KLINICKÁ MIKROBIOLOGIE gastriontestinální a sexuálně přenosné infekce. MUDr. Pavel Čermák, CSc.

Transkript

1 KLINICKÁ MIKROBIOLOGIE gastriontestinální a sexuálně přenosné infekce MUDr. Pavel Čermák, CSc.

2 Běžná flóra GIT tlusté střevo / téměř vše / dutina ústní / koky / neustálá obnova

3 Běžně sterilní oblasti jícen žaludek duodenum + žlučové cesty jejunum horní ileum / dolní ileum - fekální flóra / - problematická diagnostika

4 Střevní infekce Původce průjmu /3 /3 /3 Infekce interní onem. obžerství bakteriální inf. virové inf. bakteriální enterokolitida enterotoxikóza (S.aureus) exotoxin!!!

5 Patogenní střevní bakterie ČR Salmonella enteritidis 90% Salmonella typhimurium Campylobacter sp. Shigella sonnei, Shigella flexneri Yersinia enterocolitica Vibrio cholerae E. coli děti enteropatogenní, enterotoxigenní enteroinvazivní, enterohemorhag. dospělí cestovatelský průjem jiné enterobakterie = NESMYSL

6 Taxonomie salmonel 2005 rod Salmonella má 2 druhy: S. enterica (dříve cholerasuis) S. bongori (dříve subspec. V) S. enterica má 6 podspecies: S. enterica enterica S. enterica salamae S. enterica arizonae, S.e.diarizonae S. enterica houtenae S. enterica bongon S. enterica indica Kauffman-Whiteova klasifikace podle tělových O a bičíkových H antigenů 2000 sérotypů, zjednodušený zápis Salmonella Enteritidis (,9,2;g,m) = S. enterica enterica enteritidis

7 Salmonely 997 FN HK Salm. enteritidis Salm. typhimurium Salm. skup. C isolace pacienti

8 Salmonely 997 FN HK počet dec. 2.dec. 3.dec. 4.dec. 5.dec. 6.dec. 7.dec. isolace pacienti

9 Salmonely 997 FN HK počet dec. 2.dec. 3.dec. 4.dec. 5.dec. 6.dec. 7.dec. isol.ženy pac.ženy isol.muži pac.muži

10 salmonelové infekce primárně patogenní pro člověka tyfus, paratyfus Klinika - slabé střevní příznaky - bolesti hlavy, septické teploty - postižení mezenterických uzlin - rezervoár - žlučník primárně zoopatogenní průjmová onemocnění Klinika - průjmy - u oslabených sepse - metastatické infekce - nosičství až několik měsíců zdroj práci, drůbež v ČR 2x více infekcí než v záp. Evropě sporadický výskyt x epidemie

11 Shigella sp. 997 FN HK isolace pacienti Shigella flexneri 3 2 Shigella sonnei

12 shigelové infekce S. sonnei, S. flexneri, S. dysenteriae, S. boydii vředy v tlustém střevě shiga toxin Klinika - průjmy s tenesmy - hlen a krev ve stolici Abb. : Verlauf einer Shigella-Infektion () Shigella flexneri dringt durch die M-Zellen in das Dickdarmepithel ein. (2) Infektion und Apoptose des Makrophagen. (3) Infektion über die basolaterale Zellmembran und intraund interzelluläre Ausbreitung von S. flexneri mithilfe des Zellskeletts der Wirtszelle. (4) Neutrophile durchdringen das Epithel und führen zu einer neuen Welle der bakteriellen Infektion.

13 Campylobacter sp. 997 C.jejuni isolace 2x u 2 pacientů, v současné době některými autory považován za nejčastější mikroaerofilní vibria střevní trakt teplokrevných zvířat - drůbež, ovce, prasata inkubace 2-0 dní, často děti krátkodobá enteritida /5-7 dní/ ATB - makrolidy, chloramfenikol Dg. - transportní půda

14 Toxiny E. coli St. aureus Clostridium difficile Clostridium botuli enterotoxigenní terolab. a terostab. Toxin enterohemorh. - Verotoxin,2 enterotoxin toxin A - enterotoxin toxin B - nekrotoxin neurotoxin

15 Bakteriální střevní infekce souhrn Vehikulum Salmonelly - vajíčka + výrobky Shigelly - voda (Balkán, jih bývalého SSSR) Campylobacter - kuřata nemocný perzonál Vždy nedodržení technologie přípravy potravin nedodržení předpisů pro manipulaci a úschovu potravin

16 Bakteriální střevní infekce souhrn Klinika Průjem Šok Sepse Salmonella - nutná masivní infekce Shigella - stačí min. počet zárodků Enterotoxikóza - těžký průběh, rychlá restaurace Botulismus!!! - nejčastěji ze zeleniny Dg. - klasická kultivace, záchytnost silně kolísá (30-50%) Terapie - dle kliniky, symptomatická (náhrada tekutin) - ATB pouze u septických stavů, malých dětí prodlužují nosičství (Salm. jsou intracelulární, ukryjí se v bb. střev. sliz. exacerbace)

17 Viry - pouze patogeny - /3 průjmů Rotaviry RNA - mláďata savců - 5 skupin, nejvíce A /6serotypů/ Inkubace - 4 dny Enterotoxin - protrin NSP Očkování kojenců

18 Rotaviry - FN HK 997 počet měsíce vyšetření pozit.pac.

19 Viry Nekultivovatelné adenoviry Caliciviry DNA typy 40 a 4 - průjmy malých dětí RNA winter womiting disease - starší děti, dospělí Norwalk virus, SRS virus Lokální epidemie gastroenteritid Mexico virus, Bristol-like virus, Garlington-like virus

20 hepatoviry virus zařazení genom přenos imunizace HAV Picornaviridae, Hepatovirus RNA fekálně - orální pasivní, aktivní HBV HCV Hepadnoviridae, Orthohepadnovirus Flaviviridae, Hepacivirus DNA RNA parenterální parenterální pasivní, aktivní HDV Deltovirus RNA parenterální HEV Caliciviridae RNA fekálně - orální HGV Virus přenášený transfuzí parenterální inkubační doba: HAV 5 45 dní HAB dní přechod do chronicity 0% HCV 5 60 dní přechod do chronicity 70-90% HDV dní

21

22

23

24 diagnostika HAV, HBV ELISA

25 hepatitidy terapie symptomatická HBV alfainterferon,amivudin HCV alfa interferon, ribavirin Prevence HAV hygiena nemoc špinavých rukou sexuální praktiky HBV infikovaná krev, jakékoliv tělesné tekutiny bezpečný sex HCV infikovaná krev gamaglobulin nespecifický specifický očkování

26 Střevní prvoci Bičíkovci Měňavky Výtrusovci Nálevníci Giardia intestinalis Chilomastix mesnili Entamoeba histolytica - amébová dysnterie Entamoeba coli, hartmanni, pelecki Endolimax nana Cryptosporidium sp. - průjmy /AIDS/ Balantidium coli - ulcerosní kolitidy

27 Červi - tenké střevo Motolice Fasciolopsis buski /vodní rostliny/ Hlísti oblí Trichostrongylus sp. Ascaris lumbricoides Ancylostoma duodenale Necator americanus Strongyloides stercoralis /přežvýkavci/ /člověk, prase/ /člověk/ /člověk, pes, kočka/

28 Červi - tenké střevo Tasemnice Diphyllobothrium latum Taeniarhynchus saginatus Taenia solium Hymenolepsis nana Diphylidum caninum / ryby / / hovězí / / vepřové / / hlodavci / / psi /

29 Červi - tlusté střevo vyšetření od 942 pacientů Hlísti oblí Enterobius vermicularis isolací od 252 pacientů Trichiuris trichiura isolace od 2 pacientů

30 Listeriové infekce nálezy listerií v potravinách zvýšený výskyt listeriových infekcí v ČR medializace problému? jaký je skutečný výskyt prokázaných listeriových infekcí => retrospektivní studie záchytu listerií mikrobiologickými metodami v letech

31

32 listérie podmíněný patogen u zvířat (dobytek, ptáci, ryby) L. monocytogenes, L. ivanovii, L. inocua. problém potravinářského průmyslu prostředí masokombinátů zpracování mléka zpracování ryb kontaminace průmyslově vyráběných potravin veškeré masné výrobky (vepřové, hovězí) rybí výrobky (saláty atd) sýry (zrající)

33 listériové infekce Patogeneze primárně GIT infekce inaparentní až nespecifické chřipkové onemocnění intrauterinní postižení plodu Oslabení jedinci meningitídy sepse infekce novorozence velmi těžký průběh!!! Dg. kultivace, PCR (likvor, krev) Terapie ampicilin!!! fluorochinolony, azitromycin

34 Celkový trend výskytu onemocnění způsobená listeriemi počet

35 Výsledky celkem meningitis sepse meningitis sepse celkem dospělý dítě

36 Úmrtí na listeriovou infekci dítě dospělý celkem celkem 8 9

37 Rozbor diagnóz pacientů s listeriovou infekcí děti dospělí Diagnoza nízká porodní hmotnost bakterální sepse novorozence bakteriální meningitida bakteriální meningitida hematoonkolog. onemocnění selhání ledvin sepse jiná (8) 2(7) 2 4 nejčastěji hematoonkologické onemocnění těžké poškození ledvin různé etiologie terapie kortikoidy (nejčastěji OCHPN) diabetes a obezita alkoholismus výjimka zdravý sportovec (alkohol + gastronomický exces???)

38 Záchyt listerií v klinických vzorcích vzorek hemokultura likvor PCR likvor zvukovod aspirat žaludeční pupek krk oko pochva stolice počet PCR likvoru 8x pozitivní při negativní kultivaci výtěr z krku pozitivní u novorozenců generalizovaná infekce stolice generalizovaná Infekce novorozence pochva matky novorozenců s listeriovou infekcí

39 prediktivní mikrobiologie potravinářský průmysl normy pro přítomnost vybraných mikrobů některých bakterií se nelze zbavit..listérie jsou vždy obsaženy v potravinách!!! Problém transportu a uskladnění - v obchoníchřetězcích - v domácnosti znalost růstových vlastností bakterií - propočet kvantity v potravině do spotřeby - úprava norem, spotřební lhůty

40 Sexuálně přenosné infekce (STD) Původce Viry - herpesviry, retroviry (HIV,2) Patogen Bakterie - N.gonorrhoeae Treponema pallidum Chlamydia trachomatis Dysmikrobie (vaginóza) Ureaplasma urealytikum Gardnerella vaginalis streptokoky beta hemol. sk.b kvasinky

41 Sexuálně přenosné infekce (STD) Běžná vaginální flóra - laktobacily, PK- stafylokoky, koryneformní bakterie, alfa streptokoky (30% žen) Klinika muži ženy gonokoky chlamydie kvas.,strep.b, ostatní b Chlamydie - eroze dělož. čípku karcinom? Gard. vagin. - vaginóza - klin. syndrom (mírný výtok, pálení, bolesti atd.)

42 Sexuálně přenosné infekce (STD) Dg. mikroskopie (GO) IF (chlamydie), kultivace, serol. Nejčastější přenos Terapie GO - peniciliny, cefalosporiny chlamydie, ureapl. - tetracykliny, makrolidy, chinolony ostatní - dle citlivosti Obtížné, dlouhodobé - 4 denní intracelul.cyklus!pokud možno všechny partnery!

43 Sexuálně přenosné infekce (STD) lidské papilomaviry (HPV) HPV 6, condylomata accuminata HPV 6, 8, 45 - karcinom děložního čípku vakcinace virus lidského imunodeficitu HIV subtypů HIV 2 3 subtytpy přenos krví, spermatem, sliny méněčasto buňky s CD4 + receptory makrofágy a lymfocyty cytotoxické T lymf. CD8 + antigen p24, vysoká virémie snadné šíření pokles virémie, rovnovážný stav vyčerpání organismu, pokles CD4+ oportunní infekce terapie inhibitory reversní transkriptázy, virové proteázy, vstupu HIV do buňky

44

45

46