LABORATOŘ KULTIVAČNÍCH TECHNIK - ORGANIZACE PŘEDMĚTU Výuka předmětu Laboratoř kultivačních technik a modelování bioprocesů bude probíhat dle následujícího harmonogramu (Tab. I). Výuka se skládá z bloku základních úloh, bloku speciálních úloh a bloku věnovaného modelování a řízení bioprocesů. Na závěr bude každá prezentovat vybraný samostatný projekt. Tabulka I Harmonogram úloh vyučovaných v rámci předmětu laboratoř KT 15.9. Úvodní lekce a školení bezpečnosti práce BLOK ZÁKLADNÍCH ÚLOH 22.9. 1. základní úloha Příprava médií a 2. základní úloha Stanovení K L a a 29.9. 1. základní úloha Příprava médií a 2. základní úloha Stanovení K L a a 6.10. 3.základní úloha Techniky molekulární biologie a jejich využití 4. základní úloha Kultivace na pevném 13.10. 3.základní úloha Příprava médií a 4. základní úloha Kultivace na pevném BLOK SPECIÁLNÍCH ÚLOH 20.10. 1.speciální úloha dle vylosované specifikace 27.10. 1. speciální úloha dle vylosované specifikace 3.11. 2.speciální úloha dle vylosované specifikace 10.11. 2.speciální úloha dle vylosované specifikace BLOK MODELOVÁNÍ A ŘÍZENÍ BIOPROCESŮ 24.11. Inženýrský úvod a úvod do modelování 1.12. Individuální příprava na prezentaci samostatných projektů 8.12. Modelování bioprocesů, řízení a regulace bioprocesů 15.12. PREZENTACE SAMOSTATNÝCH PROJEKTŮ ZÁKLADNÍ POŽADAVKY: 1. Aktivní účast na cvičeních - připouští se 2 omluvené absence 2. Včasný příchod do laboratoří - při pozdním příchodu překračujícím 10 min nebude student vpuštěn do laboratoře, úloha bude klasifikována stupněm F 3. Připravenost na cvičení - před začátkem každé úlohy student absolvuje krátký písemný test, případně ústní přezkoušení, nedostatečná připravenost vylučuje studenta ze cvičení a je klasifikována stupněm F. Po 2 nedostatečných je student z laboratoří vyloučen. 4. Včasné odevzdání protokolu (úvod, metodika, zpracované výsledky) nejpozději do 7 dnů od ukončení měření úlohy vedoucímu úlohy 5. Prezentace samostatného projektu, který zahrnuje zpracování dat naměřených všemi mi, které dané téma řešily, jejich diskuzi a jasné závěry. Podmínkou je aktivní účast na přípravě a prezentaci zadané úlohy od všech členů skupiny. 6. Na blok modelování bioprocesů bude mít každý student k dispozici vlastní notebook ne tablet!
ČÍSLO SKUPINY 1 JMÉNA ČLENŮ SKUPINY SPECIÁLNÍ ÚLOHY ZÁVĚREČNÁ ÚLOHA Zralá Nikola Doležalová Jana Vácha Martin Kultivace na pevném 2 Lokajová Romana Nováková Marcela Holovatská Natalia Stanovení KLa 3 Sembolová Eliška Zimola Michal Bandy David Novotný Jiří Kontinuální kultivace v náplňovém biou Kontinuální kultivace v náplňovém biou 4 Mačaj Kryštof Korda Filip Pánek Tomáš 5 Ruffer Jakub Pecháčková Zora Yeudakimenka Natallia Kontinuální kultivace v náplňovém biou Kultivace mořských mikroorganismů
ZÁKLADNÍ ÚLOHY - 22. 9.- 13. 10. 2015, začátek je vždy od 9 hodin v laboratoři 122 Výuka bloku základních úloh bude probíhat vždy celý jeden den (úterý) v případě úloh 1,2,3; úloha 4 bude navíc zahrnovat odběr vzorků během následujících dní dle harmonogramu určeného vedoucím úlohy. Všechny skupiny absolvují všechny základní úlohy. Vyučované úlohy: Základní úloha 1 - Příprava médií a Vedoucí úlohy: Ing. Richard Ježdík Vyučující: Ing. Paldrychová, Ing. Ježdík, Ing. Patrovský Základní úloha 2 - Stanovení koeficientu přestupu kyslíku a mikroorganismů Vedoucí úlohy: Ing. Tomáš Humhal Vyučující: Ing. Humhal, Ing. Raschmanová Základní úloha 3 - Techniky molekulární biologie a jejich využití v biotechnologiích Vedoucí úlohy: Mgr. Jan Kolek Vyučující: Mgr. Kolek, Ing. Urbanská, Ing. Raschmanová Základní úloha 4 - Kultivace na pevném a stanovení enzymové aktivity Vedoucí úlohy: Ing. Matěj Patrovský, Ing. Pádrová, Ing. Koukalová
Základní blok úloh přehled rozdělení skupin 22.9. 29.9. 6.10. 13.10. 1 1 Vyučující: Mgr.Kolek Vyučující: Ing. Humhal 1 Vyučující: Ing. Ježdík 2 Vyučující: Ing. Paldrychová 3 4 Vyučující: Ing. Humhal 5 Vyučující: Ing. Raschmanová 2 Vyučující: Ing. Kolek 3 Vyučující: Ing. Humhal 4 Vyučující: Ing. Ježdík 5 2 Vyučující: Ing. Urbanská 3 Vyučující: Ing.Raschmanová 4 5 Vyučující: Ing. Koukalová 1 2 Vyučující: Ing. Pádrová Místnost I01 3 Vyučující: Ing. Koukalová 4 Vyučující: Mgr.Kolek 5 Vyučující: Ing. Urbanská
SPECIÁLNÍ ÚLOHY - 20. 10. - 10. 11. 2015, začátek a místo specifikováno u jednotlivých úloh Každá ze skupin si vylosuje kombinaci dvou úloh, na provedení každé úlohy bude mít 2 týdny, tj. práce bude zahrnovat více dní v týdnu dle pokynů vedoucího úlohy. V následujícím rozpisu je uveden čas začátku úloh v prvním týdnu, začátek práce v dalším týdnu bude upřesněn po domluvě s vedoucím dané úlohy. Vyučované úlohy: Speciální úloha 1 - - místnost S57, začátek v 8 hodin Vedoucí úlohy: Ing. Lukáš Jelínek Vyučující: Ing. Jelínek, Ing. Brožová, Ing. Karabín Speciální úloha 2 - místnost S55, začátek v 6:45 hodin Pozn: Na tuto úlohu je potřeba provést přípravu den předem tj. během pondělka po předchozí domluvě s panem Jungem místnost S55, telefonní číslo 4078 Vedoucí úlohy: Ing. Marcel Karabín, PhD Vyučující: R.Jung, Ing. Karabín, Ing. Cejnar, Ing. Jelínek Speciální úloha 3 - Kontinuální kultivace a kinetika úbytku podél výšky lože náplňového u místnost S55 b, začátek v 9 hodin Vedoucí úlohy: Ing. Martin Halecký, PhD Vyučující: Ing. Halecký, Ing. Strejc Speciální úloha 4- Kultivace mořských mikroorganismů místnost K04, začátek v 8:30 hodin Vedoucí úlohy: Ing. Humhal Vyučující: Ing. Humhal, Ing. Ježdík, Ing. Kvasničková Speciální úloha 5 Charakterisktika toku fází - rozložení dob prodlení, ideální tok, pístový tok, neideální tok v náplňovém biou místnost S55, začátek v 8:30 hodin Vedoucí úlohy: Ing. Jan Strejc Vyučující: Ing. Strejc, Ing. Čadková
vyučující: Ing. Humhal, Ing. Ježdík místnost bude doplněna, začátek 8:30 Speciální úlohy rozdělení skupin 20.10. 27.10. 3.11. 10.11. vyučující: Ing. Humhal, Ing. Ježdík vyučující: Ing. Jelínek, Ing. Brožová místnost S57, začátek 8:00 vyučující: Ing. Jelínek, Ing. Brožová, Ing. Karabín vyučující: R. Jung, Ing. Karabín místnost S55, začátek 6:45 vyučující: Ing. Jelínek, Ing. Cejnar Vyučující: Ing. Strejc, Ing. Čadková místnost S55, začátek 8:30 Vyučující: Ing. Strejc, Ing. Čadková 3 vyučující: Ing. Jelínek, Ing. Brožová místnost S57, začátek 8:00 4 Vyučující: Ing. Strejc, Ing. Čadková místnost S55, začátek 8:30 vyučující: Ing. Halecký, Ing. Strejc místnost S55 b, začátek 9:00 3 vyučující: Ing. Jelínek, Ing. Karabín 4 Vyučující: Ing. Strejc Ing. Čadková vyučující: Ing. Halecký,Ing. Strejc 3 vyučující: Ing. Halecký, Ing. Strejc místnost S55 b, začátek 9:00 4 vyučující: R. Jung, Ing. Karabín místnost S55, začátek 6:45 vyučující: Ing. Humhal, Ing. Kvasničková místnost bude doplněna, začátek 8:30 3 vyučující: Ing. Halecký, Ing. Strejc 4 vyučující: Ing. Jelínek, Ing. Cejnar vyučující: Ing. Humhal, Ing. Kvasničková
MODELOVÁNÍ BIOPROCESŮ - 24.11. a 8.12. 2015, začátek v 9 h, zasedací místnost FCHI Výuka bloku modelování a řízení bioprocesů bude probíhat formou přednášek a úloh, ve kterých budou data naměřená v předchozích úlohách využita pro modelování průběhu bioprocesů. Je nutné, aby měl každý student na tento blok k dispozici vlastní notebook (ne tablet). Vedoucími tohoto bloku jsou Ing. Martin Halecký, PhD a Ing. Jana Finkeová, CSc. Vyučované úlohy: Chemická kinetika Simulace dynamického chování chemostatu Identifikace parametrů matematického modelu Bilance tepla a regulace teploty SAMOSTATNÝ PROJEKT A JEHO PREZENTACE 1.12. a 15. 12. 2015 1.12.2015 je volno na přípravu prezentace samostatného projektu. Vlastní prezentace proběhne dne 15.12.2015 v zasedací místnosti FCHI od 9 hodin Každá si vylosuje jednu z dříve řešených úloh (základní nebo speciální), k této úloze si sežene od ostatních skupin, které dané téma řešily, naměřená data. Členové skupiny poté SPOLEČNĚ zpracují všechna naměřená data a připraví 15 min prezentaci, ve které se soustředí zejména na: a) Stručný a výstižný teoretický úvod k dané problematice b) Krátké shrnutí metodiky práce c) Souhrnnou prezentaci všech naměřených výsledků d) Jasné závěry z naměřených dat e) Porovnání naměřených dat s literárními údaji Prezentovat budou VŠICHNI ČLENOVÉ SKUPINY, ne pouze jeden zástupce. Po ukončené prezentaci bude následovat diskuze, členové skupiny musí mít o prezentované problematice přehled a být připraveni odpovědět na otázky členů komise i svých kolegů.