Aplikace hmotnostní spektrometrie. Hmotnostní spektrometr měří pouze hmotnost, na nás je jak toho využijeme.
|
|
- Jindřiška Brožová
- před 7 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 Aplikace hmotnostní spektrometrie Hmotnostní spektrometr měří pouze hmotnost, na nás je jak toho využijeme.
2 Peptide mass fingerprinting Rozštěpení neznámého proteinu specificky štěpící proteasou. Stanovení hmotností vzniklých peptidů pomocí MALDI-TOF MS. Porovnání naměřených hmotností s vypočtenými. Všechny sekvence v dostupné proteinové databázi jsou virtuálně naštěpeny za stejných podmínek jako stanovovaný vzorek a data porovnány.
3 Peptide mass fingerprinting
4 Peptide mass fingerprinting
5 Peptide mass fingerprinting
6 Často používané enzymy
7 Co ovlivňuje identifikaci Velikost peptidů příliš velké nebo malé. Nespecifické štěpení proteinů (aktivní proteasy). Modifikace proteinu oxidace M, acetylace N-konce, nečekané modifikace. Vlastní měření kalibrace. Bioinformatika databáze, taxonomie. Kontaminace keratiny, BSA, Vzájemné potlačení signálů peptidů. Vzorek obsahuje směs proteinů.
8 Peptidové mikrosekvenování Důvěryhodnější než PMF. Vhodné i pro velmi komplexní směsi proteinů (až celobuněčné lyzáty). Většinou spojeno s kapalinovou chromatografií (i vícedimenzionální). Lokalizace modifikací (posttranslačních, chemických).
9 Peptidové mikrosekvenování
10
11
12 Snadná automatizace. Výhody a nevýhody Identifikace proteinů ze složitých směsí, lokalizace PTM. Identifikace homologních proteinů z jiných organismů. Možná identifikace peptidů nesoucích nepředpokládané modifikace, SNPs, štěpených nespecifickými proteasami. K identifikaci lze použít nukleotidové databáze. Ke spolehlivé identifikaci stačí jen dva peptidy (popř. 1 one hit wonders). Ve srovnání s PMF nutná dražší instrumentace, delší doba experimentu (chromatografická separace). Identifikují se peptidy!!! Určení přítomných proteinů může být obtížné.
13 Od peptidů k proteinům Vytvořit minimální seznam proteinů, které by vysvětlily přítomnost identifikovaných peptidů. Protein A Protein B Protein C Peptide 1 Peptide 2 Peptide 3 Peptide 1 Peptide 3 Peptide 2
14 Od peptidů k proteinům Nesvizhskii, A. I. and Aebersold, R. (2005). Interpretation of shotgun proteomic data - The protein inference problem. Mol. & Cellular Proteomics, 4,
15 Bottom-up vs. Top-down Bottom-up protein je nejprve rozštěpen na peptidy, peptidy fragmentovány (MS/MS), identifikace peptidů z MS/MS spekter, nalezení proteinů. Top-down protein je rovnou fragmentován v hmotnostním spektrometru, identifikace proteinu z MS/MS spektra.
16 Proteomika Termín zaveden v 1994 pro označení veškerého proteinového komplementu kódovaného genomem. Problém lidských genů kóduje přinejmenším proteinů. Výzkum zahrnuje: identifikaci veškerých proteinů produkovaných buňkou, definici vzájemných interakcí těchto proteinů nezbytných pro určitou biologickou funkci a stanovení přesné trojrozměrné struktury proteinů klíčové pro identifikaci nízkomolekulárních ligandů. Základní nástroje - 2D elektroforéza, 2D kapalinová chromatografie, hmotnostní spektrometrie. High throughput analýzy (robotizace), diferenční analýzy - normální vs patogenní stav, kvantifikace.
17 Biomarker Látka sloužící jako indikátor biologického stavu. Po pečlivé validaci slouží jako indikátor normálního nebo patogenního stavu či odezvy na léčebný zásah. V literatuře navrhováno mnoho potenciálních biomarkerů, ale velice málo z nich je užíváno v klinické praxi. Příklad - odlišná glykosylace, odlišná exprese isoforem proteinů za patologických podmínek. Problém často stejné proteiny uváděné jako biomarkery velmi odlišných chorob.
18 2D elektroforéza
19 Proč 2D elektroforéza Vyzrálá technika, známy výhody i limity. Snadné spojení s imunoblottingem, hmotnostní spektrometrií, vysoké rozlišení. Separace na úrovní proteinů identifikace isoforem, PTM. Kvantifikace ještě před MS drastické snížení počtu spotů pro identifikaci. Precipitace během isoelektrické fokusace, zvláště membránové proteiny. Více proteinů v jednom spotu který protein je regulován?!? Nízká reprodukovatelnost 2D gelů. Omezená hloubka pokrytí proteomu detekovány pouze nejabundantnější proteiny, nutná frakcionace, odstranění proteinů (rubisco, sérum HSA, komplement, imunoglobuliny).
20 Barvení 2D gelů Citlivost, linearita, kompatibilita s hmotnostní spektrometrií. Koloidní Coomassie Brilliant Blue střední citlivost, velmi dobrá linearita, excelentní kompatibilita s MS. Stříbro citlivější než CBB, omezená linearita, reprodukovatelnost barvení, kompatibilita s MS občas problematická. Fluorescenční barviva dobrá citlivost, linearita a kompatibilita s MS (ale jsou výjimky!!!). Klíčová analýza obrazu výsledky odlišné i mezi různými verzemi stejného programu.
21 Difference gel electrophoresis (DIGE)
22 Difference gel electrophoresis (DIGE) Označení vzorků (max. 2) a směsného standardu před vlastní 2D elektroforézou. Po elektroforéze se laserovým skenerem získají obrazy, kde se kvantitativně vyhodnotí změny intenzit skvrn vzorků a standardu. Mnohem reprodukovatelnější než klasická denzitometrické kvantifikace spotů. Značná úspora času a materiálu menší počet elektroforéz při stejném počtu vzorků. Vysoký dynamický rozsah kvantifikace čtyři řády (100x více než stříbro, také vyšší citlivost). Nevýhody značky extrémně drahé a mají omezenou životnost, nutnost pořízení fluorescenčního skeneru.
23 DIGE praktický příklad Šest odrůd pšenice, odběr vzorků ve čtyřech časových bodech, tři biologická opakování. 6 x 3 x 4 = 72 vzorků DIGE 36 elektroforéz Klasické 2D elfo min. 216 elektroforéz (72 x 3 technická opakování)
24 2D a více kapalinová chromatografie Cílem snížit komplexitu vzorku před MS analýzou. Kombinace chromatografických metod pracujících na různém principu (orthogonalita). Nejčastější uspořádání: SCX-RP LC, dále SAX-RP nebo RP vysoké ph RP nízké ph, GPC (proteiny) rozštěpení na peptidy, dále SCX-RP LC. Kombinace s elektroforetickými technikami: IEF (peptidy)-rp LC, GeLC 1D SDS-PAGE (proteiny) RP. Kapilární a nano kolony, nízké průtoky, UHPLC.
25 Kvantifikace pomocí MS MS není v zásadě kvantitativní technika - různé peptidy se neionizují stejně, vzájemné potlačování ionizace ve směsi Absolutní kvantifikace isotopově značený standard, Hi3. Relativní kvantifikace - sledování změny koncentrace proteinů mezi různými vzorky/fyziologickými stavy. Label free metody. Metody se značkou - SILAC, itraq, TMT, ICAT, 18 O.
26 Isotope coded affinity tag (ICAT) Kovalentně se váže na cystein, obsahuje i biotin pro afinitní purifikaci. Lehká a těžká forma (značená uhlíkem 13 C) se liší o 9 Da. Kvantifikace dosaženo porovnáním intenzit píků lehké a těžké formy.
27 Isotope coded affinity tag (ICAT) Kvantifikace pouze peptidů obsahujících cystein zjednodušení MS spekter, ale problémem membránové proteiny.
28 Isobaric tag for relative and absolute quantification (itraq) Metoda založena na kovalentní modifikaci postranního řetězce lysinu nebo N-konce peptidu. Možnost porovnat až 8 fyziologických stavů během jednoho experimentu. Značky mají stejnou hmotnost (isobarické) - nerozlišitelné při MS. Během MSMS analýzy dochází k odštěpení reportérového fragmentu ( Da, mimo 120). Kvantifikace dosaženo porovnáním intenzit reportérových fragmentů.
29 itraq značka
30 Schéma itraq experimentu
31
32 Stable isotope labelling with amino acids in cell culture (SILAC) Použitelné pro buňky rostoucí na živném médiu. Jedna část buněk roste na normálním médiu, druhá část na médiu obsahujícím AK značenou 13 C (často arginin, lysin). Obě části smíchány, rozštěpeny trypsinem, rozděleny 2D-LC a analyzovány MS(MS). Kvantifikace z intensit párů lehký těžký.
33 Absolute quantification of abundance (AQUA) Absolutní kvantifikační metoda. Kvantifikace signálu peptidu se signálem identického, izotopově značeného peptidu. Kvantifikace jednoho nebo několika vybraných peptidů (proteinů) targeted quantification. Kritická je volba peptidu a optimalizace chromatografie.
34 Bez použití značky. Label free kvantifikace Vzorek je naštěpen trypsinem, směs peptidů rozdělena 2D-LC nebo kombinací IEF a 1D-LC a změřena MSMS spektra. Kvantifikace intensita píků nebo spectral counting, Hi3. Intensita píků porovnání intensit píků příslušných peptidů mezi vzorky (EIC). Spectral counting počítá se výskyt peptidů příslušejících určitému proteinu (čím častěji jsou peptidy vybírány pro MS/MS analýzu tím více je proteinu ve vzorku). Hi3 absolutní metoda, intenzita tří nejintenzivnějších peptidů daného proteinu je úměrná jeho koncentraci, kvantifikace umožněna porovnáním intenzit se standardem přidaným ve známém množství.
35 Multiple reaction monitoring (MRM) Cílená kvantifikace peptidů ve vzorku. Vysoká citlivost, specifita, dobrá prostupnost vzorků. Možná absolutní kvantifikace při použití izotopově značeného standardu. Scheduled MRM (smrm) využití znalosti elučních časů analyzovaných peptidů možno kvantifikovat 10ky až 100ky proteinů.
36 Se značkou nebo bez? Se značkou isotopicky značené značky jsou drahé, kvantitativnost značení?!, ale možnost multiplexnosti analýzy možnost analyzovat více vzorků během jednoho LC-MS/MS nástřiku, značení, měření a analýza dat poměrně nenáročná. Bez značky žádné náklady na značení, ale nutnost provádět opakované nástřiky pro statistické vyhodnocení přístrojový čas drahý, nutná vysoká stabilita LC-MS, reprodukovatelnost přípravy vzorku pro analýzu, pečlivé natrénování na modelových vzorcích před analýzou ostrých vzorků.
37 MALDI Biotyping Identifikace mikroorganismů v rutinních klinických vyšetřeních, kontrolách kvality potravin i armádní využití (biologické zbraně). Založeno na předpokladu, že proteiny uvolněné během přípravy vzorku jsou charakteristické pro každou bakterii. Bakterie naneseny na MALDI terčík a překryty matricí, nebo nejdříve ošetřeny organickým rozpouštědlem (ethanol, acetonitril) pro rozrušení buněčné stěny. Identifikace bakterie porovnání změřeného spektra s knihovnou referenčních spekter.
38 Spektra bakterií
39
40 Identifikace Mykobakterií
41 Identifikace plísní
42 MALDI Imaging Technika umožňující zobrazit distribuci proteinů, léčiv a jejich metabolitů, biomarkerů na tenkém řezu tkáně. Tenký plátek tkáně pokryt matricí a zaveden do MALDI spektrometru. Spektrometr postupně zaznamenává prostorovou distribuci látek (peptidy, proteiny, malé molekuly) v tkáni. Získaná data jsou příslušným softwarem zobrazena na optickém snímku tkáně. Nejsou třeba žádné protilátky, sondy, fluorescenční barviva nebo radioaktivní značení.
43
44
45 Studium posttranslačních modifikací Posttranslační modifikace (PTM) významně ovlivňují funkci proteinu. PTM mění hmotnost proteinu/peptidu - přístupné pro MS analýzu. Velmi časté - glykosylace, fosforylace, methylace, hydroxylace, acetylace Často nutná afinitní purifikace - např. izolace glykopeptidů pomocí lektinů.
46 Fosforylace Jedna z nejdůležitějších a nejrozšířenějších PTM, zároveň velmi obtížně studovatelná. Fosfoserin (90 %), fosfothreonin (10 %), fosfotyrosin (0,01 %) Velmi heterogenní, často jen malá část zbytků je fosforylovaná, mění se v čase. Specialita MS - špatná ionizace fosfopeptidů díky záporně nabité fosfoskupině/fosfoskupinám. Afinitní purifikace před MS - protilátky, ionty kovů (Fe 3+, Ga 3+ ), oxidy kovů (TiO 2, ZrO 2 ).
47
48 Fosforylace - lokalizace Posun hmotnosti (80 Da) - možno v případě je-li v sekvenci pouze jeden fosforylovatelný zbytek. Sekvenování peptidu - problém - fosforylace velmi labilní během ToF/ToF nebo CID experimentu. Lepší výsledky s ECD/ETD - jemnější než výše zmíněné techniky, lepší pokrytí sekvence.
49 Peptid DIGSESTEDQAMEDIK
50 3 main structural types of N-glycans: Glykosylace High-mannose type Complex type Hybrid type
51 Glykosylace Core structures of O-glycans: GalNac is common sensus core
52 Proč je studium glykosylace obtížné? Makroheterogenita různé molekuly téhož proteinu mají rozdílné sacharidové řetězce. Mikroheterogenita jedno glykosylační místo může nést rozdílné sacharidové řetězce.
53 Intens. [a.u.] Příklad fragmentace MALDI-ToF/ToF Example: Fragmentation of mab N-glycopeptides in MALDI-TOF/TOF x Peptide moiety Glycan moiety m/z
54 Příklad fragmentace ESI-CID Example: CID-MS/MS of mab N-glycopeptide on amazon: peptide pep ++ pep ++ pep + pep ++ N-acetylglucosamine galactose mannose fucose sialic acid pep + + pep + pep + pep + pep m/z
55 Studium prostorové struktury Vhodné pro špatně krystalizující proteiny malé množství proteinu k dispozici směsi proteinů Studium interakce proteinů, protein/dna konformačních změn (vazba substrátů, aktivátorů ) membránových proteinů potvrzení predikovaných modelů Specifické modifikace aminokyselin, prokřižování pomocí bifunkčních činidel, výměna vodíku za deuterium.
56 Specifické modifikace aminokyselin Pomocí činidel specificky reagujících s určitými aminokyselinami zmapovat povrch proteinu. Reaktivní aminokyseliny - Tyr, Trp, Lys, His, Arg, Cys, Glu, Asp. Používaná činidla - tetranitromethan, jod (Tyr), Sulfo-NHSacetát (Lys), diethylpyrokarbonát (His), p-hydroxyfenylglyoxal (Arg), N-ethylmaleinimid (Cys). Modifikační činidlo způsobí definovaný hmotnostní posun (např. acetylace - 42 Da). Nespecifická činidla hydroxyl footprinting. Problémy reaktivitu ovlivňuje i mikrookolí dané AK, udržení nativní struktury.
57 Obecný postup Modifikace proteinu Odstranění přebytku činidla 72 Da Enzymové štěpení proteinu Změření hmotnostních spekter Identifikace modifikovaných AK zbytků
58 Lokalizace chemické modifikace peptid HFQFQSPYEGGR
59 Prokřižování pomocí bifunkčních činidel Používají se činidla s dvěma reaktivními skupinami, které specificky reagují s dostupnými aminokyselinami. Činidlo má určitou délku, reagující AK musí být blízko u sebe. Studium interakce proteinů - nejen, že spolu interagují, ale jak se k sobě proteiny vážou. Studium jednotlivých proteinů - vzdálenosti mezi reaktivními zbytku mohou být užity při modelování prostorové struktury proteinu.
60 Používaná činidla
61
62 Výměna vodíku za deuterium (HDX) Chemická reakce během které je amidový atom vodíku peptidové vazby nahrazen deuteriem. Nahrazovány pouze atomy přístupné rozpouštědlu. Protein rozpuštěn v D 2 O při neutrálním ph, reakce ukončena prudkým snížením ph na 2,2 a je přidán pepsin k rozštěpení proteinu. Každý nahrazený atom vodíku představuje nárůst hmotnosti o 1 Da. Skvělé pro analýzu interakcí proteinů - porovnání výměny volných proteinů a vázaných v komplexu lze určit interagující regiony. Rychlost výměny závisí i na tom, zda se daný amidový vodík účastní vodíkové vazby.
63
MENÍ A INTERPRETACE SPEKTER BIOMOLEKUL. Miloslav Šanda
MENÍ A INTERPRETACE SPEKTER BIOMOLEKUL Miloslav Šanda Ionizaní techniky využívané k analýze biomolekul (biopolymer) MALDI : proteiny, peptidy, oligonukleotidy, sacharidy ESI : proteiny, peptidy, oligonukleotidy,
VíceKvantitativní proteomická analýza. Martin Hubálek
Kvantitativní proteomická analýza Martin Hubálek Kvantifikace proteinů Většinou pouze relativní srovnání odezvy mezi dvěma experimenty, případně mezi experimentem a standardem Množství proteinu bývá odvozeno
VíceUrčení molekulové hmotnosti: ESI a nanoesi
Cvičení Určení molekulové hmotnosti: ESI a nanoesi ) 1)( ( ) ( H m z H m z M k j j j m z z zh M Molekula o hmotnosti M se nabije z-krát protonem, pík iontu ve spektru je na m z : ) ( H m z M z Pro dva
VíceOPVK CZ.1.07/2.2.00/
OPVK CZ.1.07/2.2.00/28.0184 Základní principy vývoje nových léčiv OCH/ZPVNL Mgr. Radim Nencka, Ph.D. ZS 2012/2013 První kroky k objevu léčiva Nobelova cena za chemii 2013 Martin Karplus Michael Levitt
VíceGel-based a Gel-free kvantifikace v proteomice
Gel-based a Gel-free kvantifikace v proteomice Juraj Lenčo Ústav molekulární patologie Fakulta vojenského zdravotnictví U Hradec Králové Funkce proteinů Proteomika Lokalizace proteinů Proteinové interakce
VícePROTEOMIKA 2015 SHOT-GUN LC, IEF
PROTEOMIKA 2015 SHOT-GUN LC, IEF peptidů Kvantitativní přístupy icat, itraq, SILAC, dimetylace, AQUA. Kdy použít PMF a kdy musím fragmentovat peptid? Jediný protein ( z 2-DE) Směs peptidů z jednoho proteinu
VíceKvantitativní proteomická analýza
Kvantitativní proteomická analýza Martin Hubálek Kvantifikace proteinů Většinou pouze relativní srovnání odezvy mezi dvěma experimenty, případně mezi experimentem a standardem Množství proteinu bývá odvozeno
VíceTématické okruhy pro státní závěrečné zkoušky
Tématické okruhy pro státní závěrečné zkoušky Obor Povinný okruh Volitelný okruh (jeden ze dvou) Forenzní biologická Biochemie, pathobiochemie a Toxikologie a bioterorismus analýza genové inženýrství Kriminalistické
VíceLABORATOŘ OBORU I ÚSTAV ORGANICKÉ TECHNOLOGIE (111) Použití GC-MS spektrometrie
LABORATOŘ OBORU I ÚSTAV ORGANICKÉ TECHNOLOGIE (111) C Použití GC-MS spektrometrie Vedoucí práce: Doc. Ing. Petr Kačer, Ph.D., Ing. Kamila Syslová Umístění práce: laboratoř 79 Použití GC-MS spektrometrie
VíceIZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek
IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek Studium aktinu, mikrofilamentární složky cytoskeletu pomocí dvou metod: detekce přímo v buňkách - fluorescenční barvení
VíceHmotnostní spektrometrie
Hmotnostní spektrometrie Princip: 1. Ze vzorku jsou tvořeny ionty na úrovni molekul, nebo jejich zlomků (fragmentů), nebo až volných atomů dodáváním energie, např. uvolnění atomů ze vzorku nebo přímo rozštěpení
VíceMetody práce s proteinovými komplexy
Metody práce s proteinovými komplexy Zora Nováková, Zdeněk Hodný Proteinové komplexy tvořeny dvěma a více proteiny spojenými nekovalentními vazbami Van der Waalsovy síly vodíkové můstky hydrofobní interakce
VícePříprava vzorků pro proteomickou analýzu
Příprava vzorků pro proteomickou analýzu 1) Úvod Proteomické analýzy mohou být naprosto odlišné cíle... Detekce změn v mozkové kůře při Alzheimerově chorobě Identifikace plazmatických markerů karcinomu
VíceHMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE
HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE A MOŽNOSTI JEJÍHO SPOJENÍ SE SEPARAČNÍMI METODAMI SEPARACE chromatografie CGC, GC x GC HPLC, UPLC, UHPLC, CHIP-LC elektromigrační m. CZE, CITP INTERFACE SPOJENÍ x ROZHRANÍ GC vyhřívaná
Vícevolba separace pro následnou MS kvantifikaci proteinů Jan Havliš Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta, Brno Ústav experimentální biologie : Oddělení funkční genomiky a proteomiky :: Centrální laboratoř
VíceSeparační metody používané v proteomice
Separační metody používané v proteomice Proteome = komplexní směsi proteinů Lidská buňka 10,000 typů proteinů Rozdíl v koncentraci 10 6,plasma10 9 Nutnost separace, frakcionace Na úrovni Proteinů Obtížně
VíceProteomické aplikace a experimenty v onkologickém výzkumu. Pavel Bouchal
Proteomické aplikace a experimenty v onkologickém výzkumu Pavel Bouchal Analýza genové exprese: mrna nebo protein? Protein: proteom (PROTEin complement expressed by a genome) informace o skutečných efektorech
VícePražské analytické centrum inovací Projekt CZ / /0002 spolufinancovaný ESF a Státním rozpočtem ČR
Pražské analytické centrum inovací Projekt CZ.04.3.07/4.2.01.1/0002 spolufinancovaný ESF a Státním rozpočtem ČR SEPARACE PROTEINŮ Preparativní x analytická /měřítko, účel/ Zvláštnosti dané povahou materiálu
VíceImunochemické metody. na principu vazby antigenu a protilátky
Imunochemické metody na principu vazby antigenu a protilátky ANTIGEN (Ag) specifická látka (struktura) vyvolávající imunitní reakci a schopná vazby na protilátku PROTILÁTKA (Ab antibody) molekula bílkoviny
VíceEvropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti URČOVÁNÍ PRIMÁRNÍ STRUKTURY BÍLKOVIN
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti URČOVÁNÍ PRIMÁRNÍ STRUKTURY BÍLKOVIN Primární struktura primární struktura bílkoviny je dána pořadím AK jejích polypeptidových řetězců
VíceKlinická a farmaceutická analýza. Petr Kozlík Katedra analytické chemie
Klinická a farmaceutická analýza Petr Kozlík Katedra analytické chemie e-mail: kozlik@natur.cuni.cz http://web.natur.cuni.cz/~kozlik/ 1 Spojení separačních technik s hmotnostní spektrometrem Separační
VíceJaterní homogenát, preparativní nanáška 2 mg, barvení koloidní Coomassie Blue 1025 spotů. ph 4 ph 7
2018 PROTEOMIKA 2018 Proteomika, proteiny, co a proč. Metody práce s bílkovinami (Petrák 15/10) Značení bílkovin, separační metody, 2-DE (Petrák 22/10) 2-DE záludnosti, digesce a identifikace bílkovin
VíceMožná uplatnění proteomiky směrem do klinické praxe
Možná uplatnění proteomiky směrem do klinické praxe Formy uplatnění proteomiky do klinické praxe Přímé uplatnění proteomických technologií Metody pro studium proteinů tu byly dřív něž proteomika jako obor
VíceIzolace nukleových kyselin
Izolace nukleových kyselin Požadavky na izolaci nukleových kyselin V nativním stavu z přirozeného materiálu v dostatečném množství požadované čistotě. Nukleové kyseliny je třeba zbavit všech látek, které
VíceInovace studia molekulární a buněčné biologie
Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. MBIO1/Molekulární biologie 1 Tento projekt je spolufinancován
VíceMETODY STUDIA PROTEINŮ
METODY STUDIA PROTEINŮ Mgr. Vlasta Němcová vlasta.furstova@tiscali.cz OBSAH PŘEDNÁŠKY 1) Stanovení koncentrace proteinu 2) Stanovení AMK sekvence proteinu Hmotnostní spektrometrie Edmanovo odbourávání
VíceIzolace RNA. doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD..
Izolace RNA doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD.. Metodiky izolace RNA celková buněčná RNA ( total RNA) zahrnuje řadu typů RNA, které se mohou lišit svými fyzikálněchemickými vlastnostmi a tedy i nároky na jejich
VíceZpráva ze zahraniční odborné stáže
Zpráva ze zahraniční odborné stáže Zahraniční odborná stáž byla realizována v rámci projektu ROZVOJ A POSÍLENÍ SPOLUPRÁCE MEZI AKADEMICKÝMI A SOUKROMÝMI SUBJEKTY SE ZAMĚŘENÍM NA CHEMICKÝ A FARMACEUTICKÝ
VíceMasarykova univerzita. Přírodovědecká fakulta Katedra biochemie. Nejnovější proteomické technologie
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta Katedra biochemie Nejnovější proteomické technologie Bakalářská práce Jarmila Sobotková Brno 2006 Chtěla bych poděkovat RNDr. Zbyňkovi Zdráhalovi Dr., za poskytnutí
VíceHmotnostní detekce biologicky významných sloučenin pro biotechnologie část 3 - Provedení štěpení proteinů a následné analýzy,
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií Hmotnostní detekce biologicky významných sloučenin pro biotechnologie část 3 - Provedení štěpení proteinů a následné analýzy, vyhodnocení výsledků, diskuse Anotace
VíceEvropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY ELEKTROFORÉZA K čemu to je? kritérium čistoty preparátu stanovení molekulové hmotnosti makromolekul stanovení izoelektrického
Více: nízkokroková nízkokroková ( a al a ýza analýza analýza komplexního komplexního vzorku proteinů protein /peptid
přímá kvantitativní analýza v HPLC MS (bez izotopového otopoého značení) Jan Havliš Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta, Brno Ústav experimentální biologie : Oddělení funkční genomikya proteomiky
VíceDvoudimenzionální elektroforéza
Rozvoj týmu pro výuku, výzkum a aplikace v oblasti funkční genomiky a proteomiky (CZ.1.07/2.3.00/09.0132) Dvoudimenzionální elektroforéza Hana Konečná Oddělení funkční genomiky a proteomiky ÚEB PřF MU
VíceZáklady hmotnostní spektrometrie
Základy hmotnostní spektrometrie Lenka Hernychová e-mail: hernychova@pmfhk.cz Ústav molekulární patologie, Fakulta vojenského zdravotnictví, Universita obrany Hradec Králové Historie Koichi Tanaka vyvinul
VíceCharakterizace proteinů hmotnostní spektrometrií
Oddělení funkční genomiky a proteomiky Přírodovědecká fakulta MU Charakterizace proteinů hmotnostní spektrometrií Část III Zbyněk Zdráhal Centrální laboratoř-proteomika, CEITEC-MU Oddělení funkční genomiky
VíceHMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE - kvalitativní i kvantitativní detekce v GC a LC - pyrolýzní hmotnostní spektrometrie - analýza polutantů v životním
HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE - kvalitativní i kvantitativní detekce v GC a LC - pyrolýzní hmotnostní spektrometrie - analýza polutantů v životním prostředí - farmakokinetické studie - kvantifikace proteinů
VícePetr Breinek. BC_HbA1c_N2011 1
Glykovaný hemoglobin ba1c Petr Breinek B_bA1c_N2011 1 Glykovaný hemoglobin (ba1c) Ukazatel dlouhodobé kompenzace diabetu Diagnostika onemocnění Kontrola terapie Včasné odhalení hrozících komplikací V roce
VíceStanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů
Stanovení koncentrace (kvantifikace) proteinů Bioanalytické metody Prof. RNDr. Pavel Peč, CSc. Úvod Kritéria výběru metod stanovení koncentrace proteinů jsou založena na možnostech pro vlastní analýzu,
VíceAutoři: Pavel Zachař, David Sýkora Ukázky spekter k procvičování na semináři: Tento soubor je pouze prvním ilustrativním seznámením se základními prin
Autoři: Pavel Zachař, David Sýkora Ukázky spekter k procvičování na semináři: Tento soubor je pouze prvním ilustrativním seznámením se základními principy hmotnostní spektrometrie a v žádném případě nezahrnuje
VíceStruktura proteinů. - testík na procvičení. Vladimíra Kvasnicová
Struktura proteinů - testík na procvičení Vladimíra Kvasnicová Mezi proteinogenní aminokyseliny patří a) kyselina asparagová b) kyselina glutarová c) kyselina acetoctová d) kyselina glutamová Mezi proteinogenní
VíceEvropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Translace, techniky práce s DNA
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti Translace, techniky práce s DNA Translace překlad z jazyka nukleotidů do jazyka aminokyselin dá se rozdělit na 5 kroků aktivace aminokyslin
VíceMetody používané v MB. analýza proteinů, nukleových kyselin
Metody používané v MB analýza proteinů, nukleových kyselin Nukleové kyseliny analýza a manipulace Elektroforéza (délka fragmentů, čistota, kvantifikace) Restrikční štěpení (manipulace s DNA, identifikace
VíceMetody používané v MB. analýza proteinů, nukleových kyselin
Metody používané v MB analýza proteinů, nukleových kyselin Nukleové kyseliny analýza a manipulace Elektroforéza (délka fragmentů, čistota, kvantifikace) Restrikční štěpení (manipulace s DNA, identifikace
VíceChromatofokusace. separace proteinů na základě jejich pi vysoké rozlišení. není potřeba připravovat ph gradient zaostřovací efekt jednoduchost
Chromatofokusace separace proteinů na základě jejich pi vysoké rozlišení není potřeba připravovat ph gradient zaostřovací efekt jednoduchost Polypufry - amfolyty Stacionární fáze Polybuffer 96 - ph 9-6
VíceAminokyseliny, proteiny, enzymy Základy lékařské chemie a biochemie 2014/2015 Ing. Jarmila Krotká Metabolismus základní projev života látková přeměna souhrn veškerých dějů, které probíhají uvnitř organismu
VíceLC/MS a CE/MS v proteomické analýze
LC/MS a CE/MS v proteomické analýze OBSAH Příklad jednoduché analýzy Separční techniky MS techniky Identifikace proteinů Určení molekulové hmotnosti Analytická výzva Mgr. Martin Hubálek, Ph.D. Ústav organické
VíceVývoj biomarkerů. Jindra Vrzalová, Ondrej Topolčan, Radka Fuchsová FN Plzeň, LF v Plzni UK
Vývoj biomarkerů Jindra Vrzalová, Ondrej Topolčan, Radka Fuchsová FN Plzeň, LF v Plzni UK Proč potřebujeme laboratoř? Proč potřebujeme biomarkery? Časná diagnostika Správná diagnostika a stratifikace pacientů
VíceCentrum aplikované genomiky, Ústav dědičných metabolických poruch, 1.LFUK
ové technologie v analýze D A, R A a proteinů Stanislav Kmoch Centrum aplikované genomiky, Ústav dědičných metabolických poruch, 1.LFUK Motto : "The optimal health results from ensuring that the right
VíceDiagnostika bronchiálního. ho astmatu HPLC/MS analýzou. Kamila Syslová Ústav organické technologie
Diagnostika bronchiálního ho astmatu HPLC/MS analýzou Kamila Syslová Ústav organické technologie Bronchiální astma Civilizační onemocnění rostoucí počet případů snižující se věková hranice prvních projevů
VíceVÝBĚROVÁ ŘÍZENÍ CENTRUM REGIONU HANÁ PROJEKT EXCELENTNÍ VÝZKUM (OP VVV)
VÝBĚROVÁ ŘÍZENÍ CENTRUM REGIONU HANÁ PROJEKT EXCELENTNÍ VÝZKUM (OP VVV) Oddělení biofyziky - absolvování magisterského studia v oboru biofyzika, biochemie nebo v biologickém oboru - prezenční Ph.D. studium
VícePŘÍPRAVA PROTEINOVÉHO VZORKU PRO MS ANALÝZU. Hana Konečná
Středoevropský technologický institut CEITEC CL - proteomika Charakterizace proteinů hmotnostní spektrometrií Bi 7050 PŘÍPRAVA PROTEINOVÉHO VZORKU PRO MS ANALÝZU Hana Konečná Název prezentace v zápatí
VíceHMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE
HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE MASS SPECTROMETRY (MS) Alternativní názvy (spojení s GC, LC, CZE, ITP): Hmotnostně spektrometrický (selektivní) detektor Mass spectrometric (selective) detector (MSD) Spektrometrie
VíceGlykobiologie Glykoproteomika Funkční glykomika
Glykobiologie Glykoproteomika Funkční glykomika Glycobiology how sweet it is! Monosacharidy (glukosa, fruktosa, galaktosa ) Oligosacharidy (maltosa, isomaltosa, sacharosa, laktosa.., oligosacharidové řetězce
VíceHmotnostní spektrometrie v klinické laboratoři
Hmotnostní spektrometrie v klinické laboratoři B.Friedecký Brno Pracovní den 10.11.2010 Minulost MS Referenční metody měřm ěření nízkomolekulárních látek l biologických materiálů GC-MS LC-MS Základ metrologické
VíceMetody testování humorální imunity
Metody testování humorální imunity Co je to humorální imunita? Humorální = látková Buněčné produkty Nespecifická imunita příklady:» Lysozym v slinách, slzách» Sérové proteiny (proteiny akutní fáze)» Komplementový
VíceOdůvodnění veřejné zakázky
Odůvodnění veřejné zakázky ZADAVATEL: Česká zemědělská univerzita v Praze Sídlem: Kamýcká 129, 165 21 Praha - Suchdol Zastoupený: Ing. Jana Vohralíková, kvestorka IČO: 60460709 Profil zadavatele: https://zakazky.czu.cz
VíceIndentifikace molekul a kvantitativní analýza pomocí MS
Indentifikace molekul a kvantitativní analýza pomocí MS Identifikace molekul snaha určit molekulovou hmotnost, sumární složení, strukturní části molekuly (funkční skupiny, aromatická jádra, alifatické
VíceINTERPRETACE HMOTNOSTNÍCH SPEKTER
INTERPRETACE HMOTNOSTNÍCH SPEKTER Hmotnostní spektrometrie hmotnostní spektrometrie = fyzikálně chemická metoda založená na rozdělení hmotnosti iontů v plynné fázi podle jejich poměru hmotnosti a náboje
VíceIontové zdroje II. Iontový zdroj. Data. Vzorek. Hmotnostní analyzátor. Zdroj vakua. Iontové zdroje pracující za sníženého tlaku
Iontové zdroje II. Iontové zdroje pracující za sníženého tlaku Elektronová/chemická ionizace Iontové zdroje pro spojení s planárními separacemi Ionizace laserem za účasti matrice Ambientní ionizační techniky
VíceHmotnostní detekce v separačních metodách
Hmotnostní detekce v separačních metodách MC230P83 2/1 Z+Zk 4 kredity doc. RNDr. Josef Cvačka, Ph.D. Mgr. Martin Hubálek, Ph.D. Ústav organické chemie a biochemie AVČR, v.v.i. Flemingovo nám. 2, 166 10
VíceCRH/NPU I - Systém pro ultraúčinnou kapalinovou chromatografii (UHPLC) ve spojení s tandemovým hmotnostním spektrometrem (MS/MS)
ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY v souladu s 156 zákona č. 137/2006, Sb., o veřejných zakázkách, ve znění pozdějších předpisů Nadlimitní veřejná zakázka na dodávky zadávaná v otevřeném řízení v souladu s ust.
VíceVýzkumné centrum genomiky a proteomiky. Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i.
Výzkumné centrum genomiky a proteomiky Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i. Systém pro sekvenování Systém pro čipovou analýzu Systém pro proteinovou analýzu Automatický sběrač buněk Systém pro sekvenování
VíceSYNTETICKÉ OLIGONUKLEOTIDY
Oddělení funkční genomiky a proteomiky Přírodovědecká fakulta Masarykovy university SYNTETICKÉ OLIGONUKLEOTIDY Hana Konečná CENTRÁLNÍ LABORATOŘ Masarykovy Univerzity v Brně ODDĚLENÍ FUNKČNÍ GENOMIKY A
VíceHybridizace nukleových kyselin
Hybridizace nukleových kyselin Tvorba dvouřetězcových hybridů za dvou jednořetězcových a komplementárních molekul Založena na schopnosti denaturace a renaturace DNA. Denaturace DNA oddělení komplementárních
VíceAnalýza obrazu. Gabriela Lochmanová. Studijní materiály
Analýza obrazu Gabriela Lochmanová 1 Stanovení cíle experimentu Způsob detekce? Postup zpracování vzorku, kontrolní vzorky, standard Definice jasně stanovených otázek cílů potvrzení hypotézy soustředění
VíceÚvod do strukturní analýzy farmaceutických látek
Úvod do strukturní analýzy farmaceutických látek Garant předmětu: doc. Ing. Bohumil Dolenský, Ph.D. A28, linka 4110, dolenskb@vscht.cz Hmotnostní spektrometrie II. Příprava předmětu byla podpořena projektem
VíceZkušební okruhy k přijímací zkoušce do magisterského studijního oboru:
Biotechnologie interakce, polarita molekul. Hydrofilní, hydrofobní a amfifilní molekuly. Stavba a struktura prokaryotní a eukaryotní buňky. Viry a reprodukce virů. Biologické membrány. Mikrobiologie -
VíceMetody používané v MB. analýza proteinů, nukleových kyselin
Metody používané v MB analýza proteinů, nukleových kyselin Proteiny analýza a manipulace Izolace, purifikace (rozdělovací metody) Centrifugace Chromatografie Elektroforéza Blotting (identifikace, western
VíceSpektra 1 H NMR. Velmi zjednodušeně! Bohumil Dolenský
Spektra 1 MR Velmi zjednodušeně! Bohumil Dolenský Spektra 1 MR... Počet signálů C 17 18 2 O 2 MeO Počet signálů = počet neekvivalentních skupin OMe = informace o symetrii molekuly Spektrum 1 MR... Počet
VíceSbohem, paní Bradfordová
Sbohem, paní Bradfordová aneb IČ spektroskopie ve službách kvantifikace proteinů Mgr. Stanislav Kukla Merck spol. s r. o. Agenda 1 Zhodnocení současných možností kvantifikace proteinů Bradfordové metoda
Více10. Tandemová hmotnostní spektrometrie. Princip tandemové hmotnostní spektrometrie
10. Tandemová hmotnostní spektrometrie Princip tandemové hmotnostní spektrometrie Informace získávané při tandemové hmotnostní spektrometrii Možné způsoby uspořádání tandemové HS a/ scan fragmentů vzniklých
VíceDynamické procesy & Pokročilé aplikace NMR. chemická výměna, translační difuze, gradientní pulsy, potlačení rozpouštědla, NMR proteinů
Dynamické procesy & Pokročilé aplikace NMR chemická výměna, translační difuze, gradientní pulsy, potlačení rozpouštědla, NMR proteinů Chemická výměna jakýkoli proces při kterém dané jádro mění svůj stav
Více1. Definice a historie oboru molekulární medicína. 3. Základní laboratorní techniky v molekulární medicíně
Obsah Předmluvy 1. Definice a historie oboru molekulární medicína 1.1. Historie molekulární medicíny 2. Základní principy molekulární biologie 2.1. Historie molekulární biologie 2.2. DNA a chromozomy 2.3.
VíceHmotnostní spektrometrie. Historie MS. Schéma MS
Hmotnostní spektrometrie MS mass spectrometry MS je analytická technika, která se používá k měření poměru hmotnosti ku náboji (m/z) u iontů původně studium izotopového složení dnes dynamicky se vyvíjející
VíceHmotnostní spektrometrie peptidů ů a proteinů Petr Halada Mikrobiologický ústav AV ČR halada@biomed.cas.cz Proč chceme znát molekulovou hmotnost? Všechny prvky a molekuly jsou charakterizovány 2 základními
VíceChromatografie. Petr Breinek
Chromatografie Petr Breinek Chromatografie-I 2012 Společným znakem všech chromatografických metod je kontinuální dělení složek analyzované směsi mezi dvěma fázemi. Pohyblivá fáze (mobilní), eluent Nepohyblivá
VíceVysokoúčinná kapalinová chromatografie
Vysokoúčinná kapalinová chromatografie HPLC High Performance Liquid Chromatography Vysokoúčinná...X... Vysoceúčinná kapalinová chromatografie RRLC Rapid Resolution Liquid Chromatography Rychle rozlišovací
VíceAminokyseliny příručka pro učitele. Obecné informace: Téma otevírá kapitolu Bílkoviny, která svým rozsahem překračuje rámec jedné vyučovací hodiny.
Obecné informace: Aminokyseliny příručka pro učitele Téma otevírá kapitolu Bílkoviny, která svým rozsahem překračuje rámec jedné vyučovací hodiny. Navazující učivo Před probráním tématu Aminokyseliny probereme
VíceAnalytická technika HPLC-MS/MS a možnosti jejího využití v hygieně
Analytická technika HPLC-MS/MS a možnosti jejího využití v hygieně Šárka Dušková 24. září 2015-61. konzultační den Hodnocení expozice chemickým látkám na pracovištích 1 HPLC-MS/MS HPLC high-performance
VíceMOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÉ METODY V ENVIRONMENTÁLNÍ MIKROBIOLOGII. Martina Nováková, VŠCHT Praha
MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÉ METODY V ENVIRONMENTÁLNÍ MIKROBIOLOGII Martina Nováková, VŠCHT Praha MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE V BIOREMEDIACÍCH enumerace FISH průtoková cytometrie klonování produktů PCR sekvenování
Víceasné proteomiky Pavel Bouchal Laboratoř proteomiky Ústav biochemie PřF MU
2-D elektroforéza jako jádro současn asné proteomiky Pavel Bouchal Laboratoř proteomiky Ústav biochemie PřF MU Genomika transkriptomika - proteomika Genom soubor genů informace převážně o genetických dispozicích
VíceNAŘÍZENÍ KOMISE (EU) /... ze dne , kterým se mění nařízení (ES) č. 847/2000, pokud jde o definici pojmu podobný léčivý přípravek
EVROPSKÁ KOMISE V Bruselu dne 29.5.2018 C(2018) 3193 final NAŘÍZENÍ KOMISE (EU) /... ze dne 29.5.2018, kterým se mění nařízení (ES) č. 847/2000, pokud jde o definici pojmu podobný léčivý přípravek (Text
VíceGlykovaný hemoglobin. Ing. Martina Podborská, Ph.D. OKB FN Brno. Školní rok 2015/2016. Zpracováno s pomocí přednášek RNDr.
Glykovaný hemoglobin Ing. Martina Podborská, Ph.D. OKB FN Brno Zpracováno s pomocí přednášek RNDr. Petra Breineka Školní rok 2015/2016 Glykovaný hemoglobin (HbA 1c ) Hemoglobin [http://sweet-aboutme.webnode.cz]
VíceBílkoviny - proteiny
Bílkoviny - proteiny Proteiny jsou složeny z 20 kódovaných aminokyselin L-enantiomery Chemická struktura aminokyselin R představuje jeden z 20 různých typů postranních řetězců R Hlavní řetězec je neměnný
VíceOdůvodnění veřejné zakázky. LC-MS systém pro proteomiku a genomiku
Odůvodnění veřejné zakázky dle ustanovení 156 odst. 1 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách, ve znění pozdějších předpisů (dále jen zákon ) a vyhlášky č. 232/2012 Sb., o podrobnostech rozsahu odůvodnění
VícePROTEOMIKA 2017 SHOT-GUN METODY
PROTEOMIKA 2017 SHOT-GUN METODY LC, IEF peptidů Kvantitativní přístupy SILAC,iTRAQ, dimetylace, 18 O, AQUA Label free MRM/SRM proteiny proteiny 2-DE LC-MS shotgun peptidy peptidy SPECIFICKÉ ŠTĚPENÍ BÍLKOVIN
VícePLANÁRNÍ (PLOŠNÁ) CHROMATOGRAFIE
PLANÁRNÍ (PLOŠNÁ) CHROMATOGRAFIE Tenkovrstvá chromatografie je technika pro identifikaci a separaci směsi organických látek Identifikace složek směsi (nutné použít standard) analysa frakcí sbíraných během
VíceNo. 1- určete MW, vysvětlení izotopů
No. 1- určete MW, vysvětlení izotopů ESI/APCI + 325 () 102 (35) 327 (33) 326 (15) 328 (5) 150 200 250 300 350 400 450 500 ESI/APCI - 323 () 97 (51) 325 (32) 324 (13) 326 (6) 150 200 250 300 350 400 450
VíceMetabolismus bílkovin. Václav Pelouch
ZÁKLADY OBECNÉ A KLINICKÉ BIOCHEMIE 2004 Metabolismus bílkovin Václav Pelouch kapitola ve skriptech - 3.2 Výživa Vyvážená strava člověka musí obsahovat: cukry (50 55 %) tuky (30 %) bílkoviny (15 20 %)
VíceCOSY + - podmínky měření a zpracování dat ztráta rozlišení ve spektru. inphase dublet, disperzní. antiphase dublet, absorpční
y x COSY 90 y chem. posuv J vazba 90 x : : inphase dublet, disperzní inphase dublet, disperzní antiphase dublet, absorpční antiphase dublet, absorpční diagonální pík krospík + - - + podmínky měření a zpracování
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU NEPOVOLENÝCH DOPLŇKOVÝCH LÁTEK METODOU LC-MS
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU NEPOVOLENÝCH DOPLŇKOVÝCH LÁTEK METODOU LC-MS 1 Účel a rozsah Tato metoda specifikuje podmínky pro stanovení nepovolených doplňkových látek Zn-bacitracinu,
VíceModerní nástroje v analýze biomolekul
Moderní nástroje v analýze biomolekul Definice Hmotnostní spektrometrie (zkratka MS z anglického Mass spectrometry) je fyzikálně chemická metoda. Metoda umožňující určit molekulovou hmotnost chemických
Více8. Polysacharidy, glykoproteiny a proteoglykany
Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL 8. Polysacharidy, glykoproteiny a proteoglykany Ivo Frébort Polysacharidy Funkce: uchovávání energie, struktura, rozpoznání a signalizace Homopolysacharidy a
VíceVeronika Janů Šárka Kopelentová Petr Kučera. Oddělení alergologie a klinické imunologie FNKV Praha
Veronika Janů Šárka Kopelentová Petr Kučera Oddělení alergologie a klinické imunologie FNKV Praha interakce antigenu s protilátkou probíhá pouze v místech epitopů Jeden antigen může na svém povrchu nést
VíceLuminiscenční analýza Použití luminiscenční spektroskopie v analytické chemii
Luminiscenční analýza Použití luminiscenční spektroskopie v analytické chemii Kvantitativní analýza: F = k φ Φ o Vysoká citlivost metody: 2.3 c l ε použití laserů odezva na relativně malé změny v okolí
VíceVizualizace DNA ETHIDIUM BROMID. fluorescenční barva interkalační činidlo. do gelu do pufru barvení po elfu SYBR GREEN
ETHIDIUM BROMID fluorescenční barva interkalační činidlo do gelu do pufru barvení po elfu Vizualizace DNA SYBR GREEN Barvení proteinů Coommassie Brilliant Blue Coomassie Blue x barvení stříbrem Porovnání
Vícejako markeru oxidativního
Monitoring koncentrace 8-isoprostanu jako markeru oxidativního stresu v kondenzátu vydechovaného vzduchu Lukáš Chytil Ústav organické technologie Úvod Cíl: - nalezení vhodného analytické metody pro analýzu
VíceIdentifikace a charakterizace metalothioneinu v nádorových buňkách pomocí MALDI-TOF/TOF hmotnostní spektrometrie
Identifikace a charakterizace metalothioneinu v nádorových buňkách pomocí MALDI-TOF/TOF hmotnostní spektrometrie 14.6.2013 MSc. Miguel Ángel Merlos Rodrigo Ústav chemie a biochemie, Agronomická fakulta,
Více