PROTEINOVÁ DENATURUJÍCÍ ELEKTROFORÉZA (SDS PAGE)
|
|
- Tomáš Marek Vopička
- před 7 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 PROTEINOVÁ DENATURUJÍCÍ ELEKTROFORÉZA (SDS PAGE) Denaturující proteinová elektroforéza (SDS PAGE - SDS Protein Acrylamide Gel Electrophoresis) je metoda, která se používá k separaci proteinů podle velikosti, na základě jejich migrace v gelu v elektrickém poli. SDS (sodium dodecylsulfát) je detergent, který se při PAGE přidává k vzorku proteinu, protein denaturuje a uděluje mu negativní náboj. U většiny proteinů dochází k rovnoměrnému přidělení negativního náboje na jednotku hmoty (standardně 1,4 g SDS / 1 g polypeptidu). U hodně hydrofóbních proteinů (např. membránové proteiny) není navázání SDS rovnoměrné a tyto proteiny migrují v gelu neproporcionálně své velikosti. Gel pro proteinovou elektroforézu lze vyrobit v různých koncentracích a o různých velikostech pórů. Velikost pórů určuje poměr složek akrylamidu a bisakrylamindu v gelu. Se vzrůstající koncentrací akrylamidu se póry v gelu zmenšují. V našem případě používáme poměr mezi akrylamidem a bisakrylamidem 1:30. Použité roztoky: 10% amonium persulfát 10% SDS 30% akryl bisakrylamid mix (29:1) TEMED 1,5 M Tris (ph 8,8) 1,5 M Tris (ph 6,8) Running buffer Vzorkový pufr Coomasie Brilliant Blue (CBB) CBB odbarvovací roztok Funkce některých důležitých chemikálií a pufrů: SDS: je silný detergent, který se používá k denaturaci a obalení proteinů negativním nábojem, k čemuž dochází při zahřátí na 100 C. Stíní tím vnitřní náboj polypeptidů, který je tím pádem zanedbatelný. Komplex má pak jednotkový náboj na hmotnostní jednotku. Proteiny migrují k anodě. Running buffer: stabilizuje ph během elektroforézy, protože během elektroforézy dochází k elektrolýze vody. V našem případě používáme Tris pufr. Glycin: slouží jako protiiont, který vyrovnává vnitřní náboj running bufferu, je lehce záporně nabitý a napomáhá zanoření proteinů do horního gelu. Po zanoření do gelu svůj náboj ztrácí a dál pohyb proteinů neovlivňuje.
2 Bisakrylamid: 1 molekula bisakrylamidu na sebe váže 2 molekuly akrylamidu a crosslinkuje je, čímž dochází k tvorbě gelu. Poměr bisakryamidu a akrylamidu určuje porozitu gelu. Ammonium persulfát: je zdrojem volných radikálů nutných pro polymeraci gelu. Vyšší množství volných radikálů má za následek snížení průměrné délky polymerního řetězce a snížení elasticity gelu. Měla by se používat nejnižší možná koncentrace volných radikálů, která ještě vede k polymerizaci. Katalyzátor polymerace gelu. TEMED: stabilizuje volné radikály, čímž zlepšuje polymeraci gelu. Míra polymerace a vlastnosti gelu závisí na koncentraci volných radikálů. Bromfenolová modř: používá se ke zviditelnění vzorku jak při nanášení na gel, tak pro orientaci migrace vzorků gelem. Je negativně nabitá a migruje spolu s proteiny k anodě, má malou molekulovou hmotnost, takže migruje rychleji než nejmenší proteiny (je vepředu jako první). Za neutrálního a alkalického ph je modře zbarvena. Glycerol: používá se k zatížení vzorků, aby klesly na dno jamky. Je nereaktivní, nenabitý a neinterferuje s průběhem elektroforézy. CBB: používá se k barvení proteinů. Kyselina octová v barvícím roztoku má za úkol stabilizovat proteiny v gelu. β-merkaptoetanol: používá se k denaturaci, redukuje disulfidické můstky v proteinech narušuje terciární a kvartérní struktury proteinů. Příprava pufrů Tris 1,5 M, ph 8,8 navážit 18,17 g Tris rozpustit v 80 ml dh2o upravit ph na hodnotu 8,8 doplnit do 100 ml dh2o Tris 1,5 M, ph 6,8 navážit 18,17 g Tris rozpustit v 80 ml dh2o upravit ph na hodnotu 6,8 doplnit do 100 ml dh2o
3 10% SDS rozpustit 10 g sodium dodecylsulfátu v 90 ml dh2o a zahřát max na 68 C, aby se SDS plně rozpustilo upravit ph na 7,2 pomocí HCl doplnit objem do 100 ml pokud SDS precipituje (za nízké teploty), rozpustit krystalky zahřátím na 37 C 10% amonium persulfát (APS) rozpustit 1 g APS v 8 ml dh2o doplnit objem do 10 ml rozplnit po 0,5 ml do eppendorfových zkumavek a zamrazit na -20 C po použití vyhodit, znovu nezamrazovat Vzorkový pufr 2X I 10 ml 1,5M Tris (ph 6,8) 6 ml 20% SDS 30 ml glycerolu 15 ml β-merkaptoetanolu 1,8 g bromfenolové modře doplnit objem do 100 ml dh2o rozplnit do zkumavek a zamrazit na -20 C 10X Running buffer rozpustit v 800 ml dh2o: 10 g SDS 30,3 g Tris 144,1 g glycinu doplnit objem do 1 l dh2o před použitím 10x naředit CBB R ml metanolu 100 ml kyseliny octové 400 ml dh2o rozpustit 2,5 g CBB R-250 ve směsi připravené v předchozím kroku doplnit objem do 1 l dh2o
4 Odbarvovací roztok 450 ml metanolu 100 ml kyseliny octové doplnit do 1 l dh2o Příprava gelu Dolní gel (separační) 12%; 1 gel 1,6 ml dh2o 2 ml 30% akryl bisakrylamidu 1,3 ml Tris, ph 8,8 50 µl 10% SDS 50 µl APS 2 µl TEMEDu Horní gel (zaostřující) 5%; 1 gel 1,4 ml dh2o 330 µl 30% akryl bisakrylamidu 250 µl Tris, ph 8,8 20 µl 10% SDS 20 µl APS 2 µl TEMEDu Dolní i horní gel se míchá čerstvě. Jako poslední se k roztoku přidává APS a TEMED. Roztok se velmi pečlivě zamíchá a pipetou se nalije mezi sestavená skla, cca do 2/3 objemu. Nalitý roztok se převrství butanolem a gel se nechá ztuhnout. Po ztuhnutí se butanol vylije, namíchá se čerstvý horní gel (TEMED a APS jako poslední), pečlivě se promíchá a pipetou se nanese na dolní gel. Mezi skla se vloží hřebínek, který nám v gelu vytvoří jamky pro nanesení vzorku. Horní gel se nechá zatuhnout, hřebínek se vyndá a jamky se mohou propláchnout destilovanou vodou. Takto připravený gel mezi skly se použije k sestavení elektroforézy. Příprava vzorků Příprava buněčných lyzátů buněčnou suspenzi zamrazte na -80 C/min 12h rozmrazte při teplotě 37 C (vodní lázeň, do úplného rozmražení) buněčný lyzát centrifugujte 900xg/30min/20 C ihned po ukončení centrifugace opatrně odeberte supernatant (roztok, obsahuje proteiny)
5 odebraný supernatant skladujte v lednici nebo -20 C do analýzy proveďte analýzu proteinů pomocí SDS-PAGE (kvalitativní - molekulová hmotnost proteinů) a stanovte koncentraci proteinů ve vzorku metodou dle Bradfordové (kvantitativní stanovení celkového množství proteinů). Příprava vzorků pro SDS PAGE Vzorek proteinů (např. buněčný lyzát) smíchám v poměru 1:1 se vzorkovacím pufrem (2X I) a 5 10 minut povařím při 100 C. Vzorek stočím na centrifuze na maximum (cca 5000 otáček) po dobu 1 minuty. Takto připravený vzorek můžu nanést do jamky v gelu. V závislosti na tom, jaký marker molekulových hmotností používám, je možné, že bude potřeba stejným způsobem připravit a zavařit i marker (pozor! ready to use se již nevaří!). Elektroforéza Pomocí dvou skel s gelem sestavím vnitřní vaničku na horní pufr. Místo jednoho skla mohu případně použít plastovou vložku. Vaničku vložím do vany a do obou naliji running buffer. Do horní až úplně po vrch, do dolní tak, aby spodní elektroda byla ponořena v pufru. Postupně nanesu do první jamky marker molekulových hmotností (podle druhu markeru nanáším 3 5 µl) a do každé další jamky vzorek (po dohodě se školitelem). Vanu zakryji víkem, připojím elektrody ke zdroji (pozor na (+) a (-), musí vše lícovat!!!) a ten spustím. Napětí nastavím na 90 V a nechám cca 15 minut běžet (minimálně po dobu, než mi vzorky zajedou do gelu a vytvoří jednu linii). Poté mohu napětí zvednout na 120 V. Elektroforéza běží cca 1 1,5 hodiny, podle použitého napětí. Barvení Po dokončení elektroforézy opatrně od sebe oddělím skla, mezi kterými mám gel. Od gelu odříznu horní zaostřovací gel a odříznu i kousek horního rohu u markeru. Tím si označím orientaci gelu. Gel vložím do misky s CBB a nechám míchat na míchačce přes noc. Druhý den sliji CBB (lze použít opakovaně), gel propláchnu v destilované vodě a dám odbarvovat do odbarvovacího roztoku do té doby, než se gel úplně neodbarví a nezůstanou obarvené pouze proteiny. Odbarvovací roztok lze měnit dle potřeby. Po obarvení gelu lze gel krátkodobě skladovat v destilované vodě a naskenovat, případně vložit do sušícího roztoku na noc a pak vložit mezi celofán, vypnout do rámečku a nechat uschnout. Takto lze gel dlouhodobě skladovat.
SDS-PAGE elektroforéza
SDS-PAGE elektroforéza Příprava gelu... 1 Recept na 0.75 mm gel (1 gel/2 gely)... 2 Recept na 1.5 mm gel (1 gel/2 gely)... 2 Příprava vzorku... 3 Elektroforéza... 3 Barvení gelů Blue Silver... 4 Chemikálie
VíceSDS polyakrylamidová gelová elektroforéza (SDS PAGE)
SDS polyakrylamidová gelová elektroforéza (SDS PAGE) Princip SDS polyakrylamidová gelová elektroforéza slouží k separaci proteinů na základě jejich velikosti (molekulové hmotnosti). Zahřátím vzorku za
VíceObsah Protein Gel Electrophoresis Kitu a jeho skladování
Obsah Protein Gel Electrophoresis Kitu a jeho skladování Protein Gel Electrophoresis Kit obsahuje veškerý potřebný materiál provádění vertikální polyakrilamidové gelové elektroforézy. Experiment provádějí
VícePROTOKOL WESTERN BLOT
WESTERN BLOT 1. PŘÍPRAVA ELEKTROFORETICKÉ APARATURY Saponátem a vodou se důkladně umyjí skla, plastové vložky a hřebínek, poté se důkladně opláchnou deionizovanou/destilovanou vodou a etanolem a nechají
VíceWestern blotting. 10% APS 20,28 µl 40,56 µl 81,12 µl 20,28 µl 40,56 µl 81,12 µl
Western blotting 1. Příprava gelu složení aparatury hustotu gelu volit podle velikosti proteinů příprava rozdělovacího gelu: 10% 12% počet gelů 1 2 4 1 2 4 objem 6 ml 12 ml 24 ml 6 ml 12 ml 24 ml 40% akrylamid
VíceELEKTROFORETICKÉ METODY
ELEKTROFORETICKÉ METODY ELEKTROFORETICKÁ SEPARACE AMINOKYSELIN NA PAPÍROVÉM NOSIČI Aminokyseliny lze rozdělit elektroforézou na papíře. Protože molekulová hmotnost jednotlivých aminokyselin není příliš
VíceInovace bakalářského studijního oboru Aplikovaná chemie CZ.1.07/2.2.00/
Dělení bílkovin pomocí diskontinuální elektroforézy v polyakrylamidovém gelu (PAGE) Při elektroforéze dochází k pohybu (migraci) iontů v elektrickém poli. Elektroforetické metody se tedy používají k separaci
VíceElektroforéza v přítomnosti SDS SDS PAGE
Elektroforéza v přítomnosti SDS SDS PAGE Elektroforéza v přítomnosti SDS SDS PAGE je jednoduchá, rychlá a reprodukovatelná metoda pro kvalifikovanou charakterizaci a srovnání bílkovin.tato metoda separuje
VíceVýzkumný ústav rostlinné výroby Praha Ruzyně. Metodika byla vypracována jako výstup výzkumného záměru MZe č. 0002700602. Autor: Ing.
Výzkumný ústav rostlinné výroby Praha Ruzyně Optimalizovaná metodika SDS-PAGE pro analýzu LMW podjednotek gluteninů pšenice Metodika byla vypracována jako výstup výzkumného záměru MZe č. 0002700602 Autor:
VíceELEKTROFORETICKÁ SEPARACE NUKLEOVÝCH KYSELIN
ELEKTROFORETICKÁ SEPARACE NUKLEOVÝCH KYSELIN Fragmenty nukleových kyselin lze dle jejich velikosti rozdělit elektroforézou. Elektroforéza využívá rozdílné pohyblivosti jednotlivých fragmentů, danou právě
VíceSraz studentů v 8:00 před laboratoří A5/108, s sebou plášť a přezutí PRINCIP. Polyakrylamidová gelová elektroforéza v přítomnosti SDS (SDS-PAGE)
PRINCIP Sraz studentů v 8:00 před laboratoří A5/108, s sebou plášť a přezutí Polyakrylamidová gelová elektroforéza v přítomnosti SDS (SDS-PAGE) SDS-PAGE slouží k separaci proteinů na základě jejich molekulové
VíceElektromigrační metody
Elektromigrační metody Princip: molekuly nesoucí náboj se pohybují ve stejnosměrném elektrickém Arne Tiselius rozdělil proteiny krevního séra na základě jejich rozdílných rychlostí pohybu v elektrickém
VíceVýzkumný ústav rostlinné výroby Praha Ruzyně
Výzkumný ústav rostlinné výroby Praha Ruzyně Optimalizovaná metodika PAGE pro analýzu peroxidáz v hlízách brambor (Solanum tuberosum L.) Vypracovaná jako výstup projektu 1B 44011 VÝVOJ A TESTOVÁNÍ SYSTÉMU
VíceWESTERN BLOT. Velikost signálu je vyhodnocována srovnáním s naneseným proteinovým markerem, což je komerčně dostupná směs proteinů o známé velikosti.
WESTERN BLOT Western blot je metoda používaná pro kvalitativní nebo semikvantitativní detekci určitého proteinu ve vzorku. Metoda je tvořena třemi základními kroky: 1. elektroforetickou separací proteinů,
Vícelaktoferin BSA α S2 -CN α S1 -CN Popis: BSA bovinní sérový albumin, CN kasein, LG- laktoglobulin, LA- laktalbumin
Aktivita KA 2340/4-8up Stanovení bílkovin v mléce pomocí SDS PAGE (elektroforéza na polyakrylamidovém gelu s přídavkem dodecyl sulfátu sodného) vypracovala: MVDr. Michaela Králová, Ph.D. Princip: Metoda
VíceS filtračními papíry a membránou je nutno manipulovat pinzetou s tupým koncem.
Western Blotting Příprava blotovacího sendviče... 1 Blotování... 2 Kontrola přenesení proteinů na membránu... 2 Blokování membrány... 2 Aplikace protilátek... 2 Vizualizace... 3 Vyvolání filmu... 4 Chemikálie
VíceIZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek
IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek Studium aktinu, mikrofilamentární složky cytoskeletu pomocí dvou metod: detekce přímo v buňkách - fluorescenční barvení
VíceGelová elektroforéza - úvod, demonstrační sada pro učitele Kat. číslo
Gelová elektroforéza - úvod, demonstrační sada pro učitele Kat. číslo 108.6411 PŘÍRUČKA PRO UČITELE S NÁVODEM PRO STUDENTY Strana 1 ze 18 Příručka pro učitele Úvod do gelové elektroforézy Shrnutí Cíle
VíceTurnusové praktikum z biochemie
Turnusové praktikum z biochemie FÚ UK Turnusové praktikum z biochemie úloha název strana 1 Identifikace neznámého vzorku, aneb chemik detektivem 3-11 2 Izolace nukleových kyselin 12-13 3 Fluorescenční
VíceMOLEKULÁRNÍ METODY V EKOLOGII MIKROORGANIZMŮ
MOLEKULÁRNÍ METODY V EKOLOGII MIKROORGANIZMŮ (EKO/MMEM) DENATURAČNÍ GRADIENTOVÁ GELOVÁ ELEKTROFORÉZA Denaturační gradientová gelová elektroforéza (DGGE) je technologie umožňující separaci molekul DNA v
VíceNávody pro praktikum Analýza struktury chromatinu Petra Procházková Schrumpfová, Miloslava Fojtová
Návody pro praktikum Analýza struktury chromatinu Petra Procházková Schrumpfová, Miloslava Fojtová 1. Izolace buněčných jader z rostlinných tkání Před začátkem práce je nutno si připravit: Pracovní roztoky
Více1. Příloha 1 Návod úlohy pro Pokročilé praktikum z biochemie I
1. Příloha 1 Návod úlohy pro Pokročilé praktikum z biochemie I Vazba bromfenolové modři na sérový albumin Princip úlohy Albumin má unikátní vlastnost vázat menší molekuly mnoha typů. Díky struktuře, tvořené
VíceVýzkumný ústav rostlinné výroby Praha Ruzyně
Výzkumný ústav rostlinné výroby Praha Ruzyně Optimalizovaná metodika PAGE pro analýzu esteráz v hlízách brambor (Solanum tuberosum L.) Vypracovaná jako výstup projektu 1B 44011 VÝVOJ A TESTOVÁNÍ SYSTÉMU
VíceProteinový fingerprinting vaječného bílku
Proteinový fingerprinting vaječného bílku Proteinový fingerprinting je technika studia populací organizmů založená na izoelektrické fokuzaci (IEF). IEF spočívá v elektroforetickém dělení proteinů podle
VíceEvropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY ELEKTROFORÉZA K čemu to je? kritérium čistoty preparátu stanovení molekulové hmotnosti makromolekul stanovení izoelektrického
VíceObr. 1. Schematické znázornění 2D-PAGE (převzato z Lodish, H. a kol.: Molecular Cell Biology, 3. vyd., Freeman 1996)
Dvourozměrná elektroforéza (2D-PAGE) 2D-PAGE je vysoce efektivní separační metodou umožňující rozdělení komplikovaných směsí stovek různých bílkovin a představuje základní nástroj v novém rozvíjejícím
VíceSeminář izolačních technologií
Seminář izolačních technologií Zpracoval: Karel Bílek a Kateřina Svobodová Podpořeno FRVŠ 2385/2007 a 1305/2009 Úpravy a aktualizace: Pavla Chalupová ÚMFGZ MZLU v Brně 1 Lokalizace jaderné DNA 2 http://www.paternityexperts.com/basicgenetics.html
VícePolymorfismus délky restrikčních fragmentů (RFLP)
ÚSTAV LÉKAŘSKÉ BIOCHEMIE A LABORATORNÍ DIAGNOSTIKY 1. LF UK Polymorfismus délky restrikčních fragmentů (RFLP) Praktické cvičení z lékařské biochemie Všeobecné lékařství Martin Vejražka 2017/18 Obsah POLYMORFISMUS
VíceProjekt Pospolu. Stanovení jílovitých podílů podle ČSN EN A1 Zkouška s methylenovou modří
Projekt Pospolu Stanovení jílovitých podílů podle ČSN EN 933-9+A1 Zkouška s methylenovou modří Autorem materiálu a všech jeho částí, není-li uvedeno jinak, je Tomáš Táborský. Jako jedna z hlavních složek
VíceIdentifikace mikroorganismů pomocí sekvence jejich genu pro 16S rrna
Praktická úloha Identifikace mikroorganismů pomocí sekvence jejich genu pro 16S rrna Pro spolehlivou identifikaci mikroorganismů pomocí genetických metod se velmi často využívá stanovení nukleotidové sekvence
VíceAplikace elektromigračních technik Laboratorní úlohy
Laboratorní úlohy Výukový materiál vznikl za finanční podpory Fondu rozvoje vysokých škol v rámci řešení projektu č. 1377/2013 Vytvoření demonstračních úloh sloužících k inovaci předmětu Aplikace elektromigračních
VíceTkáňový homogenizátor MagNA Lyser od společnosti Roche
Izolace RNA Pracovní postup Homogenizace: Pozn. Postup homogenizace platí pouze pro izolaci RNA z nativní tkáně, v případě izolace z buněčné suspenze je tento krok vynechán a začíná se přídavkem homogenizačního
VíceTECHNICKÁ SPECIFIKACE Vybavení genetické laboratoře pro projekt EXTEMIT-K část B
TECHNICKÁ SPECIFIKACE Vybavení genetické laboratoře pro projekt EXTEMIT-K část B OBSAH Sestava pro vertikální elektroforézu... 2 Jednotka pro elektroforézu... 3 Termocykler... 4 Elektrický zdroj pro elektroforézu...
Více1. Metodika. Protokol č. F1-4 Metodika: Srovnávací analýza efektivity přípravy rekombinantního proteinu ve fermentoru
Protokol č.: F1-4 Datum: 20.12.2010 Metodika: analýza efektivity přípravy výběr z výsledků ze zkušebních provozů výroby antigenů. Vypracoval: Ing. Václav Filištein, Mgr. Tereza Chrudimská, Spolupracující
VíceHmotnostní detekce biologicky významných sloučenin pro biotechnologie část 3 - Provedení štěpení proteinů a následné analýzy,
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií Hmotnostní detekce biologicky významných sloučenin pro biotechnologie část 3 - Provedení štěpení proteinů a následné analýzy, vyhodnocení výsledků, diskuse Anotace
Vícebakteriemi Magnetospirillum gryphiswaldense
Příprava, charakterizace a porovnání nanočástic připravených tepelným rozkladem v pevné fázi a nanočástic vzniklých biomineralizací (bakteriální magnetické nanočástice) Obecný úvod Nanočástice oxidů železa
Více2) Připravte si 7 sad po pěti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.
CVIČENÍ Z ENZYMOLOGIE 1) Stanovení Michaelisovy konstanty trypsinu pomocí chromogenního substrátu. Aktivita trypsinu se určí změřením rychlosti hydrolýzy chromogenního substrátu BAPNA (Nα-benzoyl-L-arginin-p-nitroanilid)
VíceÚSTAV LÉKAŘSKÉ BIOCHEMIE A LABORATORNÍ DIAGNOSTIKY 1. LF UK. Bílkoviny. Praktické cvičení z lékařské biochemie Všeobecné lékařství
ÚSTAV LÉKAŘSKÉ BIOCHEMIE A LABORATORNÍ DIAGNOSTIKY 1. LF UK Bílkoviny Praktické cvičení z lékařské biochemie Všeobecné lékařství Martin Vejražka, Jan Pláteník, Lenka Fialová 2018/19 Obsah ÚLOHA 1 NATIVNÍ
VíceIMUNOANALÝZA elektroforetické separační metody. 3. ročník Klinická biologie a chemie
IMUNOANALÝZA elektroforetické separační metody 3. ročník Klinická biologie a chemie Princip elektroforézy I. Separační metoda využívající různé pohyblivosti různých iontů (složek směsi) ve stejnosměrném
VíceCHARAKTERIZACE GENOTYPŮ OVSA S VYUŽITÍM ELEKTROFORÉZY AVENINŮ V POLYAKRYLAMIDOVÉM GELU (A-PAGE)
Zemědělský výzkumný ústav Kroměříž, s.r.o. Agrotest fyto, s.r.o. CHARAKTERIZACE GENOTYPŮ OVSA S VYUŽITÍM ELEKTROFORÉZY AVENINŮ V POLYAKRYLAMIDOVÉM GELU (A-PAGE) Metodika Kroměříž, 2010 I. Polišenská, L.
VícePraktické cvičení: Izolace a purifikace rekombinantního proteinu
Praktické cvičení: Izolace a purifikace rekombinantního proteinu Toto blokové praktické cvičení spočívá v teoretickém i praktickém seznámení s rekombinantními proteiny, jejich izolací, purifikací a využitím.
VíceProtokoly Transformace plasmidu do elektrokompetentních buněk BL21 Pracovní postup:
Protokoly Pracovní potřeby, pufry a chemikálie jsou uvedeny na konci protokolu. Pracovní postupy jsou odvozeny od těchto kitů: Champion pet160 Directional TOPO Expression Kit with Lumio Technology (Invitrogen)
VíceTéma: Testy životaschopnosti a Počítání buněk
LRR/BUBV vičení z buněčné biologie Úloha č. 3 Téma: Testy životaschopnosti a Počítání Úvod: Při práci s buňkami je jedním ze základních sledovaných parametrů stanovení jejich životaschopnosti (viability).
VíceIzolace nukleových kyselin
Izolace nukleových kyselin Požadavky na izolaci nukleových kyselin V nativním stavu z přirozeného materiálu v dostatečném množství požadované čistotě. Nukleové kyseliny je třeba zbavit všech látek, které
VíceIzolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie
Izolace genomové DNA ze savčích buněk, stanovení koncentrace DNA pomocí absorpční spektrofotometrie IZOLACE GENOMOVÉ DNA Deoxyribonukleová kyselina (DNA) představuje základní genetický materiál většiny
VíceVýzkumný ústav rostlinné výroby Praha Ruzyně
Výzkumný ústav rostlinné výroby Praha Ruzyně Optimalizace metod elektroforézy proteinů pro identifikaci odrůd ječmene (Hordeum vulgare L.) Metodika vypracována jako výstup projektu NAZV QF 3050: Vývoj
VíceReakce kyselin a zásad
seminář 6. 1. 2011 Chemie Reakce kyselin a zásad Známe několik teorií, které charakterizují definují kyseliny a zásady. Nejstarší je Arrheniova teorie, která je platná pro vodné prostředí, podle které
VíceIzolace RNA. doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD..
Izolace RNA doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD.. Metodiky izolace RNA celková buněčná RNA ( total RNA) zahrnuje řadu typů RNA, které se mohou lišit svými fyzikálněchemickými vlastnostmi a tedy i nároky na jejich
VíceInovace výuky chemie. ph a neutralizace. Ch 8/09
Inovace výuky chemie ph a neutralizace Ch 8/09 Vzdělávací oblast: Vzdělávací obor: Tematický okruh: Cílová skupina: Klíčová slova: Očekávaný výstup: Člověk a příroda Chemie Anorganické sloučeniny 8. ročník
Více2) Připravte si 3 sady po šesti zkumavkách. Do všech zkumavek pipetujte 0.2 ml roztoku BAPNA o různé koncentraci podle tabulky.
CVIČENÍ Z ENZYMOLOGIE 1) Stanovení Michaelisovy konstanty trypsinu pomocí chromogenního substrátu. Aktivita trypsinu se určí změřením rychlosti hydrolýzy chromogenního substrátu BAPNA (Nα-benzoyl-L-arginin-p-nitroanilid)
VíceMetody detekce apoptózy indukované cytotoxickými látkami u nádorových buněk
Metody detekce apoptózy indukované cytotoxickými látkami u nádorových buněk 1. Detekce hladiny p-p53 (S15) pomocí elektroforézy a westernového přenosu 2. Měření hladiny superoxidových aniontů sondou DHE
VíceColumn DNA Lego Kit UNIVERZÁLNÍ SOUPRAVY PRO RYCHLOU IZOLACI ČISTÉ DNA (Katalogové číslo D201 + D202)
Column DNA Lego Kit UNIVERZÁLNÍ SOUPRAVY PRO RYCHLOU IZOLACI ČISTÉ DNA (Katalogové číslo D201 + D202) Popis Column DNA Lego Kit je základ moderní stavebnicové (Lego) soupravy pro izolaci čisté DNA různého
VíceIzolace proteinů ze savčích buněk
Izolace proteinů ze savčích buněk Velmi často je nezbytné v laboratorní praxi izolovat určitý protein z biologického materiálu. Cílem je především získat čistý, aktivní produkt v co nejvyšším možném množství.
VíceElektroforéza. Rozdělení proteinů na základě pohyblivosti v el. poli
Elektroforéza Rozdělení proteinů na základě pohyblivosti v el. poli K realizaci je nutné mít: Stejnosměrný el. proud Speciální elektroforetické vany Vhodný pufr a nosič (dříve papír, acetátcelulóza, agar)
VíceVybraná vyšetření u pacientů s diabetes mellitus
ÚSTAV LÉKAŘSKÉ BIOCHEMIE A LABORATORNÍ DIAGNOSTIKY 1. LF UK Vybraná vyšetření u pacientů s diabetes mellitus Praktické cvičení z lékařské biochemie Všeobecné lékařství Martin Vejražka 2018/19 Obsah 1.
VíceInkubace enzymů se substráty
Inkubace enzymů se substráty Inkubace redukčních enzymů... 1 Inkubace oxidačních enzymů... 2 Extrakce látek z inkubační směsi... 2 Příprava vzorků k HPLC/UHPLC detekci... 3 Chemikálie a roztoky... 4 Substráty...
VíceLRR/BUBCV CVIČENÍ Z BUNĚČNÉ BIOLOGIE 3. TESTY ŽIVOTASCHOPNOSTI A POČÍTÁNÍ BUNĚK
LRR/BUBCV CVIČEÍ Z BUĚČÉ BILGIE 3. TESTY ŽIVTASCHPSTI A PČÍTÁÍ BUĚK TERETICKÝ ÚVD: Při práci s buňkami je jedním ze základních sledovaných parametrů stanovení jejich životaschopnosti (viability). Tímto
VíceHYDROXYDERIVÁTY - ALKOHOLY
LABORATORNÍ PRÁCE Č. 26 HYDROXYDERIVÁTY - ALKOHOLY PRINCIP Hydroxyderiváty jsou kyslíkaté deriváty uhlovodíků, které vznikají náhradou jednoho nebo více atomů vodíku v molekule uhlovodíku hydroxylovou
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU PROBIOTICKÝCH BAKTERIÍ RODU ENTEROCOCCUS
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU PROBIOTICKÝCH BAKTERIÍ RODU ENTEROCOCCUS 1 Rozsah a účel Postup slouží ke stanovení počtu probiotických bakterií v doplňkových látkách, premixech
VíceCOMET ASSAY (SINGLE CELL GEL ELECTROPHORESIS)
COMET ASSAY (SINGLE CELL GEL ELECTROPHORESIS) OBSAH 1. Princip metody 2. Přístroje a zařízení 3. Příprava vzorků 3.1 Kultivace a sklízení buněk A549 3.2 Výpočet koncentrace buněk 3.3 Hodnocení viability
VíceVýzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i., Praha 6 - Ruzyně, 2011 ISBN 978-80-7427-056-7
Metodika vznikla za finanční podpory MZe ČR a je výstupem řešení projektu NAZV QH92155 Využití biodiverzity zásobních proteinů pšenice s důrazem na nízkomolekulární gluteniny ve vztahu ke kvalitě produkce.
VíceJednotné pracovní postupy testování odrůd STANOVENÍ OBSAHU TANINŮ V ČIROKU SPEKTROFOTOMETRICKY
5321.1 Stanovení obsahu taninů v čiroku Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU TANINŮ V ČIROKU SPEKTROFOTOMETRICKY 1 Účel a rozsah Postup je určen pro stanovení obsahu taninů v zrnech čiroku. 2 Princip Taniny se ze
VíceCRP. Axis - Shield. SINGLE TESTS CRP kvantitativní stanovení pomocí přístroje NycoCard Reader II
Lékařská technika a speciální zdravotní materiál Společnost je zapsána v obchodním rejstříku Městského soudu v Praze, odd. C vložka 1299 Obchodní 110, 251 70 Praha Čestlice Tel. +420 296 328 300 Fax. +420
VíceANALYTICKÝ SYSTÉM PHOTOCHEM
ANALYTICKÝ SYSTÉM PHOTOCHEM Analytický systém Photochem (firmy Analytik Jena, Německo) je vhodný pro stanovení celkové antioxidační kapacity (tj. celkové schopnosti vzorku vychytávat volné radikály) různých
VíceSure-MeDIP I. with magnetic beads and MNase. www.krd.cz
Sure-MeDIP I with magnetic beads and MNase www.krd.cz 1 Obsah soupravy a skladování MeDIP souprava obsahuje reagencie na provedení 25 reakcí. Souprava je rozdělen do dvou částí, jedna je distribuována
VíceAnalýza protein SDS PAGE elektroforézou
Analýza protein SDS PAGE elektroforézou Molekulárn biologická diagnostika Diagnostika na úrovni DNA, RNA a protein Analýza genomu, transkriptomu, proteomu, p íp. metabolomu Analýza kvalitativní i kvantitativní
VíceElektroforéza - I (v klasickém provedení)
Elektroforéza - I (v klasickém provedení) Příprava předmětu byla podpořena projektem OPPA č. CZ.2.17/3.1.00/33253 Elektroforéza B.D.Hames, D.Rickwood - Gel electrophoresis of proteins, Practical approach,
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv
Národní referenční laboratoř Strana KVANTITATIVNÍ STANOVENÍ GENETICKÝCH MODIFIKACÍ METODOU qpcr POMOCÍ ROTOR-GENE PROBE PCR KITU Účel a rozsah Postup slouží ke kvantitativnímu stanovení genetických modifikací
VíceElektroforéza. Rozdělení proteinů na základě pohyblivosti v el. poli
Elektroforéza Rozdělení proteinů na základě pohyblivosti v el. poli K realizaci je nutné mít: Stejnosměrný el. proud Speciální elektroforetické vany Vhodný pufr a nosič (dříve papír, acetátcelulóza, agar)
VíceStanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů
Stanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů Bioanalytické metody Prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Úvod Kritéria výběru metod stanovení koncentrace proteinů jsou založena na možnostech pro vlastní analýzu,
Více1. Proteiny. relativní. proteinu. Tento. České republiky.
Určení koncentrace celkových proteinů v krevním séru za využití různých metod Teoretická část: krátký úvod k metodám pro stanovení, analýzu a separaci proteinů. Praktická část: testt tří různých technik
VícePrvní testový úkol aminokyseliny a jejich vlastnosti
První testový úkol aminokyseliny a jejich vlastnosti Vysvětlete co znamená pojem α-aminokyselina Jaký je rozdíl mezi D a L řadou aminokyselin Kolik je základních stavebních aminokyselin a z čeho jsou odvozeny
VíceSada Látky kolem nás Kat. číslo 104.0020
Sada Kat. číslo 104.0020 Strana 1 z 68 Strana 2 z 68 Sada pomůcek Obsah Pokyny k uspořádání pokusu... 4 Plán uspořádání... 5 Přehled jednotlivých součástí... 6, 7 Přehled drobných součástí... 8, 9 Popisy
Více(Triticum aestivum L.)
Výzkumný ústav rostlinné výroby Praha Ruzyně Optimalizace metod elektroforézy proteinů pro identifikaci odrůd pšenice (Triticum aestivum L.) Metodika vypracována jako výstup projektu NAZV QF 3050: Vývoj
VíceProtokol 04. pšeničná bílkovina. masné výrobky. zkrácená verze
1 Popis vzorku Podle protokolu č. 04 lze vyšetřit vzorky různých druhů masných výrobků na přítomnost pšeničné bílkoviny. 2 Detekční limit vyšetření Přítomnost pšeničné bílkoviny lze spolehlivě prokázat,
VíceIZOLACE DNA (KIT DNeasy Plant Mini)
17.1 Izolace DNA (kit DNeasy Plant Mini) Strana 1 IZOLACE DNA (KIT DNeasy Plant Mini) 1 Účel a rozsah Postup slouží k získání deoxyribonukleové kyseliny (DNA) ze vzorku pomocí komerčního kitu DNeasy Plant
VíceKomplement fixační antigen Influenza A (KF Ag Influenza A)
Komplement fixační antigen Influenza A (KF Ag Influenza A) OD - 109 Návod k použití soupravy VÝROBCE : VIDIA spol. s r.o., Nad Safinou II/365, Vestec, 252 42 Jesenice u Prahy, tel.: 261090565 www.vidia.cz
VíceSešit pro laboratorní práci z chemie
Sešit pro laboratorní práci z chemie téma: Standardizace. Alkalimetrie. autor: ing. Alena Dvořáková vytvořeno při realizaci projektu: Inovace školního vzdělávacího programu biologie a chemie registrační
VíceStanovení celkové kyselosti nápojů potenciometrickou titrací
Stanovení celkové kyselosti nápojů potenciometrickou titrací Princip metody U acidobazických titrací se využívají dva druhy indikace bodu ekvivalence - vizuální a instrumentální. K vizuální indikaci bodu
Více53. ročník 2016/2017
Ústřední komise Chemické olympiády 53. ročník 2016/2017 OKRESNÍ KOLO kategorie D ŘEŠENÍ PRAKTICKÉ ČÁSTI časová náročnost: 90 minut Úloha 1 Yamadův univerzální indikátor 30 bodů Úkoly: 1. Doplněná Tabulka
VíceVzdělávání středoškolských pedagogů a studentů středních škol jako nástroj ke zvyšování kvality výuky přírodovědných předmětů CZ.1.07/1.1.00/14.
Praktické cvičení z chemie 1) Stanovení lipofilních listových barviv pomocí adsorpční chromatografie. 2) Stanovení proteinů v roztoku. 3) Homogenizace rostlinného materiálu pomocí tekutého dusíku a stanovení
VíceCLP ANALYSIS OF MOLECULAR MARKERS GEL ELECTROPHORESIS OF ISOZYMES AND PROTEINS CZECH VERSION
CLP ANALYSIS OF MOLECULAR MARKERS GEL ELECTROPHORESIS OF ISOZYMES AND PROTEINS CZECH VERSION ANALÝZA BIOCHEMICKÝCH MARKERŮ GELOVÁ ELEKTROFORÉZA ISOENZYMŮ A PROTEINŮ *** Extrakce proteinů pro SDS elektroforézu:,
VícePodklady pro cvičení: USEŇ A PERGAMEN. Určení živočišného původu kolagenového materiálu. Úkol č. 1
Podklady pro cvičení: USEŇ A PERGAMEN Úkol č. 1 Určení živočišného původu kolagenového materiálu Během technologického zpracování surové kůže na useň nebo pergamen jsou odstraňovány podkožní vrstvy kůže
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU SEMDURAMICINU METODOU HPLC
Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU SEMDURAMICINU METODOU HPLC 1 Rozsah a účel Postup specifikuje podmínky pro stanovení obsahu semduramicinu v krmivech metodou vysokoúčinné kapalinové chromatografie (HPLC) v koncentračním
VíceLaboratorní cvičení z kinetiky chemických reakcí
Laboratorní cvičení z kinetiky chemických reakcí LABORATORNÍ CVIČENÍ 1. Téma: Ovlivňování průběhu reakce změnou koncentrace látek. podmínek průběhu reakce. Jednou z nich je změna koncentrace výchozích
VíceSLEDOVÁNÍ VZTAHU MEZI OBSAHEM ENZYMU RUBISCO A KONCENTRACÍ CO 2 V CHLOROPLASTU
SLEDOVÁNÍ VZTAHU MEZI OBSAHEM ENZYMU RUBISCO A KONCENTRACÍ CO 2 V CHLOROPLASTU Nikola Burianová Experimentální biologie 2.ročník navazujícího studia Katedra Fyziky Ostravská univerzita v Ostravě OBSAH
VícePříprava půd pro diskovou difuzní metodu EUCAST a pro vyšetření hodnot MIC bujonovou mikrodiluční metodou. Změny proti předchozí verzi (v. 4.
Version 5.0 January 2017 Příprava půd pro diskovou difuzní metodu EUCAST a pro vyšetření hodnot MIC bujonovou mikrodiluční metodou. Změny proti předchozí verzi (v. 4.0) A. Půdy pro diskovou difuzní metodu
VíceMetody používané v MB. analýza proteinů, nukleových kyselin
Metody používané v MB analýza proteinů, nukleových kyselin Nukleové kyseliny analýza a manipulace Elektroforéza (délka fragmentů, čistota, kvantifikace) Restrikční štěpení (manipulace s DNA, identifikace
VíceMUKOADHEZIVNÍ ORÁLNÍ FILMY
Návod na cvičení pro skupinu č. 1 MUKOADHEZIVNÍ ORÁLNÍ FILMY Cílem praktické části cvičení je příprava a hodnocení dvou druhů MOF: MOF-A: 4 % sodná sůl karboxymethylcelulosy (NaCMC), 3 % glycerol, ad 100
VíceElektroforesa proteinů séra Vlastnosti proteinů
Elektroforesa proteinů séra Vlastnosti proteinů Praktikum z Lékařské Chemie a Biochemie Všeobecné lékařství Jan Pláteník 2010/2011 1 1 Elektroforesa proteinů séra v 0,5% agarose Nativní elektroforesa sérových
VíceRNA Blue REAGENS PRO RYCHLOU PŘÍPRAVU ČISTÉ A NEDEGRADOVANÉ RNA (katalogové číslo R011, R012, R013)
RNA Blue REAGENS PRO RYCHLOU PŘÍPRAVU ČISTÉ A NEDEGRADOVANÉ RNA (katalogové číslo R011, R012, R013) Upozornění: RNA Blue obsahuje fenol a další toxické komponenty. Při kontaktu s kůží je nutné omytí velkým
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU HPLC - OCHRATOXIN A
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU MYKOTOXINŮ METODOU HPLC - OCHRATOXIN A 1 Rozsah a účel Metoda specifikuje podmínky pro stanovení ochratoxinu A v krmivech. 1 Ochratoxin A patří mezi
VíceExprese a purifikace rekombinantních proteinů
Jméno a učo: Datum: Exprese a purifikace rekombinantních proteinů Teoretická část Pomocí různých expresních systémů je možné vytvořit rekombinantní protein odvozený od konkrétního genu, nebo části genu.
VíceAPLIKOVANÉ ELEKTROMIGRAČNÍ METODY
APLIKOVANÉ ELEKTROMIGRAČNÍ METODY Princip: migrace elektricky nabitých částic v elektrickém poli Druhy iontů: +, -, obojaký (zwitterion), vícenásobný Typy migrace: a) přímá migrují ionty analytů b) nepřímá
VíceI N V E S T I C E D O R O Z V O J E V Z D Ě L Á V Á N Í
I V E S T I E D Z V J E V Z D Ě L Á V Á Í AMIKYSELIY PEPTIDY AMIKYSELIY = substituční/funkční deriváty karboxylových kyselin = základní jednotky proteinů (α-aminokyseliny) becný vzorec 2-aminokyselin (α-aminokyselin):
VíceStanovení cholesterolu ve vaječném žloutku a mléce kapilární elektroforézou
Stanovení cholesterolu ve vaječném žloutku a mléce kapilární elektroforézou Úkol Stanovte obsah cholesterolu ve vaječném žloutku a mléce pomocí kapilární elektroforézy. Teoretická část Cholesterol je steroidní
VíceVšeobecné lékařství 2014/15
ÚSTAV LÉKAŘSKÉ BIOCHEMIE A LABORATORNÍ DIAGNOSTIKY 1. LF UK Úvod do práce v laboratoři Měření objemů, filtrace, centrifugace, rozpustnost, dělení směsí Praktické cvičení z lékařské biochemie Všeobecné
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ AKTIVITY FYTÁZY
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ AKTIVITY FYTÁZY 1 Rozsah a účel Postup specifikuje stanovení fytázové aktivity ve vzorcích krmiva. Tímto postupem se nestanoví rozdíl mezi fytázou přidanou
VíceÚloha č. 1 Odměřování objemů, ředění roztoků Strana 1. Úkol 1. Ředění roztoků. Teoretický úvod - viz návod
Úloha č. 1 Odměřování objemů, ředění roztoků Strana 1 Teoretický úvod Uveďte vzorec pro: výpočet směrodatné odchylky výpočet relativní chyby měření [%] Použitý materiál, pomůcky a přístroje Úkol 1. Ředění
Více