MOŽNOST VYUŽITÍ ELEKTROFORÉZY HLÍZOVÝCH PROTEINŮ A ESTERÁZ K CHARAKTERIZACI REGISTROVANÝCH ODRŮD BRAMBOR

Transkript

1 MOŽNOST VYUŽITÍ ELEKTROFORÉZY HLÍZOVÝCH PROTEINŮ A ESTERÁZ K CHARAKTERIZACI REGISTROVANÝCH ODRŮD BRAMBOR The Possibility of Use of Tuber Protein and Esterase Electrophoresis for the Characterization of Potato Registered Cultivars Světlana Sýkorová, Jana Bradová, Eva Matějová, Marie Berová VÚRV Praha Abstract Potatoes represent a very fundamental and irreplaceable crop and food. The cultivar verification and identification as well as the possibility of the cultivar genuineness control have become an obvious necessity. The electrophoretic profiles of soluble tuber proteins and enzymes are considered as appropriate for the cultivar identification. Two methods of PAGE UPOV (1996, 2002) were used for the characterization and identification of the registered potato cultivars. Potato cultivars were found by both methods used to be distinguishable and identifiable. Key words: potatoes, cultivars, identification, tuber protein, enzym, electrophoresis Souhrn Brambory jsou velmi důležitou plodinou a nenahraditelnou potravinou. Odrůda je současně přímým nositelem kvalitativních znaků. Verifikace a identifikace odrůdy jakož i možnost kontroly pravosti odrůdové deklarace jsou velmi důležitým nástrojem např. pro kontrolu sadby. K tomuto účelu jsou velmi dobře využitelné elektroforetické profily rozpustných hlízových proteinů a enzymů. Pro identifikaci a charakterizaci registrovaných odrůd brambor byly použity dvě metody elektroforézy v polyakrylamidovém gelu podle UPOV (1996, 2002). Odrůdy byly rozlišitelné a identifikovatelné oběma metodami. Úvod Brambory jsou důležitou a v našich podmínkách i těžko nahraditelnou plodinou a potravinou, u níž je význam odrůdy jako nositele kvality nesporný. Brambory se stávají potravinou v okamžiku, kdy jsou uváděny do oběhu k přímému prodeji spotřebiteli a vztahuje se na ně ustanovení Zákona o potravinách (Zákon č.110/97 Sb.). Vzhledem k tomu, že prováděcí vyhláška k tomuto zákonu připouští pouze 2% příměsi cizí odrůdy, je velmi žádoucí disponovat metodami, které umožní identifikaci, verifikaci a provedení kontroly pravosti odrůdové deklarace u brambor. Celý proces musí samozřejmě začínat již u šlechtitele a producenta sadby. Metody identifikace odrůd založené na morfologických znacích rostlin a hlíz nejsou příliš objektivní, tyto znaky jsou značně závislé na podmínkách prostředí a ročníku; proto za nejvhodnější pro identifikaci odrůdy jsou pokládány stabilní znaky hlíz, např. rozpustné hlízové proteiny a enzymy, které tyto závislosti nevykazují, jsou tedy geneticky fixovány. Hlízy brambor představují relativně homogenní pletivo, z něhož lze rozpustné proteiny hlíz poměrně snadno extrahovat. Rozpustné proteiny získávané z čerstvě sklizených zralých hlíz jsou převážně albuminy a globuliny. Glykoprotein patatin tvoří až 20% rozpustných proteinů, hlavní protein z frakce albuminů tuberin vykazuje esterázovou aktivitu (Desborough,1983). Vhodnou a účinnou metodou pro separaci těchto proteinů je elektroforéza v polyakrylamidovém nebo škrobovém gelu v alkalickém i kyselém prostředí, přičemž elektroforetické spektrum proteinů se nemění v hlízách Osivo a sadba,

2 skladovaných po několik měsíců v chladu ani v bramborách pěstovaných na různých lokalitách a v různých ročnících (Desborough,1983). Katalog evropských odrůd brambor založený na variabilitě elektroforetických spekter proteinů a esteráz vypracovali Stegemann a Loeschcke (1977). Také mezinárodní organizace pro ochranu práv k odrůdám UPOV doporučila využití polymorfismu hlízových proteinů a enzymů ke zjištění odlišnosti, homogenity a stability (DUS) (UPOV, 1996, 2002). Metodika Jako rostlinný materiál k elektroforetickým analýzám byl použit modelový soubor hlíz 15 v ČR registrovaných odrůd brambor (standardní etalonové vzorky) poskytnutý Hlavní odrůdovou zkušebnou ÚKZÚZ Lípa u Havlíčkova Brodu a hlízy 10 kalibračních etalonových odrůd, užívaných podle UPOV. Používané hlízy musí být zralé a čerstvě sklizené. Tyto vzorky byly poskytnuty z IPK Genbank Luesewitz, SRN. Extrakty pro elektroforézu byly získány vymačkáním hlízové vody z hluboce zmrazených a následně rozmrazených hlíz, stabilizací s antioxidačním činidlem (roztok siřičitanu a disiřičitanu sodného), zahuštěním a obarvením koncentrovaným roztokem sacharózy a amidočerní a centrifugací. Získané supernatanty byly buď ihned použity k elektroforetickým analýzám nebo zmrazeny při -24 C a skladovány (použitelnost minimálně 1 rok). K charakterizaci a identifikaci odrůd brambor byly použity dvě metody elektroforézy hlízových proteinů a esteráz v polyakrylamidovém gelu (PAGE) doporučené UPOV. První vhodná k identifikaci hlízových proteinů a esteráz je založena na systému 1 gelu a Tris-borátovém pufru o ph 7,9 (UPOV 1996), druhá metoda doporučená hlavně pro patatiny využívá soustavy dvou gelů (zaostřovacího a dělicího) a pufru Tris Glycin o ph 8,9 (UPOV 2002). Získaná elektroforetická spektra patatinů byla usušena mezi dvěma vrstvami celofánu, následně proměřena, vypočteny hodnoty relativní elektroforetické mobility (REM) jednotlivých pruhů, sestrojena grafická schemata elektroforeogramů a sestavena matice indexů identity celého souboru. Elektroforetická spektra esteráz byla rovněž usušena, proměřena a základní pruhy byly zkalibrovány pomocí kalibračních odrůd. Následně bylo provedeno jejich předběžné zařazení do kategorií esteráz podle postupu navrženého UPOV (2002). Výsledky a diskuse Přehled použitých odrůd je uveden v tabulce 1. Tab. 1: Přehled souboru registrovaných a kalibračních odrůd brambor Matice indexů identity (ii) pro jejich velký rozsah neuvádíme. Registrované Kalibrační Z matice indexů identity esteráz u souboru registrovaných odrůd odrůdy odrůdy Camilla S38 Hansa vyplynulo, že z celkem porovnávaných 105 párů odrůd 14 párů mělo Fresco S39 Karolin hodnotu ii vyšší nebo rovnou 50, s maximem 67% u páru Amylex - Karmela S40 Cinja Katka a Vineta Klera, 34 párů mělo hodnotu ii mezi 0 a 10% a 57 párů Molli S41 Corine mezi 10 a 50. Průměrná hodnota ii esteráz souboru testovaných odrůd Vivaldi S42 Diana činila 25%. Ze sestrojené matice indexů identity patatinů u souboru Vital S43 Leyla registrovaných odrůd, obsahující 105 porovnávaných párů odrůd, Remarka S44 Sieglinde vyplývá, že maximální nalezená hodnota ii činí 70 % a byla zjištěna u Cicero S47 Obelix dvou párů odrůd, a to Vital Remarka; Katka Felsina. Celkem ze 105 Felsina S49 Jetta párů mělo hodnotu ii vyšší než 50% 9 párů, mezi 10 a 50% 81 párů a pod Karlena S50 Premiere Katka S51 Ute 10 % 15 párů. Průměrná hodnota indexu identity patatinů testovaného Klera S52 modelového souboru registrovaných odrůd činila 28 %. Victoria S58 Pokud se týká matice indexů identity kalibračních odrůd, bylo Vineta S59 porovnáváno celkem 45 párů odrůd, u esteráz maximální hodnota činila Amylex S60 80% a byla zjištěna u dvou párů odrůd Leyla-Hansa a Sieglinde-Corine, u 5 párů byla zjištěna hodnota ii nad 50%, u 25 párů hodnota ii činila 0% a u 15 párů se hodnota ii 2 Osivo a sadba,

3 pohybovala mezi 0 a 50%. Průměrná hodnota ii esteráz tohoto souboru činila 20%. Z matice indexů identity patatinů u kalibračních odrůd vyplynulo, že jeho maximální hodnota činila maximálně 67 % u páru Jetta Sieglinde; u celkem 6 párů dosahovala hodnot nad 50% a u zbylých 38 párů se hodnota ii patatinů pohybovala mezi 15 a 50%. Průměrná hodnota ii patatinů souboru kalibračních odrůd činila 15%. Postupem podle UPOV (2002), který vyplývá z práce Stegemann a Loeschcke (1977) byly zjištěny kalibrační hodnoty REM jednotlivých pruhů spektra patatinů a esteráz a provedeno zařazení do skupiny podle příslušného lokusu nejprve u souboru kalibračních odrůd (tabulka 2) a předběžně u souboru testovaných odrůd (tabulka 3). Z tabulky 3 je patrné, že se toto zařazení zdařilo jen u některých odrůd, intenzivní práce v tomto směru budou pokračovat. Tab. 2: Kalibrační hodnoty REM pro odrůdy - etalony a skupiny patatinů a esteráz (UPOV) Odrůda Patatiny Pat.sk. Est2 Est2 skup. Est3 Est 3 skup. Hansa 15,21,26,33,43,50, ,83 j 0 o 74,83 Karolin 15,31,43, ,84 j 88 c 74,84,88 Cinja 13,15,23,43,49, Corine 15,21,26,33,43,50, ,75 74,75 Diana 15,26,31, ,67 65,67 Leyla 15,23,31,43 Keř.rohl. 74,76,83 dl tot.l 0 o 74,76,83 Sieglinde 15,26,33,43,60? 75,77 l 88 c 75,77,88 Obelix 15,21,26,31,43, ,75 c 0 o 66,75 Jetta 15,26,31, ,76 h 0 o 73,76 Premiere 15,21,26,43,59 71,74 g 86 b 71,74,86 Ute 15,23,33,43, ,82 j 86 b 74,82,86 Tab. 3: Pokus o předběžné zařazení odrůd do skupin patatinů a esteráz podle UPOV (2002) Odrůda Patatiny Pat.sk. Esterázy Est.sk. Camilla S38 15,33,43, ,75,79,85,86? Fresco S39 15,31,43, ,71,75,83,89? Karmela S40 15,26,31,43, ,75,78,84,91 67+Fambo Molli S41 15,31,43, ,76,82,91? Vivaldi S42 15,23,33,43, ,84,86? Vital S43 15,21,26,33,43, ,75,77,88 67+Sieglinde Remarka S44 15,21,26,43,59 Premiere 71,75,84,91? Cicero S47 13,15,26,31,43, Tegal 75,84? Felsina S49 13,15,21,26,31,43,53, Vineta (69,74,77,83); 70,75,84? Karlena S50 13,15,26,31,33,43,52,59,60? 66,75,79,84 79,84+Obelix Katka S51 13,15,21,26,30,43,52,60? 75,77,84,88 84+Sieglinde Klera S52 15,23,33,43 Baltica 75,77,83,88 83+Sieglinde Victoria S58 13,15,21,26,31,43,53, Felsina 67,75,77,85 Pod.Kuras Vineta S59 13,15,21,26,31,43,52, ,75,78,84? Amylex S60 15,21,26,33,43,52, , ,75,77,86,91 69,75,91+Donald Závěr Aplikací obou popsaných metod na modelový soubor registrovaných odrůd brambor bylo zjištěno, že je lze pomocí uvedenými postupy vzájemně rozlišit a identifikovat a tím jednoznačně a objektivně verifikovat odrůdovou deklaraci a odrůdovou čistotu jak u šlechtitelského materiálu, tak u certifikované sadby i konzumních vzorků brambor. Snaha o genetickou intepretaci získaných výsledků zařazení odrůd do příslušných skupin patatinů a esteráz bude pokračovat v dalších letech řešení výzkumných projektů. Osivo a sadba,

4 Literatura Desborough,S.L.: Potato (Solanum Tuberosum L.). S.D.Tanksley,T.J.Orton(Eds.) Isozymes in Plant genetics and breeding, Part B. Elsevier Science Publishers B.V.,Amsterdam: 1983, s Stegemann, H.- Loeschcke,V.: Das europäische Kartoffelsortiment und seine Indexierung. Potato Res.20, 1977, s UPOV, Bundessortenamt, 1996 UPOV TWA 31/6 Bundessortenamt (Rio de Janeiro 2002) Draft test guedelines for potato Výsledky byly získány v rámci řešení projektů NAZV QF 3050 a 1B Kontaktní adresa autora: Mgr. Světlana Sýkorová, CSc., Výzkumný ústav rostlinné výroby, Drnovská 507, Praha 6, sykorova@vurv.cz 4 Osivo a sadba,

5 Osivo a sadba,