PROTEOMIKA V MOLEKULÁRNÍ TOXIKOLOGII: IDENTIFIKACE POTENCIÁLNÍCH ČASNÝCH PROTEI- NOVÝCH BIOMARKERŮ HEPATO- KARCINOGENITY U KRYS
|
|
- Libor Kadlec
- před 8 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 PROTEOMIKA V MOLEKULÁRNÍ TOXIKOLOGII: IDENTIFIKACE POTENCIÁLNÍCH ČASNÝCH PROTEI- NOVÝCH BIOMARKERŮ HEPATO- KARCINOGENITY U KRYS KERSTIN FELLA a, MATTHIAS GLÜCKMANN b, VOLKER KRUFT b, PETER-JÜRGEN KRAMER a a MICHAELA KRÖGER a a Merck KGaA, Institute of Toxicology, Frankfurter Strasse 250, D Darmstadt, Německo, b Applied Biosystems, Darmstadt, Německo michaela.kroeger@merck.de Došlo , přijato Klíčová slova: MALDI TOF-TOF MS, proteomika, biomarkery, molekulární toxikologie, hepatokarcinogenita Obsah 1. Úvod 2. Identifikace biomarkerů metodami dvourozměrné elektroforézy a hmotnostní spektrometrie 3. Instrumentace TOF/TOF 4. Biologický význam výsledků získaných 2DE/MS 4.1. Histopatologická pozorování 4.2. Analýza akutních toxických efektů 4.3. Subakutní a chronické toxické účinky 4.4. Potenciální proteinové biomarkery pro predikci 5. Závěr 1. Úvod Metody, které jsou užívány v současné tradiční toxikologii ke studiu toxicity nových potenciálních léčiv a jiných chemických látek, jsou založeny zejména na klasických bezpečnostních studiích na zvířatech. Tyto postupy zahrnují rovněž histopatologické a biochemické výsledky. S ohledem na etické aspekty je nutno tradiční toxikologické metody podpořit moderními analytickými technikami, které umožňují postihnout změny na molekulární úrovni dříve, než se projeví morfologicky. Zejména výzkum karcinogenity je založen na dlouhodobých studiích, ve kterých mohou zvířata chronicky strádat. Detekce nových molekulárních biomarkerů už před tím, než se nádor projeví morfologicky, by mohla v budoucnu umožnit zkrácení experimentů. V molekulární toxikologii, nově se etablujícím oboru, jsou jedním z přístupů k hledání biomarkerů proteomické techniky. Ke studiu molekulárních změn v krysích játrech vyvolaných hepatokarcinogenem jsme proto použili dvourozměrnou elektroforézu (2DE) a poté hmotnostní spektrometrii (MS). Tímto postupem jsme byli schopni detegovat potenciální časné proteinové biomarkery, které mohou do budoucna umožnit brzkou předpověď možných toxických i karcinogenních účinků vybraných látek 1. Analýza biologické významnosti nám navíc může pomoci objasnit základní fyziologické a patofyziologické mechanismy Identifikace biomarkerů metodami dvourozměrné elektroforézy a hmotnostní spektrometrie Cílem této studie bylo monitorovat metodou 2DE proteinové změny vyvolané hepatokarcinogenem N-nitrosomorfolinem (NNM) v jaterní tkáni krys. Diferenční expresní analýza jater ovlivněných NNM vedla k vytipování proteinů, které pak byly vyříznuty z gelu, proteolyticky naštěpeny a identifikovány jak metodou peptidového mapování (peptide mass fingerprinting, PMF), tak také tandemovou hmotnostní spektrometrií (MS/MS). K hledání potenciálních biomarkerů pro předpověď toxicity/karcinogenity jsme použili samce krys kmene Wistar, kteří byli vystaveni vlivu jaterního toxinu NNM (působícího na DNA) v koncentraci 20 mg kg 1 tělesné hmotnosti po 7 týdnů následovaných osmnácti týdenním obdobím regenerace. Zvířata byla utracena v různých časových intervalech (po jednom dni, po 3 týdnech a po 25 týdnech), extrahované jaterní proteiny byly separovány metodou 2DE (cit. 3 ). Proteiny v gelu byly barveny přes noc 1µM roztokem barviva na bázi komplexu ruthenia v 20% ethanolu a zviditelněny skenováním gelu na fluorescenčním laserovém skeneru Molecular Imager FX (BioRad, Hercules, CA). Diferenční expresní analýza byla provedena s použitím software ProteomWeaver 2.0 (Definiens, Mnichov, Německo). Vybrané proteinové skvrny (landmarks, obr. 1) byly identifikovány ve všech gelech a umožnily tak přesné vzájemné přiřazení jednotlivých obrazových analýz. Proteinové skvrny, které vykazovaly signifikantní regulaci exprese proteinů (hladina významnosti P 0,02), byly vyříznuty z gelu a přes noc štěpeny trypsinem (Promega, Madison, WA, USA). Peptidové vzorky pro UV-MALDI analýzu byly připraveny standardní metodou schnoucí kapky s matricí 4-hydroxy-α- -kyanoskořicové kyseliny (Applied Biosystems, Foster City, CA), 2 mg ml 1 ve směsi acetonitril : 0,1% kyselina trifluoroctová, 1:1 (v/v). MS a MS/MS analýza proběhla na hmotnostním spektrometru Applied Biosystems 4700 Proteomics Analyzer MALDI TOF/TOF (obr. 2) (cit. 4 ). Kombinované hledání peptidovým mapováním and tandemovou hmotnostní spektrometrií bylo umožněno prohledávacími algoritmy MASCOT (Matrix Science Ltd., UK) v databázi SWISS-PROT. 957
2 iontový zdroj MALDI se zpožděnou extrakcí Nd:YAG laser kolizní cela s časově proměnným el. potenciálem 2. iontový zdroj se zpožděnou extrakcí detektory TIS zpožďující čočky dvojúrovňový reflektor 250 L/s 250 L/s 250 L/s Schéma 1. MALDI-TOF/TOF instrumentace Obr. 1. 2DE separace krysích jaterních proteinů kontrolního jedince; separace v prvním rozměru proběhla na 24 cm pruhu s imobilizovaným gradientem ph 4-7, pro separaci v druhém rozměru byla použita SDS-PAGE v 10% polyakrylamidovém gelu. Proteiny byly barveny fluorescenčně rutheniem. Identifikované proteiny považované za významné markery (landmarks) jsou zvýrazněny 3. Instrumentace TOF/TOF Nejnovější konfigurace přístroje MALDI TOF/TOF je zobrazena na schématu 1 (cit. 4 ). Pro odpaření a ionizaci vzorku je v přístroji Applied Biosystems 4700 Proteomics Analyzer použit laser v tuhé fázi (diodový Nd:YAG laser) pracující při frekvenci 200 Hz a při vlnové délce λ = 355 nm. Před vstupem do průletového analyzátoru hmotnostního spektrometru jsou ionty urychleny elektrickým polem (MS mód 20kV, MS/MS mód 8kV). Protože všechny ionty jsou urychleny stejným napětím, ionty s odlišným poměrem hmotnost/náboj (m/z) budou putovat rozdílnou rychlostí a ionty s vysokou hodnotou m/z budou putovat pomaleji než menší ionty. Poměr m/z ionizovaných analytů Obr. 2. Přístroj 4700 Proteomics Analyzer MALDI-TOF/ TOF TM ; patentovaná TOF/TOF optika umožňuje získávat data v lineárním a reflektorovém módu a následující analýzu sekvence v MS/MS módu je stanoven měřením času dopadu na dvoukanálový detektor. Systém přepočítává dobu letu na přesnou molekulovou hmotnost, která pak dovoluje identifikaci nebo charakterizaci testovaného vzorku. Dvoustupňový reflektor umožňuje fokusaci v širokém rozpětí fragmentů v MS/MS módu, aniž snižuje kvalitu dat v MS módu. Prvky iontové optiky, zobrazené v sekci druhého iontového zdroje, umožňují výběr prekurzoru a reakceleraci iontů jeho fragmentů v MS/MS módu (iontové selektory, zpomalovací čočky, kolizní cela a sekundární disociace indukovaná srážkami v oblasti kolizní cely přispívají k intenzitě iontového signálu v MS/MS módu). Obvyklá kolizní energie při MS/MS módu je 1 kv a je dána potenciálovým rozdílem mezi celkovým urychlovacím napětím ve zdroji (8 kv) a napětím v kolizní cele (7 kv). Všechny ionty fragmentů, které vznikly buď samovolným rozpadem nebo disociací 958
3 indukovanou srážkami v kolizní cele, přispívají k intenzitě signálu v MS/MS módu. TOF/TOF optika přístroje Applied Biosystems 4700 Proteomics Analyzer spolu s tandemovými průletovými analyzátory umožňuje velmi rychle získat úplnou strukturní informaci o vzorku. Konfigurace přístroje zajišťuje automatický sběr vysoce kvalitních dat za použití MALDI ionizace. TOF/TOF optika navíc poskytuje spektra typická pro vysokoenergetické kolize s důležitou strukturní informací, jako jsou např. immoniové ionty, štěpení v bočních řetězcích a interní fragmenty. Komplexní spektra s konzistentními sériemi iontů dovolují úplnou identifikaci proteinů a jejich kompletní charakterizaci při zachování vysoké rychlosti a přesnosti analýzy. 4. Biologický význam výsledků získaných 2DE/MS 4.1. Histopatologická pozorování Korelace nových proteomických přístupů s klasickými toxikologickými metodami byla provedena histopatologickou analýzou krysích jater. U krys nebyly po prvním dnu vystavení vlivu N-nitrosomorfolinu pozorovatelné ani makroskopické, ani histologické změny, které by mohly být jednoznačně přičítány účinku NNM. Po 3 týdnech expozice NNM vykazovala většina jater granulární povrch kapsuly a zmenšení. Histopatologicky byly zaznamenány akutní degenerativní a subakutní reaktivní léze. Po 7 týdnech vystavení vlivu NNM, která pokračovala osmnácti týdenním obdobím regenerace, vykazovala některá játra změny ve velikosti a barvě. Histopatologická vyšetření odhalila léze s poškozením buněk a oblasti regenerace, buněčné adenomy, a také buněčné karcinomy u 4 krys Analýza akutních toxických efektů Na rozdíl od histopatologických nálezů odhalila diferenční 2DE analýza krysích jaterních tkání po jednom dni expozice NNM 13 statisticky signifikantních proteinových skvrn při více než 1,7 násobném zvýšení exprese ve srovnání s intenzitami skvrn v kontrolních gelech (významnosti P 0,02). Všechny proteiny byly identifikovány metodou MS a následnými MS/MS experimenty. Při bližším pohledu na molekulární funkci těchto proteinů (tabulka I) je zřejmé, že se účastní obranných procesů při akutním buněčném stresu. Signifikantně se zvýšila exprese mnoha proteinů nezbytných pro redoxní buněčné regulace. Peroxiredoxin 2 hraje důležitou roli v eliminaci peroxidů prostřednictvím redukce reaktivních forem kyslíku ( reactive oxygen species, ROS) thioredoxinovým systémem 5. O zvýšeném buněčné stresu vypovídá také indukce superoxiddismutasy, která je známa tím, že odbourává radikály. Heat shock protein 60 (HSP60) je významným proteinem usnadňujícím správné skládání proteinu, které je narušeno stresem. Zvýšená exprese HSP60 navíc indikuje zintenzivnění procesů apoptózy, což představuje sekundární efekt vyvolaný oxidativním poškozením buňky. Všechny iniciované procesy a reakce vedou k různým modifikacím energetického metabolismu, které se projevují zvýšenou expresí aldehyddehydrogenasy, pyrokatechol-o-methyltransferasy, prekurzoru transthyretinu a 3-hydroxyanthranilát-3,4-dioxygenasy. Zvýšený metabolismus proteinů odrážejí zvýšené hladiny prekurzoru proteindisulfidisomerasy A3 a také regulační podjednotky 6B proteasy 26S, která se podílí na proteinové degradaci Subakutní a chronické toxické úč inky Po třech týdnech expozice NNM byly ve srovnání se změnami pozorovanými v játrech po prvním dnu působení detegovány mnohé další deregulované proteiny. Změny zahrnuté v buněčné reakci na stres vyvolaný NNM byly ještě ve třetím týdnu detegovatelné, což dokazuje zvýšená exprese HSP60, 71 kda heat shock proteinu příbuzného a heat shock proteinu 90-β (tabulka I). Po třech týdnech se k proteinovým změnám pozorovaným na počátku studie přidaly procesy vztahující se k obranným mechanismům proti buněčnému stresu, které jsou doprovázeny zvýšenou deregulací anabolismu a katabolismu. Aldehyddehydrogenasa a glycerol-3-fosfátdehydrogenasa byly v této fázi deregulovány. Změněná exprese pyruvátkinasy a fruktosa-1,6-bisfosfatasy (F16P), které obě patří mezi enzymy glykolýzy, upozornila na závažné změny energetického metabolismu. Zejména snížení exprese F16P znamená metabolický posun od glukoneogeneze ke glykolýze, a proto je indikována zvýšená potřeba energie pro regeneraci a proliferaci jaterní buňky. Tento efekt, který je elementární pro karcinogenní procesy, mohl být proteomickým přístupem detegován mnohem dříve než konvenčními metodami dosud užívanými v toxikologii 6. Po 7 týdnech byla expozice zvířat účinku NNM zastavena a následovalo pozorovací období 18 týdnů bez karcinogenu, poté ve 25. týdnu byla jaterní tkáň analyzována. Histopatologie odhalila, že u většiny krys se v této fázi vytvořily nádory jater. Analýza této tkáně metodou 2DE prokázala deregulaci tumorových specifických markerových proteinů. Rho GDP inhibitor disociace, HSP 60 a prekurzor kaspasy-8 (tabulka I), které hrají klíčovou roli v mitochondriálním řízení apoptózy, vykazovaly sníženou expresi 7,8. To indikuje inhibici procesů apoptózy a následně podporuje nekontrolovaný růst maligních jaterních buněk. 2DE analýza odhalila, že v této poslední fázi bylo diferenčně exprimováno méně proteinů než ve třetím týdnu (75 signifikantních skvrn ve 3. týdnu versus 45 skvrn ve 25. týdnu). Deregulované proteiny svědčí o tom, že ve 25. týdnu, po 18 týdnech odpočinku a regenerace, už buňka nemusí reagovat na buněčný stres původně vyvolaný NNM. Exprese některých proteinů normálně indukovaných buněčným stresem byla nyní jen lehce snížena, jako např. 71 kda heat shock proteinu příbuzného, jehož exprese byla naproti tomu ve 3. týdnu zvýšena více než dvakrát. Avšak proteiny anabolismu a katabolismu byly ještě deregulovány, jako např. aldehyddehydrogenasa, malátdehydrogenasa, F16P a β-řetězec ATP- synthasy. 959
4 Tabulka I Proteiny, které byly diferenčně exprimovány po 1 dnu, 3 týdnech a 25 týdnech expozice NNM, identifikovány peptidovým mapováním a následnou tandemovou hmotnostní spektometrií. Hladiny významnosti (P) byly vypočteny testem podle Mann-Whitneye Kategorie Protein Swiss Prot AN Násobek Hodnota P změny den 1 Buněčný stres peroxiredoxin 2 P ,05 0,0069 superoxiddismutasa P ,37 0, kda Heat shock protein P ,61 0,0019 Metabolismus aldehyddehydrogenasa P ,21 0, Hydroxyanthranilát-3,4-dioxygenasa P ,13 0,0034 pyrokatechol O-methyltransferasa P ,16 0,0060 týden 3 Buněčný stres 60 kda Heat shock protein P ,38 0, kda Heat shock protein příbuzný P ,38 0,0002 Heat shock protein HSP 90-beta P ,10 0,0000 Metabolismus aldehyddehydrogenasa P ,80 0,0000 pyruvátkinasa P ,23 0,0000 prekurzor jaterní karboxylesterasy 10 P ,28 0,0000 ketohexokinasa Q ,57 0,0000 glycerol-3-fosfátdehydrogenasa O ,58 0,0000 pyrokatechol O-methyltransferasa P ,43 0,0000 fruktosa-1,6-bisfosfatasa P ,64 0,0000 týden 25 Tumor specifické prekurzor kaspasy-8 O ,56 0, kda Heat shock protein P ,66 0,0005 Rho GDP inhibitor disociace Q99PT1 0,73 0,0001 Buněčný stres 71 kda Heat shock protein příbuzný P ,63 0,0103 Metabolismus fruktosa-1,6-bisfosfatasa P ,68 0,0000 ATP synthasa, β-řetězec P ,56 0,0005 aldehyddehydrogenasa P ,67 0,0001 malátdehydrogenasa P ,58 0,0000 glycerol-3-fosfátdehydrogenasa O ,62 0,0011 pyruvátkinasa P ,57 0, Potenciální proteinové biomarkery pro predikci Naším hlavním cílem bylo detegovat časné proteinové biomarkery, které umožňují předpovědět pozdní stadia jaterní karcinogeneze. Tyto proteiny by mohly podpořit a posílit předpověď karcinogenních efektů chemických látek. Proto jsme se zaměřili na proteiny, které byly v jaterních vzorcích signifikantně regulovány jak po 3 týdnech, tak i po 25 týdnech. V poslední fázi jsme se soustředili pouze na tumorovou tkáň. Změny v sacharidovém metabolismu, které byly diskutovány jako významné prekancerogenní změny detegovatelné po 3 týdnech expozice, byly stejným způsobem regulovány i po 25 týdnech (F16P, pyruvátkinasa, glycerol-3-fosfátdehydrogenasa, tabulka I). Oproti tomu absence odpovědi na buněčný stres, stejně jako snížená aktivita vedoucí k apoptóze, vyplývá ze snížené exprese 71 kda heat shock proteinu příbuzného, CH60 a Rho GDP inhibitoru disociace v 25. týdnu, zatímco exprese všech těchto proteinů byla signifikantně zvýšena po 3. týdnu. Závěrem konstatujeme, že náš přístup odhalil 18 diferenčně exprimovaných proteinů (obr. 3) detegovatelných už po 3 týdnech chemické expozice. Použitelnost těchto proteinů jako biomarkerů pro předpověď hepatokarcinogenity musí být ještě potvrzena dalšími experimenty a v současné době se studuje. 5. Závěr Naše výsledky ukazují, že postupy dvourozměrné elektroforézy a hmotnostní spektrometrie citlivě detegují změny na molekulární translační úrovni dokonce už po 960
5 LITERATURA Obr. 3. 2DE separace proteinů z lyzátu jaterních buněk pocházejících ze 3. týdne (ph 4-7); potenciální časné biomarkerové proteiny, které byly diferenčně exprimovány ve 3. týdnu a na konci studie ve 25. týdnu, jsou zvýrazněny jednom dni působení N-nitrosomorfolinu. Po třech dnech jsou tyto akutní projevy doprovázeny různými změnami energetického metabolismu, které mohou mít vztah k časným stadiím hepatokarcinogeneze. Tento typ změn nemůže být klasickými toxikologickými metodami v takovém rozsahu prokázán, čímž se potvrzuje význam proteomických technologií pro zlepšení predikce v toxikologii. Navíc jsme byli schopni nalézt specifické proteinové markery v tumorové jaterní tkáni a také endpoint markerové proteiny dokonce po třech týdnech expozice. Posledně uvedené markery mohou fungovat jako užitečné časné proteinové biomarkery pro předpověď hepatocelulárního karcinomu. V budoucnu může tato raná detekce, umožněná zahrnutím proteomických přístupů do rutinních toxikologických studií, nahradit některé studie karcinogenity. Prezentované výsledky jsou příslibem tohoto potenciálu proteomických přístupů pro klasickou a predikční toxikologii. 1. Bandara L. R., Kennedy S.: Drug Discovery Today 7, 411 (2002). 2. MacGregor J. T., Farr S., Tucker J. D.: Fundam. Appl. Toxicol. 26, 156 (1995). 3. Görg A., Weiss W., v knize: Proteome Research: Two-Dimensional Gel Electrophoresis and Identification Methods, (Rabilloud T., ed.), kap.4, str. 57. Springer-Verlag, Wien Medzihradszky K. F., Campbell J. M., Baldwin M. A.: Anal. Chem. 72, 552 (2000). 5. Yergey A. L., Coorssen J. R., Backlund P. S. Jr., Blank P. S., Humphrey G. A., Zimmerberg J., Campbell J. M., Vestal M. L.: J. Am. Soc. Mass Spectrom. 13, 784 (2002). 6. Miranda-Vizuete A., Damdimopoulos A. E., Spyrou G.: Antioxid. Redox Signal. 2, 801 (2000). 7. Bannasch P., Hacker H., Klimek F., Mayer D.: Adv. Enzyme Regul. 22, 97 (1982). 8. Schramek K., Schumacher M., Wilflingseder D.: Am. J. Physiol. 272, C (1997). 9. Degterev A., Boyce M., Yan J.: Oncogene 22, 8543 (2003). K. Fella a, M. Glückmann b, V. Kruft b, P.-J. Kramer a and M. Kröger a ( a Merck KGaA, Institute of Toxicology, b Applied Biosystems, Darmstadt, Germany): Proteomics in Molecular Toxicology: Identification of Potential Early Protein Biomarkers for Hepatocarcinogenicity in Rats Modern proteomics technology was used for identification of protein biomarkers for hepatocarcinogenicity. It replaced currently used methods for the studies of toxic effects of drug candidates. The detection of new biomolecular markers can shorten future studies. Tento projekt byl podpořen grantem č německého Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF). 961
LABORATOŘ OBORU I ÚSTAV ORGANICKÉ TECHNOLOGIE (111) Použití GC-MS spektrometrie
LABORATOŘ OBORU I ÚSTAV ORGANICKÉ TECHNOLOGIE (111) C Použití GC-MS spektrometrie Vedoucí práce: Doc. Ing. Petr Kačer, Ph.D., Ing. Kamila Syslová Umístění práce: laboratoř 79 Použití GC-MS spektrometrie
VícePražské analytické centrum inovací Projekt CZ / /0002 spolufinancovaný ESF a Státním rozpočtem ČR
Pražské analytické centrum inovací Projekt CZ.04.3.07/4.2.01.1/0002 spolufinancovaný ESF a Státním rozpočtem ČR SEPARACE PROTEINŮ Preparativní x analytická /měřítko, účel/ Zvláštnosti dané povahou materiálu
VíceMENÍ A INTERPRETACE SPEKTER BIOMOLEKUL. Miloslav Šanda
MENÍ A INTERPRETACE SPEKTER BIOMOLEKUL Miloslav Šanda Ionizaní techniky využívané k analýze biomolekul (biopolymer) MALDI : proteiny, peptidy, oligonukleotidy, sacharidy ESI : proteiny, peptidy, oligonukleotidy,
VíceHMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE - kvalitativní i kvantitativní detekce v GC a LC - pyrolýzní hmotnostní spektrometrie - analýza polutantů v životním
HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE - kvalitativní i kvantitativní detekce v GC a LC - pyrolýzní hmotnostní spektrometrie - analýza polutantů v životním prostředí - farmakokinetické studie - kvantifikace proteinů
VíceTématické okruhy pro státní závěrečné zkoušky
Tématické okruhy pro státní závěrečné zkoušky Obor Povinný okruh Volitelný okruh (jeden ze dvou) Forenzní biologická Biochemie, pathobiochemie a Toxikologie a bioterorismus analýza genové inženýrství Kriminalistické
VíceHmotnostní spektrometrie
Hmotnostní spektrometrie Princip: 1. Ze vzorku jsou tvořeny ionty na úrovni molekul, nebo jejich zlomků (fragmentů), nebo až volných atomů dodáváním energie, např. uvolnění atomů ze vzorku nebo přímo rozštěpení
VíceNo. 1- určete MW, vysvětlení izotopů
No. 1- určete MW, vysvětlení izotopů ESI/APCI + 325 () 102 (35) 327 (33) 326 (15) 328 (5) 150 200 250 300 350 400 450 500 ESI/APCI - 323 () 97 (51) 325 (32) 324 (13) 326 (6) 150 200 250 300 350 400 450
VíceEvropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti ELEKTROMIGRAČNÍ METODY ELEKTROFORÉZA K čemu to je? kritérium čistoty preparátu stanovení molekulové hmotnosti makromolekul stanovení izoelektrického
VíceKlinická a farmaceutická analýza. Petr Kozlík Katedra analytické chemie
Klinická a farmaceutická analýza Petr Kozlík Katedra analytické chemie e-mail: kozlik@natur.cuni.cz http://web.natur.cuni.cz/~kozlik/ 1 Spojení separačních technik s hmotnostní spektrometrem Separační
VíceMožná uplatnění proteomiky směrem do klinické praxe
Možná uplatnění proteomiky směrem do klinické praxe Formy uplatnění proteomiky do klinické praxe Přímé uplatnění proteomických technologií Metody pro studium proteinů tu byly dřív něž proteomika jako obor
VíceZáklady hmotnostní spektrometrie
Základy hmotnostní spektrometrie Lenka Hernychová e-mail: hernychova@pmfhk.cz Ústav molekulární patologie, Fakulta vojenského zdravotnictví, Universita obrany Hradec Králové Historie Koichi Tanaka vyvinul
Vícejako markeru oxidativního
Monitoring koncentrace 8-isoprostanu jako markeru oxidativního stresu v kondenzátu vydechovaného vzduchu Lukáš Chytil Ústav organické technologie Úvod Cíl: - nalezení vhodného analytické metody pro analýzu
VíceIdentifikace a charakterizace metalothioneinu v nádorových buňkách pomocí MALDI-TOF/TOF hmotnostní spektrometrie
Identifikace a charakterizace metalothioneinu v nádorových buňkách pomocí MALDI-TOF/TOF hmotnostní spektrometrie 14.6.2013 MSc. Miguel Ángel Merlos Rodrigo Ústav chemie a biochemie, Agronomická fakulta,
VíceHmotnostní detekce biologicky významných sloučenin pro biotechnologie
Název: Školitelé: Hmotnostní detekce biologicky významných sloučenin pro biotechnologie MSc. Miguel Angel Merlos Rodrigo, Mgr. Ondřej Zítka, Ph.D. Datum: 17.5.2013 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.3.00/20.0148
VíceINTERPRETACE HMOTNOSTNÍCH SPEKTER
INTERPRETACE HMOTNOSTNÍCH SPEKTER Hmotnostní spektrometrie hmotnostní spektrometrie = fyzikálně chemická metoda založená na rozdělení hmotnosti iontů v plynné fázi podle jejich poměru hmotnosti a náboje
VíceOdůvodnění veřejné zakázky
Odůvodnění veřejné zakázky ZADAVATEL: Česká zemědělská univerzita v Praze Sídlem: Kamýcká 129, 165 21 Praha - Suchdol Zastoupený: Ing. Jana Vohralíková, kvestorka IČO: 60460709 Profil zadavatele: https://zakazky.czu.cz
VíceHmotnostní detekce biologicky významných sloučenin pro biotechnologie část 3 - Provedení štěpení proteinů a následné analýzy,
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií Hmotnostní detekce biologicky významných sloučenin pro biotechnologie část 3 - Provedení štěpení proteinů a následné analýzy, vyhodnocení výsledků, diskuse Anotace
VíceHMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE
HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE A MOŽNOSTI JEJÍHO SPOJENÍ SE SEPARAČNÍMI METODAMI SEPARACE chromatografie CGC, GC x GC HPLC, UPLC, UHPLC, CHIP-LC elektromigrační m. CZE, CITP INTERFACE SPOJENÍ x ROZHRANÍ GC vyhřívaná
VíceHmotnostní spektrometrie. Historie MS. Schéma MS
Hmotnostní spektrometrie MS mass spectrometry MS je analytická technika, která se používá k měření poměru hmotnosti ku náboji (m/z) u iontů původně studium izotopového složení dnes dynamicky se vyvíjející
VíceToxické látky v potravinách s nebezpečím onkologické aktivace
Toxické látky v potravinách s nebezpečím onkologické aktivace Doc. MUDr. Pavel Dlouhý, Ph.D. Ústav hygieny 3. LF UK, Praha Rizikové faktory pro vznik nádorů Obezita Nadměrný příjem tuků? Nadměrná konzumace
VíceÚvod do strukturní analýzy farmaceutických látek
Úvod do strukturní analýzy farmaceutických látek Garant předmětu: doc. Ing. Bohumil Dolenský, Ph.D. A28, linka 4110, dolenskb@vscht.cz Hmotnostní spektrometrie II. Příprava předmětu byla podpořena projektem
VíceSLEDOVÁNÍ VÝSKYTU GENOTOXICKÝCH LÁTEK V POVODÍ ŘEKY SVRATKY V SOUVISLOSTI S URANOVÝM PRŮMYSLEM
SLEDOVÁNÍ VÝSKYTU GENOTOXICKÝCH LÁTEK V POVODÍ ŘEKY SVRATKY V SOUVISLOSTI S URANOVÝM PRŮMYSLEM Jana Badurová, Hana Hudcová, Radoslava Funková, Helena Mojžíšková, Jana Svobodová Toxikologická rizika spojená
VíceZpráva ze zahraniční odborné stáže
Zpráva ze zahraniční odborné stáže Zahraniční odborná stáž byla realizována v rámci projektu ROZVOJ A POSÍLENÍ SPOLUPRÁCE MEZI AKADEMICKÝMI A SOUKROMÝMI SUBJEKTY SE ZAMĚŘENÍM NA CHEMICKÝ A FARMACEUTICKÝ
VíceRenáta Kenšová. Název: Školitel: Datum: 24. 10. 2014
Název: Školitel: Sledování distribuce zinečnatých iontů v kuřecím zárodku za využití moderních technik Monitoring the distribution of zinc ions in chicken embryo using modern techniques Renáta Kenšová
VíceMetody práce s proteinovými komplexy
Metody práce s proteinovými komplexy Zora Nováková, Zdeněk Hodný Proteinové komplexy tvořeny dvěma a více proteiny spojenými nekovalentními vazbami Van der Waalsovy síly vodíkové můstky hydrofobní interakce
Vícelaboratorní technologie
Kreatinin srovnání metod pro stanovení hladiny v moči D. Friedecký, R. Hušková, P. Chrastina, P. Hornik a T. Adam Kreatinin je jedním z nejčastěji stanovovaných analytů v biochemické laboratoři. V tomto
Více1. Metodika. Protokol č. F1-4 Metodika: Srovnávací analýza efektivity přípravy rekombinantního proteinu ve fermentoru
Protokol č.: F1-4 Datum: 20.12.2010 Metodika: analýza efektivity přípravy výběr z výsledků ze zkušebních provozů výroby antigenů. Vypracoval: Ing. Václav Filištein, Mgr. Tereza Chrudimská, Spolupracující
VíceHMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE
HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE MASS SPECTROMETRY (MS) Alternativní názvy (spojení s GC, LC, CZE, ITP): Hmotnostně spektrometrický (selektivní) detektor Mass spectrometric (selective) detector (MSD) Spektrometrie
VíceGrantové projekty řešené OT v současnosti
Grantové projekty řešené OT v současnosti Grantové projekty řešené OT v současnosti GAČR č. P303/12/G163: Centrum interakcí potravních doplňků s léčivy a nutrigenetiky Doc. Doba řešení: 2012-2018 Potravní
VíceHmotnostní spektrometrie ve spojení se separačními metodami
Pražské analytické centrum inovací Projekt CZ.04.3.07/4.2.01.1/0002 spolufinancovaný ESF a Státním rozpočtem ČR Hmotnostní spektrometrie ve spojení se separačními metodami Ivan Jelínek PřF UK Praha Definice:
VíceIZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I. Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek
IZOLACE, SEPARACE A DETEKCE PROTEINŮ I Vlasta Němcová, Michael Jelínek, Jan Šrámek Studium aktinu, mikrofilamentární složky cytoskeletu pomocí dvou metod: detekce přímo v buňkách - fluorescenční barvení
VíceÚSTAV CHEMIE A ANALÝZY POTRAVIN
VYSOKÁ ŠKOLA CHEMICKO-TECHNOLOGICKÁ V PRAZE ÚSTAV CHEMIE A ANALÝZY POTRAVIN Technická 5, 166 28 Praha 6 tel./fax.: + 420 220 443 185; jana.hajslova@vscht.cz LABORATOŘ Z ANALÝZY POTRAVIN A PŘÍRODNÍCH PRODUKTŮ
Více*Mléko a mléčné výrobky obsahují řadu bioaktivních
www.bileplus.cz Mléko a mléčné výrobky obsahují řadu bioaktivních látek (vápník, mastné kyseliny, syrovátka, větvené aminokyseliny) ovlivňující metabolismus tuků spalování tuků Mléčné výrobky a mléčné
VíceDvoudimenzionální elektroforéza
Rozvoj týmu pro výuku, výzkum a aplikace v oblasti funkční genomiky a proteomiky (CZ.1.07/2.3.00/09.0132) Dvoudimenzionální elektroforéza Hana Konečná Oddělení funkční genomiky a proteomiky ÚEB PřF MU
VíceTypizace amyloidóz pomocí laserové mikrodisekce a hmotnostní spektrometrie
Typizace amyloidóz pomocí laserové mikrodisekce a hmotnostní spektrometrie Dušan Holub Laboratoř experimentální medicíny, Ústav molekulární a translační medicíny Lékařské fakulty Univerzity Palackého v
VíceHmotnostní spektrometrie s průletovým analyzátorem a ionizací laserovou desorpcí v přítomnosti matrice (MALDI TOF MS)
Hmotnostní spektrometrie s průletovým analyzátorem a ionizací laserovou desorpcí v přítomnosti matrice (MALDI TOF MS) MALDI TOF MS (z anglického Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Timeof-Flight
VíceCRH/NPU I - Systém pro ultraúčinnou kapalinovou chromatografii (UHPLC) ve spojení s tandemovým hmotnostním spektrometrem (MS/MS)
ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY v souladu s 156 zákona č. 137/2006, Sb., o veřejných zakázkách, ve znění pozdějších předpisů Nadlimitní veřejná zakázka na dodávky zadávaná v otevřeném řízení v souladu s ust.
Víceve srovnání s eukaryoty (životnost v řádu hodin) u prokaryot kratší (životnost v řádu minut) na životnost / stabilitu molekuly mají vliv
Urbanová Anna ve srovnání s eukaryoty (životnost v řádu hodin) u prokaryot kratší (životnost v řádu minut) na životnost / stabilitu molekuly mají vliv strukturní rysy mrna proces degradace každá mrna v
VíceUrychlení úpravy krvetvorby poškozené cytostatickou terapií (5-fluorouracil a cisplatina) p.o. aplikací IMUNORu
Urychlení úpravy krvetvorby poškozené cytostatickou terapií (5-fluorouracil a cisplatina) p.o. aplikací IMUNORu Úvod Myelosuprese (poškození krvetvorby) patří mezi nejčastější vedlejší účinky chemoterapie.
Více1. Definice a historie oboru molekulární medicína. 3. Základní laboratorní techniky v molekulární medicíně
Obsah Předmluvy 1. Definice a historie oboru molekulární medicína 1.1. Historie molekulární medicíny 2. Základní principy molekulární biologie 2.1. Historie molekulární biologie 2.2. DNA a chromozomy 2.3.
VíceS P E K T R O M E T R I E 2. roník. 18.-19. listopadu 2009
M I N I Š K O L A H M O T N O S T N Í S P E K T R O M E T R I E 2. roník 18.-19. listopadu 2009 Pro Miniškola a MS? Informace pro uživatele» o službách poskytovaných skupinou MS» o tom, jaká data a jak
VíceVizualizace DNA ETHIDIUM BROMID. fluorescenční barva interkalační činidlo. do gelu do pufru barvení po elfu SYBR GREEN
ETHIDIUM BROMID fluorescenční barva interkalační činidlo do gelu do pufru barvení po elfu Vizualizace DNA SYBR GREEN Barvení proteinů Coommassie Brilliant Blue Coomassie Blue x barvení stříbrem Porovnání
VíceOPVK CZ.1.07/2.2.00/
OPVK CZ.1.07/2.2.00/28.0184 Základní principy vývoje nových léčiv OCH/ZPVNL Mgr. Radim Nencka, Ph.D. ZS 2012/2013 První kroky k objevu léčiva Nobelova cena za chemii 2013 Martin Karplus Michael Levitt
VíceIndentifikace molekul a kvantitativní analýza pomocí MS
Indentifikace molekul a kvantitativní analýza pomocí MS Identifikace molekul snaha určit molekulovou hmotnost, sumární složení, strukturní části molekuly (funkční skupiny, aromatická jádra, alifatické
VíceEnzymy v diagnostice Enzymy v plazm Bun né enzymy a sekre ní enzymy iny zvýšené aktivity bun ných enzym v plazm asový pr h nár
Enzymy v diagnostice Enzymy v plazmě Enzymy nalézané v plazmě lze rozdělit do dvou typů. Jsou to jednak enzymy normálně přítomné v plazmě a mající zde svou úlohu (např. enzymy kaskády krevního srážení
VíceÚvod do spektrálních metod pro analýzu léčiv
Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti Úvod do spektrálních metod pro analýzu léčiv Pavel Matějka, Vadym Prokopec pavel.matejka@vscht.cz pavel.matejka@gmail.com Vadym.Prokopec@vscht.cz
VíceBioinformatika a výpočetní biologie KFC/BIN. I. Přehled
Bioinformatika a výpočetní biologie KFC/BIN I. Přehled RNDr. Karel Berka, Ph.D. Univerzita Palackého v Olomouci Definice bioinformatiky (Molecular) bio informatics: bioinformatics is conceptualising biology
Vícepřesnost (reprodukovatelnost) správnost (skutečná hodnota)? Skutečná hodnota použití různých metod
přesnost (reprodukovatelnost) správnost (skutečná hodnota)? Skutečná hodnota použití různých metod Měření Pb v polyethylenu 36 různými laboratořemi 0,47 0 ± 0,02 1 µmol.g -1 tj. 97,4 ± 4,3 µg.g -1 Měření
VíceHmotnostní analyzátory a detektory iont
Hmotnostní analyzátory a detektory iont Hmotnostní analyzátory Hmotnostní analyzátory Rozdlí ionty v prostoru nebo v ase podle jejich m/z Analyzátory Magnetický analyzátor (MAG) Elektrostatický analyzátor
VíceVývoj biomarkerů. Jindra Vrzalová, Ondrej Topolčan, Radka Fuchsová FN Plzeň, LF v Plzni UK
Vývoj biomarkerů Jindra Vrzalová, Ondrej Topolčan, Radka Fuchsová FN Plzeň, LF v Plzni UK Proč potřebujeme laboratoř? Proč potřebujeme biomarkery? Časná diagnostika Správná diagnostika a stratifikace pacientů
VíceVyužití metod strojového učení v bioinformatice David Hoksza
Využití metod strojového učení v bioinformatice David Hoksza SIRET Research Group Katedra softwarového inženýrství, Matematicko-fyzikální fakulta Karlova Univerzita v Praze Bioinformatika Biologické inspirace
VíceIontové zdroje II. Iontový zdroj. Data. Vzorek. Hmotnostní analyzátor. Zdroj vakua. Iontové zdroje pracující za sníženého tlaku
Iontové zdroje II. Iontové zdroje pracující za sníženého tlaku Elektronová/chemická ionizace Iontové zdroje pro spojení s planárními separacemi Ionizace laserem za účasti matrice Ambientní ionizační techniky
VíceCOSY + - podmínky měření a zpracování dat ztráta rozlišení ve spektru. inphase dublet, disperzní. antiphase dublet, absorpční
y x COSY 90 y chem. posuv J vazba 90 x : : inphase dublet, disperzní inphase dublet, disperzní antiphase dublet, absorpční antiphase dublet, absorpční diagonální pík krospík + - - + podmínky měření a zpracování
VíceStanovení biomarkerů oxidativního stresu u kapra obecného (Cyprinus carpio L.) po dlouhodobém působení simazinu Hlavní řešitel Ing.
Stanovení biomarkerů oxidativního stresu u kapra obecného (Cyprinus carpio L.) po dlouhodobém působení simazinu Hlavní řešitel Ing. Alžběta Stará Vedoucí projektu dr. hab. Ing. Josef Velíšek, Ph.D. 1 Úvod
VíceHmotnostní spektrometrie s analyzátorem doby letu a laserovou desorpcí/ionizací za účasti matrice (MALDI TOF MS)
Hmotnostní spektrometrie s analyzátorem doby letu a laserovou desorpcí/ionizací za účasti matrice (MALDI TOF MS) MALDI TOF MS (z anglického Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of- Flight Mass
VíceHmotnostní spektrometrie
Hmotnostní spektrometrie Podstatou hmotnostní spektrometrie je studium iontů v plynném stavu. Tato metoda v sobě zahrnuje tři hlavní části:! generování iontů sledovaných atomů nebo molekul! separace iontů
VíceRole hemoxygenasy a gangliosidů při estrogenové a obstrukční cholestáze
Role hemoxygenasy a gangliosidů při estrogenové a obstrukční cholestáze PETR T 1, ŠMÍD V 1, KUČEROVÁ V 1, ŠMÍDOVÁ J 2, VÁŇOVÁ K 1, VÍTEK L 1, ŠMÍD F 1, MUCHOVÁ L 1 1 Ústav klinické biochemie a laboratorní
VíceMáte rádi kuřata??? Jiří Hanika. Ústav chemických procesů AV ČR, v. v. i., Praha
Máte rádi kuřata??? Jiří Hanika Ústav chemických procesů AV ČR, v. v. i., Praha 1 Domácí chov? 2 Velkochov? 3 Budoucí rodinný oběd pro 4? 10 000 000 lidí si pochutná na více než 150 000 000 kuřat ročně!!!
VíceAbiotický stres - sucho
FYZIOLOGIE STRESU Typy stresů Abiotický (vliv vnějších podmínek) sucho, zamokření, zasolení půd, kontaminace prostředí toxickými látkami, chlad, mráz, vysoké teploty... Biotický (způsobený jiným druhem
VíceJaterní homogenát, preparativní nanáška 2 mg, barvení koloidní Coomassie Blue 1025 spotů. ph 4 ph 7
2018 PROTEOMIKA 2018 Proteomika, proteiny, co a proč. Metody práce s bílkovinami (Petrák 15/10) Značení bílkovin, separační metody, 2-DE (Petrák 22/10) 2-DE záludnosti, digesce a identifikace bílkovin
VícePondělí 10. září 2007
Pondělí 10. září 2007 8:00-13:00 Příjezd účastníků, registrace, instalace stánků 12:00-13:00 Oběd Sekce 1: Úvod do hmotnostní spektrometrie (předsedající: M. Ryska, V. Havlíček) 13:00-13:10 J. Čáslavský
VíceVliv selenu na metabolismus laboratorního potkana
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze Vliv selenu na metabolismus laboratorního potkana Klára Truhlářová, FPBT BL 342 Vliv selenu na metabolismus laboratorního potkana Laboratoř živočišné biochemie
VíceKOMBINACE PEPTIDŮ BRÁNÍCÍCH STÁRNUTÍ
KOMBINACE PEPTIDŮ BRÁNÍCÍCH STÁRNUTÍ GMP PEPTIDY PRO KOSMETICKÉ PŘÍPRAVKY NOVÁ SYNTETICKÁ SLOŽKA KOSMETICKÝCH PŘÍPRAVKŮ PŘEHLED Výzkum základních biochemických mechanismů působení proti vráskám vedl k
Více10. Tandemová hmotnostní spektrometrie. Princip tandemové hmotnostní spektrometrie
10. Tandemová hmotnostní spektrometrie Princip tandemové hmotnostní spektrometrie Informace získávané při tandemové hmotnostní spektrometrii Možné způsoby uspořádání tandemové HS a/ scan fragmentů vzniklých
VíceGlykobiologie Glykoproteomika Funkční glykomika
Glykobiologie Glykoproteomika Funkční glykomika Glycobiology how sweet it is! Monosacharidy (glukosa, fruktosa, galaktosa ) Oligosacharidy (maltosa, isomaltosa, sacharosa, laktosa.., oligosacharidové řetězce
VíceAutoři: Pavel Zachař, David Sýkora Ukázky spekter k procvičování na semináři: Tento soubor je pouze prvním ilustrativním seznámením se základními prin
Autoři: Pavel Zachař, David Sýkora Ukázky spekter k procvičování na semináři: Tento soubor je pouze prvním ilustrativním seznámením se základními principy hmotnostní spektrometrie a v žádném případě nezahrnuje
VíceSeznam otázek pro zkoušku z biofyziky oboru lékařství pro školní rok
Seznam otázek pro zkoušku z biofyziky oboru lékařství pro školní rok 2014-15 Stavba hmoty Elementární částice; Kvantové jevy, vlnové vlastnosti částic; Ionizace, excitace; Struktura el. obalu atomu; Spektrum
VíceÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH
ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH ZPRÁVA O UKONČENÍ PROJEKTU Projekt Název projektu: Stanovení biomarkerů oxidativního stresu u kapra obecného (Cyprinus carpio L.) po
VíceVÝBĚROVÁ ŘÍZENÍ CENTRUM REGIONU HANÁ PROJEKT EXCELENTNÍ VÝZKUM (OP VVV)
VÝBĚROVÁ ŘÍZENÍ CENTRUM REGIONU HANÁ PROJEKT EXCELENTNÍ VÝZKUM (OP VVV) Oddělení biofyziky - absolvování magisterského studia v oboru biofyzika, biochemie nebo v biologickém oboru - prezenční Ph.D. studium
VíceDynamické procesy & Pokročilé aplikace NMR. chemická výměna, translační difuze, gradientní pulsy, potlačení rozpouštědla, NMR proteinů
Dynamické procesy & Pokročilé aplikace NMR chemická výměna, translační difuze, gradientní pulsy, potlačení rozpouštědla, NMR proteinů Chemická výměna jakýkoli proces při kterém dané jádro mění svůj stav
VíceZTOX / Základy Toxikologie. Radim Vrzal
ZTOX / Základy Toxikologie Radim Vrzal I. Autobrewery syndrome (Gut fermentation syndrome, Endogennous ethanol fermentation) Bylo nebylo 23.9.2013 Muž měl unikátní chorobu, jeho tělo si samo vyrábělo alkohol
VíceMetody používané v MB. analýza proteinů, nukleových kyselin
Metody používané v MB analýza proteinů, nukleových kyselin Nukleové kyseliny analýza a manipulace Elektroforéza (délka fragmentů, čistota, kvantifikace) Restrikční štěpení (manipulace s DNA, identifikace
VíceMETABOLISMUS POJIVA PLICNÍCH CÉV PŘI CHRONICKÉ HYPOXII. Jana Novotná
METABOLISMUS POJIVA PLICNÍCH CÉV PŘI CHRONICKÉ HYPOXII Jana Novotná Hypoxie nedostatek O 2 v krvi (srdeční nebo plicní onemocnění). Plicní hypertenze zvýšení krevního tlaku v plicním cévním řečišti (plicní
VíceÚstav experimentální medicíny AV ČR úspěšně rozšířil přístrojové vybavení pro vědce z peněz evropských fondů
Ústav experimentální medicíny AV ČR úspěšně rozšířil přístrojové vybavení pro vědce z peněz evropských fondů Ústav úspěšně dokončil realizaci dvou investičních projektů s využitím prostředků z Operačního
VíceAktivní B12 (Holotranskobalamin) pokrok v diagnostice deficitu vitaminu B12
Aktivní B12 (Holotranskobalamin) pokrok v diagnostice deficitu vitaminu B12 Firma Abbott Laboratories nabízí na imunoanalytických systémech ARCHITECT test ke stanovení biologicky aktivní části vitaminu
VíceAnalytická technika HPLC-MS/MS a možnosti jejího využití v hygieně
Analytická technika HPLC-MS/MS a možnosti jejího využití v hygieně Šárka Dušková 24. září 2015-61. konzultační den Hodnocení expozice chemickým látkám na pracovištích 1 HPLC-MS/MS HPLC high-performance
VíceChyby spektrometrických metod
Chyby spektrometrických metod Náhodné Soustavné Hrubé Správnost výsledku Přesnost výsledku Reprodukovatelnost Opakovatelnost Charakteristiky stanovení 1. Citlivost metody - směrnice kalibrační křivky 2.
VíceKosmetika a kosmetologie Přednáška 8 Funkční látky péče o kůži II
Kosmetika a kosmetologie Přednáška 8 Funkční látky péče o kůži II Přednáška byla připravena v rámci projektu Evropského sociálního fondu, operačního programu Vzdělávání pro konkurenceschopnost s názvem
VíceZkušební okruhy k přijímací zkoušce do magisterského studijního oboru:
Biotechnologie interakce, polarita molekul. Hydrofilní, hydrofobní a amfifilní molekuly. Stavba a struktura prokaryotní a eukaryotní buňky. Viry a reprodukce virů. Biologické membrány. Mikrobiologie -
VíceBUNĚČNÁ TRANSFORMACE A NÁDOROVÉ BUŇKY
BUNĚČNÁ TRANSFORMACE A NÁDOROVÉ BUŇKY 1 VÝZNAM BUNĚČNÉ TRANSFORMACE V MEDICÍNĚ Příklad: Buněčná transformace: postupná kumulace genetických změn Nádorové onemocnění: kolorektální karcinom 2 3 BUNĚČNÁ TRANSFORMACE
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv Vydání 1 STANOVENÍ OBSAHU KOKCIDIOSTATIK METODOU LC-MS
Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU KOKCIDIOSTATIK METODOU LC-MS 1 Účel a rozsah Postup specifikuje podmínky pro stanovení diclazurilu, halofuginonu, lasalocidu, maduramicinu, monensinu, narasinu, nikarbazinu, robenidinu,
VíceNAŘÍZENÍ KOMISE (EU) /... ze dne , kterým se mění nařízení (ES) č. 847/2000, pokud jde o definici pojmu podobný léčivý přípravek
EVROPSKÁ KOMISE V Bruselu dne 29.5.2018 C(2018) 3193 final NAŘÍZENÍ KOMISE (EU) /... ze dne 29.5.2018, kterým se mění nařízení (ES) č. 847/2000, pokud jde o definici pojmu podobný léčivý přípravek (Text
VíceGel-based a Gel-free kvantifikace v proteomice
Gel-based a Gel-free kvantifikace v proteomice Juraj Lenčo Ústav molekulární patologie Fakulta vojenského zdravotnictví U Hradec Králové Funkce proteinů Proteomika Lokalizace proteinů Proteinové interakce
Víceměkká ionizační technika pro analýzu biomolekul vstup
Náplň přednášky MALDI TOF MS Základy MALDI, TOF a vybrané aplikace 1. MALDI - princip, role matrice 2. Průletové analyzátory 3. Vybrané aplikace MALDI MS Iva Tomalová Metody chemického výzkumu, 10.12.2014
VíceSekunda (2 hodiny týdně) Chemické látky a jejich vlastnosti Směsi a jejich dělení Voda, vzduch
Sekunda (2 hodiny týdně) Chemické látky a jejich vlastnosti Směsi a jejich dělení Voda, vzduch Atom, složení a struktura Chemické prvky-názvosloví, slučivost Chemické sloučeniny, molekuly Chemická vazba
VíceMALDI hmotnostní spektrometrie pro analýzu kovy značených proteinů. Typ laseru Vlnová délka UV-MALDI N 2
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií MALDI hmotnostní spektrometrie pro analýzu kovy značených proteinů Teorie PRINCIP MALDI Laserová desorpce/ionizace za účasti matrice (MALDI) měkká ionizační technika;
VíceJednotné pracovní postupy zkoušení krmiv STANOVENÍ OBSAHU NEPOVOLENÝCH DOPLŇKOVÝCH LÁTEK METODOU LC-MS
Národní referenční laboratoř Strana 1 STANOVENÍ OBSAHU NEPOVOLENÝCH DOPLŇKOVÝCH LÁTEK METODOU LC-MS 1 Účel a rozsah Tato metoda specifikuje podmínky pro stanovení nepovolených doplňkových látek Zn-bacitracinu,
VíceSYNTETICKÉ OLIGONUKLEOTIDY
Oddělení funkční genomiky a proteomiky Přírodovědecká fakulta Masarykovy university SYNTETICKÉ OLIGONUKLEOTIDY Hana Konečná CENTRÁLNÍ LABORATOŘ Masarykovy Univerzity v Brně ODDĚLENÍ FUNKČNÍ GENOMIKY A
VíceMinerální výživa na extrémních půdách. Půdy silně kyselé, alkalické, zasolené a s vysokou koncentrací těžkých kovů
Minerální výživa na extrémních půdách Půdy silně kyselé, alkalické, zasolené a s vysokou koncentrací těžkých kovů Procesy vedoucí k acidifikaci půd Zvětrávání hornin s následným vymýváním kationtů (draslík,
VíceMetody používané v MB. analýza proteinů, nukleových kyselin
Metody používané v MB analýza proteinů, nukleových kyselin Proteiny analýza a manipulace Izolace, purifikace (rozdělovací metody) Centrifugace Chromatografie Elektroforéza Blotting (identifikace, western
VíceANORGANICKÁ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE
ANORGANICKÁ HMOTNOSTNÍ SPEKTROMETRIE (c) David MILDE 2003-2010 Metody anorganické MS ICP-MS hmotnostní spektrometrie s indukčně vázaným plazmatem, GD-MS spojení doutnavého výboje s MS, SIMS hmotnostní
VíceCZ.1.07/2.4.00/31.0133
BiochemNet - Vytvoření sítě pro podporu spolupráce biomedicínských pracovišť a zvýšení uplatnitelnosti absolventů biochemických oborů v praxi CZ.1.07/2.4.00/31.0133 Univerzita Palackého Přírodovědecká
VíceMetody používané v MB. analýza proteinů, nukleových kyselin
Metody používané v MB analýza proteinů, nukleových kyselin Nukleové kyseliny analýza a manipulace Elektroforéza (délka fragmentů, čistota, kvantifikace) Restrikční štěpení (manipulace s DNA, identifikace
VíceZdroje iont používané v hmotnostní spektrometrii. Miloslav Šanda
Zdroje iont používané v hmotnostní spektrometrii Miloslav Šanda Ionizace v MS Hmotnostní spektrometrie je fyzikáln chemická metoda, pi které se provádí separace iont podle jejich hmotnosti a náboje m/z
VíceFLUORESCENČNÍ MIKROSKOP
FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP na gymnáziu Pierra de Coubertina v Táboře Pavla Trčková, kabinet Biologie, GPdC Tábor Co je fluorescence Fluorescence je jev spočívající v tom, že některé látky (fluorofory) po
VíceChromatografie. Petr Breinek
Chromatografie Petr Breinek Chromatografie-I 2012 Společným znakem všech chromatografických metod je kontinuální dělení složek analyzované směsi mezi dvěma fázemi. Pohyblivá fáze (mobilní), eluent Nepohyblivá
VíceDNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH. Michaela Nesvadbová
DNA TECHNIKY IDENTIFIKACE ŽIVOČIŠNÝCH DRUHŮ V KRMIVU A POTRAVINÁCH Michaela Nesvadbová Význam identifikace živočišných druhů v krmivu a potravinách povinností každého výrobce je řádně a pravdivě označit
VíceOdůvodnění veřejné zakázky. LC-MS systém pro proteomiku a genomiku
Odůvodnění veřejné zakázky dle ustanovení 156 odst. 1 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách, ve znění pozdějších předpisů (dále jen zákon ) a vyhlášky č. 232/2012 Sb., o podrobnostech rozsahu odůvodnění
VícePraktický kurz Praktický kurz monitorování apoptózy a autofágie u nádorových prostatických buněk pomocí průtokové cytometrie
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií Praktický kurz Praktický kurz monitorování apoptózy a autofágie u nádorových prostatických buněk pomocí průtokové cytometrie Nastavení průtokového cytometru a jeho
Více