ZÁZRAK ŽIVOTA. Život je nejúchvatnějším jevem, který se rozšířil na naší SPECIÁLNÍ SEKCE



Podobné dokumenty
Mikrobiologický ústav AV ČR (MBÚ)

Ústavu molekulární genetiky AV ČR je padesát let

Ústav experimentální medicíny AV ČR úspěšně rozšířil přístrojové vybavení pro vědce z peněz evropských fondů

1. Definice a historie oboru molekulární medicína. 3. Základní laboratorní techniky v molekulární medicíně

Biotechnologické a biomedicínské centrum Akademie věd a Univerzity Karlovy ve Vestci BIOCEV

Prezentace přístavby IBC 2. Inovační biomedicínské centrum ÚEM AV ČR Aplikace VaV v inkubátoru. Aplikace VaV v inkubátoru IBC (ÚEM AV ČR)


ODBORNÝ OPONENTNÍ POSUDEK ZÁVĚREČNÉ ZPRÁVY 2011 PROJEKTU 1M0538 OP01

Středoevropský technologický institut

Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D. Brno, 20. března 2014

Využití metod strojového učení v bioinformatice David Hoksza

Soulad studijního programu. Molekulární a buněčná biologie

Informace o studiu. Životní prostředí a zdraví Matematická biologie a biomedicína. studijní programy pro zdravou budoucnost

BMII. B i o m e d i c a l D a t a P r o c e s s i n g G r o u p

Magisterský program Biomedicínské inženýrství a informatika na ČVUT FEL Praha

Úloha protein-nekódujících transkriptů ve virulenci patogenních bakterií

XLVI. zasedání Akademického sněmu AV ČR

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Nové NIKON centrum excelence pro super-rezoluční mikroskopii v Ústavu molekulární genetiky Akademie věd ČR

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta

analýzy dat v oboru Matematická biologie

OBOROVÁ RADA BIOCHEMIE A PATOBIOCHEMIE

MATEMATICKÁ BIOLOGIE

Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/

Výuka genetiky na Přírodovědecké fakultě MU

Prezentace školy Masarykova univerzita Žerotínovo nám. 9, Brno, Jihomoravský kraj. Veřejná vysoká škola

Vývoj léků a spolupráce průmyslu s akademií. Tisková konference 5. dubna 2017

Technologický transfer v regenerativní medicíně

Zkušební okruhy k přijímací zkoušce do magisterského studijního oboru:

OR Biomedicínská informatika

Možnosti spolupráce Masarykovy univerzity s aplikační sférou. prof. MUDr. Martin Bareš, Ph.D. prorektor pro rozvoj Masarykovy univerzity

Výzkumné centrum buněčné terapie a tkáňových náhrad

16:30 17:00 příchod hostů 17:00 18:00 představení jednotlivých firem v rozsahu 120 vteřin 18:00 22:00 neformální část akce

NUKLEOVÉ KYSELINY. Základ života

Molekulární biotechnologie. Nový obor, který vznikl koncem 70. let 20. století (č.1)

INOVATIVNÍ KURZY IMUNOANALÝZY A ENDOKRINOLOGIE PRO VĚDECKÉ PRACOVNÍKY- PILOTNÍ ZKUŠENOSTI LÉKAŘSKÉ FAKULTY V PLZNI

Standard studijního programu Experimentální biologie

Výpis parku: Inovační biomedicínské centrum ÚEM AV ČR. Charakteristika parku. Provozní údaje parku. Mezinárodní spolupráce

ČESKÉ VYSOKÉ UČENÍ TECHNICKÉ V PRAZE FAKULTA BIOMEDICÍNSKÉHO INŽENÝRSTVÍ STUDIJNÍ OBORY. přehled.

Nový bakalářský studijní obor Biomedicínská informatika na Fakultě biomedicínského inženýrství v Kladně

FN Olomouc je jedním ze 13 komplexních onkologických center v České republice, do kterých je soustředěna nejnáročnější a nejdražší

FAF UK NABÍDKA SPOLUPRÁCE. Alexandr Hrabálek

PODPORA VÝZKUMU, VÝVOJE A INOVACÍ

15 hodin praktických cvičení

Tekuté biopsie u mnohočetného myelomu


Postgraduální studium v oboru jaké jsou možnosti? Pavel Michálek, KARIM 1.LF a VFN Praha. University of East Anglia, Norwich, UK

DEN OTEVŘENÝCH DVEŘÍ NA ÚMG

Preventivní medicína

Projekt FR-TI2/075 MPO příklad spolupráce farmaceutů s komerčním sektorem. Milan Bartoš. Forum veterinarium, Brno 2010

Atestační otázky z oboru alergologie a klinická imunologie

187/2009 Sb. VYHLÁKA

JIC, zájmové sdružení právnických osob Brno, U Vodárny 2, PSČ tel fax jic@jic.cz

Algoritmy a struktury neuropočítačů ASN - P10. Aplikace UNS v biomedicíně

Tématické okruhy pro státní závěrečné zkoušky

Mámou i po rakovině. Napsal uživatel

M A T U R I T N Í T É M A T A

Všeobecné lékařství prezenční studium (5103T065) Studijní plán pro studenty studující v roce 2018/2019 v 6. ročníku (tj.

LÉKAŘSKÁ BIOLOGIE B52 volitelný předmět pro 4. ročník

Biomedicínské inženýrství na ČVUT FEL

Všeobecné lékařství prezenční studium (5103T065) Studijní plán pro studenty studující v roce 2018/2019 ve ročníku (tj.

Soulad studijního programu. Organická chemie. 1402T001 Organická chemie

Všeobecné lékařství prezenční studium (M5103) Studijní plán pro studenty studující v roce 2019/2020 ve ročníku (tj.

Pokročilé operace s obrazem

4 MEDi Ostrava Hi-tech výrobní laboratoře budoucnosti.

Mechanika s Inventorem

OBOROVÁ RADA Fyziologie a patofyziologie člověka

Studium optiky a optometrie na Fakultě biomedicínského inženýrství ČVUT

INDIKATIVNÍ TABULKA SE SEZNAMEM PROJEKTŮ ZAŘAZENÝCH V ZÁSOBNÍKU PROJEKTŮ V RÁMCI OPERAČNÍHO PROGRAMU VZDĚLÁVÁNÍ PRO KONKURENCESCHOPNOST

ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Mechanika s Inventorem

2. lékařská fakulta. Genomika CLIP

Soulad studijního programu. Bioorganická chemie a chemická biologie

Zkušenosti pracovišť LF UK a FN v Hradci Králové ze spolupráce s COC, s. r. o., Rybitví, při řešení společného výzkumného projektu

Výukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/

Specifická imunitní odpověd. Veřejné zdravotnictví

Molekulární medicína v teorii a praxi

Grantové projekty řešené OT v současnosti

"Učení nás bude více bavit aneb moderní výuka oboru lesnictví prostřednictvím ICT ". Základy genetiky, základní pojmy

Sylabus témat ke zkoušce z lékařské biologie a genetiky. Struktura, reprodukce a rekombinace virů (DNA viry, RNA viry), význam v medicíně

Program nejvhodnější kombinace produktů. Vyvinut odborníky Vědeckého a inovačního Střediska Společnosti v roce 2001.

Tisková zpráva. Ústav experimentální medicíny - výsledky aplikovaného výzkumu za rok 2014

Vědci se zabývali nanotechnologiemi i reakcemi bakterií a virů na extrémní prostředí stratosféry

ehealth, telemedicína a asistivní technologie na ČVUT FEL Praha

VÝBĚROVÁ ŘÍZENÍ CENTRUM REGIONU HANÁ PROJEKT EXCELENTNÍ VÝZKUM (OP VVV)

Informace o záměru projektu AstroBioCentra

NAŘÍZENÍ KOMISE (EU) /... ze dne , kterým se mění nařízení (ES) č. 847/2000, pokud jde o definici pojmu podobný léčivý přípravek

Inteligentní bydlení a asistivní technologie

Seznam akreditovaných oborů pro habilitační a jmenovací řízení

BIOMEDICÍNSKÁ INFORMATIKA A JEJÍ ÚLOHA V PERSONALIZOVANÉ MEDICÍNĚ

Témata prezentace. Základní údaje o české VaVaI. Reforma VaVaI (základní cíle a dokumenty, mezinárodní audit)

CEBIO smysl a cíl národní biotechnologické platformy

RNDr. Ivo Rudolf, Ph.D. Oddělení mikrobiologie a molekulární biotechnologie

Projekt realizovaný na SPŠ Nové Město nad Metují

na bázi aplikované fyziky

Obsah. IMUNOLOGIE Imunitní systém Anatomický a fyziologický základ imunitní odezvy... 57

Summer Workshop of Applied Mechanics. Vliv mechanického zatížení na vznik a vývoj osteoartrózy kyčelního kloubu

DOKTORSKÉ ( POSTGRADUÁLNÍ ) STUDIUM NA FARMACEUTICKÉ FAKULTĚ UK

OBRANNÝ IMUNITNÍ SYSTÉM

Příspěvky odvysílané na stanici Český rozhlas 3 Vltava od do

Transkript:

SPECIÁLNÍ SEKCE ZÁZRAK ŽIVOTA Život je nejúchvatnějším jevem, který se rozšířil na naší planetě, a jen počet kapek v moři či zrnek písku v poušti snese srovnání s počtem živých tvorů, kteří společně s námi obývají Zemi. Nikdy nejsme sami. I na nejodlehlejší místa nás provázejí miliardy mikroskopických tvorů, kteří s námi žijí někdy v symbióze a jindy jen k vlastnímu prospěchu; najdeme je v útrobách svého těla i na jeho povrchu. Svým zrakem, jenž sám o sobě patří k největším zázrakům přírody, pak můžeme spočinout na dalších tvorech, kteří kolem nás chodí, plavou, létají, nebo třeba kvetou. Řada organismů může významně ovlivnit kvalitu našeho života: některé vylepšují naše trávení, jiné nám slouží za potravu a ještě další naopak s povděkem uvítají nás samotné jako zdroj nové potravy a energie a naše těla jako báječné nové příbytky. Čím více toho o svých společnících na pozemské pouti víme, tím větší máme šanci ovlivnit své postavení v této hře. Ve speciální sekci vám představujeme pět ústavů Akademie věd České republiky a tři pracoviště Českého vysokého učení technického v Praze. Vědci a další odborníci se v nich zabý vají nejrůznějšími organismy od těch nejmenších až po člověka, aby nám pomohli k lepšímu zdraví, čistšímu prostředí a kvalitnějšímu životu. Redakce červenec 2012, www.sciam.cz 41

SPECIÁLNÍ SEKCE ZÁZRAK ŽIVOTA MIKROBIOLOGICKÝ ÚSTAV AV ČR, v. v. i. Počet publikací v impaktovaných časopisech za rok 2011:...........167 Počet patentů udělených v ČR v roce 2011:............ 1 Počet přihlášek vynálezů v zahraničí v roce 2011:..... 5 Počet projektů podpořených Evropskou unií:......... 11 Počet pracovníků:...... 581 Počet PhD.-studentů:..... 134 Počet diplomantů:....... 88 Před 60 lety vznikla Akademie věd, před 50 lety Mikrobiologický ústav O vybudování Československé akademie věd se reálně začalo uvažovat nedlouho po osvobození. Důležitým krokem k vytvoření moderních vědeckých pracovišť bylo zřízení ústředních vědeckých ústavů podle zákona přijatého 7. 12. 1949. Dne 1. července 1950 zahájil v Praze činnost mimo jiné i Ústřední ústav biologický (ÚÚB). 29. října 1952 přijalo Národní shromáždění zákon o ČSAV a na jeho základě byla ustanovena ČSAV na slavnostním shromáždění, které se konalo 17. listopadu téhož roku v Národním divadle. ÚÚB se do nově vzniklé Akademie věd zařadil pod názvem Biologický ústav ČSAV, který se v r. 1962 rozdělil na samostatný Mikrobiologický ústav, Ústav experimentální biologie a genetiky, Ústav experimentální botaniky a další laboratoře. O rok později, v polovině r. 1963, se Mikrobiologický ústav přestěhoval do nově vybudovaného areálu v Praze 4 Krči. Součástí Mikrobiologického ústavu se od samého začátky stala i Laboratoř pro výzkum řas v Třeboni a Laboratoř gnotobiologie v Novém Hrádku. Během 50 let své existence se Mikrobiologický ústav stal jednou z nejvýznamnějších vědeckých institucí v České republice, které se zabývají základním výzkumem v oboru mikrobiologie a imunologie. Kromě základního výzkumu přináší i řadu biotechnologických aplikací. Ivan Málek na Lékařské fakultě UK v Hradci Králové vytvořil pracovní skupinu, která se později stala základem Mikrobiologického oddělení Ústředního ústavu biologického. Významně se zasloužil o československou mikrobiologii a přispěl zejména k metodě kontinuální kultivace mikroorganismů. Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. Vídeňská 1083 142 20 Praha 4 tel.: +420 296 442 341 fax: +420 296 442 201 e-mail: mbu@biomed.cas.cz Užitečné mikroorganismy Sektor biogeneze a biotechnologie přírodních látek se zabývá především fyziologií a genetikou aktinomycet a vláknitých hub, produkujících sekundární metabolity s farmakologicky významnými účinky, dále genetikou, Zdravěji a v čistším světě Sektor buněčné a molekulární mikrobiologie studuje regulaci genové exprese, buněčnou diferenciaci, vliv vnitřních a vnějších podmínek na buněčné funkce, mechanismy buněčného stárnutí, význam cytoskeletální- fyziologií a biotechnologií vláknitých hub izolovaných z různých přírodních zdrojů. Zkoumáme také vznik odolnosti bakterií vůči antibiotikům a biotransformace přírodních látek a vyvíjíme enzymové technologie. 42 Scientific American České vydání, červenec 2012

www.biomed.cas.cz/mbu/cz ho aparátu při buněčném dělení a molekulární základy bakteriální patogenicity. Praktické uplatnění nachází již dnes studium nadprodukce aminokyselin používaných jako potravní doplňky či studium mechanismů časné interakce bakteriálních patogenů s hostitelem. Usilujeme také o využití mikrobních společenství při čištění extrémně znečištěných lokalit. Mezi zkoumané mikroorganismy patří především bakterie a kvasinky. Život z vody a světla Sektor fototrofních mikroorganismů sídlí u Opatovického rybníka v Třeboni. Výzkumný program tohoto sektoru se zaměřuje na studium fotosyntetických mikroorganismů, tj. zelených řas, sinic a fotosyntetických bakterií. Studuje produkční technologie řas, jejich optimalizaci a zpracování produktů jakož i různé způsoby využití řasové hmoty. Cílem prestižního projektu ALGATECH je vyvinout nová kultivační zařízení a postupy zpracování řasové biomasy pro výrobu biopaliv, krmiv, Prospěch z půdního světa RNDr. Jiří Gabriel, DrSc., zástupce ředitele potravních doplňků a dalších cenných látek. Projekt se také zaměřuje na výzkum v oblasti fotosyntézy, na vývoj nových měřicích přístrojů a na výchovu studentů v těchto oblastech. Sektor ekologie se zaměřuje na komplexní fyziologickou, biochemickou a genetickou charakterizaci půdních mikroorganismů s využitím nejmodernějších technik molekulární biologie. Pozornost je věnována především metagenomice, metatranskriptomice a metaproteomice. Mikroorganismy jsou studovány z hlediska rozkladu přirozené organické hmoty (opadu), ale i z hlediska biologického odbourání vybraných organických nečistot. Tradičně zkoumáme mykorhizní houby a výrazně jsme pokročili s detekcí lanýžů a s jejich umělou kultivací. Součástí sektoru je i Sbírka kultur basidiomycetů, která uchovává několik stovek kmenů vyšších hub. Z jedné z nich, slizečky porcelánové (Oudemansiella mucida) izoloval Václav Musílek jediné původní československé antibiotikum Mucidin, které se dostalo do výroby a lékařské praxe. Organismy, jimiž se zabýváme, mají mikroskopické rozměry, ale jejich význam je nezměrný a užitek z nich je obrovský. RNDr. Martin Bilej, DrSc. ředitel MBÚ AV ČR, v.v.i. Výzkumná centra na MBÚ v roce 2011 Centrum cílených terapeutik Centrum molekulární a buněčné imunologie Výzkumné centrum pro studium obsahových látek ječmene a chmele Centrum molekulárních metod monitorování difúzního znečištění životního prostředí Centra základního výzkumu na MBÚ v roce 2011 Centrum molekulární biologie a fyziologie společenstev kvasinek Centrum funkční organizace buňky Centrum biokatalýzy a biotransformací Centrum environmentální mikrobiologie K lepší imunitě Sektor imunologie a gnotobiologie se zabývá studiem vzniku a vývoje imunitní odpovědi, funkční charakterizací složek imunitního systému a regulací imunitní odpovědi. Zaměřujeme se na autoimunitní a nádorová onemocnění. Cílená léčiva využívající polymerní nosiče, která byla vyvinuta v těsné spolupráci s Ústavem makromolekulární chemie AV ČR, představují jednu z nadějných možností protinádorové terapie. Detašovaná laboratoř sektoru v Novém Hrádku v Orlických horách využívá pro studium vztahů mikroorganismů a hostitele unikátní model bezmikrobních zvířat. Zapojení do projektu BIOCEV Mikrobiologický ústav je zapojen do projektu BIOCEV, společného projektu šesti ústavů Akademie věd ČR a dvou fakult Univerzity Karlovy v Praze, jehož cílem je realizace vědeckého centra excelence v oblastech biotechnologií a biomedicíny. Mikrobiologický ústav vytváří expertní vědecké týmy, které budou v rámci projektu zodpovědné za oblast prokaryotické a eukaryotické mikrobiologie a imunologie. červenec 2012, www.sciam.cz 43

SPECIÁLNÍ SEKCE ZÁZRAK ŽIVOTA ÚSTAV MOLEKULÁRNÍ GENETIKY AV ČR, v. v. i. Počet publikací citovaných více než 50krát za období 2002 2011:..... 42 Celkový počet citací těchto publikací v letech 2002 2011:.... 4828 Počet grantových projektů řešených v roce 2012:.... 121 Počet pracovníků:...... 389 Počet PhD.-studentů:...... 91 Počet dipolomantů:....... 32 Plocha nové budovy UMG:...12 500 m 2 Z toho plocha laboratoří:.........4500 m 2 Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i. Vídeňská 1083 142 20 Praha 4 Tel.: +420 241 063 215 Tel.: +420 224 310 234 Fax: +420 224 310 955 E-mail: office@img.cas.cz 50 let objevů Transgenní jednotka ÚMG Geneticky modifikované myší modely se staly klíčovým nástrojem základního a biomedicínského výzkumu. Cílené úpravy genomu poskytují možnost řídit expresi vybraných genů a odhalovat jejich role na úrovni celého organismu. To umožňuje vytvářet modely genetických poruch a vyhodnocovat účinky léků a jiných látek. V roce 1962 byl založen Ústav experimentální biologie a genetiky ČSAV (ÚEBG), ředitelem se stal Milan Hašek, vedoucí Oddělení experimentální biologie a genetiky Biologického ústavu ČSAV a spoluobjevitel imunologické tolerance. V 60. letech se na ÚEBG zrodila československá imunogenetická škola: vedle Haška například Pavol a Juraj Iványi, Jan Klein, Tomáš Hraba, Ivan Hilgert, Věra Hašková a Alena Lengerová. Hašek měl blízko k Nobelově ceně a P. Iványi se významně podílel na pokusech, za které později dostal Nobelovu cenu Jean Dausset. Jan Svoboda rozvíjel světově prioritní výzkum retrovirů. Vedle hlavního sídla v Dejvicích a několika laboratoří v Krči získal ÚMG chovné a experimentální zařízení v Kolči. S koncem nadějí roku 1968 skončila i tato slavná éra. Milan Hašek byl zbaven vedení ústavu, byly drasticky omezeny zahraniční kontakty. Mnozí pracovníci emigrovali a velmi úspěšně si vedli na nových působištích. Jan Klein se v USA stal v 70. letech zřejmě nejvýznamnějším světovým imunogenetikem; spoluobjevil imunologický význam MHC proteinů. V r. 1977 byl ÚEBG spojen s několika biochemickými laboratořemi ÚOCHB a přejmenován na Ústav molekulární genetiky ČSAV. Ředitelem ÚMG se stal pozdější předseda ČSAV Josef Říman. Od té doby byla hlavním tématem ústavu molekulární biologie. Dřívější tradiční směry imunogenetika, retrovirologie a nádorová imunologie pokračovaly stále více na molekulární úrovni. V 70. a 80. letech se J. Říman podílel na objevu reverzní transkriptázy, J. Svoboda objevil virogenii a V. Pačes určil sekvenci jednoho z prvních virových genomů. V r. 1991 se stal ředitelem Jan Svoboda a v roce 1999 ho vystřídal Václav Pačes. Po zvolení V. Pačesa předsedou Akademie věd České republiky se v roce 2005 stal ředitelem Václav Hořejší. V r. 2007 byla v krčském areálu AV ČR dokončena nová budova ústavu. Poprvé v historii tak mohla většina pracovníků ÚMG sídlit v jednom centru. Projekty programu Výzkumná centra řešené na ÚMG v letech 2005 2011 Centrum molekulární a buněčné biologie Řešitel: Prof. RNDr. Václav Hořejší, CSc. Centrum aplikované genomiky Řešitel: Prof. RNDr. Václav Pačes, DrSc. Centrum cílených terapeutik Spoluřešitel: RNDr. Milan Fábry, CSc. Projekty programu Centra základního výzkumu řešené na ÚMG v letech 2005 2011 Centrum buněčné invazivity v embryonálním vývoji a metastázách nádorů Řešitel: RNDr. Michal Dvořák, CSc. Centrum ekologie vektorů a patogenů Spoluřešitel: Doc. Marie Lipoldová, CSc. Fluorescenční mikroskopie v biologickém a lékařském výzkumu Spoluřešitel: prof. RNDr. Pavel Hozák, DrSc. Centrum funkční organizace buňky Řešitel: Prof. RNDr. Pavel Hozák, DrSc. 44 Scientific American České vydání, červenec 2012

www.img.cas.cz Do boje s alergiemi! Podařilo se prokázat, že aktivace žírných buněk vede k tvorbě doposud nepopsaných mikrotubulárních výběžků, a na molekulární úrovni objasnit, jak vznikají. Klíčovou roli mají výrazné změny ve vnitrobuněčné koncentraci vápenatých iontů. Jak se léčí poraněné buňky? Vědcům z ÚMG se ve spolupráci s pracovištěm na Drexel University College of Žírné buňky (mastocyty) jsou důležitou součástí imunitního systému, zodpovídají však také za škodlivé zánětlivé a alergické reakce a astma. Významnou roli hrají též při vzniku autoimunitních chorob, například revmatické artritidy nebo roztroušené sklerózy. Nová diagnostika, nová chemoterapie Změny sestřihu RNA a nová léčiva Při aktivaci žírných buněk dochází k rychlé tvorbě výběžků, které obsahují mikrotubuly. Žírné buňky jsou součástí obranných mechanismů působících proti bakteriím a jiným patogenům a při střetech s nimi mohou být poškozeny. Vědci z ÚMG zjistili, že se zvyšující se dávkou bakteriálního toxinu streptolysinu O se zvyšuje úmrtnost buněk v důsledku tvorby otvorů v plasmatické membráně. Pokud jsou však buňky ovlivněny látkou, která podporuje tvorbu membránových váčků (vakuolinem), umírají buňky méně často. Medicine ve Filadelfii podařilo prokázat, že u glioblastomů dochází ke kumulaci dvou typů vnitrobuněčných proteinů tubulinů, β-iii-tubulinu a γ-tubulinu. To může přispívat k abnormálnímu chování těchto nádorových buněk. Pokusy ukazují, že tubuliny představují nejen nové nástroje pro diagnostiku těchto typů nádorů, ale že β-iii-tubulin by možná mohl být i vhodnou cílovou molekulou pro vývoj nových účinných chemoterapeutik. Poruchy sestřihu RNA mohou vést k závažným onemocněním. O sestřihu rozhodují hlavně krátké úseky v RNA a regulační molekuly, jež tyto úseky v RNA rozpoznávají. Tým Davida Staňka však zjistil, že o alternativním sestřihu se částečně rozhoduje již na úrovni DNA. Malé modifikace histonů mění sestřih některých molekul RNA, např. těch, které kódují bílkovinu fibronektin. Modifikace histonů lze ovlivňovat různými látkami, a tak je možno nepřímo měnit i sestřih RNA. Mnohé tyto látky se testují v klinických studiích jako možná léčiva nádorových či neurodegenerativních onemocnění. Tato léčiva by mohla učinkovat i proti nemocem způsobeným chybným sestřihem RNA. Na základě mnohaletých zkušeností vím, že komerčně nejúspěšnější produkty pocházejí z hodně originálního základního výzkumu. Prof. RNDr. Václav Hořejší, CSc. ředitel ÚMG AV ČR, v.v.i. 7 spin-off biotechnologických firem založených pracovníky ÚMG AppGenics s.r.o. Apronex s.r.o. Cellvia s.r.o. EXBIO Praha a.s. Proteix s.r.o. recoli s.r.o. Top-Bio s.r.o. Spolupráce ÚMG s podnikatelskou sférou v letech 2010 a 2011 Hybridomové linie produkující komerčně využitelné monoklonální protilátky. Konjugované nanočástice s monoklonálními protilátkami v rámci projektu Nové nanopartikule pro ultrastrukturální diagnostiku. Nanovlákenné nosiče s inkorporovaným cyklosporinem A a nesoucí kmenové buňky pro terapeutické využití. Nová metoda pro stanovení nízkých koncentrací bílkovin v komplexních biologických tekutinách pomocí nano-imuno-pcr. Certifikovaná metodika Kvalitativní průkaz antigenů virových vakcín. Monoklonální protilátky navázané na zlaté nanotyčinky a kubické paladiové nanočástice. Projekt BIOCEV ÚMG připravuje spolu s dalšími pěti ústavy AV ČR a dvěma fakultami Univerzity Karlovy projekt výstavby Centra excelence Biotechnologického a biomedicínského centra Akademie věd a Univerzity Karlovy ve Vestci (BIOCEV). Do konce r. 2014 by mělo vyrůst moderní výzkumné centrum s podlahovou plochou 26 000 m 2. Nabídne až 600 nových pracovních příležitostí včetně 250 míst pro doktorandy a diplomanty. červenec 2012, www.sciam.cz 45

SPECIÁLNÍ SEKCE ZÁZRAK ŽIVOTA BIOTECHNOLOGICKÝ ÚSTAV AV ČR, v. v. i. Počet publikací v impaktovaných časopisech za rok 2011:........... 42 Počet výzkumných projektů řešených v roce 2011:..... 25 Úspěšnost v získání projektů Grantové agentury ČR, kde je BTÚ řešitelem, v roce 2011:..........45 % Počet pracovníků:....... 89 Počet PhD.-studentů:...... 17 Počet diplomantů:........ 6 Počet organizovaných mezinárodních akcí v roce 2011:............ 3 Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i. Vídeňská 1083 142 20 Praha 4 Tel.: +420 241 063 613 Fax: +420 244 471 707 e-mail: btu-office@img.cas.cz http://www.ibt.cas.cz Na pomoc lékařům Nové látky pro diagnostiku Jedním ze dvou směrů základního výzkumu ústavu je příprava nových biotechnologicky, diagnosticky a lékařsky důležitých biomolekul, proteinů a nukleových kyselin, konstruovaných nejmodernějšími technikami molekulární biologie a proteinového inženýrství. Objasnění struktur studovaných biomolekul a jejich vzájemného působení umožní jejich modifikaci a využití např. pro diagnostiku nemocí. Laboratoř inženýrství vazebných proteinů se zabývá designem a zlepšováním Odhalit nemoc včas Laboratoř strukturní biologie směřuje výzkum do oblasti vztahů mezi strukturou a funkcí medicínsky vhodných proteinů. Výsledky výzkumu jsou využitelné pro návrh a optimalizaci sloučenin sloužících k detekci pevných nádorů, zejména pak nádorů rakoviny prostaty. Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i., se sídlem v areálu Akademie věd v Praze Krč, je velice mladým ústavem, založeným Akademií věd České republiky 1. ledna 2008. Základem ústavu bylo několik skupin, které byly určitou dobu součástí Biotechnologického sektoru Ústavu molekulární genetiky AV ČR, v. v. i., většina skupin byla nově ustavena. U zrodu ústavu stál první ředitel Peter Šebo, od roku 2010 je ředitelkou ústavu Jana Pěknicová. Ústav se zabývá špičkovým základním výzkumem zaměřeným na praktické využití výsledků v diagnostických a terapeutických aplikacích. Jeho 8 skupin se zaměřuje na nádorová onemocnění, neplodnost, autoimmunní nemoce a embryopatii a vyvíjí nové biotechnologické metody a nástroje na úrovni molekulární, genové, proteinového inženýrství a strukturní biologie. Za první čtyři roky existence BTÚ jeho vědečtí pracovníci publikovali řadu odborných článků v impaktovaných časopisech a získavají v grantových soutěžích finance na svoji výzkumnou práci. Tento trend má jasně vzestupnou tendenci a lze jednoznačně očekávat, že se Biotechnologický ústav AV ČR zařadí mezi špičková pracoviště v oblasti základního výzkumu s důrazem na přenos technologií do biomedicínské praxe. vlastností vysoce afinních vazebných proteinových ligandů zejména pro aplikace, ve kterých byly do současnosti neúspěšně používány monoklonální protilátky. Laboratoř biomolekulárního rozpoznávání studuje interakce biomolekul, proteinů a nukleových kyselin, biofyzikálními a bioinformatickými metodami. Výzkum se zaměřuje na ty aspekty interakcí, které vedou k specifickému rozpoznávání biomolekul s potenciálním diagnostickým, léčebným nebo biotechnologickým využitím. Část z trojrozměrné struktury proteinu na povrchu buněk nádoru prostaty (šedě a světle modře) s navázanou malou molekulou, která blokuje funkci tohoto proteinu (povrch malé molekuly je ohraničen sítí barevných teček) Proč jsou buňky nemocné? Druhým směrem výzkumu v ústavu je objasnění příčin patologického stavu buňky, zjištění exprese vybraných genů, detekce změn v lokalizaci a modifikaci vybraných proteinů a identifikace dalších molekul, které souvisí s indukcí patologie. Výzkum vede k vytvoření nových metod a nástrojů pro prevenci, diagnostiku a terapii příslušného patologického stavu. 46 Scientific American České vydání, červenec 2012

www.ibt.cas.cz Ať se rodí zdravé děti! Laboratoř reprodukční biologie se dlouhodobě zabývá charakterizací procesů a molekulárních faktorů během oplodnění vajíčka a rozvíjením nástrojů (monoklonální protilátky) pro detekci mužské neplodnosti a pro detekci vybraných faktorů znečišťujících životní prostředí majících negativní dopad na reprodukci savců. Laboratoř imunopatologie a imunoterapie se zaměřuje na humorální a genetické aspekty autoimunitních nemocí, na identifikaci cílových molekul využitelných v diagnostice a terapii autoimunitních chorob. Laboratoř molekulární patogenetiky identifikuje klíčové molekuly v patogenním embryonálnim vývoji pomocí zvířecích modelů a umožňuje tak vypracovat nové postupy pro prevenci a diagnózu diabetické embryopatie. Udělejme vše pro to, aby metody asistované reprodukce byly potřeba stále méně. Zlepšit podmínky pro přirozený vznik života je důležitější než zdokonalovat umělé technologie. Doc. RNDr. Jana Pěknicová, CSc. ředitelka BTÚ AV ČR, v.v.i. Histologický řez varletem: navozená apoptóza (vlevo) a kontrola (vpravo). Vymýtit rakovinu U léčených myší došlo k výraznému zpomalení zvětšování nádoru. Vpravo jsou ultrazvukové snímky nádoru u kontrolní a léčené myši. Laboratoř molekulární terapie se zaměřuje na rakovinné kmenové buňky a na vývoj nových protirakovinných látek, zejména analogů vitamínu E, které efektivně a selektivně působí proti maligně transformovaným buňkám tím, že navozují jejich smrt (apoptózu). Výzkum Laboratoře genové exprese je směrován k rozvoji nástrojů pro profilovou analýzu exprese genů pomocí vysokokapacitní polymerázové řetězové reakce s reverzní transkripcí (qrt-pcr) na tkáňové, jednobuněčné a sub-buněčné úrovni. Špičkové přístroje Vysokokapacitní zařízení BIOMARK (výrobce Fluidigm) umožňuje současnou analýzu exprese až 96 genů v rámci jednoho experimentu. Sledování exprese řady genů v jediné buňce urychlí objasňování regulačních mechanismů buňky, mechanismů diferenciace či mechanismů odpovědi buňky na farmaka nebo na nejrůznější stimuly, jako jsou např. vlivy životního prostředí. Přístroj Vevo 770 (Visual Sonics) slouží k neinvazivnímu zobrazování a kvantitativnímu vyhodnocování modelů různých onemocnění, zejména nádorových a kardiovaskulárních. Z výzkumu do praxe Výsledkem naší práce jsou i technologie zavedené do komerční sféry. Firmě EXBIO Praha, a. s. byly předány hybridomy k detekci proteinů na spermiích, které jsou důležité pro úspěšné oplození. Tyto hybridomy jsou využívány v centrech asistované reprodukce. Ve spolupráci s firmami VIDIA spol. s r.o., EXBIO Praha, a.s., r-ecoli spol, s r.o. byly připraveny kity k detekci vybraných znečišťujících látek v životním prostředí. Pedagogická činnost Důležitým úkolem ústavu jsou odborná školení pracovníků z různých institucí v biotechnologických technikách a výchova diplomantů a doktorandů biologických, biochemických, medicínských a zemědělských oborů. Pět pracovníků BTÚ přednáší na vysokých školách. Společně k novým cílům Biotechnologický ústav AV ČR se aktivně podílí na projektu BIOCEV v rámci Operačního programu Výzkum a vývoj pro inovace. Začlenění ústavu v projektu Biocev je mimořádnou šancí k jeho dalšímu rozvoji. Ústav je též aktivním členem sdružení BIOCEV z. s. p. o. a CzechBio asociace biotechnologických společností ČR, z. s. p. o.(http://www.ibt.cas.cz). červenec 2012, www.sciam.cz 47

SPECIÁLNÍ SEKCE ZÁZRAK ŽIVOTA ÚSTAV EXPERIMENTÁLNÍ MEDICÍNY AV ČR, v. v. i. Počet publikací v impaktovaných časopisech za rok 2011:........... 81 Počet národních výzkumných projektů řešených v roce 2011:..... 26 Počet významných patentů za rok 2011:........... 4 Počet zaměstnanců:......187 Počet PhD.-studentů:...... 46 Počet diplomantů:....... 19 EU Centre of Excellence Výzkum pro zdraví Ústav experimentální medicíny AV ČR byl založen v roce 1975 sloučením 4 laboratoří z lékařských fakult Univerzity Karlovy. Je uznávaným centrem základního biomedicínského výzkumu v České republice, vyniká zejména v buněčné biologii a patologii, neurobiologii, neurofyziologii, neuropatologii, vývojové toxikologii a teratologii, molekulární epidemiologii, molekulární farmakologii, Porézní hydrogely pomáhají léčit poranění míchy Oddělení neurověd studuje degenerativní onemocnění a poranění mozku a míchy. Léčba poranění míchy vyžaduje nejen implantaci kmenových buněk, ale i přemostění poškozené části míšní tkáně pomocí porézních biomateriálů nebo nanovláken, které umožní vrůstání nových nervových vláken. Jako vhodný biokompatibilní materiál byl ve spolupráci s Ústavem makromolekulární chemie AVČR vyvinut superporézní hydrogel na bázi poly(2-hydroxyethylmethakrylátu), jehož povrch byl modifikován cholesterolem a jeho vlastnosti byly optimalizovány pro implantaci do míšní tkáně. Na společném pracovišti s 2. lékařskou fakultou UK v nemocnici imunofarmakologii, výzkumu rakoviny, molekulární embryologii a oblasti kmenových buněk a tkáňových náhrad. Výsledky výzkumu na ÚEM AV ČR nacházejí využití v oboru ochrany životního prostředí, neurověd, regenerativní medicíny, farmakologie a diagnostických metod. V současné době má ústav 10 samostatných vědeckých oddělení a 1 samostatnou laboratoř. Motol již probíhají 2 klinické zkoušky využívající kmenové buňky u pacientů s poraněním míchy a u pacientů a amyotrofickou laterání sklerózou. Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i. Vídeňská 1083 142 20 Praha 4 Tel.: +420 241 062 230 Fax: +420 241 062 782 E-mail: uemavcr@biomed.cas http://www.iem.cas.cz Abychom viděli lépe Laboratoř histochemie a farmakologie oka zkoumá příčiny špatně se hojících lézí předního očního segmentu při různých očních onemocněních nebo poraněních a hledá možnosti jejich prevence a léčby. Probíhají studie využívající k léčbě defektů rohovky kmenové buňky. Stárnutí a hluk poškozují sluch Trehalosa je neredukující disacharid glukosy, který produkují nižší organismy jako protistresový faktor. U vyšších organismů trehalosa syntetizována není, ale jestliže je aplikována ve formě očních kapek na králičí rohovku poškozenou oxidačním stresem, omezí indukci prozánětlivých cytokinů, proteolytických enzymů a oxidační/antioxidační nerovnováhu. Výsledkem je podstatně zlepšené hojení rohovky. Oddělení neurofyziologie sluchu studuje především struktury a funkce sluchového systému u zvířat za normálních podmínek a sleduje změny během vývoje, stárnutí a po působení různých patologických činitelů, například hluku nebo léků poškozujících sluch. Výsledky výzkumu mechanismů poškození sluchu po vystavení intenzivnímu hluku, prováděného na potkanech, jsou v praxi ověřovány na pacientech a dobrovolnících v rámci spolupráce s ORL klinikami pražských nemocnic. Na tento 48 Scientific American České vydání, červenec 2012

www.iem.cas.cz výzkum navazuje projekt EU NANOEAR zabývající se vlivem lokálně podaných nanočástic na funkci vnitřního ucha. Další směr představuje analýza kódování akustických signálů sítěmi neuronů v centrálním sluchovém systému. Buněčná neurofyziologie Oddělení buněčné neurofyziologie se zabývá morfologickými a elektrofyziologickými vlastnostmi astrocytů a NG2 gliových buněk v patofyziologii mozkové ischemie a postupu Alzheimerovy choroby. Jsou studovány mechanismy vápníkové signalizace u arginin,vasopresin a oxytocin Nové léky proti zánětům neuronů za fyziologických i patologických podmínek. S využitím neinvazivní zobrazovací metody DW-MRI se ukázalo, že dlouhodobě přetrvávají změny v difuzivitě nervové tkáně po ischemickém poškození mozku a u Alzheimerovy choroby. Pomocí iontoforetické metody, která využívá iontově-selektivní elektrody, byly nalezeny změny velikosti mezibuněčného prostoru a související změny na buněčné úrovni. Dnes existuje celá řada onemocnění, která neumíme léčit a která vedou ke smrti nebo k těžké ivaliditě. Léčba těchto onemocnění vyžaduje soustředěný biomedicínský výzkum, který vede k vyvinutí nových léků, kmenových buněk a prostředků tkáňového inženýrství. Snaha zavést tyto nové metody léčby do praxe je naší prioritou. Prof. MUDr. Eva Syková, DrSc., FCMA ředitelka ÚEM AV ČR, v.v.i. Na oddělení farmakologie jsme ve spolupráci s Ústavem organické chemie a biochemie AV ČR u analogů purinových nukleotidů objevili látky, které mají imunosupresivní účinky. V koncentracích, které nejsou cytotoxické, inhibují produkci prostaglandinů a oxidu dusnatého. Biologické vlastnosti nově syntetizovaných derivátů purinu mohou být využity po vývoj nových protizánětlivých léčiv. Laboratoř tkáňového inženýrství Skupina vědců je především zaměřena na přípravu tkáňových náhrad, tvorbu buněčných nosičů, především biologicky odbouratelných a na bázi nanovláken, modelování proteinových struktur a rovněž vyhledávání možností praktického využití výsledků. Pracoviště vyvíjí technologii uvolňování bioaktivních látek s využitím nanovlákenných nosičů obohacených o liposomy, což umožňuje řízený přísun živin a léků přímo do místa defektu. Připravují se umělé náhrady pro klinické využití v ortopedii a v dalších oborech. Inovační biomedicínské centrum (IBC) IBC napomáhá vzniku a úspěšnému rozběhu spin-off firem založených na vědeckých výstupech Ústavu experimentální medicíny a podporuje spolupráci mezi firmami, výzkumnými pracovišti a investory. Služby IBC pro inovační začínající firmy: podpora konkurenceschopnosti v biomedicíně podpora aplikovaného výzkumu v biomedicíně podnikatelský inkubátor pro spin-off společnosti červenec 2012, www.sciam.cz 49

SPECIÁLNÍ SEKCE ZÁZRAK ŽIVOTA BIOFYZIKÁLNÍ ÚSTAV AV ČR, v. v. i. Zaostřeno na život O schopné vědce u nás pečujeme jako o vlastní děti. Doc. RNDr. Stanislav Kozubek, DrSc. ředitel BFÚ AV ČR, v.v.i. Počet publikací BFÚ v roce 2011........... 108 Počet realizovaných projektů základního výzkumu v roce 2011............ 87 Počet mezinárodních projektů s účastí BFÚ v roce 2011.... 26 Počet společných center základního nebo aplikovaného výzkumu s univerzitami od roku 2005............ 9 Počet zaměstnanců...... 198 Počet PhD.-studentů...... 74 Počet diplomantů........ 27 Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i. Královopolská 135 612 65 Brno Tel.: +420-541 517 111 Fax: +420-541 211 293 E-mail: ibp@ibp.cz www.ibp.cz Biofyzikální ústav byl založen v roce 1955; zkoumá živou přírodu prostředky moderní fyziky a biologie s cílem získat zásadní poznatky využitelné v praxi. Od roku 1970 se podílel na mezinárodních programech COMECON a Interkosmos, nově rozvíjí další mezinárodní projekty. V BFÚ je řada výzkumných směrů: od molekulární biologie a biochemie, přes fyzikální chemii Výzkum lidských embryonálních kmenových buněk a elektrochemii až po buněčnou biologii, genetiku a dědičnost, molekulární onkologii a evoluční biologii. Jedním z aktuálních směrů v BFÚ je výzkum lidských embryonálních kmenových buněk, který navazuje na dříve rozvinuté oblasti, jako jsou molekulární cytologie, cytometrie a epigenetika. Vybrali jsme tento směr jako jeden z mnoha příkladů úspěšného výzkumu. Důležitým výsledkem BFÚ z posledních let je zjištění, že v lidských embryonálních kmenových buňkách je uspořádání genomu zcela odlišné od diferencovaných buněk, jež se nacházejí ve tkáních a orgánech a vznikají z kmenových buněk. Lidský genom v jádrech buněk je tvořen 46 molekulami DNA a společně s některými proteiny tvoří látku, jež se nazývá chromatin. Prakticky celé 20. století se věřilo, že chromatin je uspořádán náhodně a jednotlivé molekuly DNA, jež nesou dědičnou informaci, plavou v jádře jako nudle v polévce. Teprve na přelomu 20. a 21. století se zjistilo, že chromatin je vysoce organizován, přičemž jednotlivé chromosomy vytvářejí prostorově oddělená teritoria (viz obrázek). Chromatin obsahuje řadu proteinových struktur, v nichž probíhají důležité procesy. Skupina E. Bártové zjistila, že u lidských embryonálních kmenových buněk je chromatin výrazně rozvolněn a teprve při vyvolané diferenciaci dochází k jeho kondenzaci. Jeden z genů odpovědných za stav pluripotence (oct3/4) byl ve kmenových buňkách nalezen na dlouhých smyčkách, které vybíhají z chromosomového teritoria (viz obrázek). Tyto výsledky byly již potvrzeny v odborné literatuře (viz E. Meshorer, Stem- Book, HSCI) a mají vysoký potenciál pro využití v humánní medicíně. Gen pluripotence (oct3/4, červeně) se v lidských embryonálních kmenových buňkách nachází na povrchu svého chromosomového teritoria (zeleně), často na dlouhých smyčkách vybíhajících z teritoria. BFÚ je moderní výzkumná organizace se špičkovou úrovni výzkumu v ČR BFÚ je umístěn v nádherném areálu, laboratoře jsou moderní, ústav je vybaven špičkovou technikou, kterou dále doplňuje z prostředků SF EU v rámci spolupráce s ICRC a CEITEC. V ústavu pracuje řada vynikajících vědců, kteří jsou špičkou ve světovém měřítku. Ústav koordinuje 3 Projekty excelence (M. Fojta, S. Kozubek, B. Vyskot) z celkového počtu 12 těchto projektů v oblasti živé přírody a chemie v ČR; na projektech excelence se dále podílejí J. Šponer a A. Kovařík. BFÚ koordinuje také několik projektů OP VK a pomáhá tak zajišťovat lidské zdroje v oblasti výzkumu pro ČR. Jsou to oddělení M. Fojty, S. Kozubka, A. Lojka a A. Kozubíka. Při závěrečném hodnocení výzkumného záměru BFÚ za období 2005 2011 akademická komise konstatovala, že BFÚ je nejlepší na AV ČR v celé řadě kritérií. Důležitý je zejména podíl na nejcitovanějších publikacích vytvořených v ČR, kde se BFÚ drží stále na špičce v ČR. 50 Scientific American České vydání, červenec 2012

FAKULTA ELEKTROTECHNICKÁ ČVUT V PRAZE KATEDRA KYBERNETIKY Výzkum v oblasti biomedicínské informatiky Několik oddělení katedry se věnuje výzkumu kombinujícímu pokročilé metody umělé inteligence s klasickými postupy zpracování signálu i s nejmodernějšími technologiemi. Cílem je nabídnout řešení pro aktuální otázky klinické biomedicíny a přispět tak k rozvoji teoretických základů biomedicínského inženýrství i k vývoji medicínských aplikací. Co se v našich tělech děje? Soudobé technologie nabízejí řadu postupů pro získávání informací o aktivitě živých organismů na nejrozličnějších úrovních od molekulární po snímky či signály dávno standardně používané (např. EEG, EKG, PPG). Často jde o multidimenzionální data, která se mění v čase. Záznamy z různých zdrojů je třeba synchronizovat a hledat způsoby jejich interpretace. Oddělení BioDat (Biomedical Data and Signal Processing Group) se soustřeďuje např. na zpracování a analýzu dlouhodobého, novorozeneckého a spánkového EEG, na hodnocení kardiotokografie, zpracování EKG z mnohaelektrodového přístroje (120 elektrod), lokalizaci infarktu myokardu z 12-svodového EKG a vyhodnocování signálů z nitra srdce. Jak nás vidí stroje Oddělení CMP (Center for Machine Perception) zpracovává 2D a 3D medicínská a biologická obrazová data pocházející z ultrazvuku, rentgenu, MRI, CT, mikroskopie, atp. Jedním z hlavních výzkumných témat je elastická registrace obrazů pro analýzu vztahů mezi obrazy získanými v různých časech nebo různými způsoby. Vyvinuté teoretické Inspirace z přírody Oddělení NIT (Nature Inspirated Technologies Group) věnuje pozornost jak analýze dat DBS s cílem lépe porozumět procesům hloubkové mozkové stimulace, tak hledání nových efektivních postupů pro objektivizaci diagnostiky (např. strabismu) či pro dálkové monitorování stavu pacienta s cílem včas upozornit na zhoršení stavu. metody aplikujeme na řadu praktických problémů, jako jsou detekce plicních uzlů (na obrázku), lokalizace chirurgických nástrojů, segmentace kostí, zjišťování elastických vlastností tkání, prostorová rekonstrukce mozkové činnosti, vyhodnocování perfuse srdce, podpora diagnostiky (např. malárie či nemocí štítné žlázy) a detekce nádorů. Při automatickém zpracování biologických signálů a dat se často setkáváme s optimalizačními úlohami, které jsou těžko řešitelné klasickými metodami optimalizace. Proto se soustřeďujeme na rozvoj metod inspirovaných chováním živé přírody, například mravenčími společenstvy, ptačími hejny, roji hmyzu či interakcemi lidí. V současnosti klademe velký důraz na vývoj webového nástroje XGENE.ORG, který pomocí integrované analýzy profilů genové exprese získaných z genomů různých organizmů měří pomocí heterogenních čipů genovou expresi. V oblasti biomedicínských aplikací spolupracujeme s jedenácti klinikami v Česku na vývoji nových softwarů. Zvláštní pozornost věnujeme asistivním technologiím. Prof. Ing. Vladimír Mařík, DrSc. vedoucí katedry kybernetiky ČVUT FEL EU Centre of Excellence Na pomoc pacientům Pro skupiny pacientů s diagnózou diabetes nebo schizofrenie a pro pacienty starší nebo tělesně postižené, navrhujeme interaktivní podpůrné nástroje, které neinvazivně sledují fyziologické signály nebo chování, varují v případě hrozícího nebezpečí, radí či zprostředkovávají informace. K nejzajímavějším aktuálně řešeným aplikačním projektům patří MAS, SPES a BOS, teoretický výzkum je podpořen několika granty GA ČR. Naše výsledky míří do praxe Založili jsme řadu spin-off firem, např. Certicon, Neovision a Eydea Recognition. Výzkum studentů je podporován nadace www.cvutmedialab.cz. Katedra kybernetiky FEL ČVUT v Praze Karlovo nám. 13, 121 35 Praha 2 Tel.: +420-224 357 666 E-mail: 13133@fel.cvut.cz www.cyber.felk.cvut.cz červenec 2012, www.sciam.cz 51

SPECIÁLNÍ SEKCE ZÁZRAK ŽIVOTA LABORATOŘ BIOMECHANIKY ČLOVĚKA Nové technologie pro zdraví Lékařská péče a medicínská technika od včasné diagnostiky až po život zachraňující technologie provází člověka po celý život. Členové Laboratoře biomechaniky člověka aplikují znalosti a nástroje strojního inženýrství v základním a aplikovaným výzkumu a vývoji, jehož cílem je zlepšení léčebných postupů a užitných vlastností zdravotnických prostředků, aby byla zajištěna co nejvyšší kvalita pacientova života. Přijďte k nám studovat Tým laboratoře zajišťuje výuku magisterských studentů v oboru Biomechanika a lékařské přístroje a postgraduálních studentů v oboru Biomechanika. Naši studenti absolvují kromě technických předmětů také základy anatomie a fyziologie. Při přípravě diplomových prací se studenti aktivně podílejí na řešených výzkumných projektech a získávají tak zkušenosti pro svou další praxi ve vědě i v průmyslu. Výzkum a vývoj Témata řešených projektů souvisí zejména s muskuloskeletálním systémem a kardiovaskulárním systémem člověka. Podílíme se na vývoji náhrad kolenního, kyčelního nebo zápěstního kloubu, při kterém výpočetně analyzujeme zatížení komponent implantátů a provádíme dlouhodobé zkoušky životnosti a otěru kloubních ploch. Věnujeme se mechanice páteře a spinálním náhradám, podařilo se nám vyvinout pohyblivou náhradu meziobratlového disku. Pro pacienty, kteří utrpěli ztrátu kostní tkáně kvůli nehodě nebo nádorovému onemocnění, dokážeme navrhnout individuální implantát, jehož tvar vychází ze snímků pacienta pořízených medicínským zobrazovacím systémem, např. počítačovým tomografem. Při návrhu individuálního implantátu používáme technologii 3d tisku pro rychlou stavbu kontrolního modelu. Vybudovali jsme laboratorní hydraulický okruh, který simuluje cévní oběh včetně pulzací. Na tomto zařízení studujeme chování cév, cévních náhrad nebo koronárních stentů. Zajímáme se o vliv aterosklerózy a věku na strukturu cévní stěny a její mechanické vlastnosti. Individuální implantáty a modelování podle obrazových dat CAD model návrhu náhrady části dolní čelisti. Laboratoř biomechaniky člověka ČVUT v Praze, Fakulta strojní Ústav mechaniky, biomechaniky a mechatroniky Technická 4 166 07, Praha 6 Tel: +420 224 352 509 E-mail: lbc@biomed.fsid.cvut.cz www.biomechanika.cz Femorální komponenta kyčelní náhrady připravená pro test životnosti Zabýváme se analýzou mechanických vlastností biologických materiálů a technických materiálů, které se objevují v konstrukcích implantátů, vnějších fixačních prvků nebo ortéz. Také vyvíjíme nové kompozitní materiály pro implantace, které se budou lépe integrovat do organismu, a pro instrumenty, jejichž výhodou je transparentnost pro rentgenové záření (obrázek níže). Experimentální kardiovaskulární biomechanika: laboratorní hydraulický okruh pro simulaci cévního systému. Souvisejícím oborem je forenzní biomechanika. Provádíme analýzy, pohybové studie a simulace lokomoce člověka, které mohou sloužit k objasnění trestné činnosti. 52 Scientific American České vydání, červenec 2012

FAKULTA STROJNÍ ČVUT V PRAZE www.biomechanika.cz Experimentální vybavení Pro experimentální analýzy na několika úrovních máme k dispozici špičkové vybavení. Testovací systém MTS 858.2 Mini Bionix je schopen provozovat současně zatěžování osovou silou až 25 kn a momentem síly až 100 Nm. Je zcela unikátně vybaven speciálním simulátorem, který umožňuje zatěžování s osmi stupni volnosti (3 posuvy a 5 rotací). Tento simulátor je zcela ojedinělý v celé Evropě. Svou konstrukcí je primárně určen k testování páteřních implantátů. Úpravou konfigurace je však možno simulátor používat i k jiným pokusům. Celý systém splňuje požadavky mezinárodní normy ISO/ IEC 17025 a je pro něj akreditováno několik zkušebních postupů. Snímek trabekuly stehenní kosti z optického mikroskopu Dvouosým zatěžovacím strojem Messphysik (Zwick/Roell) lze realizovat tahové a tlakové zkoušky při víceosé napjatosti, které jsou nezbytné pro zjišťování mechanických vlastností anisotropních materiálů, silami až 250 N. Je využíván zejména při zkouškách měkkých tkání (tepny, žíly, chlopně, kůže, vazy), polymerů (silikony, pryže, latex, UHMWPE) a kompozitních materiálů. Nanoindentační systém Hysitron TriboIndenter TM TI 950 umožňuje provádět několik typů mechanických zkoušek na nanoúrovni. Kvazistatická nanoindentace slouží k měření elastických modulů, tvrdosti, lomové houževnatosti a dalších mechanických vlastností. Nanometrická dynamická mechanická analýza (nanodma) vyšetřuje časově závislé vlastnosti materiálů zatěžováním harmonicky buzenou silou a snímání deformační odezvy materiálu. Je navržena speciálně pro polymery a biomateriály. Scratch testy kvantifikují odolnost povrchu a tenkých povrchových vrstev. Jsme oficiální demo laboratoří firmy Hysitron, Inc. s profesionálně vyškolenou obsluhou. Pro dlouhodobé testování kloubních implantátů tým laboratoře vyvinul simulátor kloubního pohybu, který umožňuje uživatelské nastavení kinematických a dynamických parametrů a provádět experimenty za podmínek blížících se situaci v kloubu po implantaci. Pro měření deformací používáme kontaktní i bezkontaktní optické extenzometry. Pole deformací včetně geometrie v prostoru zaznamenává optický systém Dantec Q- 450, který pracuje na principu 3D korelace obrazů z vysokorychlostních kamer. Zubní implantáty (Ihde Dental) a testování životnosti Díky novým technologiím se například výroba a vývoj individuálních implantátů zkracuje z původních týdnů na dny či dokonce pouhé hodiny. Prof. Ing. Svatava Konvičková, CSc. vedoucí Laboratoře biomechaniky člověka Počítačové simulace Nedílnou součástí vývoje je matematické modelování. Počítačové simulace poskytují náhled do chování tkání a umožňují kontrolu namáhání implantátů ještě před zkouškami prototypů. Tím napomáhají k optimalizaci implantátů i k predikci účinku operačního zákroku. Tým laboratoře má dlouholeté zkušenosti s matematickými analýzami zatížení konstrukcí metodou konečných prvků. Používáme software ABAQUS doplněný o programovací nástroje umožňující aplikaci vlastních pokročilých materiálových modelů. Obecné simulace a výpočty provádíme také v software Matlab. Výpočet namáhání zubu a plomby z částicového kompozitu červenec 2012, www.sciam.cz 53

FAKULTA ELEKTROTECHNICKÁ ČVUT V PRAZE CENTRUM ASISTIVNÍCH TECHNOLOGIÍ Společný cíl: usnadnit a pomoci Centrum asistivních technologií (CAT) je realizováno ve spolupráci šesti kateder FEL ČVUT a jednoho ústavu 1. LF UK. Výuka zahrnuje prostředky a technologie péče a zkvalitnění života seniorům, zdravotně postiženým a dětem. Jádro CAT tvoří čtyři hlavní pracoviště, zaměřená na biomedicínské technologie, aplikovanou multimediální (audiovizuální) techniku, aplikovanou telekomunikační techniku, inteligentní bydlení (smart home) spojené s problematikou interakce člověka a prostředí a další související oblasti techniky. Kromě studentů se zde celoživotně vzdělávají biomedicínští inženýři a zdravotních pracovníci. Cílem CAT je i zavádění technologií a pomůcek pro vzdělávaní zdravotně postižených. V budoucnu nebude dost lidí pro péči o lidi, proto musí nastoupit asistivní technologie. Prof. Ing. Miloš Klíma, CSc. Inteligentní byt poskytuje reálné testovací prostředí zejména pro výzkum a vývoj technologií a nástrojů pro ovládání domácnosti netradičním způsobem, který usnadní život zdravotně postiženým, pro testování telemedicínských aplikací a sledování vitálních funkcí v reálném prostředí. Fakulta elektrotechnická ČVUT v Praze Technická 2 166 27 Praha 6 Prof. Ing. Miloš Klíma, CSc. klima@fel.cvut.cz tel.: 224 352 205 Doc. Ing. Lenka Lhotská, CSc. lhotska@fel.cvut.cz tel.: 224 353 933 www.fel.cvut.cz Laboratoř lékařské přístrojové techniky a biomedicínské elektroniky Jedním z projektů laboratoře je vzdálené sledování vitálních funkcí. Aplikačním výstupem je zařízení Intelligent Primer Nurse umožňující sledování srdeční a pohybové aktivity měřené osoby a klasifikaci Pracoviště multimediální techniky Účelem pokusů je zejména vyhodnocování subjektivního vjemu diváka při různých typech projekce 3D-obrazu a kvantitativní porovnání vjemu s klasickou 2D projekcí a standardní urgentních stavů. V mezinárodní soutěži 2011 OpenWorld Design Contest, vypsané společností ST Microelectronics, získalo první cenu. Další projekt se zabývá primárním screeningem aterosklerózy na základě měření hemodynamických parametrů a sledování tvaru pulsní vlny. Studenti se v rámci výuky seznamují s funkčními principy diagnostických přístrojů jako jsou např. elektrokardiografy, pulsní oxymetry, ultrazvukové diagnostické přístroje nebo přístroje pro měření krevního tlaku a průtoku krve. přirozenou scénou. Další měření se soustřeďuje na optimalizaci kódování pro doplňkový přenos animovaného tlumočníka do znakového jazyka v digitálním televizním vysílání a experimenty projektu PERSEUS, který je věnován dálkové navigaci nevidomých. V další fázi dojde k vybudování kompletního CCTV bezpečnostního kamerového systému. Mezi další projekty patří zejména bezdrátový přenos v blízkosti nebo s využitím lidského těla a v neposlední řadě problém elektromagnetické kompatibility komplexních systémů v rámci asistivních technologií. Technologie automatické identifikace Rozpoznávání stavu okolí je důležité pro zdravotnictví a asistivní technologie i pro mnoho průmyslových a ekonomických oblastí a státní správy. Na elektrotechnické fakultě se těmito technologiemi zabýváme již více než 15 let využitím čárových kódů, radiofrekvenční identifikace a biometrické identifikace. 54 Scientific American České vydání, červenec 2012