Obecná odpověď na stres
|
|
- Antonie Pavlíková
- před 8 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 Obecná odpověď na stres Odpověď na stres Gram-pozitivních bakterií Bakteriální sporulace Odpověď na stres Gram-negativních bakterií Dlouhodobé přežívání Bakteriální kompetence Mezibuněčná komunikace
2 Typy stresů Zvýšená teplota Hsp Snížená teplota Cold shock proteins Oxidativní stres Hladovění stringentní odpověď Post diauxický stres Zvýšená acidita Poškození DNA
3
4 Mechanismus přežití u Gram-negativních mikroorganismů 1985 Xu et al. Escherichia coli, Vibrio cholerae živé ale nekultivovatelné v vodním prostředí (ústí řek, mořská voda). Odpověď na hladovění stav, kdy organismus není zjistitelný standardní kultivační technikou (cfu). jsou zjistitelné mikroskopicky mají zachovanou membránovou integritu schopnost průniku do eukaryotních buněk mají zvýšenou odolnost k environmentálním vlivům změněný profil bílkovin
5 Charakteristika VBNC Gram-negativní bakterie jsou známé schopností přežívat jako živé ale nekultivovatelné buňky (VBNC), kdy nerostou na konvenčních mediích,ale zůstávají neporušené se zachovalou životaschopností. Tento jev byl pozorován mnoha způsoby a zdá se být analogický sporulaci Gram-pozitivních bakterií. Přítomnost spoo-like genů u Vibrio cholerae a Escherichia coli byla zkoumaná pomocí polymerasové řetězové reakce za užití primerů odvozených z konservovaných oblastí spooa a spoof genů Bacillus subtilis.
6 Charakteristika VBNC Nebyly identifikovány oblasti u V. cholerae nebo E. coli které by vykazovaly komplexní homologii k spoo genům z B. subtilis a proto se soustředili na alternativní přístup mutagenese transposonu. Více než 2,500 transposonových mutant V. cholerae bylo testováno za nutričního limitu v umělé mořské vodě na VBNC odpověď, a porovnáno s divokým kmenem. Mutant JR09H1 vstupoval do VBNC rychleji než divoký kmen a to jak př 25 o C a 4 o C.
7 Cold shock response E. coli Změna z 37 na 10 o C zástava růstu a po 4 5 h snížení počtu syntetizovaných proteinů. Kromě toho se v tomto období tvoří nové cold shock response proteiny. Jsou to CS7.4, NusA, RecA, H-NS, polynukleotidfosforylasa, faktor iniciace translace 2β a 2α, pyruvát dehydrogenasa. Podjednotka A DNA gyrasy byla identifikovaná jako cold shock protein. Změna ve složení lipidů cytoplasmatické membrány.
8 Adaptační systémy bakterií Se vznikem kyslíkové atmosféry rozdělení organismů na anaeroby nemají mechanismy na likvidaci superoxid aniontů. Aerobní organismy získaly ochranné mechanismy: Superoxid dismutasa SOD Katalasa Alkyl hydroperoxid reduktasa
9
10 Oxidační stres nerovnováha mezi oxidačním a antioxidačním systémem vede k závažným poškození buněk tvorba volných radikálů- endogenní - exogenní
11 Oxidativní stres Za aerobních podmínek organismy čelí tvorbě různých typů ROS. Tvoří se metabolismem, respirací β-oxidací mastných kyselin, po účinku peroxidu, nebo těžkých kovů. 2 rozměrná ELFO proteinů exprese je ovlivněna H 2 O 2 nebo menadionem (u kvasinek).
12 Oxidativní stres u mikroorganismů Obecná odpověď na stres systém regulující koordinovanou indukci více stresových genů pomocí společného cis elementu součást jejich promotorů Stress response element - STRE camp protein kinasa A - PKA STRE sekvence AGGGG celkem 186 genů STRE je funkční v obou orientacích CCCCT nebo AGGGG
13 Volné radikály nestabilní částice jeden nebo více nepárových elektronů krátký poločas rozpadu řetězová reakce- iniciace - propagace - terminace
14 Aktivní formy kyslíku ( ROS = reactive oxygen species) hlavní sloučenina - molekulární kyslík O 2 konečný akceptor elektronů v KDŘ přeměna O 2 na H 2 O- cytochromoxidasa čtyřkroková přeměna Singletový Superoxid Hydroxidový kyslík anion 1 O 2 1 O 2 - O 2 OH O:O O:O: :O:O :O:H pka = 4, H H H O:O H:O:O H:O:O:H e - O 2 HO 2 O:H H:O:H e - e - e - H 2 O 2 HO H 2 O Základní stav Hydrogen- Peroxid Hydroxylový Voda kyslíku hyperoxidový vodíku radikál radikál
15 Půbení antioxidantů na ROS
16 Typy stresů
17 Escherichia coli První sensor pro peroxid OxyR regulon Obsahuje geny pro metabolismus peroxidu: katg, ahpc, ahpf, dps, dále pro redox rovnováhu: gor, grxa, trxc a malou RNA oxys.
18 Oxidativní stres aktivuje OxyR tvorbou disulfidických vazeb.oxyr spouští expresi enzymů s redukčním účinkem na disulfidické vazby.
19 Antioxidační systém organismu enzymový systém: superoxiddismutasa ( SOD) katalasa ( CAT) glutathionperoxidasa ( GSHPx) neenzymový systém ( zhášeče): kys. askorbová (vit. C) - tokoferol ( vit. E) - karoten ( vit. A) glutathion...
20 Hlavní signální dráhy aktivované oxidativním stresem
21 Další složky antioxidační obrany Glutathion Gsh1p hypersensitivita k H2O2 Thioredoxin Trx1p/Trx2p totéž + defekt v buň.c. Glutaredoxin Glx1p Superoxide dismutasa Sod1p
22 Post Diauxic Shift Podobný cis regulující prvek identifikován v promotoru SSA3 genu. Tento úsek, jehož sekvence se podobají STRE (T/AAGGGA) je také regulován camp PKA drahou byl označen jako post-diauxic shift PDS. Oba elementy jsou však regulovány rozdílně, neboť PDS působí pouze malé zvýšení exprese jako odpověď na heat-shock, je necitlivý k osmotickému stresu a není ovlivněn mutacemi.
23 Pathogenní odpověď na stres Nutriční stres limitace Fe Exprese bakteriálních proteinů jako odpověď na tkáň hostitele Environmentální kontrola exprese genů pro bičíky (pilus gene) Teplotní regulace bakteriální virulence
24 δ E Uplatňuje se při expresi syntézy alginátu u Pseudomonas aeruginosa, u pacientů s cystickou fibrozou.
25 δ E závislá extracytoplasmatická odpověď na stres δ E je vázán antisigma faktorem RseA. RseB se váže na periplasmatickou doménu RseA a ochraňuje před proteolýzou.
26 δ E odpověď na stres Nesložené OMP aktivují proteasu DegS, která štěpí periplasmatické domény RseA. Částečně degradovaný RseA je substrátem pro RseP. RseP dále štěpí RseA a uvoňuje cytoplasmatické domény RseA navázané na δ E. Zbývající domény RseA jsou pak degradovány ClpXP a tak uvolní δ E ta pak interaguje s RNA polymerasou a řídí transkripci do regulonu. Hlavní skupiny známých genů δ E regulonu jsou ukázány. Alarmon ppgpp a protein DksA může aktivovat δe dependentní transkripci.
27 Vliv δe na buněčné obaly
28 Defekty buněčných obalů Kultury SEA007 SEA008 byly obdobně kultivovány. Vzorky se odebíraly po 2.5 h po indukci overexprese rsea a rseb ( A D). Zobrazení živých buněk za různých typů mikroskopie: DIC diferenciální interferenční mikroskopii, sloupec 1, fluorescenční mikroskopie, sloupec 2, - vizualizace membrán; barvení DAPI, sloupec 3 vizualizace DNA, exprese YFP vizualizace cytoplasmy( zeleně) slouipec 4. A kontrolní kmen δe není inhibovaná B a C δe je inhibovaná, bleby buněk
29 Definice acidického stresu Kombinovaný biologický účinek nízkého ph a slabých (organických) kyselin v prostředí Slabé kyseliny: těkavé mastné kyseliny jako butyrát, propionát a acetát Nenabité, protonované slabé kyseliny difundují přes membránu a disociují až v cytoplasmě, kde snižují ph Čím nižší je vnější ph, tím více slabých kyselin bude protonováno ( podle pka hodnot) atím více jich bude procházet membránou K usmrcení buněk při ph 3,5 je potřeba méně slabých org. kyselin, než při ph 4,5
30
31 Acid Tolerance Response
32
33
34
35
36
37
38 Obecná odpověď na stres u E. coli Spouští se mnoha typy stresů: hladovění, vysoký osmotický tlak, vysoká nebo nízká teplota, nízké ph Odpověď ve stavu nouze (emergency) a dlouhodobý program adaptace na hladovění Brání buňku před zánikem, menší vliv na opravy Akumulace δ S (RpoS): hlavní regulátor této odpovědi Více než 50 genů je indukováno tvoří δ S regulon
39
40 Listeria monocytogenes Jako odpověď na zvýšenou teplotu hsp, Geny: groesl, dnak, clpb, clpc, clpe, htra posilují virulenci Acid stres geny: gadd1t1, gadd2t2, gadd3, arcb,lmo0038, arca, atpi - posilují virulenci Osmotický stres geny: htra, kdpe, lisrk, prob, btla - posilují virulenci Bet, gbu - neovlivňují virulenci
41 SOS odpověď na poškození DNA Mikroby jsou pravidelně vystavovány působení celé řady faktorů prostředí, které poškozují jejich DNA. Toto poškození vede k reca lexa závislé indukci celé řady genů. Poškození DNA vyvolá expresi minimálně 20 genů, které nejsou spolu ve vazbě. Několik typů posttranslačních mechanismů se také účastní koordinace odpovědi na stres. LexA protein má funkci represoru genů náležejících do SOS regulonu. Signálem poškození DNA je utvoření nukleoproteinového vlákna RecA/ssDNA. Geny podléhající SOS kontrole byly identifikovány pomocí nahodile generovaných transkripčních fuzí.
42 SOS odpověď První experimentální podpora existence induktivního systému oprav DNA u Escherichia coli byla nalezena před 30 lety Miroslavem Radmanem, který zavedl termín SOS response pro popis celého řetězce událostí. Dva proteiny hrají klíčové role v regulaci SOS odpovědi: represor nazývaný LexA a induktor, RecA vlákno. Během normálního růstu LexA represor se váže na specifické sekvence SOS boxu, přítomného v promotorové oblasti SOS genů a tak zabraňuje jejich expresi. Za normálních růstových podmínek jsou SOS geny diferenciálně reprimované. Stupeň represe závisí na přesné sekvenci jejich SOS boxů (oblast promotoru, která je rozpoznávaná LexA), na jejich pozici v promotorové oblasti, a na síle promoteru.
43
44 Mechanismy, které má buňka k dispozici pro opravu poškozené DNA Excisní mechanismy opravy chybných nukleotidů:uvra, UvrB, UvrC, UvrD, DNA polyme- rasa I, DNA ligasa Kontrola dělení buňky po poškození DNA: SulA in- hibuje buněčné dělení vazbou na FtsZ. Přídavné mechanismy pro kontrolu replikační vidličky: u E.coli změna DNA polymerasy III na UmuD DNA polymerasu.
45
46
47 Aktivace SOS genů Poškození DNA vyvolává akumulaci jednovláknové DNA ssdna (single strand) RecA protein tvoří vlákno kolem ssdna, je závislý na ATP a tak se aktivuje. Aktivovaná forma RecA působí jako ko-proteasa při autokatalytickém štěpení LexA proteinu (represor)
48 Jakmile je pool LexA snížen, represe SOS genů ustává v závislosti na afinitě jejich SOS boxů k LexA. Tímto způsobem se postupně aktivují různé geny. Geny jejichž operátor má velmi slabou afinitu k LexA jsou plně exprimovány jako první. Geny se slabým SOS boxem jako jsou lexa, reca, uvra, uvrb, uvrd jsou plně indukovány i po slabém ošetření vyvolávajícím SOS odpověď. Dále jsou na řadě geny se silnějším SOS boxem: sula, umud,umuc. SulA zastavuje buněčné dělení - vznik vláken.
49
50
Abiotický stres - sucho
FYZIOLOGIE STRESU Typy stresů Abiotický (vliv vnějších podmínek) sucho, zamokření, zasolení půd, kontaminace prostředí toxickými látkami, chlad, mráz, vysoké teploty... Biotický (způsobený jiným druhem
VíceZáklady molekulární biologie KBC/MBIOZ
Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ Mária Čudejková 2. Transkripce genu a její regulace Transkripce genetické informace z DNA na RNA Transkripce dvou genů zachycená na snímku z elektronového mikroskopu.
VíceMetabolismus, taxonomie a identifikace bakterií. Karel Holada khola@lf1.cuni.cz
Metabolismus, taxonomie a identifikace bakterií Karel Holada khola@lf1.cuni.cz Klíčová slova Obligátní aeroby Obligátní anaeroby Aerotolerantní b. Fakultativní anaeroby Mikroaerofilní b. Kapnofilní bakterie
VícePivovarské kvasinky a reakce na stres
Pivovarské kvasinky a reakce na stres K. Sigler 1, D. Matoulková 2 1 Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i., Praha 2 Výzkumný ústav pivovarský a sladařský, a.s. Praha Stresy působící na kvasinky během pivovarského
Více2. Z následujících tvrzení, týkajících se prokaryotické buňky, vyberte správné:
Výběrové otázky: 1. Součástí všech prokaryotických buněk je: a) DNA, plazmidy b) plazmidy, mitochondrie c) plazmidy, ribozomy d) mitochondrie, endoplazmatické retikulum 2. Z následujících tvrzení, týkajících
VíceMOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE PROKARYOT
Informační makromolekuly MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE PROKARYOT Funkce a syntéza informačních makromolekul Regulace metabolické aktivity Nukleové kyseliny Proteiny Pořadí monomerních jednotek nese genetickou informaci
Více19.b - Metabolismus nukleových kyselin a proteosyntéza
19.b - Metabolismus nukleových kyselin a proteosyntéza Proteosyntéza vyžaduje především zajištění primární struktury. Informace je uložena v DNA (ev. RNA u některých virů) trvalá forma. Forma uskladnění
VíceExprese genetického kódu Centrální dogma molekulární biologie DNA RNA proteinu transkripce DNA mrna translace proteosyntéza
Exprese genetického kódu Centrální dogma molekulární biologie - genetická informace v DNA -> RNA -> primárního řetězce proteinu 1) transkripce - přepis z DNA do mrna 2) translace - přeložení z kódu nukleových
VíceStruktura a funkce biomakromolekul
Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL 10. Struktury signálních komplexů Ivo Frébort Typy hormonů Steroidní hormony deriváty cholesterolu, regulují metabolismus, osmotickou rovnováhu, sexuální funkce
VíceMnohobuněčné kvasinky
Laboratoř buněčné biologie PROJEKT Mnohobuněčné kvasinky Libuše Váchová ve spolupráci s laboratoří Prof. Palkové (PřFUK) Do laboratoře přijímáme studenty se zájmem o vědeckou práci Kontakt: vachova@biomed.cas.cz
VíceBuněčný cyklus. Replikace DNA a dělení buňky
Buněčný cyklus Replikace DNA a dělení buňky 2 Regulace buněčného dělení buněčný cyklus: buněčné dělení buněčný růst kontrola kvality potomstva (dceřinných buněk) bránípřenosu nekompletně zreplikovaných
VíceStruktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL
Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL 2. Posttranslační modifikace a skládání proteinů Ivo Frébort Biosyntéza proteinů Kovalentní modifikace proteinů Modifikace proteinu může nastat předtím než je
VíceLékařská chemie a biochemie modelový vstupní test ke zkoušce
Lékařská chemie a biochemie modelový vstupní test ke zkoušce 1. Máte pufr připravený smísením 150 ml CH3COOH o c = 0,2 mol/l a 100 ml CH3COONa o c = 0,25 mol/l. Jaké bude ph pufru, pokud přidáme 10 ml
VíceStruktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL
Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL 2. Posttranslační modifikace a skládání proteinů Ivo Frébort Biosyntéza proteinů Kovalentní modifikace proteinů Modifikace proteinu může nastat předtím než je
VíceZdrojem je mrna. mrna. zpětná transkriptáza. jednořetězcová DNA. DNA polymeráza. cdna
Obsah přednášky 1) Klonování složených eukaryotických genů 2) Úprava rekombinantních genů 3) Produkce rekombinantních proteinů v expresních systémech 4) Promotory 5) Vektory 6) Reportérové geny Zdrojem
VíceEvropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Vztah struktury a funkce nukleových kyselin. Replikace, transkripce
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti Vztah struktury a funkce nukleových kyselin. Replikace, transkripce Nukleová kyselina gen základní jednotka informace v živých systémech,
VíceÚvod do mikrobiologie
Úvod do mikrobiologie 1. Lidské infekční patogeny Subcelulární Prokaryotické o. Eukaryotické o. Živočichové Priony Chlamydie Houby Červi Viry Rickettsie Protozoa Členovci Mykoplasmata Klasické bakterie
VíceAntioxidanty vs. volné radikály
Antioxidanty vs. volné radikály Souboj dobra a zla? Jana Kubalová Brainstorming Volné radikály Antioxidanty Volné radikály jakákoliv molekula, atom nebo ion s nepárovými elektrony ve valenční vrstvě vzniká
VíceHořčík. Příjem, metabolismus, funkce, projevy nedostatku
Hořčík Příjem, metabolismus, funkce, projevy nedostatku Příjem a pohyb v rostlině Příjem jako ion Mg 2+, pasivní, iont. kanály Mobilní ion v xylému i ve floému, možná retranslokace V místě funkce vázán
VíceGenetika bakterií. KBI/MIKP Mgr. Zbyněk Houdek
Genetika bakterií KBI/MIKP Mgr. Zbyněk Houdek Bakteriofágy jako extrachromozomální genomy Genom bakteriofága uvnitř bakterie profág. Byly objeveny v bakteriích už v r. 1915 Twortem. Parazitické org. nemají
VíceRegulace metabolických drah na úrovni buňky
Regulace metabolických drah na úrovni buňky EB Obsah přednášky Obecné principy regulace metabolických drah na úrovni buňky regulace zajištěná kompartmentací metabolických dějů změna absolutní koncentrace
VíceMolekulární základy dědičnosti. Ústřední dogma molekulární biologie Struktura DNA a RNA
Molekulární základy dědičnosti Ústřední dogma molekulární biologie Struktura DNA a RNA Ústřední dogma molekulární genetiky - vztah mezi nukleovými kyselinami a proteiny proteosyntéza replikace DNA RNA
VíceStanovení biomarkerů oxidativního stresu u kapra obecného (Cyprinus carpio L.) po dlouhodobém působení simazinu Hlavní řešitel Ing.
Stanovení biomarkerů oxidativního stresu u kapra obecného (Cyprinus carpio L.) po dlouhodobém působení simazinu Hlavní řešitel Ing. Alžběta Stará Vedoucí projektu dr. hab. Ing. Josef Velíšek, Ph.D. 1 Úvod
VíceBuněčný cyklus a molekulární mechanismy onkogeneze
Buněčný cyklus a molekulární mechanismy onkogeneze Imunofluorescence DAPI Přehled regulace buněčného cyklu Základní terminologie: Cycliny evolučně konzervované proteiny s homologními oblastmi; jejich
VíceBAKTERIÁLNÍ GENETIKA. Lekce 12 kurzu GENETIKA Doc. RNDr. Jindřich Bříza, CSc.
BAKTERIÁLNÍ GENETIKA Lekce 12 kurzu GENETIKA Doc. RNDr. Jindřich Bříza, CSc. -dědičnost u baktérií principiálně stejná jako u komplexnějších organismů -genom haploidní a značně menší Bakteriální genom
VíceBUŇEČNÝ CYKLUS A JEHO KONTROLA
BUŇEČNÝ CYKLUS A JEHO KONTROLA MITOSA - fáze: Profáze - kondensace chromosomů - 30 nm chromatine fibres vázané na matrix Rozpad Metafáze - párové ( sesterské ) chromatidy - vázané centromerou, seřazené
VíceZÁKLADY BAKTERIÁLNÍ GENETIKY
Zdroj rozmanitosti mikrorganismů ZÁKLADY BAKTERIÁLNÍ GENETIKY Různé sekvence nukleotidů v DNA kódují různé proteiny Různé proteiny vedou k různým organismům s různými vlastnostmi Exprese genetické informace
Víceve srovnání s eukaryoty (životnost v řádu hodin) u prokaryot kratší (životnost v řádu minut) na životnost / stabilitu molekuly mají vliv
Urbanová Anna ve srovnání s eukaryoty (životnost v řádu hodin) u prokaryot kratší (životnost v řádu minut) na životnost / stabilitu molekuly mají vliv strukturní rysy mrna proces degradace každá mrna v
VíceCo nás učí nádory? Prof. RNDr. Jana Šmardová, CSc. Ústav patologie FN Brno Přírodovědecká a Lékařská fakulta MU Brno
Co nás učí nádory? Prof. RNDr. Jana Šmardová, CSc. Ústav patologie FN Brno Přírodovědecká a Lékařská fakulta MU Brno Brno, 17.5.2011 Izidor (Easy Door) Osnova přednášky 1. Proč nás rakovina tolik zajímá?
VíceStárnutí organismu Fyziologické hodnoty odchylky během stárnutí
Stárnutí organismu Stárnutí organismu Fyziologické hodnoty odchylky během stárnutí poklesy funkcí se liší mezi orgánovými systémy Některé projevy stárnutí ovlivňuje výživa Diagnostické metody odlišují
VíceBakteriální transpozony
Bakteriální transpozony Transpozon = sekvence DNA schopná transpozice, tj. přemístění z jednoho místa v genomu do jiného místa Transpozice = proces přemístění transpozonu Transponáza (transpozáza) = enzym
VíceKontrola genové exprese
Základy biochemie KBC/BC Kontrola genové exprese Inovace studia biochemie prostřednictvím e-learningu CZ.04.1.03/3.2.15.3/0407 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem
VíceNukleové kyseliny. DeoxyriboNucleic li Acid
Molekulární lární genetika Nukleové kyseliny DeoxyriboNucleic li Acid RiboNucleic N li Acid cukr (deoxyrobosa, ribosa) fosforečný zbytek dusíkatá báze Dusíkaté báze Dvouvláknová DNA Uchovává genetickou
VíceDYNAMIKA BAKTERIÁLNÍHO RŮSTU
Úvod DYNAMIKA BAKTERIÁLNÍHO RŮSTU Bakterie mohou přežívat za velice rozdílných podmínek prostředí Jednotlivé druhy však rostou za limitovaných podmínek prostředí Bakteriální kolonie V přírodě existují
VíceKatabolismus - jak budeme postupovat
Katabolismus - jak budeme postupovat I. fáze aminokyseliny proteiny polysacharidy glukosa lipidy Glycerol + mastné kyseliny II. fáze III. fáze ETS itrátový cyklus yklus trikarboxylových kyselin, Krebsův
VíceIV117: Úvod do systémové biologie
IV117: Úvod do systémové biologie David Šafránek 29.10.2008 Obsah Spojitý deterministický model transkripční regulace Obsah Spojitý deterministický model transkripční regulace Schema transkripční regulace
VíceToxické látky v potravinách s nebezpečím onkologické aktivace
Toxické látky v potravinách s nebezpečím onkologické aktivace Doc. MUDr. Pavel Dlouhý, Ph.D. Ústav hygieny 3. LF UK, Praha Rizikové faktory pro vznik nádorů Obezita Nadměrný příjem tuků? Nadměrná konzumace
VíceToxikologie PřF UK, ZS 2016/ Toxikodynamika I.
Toxikodynamika toxikodynamika (řec. δίνευω = pohánět, točit) interakce xenobiotika s cílovým místem (buňkou, receptorem) biologická odpověď jak xenobiotikum působí na organismus toxický účinek nespecifický
VíceGlobální pohled na průběh replikace dsdna
Globální pohled na průběh replikace dsdna 3' 5 3 vedoucí řetězec 5 3 prodlužování vedoucího řetězce (polymerace ) DNA-ligáza směr pohybu enzymů DNA-polymeráza I DNA-polymeráza III primozom 5' 3, 5, hotový
VíceNUKLEOVÉ KYSELINY. Základ života
NUKLEOVÉ KYSELINY Základ života HISTORIE 1. H. Braconnot (30. léta 19. století) - Strassburg vinné kvasinky izolace matiére animale. 2. J.F. Meischer - experimenty z hnisem štěpení trypsinem odstředěním
VíceVýzkumný ústav veterinárního lékařství v Brně
LIPIDY: FUNKCE, IZOLACE, SEPARACE, DETEKCE FOSFOLIPIDY chemické složení a funkce v buněčných membránách; metody stanovení fosfolipidů fosfolipázy - produkty reakcí (ceramid, DAG = 2nd messengers) a stanovení
VíceStruktura a funkce biomakromolekul
Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL 7. Interakce DNA/RNA - protein Ivo Frébort Interakce DNA/RNA - proteiny v buňce Základní dogma molekulární biologie Replikace DNA v E. coli DNA polymerasa a
VíceBUŇKA ZÁKLADNÍ JEDNOTKA ORGANISMŮ
BUŇKA ZÁKLADNÍ JEDNOTKA ORGANISMŮ SPOLEČNÉ ZNAKY ŽIVÉHO - schopnost získávat energii z živin pro své životní potřeby - síla aktivně odpovídat na změny prostředí - možnost růstu, diferenciace a reprodukce
VíceHořčík. Příjem, metabolismus, funkce, projevy nedostatku
Hořčík Příjem, metabolismus, funkce, projevy nedostatku Příjem a pohyb v rostlině Příjem jako ion Mg 2+, pasivní, iont. kanály Mobilní ion v xylému i ve floému, možná retranslokace V místě funkce vázán
VíceAnaerobní mikrobiální procesy - teorie, praxe a potenciál pro bioremediace ANAEROBNÍ LABORATOŘ. Metabolismus. Respirace. Fermentace.
Anaerobní mikrobiální procesy - teorie, praxe a potenciál pro Praxe I ANAEROBNÍ Praxe II LABORATOŘ Sanační technologie, 2013 Ipsum CNP zdroje Dolor Redfield Sit praxe Amet Proces látkové a energetické
VícePříběh pátý: Auxinová signalisace
Příběh pátý: Auxinová signalisace Co je auxin? Derivát tryptofanu Příbuzný serotoninu a melatoninu Všechny deriváty přítomny jak u živočichů, tak u rostlin IAA Serotonin Serotonin: antagonista auxinu Přítomen
VíceRadiobiologický účinek záření. Helena Uhrová
Radiobiologický účinek záření Helena Uhrová Fáze účinku fyzikální fyzikálně chemická chemická biologická Fyzikální fáze Přenos energie na e Excitace molekul, ionizace Doba trvání 10-16 - 10-13 s Fyzikálně-chemická
VíceMikrobiologické zkoumání potravin. Zákonitosti růstu mikroorganismů v přírodním prostředí, vliv fyzikálních faktorů na růst mikroorganismů
Mikrobiologické zkoumání potravin Zákonitosti růstu mikroorganismů v přírodním prostředí, vliv fyzikálních faktorů na růst mikroorganismů Potravinářská mikrobiologie - historie 3 miliardy let vývoj prvních
VíceRich Jorgensen a kolegové vložili gen produkující pigment do petunií (použili silný promotor)
RNAi Rich Jorgensen a kolegové vložili gen produkující pigment do petunií (použili silný promotor) Místo silné pigmentace se objevily rostliny variegované a dokonce bílé Jorgensen pojmenoval tento fenomén
VíceZTOX / Základy Toxikologie. Radim Vrzal
ZTOX / Základy Toxikologie Radim Vrzal I. Autobrewery syndrome (Gut fermentation syndrome, Endogennous ethanol fermentation) Bylo nebylo 23.9.2013 Muž měl unikátní chorobu, jeho tělo si samo vyrábělo alkohol
VíceDYNAMIKA BAKTERIÁLNÍHO RŮSTU
Úvod DYNAMIKA BAKTERIÁLNÍHO RŮSTU Bakterie mohou přežívat za velice rozdílných podmínek prostředí Jednotlivé druhy však rostou za limitovaných podmínek prostředí Bakteriální kolonie V přírodě existují
VíceMechanismy hormonální regulace metabolismu. Vladimíra Kvasnicová
Mechanismy hormonální regulace metabolismu Vladimíra Kvasnicová Osnova semináře 1. Obecný mechanismus působení hormonů (opakování) 2. Příklady mechanismů účinku vybraných hormonů na energetický metabolismus
VíceZáklady molekulární biologie KBC/MBIOZ
Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ Mária Majeská Čudejková 3. Proteosyntéza Centrální dogma molekulární biologie Rozluštění genetického kódu in vitro Marshall Nirenberg a Heinrich Matthaei zjistili,
VíceBi8240 GENETIKA ROSTLIN
Bi8240 GENETIKA ROSTLIN Prezentace 07 Rezistence rostlin k abiotickým faktorům doc. RNDr. Jana Řepková, CSc. repkova@sci.muni.cz Abiotické faktory 1. Nízké teploty ( chladuvzdornost, mrazuvzdornost, zimovzdornost)
VíceInovace profesní přípravy budoucích učitelů chemie
Inovace profesní přípravy budoucích učitelů chemie I n v e s t i c e d o r o z v o j e v z d ě l á v á n í CZ.1.07/2.2.00/15.0324 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem
VíceAMPK AMP) Tomáš Kuc era. Ústav lékar ské chemie a klinické biochemie 2. lékar ská fakulta, Univerzita Karlova v Praze
AMPK (KINASA AKTIVOVANÁ AMP) Tomáš Kuc era Ústav lékar ské chemie a klinické biochemie 2. lékar ská fakulta, Univerzita Karlova v Praze 2013 AMPK PROTEINKINASA AKTIVOVANÁ AMP přítomna ve všech eukaryotních
VíceIV117: Úvod do systémové biologie
IV117: Úvod do systémové biologie David Šafránek 3.12.2008 Obsah Obsah Robustnost chemotaxe opakování model chemotaxe bakterií nerozliseny stavy aktivity represoru aktivita = ligandy a konc. represoru
VíceMolekulárn. rní. biologie Struktura DNA a RNA
Molekulárn rní základy dědičnosti Ústřední dogma molekulárn rní biologie Struktura DNA a RNA Ústřední dogma molekulárn rní genetiky - vztah mezi nukleovými kyselinami a proteiny proteosyntéza replikace
VíceBílkoviny a rostlinná buňka
Bílkoviny a rostlinná buňka Bílkoviny Rostliny --- kontinuální diferenciace vytváření orgánů: - mitotická dělení -zvětšování buněk a tvorba buněčné stěny syntéza bílkovin --- fotosyntéza syntéza bílkovin
VíceMIKROBIOLOGIE V BIOTECHNOLOGII
Biotechnologie MIKROBIOLOGIE V BIOTECHNOLOGII Využití živých organismů pro uskutečňování definovaných chemických procesů pro průmyslové nebo komerční aplikace Organismus je geneticky upraven metodami genetického
VíceBiologie buňky. systém schopný udržovat se a rozmnožovat
Biologie buňky 1665 - Robert Hook (korek, cellulae = buňka) Cytologie - věda zabývající se studiem buňek Buňka ozákladní funkční a stavební jednotka živých organismů onejmenší známý uspořádaný dynamický
VíceBuněčné dýchání Ch_056_Přírodní látky_buněčné dýchání Autor: Ing. Mariana Mrázková
Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.1.38/02.0025 Název projektu: Modernizace výuky na ZŠ Slušovice, Fryšták, Kašava a Velehrad Tento projekt je spolufinancován z Evropského sociálního fondu a státního
VíceChemie nukleotidů a nukleových kyselin. Centrální dogma molekulární biologie (existují vyjímky)
Chemie nukleotidů a nukleových kyselin Centrální dogma molekulární biologie (existují vyjímky) NH 2 N N báze O N N -O P O - O H 2 C H H O H H cukr OH OH nukleosid nukleotid Nukleosidy vznikají buď syntézou
VíceVliv selenu na metabolismus laboratorního potkana
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze Vliv selenu na metabolismus laboratorního potkana Klára Truhlářová, FPBT BL 342 Vliv selenu na metabolismus laboratorního potkana Laboratoř živočišné biochemie
VíceREPLIKACE, BUNĚČNÝ CYKLUS, ZÁNIK BUNĚK
Molekulární základy dědičnosti - rozšiřující učivo REPLIKACE, BUNĚČNÝ CYKLUS, ZÁNIK BUNĚK REPLIKACE deoxyribonukleové kyseliny (zdvojení DNA) je děj, při kterém se tvoří z jedné dvoušoubovice DNA dvě nová
VíceHumorální imunita. Nespecifické složky M. Průcha
Humorální imunita Nespecifické složky M. Průcha Humorální imunita Výkonné složky součásti séra Komplement Proteiny akutní fáze (RAF) Vztah k zánětu rozdílná funkce zánětu Zánět jako fyziologický kompenzační
VíceCentrální dogma molekulární biologie
řípravný kurz LF MU 2011/12 Centrální dogma molekulární biologie Nukleové kyseliny 1865 zákony dědičnosti (Johann Gregor Mendel) 1869 objev nukleových kyselin (Miescher) 1944 genetická informace v nukleových
VíceZkušební okruhy k přijímací zkoušce do magisterského studijního oboru:
Biotechnologie interakce, polarita molekul. Hydrofilní, hydrofobní a amfifilní molekuly. Stavba a struktura prokaryotní a eukaryotní buňky. Viry a reprodukce virů. Biologické membrány. Mikrobiologie -
VíceNukleové kyseliny Replikace Transkripce, RNA processing Translace
Nukleové kyseliny Replikace Transkripce, RNA processing Translace Figure 6-2 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008) replikace Figure 4-8 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science
Více1. Napište strukturní vzorce aminokyselin D a Y a vzorce adenosinu a thyminu
Test pro přijímací řízení magisterské studium Biochemie 2019 1. Napište strukturní vzorce aminokyselin D a Y a vzorce adenosinu a thyminu U dalších otázek zakroužkujte správné tvrzení (pouze jedna správná
VíceExprese rekombinantních proteinů
Exprese rekombinantních proteinů Exprese rekombinantních proteinů je proces, při kterém můžeme pomocí různých expresních systémů vytvořit protein odvozený od konkrétního genu, nebo části genu. Tento protein
VíceApoptóza Onkogeny. Srbová Martina
Apoptóza Onkogeny Srbová Martina Buněčný cyklus Regulace buněčného cyklu 1. Cyklin-dependentní kináza (Cdk) cyclin Regulace buněčného cyklu 2. Retinoblastomový protein (prb) E2F Regulace buněčného cyklu
VíceMIKROBIOLOGIE V BIOTECHNOLOGII
Biotechnologie MIKROBIOLOGIE V BIOTECHNOLOGII Termín biotechnologie byl poprvé použit v roce 1917 Procesy, při kterých se na tvorbě výsledného produktu podílejí živé organismy Širší definice: biotechnologie
VíceKosterní svalstvo tlustých a tenkých filament
Kosterní svalstvo Základní pojmy: Sarkoplazmatické retikulum zásobárna iontů vápníku - depolarizace membrány uvolnění vápníku v blízkosti kontraktilního aparátu vazba na proteiny zajišťující kontrakci
VíceÚloha protein-nekódujících transkriptů ve virulenci patogenních bakterií
Téma bakalářské práce: Úloha protein-nekódujících transkriptů ve virulenci patogenních bakterií Nové odvětví molekulární biologie se zabývá RNA molekulami, které se nepřekládají do proteinů, ale slouží
VíceVodní režim rostlin. Vodní stres. Základní procesy ovlivněné vodním deficitem. Vznik vodního deficitu. Adaptace k suchu. Signály a jejich přenos
Vodní režim rostlin Vodní stres Vznik vodního deficitu Adaptace k suchu Signály a jejich přenos Základní procesy ovlivněné vodním deficitem Tvorba proteinů Osmolyty ROS Vodní stres Vzniká při jakékoli
VíceNukleové kyseliny. Nukleové kyseliny. Genetická informace. Gen a genom. Složení nukleových kyselin. Centrální dogma molekulární biologie
Centrální dogma molekulární biologie ukleové kyseliny 1865 zákony dědičnosti (Johann Gregor Transkripce D R Translace rotein Mendel) Replikace 1869 objev nukleových kyselin (Miescher) 1944 nukleové kyseliny
Víceprokaryotní Znaky prokaryoty
prokaryotní buňka Znaky prokaryoty Základní stavební jednotka bakterií a sinic Mikroskopická velikost viditelné pouze v optickém mikroskopu Buňka neobsahuje organely Obsahuje pouze 1 biomembránu cytoplazmatickou
VíceFLUORESCENČNÍ MIKROSKOP
FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP na gymnáziu Pierra de Coubertina v Táboře Pavla Trčková, kabinet Biologie, GPdC Tábor Co je fluorescence Fluorescence je jev spočívající v tom, že některé látky (fluorofory) po
VíceÚVOD DO TRANSPLANTAČNÍ IMUNOLOGIE
ÚVOD DO TRANSPLANTAČNÍ IMUNOLOGIE Základní funkce imunitního systému Chrání integritu organizmu proti škodlivinám zevního a vnitřního původu: chrání organizmus proti patogenním mikroorganizmům a jejich
VíceInovace studia molekulární a buněčné biologie
Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. MBIO1/Molekulární biologie 1 Tento projekt je spolufinancován
VíceMIKROSKOPIE JAKO NÁSTROJ STUDIA MIKROORGANISMŮ
Mikroskopické techniky MIKROSKOPIE JAKO NÁSTROJ STUDIA MIKROORGANISMŮ Slouží k vizualizaci mikroorganismů Antoni van Leeuwenhoek (1632-1723) Čočka zvětšující 300x Různé druhy mikroskopů, které se liší
VíceGENOTOXICITA A ZMĚNY V GENOVÉ EXPRESI
GENOTOXICITA A ZMĚNY V GENOVÉ EXPRESI INDUKOVANÉ PŮSOBENÍM ORGANICKÝCH LÁTEK Z PRACHOVÝCH ČÁSTIC V OVZDUŠÍ Kateřina Hanzalová Oddělení genetické ekotoxikologie Ústav experimentální medicíny AV ČR v.v.i.
VíceMetabolismus krok za krokem - volitelný předmět -
Metabolismus krok za krokem - volitelný předmět - Vladimíra Kvasnicová pracovna: 411, tel. 267 102 411, vladimira.kvasnicova@lf3.cuni.cz informace, studijní materiály: http://vyuka.lf3.cuni.cz Sylabus
VíceKosmetika a kosmetologie Přednáška 6 Stárnutí kůže
Kosmetika a kosmetologie Přednáška 6 Stárnutí kůže Přednáška byla připravena v rámci projektu Evropského sociálního fondu, operačního programu Vzdělávání pro konkurenceschopnost s názvem Zvyšování exkluzivity
VíceINTRACELULÁRNÍ SIGNALIZACE II
INTRACELULÁRNÍ SIGNALIZACE II 1 VÝZNAM INTRACELULÁRNÍ SIGNALIZACE V MEDICÍNĚ Příklad: Intracelulární signalizace: aktivace Ras proteinu (aktivace receptorové kinázy aktivace Ras aktivace kinázové kaskády
VíceZDRAVOTNÍ NEZÁVADNOST POTRAVIN
ZDRAVOTNÍ NEZÁVADNOST POTRAVIN Možnosti stanovení Listeria monocytogenes popis metod a jejich princip Mária Strážiková Aleš Holfeld Obsah Charakteristika Listeria monocytogenes Listerióza Metody detekce
VíceNUKLEOVÉ KYSELINY. Složení nukleových kyselin. Typy nukleových kyselin:
NUKLEOVÉ KYSELINY Deoxyribonukleová kyselina (DNA, odvozeno z anglického názvu deoxyribonucleic acid) Ribonukleová kyselina (RNA, odvozeno z anglického názvu ribonucleic acid) Definice a zařazení: Nukleové
VíceMendělejevova tabulka prvků
Mendělejevova tabulka prvků V sušině rostlin je obsaženo přibližně 45% uhlíku, 42% kyslíku, 6,5% vodíku, 1,5% dusíku a 5% minerálních prvků. Tzv. organogenní prvky (C, O, H, N) představují tedy 95% veškerých
Více10) Reakce rostlin k abiotickému stresu
1 2015 10) Reakce rostlin k abiotickému stresu f) Tepelný stres a tepelný šok g) Kyslíkový deficit Jenks M et al. (2005) Plant Abiotic Stress. Blackwell Publishing Ashraf M et al. (2005) Abiotic Stresses.
VícePOLYPEPTIDY. Provitaminy = organické sloučeniny bez vitaminózního účinku, které se v živočišném těle mění působením ÚV záření nebo enzymů na vitaminy.
POLYPEPTIDY Provitaminy = organické sloučeniny bez vitaminózního účinku, které se v živočišném těle mění působením ÚV záření nebo enzymů na vitaminy. Hormony = katalyzátory v živočišných organismech (jsou
VíceREKOMBINACE Přestavby DNA
REKOMBINACE Přestavby DNA variace v kombinacích genů v genomu adaptace evoluce 1. Obecná rekombinace ( General recombination ) Genetická výměna mezi jakýmkoli párem homologních DNA sekvencí - často lokalizovaných
VíceMinerální výživa na extrémních půdách. Půdy silně kyselé, alkalické, zasolené a s vysokou koncentrací těžkých kovů
Minerální výživa na extrémních půdách Půdy silně kyselé, alkalické, zasolené a s vysokou koncentrací těžkých kovů Procesy vedoucí k acidifikaci půd Zvětrávání hornin s následným vymýváním kationtů (draslík,
VíceGlykolýza Glukoneogeneze Regulace. Alice Skoumalová
Glykolýza Glukoneogeneze Regulace Alice Skoumalová Metabolismus glukózy - přehled: 1. Glykolýza Glukóza: Univerzální palivo pro buňky Zdroje: potrava (hlavní cukr v dietě) zásoby glykogenu krev (homeostáza
VíceGarant předmětu GEN: prof. Ing. Jindřich Čítek, CSc. Garant předmětu GEN1: prof. Ing. Václav Řehout, CSc.
Garant předmětu GEN: prof. Ing. Jindřich Čítek, CSc. Garant předmětu GEN1: prof. Ing. Václav Řehout, CSc. Další vyučující: Ing. l. Večerek, PhD., Ing. L. Hanusová, Ph.D., Ing. L. Tothová Předpoklady: znalosti
VíceRespirace. (buněčné dýchání) O 2. Fotosyntéza Dýchání. Energie záření teplo BIOMASA CO 2 (-COO - ) = -COOH -CHO -CH 2 OH -CH 3
Respirace (buněčné dýchání) Fotosyntéza Dýchání Energie záření teplo chem. energie CO 2 (ATP, NAD(P)H) O 2 Redukce za spotřeby NADPH BIOMASA CO 2 (-COO - ) = -COOH -CHO -CH 2 OH -CH 3 oxidace produkující
VíceTématické okruhy pro státní závěrečné zkoušky
Tématické okruhy pro státní závěrečné zkoušky Program / Obor Povinný okruh Volitelný okruh (jeden ze tří) Mikrobiologie a buněčná biologie Mikrobiologie životního prostředí Obor: Mikrobiologie Bioinženýrství
VíceInovace studia molekulární a buněčné biologie
Investice do rozvoje vzdělávání Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. Investice do rozvoje vzdělávání
VíceOxidace proteinů, tuků a cukrů jako zdroj energie v živých organismech
Citrátový cyklus Oxidace proteinů, tuků a cukrů jako zdroj energie v živých organismech 1. stupeň: OXIDACE cukrů, tuků a některých aminokyselin tvorba Acetyl-CoA a akumulace elektronů v NADH a FADH 2 2.
Více