Příloha č.4 Seznam mikrobiologických vyšetření - bakteriologie

Transkript

1 Příloha č.4 Seznam mikrobiologických Obsah Dýchací cesty... 2 Močová soustava... 2 Trávicí soustava... 2 Pohlavní soustava... 2 Klinický materiál... 2 Odběry na kultivační vyšetření... 3 Chyby při odběru materiálů: Stránka 1 z 12

2 Vyšetření prováděna v Laboratorním a diagnostickém centru MeDiLa Pardubice Dýchací cesty Kultivace výtěru z krku Kultivace výtěru z nosu Kultivace výtěru z krku + mykologicky Kultivace výtěru z hrtanu Kultivace výtěru z tonzil Kultivace výtěru z levé tonzily Kultivace výtěru z pravé tonzily Kultivace výtěru z nasopharyngu Kultivace stěru z jazyka Močová soustava Moč Cévkovaná moč Moč z permanentní cévky Moč URICULT Moč Ag. Chlamydia trachomatis Moč urogenitální mykoplazmata (Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum) Trávicí soustava Kultivace výtěru z rekta - návrat z ciziny Kultivace výtěru z rekta Kultivace výtěru z rekta děti do 3 let Grahamův stěr - vyšetření na enterobiózu Stolice na rotaviry a adenoviry Stolice na rotaviry Stolice na adenoviry Pohlavní soustava Kultivace výtěru z pochvy Výtěr z pochvy - Ag. Chlamydia trachomatis Výtěr z pochvy urogenitální mykoplazmata (Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum) Kultivace výtěru z vulvy Kultivace výtěru z labií Kultivace výtěru z hrdla děložního Výtěr z hrdla děložního - Ag. Chlamydia trachomatis Výtěr z hrdla děložního urogenitální mykoplazmata (Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum) Mikrobiální obraz poševní = MOP Kultivace výtěru z pochvy na Streptococcus agalactiae Kultivace stěru z penisu Kultivace z ejakulátu Ejakulát na chlamydie Ejakulát urogenitální mykoplazmata (Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum) Klinický materiál Kultivace stěru z rány Kultivace stěru z ložiska Kultivace stěru z defektu Kultivace stěru z dekubitu Kultivace hnisu Kultivace stěru z abscesu Kultivace stěru z bércového vředu Kultivace tkáně Kultivace stěru z kůže Stránka 2 z 12

3 Kultivace z mateřského mléka Kultivace stěru z oka Kultivace stěru z pravého oka Kultivace stěru z levého oka Kultivace kloubního punktátu Kultivace kloubního punktátu anaerobně Kultivace punktátu Kultivace punktátu anaerobně Kultivace stěru z pupku Kultivace stěru z dutiny ústní Kultivace stěru: Kultivace tekutiny: Kultivace tekutiny anaerobně Kultivace tekutiny z puchýře Kultivace výtěru z uretry Výtěr z uretry na chlamydie Výtěr z uretry urogenitální mykoplazmata Kultivace z vedlejších nosních dutin Kultivace výtěru ze zvukovodu Kultivace výtěru z pravého zvukovodu Kultivace výtěru z levého zvukovodu Stěr ze spojivkového vaku na chlamydie Kultivace stěru z perinea Kultivace punktátu burza Kultivace punktátu burza anaerobně Kultivace stěru z tracheostomie Kultivace výtěru z vulvy - dítě Kultivace stěru z pahýlu Kultivace stěru ze sliznice Kultivace ze sputa Odběry na kultivační vyšetření Stránka 3 z 12

4 Odběry provádějte před zahájením antibiotické terapie (pokud je pacient léčen antibiotiky je nutné je vypsat na průvodní list) Odběry provádějte za sterilních podmínek do sterilních souprav Provádějte odběry typické části (hnis apod.), jen z postiženého místa Odběry provádějte ve vhodnou dobu (např. v období teplot) Materiál odešlete do laboratoře co nejrychleji Odběry dle možností a potřeby opakujte Provádějte kontrolní odběry po 48 hod po ukončení antibiotické léčby V případě, že pacient bude odběry provádět sám, poučte ho o přesném postupu při odběru materiálu Výtěr z krku: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová bez transportního média nebo s transportním médiem (Amies) Dřevěnou špachtlí stlačíme jazyk, sterilní plastovou výtěrovkou válivým pohybem setřeme povrch obou tonzil a současně setřeme zadní stěnu faryngu. Výtěrovku opatrně vyjmeme, aby nedošlo k její kontaminaci např. kontaktem s jazykem. U pacientů po tonzilektomii provedeme výtěr pouze ze zadní stěny faryngu. Po odběru zasuneme výtěrovku zpátky do plastové zkumavky. Uchovávání: 24 hod při teplotě C Poznámka: Vysoké procento povlakových angín je vyvoláno viry (70%), menší část bakteriemi (do 30%), převážnou část bakteriálních infekcí způsobuje Streptococcus pyogenes. Haemophilus infl ezae, Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, Moraxella catarrhalis patří do tvz. re zidentní mikroflóry, která se přirozeně vyskytuje na sliznicích horních cest dýchacích zdravých jedinců a nemá etiologický význam u povlakových angín. Indikace antibiotik u těchto nálezů záleží na posouzení celkového stavu pacienta a vyhodnocení dalších zánětlivých ukazatelů (CRP, FW, počet leukocytů). Stránka 4 z 12

5 Výtěr z nosu: Příloha č. 4 Laboratorní příručka Laboratoří MeDiLa, v05 - Seznam mikrobiologických Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová bez transportního média nebo s transportním médiem (Amies) Sterilní plastovou výtěrovkou vytřeme obě nosní dírky krouživým pohybem. Po odběru zasuneme výtěrovku zpět do plastové zkumavky. Uchovávání: 24 hod při teplotě C Poznámka: Infekční rýma je vyvolána viry. Výtěr z laryngu: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka na drátě bez transportního média nebo s transportním médiem (Amies) Odběr provádíme sterilní výtěrovkou na drátě, kterou před použitím zahneme cca do úhlu Jazyk stlačíme dřevěnou špachtlí a výtěrovku zavedeme do laryngu a provedeme výtěr. Po odběru zasuneme výtěrovku zpět do plastové zkumavky. Poznámka: Onemocnění Laryngitis acuta je převážně vyvoláno respiračními viry, průběh je většinou samoúzdravný a léčba antibiotiky není indikována. Odběr vzorku sputa: Odběrová souprava: sterilní plastová nádobka 30 ml se šroubovacím uzávěrem Materiál: Sputum (1 ml) vykašlané hlubokým zakašláním Sliny a vzorky z nosních dutin nejsou vhodné Bronchoalveolární laváž (BAL) Bronchiální výplachy Bronchiální aspiráty Odběr podle metodického návodu pro obor TRN. Ke klasickému bakteriologickému vyšetření odeslat 5 ml BAL. Uchování: 24 hod při 2 8 C Poznámka : DŮLEŽITÉ je zabránit kontaminaci odebraného materiálu flórou horních cest dýchacích, kontaminace může být důvodem k odmítnutí vzorku nebo příčinou zkreslení nálezu ve vyšetřovaném materiálu. Neprovádíme vyšetření na Mycobacterium tuberculosis a parazitární infekce DCD. Stránka 5 z 12

6 Výtěr z ucha: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová nebo na drátě s transportním médiem (Amies) Výtěr ze zvukovodu provádíme u externích otitid, kdy opatrným šroubovitým pohybem zavedeme sterilní výtěrovku na drátě do vnějšího zvukovodu a provedeme výtěr. Po odběru zasuneme výtěrovku zpět do plastové zkumavky. Poznámka: Validním materiálem pro kultivační vyšetření u dg. Otitis media acuta je středoušní sekret, získaný punkcí nebo snadněji výtěrem po paracentéze, kde je však vyšší riziko kontaminace vzorku mikroflórou ze zevního zvukovodu. Středoušní sekret odebíráme do výtěrovky s transportní půdou. Výtěr spojivkového vaku: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová s transportní půdou Amies Sterilní výtěrovkou vytřeme spojivkový vak šroubovitým pohybem. Nabíráme sekret nebo materiál z vřídků. Po odběru zasuneme výtěrovku zpět do plastové zkumavky s transportní půdou. Stěry z ran a povrchových defektů kůže: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová s transportní půdou Amies Sterilní výtěrovkou setřeme místo infekce nebo setřeme tkáň na spodině rány po odstranění odumřelého pojiva. Při rozsáhlejších defektech doporučujeme provést současně několik odběrů na různých místech - pro každou lokalitu použijeme nový tampón. Po odběru zasuneme výtěrovku zpět do plastové zkumavky s transportním médiem. Hnisy, punktáty, exudáty, drény a ostatní klinický materiál: Typ výtěrovky: sterilní plastová výtěrovka s transportní půdou, sterilní plastová sterilní zkumavka Tekutý infekční materiál odebíráme sterilní punkční stříkačkou a obsah převedeme do sterilní plastové zkumavky, kterou ihned po odběru uzavřeme. Pokud je materiál hustý, odebereme jej sterilní výtěrovkou, kterou po odběru vložíme zpět do plastové zkumavky s transportní půdou. Drény vložíme sterilní pinzetou do sterilní zkumavky a ihned ji uzavřeme. Stránka 6 z 12

7 V případě požadavku anaerobní kultivace u tekutých materiálů tyto vzorky necháme v injekční stříkačce, jehlu odstraníme a stříkačku uzavřeme Kombi zátkou. materiál na výtěrovce, tekuté materiály při teplotě 2 8 C, materiál na anaerobní kultivaci dodáme do laboratoře ihned po odběru Výtěr z rekta: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová s transportní půdou U pacienta zavedeme sterilní výtěrovku šroubovitým pohybem do konečníku tak, aby došlo ke znečištění výtěrovky stolicí. Výtěrovku z konečníku opatrným pohybem vytáhneme a uložíme zpět do plastové zkumavky s transportní půdou. Poznámka : není-li výtěr v transportní půdě, vzorek nelze vyšetřit na přítomnost Campylobacter jejuni Doba odezvy: 3 5 dní Stránka 7 z 12

8 Odběr stolice pro přímý průkaz Adenovirů, Rotavirů a Norovirů: Odběrová souprava: sterilní zkumavka s lopatičkou Stolici nabereme pomocí lopatičky, která je připevněna zespodu k víčku odběrové soupravy, stolici na lopatičce vložíme do nádobky nádobku uzavřeme. Nádobku zašleme do laboratoře. Uchovávání: 7 dní při 2-8 C ( lednice ), NEMRAZÍME! Poznámka : Maximální vylučování Rotavirů je den od začátku klinických příznaků, u Adenovirů den po začátku klinických příznaků. Provedení Grahamova stěru na průkaz Enterobius vermicularis: Odběrová souprava: podložní sklíčko + průhledná izolepa šíře podložního sklíčka Grahamův stěr se provádí pomocí průhledné izolepy velikosti a šíře podložního sklíčka, která se přitiskne k análnímu otvoru a konečníkovým řasám a poté se přilepí na podložní sklíčko. Vyhodnocení se provádí mikroskopicky. Odběr se provádí ráno před defekací a omýváním konečníku. Poznámka : odběr se provádí ráno, před provedením osobní hygieny. Nelepit identifikační štítky doprostřed podložního sklíčka!!! Vaginální výtěry na kultivační vyšetření: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová s transportní půdou Sterilní výtěrovkou se provede stěr ze zadní klenby poševní a po odběru se výtěrovka umístí zpět do plastové zkumavky s transportní půdou. Mikrobiální obraz poševní = MOP Odběrová souprava: podložní sklíčko Vyhodnocení: mikroskopicky. Uchování: při teplotě C Poznámka : Stěr provádí lékař v ordinaci a přímo natírá na řádně označené podložní sklíčko. Doba odezvy: 24 hodin Stránka 8 z 12

9 Endocervikální nebo vaginální stěr na vyšetření přítomnosti Chalmydia trachomatis: Typ výtěrovky: sterilní tampón Dacron nebo z umělého hedvábí Před odběrem vzorku odstraňte hlen z oblasti cervixu bavlněným tampónem a znehodnoťte jej. Sterilní odběrový tampón má být vložen do endocervikálního kanálu co nejhlouběji, až není vidět jeho špička. To umožní získání columnárních nebo cuboidálních epitelií, které jsou zásobárnou chlamydií. Jemně otáčejte tampónem jedním směrem o 360, ponechte v klidu 15 vteřin a potom vyjměte. Uchování: 4 6 hodin při teplotě C, 24 hod při teplotě 2 8 C. Vzorek se nesmí zmrazit! do 6 hodin, poté při teplotě 2 8 C Výtěr z uretry na vyšetření přítomnosti Chalmydia trachomatis: Typ výtěrovky: sterilní úzký tampón Dacron nebo z umělého hedvábí Pacient má být poučen, aby nemočil nejméně jednu hodinu před odběrem. Vsuňte tampón do uretry na 2 až 4 cm a jemně jím otáčejte jedním směrem o 360, ponechte v klidu 15 vteřin a potom vyjměte. Uchování: 4 6 hodin při teplotě C, 24 hod při teplotě 2 8 C. Vzorek se nesmí zmrazit! do 6 hodin, poté při teplotě 2 8 C Endocervikální nebo vaginální stěr na vyšetření přítomnosti Ureaplasma urealyticum a Mycoplasma hominis: Odběrová souprava: sterilní tampón Dacron (popř. z umělého hedvábí) UMMt transportní médium Cervix je nejprve opatrně otřete tampónem kvůli odstranění sekretu a tampón znehodnoťte. Sterilním dacronovým tampónem otřete silně slizniční stěnu tak, abyste získali vzorek bohatý na epiteliální buňky. Umístěte tampón do lahvičky s UMMt transportním médiem a konec zastřihněte nebo zalomte. UMMt transportní médium se vzorkem řádně označte jménem a rodným číslem pacienta., 48 hodin při teplotě 2 8 C do 2 hodin, poté při teplotě 2 8 C Stránka 9 z 12

10 Výtěr z uretry na vyšetření přítomnosti Ureaplasma urealyticum a Mycoplasma hominis: Odběrová souprava: sterilní tampón Dacron (popř. z umělého hedvábí) UMMt transportní médium Očistěte močovod, zanořte tampón do hloubky min. 4 cm a pomalým krouživým pohybem otřete nebo seškrábněte oblast, abyste získali buňky. Umístěte tampón do lahvičky s UMMt transportním médiem a konec zastřihněte nebo zalomte. UMMt transportní médium se vzorkem řádně označte jménem a rodným číslem pacienta., 48 hodin při teplotě 2 8 C do 2 hodin, poté při teplotě 2 8 C Odběr moče na kultivační vyšetření: Odběrová souprava: sterilní plastová zkumavka Na kultivační vyšetření se odebírá ranní moč. Před odběrem si muži po stažení předkožky umyjí glans mýdlem a vodou. Ženy si umyjí vnější genitál po oddálení labií mýdlem a potom provedou opláchnutí vodou. Přímo do sterilní zkumavky se poté provede zachycení středního proudu ranní moče o objemu 5 10 ml. Zkumavka se poté ihned uzavře víčkem. Uchování: 24 hod při 2 8 C do 2 hodin, poté při teplotě 2 8 C Odběr moče do soupravy URICULT: Odběrová souprava: URICULT Před odběrem provedeme hygienu genitálií stejným způsobem jako u odběru moče do plastové sterilní zkumavky. Do sterilní odběrové nádobky soupravy URICULT zachytíme střední proud ranní moče. Do nádobky s močí ponoříme nosič se živnými půdami a cca po 1 min nosič vyndáme, moč vylijeme do odpadu a nosič s půdami zašroubujeme zpět do prázdné odběrové nádobky. Doručíme do laboratoře. Uchování: řídí se pokyny výrobce odběrové soupravy Transport: při teplotě 2 8 C Stránka 10 z 12

11 Odběr moče a spermatu na vyšetření přítomnosti Ureaplasma urealyticum a Mycoplasma hominis: Odběrová souprava: sterilní plastová zkumavka s červeným uzávěrem Odebírá se min.1 ml ze středního proudu ranní moče nebo spermatu. Zkumavka se poté ihned uzavře víčkem. Uchování: 48 hod při 2 8 C do 4 hodin, poté při teplotě 2 8 C Odběr moče na vyšetření přítomnosti Chalmydia trachomatis: Odběrová souprava: sterilní plastová zkumavka s červeným uzávěrem Odebírá ml ze první porce ranní moče. Zkumavka se poté ihned uzavře víčkem. Uchování: 24 hod při 2 8 C do 4 hodin, poté při teplotě 2 8 C Screening MRSA: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová s transportním médiem (Amies) Provede se stěr z oblasti určevé ke screeningu krk, nos, perineum, moč, dekubitus, rána atd. Uchovávání: 24 hod při teplotě C Poznámka: jedná se o cílené vyhledávání Methicilin/oxacilin rezistentního kmene Staphylococcus aureus s následným stanovením citlivosti na ATB. Ostatní kmeny se netestují. Doba odezvy: 2-5 dní Screening ESBL: Typ výtěrovky: sterilní výtěrovka plastová s transportním médiem (Amies) Provede se stěr z oblasti určevé ke screeningu krk, nos, perineum, moč, dekubitus, rána atd. Uchovávání: 24 hod při teplotě C Poznámka: jedná se o cílené vyhledávání Enterobacteriaceae kmenů produkujících širokospektrou betalaktamázů typu AmpC a ESBL Ostatní kmeny se netestují. Doba odezvy: 2-5 dní Stránka 11 z 12

12 Chyby při odběru materiálů: nedodržení aseptických podmínek při odběru, následná kontaminace vzorku jinou mikroflórou odběry jsou prováděny až po zahájení léčby antibiotiky, vyšetření vzorku v průběhu léčby nebo po léčbě neodhalí skutečného původce infekce, jeho výsledek může být zavádějící a může vést k chybné indikaci antibiotik s vážnými důsledky pro stav nemocného nevhodné skladování vzorku před transportem do laboratoře, např. v lednici, kdy nižší teplota může usmrtit některé na teplotu citlivé bakteriální původce infekcí a výsledek poté neodpovídá skutečnosti odběr je prováděn z nevhodného místa, např. při zánětu středouší ze zevního zvukovodu výtěr je prováděn nevhodnou odběrovou soupravou, např. anální výtěr je prováděn výtěrovkou bez transportní půdy, poté nemůže být provedena cílená kultivace na průkaz Campylobacter jejuni odběr je prováděn v nevhodnou dobu, viz Odběr pro přímý průkaz Rotavirů, Adenovirů a Norovirů Stránka 12 z 12