Pro Met Gln Cys 7

8 Adukty cizorodých látek s globinem: Metody analýzy (2) Val Val Leu His Phe Pro Lys Gly Cys Ile Gln Edmanova degradace nebo modifikovaná Edmanova degradace Arg Gly Cys Trp Leu Phe Gly Gly Asp Tyr Lys His Gly Glu Ile Pro Met Gln Cys 8

9 Adukty cizorodých látek s globinem: Metody analýzy (3) Val Leu His Phe Pro Lys Gly Cys Ile Gln totální hydrolýza (kyselá nebo enzymatická) Arg Gly Cys Trp Leu Phe Gly Gly Asp Tyr Lys His Gly Glu Ile Pro Met Gln Cys Val Leu His His Phe Pro Lys Gly Cys Cys Ile 9

10 Materiál Lidský globin inkubovaný in vitro s SO (vysoká hladina aduktů) Analytický postup (základní) Enzymatická hydrolýza pronasou Odpaření dosucha Derivatizace MTBSTFA Extrakce do heptanu GC/MS Výsledky Všechny očekávané adukty SO s Cys, Lys a His nalezeny (Jágr et al. Chem. Res. Toxicol. 20, (2007) 10

11 4,0x10 6 2,0x10 6 0, TIC Abundance 6x (21.13) 3x (21.28) 0 6x (22.86) m/z 526 m/z x (23.02) SO-Cys (TBDMS) 3 SO-Lys (TBDMS) 3 6x10 4 3x10 4 m/z (24.44) 5 (24.60) 6 (24.27) 7 (24.74) Time (min.) SO-His (TBDMS) 3 (Jágr et al. Chem. Res. Toxicol. 20, (2007) 11

12 Zvýšení citlivosti stanovení SO-Cys Stanovení SO-Cys v globinech in vitro krev + SO (0,01, 0,1 a 1 mm) myši exp. styrenu (600 nebo 1200 mg/m 3, 6 h/den 10 dní) dělníci exp. styrenu na pracovišti 12

13 Analytický postup (základní) Enzymatická hydrolýza globinu Odpaření dosucha Derivatizace MTBSTFA Extrakce do heptanu GC/MS Analytický postup (modifikovaný) Enzymatická hydrolýza globinu Prekoncentrace SPE Odpaření dosucha Derivatizace PFBB + MTBSTFA Extrakce do heptanu GC/MS 13

14 Cíl: Extrakce na pevné fázi (solid phase extraction, SPE) zakoncentrovat SO-Cys z globinového hydrolyzátu, odstranit nadbytek volných aminokyselin a solí Nalezené řešení: SPE kolonky Strata X, 500 mg (Phenomenex) Výsledek: SO-Cys oddělen od všech složek kromě Trp (hmotnostní bilance SPE kroku: 46 mg 1 mg) 14

15 Derivatizace SO-Cys pro GC-MS HO CH 2 CH S CH 2 CH CO NH 2 SO-Cys(1) HO CH CH 2 S CH 2 CH CO SO-Cys(2) NH 2 15

16 Derivatizace SO-Cys pro GC-MS A) TBDMS- HO CH 2 CH S CH 2 CH CO-TBDMS NH 2 -TBDMS stanovení GC-MS/EI B) PFB TBDMS- HO F F CH 2 + F F F CH 2 CH S CH 2 TBDMS CH CO-PFB NH 2 -TBDMS stanovení GC-MS/NCI CH 3 CH 3 H 3 C C Si + CH 3 CH 3 16

17 Derivatizace: výsledky A) MTBSTFA: - očekávané produkty: SO-Cys(TBDMS) 3, Trp(TBDMS) 3 B) PFBB + MTBSTFA: - neočekávané produkty, špatná reprodukovatelnost - GC-MS/NCI pouze srovnatelně citlivá s GC-MS/EI nadále používán jen MTBSTFA 17

18 SO-Cys: lidský globin, inkubace in vitro s 0,1mM SO b) control a) 0,1 mm SO

19 SO-Cys: myší globin, exp. styrenu 600 mg/m 3 6 h/d, 10 d 4000 b) control a) exposed

20 SO-Cys: lidský globin, profesionální expozice styrenu a) control b) control c) exposed d) exposed

21 SO-Cys(2) v lidském globinu Skupina n n (> LOD) Range SO-Cys(2) (nmol/g glob) Mean ± S.D. a kontroly 9 2 < LOD ± 0.1 exponovaní, závod A 10 2 < LOD ± 0.2 exponovaní, závod B ± 2.1 mez detekce LOD = 0,4 nmol/g globinu a u vzorků s hladinou SO-Cys(2) < LOD přiřazena hodnota 1/2 LOD 21

22 SHRNUTÍ u osob exponovaných styrenu prokázán SO-Cys proč jen SO-Cys(2)? validace SO-Cys(2) jako biomarkeru expozice korelace hladiny SO-Cys(2) a expozice styrenu 22

Nový postup stanovení N-(2-hydroxyethyl)valinu v globinu pracovníků exponovaných ethylenoxidu

Nový postup stanovení N-(2-hydroxyethyl)valinu v globinu pracovníků exponovaných ethylenoxidu Nový postup stanovení N-(2-hydroxyethyl)valinu v globinu pracovníků exponovaných ethylenoxidu J. Mráz, I. Hanzlíková, Š. Dušková, L. Dabrowská, H. Chrástecká, M. Tvrdíková, R. Vajtrová Státní zdravotní

Více

Degradační produkty proteinových aduktů v moči jako perspektivní biomarkery kumulativní expozice reaktivním chemickým látkám

Degradační produkty proteinových aduktů v moči jako perspektivní biomarkery kumulativní expozice reaktivním chemickým látkám Degradační produkty proteinových aduktů v moči jako perspektivní biomarkery kumulativní expozice reaktivním chemickým látkám J. Mráz, I. Linhart *, I. Hanzlíková, Š. Dušková, L. Dabrowská, H. Chrástecká,

Více

Degradační produkty proteinových aduktů v moči jako nový typ biomarkerů v toxikologii

Degradační produkty proteinových aduktů v moči jako nový typ biomarkerů v toxikologii 28.Teisingerův den průmyslové toxikologie, 11. 6.2013 Degradační produkty proteinových aduktů v moči jako nový typ biomarkerů v toxikologii J. Mráz, I. Linhart *, I. Hanzlíková, Š. Dušková, L. Dabrowská,

Více

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti URČOVÁNÍ PRIMÁRNÍ STRUKTURY BÍLKOVIN

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti URČOVÁNÍ PRIMÁRNÍ STRUKTURY BÍLKOVIN Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti URČOVÁNÍ PRIMÁRNÍ STRUKTURY BÍLKOVIN Primární struktura primární struktura bílkoviny je dána pořadím AK jejích polypeptidových řetězců

Více

Aminokyseliny. Gymnázium a Jazyková škola s právem státní jazykové zkoušky Zlín. Tematická oblast Datum vytvoření Ročník Stručný obsah Způsob využití

Aminokyseliny. Gymnázium a Jazyková škola s právem státní jazykové zkoušky Zlín. Tematická oblast Datum vytvoření Ročník Stručný obsah Způsob využití Aminokyseliny Tematická oblast Datum vytvoření Ročník Stručný obsah Způsob využití Autor Kód Chemie přírodních látek proteiny 18.7.2012 3. ročník čtyřletého G Určování postranních řetězců aminokyselin

Více

Metabolismus aminokyselin. Vladimíra Kvasnicová

Metabolismus aminokyselin. Vladimíra Kvasnicová Metabolismus aminokyselin Vladimíra Kvasnicová Aminokyseliny aminokyseliny přijímáme v potravě ve formě proteinů: důležitá forma organicky vázaného dusíku, který tak může být v těle využit k syntéze dalších

Více

Metabolismus bílkovin. Václav Pelouch

Metabolismus bílkovin. Václav Pelouch ZÁKLADY OBECNÉ A KLINICKÉ BIOCHEMIE 2004 Metabolismus bílkovin Václav Pelouch kapitola ve skriptech - 3.2 Výživa Vyvážená strava člověka musí obsahovat: cukry (50 55 %) tuky (30 %) bílkoviny (15 20 %)

Více

STANOVENÍ AMINOKYSELINOVÉHO SLOŽENÍ BÍLKOVIN. Postup stanovení aminokyselinového složení

STANOVENÍ AMINOKYSELINOVÉHO SLOŽENÍ BÍLKOVIN. Postup stanovení aminokyselinového složení STANVENÍ AMINKYSELINVÉH SLŽENÍ BÍLKVIN Důvody pro stanovení AK složení určení nutriční hodnoty potraviny, suroviny (esenciální vs. neesenciální AK) charakterizace určité bílkovinné frakce nebo konkrétní

Více

hygieně K. Černá, Š. Dušková, J. Mráz, L. Řimnáčová*, P. Šimek* Státní zdravotní ústav Praha *Biologické centrum AV ČR České Budějovice

hygieně K. Černá, Š. Dušková, J. Mráz, L. Řimnáčová*, P. Šimek* Státní zdravotní ústav Praha *Biologické centrum AV ČR České Budějovice Chemické derivatizace s alkylchlorformiáty a jejich využití v hygieně K. Černá, Š. Dušková, J. Mráz, L. Řimnáčová*, P. Šimek* Státní zdravotní ústav Praha *Biologické centrum AV ČR České Budějovice Možnosti

Více

Struktura proteinů. - testík na procvičení. Vladimíra Kvasnicová

Struktura proteinů. - testík na procvičení. Vladimíra Kvasnicová Struktura proteinů - testík na procvičení Vladimíra Kvasnicová Mezi proteinogenní aminokyseliny patří a) kyselina asparagová b) kyselina glutarová c) kyselina acetoctová d) kyselina glutamová Mezi proteinogenní

Více

Biologické expoziční testy

Biologické expoziční testy Biologické expoziční testy ddělení pro hodnocení expozice chemickým látkám na pracovištích SZÚ, Praha Dušková Š. Kreatinin Kreatinin - vztažná veličina pro hodnocení expozice cizorodým látkám v moči, všechny

Více

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Inovace studia molekulární a buněčné biologie Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. MBIO1/Molekulární biologie 1 Tento projekt je spolufinancován

Více

Stanovení alkoxyoctových kyselin v moči metodou GC-MS s využitím technik head- space a SPME

Stanovení alkoxyoctových kyselin v moči metodou GC-MS s využitím technik head- space a SPME Stanovení alkoxyoctových kyselin v moči metodou GC-MS s využitím technik head- space a SPME V.Stránský, I.Šperlingová, L. Dabrowská, Š.Dušková, M.Tvrdíková sperling@szu.cz Oddělení pro hodnocení expozice

Více

Aminokyseliny a dlouhodobá parenterální výživa. Luboš Sobotka

Aminokyseliny a dlouhodobá parenterální výživa. Luboš Sobotka Aminokyseliny a dlouhodobá parenterální výživa Luboš Sobotka Reakce na hladovění a stres jsou stejné asi 4000000 let Přežít hladovění a akutní stav Metody sledování kvality AK roztoků Vylučovací metoda

Více

Určení molekulové hmotnosti: ESI a nanoesi

Určení molekulové hmotnosti: ESI a nanoesi Cvičení Určení molekulové hmotnosti: ESI a nanoesi ) 1)( ( ) ( H m z H m z M k j j j m z z zh M Molekula o hmotnosti M se nabije z-krát protonem, pík iontu ve spektru je na m z : ) ( H m z M z Pro dva

Více

Aminokyseliny příručka pro učitele. Obecné informace: Téma otevírá kapitolu Bílkoviny, která svým rozsahem překračuje rámec jedné vyučovací hodiny.

Aminokyseliny příručka pro učitele. Obecné informace: Téma otevírá kapitolu Bílkoviny, která svým rozsahem překračuje rámec jedné vyučovací hodiny. Obecné informace: Aminokyseliny příručka pro učitele Téma otevírá kapitolu Bílkoviny, která svým rozsahem překračuje rámec jedné vyučovací hodiny. Navazující učivo Před probráním tématu Aminokyseliny probereme

Více

Metabolismus aminokyselin 2. Vladimíra Kvasnicová

Metabolismus aminokyselin 2. Vladimíra Kvasnicová Metabolismus aminokyselin 2 Vladimíra Kvasnicová Odbourávání AMK 1) odstranění aminodusíku z molekuly AMK 2) detoxikace uvolněné aminoskupiny 3) metabolismus uhlíkaté kostry AMK 7 produktů 7 degradačních

Více

Identifikace aminokyselin a jiných organických strukturních jednotek v přírodních a syntetických peptidech technikou GC-MS.

Identifikace aminokyselin a jiných organických strukturních jednotek v přírodních a syntetických peptidech technikou GC-MS. Setkání Thermo Fisher Scientific, Tichonice 2010 Identifikace aminokyselin a jiných organických strukturních jednotek v přírodních a syntetických peptidech technikou GC-MS. Identification of amino acids

Více

Méně obvyklé biologické expoziční testy

Méně obvyklé biologické expoziční testy Méně obvyklé biologické expoziční testy Š. Dušková 42. konzultační den SZÚ Praha Biologické monitorování Stanovení sledované chemické škodliviny nebo jejích metabolitů v organismu Jeden ze způsobů posuzování

Více

Inovace bakalářského studijního oboru Aplikovaná chemie http://aplchem.upol.cz

Inovace bakalářského studijního oboru Aplikovaná chemie http://aplchem.upol.cz Inovace bakalářského studijního oboru Aplikovaná chemie http://aplchem.upol.cz Z.1.07/2.2.00/15.0247 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. Funkční

Více

Bílkoviny - proteiny

Bílkoviny - proteiny Bílkoviny - proteiny Proteiny jsou složeny z 20 kódovaných aminokyselin L-enantiomery Chemická struktura aminokyselin R představuje jeden z 20 různých typů postranních řetězců R Hlavní řetězec je neměnný

Více

Biologické monitorování expozice 2-ethoxyethanolu

Biologické monitorování expozice 2-ethoxyethanolu Biologické monitorování expozice 2-ethoxyethanolu I.Šperlingová, L. Dabrowská, V.Stránský, Š.Dušková, M.Tvrdíková sperling@szu.cz Oddělení pro hodnocení expozice chemickým látkám na pracovišti Státní zdravotní

Více

PROTEINY. Biochemický ústav LF MU (H.P.)

PROTEINY. Biochemický ústav LF MU (H.P.) PROTEINY Biochemický ústav LF MU 2013 - (H.P.) 1 proteiny peptidy aminokyseliny 2 Aminokyseliny 3 Charakteristika základní stavební jednotky proteinů geneticky kódované 20 základních aminokyselin 4 a-aminokyselina

Více

Možnosti monitorování expozice diisokyanátům. Š. Dušková SZÚ Praha

Možnosti monitorování expozice diisokyanátům. Š. Dušková SZÚ Praha Možnosti monitorování expozice diisokyanátům Š. Dušková SZÚ Praha Praha, 20.9.2018 Diisokyanáty chemické sloučeniny mající 2 funkční vysoce reaktivní N=C=O skupiny na alifatickém nebo aromatickém skeletu

Více

Aminokyseliny, proteiny, enzymy Základy lékařské chemie a biochemie 2014/2015 Ing. Jarmila Krotká Metabolismus základní projev života látková přeměna souhrn veškerých dějů, které probíhají uvnitř organismu

Více

Možnosti biologického monitorování expozice pesticidům

Možnosti biologického monitorování expozice pesticidům Možnosti biologického monitorování expozice pesticidům Jaroslav Mráz Státní zdravotní ústav Praha Centrum hygieny práce a pracovního lékařství NRL pro biologické monitorování expozice chemickým látkám

Více

Činnosti a nabídka služeb oddělení pro hodnocení expozice chemickým látkám na pracovištích SZÚ Praha

Činnosti a nabídka služeb oddělení pro hodnocení expozice chemickým látkám na pracovištích SZÚ Praha Činnosti a nabídka služeb oddělení pro hodnocení expozice chemickým látkám na pracovištích SZÚ Praha Š. Dušková 47. Konzultační den 20. září 2012 SZÚ Centrum hygieny práce a pracovního lékařství Oddělení

Více

Struktura a ceník služeb Ústavu chemie a biochemie

Struktura a ceník služeb Ústavu chemie a biochemie ROZHODNUTÍ DĚKANA 1 / 2019 Struktura a ceník služeb Ústavu chemie a biochemie Ostatním součástem AF Určeno: č. j.: 19470/2019-291 ze dne: 28. 8. 2019 a MENDELU Zpracovatel: doc. RNDr. Ondřej Zítka, Ph.D.

Více

Metabolismus aminokyselin - testík na procvičení - Vladimíra Kvasnicová

Metabolismus aminokyselin - testík na procvičení - Vladimíra Kvasnicová Metabolismus aminokyselin - testík na procvičení - Vladimíra Kvasnicová Vyberte esenciální aminokyseliny a) Asp, Glu b) Val, Leu, Ile c) Ala, Ser, Gly d) Phe, Trp Vyberte esenciální aminokyseliny a) Asp,

Více

Proteiny Genová exprese. 2013 Doc. MVDr. Eva Bártová, Ph.D.

Proteiny Genová exprese. 2013 Doc. MVDr. Eva Bártová, Ph.D. Proteiny Genová exprese 2013 Doc. MVDr. Eva Bártová, Ph.D. Bílkoviny (proteiny), 15% 1g = 17 kj Monomer = aminokyseliny aminová skupina karboxylová skupina α -uhlík postranní řetězec Znát obecný vzorec

Více

Názvosloví cukrů, tuků, bílkovin

Názvosloví cukrů, tuků, bílkovin Názvosloví cukrů, tuků, bílkovin SACARIDY CUKRY MNSACARIDY LIGSACARIDY PLYSACARIDY (z mnoha molekul monosacharidů) ALDSY KETSY -DISACARIDY - TRISACARIDY - TETRASACARIDY atd. -aldotriosy -aldotetrosy -aldopentosy

Více

AMINOKYSELINY Substituční deriváty karboxylových kyselin ( -COOH, -NH 2 nebo -NH-) Prolin α-iminokyselina

AMINOKYSELINY Substituční deriváty karboxylových kyselin ( -COOH, -NH 2 nebo -NH-) Prolin α-iminokyselina Aminokyseliny - Základní stavební jednotky peptidů a proteinů - Proteinogenní (kódované) 20 AK - Odvozené chemické modifikace, metabolity - Esenciální AK AMINOKYSELINY Substituční deriváty karboxylových

Více

Obecná struktura a-aminokyselin

Obecná struktura a-aminokyselin AMINOKYSELINY Obsah Obecná struktura Názvosloví, třídění a charakterizace Nestandardní aminokyseliny Reaktivita - peptidová vazba Biogenní aminy Funkce aminokyselin Acidobazické vlastnosti Optická aktivita

Více

Pražské analytické centrum inovací Projekt CZ / /0002 spolufinancovaný ESF a Státním rozpočtem ČR

Pražské analytické centrum inovací Projekt CZ / /0002 spolufinancovaný ESF a Státním rozpočtem ČR Pražské analytické centrum inovací Projekt CZ.04.3.07/4.2.01.1/0002 spolufinancovaný ESF a Státním rozpočtem ČR Obsah 1. Úvod 1.1. Miniaturizace v analytické chemii 1.2. Přednosti a nevýhody kapilárních

Více

Biochemie dusíkatých látek při výrobě vína

Biochemie dusíkatých látek při výrobě vína Biochemie dusíkatých látek při výrobě vína Ing. Michal Kumšta www.zf.mendelu.cz Ústav vinohradnictví a vinařství kumsta@mendelu.cz Vzdělávací aktivita je součástí projektu CZ.1.07/2.4.00/31.0089 Projekt

Více

Metabolizmus aminokyselin II

Metabolizmus aminokyselin II Metabolizmus aminokyselin II Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol MUDr. Bc. Matej Kohutiar, Ph.D. matej.kohutiar@lfmotol.cuni.cz Praha 2018 Degradace uhlíkové kostry aminokyselin

Více

Molekulární genetika IV zimní semestr 6. výukový týden ( )

Molekulární genetika IV zimní semestr 6. výukový týden ( ) Ústav biologie a lékařské genetiky 1.LF UK a VFN, Praha Molekulární genetika IV zimní semestr 6. výukový týden (5.11. 9.11.2007) Nondisjunkce u Downova syndromu 2 Tři rodokmeny rodin s dětmi postiženými

Více

HPLC/MS tělních tekutin nový rozměr v medicinální diagnostice

HPLC/MS tělních tekutin nový rozměr v medicinální diagnostice HPLC/MS tělních tekutin nový rozměr v medicinální diagnostice Lukáš Chytil Ústav organické technologie VŠCHT Praha Medicinální diagnostika a hmotnostní spektrometrie Medicinální diagnostika: - Klasické

Více

BIOSTIMULÁTOR AGRO-SORB ZDRAVÍ PRO POLE. VP AGRO, spol. s.r.o. Stehlíkova , Praha 6 - Suchdol

BIOSTIMULÁTOR AGRO-SORB ZDRAVÍ PRO POLE. VP AGRO, spol. s.r.o. Stehlíkova , Praha 6 - Suchdol BIOSTIMULÁTOR AGRO-SORB ZDRAVÍ PRO POLE VP AGRO, spol. s.r.o. Stehlíkova 977 165 00, Praha 6 - Suchdol 18 volných aminokyselin (L- alfa) 18 volných aminokyselin (L- alfa) 18 volných aminokyselin (L- alfa)

Více

Nabídka biologických expozičních testů Oddělení pro hodnocení expozice chemickým látkám na pracovištích

Nabídka biologických expozičních testů Oddělení pro hodnocení expozice chemickým látkám na pracovištích Nabídka biologických expozičních testů ddělení pro hodnocení expozice chemickým látkám na pracovištích Dušková Š. Státní zdravotní ústav, Praha Biologické expoziční testy Jeden ze způsobů posuzování expozice

Více

ÚVOD DO BIOCHEMIE. Dělení : 1)Popisná = složení org., struktura a vlastnosti látek 2)Dynamická = energetické změny

ÚVOD DO BIOCHEMIE. Dělení : 1)Popisná = složení org., struktura a vlastnosti látek 2)Dynamická = energetické změny BIOCHEMIE 1 ÚVOD DO BIOCHEMIE BCH zabývá se chemickými procesy v organismu a chemickým složením živých organismů Biologie: bios = život + logos = nauka Biochemie: bios = život + chemie Dělení : Chemie

Více

NMR biomakromolekul RCSB PDB. Progr. NMR

NMR biomakromolekul RCSB PDB. Progr. NMR NMR biomakromolekul Typy biomakromolekul a možnosti studia pomocí NMR proteiny a peptidy rozmanité složení, omezení jen velikostí molekul nukleové kyseliny (RNA, DNA) a oligonukleotidy omezení malou rozmanitostí

Více

Biologické expoziční testy (BET) v České republice a ve Státním zdravotním ústavu v Praze

Biologické expoziční testy (BET) v České republice a ve Státním zdravotním ústavu v Praze Biologické expoziční testy (BET) v České republice a ve Státním zdravotním ústavu v Praze Současný stav, možnosti, výhled do budoucna Jaroslav Mráz, Šárka Dušková Oddělení pro hodnocení expozice chemickým

Více

Základy analýzy potravin Přednáška 8. Důvody pro analýzu bílkovin v potravinách. určování původu suroviny, autenticita výrobku

Základy analýzy potravin Přednáška 8. Důvody pro analýzu bílkovin v potravinách. určování původu suroviny, autenticita výrobku BÍLKOVINY Důvody pro analýzu bílkovin v potravinách posuzování nutriční hodnoty celkový obsah bílkovin aminokyselinové složení bílkoviny, volné aminokyseliny obsah cizorodých nebo neplnohodnotných bílkovin

Více

Struktura nukleových kyselin Vlastnosti genetického materiálu

Struktura nukleových kyselin Vlastnosti genetického materiálu Struktura nukleových kyselin Vlastnosti genetického materiálu V předcházejících kapitolách bylo konstatováno, že geny jsou uloženy na chromozomech a kontrolují fenotypové vlastnosti a že chromozomy se

Více

Bílkoviny. Charakteristika a význam Aminokyseliny Peptidy Struktura bílkovin Významné bílkoviny

Bílkoviny. Charakteristika a význam Aminokyseliny Peptidy Struktura bílkovin Významné bílkoviny Bílkoviny harakteristika a význam Aminokyseliny Peptidy Struktura bílkovin Významné bílkoviny 1) harakteristika a význam Makromolekulární látky složené z velkého počtu aminokyselinových zbytků V tkáních

Více

AMINOKYSELINY Substituční deriváty karboxylových kyselin ( -COOH, -NH 2 nebo -NH-) Prolin α-iminokyselina

AMINOKYSELINY Substituční deriváty karboxylových kyselin ( -COOH, -NH 2 nebo -NH-) Prolin α-iminokyselina Aminokyseliny - Základní stavební jednotky peptidů a proteinů - Proteinogenní (kódované) 20 AK - Odvozené chemické modifikace, metabolity - Esenciální AK AMINOKYSELINY Substituční deriváty karboxylových

Více

Gymnázium Vysoké Mýto nám. Vaňorného 163, 566 01 Vysoké Mýto

Gymnázium Vysoké Mýto nám. Vaňorného 163, 566 01 Vysoké Mýto Gymnázium Vysoké Mýto nám. Vaňorného 163, 566 01 Vysoké Mýto SUBSTITUČNÍ DERIVÁTY KARBOXYLOVÝCH O KYSELIN R C O X karboxylových kyselin - substituce na vedlejším uhlovodíkovém řetězci aminokyseliny - hydroxykyseliny

Více

Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK. Anotace. Název školy: Gymnázium, Zábřeh, náměstí Osvobození 20. Číslo projektu:

Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK. Anotace. Název školy: Gymnázium, Zábřeh, náměstí Osvobození 20. Číslo projektu: Vzdělávací materiál vytvořený v projektu P VK Název školy: Gymnázium, Zábřeh, náměstí svobození 20 Číslo projektu: Název projektu: Číslo a název klíčové aktivity: CZ.1.07/1.5.00/34.0211 Zlepšení podmínek

Více

MOLEKULOVÉ MODELOVÁNÍ - STRUKTURA. Monika Pěntáková Katedra Farmaceutické chemie

MOLEKULOVÉ MODELOVÁNÍ - STRUKTURA. Monika Pěntáková Katedra Farmaceutické chemie MOLEKULOVÉ MODELOVÁNÍ - STRUKTURA Monika Pěntáková Katedra Farmaceutické chemie Chemická struktura a geometrie KONFORMACE = můžeme změnit pouhým otočením kolem kovalentní vazby KONFIGURACE = při změně

Více

Hygienická problematika expozice glykoletherům a jejich acetátům

Hygienická problematika expozice glykoletherům a jejich acetátům Hygienická problematika expozice glykoletherům a jejich acetátům I.Šperlingová, L. Dabrowská, V.Stránský, M.Tvrdíková sperling@szu.cz Oddělení pro hodnocení expozice chemickým látkám na pracovišti Státní

Více

Metabolizmus aminokyselin II

Metabolizmus aminokyselin II Metabolizmus aminokyselin II Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol dr. Matej Kohutiar, doc. Jana Novotná matej.kohutiar@lfmotol.cuni.cz Praha 2017 Degradace uhlíkové kostry aminokyselin

Více

Stanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů

Stanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů Stanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů Bioanalytické metody Prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Úvod Kritéria výběru metod stanovení koncentrace proteinů jsou založena na možnostech pro vlastní analýzu,

Více

Aminokyseliny, struktura a vlastnosti bílkovin. doc. Jana Novotná 2 LF UK Ústav lékařské chemie a klinické biochemie

Aminokyseliny, struktura a vlastnosti bílkovin. doc. Jana Novotná 2 LF UK Ústav lékařské chemie a klinické biochemie Aminokyseliny, struktura a vlastnosti bílkovin doc. Jana Novotná 2 LF UK Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 1. 20 aminokyselin, kódovány standardním genetickým kódem, proteinogenní, stavebními

Více

No. 1- určete MW, vysvětlení izotopů

No. 1- určete MW, vysvětlení izotopů No. 1- určete MW, vysvětlení izotopů ESI/APCI + 325 () 102 (35) 327 (33) 326 (15) 328 (5) 150 200 250 300 350 400 450 500 ESI/APCI - 323 () 97 (51) 325 (32) 324 (13) 326 (6) 150 200 250 300 350 400 450

Více

Biochemie I. Aminokyseliny a peptidy

Biochemie I. Aminokyseliny a peptidy Biochemie I Aminokyseliny a peptidy Aminokyseliny a peptidy (vlastnosti, stanovení a reakce) AMINOKYSELINY Když se řekne AK ( -COOH, -NH 2 nebo -NH-) prostorový vztah aminoskupiny a karboxylové skupiny:

Více

Jana Fauknerová Matějčková

Jana Fauknerová Matějčková Jana Fauknerová Matějčková převody jednotek výpočet ph ph vodných roztoků ph silných kyselin a zásad ph slabých kyselin a zásad, disociační konstanta, pk ph pufrů koncentace 1000mg př. g/dl mg/l = = *10000

Více

AMK u prasat. Pig Nutr., 20/3

AMK u prasat. Pig Nutr., 20/3 AMK u prasat. Pig Nutr., 20/3 Potřeba AMK ve výživě prasat Prasata mají obecně odlišné nároky na živiny než ostatní hospodářská zvířata, především pak na zastoupení aminokyselin. Ve výživě prasat se krmná

Více

3 Acidobazické reakce

3 Acidobazické reakce 3 Acidobazické reakce Brønstedova teorie 1. Uveďte explicitní definice podle Brønstedovy teorie. Kyselina je... Báze je... Konjugovaný pár je... 2. Doplňte tabulku a pojmenujte všechny sloučeniny. Kyselina

Více

Různé přístupy ke stanovení středně těkavých organických látek ve vodách pomocí GC/MS

Různé přístupy ke stanovení středně těkavých organických látek ve vodách pomocí GC/MS Různé přístupy ke stanovení středně těkavých organických látek ve vodách pomocí GC/MS Martin Ferenčík a kolektiv, Povodí Labe, s.p., OVHL, Víta Nejedlého 951, 500 03 Hradec Králové, ferencikm@pla.cz, tel.:

Více

DUM č. 15 v sadě. 22. Ch-1 Biochemie

DUM č. 15 v sadě. 22. Ch-1 Biochemie projekt GML Brno Docens DUM č. 15 v sadě 22. Ch-1 Biochemie Autor: Martin Krejčí Datum: 30.04.2014 Ročník: 6AF, 6BF Anotace DUMu: Rozdělení aminokyselin, chemické vzorce aminokyselin, amnokyseliny, významné

Více

4. Termická analýza. Příprava předmětu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253

4. Termická analýza. Příprava předmětu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253 4. Termická analýza Příprava předmětu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253 1 Emisní termoanalýza EGA kvalitativní informace těkavé látky simultánní reakce stabilita rozkladné děje stanovení

Více

Molekulární biofyzika

Molekulární biofyzika Molekulární biofyzika Molekuly v živých systémech - polymery Lipidy (mastné kyseliny, fosfolipidy, isoprenoidy, sfingolipidy ) proteiny (aminokyseliny) nukleové kyseliny (nukleotidy) polysacharidy (monosacharidy)

Více

Petr Breinek. BC_HbA1c_N2011 1

Petr Breinek. BC_HbA1c_N2011 1 Glykovaný hemoglobin ba1c Petr Breinek B_bA1c_N2011 1 Glykovaný hemoglobin (ba1c) Ukazatel dlouhodobé kompenzace diabetu Diagnostika onemocnění Kontrola terapie Včasné odhalení hrozících komplikací V roce

Více

Základy pedologie a ochrana půdy

Základy pedologie a ochrana půdy Základy pedologie a ochrana půdy 6. přednáška VZDUCH V PŮDĚ = plynná fáze půdy Význam (a faktory jeho složení): dýchání organismů výměna plynů mezi půdou a atmosférou průběh reakcí v půdě Formy: volně

Více

3 Acidobazické reakce

3 Acidobazické reakce 3 Acidobazické reakce Brønstedova teorie 1. Uveďte explicitní definice podle Brønstedovy teorie. Kyselina je... Báze je... Konjugovaný pár je... 2. Doplňte tabulku a pojmenujte všechny sloučeniny. Kyselina

Více

Zajištění správnosti výsledků analýzy kotininu a kreatininu

Zajištění správnosti výsledků analýzy kotininu a kreatininu Zajištění správnosti výsledků analýzy kotininu a kreatininu Š.Dušková, I.Šperlingová, L. Dabrowská, M. Tvrdíková, M. Šubrtová duskova@szu.cz sperling@szu.cz Oddělení pro hodnocení expozice chemickým látkám

Více

Diagnostika bronchiálního. ho astmatu HPLC/MS analýzou. Kamila Syslová Ústav organické technologie

Diagnostika bronchiálního. ho astmatu HPLC/MS analýzou. Kamila Syslová Ústav organické technologie Diagnostika bronchiálního ho astmatu HPLC/MS analýzou Kamila Syslová Ústav organické technologie Bronchiální astma Civilizační onemocnění rostoucí počet případů snižující se věková hranice prvních projevů

Více

Tomáš Oberhuber. Faculty of Nuclear Sciences and Physical Engineering Czech Technical University in Prague

Tomáš Oberhuber. Faculty of Nuclear Sciences and Physical Engineering Czech Technical University in Prague Tomáš Faculty of Nuclear Sciences and Physical Engineering Czech Technical University in Prague Buňka buňka je základní stavební prvek všech živých organismů byla objevena Robertem Hookem roku 1665 jednodušší

Více

jako markeru oxidativního

jako markeru oxidativního Monitoring koncentrace 8-isoprostanu jako markeru oxidativního stresu v kondenzátu vydechovaného vzduchu Lukáš Chytil Ústav organické technologie Úvod Cíl: - nalezení vhodného analytické metody pro analýzu

Více

ZKULAB s.r.o. Laboratoř Postoloprty Masarykova 300, Postoloprty SOP I/A. 152/2009, příloha III, postup A) SOP I/B. (Nařízení Komise (ES) č.

ZKULAB s.r.o. Laboratoř Postoloprty Masarykova 300, Postoloprty SOP I/A. 152/2009, příloha III, postup A) SOP I/B. (Nařízení Komise (ES) č. Laboratoř je způsobilá aktualizovat normy identifikující zkušební postupy. Laboratoř poskytuje odborná stanoviska a interpretace výsledků zkoušek. Laboratoř je způsobilá provádět samostatné vzorkování.

Více

Aktuální změny v tabulce BET (novela vyhlášky č. 432/2003 Sb.)

Aktuální změny v tabulce BET (novela vyhlášky č. 432/2003 Sb.) Aktuální změny v tabulce BET (novela vyhlášky č. 432/2003 Sb.) Jaroslav Mráz Státní zdravotní ústav Praha Centrum hygieny práce a pracovního lékařství NRL pro biologické monitorování expozice chemickým

Více

Analytická toxikologie

Analytická toxikologie analytická toxikologie xenobiotik/metabolitů odhad možné expozice potenciálním xenobiotikem, vyskytujícím se v prostředí (vzduch, voda, potrava) koncentrací xenobiotik / metabolitů identifikace metabolitů

Více

BÍLKOVINY = PROTEINY Polymery aminokyselin propojených peptidovou vazbou

BÍLKOVINY = PROTEINY Polymery aminokyselin propojených peptidovou vazbou BÍLKOVINY = PROTEINY Polymery aminokyselin propojených peptidovou vazbou 20 AK 20 18 variant pro peptid složený z 20 AK!!! Průměrná bílkovina 300 AK Relativní molekulová hmotnost (bezrozměrné číslo) Molární

Více

Genetický kód. Jakmile vznikne funkční mrna, informace v ní obsažená může být ihned použita pro syntézu proteinu.

Genetický kód. Jakmile vznikne funkční mrna, informace v ní obsažená může být ihned použita pro syntézu proteinu. Genetický kód Jakmile vznikne funkční, informace v ní obsažená může být ihned použita pro syntézu proteinu. Pravidla, kterými se řídí prostřednictvím přenos z nukleotidové sekvence DNA do aminokyselinové

Více

Genomické databáze. Shlukování proteinových sekvencí. Ivana Rudolfová. školitel: doc. Ing. Jaroslav Zendulka, CSc.

Genomické databáze. Shlukování proteinových sekvencí. Ivana Rudolfová. školitel: doc. Ing. Jaroslav Zendulka, CSc. Genomické databáze Shlukování proteinových sekvencí Ivana Rudolfová školitel: doc. Ing. Jaroslav Zendulka, CSc. Obsah Proteiny Zdroje dat Predikce struktury proteinů Cíle disertační práce Vstupní data

Více

ORGANICKÁ SYNTÉZA NA PEVNÉ FÁZI OCH/OSPF ZS

ORGANICKÁ SYNTÉZA NA PEVNÉ FÁZI OCH/OSPF ZS RGAICKÁ SYTÉZA A PEVÉ FÁZI C/SPF ZS 2012-13 1828 : První laboratorní syntéza Příprava močoviny z kyanatanu amoného Friedrich Wöhler (1800-1882) 4 C T 2 2 Musím Vám říci, že mohu připravit močovinu, přičemž

Více

Biochemie I. Aminokyseliny a peptidy

Biochemie I. Aminokyseliny a peptidy Biochemie I Aminokyseliny a peptidy AMINOKYSELINY Když se řekne AK ( -COOH, -NH 2 nebo -NH-) prostorový vztah aminoskupiny a karboxylové skupiny: - (=2-), -(=3-)... -(= poslední) -alanin součástí koenzymu

Více

Hmotnostní spektrometrie

Hmotnostní spektrometrie Hmotnostní spektrometrie Miroslav Polášek Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského Akademie věd v České republiky Dolejškova 3, 182 23 Praha 8 Co je hmotnostní spektrometrie? Fyzikálně chemická metoda pro:

Více

P. Martinková, R. Jobánek, D. Pospíchalová. Stanovení vybraných léčiv v čistírenském kalu

P. Martinková, R. Jobánek, D. Pospíchalová. Stanovení vybraných léčiv v čistírenském kalu P. Martinková, R. Jobánek, D. Pospíchalová Stanovení vybraných léčiv v čistírenském kalu PPCP Pharmaceutical and Personal Care Products (farmaka a produkty osobní potřeby) Do životního prostředí se dostávají

Více

Kras XL StripAssay. Kat. číslo 5-680. 20 testů 2-8 C

Kras XL StripAssay. Kat. číslo 5-680. 20 testů 2-8 C Kras XL StripAssay Kat. číslo 5-680 20 testů 2-8 C Popis stripu: Pracovní postup 1. Izolace DNA Musí být použity vhodné metody extrakce DNA, v závislosti na typu vzorku, který má být vyšetřován. Doporučení

Více

Virtuální svět genetiky 1. Translace

Virtuální svět genetiky 1. Translace (překlad) je druhým krokem exprese genetické informace a ukončuje dráhu DNA > RNA > protein. probíhá mimo jádro, v cytoplazmě na ribozómech. Výchozími látkami pro translaci je 21 standardních aminokyselin,

Více

Luminiscenční analýza Použití luminiscenční spektroskopie v analytické chemii

Luminiscenční analýza Použití luminiscenční spektroskopie v analytické chemii Luminiscenční analýza Použití luminiscenční spektroskopie v analytické chemii Kvantitativní analýza: F = k φ Φ o Vysoká citlivost metody: 2.3 c l ε použití laserů odezva na relativně malé změny v okolí

Více

ZKULAB s.r.o. Masarykova 300, POSTOLOPRTY

ZKULAB s.r.o. Masarykova 300, POSTOLOPRTY Laboratoř je způsobilá aktualizovat normy identifikující zkušební postupy. Laboratoř poskytuje odborná stanoviska a interpretace výsledků zkoušek. Laboratoř je způsobilá provádět samostatné vzorkování.

Více

Struktura aminokyselin, peptidů a bílkovin.

Struktura aminokyselin, peptidů a bílkovin. Struktura aminokyselin, peptidů a bílkovin. Ústav lékařské chemie a klinické biochemie 2.LF UK a FN Motol MUDr. Bc. Matej Kohutiar, Ph.D. matej.kohutiar@lfmotol.cuni.cz Praha 2018 I. Struktura aminokyselin

Více

Chromatografie. Petr Breinek. Chromatografie_2011 1

Chromatografie. Petr Breinek. Chromatografie_2011 1 Chromatografie Petr Breinek Chromatografie_2011 1 Společným znakem všech chromatografických metod je kontinuální rozdělování složek analyzované směsi vzorku mezi dvěma fázemi. Nepohyblivá fáze (stacionární

Více

Aminokyseliny R CH COO. R = postranní etzec

Aminokyseliny R CH COO. R = postranní etzec Aminokyseliny Z biologických systém bylo izolováno nkolik stovek aminokyselin. které jsou rozšíené obecn, jiné jsou jen v uritých druzích nebo dokonce jen v jednom organismu. ejdležitjších z nich je 20,

Více

Molekulární základ dědičnosti

Molekulární základ dědičnosti Molekulární základ dědičnosti Dědičná informace je zakódována v deoxyribonukleové kyselině, která je uložena v jádře buňky v chromozómech. Zlomovým objevem pro další rozvoj molekulární genetiky bylo odhalení

Více

Anorganické látky v buňkách - seminář. Petr Tůma některé slidy převzaty od V. Kvasnicové

Anorganické látky v buňkách - seminář. Petr Tůma některé slidy převzaty od V. Kvasnicové Anorganické látky v buňkách - seminář Petr Tůma některé slidy převzaty od V. Kvasnicové Zastoupení prvků v přírodě anorganická hmota kyslík (O) 50% křemík (Si) 25% hliník (Al) 7% železo (Fe) 5% vápník

Více

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Metabolismus dusíkatých látek

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Metabolismus dusíkatých látek Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti Metabolismus dusíkatých látek Oxidace aminokyselin Podíl AK na metabolické E se silně liší dle organismu a jeho momentálních potřeb, např.

Více

GENOTOXICITA A ZMĚNY V GENOVÉ EXPRESI

GENOTOXICITA A ZMĚNY V GENOVÉ EXPRESI GENOTOXICITA A ZMĚNY V GENOVÉ EXPRESI INDUKOVANÉ PŮSOBENÍM ORGANICKÝCH LÁTEK Z PRACHOVÝCH ČÁSTIC V OVZDUŠÍ Kateřina Hanzalová Oddělení genetické ekotoxikologie Ústav experimentální medicíny AV ČR v.v.i.

Více

Využití BET v rámci preventivní prohlídky

Využití BET v rámci preventivní prohlídky Využití BET v rámci preventivní prohlídky V. Stránský, J. Mráz, SZÚ, Centrum pracovního lékařství, NRL pro biologické monitorování expozice chemickým látkám v pracovním prostředí 17. konzultační den SZÚ

Více

Populační genetika. ) a. Populační genetika. Castle-Hardy-Weinbergova zákonitost. Platí v panmiktické populaci za předpokladu omezujících podmínek

Populační genetika. ) a. Populační genetika. Castle-Hardy-Weinbergova zákonitost. Platí v panmiktické populaci za předpokladu omezujících podmínek Poulační genetika Poulační genetika ORGANISMUS Součást výše organizované soustavy oulace POPULACE Soubor jedinců jednoho druhu Genotyově heterogenní V určitém čase má řirozeně vymezený rostor Velký očet

Více

Molekulární biofyzika

Molekulární biofyzika Molekulární biofyzika Molecules of life Centrální dogma membrány Metody GI a MB Biofyzika buňky Biofyzika tkání proteiny, nukleové kyseliny struktura, funkce replikace, transkripce, translace struktura,

Více

Chromatofokusace. separace proteinů na základě jejich pi vysoké rozlišení. není potřeba připravovat ph gradient zaostřovací efekt jednoduchost

Chromatofokusace. separace proteinů na základě jejich pi vysoké rozlišení. není potřeba připravovat ph gradient zaostřovací efekt jednoduchost Chromatofokusace separace proteinů na základě jejich pi vysoké rozlišení není potřeba připravovat ph gradient zaostřovací efekt jednoduchost Polypufry - amfolyty Stacionární fáze Polybuffer 96 - ph 9-6

Více

Výběr fluoroforu. http://www.chem.duke.edu/~wwarren/tissueimaging.php

Výběr fluoroforu. http://www.chem.duke.edu/~wwarren/tissueimaging.php 10. Fluorofory Výběr fluoroforu Citlivost k měřenému parametru - velikost změny fluorescenčního parametru - rozsah použitelnosti (např. při měření ph je dán pk A, při měření vazby K D,...) - selektivita

Více

Výzkumný ústav veterinárního lékařství v Brně

Výzkumný ústav veterinárního lékařství v Brně LIPIDY: FUNKCE, IZOLACE, SEPARACE, DETEKCE FOSFOLIPIDY chemické složení a funkce v buněčných membránách; metody stanovení fosfolipidů fosfolipázy - produkty reakcí (ceramid, DAG = 2nd messengers) a stanovení

Více

FYTOREMEDIACE LÉČIV A JEJICH REZIDUÍ

FYTOREMEDIACE LÉČIV A JEJICH REZIDUÍ FYTOREMEDIACE LÉČIV A JEJICH REZIDUÍ Petr Soudek Ústav experimentální botaniky Akademie věd ČR Centralizovaný rozvojový projekt MŠMT č. C29: Integrovaný systém vzdělávání v oblasti výskytu a eliminace

Více

Možnosti objektivního posouzení expozice tabákovému kouři pasivní kouření. Dušková Š., SZÚ Praha

Možnosti objektivního posouzení expozice tabákovému kouři pasivní kouření. Dušková Š., SZÚ Praha Možnosti objektivního posouzení expozice tabákovému kouři pasivní kouření Dušková Š., SZÚ Praha 1 Cigaretový kouř Směs 4000 chemických látek, látky z tabákové rostliny, látky vznikající při fermentaci,

Více