ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Rozměr: px
Začít zobrazení ze stránky:

Download "ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH"

Transkript

1 ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH PŘIHLÁŠKA STUDENTSKÉHO PROJEKTU Projekt Název projektu: Vývoj a charakterizace mikrosatelitních markerů pro druhový komplex Crenicichla mandelburgeri [Teleostei: Cichlidae] Uchazeč Hlavní řešitel Příjmení, jméno, tituly: Piálek, Lubomír, Mgr. Ing. Tel.: Studium v doktorském studijním programu zahájeno dne: Pracoviště/místo studia JU v Českých Budějovicích Fakulta (VŠ ústav): Přírodovědecká fakulta Katedra (ústav, pracoviště): Katedra zoologie Školitel: Oldřich Říčan Vedoucí projektu Příjmení, jméno, tituly: Říčan, Oldřich, Mgr. PhD. Tel.: Pracoviště JU v Českých Budějovicích Fakulta (VŠ ústav): Přírodovědecká fakulta Katedra (ústav, pracoviště): Katedra zoologie Celkové náklady na řešení projektu Náklady nebo výdaje na pořízení hmotného a nehmotného majetku: 0 Další provozní náklady nebo výdaje: Kč Doplňkové náklady nebo výdaje: 0 Celkem Kč: Kč V Českých Budějovicích dne Podpis uchazeče: Lubomír Piálek

2 Zdůvodnění návrhu projektu Stav řešení problematiky projektu (max. 2 stránky): Rod Crenicichla Heckel je druhově nejpočetnějším rodem neotropických cichlid řazený do skupiny Geophagini. Na rozdíl od všech ostatních linií cichlid jsou příslušníci této skupiny snadno rozpoznatelní díky protáhlému štíhlému tělu (odtud anglický název pike cichlids, "štikovité cichlidy"). Naprostá většina zástupců tohoto rodu jsou predátoři živící se hlavně vodními i suchozemskými bezobratlými a rybami; na svou kořist číhají v úkrytu za kamenem, potopenými věvemi či mezi kořeny. Ve srovnání s ostatními cichlidami jsou nenáročné na hydrologické podmínky a vyskytují se ve většině vodních biotopů od velkých údolních řek, lagun a přehradních nádrží až po malé horské potoky (pers. obs.). V dnešním pojetí zahrnuje tato skupina 85 popsaných druhů (Casciotta et al. 2006; Kullander & Lucena 2006; často úzce endemitních, a počet v současnosti rychle narůstá (Lucena 2007; Casciotta & Almirón 2008; Montaña et al. 2008; Kullander 2009; Piálek et al. 2010, Casciotta et al. 2010). Stawikowski & Werner (2004) uvádějí více než 120 známých druhů včetně těch dosud nepopsaných. Crenicichla má rozsáhlý areál rozšíření sahající od severního okraje jihoamerického kontinentu až po río Negro v argentinské části Patagonie (Casciotta 1987). Zatímco většina skupin neotropických ryb vykazuje nejvyšší počty druhů v povodí Amazonky, podle Kullandera (2009) je druhová diverzita tohoto rodu prokazatelně vyšší v jižní části areálu, v povodí Río de La Plata a přilehlých atlantských povodích. Molekulární fylogenezí této "jižní" druhové skupiny rodu Crenicichla se mj. zabývám v rámci své dizertační práce (Piálek et al., submitted). V rámci této studie jsme popsali nové druhové hejno ze střední části povodí Paraná a nazvali jej C. mandelburgeri sp. complex. Toto uskupení zahrnuje více než 10 morfologicky různých typů odlišujících se navzájem jednak zbarvením a dále stavbou hlavy, čelistí a druhem dentice. Morfotypy sdílející stejné zbarvení a lišící se zmíněnými ekomorfologickými charakteristikami žijí v několika případech (řeka Iguazú) úzce syntopicky a naznačují spolu s výsledky biogeografické analýzy možnost vzniku sympatrickou speciací. Tento způsob diverzifikace byl u ryb čeledi Cichlidae mnohokrát studován, výhradně však v jezerních systémech. Genetická variabilita uvedených ryb byla v rámci čtyř analyzovaných molekulárních lokusů (cytb, ND2, 16S, S7-i1) na rozdíl od variability morfologické velmi nízká (< 1%) a neumožnila navrhnout hodnověrnou hypotézu objasňující jejich evoluční vztahy a mechanismy speciace. Vzhledem k možnosti prokázání prozatím nepopsaného fenoménu sympatrické speciace cichlid v říčních systémech bych proto rád dále studoval uvedené druhové hejno na populačně-genetické úrovni s využitím mikrosatelitních markerů. Přestože jsou neotropické cichlidy bohatě diverzifikovanou skupinou (550 druhů; Kullander 2003) a studium jejich fylogenetických vztahů molekulárními metodami se v posledních letech těší značné oblibě, jen málo prací se zatím této linii ryb věnovalo na populační úrovni (Amado et al. 2008). Vhodné mikrosatelitní lokusy pro analýzu druhového hejna C. mandelburgeri tedy není v současnosti možné (přinejmenším v dostatečném počtu) převzít z literatury a je třeba je vyvinout a otestovat. Na druhou stranu jsou lokusy obsahující mikrosatelitní motivy u ryb často překvapivě konzervativní (Holmen et al. 2005, Amado et al. 2008) a markery identifikované v rámci tohoto projektu by proto mohly mít obecnější použití a posloužit případně i v populačních analýzách dalších skupin cichlid.

3 Literatura: Amado M.V., Hrbek T., Gravena W., Fantin C., Nogueira de Assunção E., Astolfi-Filho S. & Farias I.P. (2008) Isolation and characterization of microsatellite markers for the ornamental discus fish Symphysodon discus and cross-species amplification in other Heroini cichlid species. Molecular Ecology Resources 8: Casciotta J.R. (1987) Crenicichla celidochilus n. sp. from Uruguay and a multivariate analysis of the lacustris group (Perciformes, Cichlidae). Copeia 1987: Casciotta J. & Almirón A. (2008) Crenicichla tesay, a new species of cichlid (Perciformes: Labroidei) from the río Iguazú basin in Argentina. Revue suisse de Zoologie 115: Casciotta J.R., Almirón A.E. & Gómez S.E. (2006) Crenicichla yaha sp. n. (Perciformes: Labroidei: Cichlidae), a new species from the río Iguazú and arroyo Urugua-í basins, northeastern Argentina. Zoologische Abhandlungen, Staatliche Naturhistorische Sammlungen Dresden, Museum für Tierkunde 56: Casciotta J., Almirón A., Piálek L., Gómez S. & Říčan O. (2010) Crenicichla ypo (Teleostei: Cichlidae), a new species from the middle Paraná basin in Misiones, Argentina. Neotropical Ichthyology 8(3): Holmen J., Vøllestad L.A., Jakobsen K.S. & Primmer C.R. (2005) Cross-species amplification of zebrafish and central stoneroller microsatellite loci in six other cyprinids. Journal of Fish Biology 66: Kullander S.O. (2003) Cichlidae (Cichlids). In: Reis, R.E., Kullander, S.O., Ferraris Jr., C.J. (Eds.), Checklist of the Freshwater Fishes of South and Central America. EDIPUCRS, Porto Alegre, pp Kullander S.O. (2009) Crenicichla mandelburgeri, a new species of cichlid fish (Teleostei: Cichlidae) from the Paraná River drainage in Paraguay. Zootaxa 2006: Kullander S.O. & Lucena C.A.S. (2006) A review of the species of Crenicichla (Teleostei: Cichlidae) from the Atlantic coastal rivers of southeastern Brasil from Bahia to Rio Grande do Sul State, with description of three new species. Neotropical Ichthyology 4: Lucena C.A.S. (2007) Two new species of the genus Crenicichla Heckel, 1840 from the upper rio Uruguay drainage (Perciformes: Cichlidae). Neotropical Ichthyology 5: Montaña C.G., López-Fernández H. & Taphorn D.C. (2008) A new species of Crenicichla (Perciformes: Cichlidae) from the Ventuari River, Upper Orinoco River basin, Amazonas State, Venezuela. Zootaxa 1856: Piálek L., Říčan O., Almirón A. & Casciotta J. (2010) Crenicichla hu, a new species of cichlid fish (Teleostei : Cichlidae) from the Paraná basin in Misiones, Argentina. Zootaxa 2537: Piálek L., Říčan O., Casciotta J., Almirón A. & Zrzavý J. (submitted) Multilocus phylogeny of Crenicichla (Teleostei: Cichlidae), with biogeography of the C. lacustris group: species flocks as a model for sympatric speciation in rivers. Molecular Phylogenetics and Evolution. Stawikowski R. & Werner U. (2004) Die Buntbarsche Amerikas. Band 3: Erdfresser, Hecht- und Kammbuntbarsche. Eugen Ulmer, Stuttgart, 478 pp.

4 Stanovení badatelských cílů, metody a způsob řešení (max. 2 stránky): Cílem tohoto projektu je: A. Vyvinout a charakterizovat dostatečný počet mikrosatelitních markerů, které by byly informativní pro druhový komplex Crenicichla mandelburgeri. B. Testovat amplifikovatelnost vybraných mikrosatelitních lokusů u dalších skupin v rámci čeledi Cichlidae. A.1. Příprava mikrosatelitní knihovny Tkáňové vzorky ryb z druhového hejna C. mandelburgeri již byly získány během terénních prací v Argentině v letech Genomová DNA bude izolována komerčním kitem Qiagen dle standardního protokolu. Kontrola kvality izolátů bude provedena pokusnou PCR amplifikací již optimalizovaných markerů (cytb, ND2) a její koncentrace bude proměřena absorpční metodou na UV/Vis spektrofotometru (Nanodrop). Pro zajištění polymorfismu navržených lokusů bude pro tvorbu mikrosatelitní knihovny použita směs izolátů genomové DNA z ca vybraných exemplářů v ekvivalentním poměru. Zhotovení mikrosatelitní knihovny (restrikce, ligace adaptérů, amplifikace, hybridizace se sondami s mikrosatelitními motivy) bude zajištěno komerčně u firmy GenoScreen, Francie včetně následného NGS sekvenování získaných fragmentů. Knihovna bude firmou dodána ve formě počítačových souborů obsahující jak zjištěné sekvence, tak navržené páry primerů. GenoScreen garantuje identifikaci min různých sekvencí s mikrosatelitními motivy a min. 100 bioinformatickými metodami ověřených párů primerů včetně délky jimi amplifikovaných lokusů. A.2 Výběr primerů a jejich praktické ověření Z navržených primerů bude vybráno min. 30 párů (pro různé lokusy) na základě termodynamických kritérií (změna Gibbsovy energie vazeb při tvorbě dimerů, heterodimerů a vlásenek). V úvahu bude brána rovněž délka amplifikovaných lokusů tak, aby bylo ve výsledné fázi možné detekovat co největší počet nezávislých lokusů v rámci jedné fragmentační analýzy. Zvolené primery budou v neznačené formě pořízeny u firmy Integrated DNA Technologies a jejich funkčnost bude ověřena PCR amplifikací (optimalizace na teplotním gradientu) a detekcí příslušných fragmentů na agarózovém gelu. Analýzy budou prováděny na 20 až 30 vzorcích ryb zahrnujících všechny známé morfotypy z uvedeného druhového komplexu. A.3. Ověření informativnosti vybraných lokusů Na základě výsledků PCR amplifikace bude vybráno ca mikrosatelitních lokusů, pro které budou objednány značené F primery (Applied Biosystems, G5 set). Zvolené lokusy budou testovány na jedincích prostřednictvím fragmentační analýzy provedené komerčně u firmy Macrogen Europe, Holandsko. Délka fragmentů bude analyzována prostřednictvím software GeneMapper; populačně-genetické parametry jednotlivých lokusů (genetická variabilita, pozorovaná a očekávaná heterozygosita, F-statistika) pak v programu GENETIX. B.1. Test amplifikovatelnosti mikrosatelitních lokusů u dalších skupin čeledi Cichlidae Neznačené primery (min. 30 párů) vybrané postupem A.2 budou použity rovněž k testování amplifikovatelnosti příslušných lokusů u dalších linií neotropických a afrických cichlid (ca. 50 jedinců min. 35 různých rodů). Tkáňové vzorky jsou k dispozici z našich terénních sběrů,

5 postup izolace bude shodný s předešlým. Amplifikované fragmenty budou detekovány na agarózovém gelu a jejich délka odhadnuta porovnáním s velikostním standardem. Harmonogram prací: týden Výběr a izolace tkáňových vzorků, kontrola kvality (PCR), objednání mikrosatelitní knihovny u firmy GenoScreen (dodací lhůta ca. 3 měsíce) týden Během přípravy knihovny bude proveden výběr vzorků dalších linií cichlid (ca. 50), izolace genomové DNA a kontrola kvality (PCR). 17. týden Výběr potenciálně vhodných primerů a jejich pořízení v neznačené formě týden Optimalizace a PCR amplifikace vybraných lokusů s neznačenými primery: 1. Crenicichla mandelburgeri sp. komplex, 2. ostatní rody. Výběr a pořízení značených primerů týden Amplifikace vybraných lokusů se značenými primery, fragmentační analýzy týden Analýza jednotlivých lokusů, sepisování závěrečné zprávy, zahájení přípravy publikace Předpokládaný typ vědeckých výsledků projektu Publikace mikrosatelitních markerů a charakteristik příslušných lokusů v časopisu Molecular Ecology Resources. Hlavní řešitel (maximálně 30 řádek) Piálek Lubomír, Mgr. Ing. V rámci doktorského studia se na katedře zoologie PřF JU zabývám fylogenezí a historickou biogeografií živočichů, především neotropických cichlid s využitím molekulárních metod (sekvenování DNA, AFLP). Granty: 2010: GAJU - Evoluce druhové diverzity rodu Crenicichla [Teleostei: Cichlidae] v provincii Misiones jako důsledek historického vývoje oblasti Publikace: Říčan O., Piálek L., Almirón A. & Casciotta J. (in press) Two new species of Australoheros (Teleostei: Cichlidae), with notes on diversity of the genus and biogeography of the Río de la Plata basin. Zootaxa.

6 Casciotta J., Almirón A., Piálek L., Gómez S. & Říčan O. (2010) Crenicichla ypo (Teleostei: Cichlidae), a new species from the middle Paraná basin in Misiones, Argentina. Neotropical Ichthyology 8(3): Piálek L., Říčan O., Almirón A. & Casciotta J. (2010) Crenicichla hu, a new species of cichlid fish (Teleostei : Cichlidae) from the Paraná basin in Misiones, Argentina. Zootaxa 2537: Zrzavý J., Říha P., Piálek L. & Janouškovec J. (2009) Phylogeny of Annelida (Lophotrochozoa): total-evidence analysis of morphology and six genes. BMC Evolutionary Biology 9: 189. Vedoucí projektu (maximálně 30 řádek) Říčan Oldřich, Mgr., PhD. Odborná charakteristika: Výzkum evoluce a diverzity Neotropické oblasti, historická biogeografie (Guyanská a Brazilská vysočina, Andy, Stř. Amerika) založená na studiu fylogenetických vztahů a areálů rozšíření. Modelovou skupinou jsou sladkovodní ryby, převážně čeleď Cichlidae. Výzkum zahrnuje kompletní spektrum aktivit začínají výzkumem v terénu a končící analýzou ekologických, morfologických a molekulárních dat. Granty - výběr: : GAČR 206/08/P003 - Phylogeny and biogeography of cichlid fishes in Mesoamerica. 2005: Grant Agency of the University of South Bohemia - Phylogenetic analysis and biogeographic history of Middle American cichlid fishes. 2004: Helge Axon s Johnsons Stiftelse (Sweden) - Phylogeny and biogeography of Central American cichlid fishes. Publikace - výběr: Musilová Z., Říčan O. & Novák J Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research 47 (3): IF Musilová Z., Říčan O., Janko K. & Novák J Molecular Phylogenetics and Evolution 46: IF Říčan O. & Kullander S. O Zootaxa 1724: IF Říčan O., Zardoya R. & Doadrio I Molecular Phylogenetics and Evolution 49: IF Concheiro Peréz G. A., Říčan O., Ortí G., Bermingham E., Doadrio I. & Zardoya R Molecular Phylogenetics and Evolution 43: IF Higham T. E., Hulsey C. D., Říčan O. & Carroll A. M Journal of Evolutionary Biology 20: IF Říčan O. & Kullander S. O Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research 44 (2): IF 1.826

7 Říčan O. & Kullander S.O Copeia 2003 (4): IF 0.748

8 Požadované finanční prostředky Výdaje a náklady na pořízení hmotného a nehmotného majetku (max Kč) Drobný hmotný a nehmotný majetek: 0 Kč Spotřební materiál: Kč Náklady na publikace (max. 2000Kč): 2000 Kč Požadované finanční prostředky celkem: Kč Slovní zdůvodnění a rozpis finančních prostředků izolace DNA QIAGEN DNeasy Blood & Tissue Kit - budou využity přebytky z jiných projektů 0 zhotovení mikrosatelitní knihovny bude hrazeno z jiných zdrojů 0 PCR amplifikace: neznačené primery IDT, 60 ks 15 značené primery Applied Biosystems, 15 ks 35 polymeráza budou využity přebytky z jiných projektů fragmentační analýzy: budou hrazeny z jiných zdrojů 0 spotřební materiál: eppendorfky, plata 96, rukavice, špičky, ethanol, PCR voda, TAE, agarosa, SYBR Green I atd. budou využity přebytky z jiných projektů 0 odborná literatura 2 Hedrick: Genetics of populations Wakeley: Coalescent Theory - An Introduction Celkem 52

ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH Projekt ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH PŘIHLÁŠKA STUDENTSKÉHO PROJEKTU Název projektu: Návrh a implementace procesu zpracování dat, formát MzXML Uchazeč Hlavní řešitel

Více

Fisher M. & al. (2000): RAPD variation among and within small and large populations of the rare clonal plant Ranunculus reptans (Ranunculaceae).

Fisher M. & al. (2000): RAPD variation among and within small and large populations of the rare clonal plant Ranunculus reptans (Ranunculaceae). Populační studie Fisher M. & al. (2000): RAPD variation among and within small and large populations of the rare clonal plant Ranunculus reptans (Ranunculaceae). American Journal of Botany 87(8): 1128

Více

Genetická diverzita masného skotu v ČR

Genetická diverzita masného skotu v ČR Genetická diverzita masného skotu v ČR Mgr. Jan Říha Výzkumný ústav pro chov skotu, s.r.o. Ing. Irena Vrtková 26. listopadu 2009 Genetická diverzita skotu pojem diverzity Genom skotu 30 chromozomu, genetická

Více

ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH ZPRÁVA O UKONČENÍ PROJEKTU Projekt Název projektu: Landscape genetics of Natal Multimammate Mouse (Mastomys natalensis), important rodent

Více

6. Kde v DNA nalézáme rozdíly, zodpovědné za obrovskou diverzitu života?

6. Kde v DNA nalézáme rozdíly, zodpovědné za obrovskou diverzitu života? 6. Kde v DNA nalézáme rozdíly, zodpovědné za obrovskou diverzitu života? Pamatujete na to, co se objevilo v pracích Charlese Darwina a Alfreda Wallace ohledně vývoje druhů? Aby mohl mechanismus přírodního

Více

R E G I O N ÁL N Í Z E M ĚP I S

R E G I O N ÁL N Í Z E M ĚP I S R E G I O N ÁL N Í Z E M ĚP I S VÝUKOVÁSLEPÁMAPA JIŽNÍAMERIKA -HYDROLOGIE Mgr. Iva Svobodová Hydrologické vymezení poloha: Jižní Amerika se rozkládá na západní polokouli, ze západu ji omývá Tichý oceán,

Více

Výuka genetiky na Přírodovědecké fakultě UK v Praze

Výuka genetiky na Přírodovědecké fakultě UK v Praze Výuka genetiky na Přírodovědecké fakultě UK v Praze Studium biologie na PřF UK v Praze Bakalářské studijní programy / obory Biologie Biologie ( duhový bakalář ) Ekologická a evoluční biologie ( zelený

Více

UTILIZATION OF DNA MICROSATELLITES USED IN PARENTITY PANEL IN EVALUATION OF DIVERZITY AND DISTANCES BETWEEN THE BREEDS OF PIGS IN CZECH REPUBLIC

UTILIZATION OF DNA MICROSATELLITES USED IN PARENTITY PANEL IN EVALUATION OF DIVERZITY AND DISTANCES BETWEEN THE BREEDS OF PIGS IN CZECH REPUBLIC UTILIZATION OF DNA MICROSATELLITES USED IN PARENTITY PANEL IN EVALUATION OF DIVERZITY AND DISTANCES BETWEEN THE BREEDS OF PIGS IN CZECH REPUBLIC VYUŽITÍ DNA MIKROSATELITŮ POUŽÍVANÝCH V PANELU NA URČOVÁNÍ

Více

MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÉ METODY V ENVIRONMENTÁLNÍ MIKROBIOLOGII. Martina Nováková, VŠCHT Praha

MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÉ METODY V ENVIRONMENTÁLNÍ MIKROBIOLOGII. Martina Nováková, VŠCHT Praha MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÉ METODY V ENVIRONMENTÁLNÍ MIKROBIOLOGII Martina Nováková, VŠCHT Praha MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE V BIOREMEDIACÍCH enumerace FISH průtoková cytometrie klonování produktů PCR sekvenování

Více

Využití DNA sekvencování v

Využití DNA sekvencování v Využití DNA sekvencování v taxonomii prokaryot Mgr. Pavla Holochová, doc. RNDr. Ivo Sedláček, CSc. Česká sbírka mikroorganismů Ústav experimentální biologie Přírodovědecká fakulta Masarykova univerzita,

Více

Genetický polymorfismus jako nástroj identifikace osob v kriminalistické a soudnělékařské. doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc.

Genetický polymorfismus jako nástroj identifikace osob v kriminalistické a soudnělékařské. doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc. Genetický polymorfismus jako nástroj identifikace osob v kriminalistické a soudnělékařské praxi doc. RNDr. Ivan Mazura, CSc. Historie forenzní genetiky 1985-1986 Alec Jeffreys a satelitní DNA 1980 Ray

Více

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/ Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky Populační genetika (KBB/PG)

Více

Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii

Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii Ctirad Hofr 1/1 Proč biofyzikální metody? Biofyzikální metody využívají fyzikální principy ke studiu biologických systémů Poskytují kvantitativní

Více

Mendelova univerzita v Brně Agronomická fakulta Ústav biologie rostlin

Mendelova univerzita v Brně Agronomická fakulta Ústav biologie rostlin Mendelova univerzita v Brně Agronomická fakulta Ústav biologie rostlin Inovace praktických cvičení molekulárně-biologických předmětů o sekvenční úlohy PRACOVNÍ PROTOKOL PRO PŘEDMĚT GENETCKÁ DIVERZITA Vypracováno

Více

Vyhledávání a charakteristika genů zodpovědných za modré zabarvení obilky pšenice seté (Triticum aestivum L.)

Vyhledávání a charakteristika genů zodpovědných za modré zabarvení obilky pšenice seté (Triticum aestivum L.) Předběžná oponentura disertační práce Vyhledávání a charakteristika genů zodpovědných za modré zabarvení obilky pšenice seté (Triticum aestivum L.) Školitel: Prof. RNDr. Ladislav Havel, CSc. Doktorandka:

Více

1. Děkan PřF UHK vyhlašuje soutěž na projekty specifického výzkumu pro rok 2013.

1. Děkan PřF UHK vyhlašuje soutěž na projekty specifického výzkumu pro rok 2013. 1. Děkan PřF UHK vyhlašuje soutěž na projekty specifického výzkumu pro rok 2013. 2. Soutěž se řídí směrnicí kvestora UHK č. 2/2012 a dalšími právními předpisy uvedenými v čl. I této směrnice. 3. Text vyhlášení

Více

Dědičnost pohlaví Genetické principy základních způsobů rozmnožování

Dědičnost pohlaví Genetické principy základních způsobů rozmnožování Dědičnost pohlaví Vznik pohlaví (pohlavnost), tj. komplexu znaků, vlastností a funkcí, které vymezují exteriérové i funkční diference mezi příslušníky téhož druhu, je výsledkem velmi komplikované série

Více

Biotechnologický kurz. II. letní škola metod molekulární biologie nukleových kyselin a genomiky 17. - 21. 6. 2013

Biotechnologický kurz. II. letní škola metod molekulární biologie nukleových kyselin a genomiky 17. - 21. 6. 2013 Biotechnologický kurz Biotechnologický kurz II. letní škola metod molekulární biologie nukleových kyselin a genomiky 17. - 21. 6. 2013 Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat AF MENDELU v Brně Zemědělská

Více

THE CHOICE OF THE MOST SUITABLE TECHNIQUE FOR ISOLATION OF NUCLEIC ACIDS AT DEPARTMENT OF ANIMAL MORPHOLOGY, PHYSIOLOGY AND GENETICS

THE CHOICE OF THE MOST SUITABLE TECHNIQUE FOR ISOLATION OF NUCLEIC ACIDS AT DEPARTMENT OF ANIMAL MORPHOLOGY, PHYSIOLOGY AND GENETICS THE CHOICE OF THE MOST SUITABLE TECHNIQUE FOR ISOLATION OF NUCLEIC ACIDS AT DEPARTMENT OF ANIMAL MORPHOLOGY, PHYSIOLOGY AND GENETICS VÝBĚR NEJVHODNĚJŠÍHO ZPŮSOBU IZOLACE NUKLEOVÝCH KYSELIN NA ÚSTAVU MORFOLOGIE,

Více

Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 12. Shrnutí,

Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 12. Shrnutí, Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin 12. Shrnutí, Přehled molekulárních markerů 1. proteiny isozymy 2. DNA markery RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) založené

Více

Biotechnologický kurz. III. letní škola metod molekulární biologie nukleových kyselin a genomiky

Biotechnologický kurz. III. letní škola metod molekulární biologie nukleových kyselin a genomiky Biotechnologický kurz Biotechnologický kurz III. letní škola metod molekulární biologie nukleových kyselin a genomiky 18. - 22. 6. 2012 Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat AF MENDELU v Brně

Více

PhD. České Budějovice

PhD. České Budějovice PhD. České Budějovice Sledování a využívání poznatků o genetické biodiverzitě mezi populacemi hospodářských zvířat Dvořák Josef prof. Genetiky živočichů Ústavu genetiky MZLU v Brně Pro seminář doktorského

Více

- taxonomicky jeden z nejobtížnějších rodů v Evropě (ca 200-300 druhů)

- taxonomicky jeden z nejobtížnějších rodů v Evropě (ca 200-300 druhů) - produkují taxonomickou diverzitu hybridizací uvnitř skupiny - taxonomicky jeden z nejobtížnějších rodů v Evropě (ca 200-300 druhů) - hlavní příčina taxonomické obtížnosti: relativně běžná hybridizace

Více

Tok GI v buňce. Genetický polymorfizmus popis struktury populací. Organizace genetického materiálu. Definice polymorfismu

Tok GI v buňce. Genetický polymorfizmus popis struktury populací. Organizace genetického materiálu. Definice polymorfismu Genetický olymorfizmus ois struktury oulací Tok GI v buňce Dr. Ing. Urban Tomáš ÚSTAV GEETIKY MZLU Brno urban@mendelu.cz htt://www.mendelu.cz/af/genetika/ Seminář doktorského grantu 53/03/H076 : Molekulárn

Více

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY

PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY RNDr. Pavel Lízal, Ph.D. Přírodovědecká fakulta MU Ústav experimentální biologie Oddělení genetiky a molekulární biologie lizal@sci.muni.cz 1) Praktikum z obecné genetiky 2) Praktikum z genetiky rostlin

Více

ODLIŠENÍ ODRŮD PŠENICE OBECNÉ TRITICUM AESTIVUM L. METODOU RAPD

ODLIŠENÍ ODRŮD PŠENICE OBECNÉ TRITICUM AESTIVUM L. METODOU RAPD ODLIŠENÍ ODRŮD PŠENICE OBECNÉ TRITICUM AESTIVUM L. METODOU RAPD Distinguishing of Wheat Varieties (Tritium aestivum L.) by Method RAPD Zuzana Kohutová, Zuzana Kocourková, Hana Vlastníková, Petr Sedlák

Více

Obhajoba IP 2014 Zemědělská fakulta JU FOTO

Obhajoba IP 2014 Zemědělská fakulta JU FOTO Obhajoba IP 2014 Zemědělská fakulta JU FOTO Přehled projektů IP14_39 PO2 Rozvoj vzdělávací činnosti na ZF prof. Ing. Martin Křížek, CSc. IP14_40 PO3 Internacionalizace Zemědělské fakulty JU v Č. Budějovicích

Více

Projekt SPINNET CZ.1.07/2.4.00/17.0094 V JIHOČESKÉM REGIONU

Projekt SPINNET CZ.1.07/2.4.00/17.0094 V JIHOČESKÉM REGIONU Společnost vědeckotechnických parků ČR Projekt SPINNET CZ.1.07/2.4.00/17.0094 V JIHOČESKÉM REGIONU Jihočeská agentura pro podporu inovačního podnikání o.p.s. Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích

Více

EKONOMICKÉ ASPEKTY GENETICKÝCH VYŠETŘENÍ. I. Šubrt Společnost lékařské genetiky ČLS JEP

EKONOMICKÉ ASPEKTY GENETICKÝCH VYŠETŘENÍ. I. Šubrt Společnost lékařské genetiky ČLS JEP EKONOMICKÉ ASPEKTY GENETICKÝCH VYŠETŘENÍ I. Šubrt Společnost lékařské genetiky ČLS JEP Lékařská genetika Lékařský obor zabývající se diagnostikou a managementem dědičných onemocnění Genetická prevence

Více

V. letní škola metod molekulární biologie nukleových kyselin a genomiky 16. - 20. 6. 2014. Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat AF MENDELU

V. letní škola metod molekulární biologie nukleových kyselin a genomiky 16. - 20. 6. 2014. Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat AF MENDELU V. letní škola metod molekulární biologie nukleových kyselin a genomiky 16. - 20. 6. 2014 Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat AF MENDELU Zemědělská 1, Budova A, 4. patro (učebny dle programu)

Více

Genetický polymorfismus

Genetický polymorfismus Genetický polymorfismus Za geneticky polymorfní je považován znak s nejméně dvěma geneticky podmíněnými variantami v jedné populaci, které se nachází v takových frekvencích, že i zřídkavá má frekvenci

Více

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/ Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0032 Moderní metody pro studium diverzity a evoluce rostlin Hana Šimková Ekologie

Více

Diagnostika infekce Chlamydia trachomatis pomocí molekulárně genetické metody real time PCR nejen u pacientek z gynekologických zařízení

Diagnostika infekce Chlamydia trachomatis pomocí molekulárně genetické metody real time PCR nejen u pacientek z gynekologických zařízení Diagnostika infekce Chlamydia trachomatis pomocí molekulárně genetické metody real time PCR nejen u pacientek z gynekologických zařízení Mgr. Klára Vilimovská Dědečková, Ph.D. Synlab genetics s.r.o. Molekulární

Více

PCR IN DETECTION OF FUNGAL CONTAMINATIONS IN POWDERED PEPPER

PCR IN DETECTION OF FUNGAL CONTAMINATIONS IN POWDERED PEPPER PCR IN DETECTION OF FUNGAL CONTAMINATIONS IN POWDERED PEPPER Trojan V., Hanáček P., Havel L. Department of Plant Biology, Faculty of Agronomy, Mendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Zemedelska

Více

Narozena: v Sokolově. Jazyky: - vývojová a funkční anatomie a morfologie obojživelníků. - hybridní zóna evropských kuněk

Narozena: v Sokolově. Jazyky: - vývojová a funkční anatomie a morfologie obojživelníků. - hybridní zóna evropských kuněk - vývojová a funkční anatomie a morfologie obojživelníků - hybridní zóna evropských kuněk Pedagogická činnost Školitelství Kontakt Narozena: 20. 3. 1978 v Sokolově Jazyky: - angličtina (středně pokročilá)

Více

ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH PŘIHLÁŠKA STUDENTSKÉHO PROJEKTU Projekt Název projektu: Rozptyl primárních elektronů na atomech zalévacího média biologického materiálu

Více

Interní grantová agentura AF MENDELU Individuální doktorské projekty Formuláře platné pro rok 2015

Interní grantová agentura AF MENDELU Individuální doktorské projekty Formuláře platné pro rok 2015 Individuální doktorské projekty Formuláře platné pro rok 2015 Grantová přihláška se podává v termínu od 17.července 2014 do 31.října 2014 do 10:00 hod. Kanceláři IGA AF MENDELU výhradně v elektronické

Více

S = c.a z. log(s) = log(c) + z.log(a) Rovnovážná teorie ostrovní biogeografie. The species-area relationship. The species-area relationship

S = c.a z. log(s) = log(c) + z.log(a) Rovnovážná teorie ostrovní biogeografie. The species-area relationship. The species-area relationship Rovnovážná teorie ostrovní biogeografie equilibrium theory of island biogeography Robert MacArthur & Edward Osborne Wilson (1963, 1967) proč druhů přibývá s plochou ostrova? proč druhů ubývá s izolovaností

Více

VARIABILITY IN H-FABP, C-MYC, GH, LEP, LEPR GENES IN LARGE WHITE, LANDRACE AND DUROC BREEDS OF PIGS

VARIABILITY IN H-FABP, C-MYC, GH, LEP, LEPR GENES IN LARGE WHITE, LANDRACE AND DUROC BREEDS OF PIGS VARIABILITY IN H-FABP, C-MYC, GH, LEP, LEPR GENES IN LARGE WHITE, LANDRACE AND DUROC BREEDS OF PIGS VARIABILITA GENŮ H-FABP, C-MYC, GH, LEP, LEPR U PLEMEN PRASAT BÍLÉ UŠLECHTILÉ, LANDRASE A DUROK Mikolášová

Více

ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH ZPRÁVA O UKONČENÍ PROJEKTU Projekt Název projektu: Impact of host ecology on metabolic capacity of Sodalis allied symbiotic bacteria

Více

Centrum aplikované genomiky, Ústav dědičných metabolických poruch, 1.LFUK

Centrum aplikované genomiky, Ústav dědičných metabolických poruch, 1.LFUK ové technologie v analýze D A, R A a proteinů Stanislav Kmoch Centrum aplikované genomiky, Ústav dědičných metabolických poruch, 1.LFUK Motto : "The optimal health results from ensuring that the right

Více

Rekonstrukce biogeografické historie: outline přednášky

Rekonstrukce biogeografické historie: outline přednášky Rekonstrukce biogeografické historie: outline přednášky tradiční přístupy (do 80-ých let) a jejich slabiny Croizatova panbiogeografie a její slabiny Hennigovo progression rule a jeho slabiny disperzní

Více

Výroční zpráva projektu specifického výzkumu v roce 2015, zakázka č. 2115

Výroční zpráva projektu specifického výzkumu v roce 2015, zakázka č. 2115 Výroční zpráva projektu specifického výzkumu v roce 2015, zakázka č. 2115 Příloha č. 1 Název projektu: UML, Unified Modeling Language a jeho využití v softwarovém inženýrství. Specifikace řešitelského

Více

NÁVOD K POUŽITÍ PRO KIT BRAF P.VAL600GLU

NÁVOD K POUŽITÍ PRO KIT BRAF P.VAL600GLU NÁVOD K POUŽITÍ PRO KIT BRAF P.VAL600GLU IntellMed, s.r.o. Šlechtitelů 21 78371 Olomouc IČ: 27780317 DIČ: CZ27780317-18 C 1 2 OBSAH IntellMed, s.r.o., Šlechtitelů 21, 78371 Olomouc Návod k použití pro

Více

Návrh směrnic pro správnou laboratorní diagnostiku Friedreichovy ataxie.

Návrh směrnic pro správnou laboratorní diagnostiku Friedreichovy ataxie. Návrh směrnic pro správnou laboratorní diagnostiku Friedreichovy ataxie. Připravila L.Fajkusová Online Mendelian Inheritance in Man: #229300 FRIEDREICH ATAXIA 1; FRDA *606829 FRDA GENE; FRDA Popis onemocnění

Více

Výroční zpráva projektu specifického výzkumu v roce 2015 zakázka č Speciální typy matic a jejich souvislost s celočíselnými posloupnostmi

Výroční zpráva projektu specifického výzkumu v roce 2015 zakázka č Speciální typy matic a jejich souvislost s celočíselnými posloupnostmi Výroční zpráva projektu specifického výzkumu v roce 2015 zakázka č. 2121 Název projektu: Speciální typy matic a jejich souvislost s celočíselnými posloupnostmi Specifikace řešitelského týmu Odpovědný řešitel:

Více

Vytvořen. ení genetické databanky vybraných druhů savců ČR ití pro udržitelný rozvoj dopravy. Tomáš. Libosvár

Vytvořen. ení genetické databanky vybraných druhů savců ČR ití pro udržitelný rozvoj dopravy. Tomáš. Libosvár Vytvořen ení genetické databanky vybraných druhů savců ČR k využit ití pro udržitelný rozvoj dopravy Tomáš Libosvár TA02031259 Vytvořen ení genetické databanky vybraných druhů savců ČR k využit ití pro

Více

- Jako člověk fascinovaný variabilitou savců se nejvíce zajímám o fylogenezi, taxonomii a ochranu savců.

- Jako člověk fascinovaný variabilitou savců se nejvíce zajímám o fylogenezi, taxonomii a ochranu savců. - Jako člověk fascinovaný variabilitou savců se nejvíce zajímám o fylogenezi, taxonomii a ochranu savců. - Za velice zajímavou považuji také domestikaci zvířat a obecně vztah člověka ke zvířatům. - Mými

Více

Zásady studentské grantové soutěže

Zásady studentské grantové soutěže Vysoká škola tělesné výchovy a sportu PALESTRA, spol. s r. o. Zásady studentské grantové soutěže Touto směrnicí jsou stanovena pravidla soutěže na podporu projektů specifického vysokoškolského výzkumu

Více

Návrh kandidáta na funkci 1 : interního člena VR AV ČR. Navrhovatel (pracoviště AV ČR): Ústav analytické chemie AV ČR, v. v. i.

Návrh kandidáta na funkci 1 : interního člena VR AV ČR. Navrhovatel (pracoviště AV ČR): Ústav analytické chemie AV ČR, v. v. i. Návrh kandidáta na funkci 1 : interního člena VR AV ČR Navrhovatel (pracoviště AV ČR): Ústav analytické chemie AV ČR, v. v. i. Jméno, příjmení a tituly kandidáta: Jiří Dědina, doc. RNDr. CSc. DSc. Rok

Více

Prezentace školy. 00216224 Masarykova univerzita Žerotínovo nám. 9, Brno, Jihomoravský kraj. Veřejná vysoká škola

Prezentace školy. 00216224 Masarykova univerzita Žerotínovo nám. 9, Brno, Jihomoravský kraj. Veřejná vysoká škola Prezentace školy 00216224 Masarykova univerzita Žerotínovo nám. 9, Brno, Jihomoravský kraj Veřejná vysoká škola Spolupráce MU s podniky Spolupráce s podniky Výzkum a vývoj Studenti Další vzdělávání Ostatní

Více

Projekt: ŠKOLA RADOSTI, ŠKOLA KVALITY Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.4.00/21.3688 EU PENÍZE ŠKOLÁM

Projekt: ŠKOLA RADOSTI, ŠKOLA KVALITY Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.4.00/21.3688 EU PENÍZE ŠKOLÁM ZÁKLADNÍ ŠKOLA OLOMOUC příspěvková organizace MOZARTOVA 48, 779 00 OLOMOUC tel.: 585 427 142, 775 116 442; fax: 585 422 713 email: kundrum@centrum.cz; www.zs-mozartova.cz Projekt: ŠKOLA RADOSTI, ŠKOLA

Více

Ondřej Scheinost Nemocnice České Budějovice, a.s.

Ondřej Scheinost Nemocnice České Budějovice, a.s. Ondřej Scheinost Nemocnice České Budějovice, a.s. Nové technologie přelomové období principy technologií klinická použitelnost chips (arrays) sekvenační technologie Důležitost genetických informací i další

Více

Diagnostika retrovirů Lentiviry - HIV. Vladislava Růžičková

Diagnostika retrovirů Lentiviry - HIV. Vladislava Růžičková Diagnostika retrovirů Lentiviry - HIV Vladislava Růžičková VI. Třída RNA-viry se zpětnou transkriptázou RT Čeleď: Retroviridae (hostitelé: Obratlovci) Rody: Alpharetrovirus Betaretrovirus Gammaretrovirus

Více

DY D NE N X Hana Vlastníková

DY D NE N X Hana Vlastníková DYNEX Hana Vlastníková Molekulární biologie: Vybavení laboratoře na klíč Přístrojová technika Kompatibilní diagnostické soupravy Profesionální přístup SOP Technická podpora Servis Přístrojové vybavení:

Více

USING OF AUTOMATED DNA SEQUENCING FOR PORCINE CANDIDATE GENES POLYMORFISMS DETECTION

USING OF AUTOMATED DNA SEQUENCING FOR PORCINE CANDIDATE GENES POLYMORFISMS DETECTION USING OF AUTOMATED DNA SEQUENCING FOR PORCINE CANDIDATE GENES POLYMORFISMS DETECTION VYUŽITÍ AUTOMATICKÉHO SEKVENOVÁNÍ DNA PRO DETEKCI POLYMORFISMŮ KANDIDÁTNÍCH GENŮ U PRASAT Vykoukalová Z., Knoll A.,

Více

1. Největší státy počet obyvatel.

1. Největší státy počet obyvatel. AMERIKA 1. Největší státy počet obyvatel. 1. Největší státy počet obyvatel. Středozápad USA oblast Velkých planin Středozápad USA oblast Velkých jezer (Great Plains) (Midwest) 2. Hospodářsky nevýznamnější

Více

Druhový koncept protist

Druhový koncept protist Druhový koncept protist Pavel Škaloud, katedra botaniky PřF UK Protistologie (MB160P62) Druhový koncept protist Význam druhového konceptu Koncepty druhů u protist Automatické odlišení druhů Druhy Základní

Více

Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 2. Přehled aplikací a otázek

Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 2. Přehled aplikací a otázek Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin 2. Přehled aplikací a otázek Přehled molekulárních markerů 1. proteiny isozymy 2. DNA markery RFLP (Restriction Fragment Length

Více

2 Inkompatibilita v systému Rhesus. Upraveno z A.D.A.M.'s health encyclopedia

2 Inkompatibilita v systému Rhesus. Upraveno z A.D.A.M.'s health encyclopedia 2 Inkompatibilita v systému Rhesus Upraveno z A.D.A.M.'s health encyclopedia 3 Inkompatibilita v systému Rhesus Úkol 7, str.119 Které z uvedených genotypových kombinací Rh systému u manželů s sebou nesou

Více

1. Děkan PřF UHK vyhlašuje soutěž na projekty specifického výzkumu pro rok 2015.

1. Děkan PřF UHK vyhlašuje soutěž na projekty specifického výzkumu pro rok 2015. 1. Děkan PřF UHK vyhlašuje soutěž na projekty specifického výzkumu pro rok 2015. 2. Soutěž se řídí směrnicí kvestora UHK č. 2/2014 a dalšími právními předpisy uvedenými v čl. I této směrnice. 3. Text vyhlášení

Více

Zpráva ze zahraniční odborné stáže

Zpráva ze zahraniční odborné stáže Zpráva ze zahraniční odborné stáže Zahraniční odborná stáž byla realizována v rámci projektu ROZVOJ A POSÍLENÍ SPOLUPRÁCE MEZI AKADEMICKÝMI A SOUKROMÝMI SUBJEKTY SE ZAMĚŘENÍM NA CHEMICKÝ A FARMACEUTICKÝ

Více

Využití metagenomiky při hodnocení sanace chlorovaných ethylenů in situ Výsledky pilotních testů

Využití metagenomiky při hodnocení sanace chlorovaných ethylenů in situ Výsledky pilotních testů Využití metagenomiky při hodnocení sanace chlorovaných ethylenů in situ Výsledky pilotních testů Stavělová M.,* Macháčková J.*, Rídl J.,** Pačes J.** * Earth Tech CZ, s.r.o ** ÚMG AV ČR PROČ METAGENOMIKA?

Více

Výzva k podání nabídek

Výzva k podání nabídek Číslo zakázky (bude doplněno poskytovatelem dotace) 1 Název programu: Registrační číslo projektu Název projektu: Název zakázky: Předmět zakázky (služba/dodávka/stavební práce): Datum vyhlášení zakázky:

Více

Závěrečná zpráva projektu specifického výzkumu zakázka č. 2109/2013. Název projektu: Vliv fyziologicky aktivních látek na rostliny

Závěrečná zpráva projektu specifického výzkumu zakázka č. 2109/2013. Název projektu: Vliv fyziologicky aktivních látek na rostliny Závěrečná zpráva projektu specifického výzkumu zakázka č. 2109/2013 Název projektu: Vliv fyziologicky aktivních látek na rostliny Specifikace řešitelského týmu Odpovědný řešitel: doc. Ing. Jiří Tůma, CSc.,

Více

Atestace z lékařské genetiky inovované otázky pro rok A) Molekulární genetika

Atestace z lékařské genetiky inovované otázky pro rok A) Molekulární genetika Atestace z lékařské genetiky inovované otázky pro rok 2017 A) Molekulární genetika 1. Struktura lidského genu, nomenklatura genů, databáze týkající se klinického dopadu variace v jednotlivých genech. 2.

Více

UNIVERZITA KARLOVA FAKULTA SOCIÁLNÍCH VĚD

UNIVERZITA KARLOVA FAKULTA SOCIÁLNÍCH VĚD UNIVERZITA KARLOVA FAKULTA SOCIÁLNÍCH VĚD roční hodnocení plnění individuálního studijního plánu doktorského studijního programu za akademický rok ID plánu 9284 Student Fakulta Studijní program Studijní

Více

RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA

RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA 1. Genotyp a jeho variabilita, mutace a rekombinace Specifická imunitní odpověď Prevence a časná diagnostika vrozených vad 2. Genotyp a prostředí Regulace buněčného

Více

Mgr. Veronika Peňásová vpenasova@fnbrno.cz Laboratoř molekulární diagnostiky, OLG FN Brno Klinika dětské onkologie, FN Brno

Mgr. Veronika Peňásová vpenasova@fnbrno.cz Laboratoř molekulární diagnostiky, OLG FN Brno Klinika dětské onkologie, FN Brno Retinoblastom Mgr. Veronika Peňásová vpenasova@fnbrno.cz Laboratoř molekulární diagnostiky, OLG FN Brno Klinika dětské onkologie, FN Brno Retinoblastom (RBL) zhoubný nádor oka, pocházející z primitivních

Více

FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP

FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP na gymnáziu Pierra de Coubertina v Táboře Pavla Trčková, kabinet Biologie, GPdC Tábor Co je fluorescence Fluorescence je jev spočívající v tom, že některé látky (fluorofory) po

Více

ČÁST A. (týká se roku 2015)

ČÁST A. (týká se roku 2015) PRŮBĚŽNÁ ZPRÁVA o uskutečňování Programu rozvoje vědních oblastí na Univerzitě Karlově (PRVOUK) za rok 2015 a o dosavadním průběhu realizace tohoto programu (varianta formuláře pro programy z oblasti lékařských

Více

Chemická olympiáda jako prostředek orientace studenta ke studiu přírodovědných disciplín

Chemická olympiáda jako prostředek orientace studenta ke studiu přírodovědných disciplín Závěrečná zpráva projektu specifického výzkumu 2012 činnost 1210 zakázka č. 2116 Chemická olympiáda jako prostředek orientace studenta ke studiu přírodovědných disciplín Odpovědný řešitel projektu: Doc.

Více

REGIONÁLNÍ GEOGRAFIE LATINSKÉ AMERIKY. 5. přednáška Biogeografie

REGIONÁLNÍ GEOGRAFIE LATINSKÉ AMERIKY. 5. přednáška Biogeografie REGIONÁLNÍ GEOGRAFIE LATINSKÉ AMERIKY 5. přednáška Biogeografie Biosféra Pro její charakter (hlavně druhové složení) jsou určující: klimatické poměry, půda lidské zásahy proto je její rozložení v Latinské

Více

!!! Veškeré prezentované materiály a informace k danému předmětu na webových stránkách

!!! Veškeré prezentované materiály a informace k danému předmětu na webových stránkách Z o o g e o g r a f i e!!! Veškeré prezentované materiály a informace k danému předmětu na webových stránkách http://kzr.agrobiologie.cz O čem to bude..? Oldřich Kopecký kopeckyo@af.czu.cz předměty / zoogeografie

Více

IP 2014 část Stimulace kvalitativního rozvoje UJEP za účelem zvyšování konkurenceschopnosti

IP 2014 část Stimulace kvalitativního rozvoje UJEP za účelem zvyšování konkurenceschopnosti IP 2014 část Stimulace kvalitativního rozvoje UJEP za účelem zvyšování konkurenceschopnosti I. Harmonogram Termín Úkol Zajistí 2014 11. 2. 1. verze výzvy k celouniverzitní soutěži Prorektorka pro studium

Více

Děkan Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích R o z h o d n u t í

Děkan Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích R o z h o d n u t í Děkan Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích R o z h o d n u t í o podmínkách přijetí ke studiu oborů v navazujících magisterských studijních programech pro akademický rok 2017/2018.

Více

DYNEX nabízí komplexní řešení v oblasti zpracování a analýzy biologických materiálů pomocí molekulárně biologických metod.

DYNEX nabízí komplexní řešení v oblasti zpracování a analýzy biologických materiálů pomocí molekulárně biologických metod. DYNEX nabízí komplexní řešení v oblasti zpracování a analýzy biologických materiálů pomocí molekulárně biologických metod. Od 1.1.2014 DYNEX jediným OFICIÁLNÍM (autorizovaným) distributorem společnosti

Více

Směrnice rektora č. 9/2013

Směrnice rektora č. 9/2013 Slezská univerzita v Opavě Směrnice rektora č. 9/213 Jíž se vyhlašuje 2. Kolo Studentské grantové soutěže s počátkem řešení projektů v roce 213 Vydáno: V Opavě, duben 213 Směrnice rektora č. 9/213 jíž

Více

Seminář izolačních technologií

Seminář izolačních technologií Seminář izolačních technologií Zpracoval: Karel Bílek a Kateřina Svobodová Podpořeno FRVŠ 2385/2007 a 1305/2009 Úpravy a aktualizace: Pavla Chalupová ÚMFGZ MZLU v Brně 1 Lokalizace jaderné DNA 2 http://www.paternityexperts.com/basicgenetics.html

Více

Osa 2 Kvalita, efektivita a otevřenost vzdělávání Rozvoj školy doktorských studií

Osa 2 Kvalita, efektivita a otevřenost vzdělávání Rozvoj školy doktorských studií Osa 2 Kvalita, efektivita a otevřenost vzdělávání Rozvoj školy doktorských studií Globální cíl: zkvalitnění výchovy doktorandů a zlepšení jejich úrovně a připravenosti pro vědeckou práci a jejich pozice

Více

APLIKACE METAGENOMIKY PRO HODNOCENÍ PRŮBĚHU SANAČNÍHO ZÁSAHU NA LOKALITÁCH KONTAMINOVANÝCH CHLOROVANÝMI ETHYLÉNY

APLIKACE METAGENOMIKY PRO HODNOCENÍ PRŮBĚHU SANAČNÍHO ZÁSAHU NA LOKALITÁCH KONTAMINOVANÝCH CHLOROVANÝMI ETHYLÉNY APLIKACE METAGENOMIKY PRO HODNOCENÍ PRŮBĚHU SANAČNÍHO ZÁSAHU NA LOKALITÁCH KONTAMINOVANÝCH CHLOROVANÝMI ETHYLÉNY Monika Stavělová 1, Jakub Rídl 2, Maria Brennerová 3, Hana Kosinová 1, Jan Pačes 2 1 AECOM

Více

Doktorské studium 2013-2014

Doktorské studium 2013-2014 Doktorské studium 2013-2014 Proč a jak studovat v doktorském studiu? Doktorské studium 3. a nejvyšší stupeň VŠ vzdělání Bakalářské (Bc.) Magisterské (Mgr., Ing.) Doktorské (Ph.D. za jménem) Doktorské studium

Více

DNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH. Michaela Nesvadbová

DNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH. Michaela Nesvadbová DNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH Michaela Nesvadbová Význam identifikace živočišných druhů v krmivu a potravinách povinností každého výrobce je řádně a pravdivě označit

Více

Genetické markery, markery DNA

Genetické markery, markery DNA Obecná genetika Genetické markery, markery DNA Prof. Ing. Dušan GÖMÖRY, DrSc. Ing. Roman LONGAUER, CSc. Ústav zakládání a pěstění lesů LDF MENDELU Brno Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním

Více

Příloha Odůvodnění účelnosti veřejné zakázky pro účely předběžného oznámení veřejného zadavatele

Příloha Odůvodnění účelnosti veřejné zakázky pro účely předběžného oznámení veřejného zadavatele Příloha Odůvodnění účelnosti veřejné zakázky pro účely předběžného oznámení veřejného zadavatele podle 1 Vyhlášky č. 232/2012 Sb. o podrobnostech rozsahu odůvodnění účelnosti veřejné zakázky a odůvodnění

Více

NÁVOD K POUŽITÍ PRO HER2 DNA QUANTIFICATION KIT

NÁVOD K POUŽITÍ PRO HER2 DNA QUANTIFICATION KIT IČ: 80 DIČ: CZ80 sales@intellmed.eu NÁVOD K POUŽITÍ PRO HER DNA QUANTIFICATION KIT IČ: 80 DIČ: CZ80 sales@intellmed.eu OBSAH Návod k použití pro HER DNA QUANTIFICATION KIT.... Úvod.... Označení.... Rozsah

Více

Zápis ze zasedání Vědecké rady Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích dne 27. 4. 2016

Zápis ze zasedání Vědecké rady Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích dne 27. 4. 2016 Zápis ze zasedání Vědecké rady Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích dne 27. 4. 2016 Přítomni: prof. RNDr. František Vácha, Ph.D., doc. Ing. MgA. David Boukal, Ph.D., prof.

Více

Článek 1 Úvodní ustanovení. Článek 2 Přihlášení ke studiu

Článek 1 Úvodní ustanovení. Článek 2 Přihlášení ke studiu OPATŘENÍ DĚKANA EF č. 100/2016 k pravidlům pro přijímací řízení a podmínkám pro přijetí ke studiu v doktorském studijním programu v akademickém roce 2016/2017 18. 2. 2016 Článek 1 Úvodní ustanovení 1)

Více

Výnos děkanky FF UHK č. 2/2016

Výnos děkanky FF UHK č. 2/2016 Hradec Králové, 13. ledna 2016 č. j. DFF/43/16 Výnos děkanky FF UHK č. 2/2016 Vyhlášení soutěže o projekty Specifického výzkumu Studentská grantová soutěž na FF UHK Vyhlašuji soutěž o projekty Specifického

Více

Typologická koncepce druhu

Typologická koncepce druhu Speciace Co je to druh? Nebudu zde ani probírat různé definice pojmu druh. Žádná z nich až dosud neuspokojila všechny přírodovědce, ale každý přírodovědec zhruba ví, co míní tím, když mluví o druhu. (Charles

Více

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Genomika (KBB/GENOM) SNPs Odvozování a genotyping Ing. Hana Šimková, CSc. Cíl přednášky - seznámení s problematikou hledání

Více

Projekt FR-TI2/075 MPO příklad spolupráce farmaceutů s komerčním sektorem. Milan Bartoš. Forum veterinarium, Brno 2010

Projekt FR-TI2/075 MPO příklad spolupráce farmaceutů s komerčním sektorem. Milan Bartoš. Forum veterinarium, Brno 2010 Projekt FR-TI2/075 MPO příklad spolupráce farmaceutů s komerčním sektorem Milan Bartoš Forum veterinarium, Brno 2010 Vývoj farmakogenetické diagnostické soupravy pro stanovení genetických polymorfismů

Více

Interakce viru klíšťové encefalitidy s hostitelským organismem a patogeneze infekce

Interakce viru klíšťové encefalitidy s hostitelským organismem a patogeneze infekce Parazitologický ústav, Akademie věd České republiky Laboratoř interakcí vektor-hostitel České Budějovice Interakce viru klíšťové encefalitidy s hostitelským organismem a patogeneze infekce Daniel Růžek,

Více

Sekvenování nové generace. Radka Reifová

Sekvenování nové generace. Radka Reifová Sekvenování nové generace Radka Reifová Prezentace ke stažení www.natur.cuni.cz/zoologie/biodiversity v záložce Přednášky 1. Přehled sekvenačních metod nové generace 2. Využití sekvenačních metod nové

Více

název titul, příjmení, jméno autora

název titul, příjmení, jméno autora School of Doctoral Studies in Biological Sciences [ Uvádějí pouze studenti biologických věd, ne Biofyziky] University of South Bohemia in České Budějovice Faculty of Science název Ph.D. Thesis titul, příjmení,

Více

Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 9. Sekvenování DNA II. nrdna, low-copy markery

Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin. 9. Sekvenování DNA II. nrdna, low-copy markery Využití molekulárních markerů v systematice a populační biologii rostlin 9. Sekvenování DNA II. nrdna, low-copy markery Jaderný genom mnoho genů je v mnoha kopiích (multiple-copy) problém s homologií nevíme,

Více

Zadávací dokumentace žádosti o grant Interní grantové agentury FLD ČZU v Praze

Zadávací dokumentace žádosti o grant Interní grantové agentury FLD ČZU v Praze Zadávací dokumentace žádosti o grant Interní grantové agentury FLD ČZU v Praze VYHLÁŠENÍ II. KOLA SOUTĚŽE KATEGORIE B NA ROK 2016 Termín vyhlášení soutěže: 4. 2. 2016 Termín odevzdání žádosti: 19.2. 2016,

Více

Laboratorní workshop s teoreticko praktickou ukázkou molekulárně biologických technik ve spolupráci s firmou ROCHE

Laboratorní workshop s teoreticko praktickou ukázkou molekulárně biologických technik ve spolupráci s firmou ROCHE BiochemNet vytvoření sítě pro podporu spolupráce biomedicínských pracovišť a zvýšení uplatnitelnosti absolventů biochemických oborů v praxi Laboratorní workshop s teoreticko praktickou ukázkou molekulárně

Více

Životopis. Osobní data jméno: Lukáš Kalous národnost: česká datum narození: místo narození: Praha

Životopis. Osobní data jméno: Lukáš Kalous národnost: česká datum narození: místo narození: Praha Životopis Osobní data jméno: Lukáš Kalous národnost: česká datum narození: 13. 12. 1974 místo narození: Praha Vzdělání / tituly 2011 Česká zemědělská univerzita v Praze, fakulta Agrobiologie, potravinových

Více

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU

DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU Úvod IntellMed, s.r.o., Václavské náměstí 820/41, 110 00 Praha 1 DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU Jednou z nejvhodnějších metod pro detekci minimální

Více