NRL Název zkoušky Identifikace zkoušky Předmět zkoušky

Transkript

1 Strana: 1 AIDS antibiotika dezinfekci a sterilizaci Současné stanovení protilátek HIV-1/2 a HIV-1 p24 antigenu metodou EIA (EIA anti HIV-1/2 a HIV p24) Současné stanovení protilátek HIV-1/2 a HIV-1 p24 antigenu metodou ELFA (ELFA anti HIV- 1/2 a HIV-1 p24) Stanovení HIV-1 p24 antigenu metodou ELFA (ELFA HIV-1 p24) Stanovení protilátek HIV-1/ /HIV-2 metodou Western blot (blot anti HIV-1) Kvantitativní stanovení HIV nukleových kyselin metodou Real Time PCR Roche TaqMan HIV- 1 Test (PCR HIV-1 RNA) Určení genotypu HIV sekvenováním Abbott Viroseq HIV-1 Genotyping System (genotyp HIV-1) Agarová diluční metoda vyšetření citlivosti baktérií k antibiotikům (Agarová diluční metoda) Disková difuzní metoda vyšetření citlivosti baktérií k antibiotikům (Disková difuzní metoda) Nitrocefinová metoda průkazu β-laktamázy bakterií (Nitrocefinová metoda) Bujónová diluční mikrometoda (BDM) vyšetření citlivosti baktérií k antibiotikům (Bujónová diluční mikrometoda) Stanovení dezinfekční účinnosti # mikrobiologickou suspenzní metodou Stanovení dezinfekční účinnosti # účinnosti mikrobiologickou metodou s uměle kontaminovanými nosiči Stanovení dezinfekční účinnosti # přípravků při dezinfekci rukou a pokožky přirozeně a uměle kontaminovaných mikroby Stanovení remanentního účinku přípravků při přirozené kontaminaci pokožky Stanovení sterilizační účinnosti parních sterilizátorů pomocí indikátorů sterilizace SOP-NRL/AIDS-03 SOP-NRL/AIDS-05 SOP-NRL/AIDS-06 SOP-NRL/AIDS-07 SOP-NRL/AIDS-19 SOP-NRL/AIDS-15 SOP-NRL/ATB-01 SOP-NRL/ATB-02 SOP-NRL/ATB-03 SOP-NRL/ATB-20 SOP-NRL/DS-01 (ČSN EN 13727, ČSN EN 13624, ČSN EN 14885) SOP-NRL/DS-02 (ČSN EN 14561, ČSN EN 14562, ČSN EN 14885) SOP-NRL/DS-03 (ČSN EN 1499, ČSN EN 1500, ČSN EN 12791, ČSN EN 14885) SOP-NRL/DS-04 (FDA a DGHM) # SOP-NRL/DS-05 Lidské sérum, plazma Lidské sérum, plazma Lidské sérum, plazma Lidské sérum, plazma Lidská plazma Lidská plazma Izoláty bakterií Izoláty bakterií Izoláty bakterií Izoláty bakterií Dezinfekční přípravky, chemické látky, dezinfekční přístroje Dezinfekční přípravky, chemické látky, dezinfekční přístroje Dezinfekční přípravky, chemické látky, dezinfekční přístroje Dezinfekční přípravky, chemické látky, dezinfekční přístroje Biologické indikátory, nebiologické indikátory, sterilizační přístroje v laboratoři nebo u zadavatele Stanovení sterilizační účinnosti horkovzdušných sterilizátorů pomocí indikátorů sterilizace SOP-NRL/DS-06 Biologické indikátory, nebiologické indikátory, sterilizační přístroje v laboratoři nebo u zadavatele

2 Strana: 2 dezinfekci a sterilizaci dezinsekci a deratizaci mykobakterie Stanovení sterilizační účinnosti etylenoxidových a formaldehydových sterilizátorů pomocí indikátorů sterilizace Stanovení sterilizační účinnosti plazmových sterilizátorů pomocí indikátorů sterilizace SOP-NRL/DS-07 SOP-NRL/DS-08 Biologické indikátory, nebiologické indikátory, sterilizační přístroje v laboratoři nebo u zadavatele Biologické indikátory, nebiologické indikátory, sterilizační přístroje v laboratoři nebo u zadavatele Sterilizační obaly Stanovení prostupnosti mikroorganizmů SOP-NRL/DS-09 sterilizačními obaly mikrobiologickou kultivací Kontrola vlastností biologických indikátorů SOP-NRL/DS-10 Biologické a nebiologické sterilizace mikrobiologickou kultivací a indikátory sterilizace nebiologických indikátorů změnou zabarvení Stanovení tarsální toxicity biocidů u hmyzu SOP-NRL/DD-01 Kontaktní biocidy hmyzu metodou intoxikace z podložky Stanovení orální toxicity biocidů u hmyzu SOP-NRL/DD-02 Požerové biocidy hmyzu metodou testů účinnosti nástrah Stanovení účinnosti repelentů proti krev sajícím SOP-NRL/DD-03 Repelentní biocidy členovcům metodou testů účinnosti repelentních přípravků aplikovaných na kůži pokusných osob Mikroskopický průkaz mykobakterií SOP-NRL/M-01 Lidské sputum, punktát, krev, stolice, laryngální výtěr, aspirát, BAL, žaludeční výplach, bioptický a sekční materiál, výtěry a stěry z píštělí hnisavých procesů a ran, mykobakteriální kultura Kultivační průkaz mykobakterií SOP-NRL/M-02 Lidské sputum, punktát, krev, stolice, laryngální výtěr, aspirát, BAL, žaludeční výplach, bioptický a sekční materiál, výtěry a stěry z píštělí hnisavých procesů a ran, mykobakteriální kultura Stanovení buněčné imunitní odpovědi u tuberkulózy metodou ELISA (Test QuantiFERON-TB Gold) Identifikace mykobakterií biochemickými metodami Testy citlivosti na antituberkulotika (dle Canettiho) Testy citlivosti na antituberkulotika (mikrometoda) SOP-NRL/M-15 SOP-NRL/M-06 SOP-NRL/M-08 SOP-NRL/M-09 Lidská plná heparinizovaná krev, IVD Mykobakteriální kultura Mykobakteriální kultura Mykobakteriální kultura RFLP # - DNA analýza M. tuberculosis SOP-NRL/M-13 Kultura M. tuberculosis

3 Strana: 3 lymeskou borreliózu Stanovení genomové nukleové kyseliny různých druhů Borrelia burgdorferi sensu lato metodou PCR (Stanovení genom. NK různých druhů B.burgdorferi s.l. metodou PCR) Stanovení plasmidové nukleové kyseliny různých druhů Borrelia burgdorferi sensu lato metodou PCR (Stanovení plasmidové NK různých druhů B.burgdorferi s.l. metodou PCR) Sérologický průkaz specifických protilátek proti borreliím metodou ELISA (enzyme-linked immunoassay) (Sérologický průkaz specif. Ab proti borreliím metodou ELISA) Průkaz antigenu u Borrelia burgdorferi sensu latoelektroforézou v sodium dodecyl sulfátovém polyacrylamidovém gelu (SDS PAGE) s následným imunoblotingem SOP-NRL/LB-01 SOP-NRL/LB-02 SOP-NRL/LB-03 SOP-NRL/LB-04 mok, výpotek, tkáň, klíště, mikrobiální kultury mok, výpotek, tkáň, klíště, mikrobiální kultury Protilátky, imunokomplexy v lidském séru, mozkomíšním moku, výpotku, IVD Lidská tkáň, mozkomíšní mok, sérum, výpotek, kultury Borrelia garinii, B.afzelii,B. burgdorferi, IVD virové hepatitidy Konfirmace specifických anti Borrelia garinii, Borrelia afzelii protilátek metodou Western blot (Konfirmace specifických anti B.garinii, B.afzelii protilátek metodou WB) Kultivace Borrelia sp. ve specifickém BSK-H médiu Přímý průkaz Borrelia sp. pomocí elektronové mikroskopie (Přímý průkaz Borrelia sp. pomocí ELM) Stanovení antigenů virů hepatitid neautomatizovanou metodou EIA (HBsAg, HBsAg konfir., HBeAg) Stanovení protilátek proti antigenům virů hepatitid neautomatizovanou metodou EIA (anti-hbc celk., IgM anti-hbc, anti-hbe, anti- HBs, anti-hcv, anti-hav celk., IgM anti-hav, IgM anti-hdv, anti-hdv celk., IgG anti-hev, IgM anti-hev) Stanovení RNA a DNA virů hepatitidy C a B metodou Real Time PCR přístroje AmpliPrep a TaqMan (HBV-DNA, HCV-RNA) Automatizované stanovení antigenů a protilátek proti antigenům virů hepatitid metodou MEIA na analyzátoru Architect (HBsAg, HBsAg konfir., HBeAg, anti-hbc celk., IgM anti-hbc, anti-hbe, anti-hbs, anti-hcv, anti-hav celk., IgM anti-hav) Stanovení protilátek proti antigenům virů hepatitid metodou LIA (anti-hcv) SOP-NRL/LB-05 SOP-NRL/LB-06 SOP-NRL/LB-08 SOP-NRL/VH-01 SOP-NRL/VH-17 SOP-NRL/VH-16 SOP-NRL/VH-05 SOP-NRL/VH-06 Lidská tkáň, mozkomíšní mok, sérum, výpotek, kultury Borrelia garinii, B.afzelii,B. burgdorferi, IVD mok, výpotek, tkáň, klíště Lidská plazma, mozkomíšní mok, tkáň Lidské sérum, plazma a jejich deriváty, IVD Lidské sérum, plazma a jejich deriváty, IVD Lidské sérum, plazma a jejich deriváty, IVD Lidské sérum, plazma a jejich deriváty, IVD Lidské sérum, plazma a jejich deriváty, IVD

4 Strana: 4 meningokokové nákazy hemofilové nákazy streptokoky a enterokoky Identifikace species rodu Neisseria biochemickými a mikroskopickými metodami Identifikace kapsulárního antigenu Neisseria meningitidis aglutinací (Identifikace kaps. Ag. N. meningitidis) Identifikace ET typu Neisseria meningitidis multilokusovou enzymovou elektroforézou Průkaz DNA meningokoka, hemofila a pneumokoka v klinickém materiálu seminested metodou PCR (Průkaz DNA metodou PCR) Stanovení antimeningokokových protilátek baktericidním testem Sekvenční typizace genu por A a fet A Neisseria meningitidis (Sekvenace N. meningitidis) Multilokusová sekvenční typizace genů abcz,adk,aroe,fumc,gdh,pdhc,pgm,pena Neisseria meningitidis (MLST N. meningitidis) Identifikace species rodu Haemophilus biochemickými testy (Biochemické testy) Identifikace kapsulárních antigenů Haemophilus influenzae sklíčkovou aglutinací (Sklíčková aglutinace) Stanovení titru antistreptolyzinu O neutralizační metodou (Stanovení titru ASO neutralizační metodou) Stanovení titru antideoxyribonukleázy B kolorimetricky (Stanovení titru ADNB kolorimetricky) Identifikace species streptokoků a enterokoků biochemickými testy a citlivostí k antibakteriálním látkám (Identifikace species biochem. testy a citl. k antibakterial. látkám) Identifikace skupinových antigenů streptokoků a enterokoků latexaglutinací (Identifikace sérologické skupiny latexaglutinací) Identifikace skupinových antigenů streptokoků a enterokoků precipitací (Identifikace sérologické skupiny precipitací) Identifikace T antigenu S.pyogenes aglutinací (T typizace S.pyogenes aglutinací) Identifikace typových antigenů S.pneumoniae a S.agalactiae latexaglutinací (Typizace S.pneumoniae latexaglutinací, typizace S.agalactiae latexaglutinací, identifikace species S.pneumoniae latexaglutinací) Identifikace typových antigenů S.pneumoniae a S.suis quellung reakcí (Typizace S.pneumoniae quellung reakcí, typizace S.suis quellung reakcí, identifikace species S.pneumoniae quellung reakcí) SOP-NRL/MEN-01 SOP-NRL/MEN-02 SOP-NRL/MEN-03 SOP-NRL/MEN-04 SOP-NRL/MEN-05 SOP-NRL/MEN-39 SOP-NRL/MEN-40 SOP-NRL/HEM-04 SOP-NRL/HEM-08 SOP-NRL/STR-01 SOP-NRL/STR-02 SOP-NRL/STR-03 SOP-NRL/STR-04 SOP-NRL/STR-05 SOP-NRL/STR-06 SOP-NRL/STR-07 SOP-NRL/STR-08 Kultury bakteriálních kmenů, IVD Kultury Neisseria meningitidis, IVD Kultury Neisseria meningitidis Mozkomíšní mok, krev, lidské sérum, bronchoalveolární laváž BAL Lidské sérum Kmeny Neisseria meningitidis Kmeny Neisseria meningitidis Kultury bakteriálních kmenů Kultury Haemophilus influenzae Lidské sérum, IVD Lidské sérum, IVD

5 Strana: 5 streptokoky a enterokoky chřipku Identifikace typových antigenů S.pyogenes metodou sekvence emm genu pro M protein (Emm typizace S.pyogenes) Hemaglutinačně inhibiční test (HIT) pro identifikaci virového antigenu (virus chřipky, viry parainfluenzy) (HIT-identifikace virového antigenu infl., parainfl.) Hemaglutinačně inhibiční test (HIT) pro průkaz antivirových protilátek (virus chřipky, viry parainfluenzy) (HIT-průkaz antivirových protilátek-infl., parainfl.) Průkaz kmenů viru chřipky izolací v tkáňových kulturách (Průkaz kmenů viru chřipky izolací v TK) Průkaz kmenů nechřipkových respiračních virů (RS virus, adenoviry, viry parainfluenzy) izolací v tkáňových kulturách (Průkaz kmenů nechř. resp. virů izolací v TK) Průkaz kmenů viru chřipky izolací v kuřecích embryích (Průkaz kmenů viru chřipky v kuřecích embryích) Imunoperoxidázový test (IPT) pro průkaz a identifikaci antigenů viru chřipky (IPT-průkaz antigenů viru chřipky) Průkaz DNA a RNA respiračních a střevních infekčních agens (chřipka A,B včetně subtypů, RSV, ADV, Mycoplasma sp., Mycoplasma pneumoniae, koronaviry - SARS CoV, CO229, OC 43 -, herpes viry, rhinoviry, konzervativní sekvence enterovirů (intratypická sopeficikace Sabin 1,2,3) metodou PCR s detekcí amplikonů v gelu (Průkaz DNA, RNA respir.virů, MPN sp. PCR) SOP-NRL/STR-09 SOP-NRL/CH-01 SOP-NRL/CH-02 SOP-NRL/CH-03 SOP-NRL/NCH-08 SOP-NRL/CH-04 SOP-NRL/CH-05 SOP-NRL/CH-55 Virová tekutina, IVD Lidské sérum, zvířecí sérum, IVD Lidský aspirát, výtěr nosohltanu, krční výplach, BAL, autoptický a bioptický materiál, virová tekutina Lidský aspirát, výtěr nosohltanu, krční výplach, BAL, autoptický a bioptický materiál, výtěr ze spojivkového vaku, seškrab rohovky, moč, virová tekutina Lidský aspirát, výtěr nosohltanu, krční výplach, BAL, autoptický a bioptický materiál, virová tekutina Lidský aspirát, výtěr nosohltanu, krční výplach, BAL, autoptický a bioptický materiál, virová tekutina Sekret horních a dolních cest dýchacích (výtěr, výplach, aspirát, BAL, exsudát, sputum), mozkomíšní mok, krev, sérum, plazma, výtěr ze spojivkového vaku, tkáně dýchacích cest (klinické vzorky - autopsie, biopsie, stěr - plíce, trachea, patro), jiné tkáně (např. biopsie myokardu), stolice, moč, infikované tkáňové kultury a média tkáňových kultur při izolaci virů, vzorky nukleové kyseliny, izoláty virů k identifikaci, odpadní vody

6 Strana: 6 chřipku nechřipkové respirační viry přímou diagnostiku virů, borelií a cizorodých buněk v klinickém materiálu pomocí elektronmikroskopických metod Průkaz DNA a RNA respiračních a střevních infekčních agens (chřipka A,B včetně subtypů H1, H3, H5, H1 pandemic, RSV, ADV, PIV, hmpv, Mycoplasma sp., Mycoplasma pneumoniae,, koronaviry - SARS CoV, CO229, OC 43 -, herpes viry, rhinoviry, konzervativní sekvence enterovirů (diferenciace Enterovirus - poliovirus: a intratypická sopeficikace Sabin 1,2,3) metodou PCR s detekcí v reálném čase (Průkaz RNA, DNA respir.virů, MPN - RT PCR) Průkaz a identifikace virových antigenů u viru chřipky, nechřipkových respiračních virů (RS virus, adenoviry, viry parainfluenzy) metodou EIA (EIA - průkaz antigenů viru chř., nechř. resp. virů) Průkaz antivirových protilátek u viru chřipky, nechřipkových respiračních virů (RS virus, adenoviry) a M. pneumoniae metodou EIA (EIA - průkaz antivir.protilátek chř., nechř. virů, MPN) Průkaz antivirových protilátek u viru chřipky, nechřipkových respiračních virů (RS virus, adenoviry) a M. pneumoniae komplement fixačním testem (KFR) (KFR - průkaz antivir. protilátek u chř. a nechř. virů) Identifikace virových antigenů (virus chřipky, viry parainfluenzy) imunofluorescenčním testem (IFT) (IFT - identifikace virových antigenů) Typizace virových antigenů (adenoviry) virus neutralizačním testem (VNT) (VNT - typizace virových antigenů nechř.resp. virů) Přímý průkaz virů pomocí elektronové mikroskopie SOP-NRL/CH-56 SOP-NRL/NCH-01 SOP-NRL/NCH-02 SOP-NRL/NCH-04 SOP-NRL/NCH-05 SOP-NRL/NCH-07 SOP-NRL/ELM-01 Sekret horních a dolních cest dýchacích (výtěr, výplach, aspirát, BAL, exsudát, sputum), mozkomíšní mok, krev, sérum, plazma, výtěr ze spojivkového vaku, tkáně dýchacích cest (klinické vzorky - autopsie, biopsie, stěr - plíce, trachea, patro), jiné tkáně (např. biopsie myokardu), stolice, moč, infikované tkáňové kultury a média tkáňových kultur při izolaci virů, vzorky nukleové kyseliny, izoláty virů k identifikaci, odpadní vody Lidský aspirát, výtěr nosohltanu, krční výplach, BAL, autoptický a bioptický materiál, výtěr ze spojivkového vaku, seškrab rohovky, moč, virová tekutina, IVD Lidské sérum, IVD Lidské sérum, zvířecí sérum, IVD Virová tekutina Virová tekutina Lidská stolice, moč, plazma, sérum, mozkomíšní mok, vesikulární tekutiny, laváže horních a dolních dýchacích cest, bioptický a autoptický materiál, vakcíny

7 Strana: 7 Průkaz enterovirů izolací v tkáňových kulturách SOP-NRL/ENT-01 Lidská stolice, mozkomíšní mok, výtěr z krku, odpadní enteroviry herpetické viry Identifikace poliovirů virus neutralizačním testem (VNT) Identifikace ECHO a coxsackie virů virus neutralizačním testem (VNT) Průkaz protilátek proti antigenům enterovirů virus neutralizačním testem (VNT) Průkaz protilátek proti enterovirům metodou ELISA Stanovení protilátek proti antigenům herpetických virů metodou EIA (IgG anti-vca EBV, IgM anti-vca EBV, IgA anti-vca EBV, IgG anti-ebna1 EBV, IgM anti-ebna1 EBV, IgG anti-ea-d EBV, IgG anti-hsv, typ. specifické IgG anti-hsv2, IgG anti-vzv, IgG anti-cmv, avidita IgG anti-cmv, IgM anti- CMV) Stanovení antigenů herpetických virů metodou EIA Stanovení protilátek proti herpetickým virům metodou nepřímé imunofluorescence (IgG anti- VCA EBV, IgM anti-vca EBV, IgG anti- EA(D+R) EBV, IgM anti-hsv, IgG anti- HSV, IgM anti.vzv, IgG anti-vzv, IgM anti- HHV6, IgG anti-hhv6) Průkaz herpetických virů: CMV, HSV1 a 2, VZV izolací v tkáňové kultuře Průkaz nukleových kyselin HSV1 a 2, VZV, CMV, EBV, HHV6 a 8 metodou PCR s detekcí amplikonu v gelu Průkaz nukleových kyselin CMV, EBV, HHV6, HSV 1 a 2, VZV metodou Real Time PCR SOP-NRL/ENT-02 SOP-NRL/ENT-03 SOP-NRL/ENT-04 SOP-NRL/ENT-05 SOP-NRL/HV-01 SOP-NRL/HV-24 SOP-NRL/HV-03 SOP-NRL/HV-04 SOP-NRL/HV- 06 SOP-NRL/HV- 07 vody Lidská stolice, mozkomíšní mok, výtěr z krku, odpadní vody Lidská stolice, mozkomíšní mok, výtěr z krku, odpadní vody Lidské sérum Lidské sérum mozkomíšní mok, IVD plná krev, mozkomíšní mok, IVD mozkomíšní mok, IVD Lidská moč, stěr z léze, BAL, aspirát, výtěr ze spojivky, autopsie, výtěr z nosohltanu, leukocyty, infikované tkáňové kultury mok, stěr z léze, moč, BAL, aspirát, výtěr ze spojivky, leukocyty, autopsie, infikované tkáňové kultury, oční tekutina, synoviální tekutina, plodová voda, IVD mok, stěr z léze, moč, BAL, aspirát, výtěr ze spojivky, leukocyty, autopsie, infikované tkáňové kultury, oční tekutina, synoviální tekutina, plodová voda, IVD

8 Strana: 8 zarděnky, spalničky, parotitidu a parvovirus B19 chlamydie leptospiry toxoplasmosu Stanovení protilátek tříd IgG a IgM proti virům zarděnek, spalniček, příušnic a parvoviru B 19 a avidity zarděnkových IgG protilátek metodou ELISA Kvalitativní průkaz DNA parvoviru B19 metodou nested PCR Kvantitativní průkaz DNA parvoviru B19 metodou real-time PCR SOP-NRL/ZSP-01 SOP-NRL/ZSP-08 SOP-NRL/ZSP-12 mozkomíšní mok Lidská nesrážlivá krev, sérum, kostní dřeň, plodová voda, biopsie Lidská nesrážlivá krev, sérum, kostní dřeň, plodová voda, biopsie Stanovení antigenu chlamydií metodou EIA SOP-NRL/CHLA-01 Lidská moč, uretrální, cervikální, konjunktivální výtěry, IVD Stanovení protilátek proti antigenům chlamydií metodou EIA SOP-NRL/CHLA-02 IVD Stanovení antigenů chlamydií metodou imunofluorescence (DFA) Stanovení protilátek proti antigenům chlamydií metodou nepřímé imunofluorescence (IFA) Průkaz DNA Chlamydophila pneumoniae a Chlamydia trachomatis metodou Real time PCR na Light Cycleru Roche Průkaz DNA Chlamydia trachomatis metodou Real time PCR na Cobas TaqMan Roche Průkaz antileptospirových protilátek mikroskopickým aglutinačním testem (MAT) (Průkaz AB Leptospira MAT ) Stanovení protilátek proti Toxoplasma gondii komplementfixační reakcí (Anti-Toxoplasma gondii KFR) Stanovení protilátek proti Toxoplasma gondii tříd IgA, IgE, IgG a IgM metodou ELISA ( Anti- Toxoplasma gondii ELISA IgG, IgM, IgA, IgE ) Stanovení avidity protilátek IgG proti Toxoplasma gondii modifikovanou metodou ELISA (Stanovení avidity Toxoplasma gondii IgG ) Analýza protilátek proti Toxoplasma gondii metodou Western blot ( Anti-Toxoplasma gondii WB IgG ) SOP-NRL/CHLA-03 SOP-NRL/CHLA-04 SOP-NRL/CHLA-14 SOP-NRL/CHLA-15 SOP-NRL/LEPT-01 SOP-NRL/TOX-01 SOP-NRL/TOX-02 SOP-NRL/TOX-03 SOP-NRL/TOX-04 Lidské uretrální, cervikální, nasofaryngeální výtěry, konjunktivální výtěry, BAL, sputum, IVD IVD Lidská moč, uretrální, cervikální, nasofaryngeální výtěry, konjunktivální výtěry, bronchoalveolární laváž -BAL, sputum, kloubní výpotky, plná krev, likvor, IVD Lidská moč, cervikální výtěry, IVD Lidská krev, sérum, mozkomíšní mok Lidské nebo zvířecí sérum, lidská plazma, mozkomíšní mok, plodová voda, oční tekutina, sérum zvířete, na kterém byl proveden izolační pokus ( viz. zkouška 77), IVD mozkomíšní mok, plodová voda, oční tekutina, IVD IVD mozkomíšní mok, plodová voda, oční tekutina

9 Strana: 9 toxoplasmosu NRL Státní sbírka typových kultur stafylokoky salmonely E.coli a shigely yersinie Průkaz Toxoplasma gondii na laboratorních zvířatech sérologicky a mikroskopicky (Průkaz Toxoplasma gondii na zvířeti) SOP-NRL/TOX-05 mok, plodová voda, oční tekutina, bioptický či sekční materiál Lyofilizáty kmenů bakterií nebo jejich směsí pro EHK Kmeny stafylokoků Zkouška životnosti bakteriálních kmenů po SOP-NRL/CNCTC-01 lyofilizačním procesu Identifikace kmenů rodu Staphylococcus SOP-NRL/ST-04 biochemickými testy (Identifikace bioch. testy) Identifikace kmenů rodu Staphylococcus SOP-NRL/ST-04 Kmeny stafylokoků biochemickými testy (Identifikace bioch. testy) Průkaz faktorů virulence u kmenů S.aureus SOP-NRL/ST-05 Kmeny stafylokoků fenotypovými metodami (Faktory virulence) Fagotypizace kmenů S.aureus (Fagotypizace) SOP-NRL/ST-06 Kmeny stafylokoků, fágy Průkaz genů kódujících produkci enterotoxinů SOP-NRL/ST-45 Kmeny Staphylococcus (sea, seb, sec, sed, see, seg, seh, sei, sej), aureus exfoliativních toxinů (eta, etb, etd), toxinu syndromu toxického šoku (tst), Pantonova- Valentinova leukocidinu (luks-pv, lukf-pv) u kmenů S. aureus metodou PCR (PCR průkaz genů toxinů S.aureus) Identifikace kmenů rodu Salmonella aglutinační SOP-NRL/SA-04 metodou Identifikace kmenů rodu Salmonella SOP-NRL/SA-05 biochemickými testy Identifikace kmenů rodů Escherichia, Shigella a SOP-NRL/ECS-04 ostatních rodů z čeledi Enterobacteriaceae biochemickými testy (ECS biochemické testy) Identifikace kmenů rodů Escherichia a Shigella SOP-NRL/ECS-06 aglutinační metodou zjišťování somatického a bičíkového antigenu sklíčkovou aglutinací (ECSsérotypizace sklíčkovou aglutinací) Identifikace kmenů Escherichia coli aglutinační SOP-NRL/ECS-20 metodou zjíštění produkce Shiga toxinů a termolabilního enterotoxinu metodou RPLA (ECS- produkce toxinů RPLA) Identifikace kmenů rodu Vibrio biochemickými SOP-NRL/ECS-07 testy (VIB-biochemické testy) Identifikace kmenů Vibrio cholerae aglutinační SOP-NRL/ECS-08 metodou (VIB-sérotypizace sklíčkovou sklíčkovou aglutinací) Průkaz genů kódujících produkci Shiga toxinů SOP-NRL/ECS-51 (stx 1, stx 2 ), EHEC-hemolyzinu (EHEC-hlyA) a O- antigenů (rfbe O157, O26wzy) u kmenů E. coli metodou PCR (PCR průkaz genů Shiga toxinů) Identifikace kmenů rodu Yersinia biochemickými SOP-NRL/YE-04 testy (YE- biochemické testy) Identifikace kmenů Yersinia enterocolitica SOP-NRL/YE-05 sklíčkovou aglutinací (YE- sérotypizace sklíčkovou aglutinací) Kmeny salmonel Kmeny salmonel Bakteriální kmen Bakteriální kmen Bakteriální kmen Bakteriální kmen Vibrio sp. Bakteriální kmen Vibrio cholerae Kmeny Escherichia coli Bakteriální kmen Yersinia sp. Bakteriální kmen Yersinia enterocolitica

10 Strana: 10 Laboratoř pro tkáňové kultury syfilis Zkouška životnosti a růstových vlastností buněčných linií kultivací a barvením (Životnost a růstové vlastnosti) Zkouška sterility buněčných linií kultivací (Sterilita) Stanovení anti-kardiolipinových protilátek flokulačně (VDRLmikro/RPR) Stanovení anti-treponemových protilátek metodou nepřímé pasivní aglutinace na nosičích (TPHA/TP-PA) Stanovení anti-treponemových protilátek metodou EIA Stanovení antigenu Treponema pallidum subsp. pallidum metodou imunofluorescence (DFA-TP) Stanovení anti-treponemových protilátek metodou imunofluorescence (FTA-ABS) Stanovení anti-treponemových protilátek metodou western blot Stanovení anti-treponemových protilátek ve tř. IgM metodou Solid phase haemadsorption (SPHA) SOP-LTK-01 SOP-LTK-04 SOP-NRL/SYF-02 SOP-NRL/SYF-03 Kultury buněčných linií Kultury buněčných linií mozkomíšní mok, IVD mozkomíšní mok, IVD SOP-NRL/SYF-04 mozkomíšní mok, IVD SOP-NRL/SYF-01 Lidský mozkomíšní mok, jiný biologický materiál, IVD SOP-NRL/SYF-05 mozkomíšní mok, IVD SOP-NRL/SYF-07 SOP-NRL/SYF-06 mozkomíšní mok, IVD mozkomíšní mok, IVD # Vysvětlivky: dezinfekční účinnost: účinnost baktericidní, sporicidní, fungicidní (mikroskopické kvasinkovité a vláknité houby) a virucidní (modelový malý neobalený virus) FDA - Food and Drug Administration USA DGHM - Die Deutsche Gesellschaft für Hygiene und Mikrobiologie RFLP restriction fragment length polymorphism Odběr primárních vzorků: Odběrové místo: Zdravotnické zařízení pro děti a dorost, Jičínská 10, Praha 3 Pořadové číslo Přesný název postupu odběru vzorku 1 Odběr klinických materiálů (nazofaryngeální výtěr) Identifikace Pořadová Druh odebíraného postupu odběru vzorku čísla postupů vzorku vyšetření SOP/V-NRL/NCH-10 Vyšetřovaný pacient 50,51,53,55,90