Název spolupracující instituce: Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i. Typ žádosti o akreditaci: udělení oprávnění uskutečňovat studijní program

Transkript

1 A-I Základní informace o žádosti o akreditaci Název vysoké školy: Univerzita Palackého v Olomouci Název součásti vysoké školy: Přírodovědecká fakulta Název spolupracující instituce: Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i. Název studijního programu: Experimentální biologie Typ žádosti o akreditaci: udělení oprávnění uskutečňovat studijní program Schvalující orgán: Rada pro vnitřní hodnocení UP Datum schválení žádosti: Vědecká rada PřF UP schválení návrhu žádosti o udělení oprávnění uskutečňovat studijní program:.. Rada pro vnitřní hodnocení Univerzity Palackého v Olomouci schválení žádosti o udělení oprávnění uskutečňovat studijní program:.. Odkaz na elektronickou podobu žádosti: UPShare: portal.upol.cz Odkazy na relevantní vnitřní předpisy: UPShare: portal.upol.cz ISCED F: 0511

2 B-I Charakteristika studijního programu Název studijního programu Experimentální biologie Typ studijního programu doktorský Profil studijního programu akademicky zaměřený Forma studia prezenční /kombinovaná Standardní doba studia 4 roky Jazyk studia Čeština Udělovaný akademický titul PhD. Rigorózní řízení ne Udělovaný akademický titul Garant studijního programu Prof. Ing. Miroslav Strnad, CSc.,DSc. Zaměření na přípravu k výkonu ne regulovaného povolání Zaměření na přípravu odborníků ne z oblasti bezpečnosti České republiky Uznávací orgán Oblast(i) vzdělávání Biologie, ekologie a životní prostředí Cíle studia ve studijním programu Studium je zaměřeno na recentní poznatky experimentální biologie a biomedicíny a jejich aplikace, na nové postupy v oblasti klonování DNA, genových technologiích, na genetické manipulace na molekulární úrovni u rostlin i živočichů, na submikroskopické metody studia, imunochemické a imunobiologické postupy zviditelňující buněčné struktury, na genomiku, proteomiku a metabolomiku, ale i na medicínské aspekty biologie. Velká pozornost bude věnována zejména biomedicíně v rámci studia fyziologických a molekulárně-biologických principů lidských onemocnění. Hlavní důraz bude položen na poznání principů a mechanizmů onemocnění (patofyziologie) a s tím souvisejícím vývojem léčiv (farmakologie) směrovaných na molekulární cíle v patologické buňce. Profil absolventa studijního programu Absolventi získají klíčové teoretické znalosti a praktické dovednosti ve všech oblastech Experimentální biologie. Budou se zabývat zejména studiem struktury molekul a jejich syntézou, vlastnostmi biomolekul, analýzou biologických materiálů a látek v nich obsažených, studiem vztahů mezi strukturou molekul a jejich biologickou aktivitou, vlastnostmi genů a jejich expresí v modelových organizmech, molekulárními mechanizmy interakce rostlinných a živočišných organizmů a stresorů, organizací organizmů na buněčné a orgánové úrovni a interakcí organizmů s cizorodými agens. Budou umět aplikovat moderní instrumentální metody a experimentálně biologické, ekologické a biomedicínské techniky, formulovat výzkumné hypotézy, navrhovat postupy, ověřovat je s využitím standardních metod a analyzovat výsledky těchto studií. Absolventi se uplatní jako vědečtí pracovníci na vysokých školách, v akademické sféře a v dalších institucích zabývajících se vědou, výzkumem, vývojem a inovacemi a to především v laboratořích zaměřených na humánní a veterinární medicínu, farmacii, zemědělství, biotechnologie a ekologii. Mohou se stát vedoucími nebo výzkumnými pracovníky mezinárodních výzkumných týmů. Pravidla a podmínky pro tvorbu studijních plánů Pravidla a podmínky pro tvorbu studijních plánů jsou v souladu s vnitřní normou děkana PřF UP PřF-B-18/04- ÚZ01. Standardy pro institucionální akreditaci a standardy studijních programů na Univerzitě Palackého v Olomouci. Kreditový systém: ECTS. Podmínky k přijetí ke studiu Uchazeč o doktorské studium oboru Experimentální biologie musí být absolventem magisterského stupně studia přírodovědného nebo lékařského směru univerzity nebo jiné vysoké školy s medicínským, biologickým, chemickým nebo biochemickým zaměřením a měl by mít přiměřenou laboratorní praxi. Příjímací řízení je prováděno formou vstupního pohovoru, u kterého musí uchazeč prokázat odborné znalosti a aktivní znalost anglického jazyka. Součástí přijímacího řízení je určení školitele a rámcového studijního a vědeckého programu. Formální požadavky a potřebné doklady jsou součástí studijních předpisů Přírodovědecké fakulty Univerzity Palackého v Olomouci.

3 Uchazeč ze zahraničí musí prokázat, že jeho vzdělání odpovídá požadavkům magisterského stupně na českých vysokých školách, že je schopen komunikovat se školitelem v anglickém nebo českém jazyce a má odpovídající finanční zajištění (stipendium). Návaznost na další typy studijních programů Doktorský studijní program navazuje na bakalářský studijní program Experimentální biologie a na navazující studijní programy Experimentální biologie a Experimentální biologie rostlin uskutečňované PřF UP.

4 B-IIb Studijní plány a návrh témat prací (doktorské studijní programy) Studijní povinnosti Studijní povinnosti jsou rozděleny do následujících kategorií v souladu s vnitřní normou děkana PřF UP PřF-B- 18/04-ÚZ01: Kreditní limit: 240 Povinné předměty A Počet kreditů: 140 LRR/PGDP1 Disertační práce 1 LRR/PGDP2 Disertační práce 2 LRR/PGDP3 Disertační práce 3 LRR/PGDP4 Disertační práce 4 LRR/PGDP5 Disertační práce 5 LRR/PGDP6 Disertační práce 6 LRR/PGOS1 Odborný seminář 1 LRR/PGOS2 Odborný seminář 2 LRR/PGST1 Vědecko-výzkumná stáž LRR/PGPK Prezentace na konferenci Povinně volitelné předměty 1 jazyková průprava B Volba min.:15 kreditů VCJ/PGAJ LRR/PGST2 LRR/PGAS1 LRR/PGAK Anglický jazyk pro doktorské studium Vědecko-výzkumná stáž Odborný seminář v AJ Přednáška v AJ na mezinárodní konferenci Povinně volitelné předměty 2 oborové B Volba min: 20 kreditů LRR/PGSX1 Experimentální biologie LRR/PGSX2 Patofyziologie LRR/PGSX3 Molekulární fyziologie rostlin LRR/PGSX4 Molekulární patologie LRR/PGSX5 Klinická farmakologie a vývoj léčiv LRR/PGSX6 Bioanalytika LRR/PGSX7 Genomika LRR/PGSX8 Proteomika LRR/PGSX9 Fyziologie a biochemie rostlin PRF/PGMVV Management vědy a výzkumu LRR/PGPC1 Pedagogická činnost 1 LRR/PGOP1 Odborný předmět 1 Povinně volitelné předměty 3 publikační činnost B Volba min: 40 kreditů LRR/PGIF LRR/PGRC LRR/PGIFS Hlavní autor publikace v časopise s IF Hlavní autor publikace v recenzovaném časopise Spoluautorství v časopise s IF Povinně volitelné předměty 4 Volba min: 10 kreditů LRR/PGT Teze k dizertační práci LRR/PGR Rešerše k disertační práci LRR/PGIF2 Hlavní autor publikace v časopise s IF 2 Volitelné předměty LRR/PGIF3 Hlavní autor publikace v časopise s IF 3 LRR/PGIFS2 Spoluautorství v časopise s IF 2 LRR/PGRC2 Hlavní autor publikace v recenzovaném časopise 1 LRR/PGOPC Ostatní publikační činnost (patent, kapitola v knize)

5 LRR/PGPC2 Pedagogická činnost 2 LRR/PGPC3 Pedagogická činnost 3 LRR/PGPPA Popularizační aktivity na UP LRR/PGPK2 Prezentace na mezinárodní konferenci 2 LRR/PGPK3 Prezentace na mezinárodní konferenci 3 LRR/PGPRO Projektová činnost LRR/PGOP2 Odborný předmět 2 Požadavky na tvůrčí činnost Publikace výsledků prostřednictvím minimálně 1 prvoautorské a minimálně 1 spoluautorské publikace v časopise s IF; Jako publikační činnost budou uznávány rovněž udělené patenty a patentové přihlášky. Příprava a vypracování disertační práce. Požadavky na absolvování stáží Stáž na zahraničním pracovišti v délce min. 30 dní. Další studijní povinnosti Podíl na pedagogické činnosti pracoviště, na základě dohody školitele s vedoucím pracoviště. Aktivní účast na mezinárodních konferencích v ČR i v zahraničí. Účast na popularizačních aktivitách v rámci UP. Návrh témat disertačních prací a témata obhájených prací Některá studovaná témata, první obhajoby předpokládáme na konci akademického roku 2018/2019: 1) Studium biologické aktivity nových syntetických indolových derivátů 2) Metabolické profilování rostlinných hormonů v buněčných organelách pomocí LC-MS technik 3) Příprava a biologická aktivita nových cytokininových derivátů 4) Příprava a studium mechanismů účinku nových cytokininových derivátů 5) Směrování inhibitorů proteinkinas do nádorových buněk 6) Příprava a studium biologické aktivity nových derivátů fytohormonů s fotolabilními protektivními skupinami 7) Nízkomolekulární inhibitory signálních a regulačních drah Státní doktorská zkouška Složení státní doktorské zkoušky není kreditově hodnoceno. Podmínky pro podání přihlášky a průběh státní doktorské zkoušky jsou stanoveny vnitřním předpisem č. A-10/2011-ÚZ03 Studijní a zkušební řád Univerzity Palackého v Olomouci a vnitřní normou č. PřF-B-18/04 Opatření děkana Přírodovědecké fakulty UP v Olomouci, kterým se se upravuje organizace doktorského studia v kreditovém systému v rámci Institucionální akreditace na Přírodovědecké fakultě UP. Státní doktorská zkouška se uskutečňuje jako vědecká rozprava, přičemž odborně navazuje na téma disertační práce. Obecnými tématy státní doktorské zkoušky jsou: Genomika. Proteomika. Metabolomika. Využití genomických přístupů v experimentální biologii. Genová terapie. Proteinové inženýrství; příprava a purifikace proteinů. Vývoj, charakterizace a produkce protilátek a využití protilátek. Medicínská a biologická chemie. Farmakologie. Vývoj, testování a charakterizace léčiv. Základy analýzy léčiv. Modelové systémy v aplikovaném výzkumu. Použití lidského biologického materiálu ve výzkumu. Prediktivní a prognostická patologie. Viry a jejich využiti v experimentální biologii.

6 Obhajoba disertační práce Obhajoba disertační práce není kreditově hodnocena. Podmínky pro podání přihlášky, jmenování komise pro obhajobu a vlastní průběh obhajoby disertační práce jsou stanoveny vnitřním předpisem č. A-10/2011-ÚZ03 Studijní a zkušební řád Univerzity Palackého v Olomouci a vnitřní normou č. PřF-B-18/04 Opatření děkana Přírodovědecké fakulty UP v Olomouci, kterým se se upravuje organizace doktorského studia v kreditovém systému v rámci Institucionální akreditace na Přírodovědecké fakultě UP

7 Návrh studijního plánu v kreditovém systému Vysoká škola Součást vysoké školy Název studijního programu Univerzita Palackého v Olomouci Přírodovědecká fakulta Experimentální biologie Kreditní limit: 240 Kód Název předmětu kred. rozsah zakonč. semestr profil. základ Povinné předměty A Počet kreditů: 140 LRR/PGDP1 Disertační práce Zp Z ZT LRR/PGDP2 Disertační práce Zp L ZT LRR/PGDP3 Disertační práce Zp Z ZT LRR/PGDP4 Disertační práce Zp L ZT LRR/PGDP5 Disertační práce Zp Z ZT LRR/PGDP6 Disertační práce Zp L ZT LRR/PGOS1 Odborný seminář Zp Z/L PZ LRR/PGOS2 Odborný seminář Zp Z/L PZ LRR/PGST1 Vědecko-výzkumná stáž D Zp Z/L PZ LRR/PGPK Prezentace na konferenci 10 - Zp Z/L PZ Povinně volitelné předměty 1 jazyková průprava B Volba min.:15 kreditů VCJ/PGAJ Anglický jazyk pro doktorské studium S+0 Zp,Zk Z/L PZ LRR/PGST2 Vědecko-výzkumná stáž D Zp Z/L PZ LRR/PGAS1 Odborný seminář v AJ 5 - Zp Z/L PZ LRR/PGAK Přednáška v AJ na mezinárodní konferenci 10 - Zp Z/L PZ Povinně volitelné předměty 2 oborové B Volba min: 20 kreditů LRR/PGSX1 Experimentální biologie 5 20S+0+0 Zk Z/L ZT LRR/PGSX2 Patofyziologie 5 20S+0+0 Zk Z/L ZT LRR/PGSX3 Molekulární fyziologie rostlin 5 20S+0+0 Zk Z/L ZT LRR/PGSX4 Molekulární patologie 5 20S+0+0 Zk Z/L ZT LRR/PGSX5 Klinická farmakologie a vývoj léčiv 5 20S+0+0 Zk Z/L ZT LRR/PGSX6 Bioanalytika 5 20S+0+0 Zk Z/L ZT LRR/PGSX7 Genomika 5 20S+0+0 Zk Z/L ZT LRR/PGSX8 Proteomika 5 20S+0+0 Zk Z/L ZT LRR/PGSX9 Fyziologie a biochemie rostlin 5 20S+0+0 Zk Z/L ZT PRF/PGMVV Management vědy a výzkumu HR+0 ZK Z/L PZ LRR/PGPC1 Pedagogická činnost Zp Z/L PZ LRR/PGOP1 Odborný předmět Zp,Zk Z/L PZ Povinně volitelné předměty 3 publikační činnost B Volba min: 40 kreditů LRR/PGIF Hlavní autor publikace v časopise s IF 30 - Zp Z/L PZ LRR/PGRC Hlavní autor publikace v 10 - Zp Z/L PZ recenzovaném časopise LRR/PGIFS Spoluautorství v časopise s IF 10 - Zp Z/L PZ Povinně volitelné předměty 4 Volba min: 10 kreditů LRR/PGT Teze k dizertační práci 10 - Zp Z/L ZT LRR/PGR Rešerše k disertační práci 10 - ZP Z/L ZT LRR/PGIF2 Hlavní autor publikace v časopise s IF Zp Z/L PZ

8 Volitelné předměty LRR/PGIF3 Hlavní autor publikace v časopise s IF 15 - Zp Z/L - 3 LRR/PGIFS2 Spoluautorství v časopise s IF Zp Z/L - LRR/PGRC2 Hlavní autor publikace v 5 - Zp Z/L - recenzovaném časopise 1 LRR/PGOPC Ostatní publikační činnost (patent, 5 - Zp Z/L - kapitola v knize) LRR/PGPC2 Pedagogická činnost Zp Z/L - LRR/PGPC3 Pedagogická činnost Zp Z/L - LRR/PGPPA Popularizační aktivity na UP 5 - Zp Z/L - LRR/PGPK2 Prezentace na mezinárodní konferenci 5 - Zp Z/L - 2 LRR/PGPK3 Prezentace na mezinárodní konferenci 5 - Zp Z/L - 3 LRR/PGPRO Projektová činnost 5 - Zp Z/L - LRR/PGOP2 Odborný předmět ZP/ZK Z/L -

9 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Disertační práce1 LRR/PGDP1 Typ předmětu Povinné předměty A doporučený ročník / semestr 1.ročník Z Rozsah studijního předmětu hod. kreditů 15 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zápočet Forma výuky výsledků Forma způsobu ověření studijních Zápočet výsledků a další požadavky na studenta Garant předmětu prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující Školitel studenta v doktorském studiu Stručná anotace předmětu Systematická práce na tématu disertační práce. Studium literatury, metodická a experimentální práce v laboratoři dle zvoleného tématu disertační práce. Studijní literatura a studijní pomůcky Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

10 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Disertační práce2 LRR/PGDP2 Typ předmětu Povinné předměty A doporučený ročník / semestr 1.ročník L Rozsah studijního předmětu hod. kreditů 15 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zápočet Forma výuky výsledků Forma způsobu ověření studijních Zápočet výsledků a další požadavky na studenta Garant předmětu prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující Školitel studenta v doktorském studiu Stručná anotace předmětu Systematická práce na tématu disertační práce. Studium literatury, metodická a experimentální práce v laboratoři dle zvoleného tématu disertační práce. Studijní literatura a studijní pomůcky Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

15 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Odborný seminář 1 LRR/PGOS1 Typ předmětu Povinné předměty A doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu hod. kreditů 5 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zápočet Forma výuky výsledků Forma způsobu ověření studijních Zápočet, Prezentace odborného, případně populárně vědeckého tématu, výsledků a další požadavky na souvisejícího s tématem disertační práce. studenta Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Stručná anotace předmětu Příprava a prezentace odborného, případně populárně vědeckého tématu, souvisejícího s tématem disertační práce studenta. Příprava prezentace, tvorba multimediálního textu, frontální demonstrace experimenty (zejména pro didaktické obory). Studijní literatura a studijní pomůcky Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

16 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Odborný seminář 2 LRR/PGOS2 Typ předmětu Povinné předměty A doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu hod. kreditů 5 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zápočet Forma výuky výsledků Forma způsobu ověření studijních Zápočet, Prezentace odborného, případně populárně vědeckého tématu, výsledků a další požadavky na souvisejícího s tématem disertační práce. studenta Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Stručná anotace předmětu Příprava a prezentace odborného, případně populárně vědeckého tématu, souvisejícího s tématem disertační práce studenta. Příprava prezentace, tvorba multimediálního textu, frontální demonstrace experimenty (zejména pro didaktické obory). Studijní literatura a studijní pomůcky Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

17 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Vědecko-výzkumná stáž 1 LRR/PGST1 Typ předmětu Povinné předměty A doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu 30 dní hod. kreditů 10 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zápočet Forma výuky výsledků Forma způsobu ověření studijních Zápočet, stáž na zahraničním pracovišti v délce minimálně 30 dní, výsledky stáže výsledků a další požadavky na musí student obhájit formou závěrečné zprávy. studenta Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Stručná anotace předmětu Student je motivován za pomoci školitele a školícího pracoviště připravit výzkumný program/žádost o grant pro stáž na zahraničním spolupracujícím pracovišti a v soutěži získat prostředky na její dofinancování např. z fakultních projektů pro podporu internacionalizace studia (RP MŠMT), projektu Erasmus, studentských grantů FRVŠ apod. Tato stáž slouží k rozšíření praktických znalostí doktoranda a zaměření stáže souvisí tématem disertační práce. Výsledky stáže musí student obhájit formou závěrečné zprávy. Studijní literatura a studijní pomůcky Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

18 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Prezentace na konferenci LRR/PGPK Typ předmětu Povinné předměty A doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu hod. kreditů 10 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zápočet Forma výuky výsledků Forma způsobu ověření studijních Zápočet, prezentace výsledků výzkumné práce formou přednášky nebo výsledků a další požadavky na plakátového sdělení studenta Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Stručná anotace předmětu Cílem předmětu je získat dovednosti při prezentaci výsledků své výzkumné práce před odbornou veřejností formou ústní prezentace nebo posterového sdělení. Studijní literatura a studijní pomůcky Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

19 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Anglický jazyk pro doktorské studium VCJ/PGAJ Typ předmětu Povinně volitelný-jazyková průprava B doporučený ročník / semestr - Rozsah studijního předmětu 0+20S+0 hod. - kreditů 15 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zkouška Forma výuky Konzultace výsledků Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta Na písemnou část zkoušky (Writing, Listening a Reading) se studenti ve STAGU zapisují jako na zápočet před zkouškou. Na ústní část zkoušky (Presentation ín English) se studenti zapisují jako na zkoušku. Před ústní zkouškou je student povinen zaslat mailem zkoušejícímu přehled snímků své prezentace, abstrakt v rozsahu maximálně 200 slov a přehled klíčové terminologie (30-50 výrazů) s přepisem výslovnosti podle IPA (International Phonetic Alphabet) a překladem termínů. Zkouška VCJ/PGAJ se koná šestkrát ročně v pevně daných termínech. Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující Mgr. Lucie Vaňková, Ph.D. 50 % kontaktní výuky Mgr. Alena Fridrichová, Mgr. Lucie Vaňková, Ph.D. Stručná anotace předmětu Cílem zkoušky VCJ/PGAJ Anglický jazyk pro doktorské studium je zaručit, že student doktorského studijního programu má znalosti a jazykové dovednosti minimálně na úrovni B2 podle Evropského referenčního rámce pro jazyky. Zkouška testuje poslech s porozuměním, čtení s porozuměním, písemné vyjadřování a součástí zkoušky je také prezentace v angličtině. Studenti doktorského studia mohou využít nabídky KCJ a účastnit se výuky garantované Kabinetem cizích jazyků, ale tato příprava není povinná. Je na zvážení studenta, aby zhodnotil své jazykové znalosti a dovednosti na základě výsledků rozřazovacího testu, který student absolvuje u zápisu do 1. ročníku studia, a zvolil způsob přípravy. Podrobné informace ke zkoušce včetně ukázkových testů jsou na stránkách Kabinetu cizích jazyků PřF UP Studijní literatura a studijní pomůcky - literatura dle doporučení vyučujícího Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím Vyučující i garant jsou trvale přítomni na pracovišti PřF UP Olomouc (osobní konzultace) + komunikace prostřednictvím u, nebo telefonu

20 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Vědecko-výzkumná stáž 2 LRR/PGST2 Typ předmětu Povinně volitelné předměty-jazyková doporučený ročník / semestr Z/L průprava B Rozsah studijního předmětu 60 dní hod. kreditů 15 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zápočet Forma výuky výsledků Forma způsobu ověření studijních Zápočet, stáž na zahraničním pracovišti, kde student prokazatelně komunikoval výsledků a další požadavky na v anglickém jazyce v délce minimálně 60 dní, výsledky stáže musí student obhájit studenta formou závěrečné zprávy. Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Stručná anotace předmětu Vědecko-výzkumná stáž na zahraničním pracovišti, která vede rozšíření praktických znalostí doktoranda. Stáž musí student absolvovat na pracovišti, kde se prokazatelně komunikuje v anglickém jazyce a doloží potvrzení zahraniční strany, že stáž absolvoval v anglickém jazyce. Délka stáže minimálně 60 dní. Studijní literatura a studijní pomůcky Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

21 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Odborný seminář v AJ LRR/PGAS1 Typ předmětu Povinně volitelné předměty-jazyková doporučený ročník / semestr - průprava B Rozsah studijního předmětu - hod. - kreditů 5 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zápočet Forma výuky Seminář výsledků Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta 75 % účasti na seminářích DSP + 1 aktivní prezentace v anglickém jazyce na semináři, ověření schopnosti diskutovat v anglickém jazyce Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. 10 % kontaktní výuky Mgr. Alena Fridrichová, Mgr. Lucie Vaňková, Ph.D. Stručná anotace předmětu Cílem předmětu je ověřit, že student doktorského studijního programu má je schopen prezentovat výsledky svého výzkumu v anglickém jazyce na interním semináři na pracovišti, za účasti zástupce kabinetu cizích jazyků PřF UP, členů oborové rady, dalších akademických nebo vědeckovýzkumných pracovníků školících pracovišť a ostatních doktorandů na pracovišti. Povinností doktoranda je prezentovat postup prací na disertaci a dílčí výsledky v 20-ti minutové prezentaci v anglickém jazyce a v následné diskuzi reagovat anglicky na odborné i laické dotazy. Studijní literatura a studijní pomůcky - literatura dle doporučení vyučujícího Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) - hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím Vyučující i garant jsou trvale přítomni na pracovišti PřF UP Olomouc (osobní konzultace) + komunikace prostřednictvím u, nebo telefonu

22 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Přednáška v AJ na mezinárodním konferenci LRR/PGAK Typ předmětu Povinně volitelné předměty-jazyková doporučený ročník / semestr Z/L průprava B Rozsah studijního předmětu hod. kreditů 10 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zápočet Forma výuky výsledků Forma způsobu ověření studijních Zápočet, ústní prezentace výsledků na mezinárodní konferenci v anglickém jazyce výsledků a další požadavky na studenta Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Stručná anotace předmětu Cílem předmětu je získat dovednosti při prezentaci výsledků své výzkumné práce před odbornou veřejností formou ústní prezentace v anglickém jazyce. Studijní literatura a studijní pomůcky Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

23 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Experimentální biologie LRR/PGSX1 Typ předmětu Povinně volitelné-oborové B doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu 20S+0+0 hod. 20 kreditů 5 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Ústní zkouška Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta Ústní zkouška g Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DSc., RNDr. Bořivoj Vojtěšek, DSc., Vyučující, zkoušející Stručná anotace předmětu Biologie nádorové buňky (mechanismy maligní transformace, angiogeneze, tvorba metastáz, protein p53, možnosti predikce, potenciální možnosti využití při terapii, možnosti terapie zaměřené na buněčný cyklus), využití genomických přístupů v experimentální biologii (metody založené na PCR, možnosti čipových analýz genové inženýrství), genová terapie (choroby léčitelné pomocí genové terapie, vektory pro genovou terapii, perspektivy genové terapie), proteinové inženýrství (studium protein-protein interakcí, "phage display" pro hledání protein-protein interakcí, analýza aktivity, "protein engineering"), příprava a purifikace proteinů (využití rozličných expresních systémů pro přípravu proteinů, využití širokého spektra "tag sekvencí" při přípravě proteinů, příprava proteinů pro vývoj monoklonálních protilátek, příprava proteinů pro funkční studie), vývoj, charakterizace a produkce protilátek (teorie přípravy monoklonálních a polyklonálních protilátek, imunizační schémata, používaná zvířata a vhodné antigeny, metody přípravy monoklonálních protilátek, metody přípravy polyklonálních protilátek, metody charakterizace protilátek, produkce, purifikace a značení protilátek), využití protilátek (oblasti aplikace monoklonálích a polyklonálních protilátek, základní a aplikovaný výzkum, humanizace protilátek), modelové systémy v aplikovaném výzkumu (modelové organismy, aplikovaná biologie buňky, modelování biologických systémů), použití lidského biologického materiálu ve výzkumu (lidské tkáně jako zdroj informací a nástroj k validaci experimentálních biologických modelů, možnosti použití a metody zpracování tkáňových vzorků pro účely experimentální biologie), prediktivní a prognostická patologie (odhad biologických vlastností a prognózy zhoubných nádorů, biologické prognostické parametry, biologické prediktory odpovědi na léčbu), vývoj, testování a charakterizace léčiv (účinná látka, farmakodynamika, farmakokinetika, modely používané pro "drug screening", knihovny chemických látek versus přírodní produkty, kvantitativní a strukturní analýza potenciálního léčiva, racionální vývoj léčiv, klinické studie), viry a jejich využiti v experimentální biologii (charakterizace a rozdělení viru, nádory a viry, adenovirové a lentivirové vektory, viry a genová terapie). Studijní literatura a studijní pomůcky Alberts, B. a kol. Molecular Biology of the Cell, 4th ed. Garland Science, New York, ISBN Cassimeris L. et al. Lewin s cells. Sudbury: Jones and Bartlett Publishers, Douglas Hanahan and Robert A. Weinberg. Hallmarks of Cancer: The Next Generation. Cell 144, Hammers C., M., Stanley J., R.. Antibody Phage Display: Technique and Applications. Journal of Investigative Dermatology, Harlow, E., Lane, D. Using antibodies. Cold Spring Harbor, New York, Klinická onkologie 2014 Supplementum. Postupy a metody v aplikované molekulární onkologii? Robert A. Weinberg. The Biology of Cancer. Second Edition ISBN Slabý O, et al. Molekulární medicína. Praha Galén 2014, ISBN Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

24 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Patofyziologie LRR/PGSX2 Typ předmětu Povinně volitelné-oborové B doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu 20S+0+0 hod. 20 kreditů 5 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Ústní zkouška Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta Ústní zkouška g Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující Doc. MUDr. Jiří Nečas, Doc. MUDr. Jiří Nečas, Vyučující, zkoušející Stručná anotace předmětu Patofyziologie je medicínský obor. Základem patofyziologie je komplexní vědecký pohled na změny funkcí a objasňování podstaty poruch na úrovni subcelulární, celulární, orgánové a celého organismu a koordinaci těchto mimořádně složitých procesů. V části obecné patologické fyziologie seznamuje s principy patologie jako vědy, zaměřuje se na přesnou terminologii, zdůrazňuje vztahy mezi symptomy, klinickými příznaky nemocí a jejich etiologií. Speciální část se zabývá patofyziologií orgánových systémů a dalších patologických stavů, které postihují specifické orgány a orgánové i regulační systémy. Jejím obsahem je patofyziologie krve, kardiovaskulárního a lymfatického systému, patofyziologie renálního systému, dýchacího systému, trávicího ústrojí, patofyziologie žláz s vnitřní sekrecí, patofyziologie nervového systému, patofyziologie lokomočního systému, senzorů a dalších. Důraz je kladen na pochopení provázanosti jednotlivých fyziologických systémů a pochopení regulačních vazeb a odpovědí v patogeneze. Předmět je vědeckým a teoretickým základem medicíny, studentům umožní poznávání příčinných souvislostí a vztahů mezi normálními a patologicky změněnými funkcemi živých objektů a možností jejich farmakoterapeutického ovlivnění. Studijní literatura a studijní pomůcky Fölsch, U. R., Kochsiek, K., Schmidt, R. F. Patologická fyziologie. Praha: Grada Publishing, Kaňková, K. a kol. Patologická fyziologie pro bakalářské studijní programy. Brno, Mačáková, J., Mačák, J. Patofyziologie endokrinního systému I. UP Olomouc, Nečas E. a kol.:. Obecná patologická fyziologie. Karolinum Praha 2004, Nečas, E. a kol. Patologická fyziologie orgánových systémů. Část I. Karolinum Praha, Nečas, E. a kol.: Patologická fyziologie orgánových systémů. Část II. Karolinum Praha Silbernagl, S., Lang, F. Atlas patofyziologie člověka. Praha: Grada Publishing, Silbernagl S., Lang F.:. Atlas patofyziologie. Grada 2012, Vokurka, M. a kol. Patofyziologie pro nelékařské směry. Praha: Karolinum Vokurka Martin a kol.: Patofyziologie pro nelékařské směry. Karolinum Praha Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

25 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Molekulární fyziologie rostlin LRR/PGSX3 Typ předmětu Povinně volitelné-oborové B doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu 20S+0+0 hod. 20 kreditů 5 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Ústní zkouška Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta Ústní zkouška g Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující prof. RNDr. Martin Fellner, Ph.D., prof. RNDr. Martin Fellner, Ph.D., Vyučující, zkoušející Stručná anotace předmětu Role světla a fytochromů ve vývoji a růstu rostlin: Vlastnosti a lokalizace fytochromů, kryptochromů a fototropinů; reakce rostlin indukované receptory červeného a modrého světla; buněčný a molekulární mechanismus funkce receptorů červeného a modrého světla. Signální dráhy rostlinných hormonů: Přenos signálů auxinů, cytokininů, brassinosteroidů, abscisové kyseliny, giberelinů, etylénu, jasmonové a salicylové kyseliny; struktura receptorů a dalších známých elementů signálních drah; finální růstové a vývojové reakce indukované hormony. Interakce signálních drah světla a hormonů v růstu rostlin: Vliv světla na hladiny hormonů, na množství a aktivitu receptorů; společné elementy signálních drah světla a hormonů. Studijní literatura a studijní pomůcky Taiz L, Zeiger E (2009) Plant Physiology. 5th Edition, Sinauer Associates, Inc., Publishers. Sunderland, Massachusetts Alberts B et al. (2004) Essential Cell Biology. 2nd Edition, Garland Science Publishing, Inc., New York & London Buchanan BB, Gruissem W, Jones RL (2000) Biochemistry & Molecular Biology of Plants. American Society of Plant Physiologists, Rockville, Maryland Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

26 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Molekulární patologie LRR/PGSX4 Typ předmětu Povinně volitelné-oborové B doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu 20S+0+0 hod. 20 kreditů 5 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Ústní zkouška Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta Ústní zkouška g Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující Prof. MUDr. Zdeněk Kolář, CSc. Prof. MUDr. Zdeněk Kolář, CSc. Vyučující, zkoušející Stručná anotace předmětu 1. Základní pojmy molekulární patologie a metodická základna 2. Prediktivní a prognostická patologie 3. Základy onkologie, typy nádorů a vymezení pojmů (TNM klasifikace, grading, invazivní růst a metastazování) 4. Proces karcinogeneze, onkogeny a nádorové supresory, apoptóza a další typy buněčné smrti, teorie nádorových kmenových buněk 5. Standardní nádorová léčba a translace nových terapií do praxe (cílená léčba, monoklonální humanizované protilátky, genová terapie, nádorové vakcíny a imunoterapie) 6. Základy histologie (buněčný, tkáňový a orgánový kontext pro znalosti z molekulární biologie a genetiky) Studijní literatura a studijní pomůcky Cagle PT and Craig T:. Basic concepts of molecular pathology. Springer, Hanahan et Weinberg. Hallmarks of Cancer: The Next Generation Junqueira C. Basic histology. Academic Internet Publishers, Junqueira, C.L. a kol. Základy histologie. Nakladatelství H+H, Kolář Z. a kol. Molekulární patologie nádorů. Epava, Olomouc, Macháček, J., Ćwiertka, K. Základy radiační a klinické onkologie. Olomouc: VUP, Tubbs RT and Stoler MH:. Cell and tissue based molecular pathology Weinberg, R.A. The Biology of Cancer. Garland Science, Weinberg, R.A. The Biology of Cancer. Garland Science Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

27 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Klinická farmakologie a vývoj léčiv LRR/PGSX5 Typ předmětu Povinně volitelné-oborové B doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu 20S+0+0 hod. 20 kreditů 5 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Ústní zkouška Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta Ústní zkouška g Garant předmětu prof. RNDr. Pavel Anzenbacher, DrSc., Zapojení garanta do výuky Vyučující, zkoušející předmětu Vyučující prof. RNDr. Pavel Anzenbacher, DrSc., Stručná anotace předmětu Definice a zaměření klinické farmakologie, s interakcemi léčiv na úrovni farmakokinetiky a farmakodynamiky u vybraných lékových skupin a s příklady dokumentujícími těchto interakcí. Principy a význam terapeutického monitorování léčiv a farmakogenetické aplikace s cílem individualizace farmakoterapie. Úvod historie a současné postavení oboru klinická farmakologie, definice základních pojmů farmakologie. Osud léčiva v organismu I. absorpce, distribuce, galenické formy. Osud léčiva v organismu II. biotransformace, eliminace, exkrece. Základní principy aplikované farmakokinetiky. Základní principy aplikované farmakodynamiky. Strategie terapeutického monitorování léčiv (TDM). Mezi lékové interakce. Základy farmakogenomiky. Základní skupiny léčiv významných z hlediska TDM I. Základní skupiny léčiv významných z hlediska TDM II. Analytické možnosti a potřeby TDM. Strategie vývoje analytických metod TDM. Kazuistiky TDM. Nároky na řízení jakosti v laboratoři klinické farmakologie a organizace oboru v ČR. Studijní literatura a studijní pomůcky Lincová D., Farghali H. a kol. Základní a aplikovaná farmakologie. Druhé vydání. Galén, Praha 2007, Martínková, J. Farmakologie pro studenty zdravotnických oborů. Grada, Praha, ISBN Perlík F. Základy farmakologie. 2. vydání. Galén. Praha 2011, Perlík, F. Základy klinické farmakologie. Galen, Praha, Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

28 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Bioanalytika LRR/PGSX6 Typ předmětu Povinně volitelné-oborové B doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu 20S+0+0 hod. 20 kreditů 5 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Ústní zkouška Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta Ústní zkouška g Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující Doc. Mgr. Ondřej Novák, PhD. Doc. Mgr. Ondřej Novák, PhD. Vyučující, zkoušející Stručná anotace předmětu Principy moderních bioanalytických metod a jejich praktické analytické aplikace. Separační a spektrální metody. Enzymové analytické metody. Imunochemické metody. Afinitní chromatografie. Elektromigrační (elektroforetické) metody. Elektrochemické metody. PCR techniky. Biočipy a biosenzory. Hmotnostní spektrometrie v biologii. Nanotechnologie a nanomateriály. Základy metabolomiky, proteomiky a genomiky. Studijní literatura a studijní pomůcky Anzenbacher, P., Kovář, J. Metody chemického výzkumu pro biochemiky. MŠMT, Praha, Holzbecher Z., Churáček J. a kol. Analytická chemie. SNTL Praha, Králová, B. Bioanalytické metody. VŠChT, Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

29 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Genomika LRR/PGSX7 Typ předmětu Povinně volitelné-oborové B doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu 20S+0+0 hod. 20 kreditů 5 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Ústní zkouška Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta Ústní zkouška g Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující Ing. Hana Šimková, CSc., Ing. Hana Šimková, CSc., Vyučující, zkoušející Stručná anotace předmětu Předmět studia genomiky. Obsah genomových projektů. Sekvenování genomů prokaryot. Sekvenování genomů eukaryot - Caenorhabditis elegans, Drosophila melanogaster, Arabidopsis thaliana, Triticum aestivum, Homo sapiens. Databáze sekvencí DNA. Genetické mapování. Mapovací populace. Molekulární markery, jejich typy a příprava. Strategie mapování. Genetické mapy, jejich konstrukce. Knihovny DNA, jejich typy a konstrukce. Fyzické mapování. Metody používané při fyzickém mapování, "fingerprinting". Integrace fyzických a genetických map. Poziční klonování genů, "chromosome walking". Strategie sekvenování DNA ("shotgun", "clone-by-clone", redukční strategie). Anotace sekvencí DNA. Funkční anotace a zařazování genů do rodin. Polymorfismus DNA. SNPs ("single nucleotide polymorphisms") a jejich využití pro "genotyping". Komparativní genomika. Genová exprese a transkriptom. Knihovny cdna, ESTs ("expressed sequence tags"), DNA arrays a DNA čipy, jejich příprava a využití. Určování funkce genů. Metody funkční genomiky - saturační přímá genetika, vysoko-kapacitní reverzní genetika. Studijní literatura a studijní pomůcky Birren a kol. Genome analysis - Mapping Genomes. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, Brdička, R. Lidský genom na rozhraní tisíciletí. Grada Publishing, Praha, Cantor, C.R., Smith, C.L. Genomics: The Science and Technology Behind the Human Genome Project, John Wiley and Sons, New York, Cullis, C.A. Plant Genomics and Proteomics. John Wiley and Sons, Inc., New York, Gibson, G., Muse, V.S. A Primer of Genome Science. Sinauer Associates, Inc., Sunderland, Hunt, S. P., Livesey, F. Functional Genomics: A Practical Approach. Oxford University Press, Oxford, Meksem, K., Kahl, G. The Handbook of Plant Genome Mapping. Wiley-VCH Verlag, Weinheim, Primrose, S.B. Principles of Genome Analysis: A guide to mapping and sequencing DNA from different organisms. Blackwell Science Inc., Rashidi, H.H., Buehler, L.K. Bioinformatics Basics. CRC Press, Boca Raton, Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

30 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Proteomika LRR/PGSX8 Typ předmětu Povinně volitelné-oborové B doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu 20S+0+0 hod. 20 kreditů 5 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Ústní zkouška Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta Ústní zkouška g Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující Mgr. René Lenobel, Ph.D. Mgr. René Lenobel, Ph.D., Vyučující, zkoušející Stručná anotace předmětu Úvod do proteomiky. Základní pojmy z oblasti separace proteinů (elektroforéza, chromatografie), hmotnostní spektrometrie, zpracování obrazu ("imaging"), využívání genových a proteinových databází. Význam expresní, diferenční a funkční proteomiky. Technologie proteomiky, aplikace. Identifikace a charakterizace proteinů v proteomice. Částečná separace proteinových směsí (konvenční chromatografie, afinitní chromatografie, preparativní elektroforéza). Jednorozměrná (1-D) elektroforéza - SDS/PAGE. Dvojrozměrná (2-D) elektroforéza. Příprava vzorku. První dimenze - isoelektrická fokusace (IEF). Amfolyty, trubičkové IEF gely. Proužky s imobilizovaným ph gradientem ("IPG strips"). Metodika a instrumentace IEF separace. Barvení IPG stripů. Druhá dimenze -SDS/PAGE. Složení pufrů. Příprava gelů. Instrumentace SDS/PAGE separace (horizontální a vertikální aparatury). Barvení proteinů v SDS/PAGE gelech, kompatibilita barvení a hmotnostní spektrometrie. Fluorescenční barvení gelů. Analýza obrazu, denzitometr, software pro vyhodnocení 2-D gelů. Srovnávání dvou a více 2-D gelů, diference. Vyřezávání (excize) proteinových spotů. Elektroeluce. Chemické a enzymové štěpení proteinů v gelu. Štěpení v roztoku. Obecné principy hmotnostní spektrometrie. Ionizační techniky využívané v proteomice. Ionizace elektrosprejem (ESI), ionizace s účastí matrice (MALDI). Iontové analyzátory, kvadrupól (Q), iontová past (IT), analyzátor doby letu (TOF), reflektron. Tandemová hmotnostní spektrometrie (MS/MS) a její instrumentace. Technika MALDI-TOF post source decay (PSD). Peptidové mapování (peptide mass fingerprinting), sekvenční analýza peptidů (de novo sequencing). Identifikace proteinů vyhledáváním v databázích. Vyhledávací programy Mascot, Sequest a Protein Prospector. Organismy s nesekvenovaným genomem, EST databáze, program MS Blast. Multidimenzionální LC-MS/MS. Afinitní chromatografie a LCMS/ MS. Kvantitativní analýza v proteomice. Metody H2O18, ICAT, SILAC, AQUA. Shotgun proteomics - nástroj pro analýzu komplexních proteinových směsí. SELDI MS, klinická proteomika. Studijní literatura a studijní pomůcky Marekov L. N., Steinert P. M. Charge derivatization by 4-sulfophenyl isothiocyanate enhances peptide sequencing by post-source decay matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry. J. Mass Spectrom. 38, , Pingoud A., Urbanke C., Hoggett J., Keltech A. Biochemical methods: A concise guide for students and researchers. Weinheim Německo, ISBN Simson, R. J. (ed.). Purifying proteins for Proteomics: a laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, Westermeier, R., Naven, T. Proteomics in practice. A laboratory manual of proteome analysis. Wiley-VCH, Weinheim, Germany, ISBN Winter M., Sherman N. E. Protein sequencing and identification using tandem mass spectrometry. John Wiley & Sons, Inc., New York, NY, USA, ISBN Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

31 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Fyziologie a biochemie rostlin Typ předmětu Povinně volitelné-oborové B doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu 20S+0+0 hod. 20 kreditů 5 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Ústní zkouška Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta Ústní zkouška g Garant předmětu prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Zapojení garanta do výuky Vyučující, zkoušející předmětu Vyučující prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Stručná anotace předmětu 1. Rostlinná buňka. Život rostliny: jednotící principy. Přehled struktury rostlinného těla. Rostlinná buňka. Cytoskelet. Regulace buněčného cyklu. Plazmodezmata. 2. Buněčná stěna: Struktura a syntéza buněčné stěny rostlin. Zákonitosti buněčného prodlužování. Rychlost buněčného prodlužování. Degradace stěny a obrana rostlin. 2. Voda a rostlinná buňka, balance vody v rostlinách: Voda v životě rostliny. Struktura a vlastnosti vody. Procesy transportu vody. Voda v půdě. Absorpce vody kořeny. Transport vody xylémem. Pohyb vody z listů do atmosféry. 3. Minerální látky a jejich asimilace: Prvky a jejich rozdělení. Deficiente a poruchy rostlin. Ošetření nedostatku živin. A hnojiva. Půda, kořeny a mikroorganismy. Dusík v přírodě. Asimilace nitrátů. Biosyntéza aminokyselin. Biologická fixace dusíku. Asimilace ostatních živin. 7. Fotosyntéza: Obecný koncept Organizace fotosyntetického aparátu. Organizace světlosběrné antény. Mechanismy transportu elektronů. Protonový transport a syntéza ATP v chloroplastech. Oprava a regulace fotosyntetického aparátu. Genetika, sestavení a evoluce fotosyntetického systému. Kelvinův cyklus. Regulace Kelvinova cyklu. Fotorespirace. C4 cyklus. CAM rostliny. Sacharáza a škrob. 10. Membrány, transport a translokace ve floému: Složení membrán. Pasivní a aktivní transport. Transport přes membránu. Proteiny membrány. Ion Transport iontů v kořenech. Translokační dráhy Zdroj a sink. Materiály translokované floémem. Rychlost transportu. Tlakoproudový model floémového transportu. Nakládání a vykládání floému. Transport mezi zdrojem a sinkem. Distribuce fotosyntátů. 11. Respirace a lipidový metabolismus: Respirace u rostlin. Glykolýzy: Cytosolické a plastidové procesy. Cyklus kyseliny citrónové. Mitochondriální elektronový transport a syntéza ATP. Respirace v intaktních rostlinách a pletivech. Metabolismus lipidů. 13. Sekundární metabolity a obrana rostlin: Kutin, vosky a Suberin. Terpeny. Fenolické sloučeniny. Dusík obsahující látky. Indukce obranných mechanismů proti hmyzu a herbivorům. Obrana vůči patogenům. 16. Růst a vývoj: Shrnutí. Embryogeneze. Původ polarity. Apikální meristém. Kořenový meristém. Vegetativní organogeneze. Senescence a programovaná buněčná smrt. 17. Fytochrom a kontrola rostlinného vývoj světlem: Fotochemické a biochemické vlastnosti fytochromu. Charakteristika fytochromem-indukovaných reakcí. Struktura a funkce proteinu fytochromu. Genetická analýza funkcí fytochromu. Signální dráhy fytochromu. Fotofyziologie odezvy na modré světlo. Fotoreceptory pro modré světlo. Cirkadienní rytmy. 19. Auxin: Vznik auxinové koncepce. Identifikace, biosyntéza a metabolismus auxinu. Transport auxinu. Působení auxinu. Buněčné prodlužování, fototropismus a gravitropismums Vývojové účinky auxinu. Auxinové signální dráhy. 20. Gibereliny: Objev a chemická struktura. Účinek giberelinů na růst a vývoj. Biosyntéza a katabolismus giberelinů. Giberelinová signalizace. Odezvy na gibereliny. 21. Cytokininy: Objev, identifikace a vlastnosti cytokininů. Biosyntéza, metabolismus a transport. Biologická úloha cytokininů. Buněčné a molekulární mechanismy účinku. 22. Ethylen: Struktura, biosyntéza a měření ethylenu. Vývojové a fyziologické účinky. Signální dráhy ethylenu.

32 23. Kyselina abscisová: Výskyt, chemická struktura a měření ABA. Biosyntéza, metabolismus a transport ABA. Vývojové a fyziologické účinky ABA. 24. Brasinosteroidy: Struktura, výskyt a genetické analýzy. Biosyntéza, metabolismus a transport brasinosteroidů. Vliv na růst a vývoj. Signalizace brasinosteroidů. 25. Kontrola kvetení: Květní meristémy a vývoj květních orgánů. Evokace kvetení. Vzrostný vrchol a fázové změny. Cirkadienní rytmy. Fotoperiodismus. The Cirkadienní hodiny a fotoperiodická kontrola času. Vernalizace. Biochemická signalizace zapojená do kvetení 26. Fyziologie stresu: Vodní deficit a tolerance k suchu. Teplotní stres a šok z přehřátí. Ochlazování a mrznutí. Nedostatek kyslíku. Stres ze zasolení Studijní literatura a studijní pomůcky Marekov L. N., Steinert P. M. Charge derivatization by 4-sulfophenyl isothiocyanate enhances peptide sequencing by post-source decay matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry. J. Mass Spectrom. 38, , Pingoud A., Urbanke C., Hoggett J., Keltech A. Biochemical methods: A concise guide for students and researchers. Weinheim Německo, ISBN Simson, R. J. (ed.). Purifying proteins for Proteomics: a laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, Westermeier, R., Naven, T. Proteomics in practice. A laboratory manual of proteome analysis. Wiley-VCH, Weinheim, Germany, ISBN Winter M., Sherman N. E. Protein sequencing and identification using tandem mass spectrometry. John Wiley & Sons, Inc., New York, NY, USA, ISBN Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

33 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu PRF/PGMVV Management vědy a výzkumu Typ předmětu Povinně volitelný, PZ doporučený ročník / semestr - Rozsah studijního předmětu 0+20S+0 hod. - kreditů 5 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních výsledků Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta Zkouška Forma výuky Přednáška, diskuze, brainstorming Course is covered with credit. Student will receive credit based on the presence at five (5) courses. Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující Prof. Mgr. Ondřej Bábek, Dr. 20 % kontaktní výuky prof. Mgr. Ondřej Bábek, Dr., Ing. Michaela Holecová,'prof. MVDr. Emil Tkadlec, CSc. Stručná anotace předmětu Cílem je připravit doktorandy PřF UP pro lepší uplatnitelnost v konkurenčním prostředí sféry vědy a výzkumu. Student získá základní přehled z problematiky projektového managementu, které mu umožní podávat vlastní projektové návrhy. Získá přehled základních principů vědecké práce, nutné pro vlastní výzkumnou činnost. Získá informace o scientometrii a vědecké etice. Získá informace o systému financování výzkumu. Studijní literatura a studijní pomůcky - Tkadlec, E. Strategie a metody vědecké práce v přírodních vědách: filozofické názory a komunikační dovednosti. Olomouc: Univerzita Palackého v Olomouci, ISBN Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím Vyučující je trvale přítomen na pracovišti PřF UP Olomouc (osobní konzultace) + komunikace prostřednictvím u, telefonu nebo Skype

34 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Pedagogická činnost 1 LRR/PGPC1 Typ předmětu Povinně volitelné-oborové B doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu hod. kreditů 5 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních zápočet Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta zápočet g Garant předmětu prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Stručná anotace předmětu Cílem předmětu je využití odborného potenciálu studenta doktorského studia ve výuce v praktických cvičeních a seminářích v daném oboru. Cílem je rovněž i posílení komunikace studenta s ostatními kolegy v oboru a studenty ve výukovém procesu. Výukové aktivity podle formy výuky (početní cvičení, semináře, praktická cvičení, laboratorní cvičení, aj.) Studijní literatura a studijní pomůcky Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

35 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Odborný předmět 1 LRR/PGOP1 Typ předmětu Povinně volitelné-oborové B doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu hod. kreditů 5 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zápočet, ústní zkouška Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta Zápočet, ústní zkouška g Garant předmětu prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující V závislosti na volbě odborného předmětu Stručná anotace předmětu Student si vybere odborný předmět z nabídky předmětů garantovaných katedrami PřF UP v závislosti na odborném zaměření svého doktorského studia. Studijní literatura a studijní pomůcky Dle zvoleného odborného předmětu Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

36 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Hlavní autor publikace v časopise s IF LRR/PGIF Typ předmětu Povinně volitelné-publikační činnost B doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu hod. kreditů 30 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zápočet Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta g Zápočet, Publikace v časopise s IF (hlavní autor). Publikace musí mít nenulový IF a být evidovaná v databázi WOS, případně Scopus. Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Stručná anotace předmětu Hlavním cílem je dosažení publikace, kterou publikuje student doktorského studijního oboru jako hlavní autor. Publikace musí mít nenulový IF a být evidovaná v databázi WOS, případně Scopus. Studijní literatura a studijní pomůcky Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

37 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Hlavní autor publikace v recenzovaném časopise LRR/PGRC Typ předmětu Povinně volitelné-publikační činnost B doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu hod. kreditů 10 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zápočet, Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta Zápočet, Publikace v recenzovaném časopise (hlavní autor). g Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Stručná anotace předmětu Získání teoretických a experimentálních dat pro sepsání vědecké publikace. Zpracování teoretických a experimentálních dat, jako podkladů pro sepsání vědecké publikace. Studijní literatura a studijní pomůcky Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

38 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Spuloautorství v časopise s IF LRR/PGIFS Typ předmětu Povinně volitelné-publikační činnost B doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu hod. kreditů 10 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zápočet Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta g Zápočet, Publikace v časopise s IF (spoluautor). Publikace musí mít nenulový IF a být evidovaná v databázi WOS, případně Scopus. Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Stručná anotace předmětu Hlavním cílem je dosažení publikace, kterou publikuje student doktorského studijního oboru jako spoluautor v časopise s nenulový IF a musí být evidována v databázi WOS, případně Scopus. Studijní literatura a studijní pomůcky Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

39 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Teze k disertační práci LRR/PGT Typ předmětu Povinně volitelné- B doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu hod. kreditů 10 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zápočet Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta Zápočet, student vypracuje tezi k disertační práci g Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Stručná anotace předmětu Teze k disertační práci písemnou formou prezentuje dosavadní aktivity studenta směřující ke zpracování disertační práce. Studijní literatura a studijní pomůcky Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

40 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Rešerše k disertační práci LRR/PGR Typ předmětu Povinně volitelné B doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu hod. kreditů 10 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zápočet Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta Zápočet, student vypracuje rešerši k disertační práci g Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Stručná anotace předmětu Rešerše k disertační práci představuje shrnutí odborné literatury k tématu disertační práce. Studijní literatura a studijní pomůcky Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

41 B-III Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu Hlavní autor publikace v časopise s IF 2 LRR/PGIF2 Typ předmětu Povinně volitelné-b doporučený ročník / semestr Z/L Rozsah studijního předmětu hod. kreditů 15 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence Způsob ověření studijních Zápočet Forma výuky Dialogická výsledků (diskuze, rozhovor, brainstormin Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta g Zápočet, Publikace v časopise s IF (hlavní autor). Publikace musí mít nenulový IF a být evidovaná v databázi WOS, případně Scopus. Garant předmětu Zapojení garanta do výuky předmětu Vyučující prof. Ing. Miroslav STRNAD, CSc., DSc. Stručná anotace předmětu Hlavním cílem je dosažení publikace, kterou publikuje student doktorského studijního oboru jako hlavní autor v časopise s nenulový IF a musí být evidovana v databázi WOS, případně Scopus. Studijní literatura a studijní pomůcky Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 20 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

42 B-IV Údaje o odborné praxi Charakteristika povinné odborné praxe Odborná praxe není v doktorském studiu vyžadována; je nahrazena zahraniční stáží. Rozsah týdnů hodin Přehled pracovišť, na kterých má být praxe uskutečňována Smluvně zajištěno Zajištění odborné praxe v cizím jazyce (u studijních programů uskutečňovaných v cizím jazyce)

43 C-I Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Experimentální biologie Jméno a příjmení Karel Doležal Tituly Mgr., Dr., DSc. Rok narození 1967 typ vztahu k VŠ pp rozsah 32 do kdy Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. pp rozsah 32 do program kdy Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu Člen oborové rady studijního programu, školitel Údaje o vzdělání na VŠ magisterské studium, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci, obor anorganická chemie, dosažený titul Mgr doktorské studium, Lékařská fakulta Univerzity Palackého v Olomouci, obor molekulární biologie, dosažený titul Dr. Disertační práce: "Metabolismus aromatických cytokininů v normálních a transgenních rostlinách". Údaje o odborném působení od absolvování VŠ Výzkumný pracovník ve Výzkumném a šlechtitelském ústavu pícninářském, Troubsko u Brna, Výzkumná stanice Zubří. Využití biochemických markerů ve šlechtění a in vitro kulturách trav. od r vědecký pracovník v ÚEB AV ČR Olomouc od r vědecký pracovník v Laboratoři růstových regulátorů PřF UP & ÚEB AV ČR Olomouc od r vedoucí Oddělení chemické biologie a genetiky CRH Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Vedení obhájených kvalifikačních prací Bakalářské práce: 3 Diplomové práce: 6 Dizertační práce: 9 Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopu s ostatn í Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům

44 Pět nejvýznamnějších publikačních výstupů za posledních 5 let, dokladujících odbornou erudici vyučujícího ve vztahu k vyučovaným předmětům: Honig, M., Plihalová, L., Spichal, L., Gruz, J., Kadlecová, A., Voller, J., Svobodová, A.R., Vostalová, J., Ulrichová, J., Doležal, K., Strnad, M.: New cytokinin derivatives possess UVA and UVB photoprotective effect on human skin cells and prevent oxidative stress. European Journal of Medicinal Chemistry 150: , 2018 Kubiasová, K., Mik, V., Nisler, J., Honig, M., Husičková, A., Spichal, L., Pěkná, Z., Šamajová, O., Doležal, K., Plíhal, O., Benková, E Strnad, M Plíhalová, L.: Design, synthesis and perception of fluorescently labeled isoprenoid cytokinins. Phytochemistry 150: 1-11, Plačková, L., Oklešťková, J., Pospíšková, K., Poláková, K., Buček, J., Stýskala, J., Zatloukal, M., Šafařík, I., Zbořil, R., Strnad, M., Doležal, K., Novák, O.: Microscale magnetic microparticle-based immunopurification of cytokinins from Arabidopsis root apex. Plant Journal, 89 (5): , Plačková, L., Hrdlička, J., Smýkalová, I., Cvečková, M., Novák, O., Griga, M., Doležal, K.: Cytokinin profiling of long-term in vitro pea (Pisum sativum L.) shoot cultures. Plant Growth Regulation 77 (2): , Antoniadi, I., Plačková, L., Simonovik, B., Doležal, K., Turnbull, C., Ljung, K., Novák, O.: Cell-Type-Specific Cytokinin Distribution within the Arabidopsis Primary Root Apex. Plant Cell 27 (7) : , Působení v zahraničí Post-docs: měsíců, Bayreuth University, Dept. of Plant Physiology (prof. Erwin Beck) rok, Swedish Agriculture University Umeå, Dept. of Forest Genetics and Plant Physiology (Prof. Goran Sandberg) (a několik kratších studijních pobytů) Podpis datum

45 C-I Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního Experimentální biologie Ph.D. studium programu Jméno a příjmení Jaroslav Doležel Titul y Prof., ing., DrSc. Rok narození 1954 typ vztahu k VŠ pp rozsah 12 do kdy N Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. program pp rozsah 12 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu Člen oborové rady studijního programu, školitel Údaje o vzdělání na VŠ obor zahradnický, Ing., 1978, Vysoká škola zemědělská, Fakulta agronomická, Brno Genetika, CSc., 1982, Ústav experimentální botaniky ČSAV Genetika, DrSc., 2001, AV ČR Údaje o odborném působení od absolvování VŠ Ústav experimentální botaniky (ÚEB) ČSAV, vědecká aspirantura, ÚEB ČSAV Olomouc, oddělení šlechtitelských biotechnologií, vědecký asistent, ÚEB ČSAV Olomouc, oddělení šlechtitelských biotechnologií, vědecký pracovník, ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie, studijní pobyt, ÚEB Olomouc, oddělení šlechtitelských biotechnologií, samostatný vědecký pracovník, ÚEB AV ČR, Olomouc, vedoucí Laboratoře molekulární cytogenetiky a cytometrie 1994 dosud ÚEB AV ČR Olomouc, vedoucí pracoviště, 1997 dosud PřF UP v Olomouci, odborný asistent, PřF UP v Olomouci, docent, PřF UP v Olomouci, profesor, 2013 dosud Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Bakalářské práce: 3 Diplomové práce: 6 Disertační práce: 15 Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Botanika 2001 UP Olomouc WO Scopu ostatn S s í Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Molekulární biologie a genetika 2013 MU Brno 7

46 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Ford, B.A., etal.: Rht18 semidwarfism in wheat is due to increased GA 2-oxidaseA9 expression and reduced GA content. Plant Physiol. 177: , Thind, A.K., et al.: Rapid cloning of genes in hexaploid wheat using cultivar-specific long-range chromosome assembly. Nat. Biotechnol. 35: , Mascher, M., et al.: A chromosome conformation capture ordered sequence of the barley genome. Nature 544: , 2017 Sánchez-Martín, J., et al.: Rapid gene isolation in barley and wheat by mutant chromosome sequencing. Genome Biol. 17: 221, Choulet, F., et al.: Structural and functional partitioning of bread wheat chromosome 3B. Science 345: , Působení v zahraničí ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie, studijní pobyt, , 12 měsíců National Nuclear Research Institute, Accra, Ghana, expert FAO/IAEA, 1987, 6 týdnů Tree Improvement Research Centre, Kitwe, Zambie, expert FAO/IAEA, 1988, 4 týdny National Nuclear Research Institute, Accra, Ghana, expert FAO/IAEA, 1989, 4 týdny ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie, 1990, 4 měsíce ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie, 1993, 4 měsíce ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie, 1994, 3 měsíce Podpis datum

47 C-I Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Experimentální biologie Jméno a příjmení Martin Fellner Tituly Prof., RNDr., Ph.D. Rok narození 1963 typ vztahu k VŠ pp rozsah 30 do kdy N Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. pp rozsah 30 do N program kdy Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu Molekulární fyziologie rostlin (LRR/PGSX3), přednášející, člen oborové rady studijního programu, školitel Údaje o vzdělání na VŠ Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, obor Biofyzika a chemická fyzika (BCHF) RNDr. - Biofyzika a chemická fyzika, Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta Ph.D. - Université de Paris-Sud XI Orsay, C.N.R.S., ISV, Gif-sur-Yvette, Francie Údaje o odborném působení od absolvování VŠ studijní pobyt na Ústavu experimentální botaniky AV ČR v Olomouci Výzkumný a šlechtitelský ústav zelinářský v Olomouci (výzkumný pracovník) Ústav experimentální botaniky AV ČR v Olomouci (výzkumný pracovník) Leden Listopad stáž, program TEMPUS, C.N.R.S., ISV, Gif-sur-Yvette, Francie (stážista) Prosinec 1992 Říjen Ústav experimentální botaniky AV ČR v Olomouci (výzkumný pracovník) Listopad 1993 Únor doktorské studium (Ph.D.), Université de Paris-Sud XI Orsay, C.N.R.S., ISV, Gif-sur- Yvette, Francie Březen Srpen Výzkumný pracovník Laboratoře růstových regulátorů (ÚEB AV ČR a UP Olomouc) Říjen - Prosinec stáž, Plant Biotechnology Institute, NRC of Canada, Saskatoon, Canada Září Duben Postdoktorandský pobyt, Department of Biology, University of Saskatchewan, Saskatoon, Canada Květen Srpen Výzkumný pracovník, Department of Botany, University of Washington, Seattle, USA Září 2003 Prosinec Odborný asistent, Katedra buněčné biologie a genetiky, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci Leden Docent, Laboratoř růstových regulátorů, Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci & Ústav experimentální botaniky, AV ČR Leden 2013 dosud - Výzkumný pracovník, Ústav experimentální botaniky, AV ČR (úvazek 0,5) Leden 2016 dosud - Profesor, Laboratoř růstových regulátorů, Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci & Ústav experimentální botaniky, AV ČR (úvazek 0,7) Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací 31 obhájených bakalářských prací, 13 obhájených diplomových prací, 3 obhájeny dizertační práce, vedení 10 prací v rámci Středoškolské odborné činnosti (SOČ) (3 studenti postoupili do Národního kola SOČ). Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Doc. Fyziologie rostlin 2009 MZLU v Brně WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 390 Prof. Fyziologie rostlin 2016 MZLU v Brně

48 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Balarynová J, Danihlík J, Fellner M (2018) Changes in plasma membrane aquaporin gene expression under osmotic stress and blue light in tomato. Acta Physiologiae Plantarum 40: Omidvar V, Mohorianu I, Dalmay T, Zheng Y, Fei Z, Pucci A, Mazzucato A, Večeřová V, Sedlářová M, Fellner M (2017) Transcriptional regulation of male-sterility in 7B-1 male-sterile tomato mutant. PlosONE 12: e Omidvar V, Mohorianu I, Dalmay T, Fellner M (2015) Identification of mirnas with potential roles in regulation of anther development and male-sterility in 7B-1 male-sterile tomato mutant. BMC Genomics 16: Hlavinka J, Nauš J, Fellner M (2013) Spontaneous mutation 7B-1 in tomato impairs blue light-induced stomatal opening. Plant Science 209: Piterková J, Luhová L, Hofman J, Turečková V, Novák O, Petřivalský M, Fellner M (2012) Nitric oxide is involved in light-specific responses of tomato during germination under normal and osmotic stress conditions. Annals of Botany 110: Překlad knihy knihy Terryho A. Browna: "Gene Cloning and DNA Analysis" An Introduction, 5. vydání, Blackwell Science Ltd Klonování genů a analýza DNA. Úvod, Vydavatelství UP v Olomouci, 2007 Působení v zahraničí 1.EC Training fellowship in Easter Europe (TEMPUS Program): CNRS, Institute of Plant Sciences, Gif-sur-Yvette, France; 8 měsíců. 2.Ph.D. scholarship: CNRS, ISV, Gif-sur-Yvette and University of Paris XI (Orsay), France; 3,5 roku 3.Postdoctoral fellowship: University of Saskatchewan, Department of Biology, Saskatoon, Canada; 2 roky a 8 měsíců 4.Postdoctoral research associate: University of Washington, Department of Botany, Seattle, USA; 3 roky a 4 měsíce Podpis datum

49 C-I Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Experimentální biologie Jméno a příjmení Jitka Frébortová Tituly doc., RNDr., Ph.D. Rok narození 1968 typ vztahu k VŠ PP rozsah 40 do kdy N Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. PP rozsah 40 do N program kdy Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu školitel Údaje o vzdělání na VŠ Mgr.: Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, analytická chemie, 1991 Ph.D.: Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, analytická chemie, 1995 RNDr.: Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, analytická chemie, 1999 Ph.D.: United Graduate School of Agricultural Sciences, Tottori University, Japonsko, Bioresources Science, 1997 doc.: Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, biochemie, 2008 Údaje o odborném působení od absolvování VŠ Laboratoř růstových regulátorů, PřF UP - vědecký pracovník mateřská dovolená Laboratoř růstových regulátorů, PřF UP - odborný asistent Laboratoř růstových regulátorů, PřF UP - docent 2010-dosud - Centrum regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum (PřF UP) - docent, senior researcher Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Vedení prací: Bc. 8 (Radek Jorda, Jana Rambousková, Veronika Smékalová, Veronika Žihlová, Helena Dobiášová, Ester Lasotová, Michaela Němcová, Tomáš Sedláček), Mgr. 4 (Radek Jorda, Veronika Smékalová, Helena Dobiášová, Ester Lasotová), Ph.D. 1 (David Zalabák) Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Biochemie 2008 UP Olomouc WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Pět nejvýznamnějších publikací za posledních 5 let: Saichana N, Matsushita K, Adachi O, Frébort I, Frébortová J (2015) Acetic acid bacteria: A group of bacteria with versatile biotechnological applications. Biotechnol. Adv. 33, (IF 2015 = 9.848) Frébortová J, Greplová M, Seidl MF, Heyl A, Frébort I (2015) Biochemical characterization of putative adenylate dimethylallyltransferase and cytokinin dehydrogenase from Nostoc sp. PCC PLoS ONE 10(9): e doi: /journal.pone (IF 2015 = 3.057) Saichana N, Tanizawa K, Pechoušek J, Novák P, Yakushi T, Toyama H, Frébortová J (2016) PqqE from Methylobacterium extorquens AM1: a radical S-adenosyl-L-methionine enzyme with an unusual tolerance to oxygen. J. Biochem. 159, (IF 2016 = 2.082) Frébortová J, Plíhal O, Florová V, Kokáš F, Kubiasová K, Greplová M, Šimura J, Novák O, Frébort I (2017) Light influences cytokinin biosynthesis and sensing in Nostoc (Cyanobacteria). J. Phycol. 53, (IF 2017 = 3.0)

50 Saichana N, Tanizawa K, Ueno H, Pechoušek J, Novák P, Frébortová J (2017) Characterization of auxiliary iron-sulfur clusters in a radical S-adenosylmethionine enzyme PqqE from Methylobacterium extorquens AM1. FEBS Open Bio 7, (IF 2017 = 1.782) Pedagogická činnost za posledních 10 let (vše na PřF UP Olomouc): Přednášky: semestrální kurzy Mikrobiologie, Principy a aplikace molekulární biotechnologie Cvičení: semestrální kurzy Laboratorní cvičení z mikrobiologie, Cvičení z mikrobiální biotechnologie Výzkumné projekty za posledních 10 let: Vliv syntetických derivátů cytokininů na percepci a metabolismus rostlinných hormonů a fenotypické změny, GA ČR, , řešitel. Působení v zahraničí , Japonsko, Yamaguchi University (3,75 roku), vědecký asistent, doktorské studium 2007, Japonsko, University of Ryukyus (5 týdnů), výzkumná a studijní stáž Další kratší výzkumné stáže: Yamaguchi, Groningen, Řím, Berlín, Braunschweig, Columbia (USA), mobility v rámci Sokrates/Erasmus: Lund, Lyngby Podpis datum

51 C-I Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Experimentální biologie Jméno a příjmení Vladimír Kryštof Tituly Doc., RNDr., Ph.D. Rok narození 1973 typ vztahu k VŠ PP rozsah 30 do kdy N Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. PP rozsah 30 do N program kdy Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i. PP 20 Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu Člen oborové rady studijního programu, školitel Údaje o vzdělání na VŠ Mgr., Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, obor analytická chemie, 1996 Ph.D., Univerzita Palackého v Olomouci, Lékařská fakulta, obor lékařská biologie, 2002 RNDr., Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, obor botanika, 2003 Docent, Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, obor biochemie, 2010 Údaje o odborném působení od absolvování VŠ PřF UP, výzkumný pracovník Ústav experimentální botaniky, v.v.i., vědecký pracovník PřF UP, vědecký pracovník Vienna Medical University, Rakousko, vědecký pracovník od PřF UP, docent od Ústav experimentální botaniky, v.v.i., docent Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací - vedení bakalářských prací (7x), diplomových prací (13x), doktorských prací (10x), oponentské posudky doktorských prací (6x) - členství v oborové radě doktorských studijních programů biologie (PřF UP) - členství v oborové komisi doktorského studijního programu experimentální biologie (PřF UP) Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Biochemie 2010 UP Olomouc WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 1703 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům - 95 odborných publikací v zahraničních peer reviewed časopisech s IF - 8 mezinárodních patentových přihlášek - 99 konferenčních příspěvků - organizace mezinárodních konferencí (člen organizačního výboru 2x,editor sborníku 2x) - výzkumné grantové projekty GAČR (5x hlavní řešitel, 3x odborný spolupracovník), IGA MZ (2x hlavní řešitel, 1x spoluřešitel), MŠMT (2x hlavní řešitel), OPVK (5x odborný spolupracovník) - hodnotící panel Grantové agentury České republiky (P303 Fyziologické obory, farmakologie, neurovědy a toxikologie), člen od roku nejvýznamnějších publikací za posledních 5 let: Gucký T., Jorda R., Zatloukal M., Bazgier V., Berka K., Řezníčková E., Béres T., Strnad M., Kryštof V.: A novel series of highly potent 2,6,9-trisubstituted purine cyclin-dependent kinase inhibitors. J. Med. Chem. 56, , (autorský podíl 15%)

52 Zhang S., Ulrich M., Gromnicka A., Havlíček L., Kryštof V., Jorda R., Strnad M., Vollmar A.M., Zahler S.: Anti-angiogenic effects of novel cyclin-dependent kinase (CDK) inhibitors with a pyrazolo[4,3-d]pyrimidine scaffold. Br. J. Pharmacol. 173, , (autorský podíl 15%) Vymětalová L., Kryštof V.: Potential Clinical Uses of CDK Inhibitors: Lessons from Synthetic Lethality Screens. Med. Res. Rev. 35, , (autorský podíl 60%) Jorda R., Bučková Z., Řezníčková E., Bouchal J., Kryštof V.: Selective inhibition reveals cyclin-dependent kinase 2 as another kinase that phosphorylates the androgen receptor at serine 81. Biochim. Biophys. Acta. 1865, , (autorský podíl 20%) Gucky T., Řezníčková E., Radosova Muchova T., Jorda R., Klejova Z., Malinkova V., Berka K., Bazgier V., Ajani H., Lepsik M., Divoky V., Kryštof V.: Discovery of N2-(4-Amino-cyclohexyl)-9-cyclopentyl- N6-(4- morpholin-4-ylmethyl-phenyl)-9 H-purine-2,6-diamine as a Potent FLT3 Kinase Inhibitor for Acute Myeloid Leukemia with FLT3 mutations. J. Med. Chem. 61, (autorský podíl 20%) Působení v zahraničí 1997 (1 měsíc) Dept. of Biochemistry, University of Dundee, Velká Británie, stáž 1998 (1 měsíc) Dept. of Genetics and Microbiology, Vienna University, Rakousko, stáž 2003 (1 měsíc) Dept. of Biophysics, Faculte de Pharmacie de Marseille, Francie, stáž 2004 (1 měsíc) Dept. of Biophysics, Faculte de Pharmacie de Marseille, Francie, stáž Institute of Cancer Research, Vienna Medical University, Rakousko, stáž Podpis datum

53 C-I Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Experimentální biologie Jméno a příjmení Ondřej Novák Tituly doc., Mgr., Ph.D. Rok narození 1976 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 20 do kdy N Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. pp. rozsah 20 do N program kdy Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu - Bioanalytika (LRR/PGSX6), přednášející - Člen oborové rady studijního programu - Školitel Údaje o vzdělání na VŠ 1999 dosažený titul Mgr., studijní program: Chemie, obor: Analytická chemie, VŠ: UP Olomouc, PřF 2006 dosažený titul Ph.D., studijní program: Biologie, obor: Botanika, VŠ: UP Olomouc, PřF Údaje o odborném působení od absolvování VŠ Laboratoř růstových regulátorů, PřF UP Olomouc, vědecký pracovník Laboratoř růstových regulátorů, PřF UP Olomouc, odborný asistent od r Laboratoř růstových regulátorů, ÚEB AV ČR Praha, vědecký pracovník od r Centrum regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum, PřF UP Olomouc & ÚEB AV ČR & VÚRV, Laboratoř růstových regulátorů, vedoucí oddělení Metabolomiky od r Laboratoř růstových regulátorů, PřF UP Olomouc, docent Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Bakalářské práce: 5 (J. Pavlík, 2010; B. Pařízková, 2013; P. Peňáková, 2015; L. Fingerová, 2018; D. Koničková, 2018) Diplomové práce: 5 (J. Pavlík, 2012; B. Pařízková, 2015; K. Bambulová, 2017; P. Peňáková, 2017; P. Voňka, 2017) Disertační práce: 2 (K. Floková, 2014; J. Šimura, 2017) Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Fyziologie rostlin 2018 MEDELU, Brno WOS Scopu ostatn s í Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům [* korespondenční autor, podíl 25%] 1. Floková K., Tarkowská D., Miersch O., Strnad M., Wasternack C., Novák O.* (2014) UHPLC-MS/MS based target profiling of stress-induced phytohormones. Phytochemistry 105: Antoniadi I., Plačková L., Simonovik B., Doležal K., Turnbull C., Ljung K., Novák O.* (2015) Cell-type specific cytokinin distribution within the Arabidopsis primary root apex. Plant Cell 27(7): Floková K., Feussner K., Herrfurth C., Miersch O., Mik V., Tarkowská D., Strnad M., Feussner I., Wasternack C., Novák O.* (2016) A previously undescribed jasmonate compound in flowering Arabidopsis thaliana the identification of cis-(+)-opda-ile. Phytochemistry 122: Plačková L., Oklestkova J., Pospíšková K., Poláková K., Buček J., Stýskala J., Zatloukal M., Šafařík I., Zbořil R., Strnad M., Doležal K.*, Novák O.* (2017) Microscale magnetic microparticle-based immunopurification of cytokinins from Arabidopsis root apex. Plant J. 89(5): Šimura J., Antoniadi I., Široká J., Tarkowská D., Strnad M., Ljung K., Novák O.* (2018) Plant hormonomics: multiple phytohormone profiling by targeted metabolomics. Plant Physiol. 177(2):

54 Působení v zahraničí Umeå Plant Science Centre, Umeå, Švédsko, post-doktorand Department of Plant Physiology, Umeå University, Umeå, Švédsko, hostující vědec Department of Forest Genetics and Plant Physiology, Swedish University of Agricultural Sciences, Umeå, Švédsko, hostující vědec Podpis datum

55 C-I Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Experimentální biologie Jméno a příjmení Jana Oklešťková Tituly Mgr., Ph.D Rok narození 1978 typ vztahu k VŠ pp rozsah 8 do kdy 8/2021 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. pp rozsah 8 do 8/2021 program kdy Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu školitel Údaje o vzdělání na VŠ dosažený titul Mgr., studijní program: Biologie, obor: Biologie-Chemie, VŠ: UP Olomouc, PřF dosažený titul Ph.D., studijní program: Biologie, obor: Botanika, VŠ: UP Olomouc, PřF Údaje o odborném působení od absolvování VŠ Laboratoř růstových regulátorů, PřF UP Olomouc, vědecký pracovník od Laboratoř růstových regulátorů, PřF UP Olomouc, odborný asistent od Laboratoř růstových regulátorů, ÚEB AV ČR Praha, vědecký pracovník Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Bakalářské práce: 4obhájené práce Diplomové práce: 4obhájené práce +2 v součastnosti vedené práce Disertační práce: 1 v součastnosti vedená práce Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopu s ostatn í Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 452 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům 1) Lucie Rárová, David Sedlák, Jana Oklestkova, Jana Steigerová, Johanna Liebl, Stefan Zahler, Petr Bartůněk, Zdeněk Kolář, Ladislav Kohout, Miroslav Kvasnica, Miroslav Strnad. (2018) The novel brassinosteroid analog BR4848 inhibits angiogenesis in human endothelial cells and induces apoptosis in human cancer cells in vitro. Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology, 178, ) Zuzana Gelová, Petra ten Hoopen, Ondřej Novák, Václav Motyka, Markéta Pernisová, Siarhei Dabravolski, Vojtěch Didi, Isolde Tillack, Jana Oklešťková, Miroslav Strnad, Bettina Hause, Danka Haruštiaková, Udo Conrad, Lubomír Janda, Jan Hejátko. (2018) Antibody-mediated modulation of cytokinins in tobacco: organspecific changes in cytokinin homeostasis, Journal of Experimental Botany, 69 (3), ) Oklestkova J., Tarkowská D., Eyer L., Elbert T., Marek A., Smrzova Z., Novák O., Fránek M., Zhabinskii V.N., Strnad M. (2017) Immunoaffinity chromatography combined with tandem mass spectrometry: A new tool for the selective capture and analysis of brassinosteroid plant hormones. Talanta 170, ) Plačková, L., Oklestkova, J., Pospíšková, K., Poláková, K., Buček, J., Stýskala, J., Zatloukal, M., Šafařík, I., Zbořil, R., Strnad, M., Doležal, K. and Novák, O. (2017), Microscale magnetic microparticle-based immunopurification of cytokinins from Arabidopsis root apex. Plant J. 89, ) Gruszka D, Janeczko A, Dziurka M, Pociecha E, Oklestkova J and Szarejko I (2016). Barley brassinosteroid mutants provide an insight into phytohormonal homeostasis in plant reaction to drought stress. Front. Plant Sci. 7:1824.

56 Působení v zahraničí měsíc v IPK Institutu, Gatersleben, Německo měsíc, Max Planck Institute for Chemical Ecologie, Jena, Německo Podpis datum

57 C-I Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Experimentální biologie Jméno a příjmení Lucie Plíhalová Tituly Mgr., Ph.D. Rok narození 1978 typ vztahu k VŠ PP rozsah 36 do kdy 2021 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. PP rozsah 36 do 2021 program kdy Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu školitel Údaje o vzdělání na VŠ dosažený titul Mgr., Přírodovědecká fakulta UP Palackého v Olomouci, obor Anorganická chemie dosažený titul Ph.D., Přírodovědecká fakulta UP Palackého v Olomouci, obor Anorganická chemie. Údaje o odborném působení od absolvování VŠ současnost: vědecký pracovník LRR PřF UP v Olomouci, příprava a fyzikálně-chemické studium biologicky aktivních organických molekul derivátů cytokininů, do současnost: VaV UEB AV ČR současnost: vědecký pracovník Centra regionu Haná pro Biotechnologický a Zemědělský výzkum a zároveň vedoucí transferu technologií tamtéž Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Studenti s dokončenou Bc.: Karolina Kubiasová, Martin Hönig, David Burget, Dardan Klos, studující: Kateřina Ryšavá Studenti s dokončenou diplomovou prací: Martin Tkáč, Hana Malečková Vylíčilová, Martin Hönig, studující: Šárka Kostková Vedení doktorských prací: Mgr. Hana Vylíčilová, Mgr. Martin Hönig Odborný konzultant při vedení dizertační práce (dokončená) Václav Mik, Ph.D. Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 301 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům 1) New cytokinin derivatives possess UVA and UVB photoprotective effect on human skin cells and prevent oxidative stress, Hönig M 1, Plíhalová L 2, Spíchal L 3, Grúz J 4, Kadlecová A 4, Voller J 4, Svobodová AR 5, Vostálová J 5, Ulrichová J 5, Doležal K 1, Strnad M 4, Eur J Med Chem Apr 25;150: , (2018). 2) Design, synthesis and perception of fluorescently labeled isoprenoid cytokinins.kubiasová K 1, Mik V 2, Nisler J 3, Hönig M 3, Husičková A 4, Spíchal L 2, Pěkná Z 2, Šamajová O 5, Doležal K 3, Plíhal O 1, Benková E 6, Strnad M 7, Plíhalová L 8. Phytochemistry Jun;150:1-11. (2018) 3) Deciphering the growth pattern and phytohormonal content in Saskatoon berry (Amelanchier alnifolia) in response to in vitro cytokinin application Moyo, Mack; Aremu, Adeyemi O.; Plackova, Lenka; et al.new BIOTECHNOLOGY Volume: 42 Pages: (2018) 4) Differential responses to isoprenoid, N-6-substituted aromatic cytokinins and indole-3-butyric acid in direct

58 plant regeneration of Eriocephalus africanus Madzikane-Mlungwana, Olwethu; Moyo, Mack; Aremu, Adeyemi O.; et al.plant GROWTH REGULATION Volume: 82 Issue: 1 Pages: (2017). 5) Physiological and Biochemical Responses of Merwilla plumbea Cultured In Vitro with Different Cytokinins After 1 Year of Growth Under Ex Vitro Conditions Moyo, Mack; Amoo, Stephen O.; Aremu, Adeyemi O.; et al.journal OF PLANT GROWTH REGULATION Volume: 36 Issue: 1 Pages: (2017). 6) CZ306987: 2,6-disubstituted purines for use as pharmaceuticals, and pharmaceutical preparations, J Voller, L Zahajská, L Plíhalová, J Komárková, D Burget, V Kryštof, M Zatloukal, K Doležal, M Strnad, D Rösel, J Brábek, A C Pataki, UEB AS CR 7) CZ306434: 2,6-disubstituted purines for use as pharmaceuticals, and pharmaceutical preparations, J Voller, Zahajská L, Plíhalová L, Komárková J, Burget D, Kryštof V, Zatloukal M, Doležal K, Strnad M, Rösel D, Brábek J, Pataki AC, UEB AS CR Působení v zahraničí Podpis datum

59 C-I Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Experimentální biologie Jméno a příjmení Jiří Pospíšil Tituly RNDr., Ph.D. Rok narození 1979 typ vztahu k VŠ pp rozsah 12 do kdy 09/2020 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. pp rozsah 12 do 09/2020 program kdy Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah Ústav Experimentální Biologie AV ČR, v.v.i pp 40 Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu Školitel Údaje o vzdělání na VŠ Mgr.: Masarykova Univerzita v Brně, obor Organická chemie, 2002 RNDr.: Masarykova Univerzita v Brně, obor Organická chemie, 2002 DEA: Université Catholique de Louvain (Belgie), obor Chemie, 2005 PhD.: Université Catholique de Louvain (Belgie), obor Organická Chemie specializace: syntéza přírodních látek, 2006 Údaje o odborném působení od absolvování VŠ : Max-Planck Institute für Kohlforschung, Mülhein-an-der-Ruhr, Německo Vědecký pracovník : Université Catholique de Louvain, Belgie F.S.R.-FNRS research fellow (samostatný vědecký pracovník) : École Polytechnique, ParisTech, Palaiseau, Francie CNRS research fellow 2014-dosud Ústav Experimentální Biologie AV ČR, v.v.i. samostatný vědecký pracovník 2014-dosud: UP Olomouc akademický pracovník na částečný pracovní úvazek Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací počet vedených bakalářských prací (obhájených): 9 (3) počet vedených (obhájených) diplomových prací: 5 (4) počet vedených doktorských prací: 3 Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Celkem 33 publikací v impaktovaných časopisech dle WOS, 5 nedávných relevantních publikací 1) "One and Two-Carbon Homologation of Primary and Secondary Alcohols to Corresponding Carboxylic Esters Using β-carbonyl BT Sulfones as a Common Intermediate" Bon, D. J. Y. D.; Kováč, O.; Ferugová, V.; Zálešák, F.; Pospíšil*, J. J. Org. Chem. 2018, 83, ) "Quantitative Analysis of Ingenol in Euphorbia species via Validated Isotope Dilution Ultra-high Performance Liquid Chromatography Tandem Mass Spectrometry" Béres*, T.; Dragull, K.; Pospíšil, J.; Tarkowská, D.; Dančák, M.; Bíba, O.; Tarkowski, P.; Doležal, K.; Strnad, M. Phytochem. Anal. 2018, 29, ) "Microwave-assisted synthesis of phenylpropanoids and coumarins: total synthesis of Osthol" Konrádová, D.; Kozubíková, H.; Doležal, K.; Pospíšil*, J. Eur. J. Org. Chem. 2017, 2017, ) "Determination of free diferulic, disinapic and dicoumaric acids in plants and foods Grúz*, J.; Pospíšil, J.; Kozubíková, H.; Pospíšil, T.; Doležal, K.; Bunzel, M.; Strnad, M. Food Chem. 2015, 171, ) On the Origin of E/Z Selectivity in the Modified Julia Olefination: Importance of the Elimination Step Robiette*, R.; Pospíšil*, J. Eur. J. Org. Chem. 2013, 2013,

60 Výzkumné projekty 1. "Vývoj metody přípravy standardů polyaminů", Inovační voucher, OP PIK, Ministerstvo průmyslu a obchodu, CZ /0.0/0.0/17_205/ ; ( až ), spoluřešitel 2. "Látky rostlinného původu proti zubnímu kazu", Technologic Agency of the Czech republic (TACR), projekt GAMA, Proof-of-concept TG , ( až ), hlavní řešitel 3. "Vývoj technologií výroby nových inhibitorů proteinkinas a jejich charakterizace a testování", Inovační voucher Olomouckého regionu, OP1: 2015/03408/OSR/DSM; ( až ), spoluřešitel 4. "Development of new cascade and multicomponent reactions", F.S.R.-FNRS research fellowship, ( až ), hlavní řešitel Působení v zahraničí 2001 (3 měsíce): Université catholique de Louvain, Louvain-la-Neuve, Belgie - výzkumný pobyt v rámci programu Sokrates-Erasmus 2001 (3 měsíce) University of Missouri, Department of Chemistry, Prof. Kent S. Gates, Columbia (MO), USA - jako Stevensonův výzkumný pracovník (stipendium) Université catholique de Louvain, Prof. I. E. Markó (Ph.D. školitel), Louvain-la-Neuve, Belgie - Ph.D. student (4 roky) : Max-Planck Institute für Kohlforschung, Prof. Dr. Alois Fürstner, Mülheim-an-der-Ruhr, Německo - postdoktorský pobyt : UClouvain, Institute of condensed matter and nanoscience, Louvain-la-Neuve, Belgie - F.S.R.-FNRS vědecký pracovník (10 měsíců): École polytechnique, Laboratoř Organické Syntézy, Prof. Samir Z. Zard, Paříž, Francie - CNRS vědecký pracovník 2014 (1 měsíc): Australian National University, Research School of Chemistry, Prof. Lewis N. Mander, Canberra, Austrálie - Visiting researcher Podpis datum

61 C-I Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Experimentální biologie Jméno a příjmení Miroslav Strnad Tituly prof. Ing. CSc., DSc. Rok narození 1958 typ vztahu k VŠ PP rozsah 32 do kdy N Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. PP rozsah 32 do N program kdy Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah Ústav experimentální botaniky AVČR PP 28 Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu Fyziologie a biochemie rostlin (LRR/PGSX9), přednášející, předseda oborové rady studijního programu, školitel Údaje o vzdělání na VŠ Ing.: Vysoká škola zemědělská v Brně, agronomická fakulta, obor fytotechnický, 1982 CSc.: Ústavu experimentální botaniky ČSAV, 1988 Prof.: Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně, 2001 DSc.: Akademie věd ČR, fyziologie rostlin, 2006 Údaje o odborném působení od absolvování VŠ stipendium v Ústavu experimentální botaniky ČSAV, Praha; vývoj biotestů pro studium vztahů mezi chemickou strukturou a biologickou aktivitou brasinosteroidů interní vědecká aspirantura v ÚEB ČSAV v Olomouci; studium role exogenních růstových regulátorů na metabolismus cytokininů během somatické embryogeneze v buněčné kultuře vojtěšky. od vědecký pracovník Ústavu experimentální botaniky ČSAV v Olomouci odborný asistent, katedra buněčné biologie a genetiky PřF UP Olomouc od odborný asistent, katedra botaniky PřF UP Olomouc od vedoucí Laboratoře růstových regulátorů - společné pracoviště ÚEB AVČR a UP habilitace v oboru fyziologie rostlin MZLÚ Brno jmenování profesorem na návrh MZLU Brno doktor věd v oboru fyziologie rostlin, AVČR vicepresident Evropské fytochemické společnosti (PSE) president PSE Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací vedení více jak 15 disertačních prací vedení více jak 25 diplomových prací Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Fyziologie rostlin 1996 Mendelova zemědělská a WOS Scopus ostatní lesnická univerzita v Brně Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Fyziologie rostlin 2001 Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně

62 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům 1. Irani NG, Di Rubbo S, Mylle E, Den Begin Jv, Schneider-Pizoń J, Hniliková J, Šíša M, Buyst D, Vilarrasa-Blasi J, Szatmári AM, Van Damme D, Mishev K, Codreanu Mc, Kohout L, Strnad M, Can~O-Delgado AI, Friml J, Madder A, Russinova E. Fluorescent castasterone reveals BRI1 signaling from the plasma membrane. Nature Chem Biol, 2012, 8(6): IF2015= ; 77 Cited in Web of Science Core Collection ( ). 2. Zhang K, Novák O, Wei Z, Gou M, Zhang X, Yu Z, Yang H, Cai Y, Strnad M, Liu CHJ (2014) Arabidopsis ABCG14 protein controls the acropetal translocation of root-synthesized cytokinins. Nature Commun. 5, Art.no. 3274; 33, 11,329. IF2015= ; 34 Cited in Web of Science Core Collection ( ). 3. Samanovic MI, Tu S, Novák O, Iyer LM, Mcallister FE, Aravind L, Gygi SP, Hubbard SR, Strnad M, Darwin KH: Proteasomal Control of Cytokinin Synthesis Protects Mycobacterium tuberculosis against Nitric Oxide. Molecular Cell, 57, 6, 2015, IF2015= ; 14 Cited in Web of Science Core Collection ( ) 4. Niemann MCE, Bartrina I, Ashikov A, Weber H, Novak O, Spichal L, Strnad M, Strasser R, Bakker H, Schmulling T, Werner T: Arabidopsis ROCK1 transports UDP-GlcNAc/UDP-GalNAc and regulates ER protein quality control and cytokinin aktivity. P NATL ACAD SCI USA. 2015, 112(1), IF2015= 9.324; 12 Cited in Web of Science Core Collection ( ) 5. Siddique S, Radakovic ZS, De La Torre CM, Chronis D, Novák O, Ramireddy E, Holbein J, Matera C, Hutten M, Gutbrod P, Anjam MS, Rozanska E, Habash S, Elashry A, Sobczak M, Kakimoto T, Strnad M, Schmülling T, Mitchum MG, Grundler FmW: A parasitic nematode releases cytokinin that controls cell division and orchestrates feeding site formation in host plants. P NATL ACAD SCI USA, 2015, 112: IF2015= 9.324; 16 Cited in Web of Science Core Collection ( ) Sedm nejvýznamnějších patentů: 1. US 8,552,161 Saponin compounds, methods of preparation thereof, use thereof and pharmaceutical compositions. Morzycki; J, Wojtkielewicz A, Okleštková J, Hoffmannová L, Strnad M. Udělen: 8/10/ Číslo patentu: Použití cholestanových derivátů k výrobě léčiva pro léčbu nádorového bujení a s ním spojené angiogeneze. Kohout Ladislav, Chodounská Hana, Hniličková Jaroslava, Kasal Alexandr, Černý Ivan, Kolář Zdeněk, Strnad Miroslav, Oklešťková Jana, Steigerová Jana, Hoffmanová Lucie. Udělen: 8/10/ US 8,552,161. Saponin compounds, methods of preparation thereof, use thereof and pharmaceutical compositions. Morzycki J.W., Wojtkielewicz A., Okleštková J., Hoffmannova L., Strnad M. Udělen: 8/10/ EP Novel saponin compounds, methods of preparation thereof, use thereof and pharmaceutical compositions. Původci: JW Morzycki, A Wojtkielewics, J Okleštková, L Hoffmanová, M Strnad. Datum udělení: 27/8/ WO (A1) Jansa P.; Kvasnica M.; Mackman R.L.: Fused pyrimidine compounds for the treatment of HIV, U.S. patent, June 30, US Natural brassinosteroids for use for treating hyperproliferation, treating proliferative diseases and reducing adverse effects of steroid dysfunction in mammals, pharmaceutical composition and its use. Okleštková J; Hoffmannová L; Steigerová J; Kohout L; Kolář Z; Strnad M. 7. EP Saccharide lupane derivatives, their use and pharmaceutical compositions containing these derivatives. Pakulski Z; Cmoch P; Okleštková J; Strnad M. Působení v zahraničí měsíc, Halle, NDR, Ústav fyziologie a biochemie rostlin; vývoj imunoanalýz a biotestů, Prof. Dr. Sembdner měsíce, Moskva, SSSR, Ústav fyziologie rostlin Akademie věd SSSR, analýza buněčných klonů tabáků na obsah endogenních cytokininů, Prof. Kulaeva měsíc Universita v Bayreuthu, SRN; porovnání ELISA metod pro různé cytokininy, identifikace prvního aromatického cytokininu, Prof. Dr. E. Beck měsíc Universita v Bayreuthu a Bochumi, SRN; identifikace nových aromatických cytokininů, Prof. Dr. E. Beck měsíce, Universita v Cambridge, Anglie; isolace a identifikace vysoce biologicky aktivních derivátů aromatických cytokininů, Dr. D. E. Hanke měsíce Universita v Cambridge, Anglie; isolace a identifikace benzyladeninu a příbuzných metabolitů, Dr. D. E. Hanke měsíců - prof. H. A. van Onckelen, Department of Biology, University Instelling Antwerpen, Belgie, cytokininy v transgenních rostlinách, HPLC-MS cytokininů měsíce - prof. H. A. van Onckelen, Department of Biology, University Instelling Antwerpen, Belgie, cytokininy v transgenních rostlinách, HPLC-MS cytokininů. Podpis datum

63 Personální zabezpečení studijního programu přehled Vysoká škola Součást vysoké školy Název studijního programu Univerzita Palackého v Olomouci Přírodovědecká fakulta Experimentální biologie Složení oborové rady Předseda Strnad Miroslav, prof., Ing., CSc., DSc., PřF UP v Olomouci Členové: Divoký Vladimír, doc., RNDr., Ph.D., LF UP v Olomouci Doležal Karel, Mgr., Dr., DSc., Ústav experimentální botaniky AVČR, Olomouc Doležel Jaroslav, prof., Ing., DrSc., Ústav experimentální botaniky AVČR, Olomouc Drábek Jiří, doc., Mgr., Ph.D., LF UP v Olomouci Fellner Martin, prof., RNDr., Ph.D., PřF UP v Olomouci Kryštof Vladimír, doc., RNDr., Ph.D., PřF UP v Olomouci Kolář Zdeněk, prof., MUDr., CSc., LF UP v Olomouci Lebeda Aleš, prof., Ing., DrSc., PřF UP v Olomouci Navrátil Milan, prof., RNDr., CSc., PřF UP v Olomouci Novák Ondřej, doc, Mgr., Ph.D., PřF UP v Olomouci Šebela Marek, prof., Mgr., Ph.D., PřF UP v Olomouc Ulrichová Jitka, prof., MUDr., Ph.D., LF UP v Olomouci Vojtěšek Bořivoj, RNDr., DrSc., Masarykův onkologický ústav Brno Vyskot Boris, prof., RNDr DrSc., Biofyzikální ústav AV ČR Brno Školitelé: Doležal Karel, Mgr., Dr., DSc., Ústav experimentální botaniky AVČR, Olomouc Doležel Jaroslav, prof., Ing., DrSc., Ústav experimentální botaniky AVČR, Olomouc Fellner Martin, prof., RNDr., Ph.D., PřF UP v Olomouci Frébortová Jitka, doc., RNDr., Ph.D., PřF UP v Olomouci Hedden Peter, prof., Ph.D., PřF UP v Olomouci Kryštof Vladimír, doc., RNDr., Ph.D., PřF UP v Olomouci Novák Ondřej, doc., Mgr., Ph.D., PřF UP v Olomouci Strnad Miroslav, prof., Ing., CSc., DSc., PřF UP v Olomouci Školitelé schválení vědeckou radou PřF UP Oklešťková Jana, Mgr., Ph.D., PřF UP v Olomouci Pospíšil Jiří, Mgr. Ph.D., PřF UP v Olomouci Plíhalová Lucie, Mgr., Ph.D., PřF UP v Olomouci Zatloukal Marek, Mgr. Ph.D., PřF UP v Olomouci Grúz Jiří, Mgr. Ph.D., PřF UP v Olomouci Gucký Tomáš, Mgr. Ph.D., PřF UP v Olomouci Kvasnica Miroslav, Mgr., Ph.D., PřF UP v Olomouci De Diego Sanchez Nuria, Ph.D, PřF UP v Olomouci Hrstka Petr, doc., Mgr., Ph.D., Masarykův onkologický ústav Brno

64 C-II Související tvůrčí, resp. vědecká a umělecká činnost Přehled řešených grantů a projektů u akademicky zaměřeného bakalářského studijního programu a u magisterského a doktorského studijního programu Řešitel/spoluřeši tel Názvy grantů a projektů získaných pro vědeckou, výzkumnou, uměleckou a další tvůrčí činnost v příslušné oblasti vzdělávání Zdroj Novák Ondřej S; Komplexní interakce mezi fytohormony během mrazové B aklimatizace. (GAČR) Strnad Miroslav S; Modulace CDK a příbuzných molekulárních cílů u B agresivních nehodkingských lymfomů (GAČR) Pěnčík Aleš Y; Homeostáze auxinu na subcelulární úrovni B (GAČR) Doležal Karel S; Studium intracelulární distribuce cytokininů a B mechanismu jejich transportu do vakuol (GAČR) Období IGA MZ Vladimír Kryštof IGA MZ A Vývoj nového kinasového inhibitoru pro léčbu akutní myeloidní leukemie Vladimír Kryštof NV A Inhibice BCR signalosomu u B buněčných malignit MZ0/NV Přehled řešených projektů a dalších aktivit v rámci spolupráce s praxí u profesně zaměřeného bakalářského a magisterského studijního programu Pracoviště praxe Název či popis projektu uskutečňovaného ve spolupráci s praxí Období Odborné aktivity vztahující se k tvůrčí, resp. vědecké a umělecké činnosti vysoké školy, která souvisí se studijním programem LRR pořádá pravidelně národní i mezinárodní konference a semináře: Mezinárodní kongres Natural Anticancer Drugs ( 30. červen 4. červenec 2012, zabývající se přírodními látkami s protinádorovou aktivitou. Kongresu se zúčastnilo 300 vědců, přičemž 2/3 byly ze zahraničí. Young scientists meeting, Trends in Natural Products Research, 2014, June, Olomouc Chemistry and Biology of Phytohormones and Related Substances, 2017, May, Kouty nad desnou Chemistry and Biology of Phytohormones and Related Substances, 2018, May, Luhačovice Kolektivní členství členů týmu v nevládních mezinárodních organizacích výzkumu a vývoje FESPB (Federation of European Societies of Plant Biology) PSE (Phytochemical Society of Europe) prof. Strnad je současným presidentem PSE IAP (International Academy of Pathology) ACS (The American Chemical Society) Informace o spolupráci s praxí vztahující se ke studijnímu programu LRR má značné množství mezinárodních patentů (rustreg.upol.cz) a spolupracuje s nepřeberným množstvím firem v oblasti výzkumu a vývoje. Byla licencována řada produktů zejména z oblasti protinádorových léčiv na bázi inhibitorů CDK (Cyclacel Ltd., C3Bio GmbH). Deriváty s antisenescenční aktivitou byly licencovány firmě Pyratine Plc. Technologie na přípravu protilátek, imunodiagnostik a imunokitů byly licencovány firmě Olchemim, spol.s.r.o. a AgroSlužby, spol.s.r.o. Řada našich produktů se nachází v katalozích největších chemických firem, viz např. olomoucin, bohemin, roskovitin, iso-olomoucin, isopropyl-olomoucin, olomoucin II, meta-, ortho-, a para-, a methoxy- topoliny, atd. (web: Sigma-Aldrich, Merck, Fluka, Alexis, Olchemim, a další).

65 C-III Informační zabezpečení studijního programu Název a stručný popis studijního informačního systému Název: IS/STAG ( Informační systém studijní agendy IS/STAG je součástí univerzitního informačního systému Univerzity Palackého v Olomouci. Jedná se komplexní systém pokrývající administraci studia od podání přihlášky až po vydání diplomu a vazby na další související informační systémy. Přístup ke studijní literatuře Studijní literatura je dostupná v univerzitní knihovně v budově Zbrojnice a v knihovně přírodovědecké fakulty. Fakultní knihovna sídlí ve dvou objektech: v budově na ulici 17. listopadu 12 je umístěn fond oborů chemie, geologie, geografie, geoinformatiky, rozvojových studií, fyziky, optiky, matematiky a informatiky; pobočka na ul. Šlechtitelů 27 pokrývá především oblast botaniky, biochemie, buněčné biologie a ekologie. Studenti mají také k dispozici elektronické informační zdroje ( Přehled zpřístupněných databází Přístup do elektronických časopisů a knih: Název a stručný popis používaného antiplagiátorského systému Název: Theses.cz ( Systém Theses.cz je vyvíjen a provozován Masarykovou univerzitou. Slouží vysokým školám jako národní registr závěrečných prací a umožňuje mezi uloženými pracemi vyhledávat plagiáty. Veřejnosti jsou zpřístupňovány záznamy o závěrečných pracích, příp. plné texty (podle rozhodnutí školy).

66 C-IV Materiální zabezpečení studijního programu Místo uskutečňování studijního 17. listopadu 12, Olomouc programu Šlechtitelů 27, Olomouc - Holice Kapacita výukových místností pro teoretickou výuku 17. listopadu 12, Olomouc LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta LP Přírodovědecká fakulta Šlechtitelů 27, Olomouc - Holice SE E1 42 Biologické centrum SE E2 24 Biologické centrum SE PC 20 Katedra botaniky SE Katedra botaniky SE Katedra botaniky SE Přírodovědecká fakulta Z toho kapacita v prostorách v nájmu Doba platnosti nájmu

67 Kapacita a popis odborné učebny Šlechtitelů 27, Olomouc - Holice SE LAB1 12 Laboratoř růstových regulátorů SE LAB3 12 Laboratoř růstových regulátorů Odborné učebny Laboratoře růstových regulátorů jsou vybaveny většinou novými přístroji a zařízeními. Mezi základní laboratorní vybavení patří rotační odparky, termostaty, minicentrifugy, vortexy, elektromagnetické míchačky a třepačky, několik zařízení pro elektroforézu (BioRad), spektrofotometr pro UV/VIS (Shimadzu), inverzní mikroskopy, vertikální flow-boxy. Studenti doktorského studia Experimentální biologie pro svou práci využívají kompletní laboratorní vybavení Laboratoře růstových regulátorů PřF UP & ÚEB AVČR, k dispozici jsou chlazené preparativní centrifugy; čtyři vysokoúčinné kapalinové chromatografy (BioRad, Spectra Physics, Beckman a Waters);. Používána je řada zařízení na horizontální i vertikální 1D elektroforézu, systém pro snímání gelů a blotovacích membrán pomocí digitální kamery Kodak s PC software na vyhodnocování (1D a 2D), spektrofotometry pro UV/VIS (Shimadzu), dále Bioimager pro měření radioaktivity el. gelech (Fuji). Pro analýzu nově syntetizovaných látek i identifikaci nových přírodních látek je Laboratoř vybavena NMR (300 a 500 MHz), CHON analyzátorem (Finnigan), IČ spektrometer (Perkin Elmer), rentgenem pro analýzu krystalů (Oxford Diffraction). Má rovněž velmi dokonalé vybavení a technologie pro analýzu femto a atomolárních koncentrací přirozeně se vyskytujících látek pomocí HPLC/MS/MS a UHPLC/MS/MS sytémů (EI-HPLC/MS, Waters) a v poslední době rozvíjí intenzivně proteomické analýzy (CapLC-Q-Tof, Waters/Micromas). Pro histochemické, imunohistochemické a buněčné experimenty jsou k dispozici špičkové světelné mikroskopy Olympus. Má kompletní vybavení pro kultivaci hybridomů a nádorových buněčných linií (horizontální flow-boxy, CO inkubátory, inverzní mikroskopy, 2 fluorscenční reader pro hodnocení cytotoxicit (Fluorescent Ascent, Flow Laboratories) a hlubokomrazící boxy. K zařízení Laboratoře patří i skleníky a fytotron pro pěstování rostlin za kontrolovaných světelných a tepelných podmínek. Dále se LRR stará a provozuje zvířetník PřF UP. Z toho kapacita v prostorách Doba platnosti nájmu v nájmu Vyjádření orgánu hygienické služby ze dne Opatření a podmínky k zajištění rovného přístupu Rovný přístup je deklarován v Řádu přijímacího řízení Univerzity Palackého v Olomouci, ve Studijním a zkušebním řádu Univerzity Palackého v Olomouci a v Etickém kodexu akademických pracovníků a vědeckých pracovníků Univerzity Palackého v Olomouci. Specializovaným pracovištěm na UP zabývajícím se podporou studentů se specifickými vzdělávacími potřebami či studentů pocházejících ze sociálně či etnicky znevýhodněného prostředí je Centrum podpory studentů se specifickými potřebami. Jedná se o celouniverzitní zařízení poskytující komplexní odborný poradenský, technický a terapeutický servis studentům se specifickými potřebami ze všech fakult Univerzity Palackého. C-V Finanční zabezpečení studijního programu Vzdělávací činnost vysoké školy financovaná ze ano státního rozpočtu Zhodnocení předpokládaných nákladů a zdrojů na uskutečňování studijního programu

68 D-I Záměr rozvoje a další údaje ke studijnímu programu Záměr rozvoje studijního programu a jeho odůvodnění Záměr rozvoje doktorského studijního programu Experimentální Biologie vychází z dlouhodobého záměru University Palackého (UP) a studijní program je úzce vázán na vědeckou činnost Laboratoře růstových regulátorů a spolupracujících ústavů lékařské fakulty UP (Ústav lékařské biofyziky, Ústav lékařské biologie, Ústav lékařské chemie a biochemie, Ústav patologie, Ústav molekulární a translační medicíny, Ústav farmakologie) Ústavu experimentální botaniky AV ČR a Centra regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum. Počet přijímaných uchazečů ke studiu ve studijním programu 2-5 ročně 2018/ přijatí studenti/3 zapsaní 2017/ přijatí studenti/4 zapsaní 2016/ přijatých studentů/9 zapsaných 2015/ přijatých studentů/13 zapsaných Předpokládaná uplatnitelnost absolventů na trhu práce Absolvent se uplatní ve vedoucích funkcích ve zdravotnických zařízeních, v diagnostických a výzkumných laboratořích v ČR i v zahraničí, v zemědělství, v potravinářství, v biotechnologických firmách, ale i při vědeckovýzkumné činnosti na univerzitách a v ústavech základního a aplikovaného výzkumu.

69 Příloha E - Formulář Sebehodnotící zprávy v rámci žádosti o schválení studijního programu Studijní program: Experimentální biologie 1 Silné stránky studijního programu Doktorské studium Experimentální biologie je určeno absolventům magisterského studia Experimentální biologie a příbuzných chemických a biologických oborů. Cílem doktorského studia je příprava vysoce kvalifikovaných vědeckých pracovníků pro obor Experimentální biologie, čímž naplňuje obsah profilu absolventa s rámcovým profilem absolventa uvedeným v popisu uvedené oblasti vzdělávání dle nařízení vlády č. 275/2016 Sb. Hlavním těžištěm studia je práce na experimentech pod vedením zkušených a kvalifikovaných vysokoškolských učitelů Laboratoře růstových regulátorů. Studenti budou zapojeni rovněž do řešení projektů, které řeší pracovníci LRR v oblasti experimentální biologie, fyziologie rostlin, medicínské chemie, farmakologie, toxikologie, biochemie, molekulární a buněčné biologie a genetiky a naučí se používat nejnovější metody experimentální biologie, molekulární a buněčné biologie, biochemie a genetiky. Absolventi se uplatní v další akademické kariéře na vysokých školách, jako pracovníci státních i soukromých výzkumných laboratoří v ČR a v zahraničí. Mohou úspěšně plnit úkoly v laboratořích se zaměřením na humánní a veterinární medicínu, farmacii, zemědělství, biotechnologii a oborech ochrany životního prostředí. Budou mít předpoklady stát se vedoucími a organizačními pracovníky výzkumných týmů. Doktorské studium Experimentální biologie naplňuje svým obsahem studijních předmětů s tematickým zaměřením uvedeným v popise oblasti vzdělávání, do níž studijní program náleží, tedy biologie. Během celého studia budou totiž studenti formou přednášek a konzultací seznamováni s nejnovějšími poznatky v oborech experimentální biologie, molekulární a buněčné biologie, genetiky, mikrobiologie, rostlinné fyziologie, farmakologie, obecné biologie, biochemie, organické a analytické chemie. Studenti se během studia zdokonalí i v anglickém jazyce tak, aby mohli běžně komunikovat, sepisovat publikace a přednášet na mezinárodních konferencích. Doktorandi získají tedy rozšířené a hluboké teoretické znalosti a praktické dovednosti ve všech oborech Experimentální biologie. U doktorského studia Experimentální biologie je v souladu obsah studia s cíli studia a profilem absolventa. 2 Slabé stránky studijního programu Doktorské studium Experimentální biologie nemá slabé stránky v žádné z uvedených oblastí. Důvodem je vědecká úroveň garantujícího pracoviště, tedy Laboratoře růstových regulátorů (LRR, LRR je interdisciplinárním a světově uznávaným pracovištěm nového typu. Jedním ze světově uznávaných příspěvků LRR v této oblasti je rozšíření řady cytokininů zejména o tzv. aromatické cytokininy topoliny a z nich odvozené deriváty na bázi olomoucinu a využití regulačních účinků těchto derivátů při léčení nádorů. První z řady protinádorových látek odvozených z cytokininů byl olomoucin, pak následoval vývoj dalších, ještě účinnějších inhibitorů cyklin-dependentních kinas, klíčových enzymů buněčného cyklu - bohemin, roskovitin, olomoucin II, atd. Roskovitin byl licencován firmě Cyclacel Pharmaceuticals Ltd. a pod komerčním názvem Seliciclib ( končí druhou fázi klinického zkoušení pro léčení nádorů, a to v Evropě a v USA. Vývoj látek proti rakovině však není jediným polem, na němž se v LRR pracuje. Úspěchy má i v oblasti zemědělství. Podařilo se například přijít na to, jak v rostlinách zvýšit množství cytokininů pomocí regulátorů hladiny cytokininů s názvem INCIDE, což podporuje růst. Díky tomu se dají zvýšit výnosy řady zemědělských plodin a odolnost rostlin vůči stresu. Nedávno se podařilo vyvinout i látku, která omlazuje pleť a pomáhá při léčbě kožních chorob. I v tomto případě při vývoji pomohly cytokininy, které oddalují stárnutí také u živočišných buněk. Na tyto objevy byly podány dva mezinárodní patenty, které byly v licenci poskytnuty americké firmě Pyratine Plc z Kaliforniie, jež hradí náklady na patentovou ochranu. Produkt s léčivou látkou odvozenou do cytokininů Pyratine ( byl uveden na trh v USA. Během posledních pár let se LRR stala publikačně nejaktivnějším pracovištěm jak ÚEB AVČR, tak i UP. Pracoviště publikuje zejména v prestižních zahraničních časopisech a ročně podává i řadu přihlášek mezinárodních patentů. Účelem pracoviště je integrovat kapacity pro společné řešení vědecko-výzkumných projektů v oblasti molekulárních a fyziologických mechanismů účinků růstových regulátorů u živých organismů. Pracoviště se zabývá vědeckovýzkumnou a pedagogickou činností v oboru experimentální biologie, zejména pak přípravou nových, vysoce biologicky účinných růstových regulátorů na bázi purinu, vývojem metod jejich analýzy, studiem jejich funkcí a účinků v růstových a vývojových procesech normální a nádorové buňky, včetně vývoje

70 protinádorových látek odvozených od rostlinných hormonů. Dále je součástí odborného programu i studium onkogenů a nádorových supresorových genů, mechanismů regulace jejich exprese, včetně vývoje transgenních organismů kontrolovaně exprimujících geny zapojené v růstově-regulačních a obranných funkcích. LRR rovněž spolupracuje na výše uvedené problematice s desítkami pracovišť u nás i v zahraničí. Příprava studentů doktorského studijního programu Experimentální biologie pro uplatnění v biotechnologických, biomedicinských a bioanalytických oborech je rovněž v souladu s projektem budování průmyslového a technologického parku regionu Olomoucka a Univerzity Palackého, situovaném v areálu PřF UP v Olomouci-Holici na ul. Šlechtitelů. Studenti budou cíleně připravováni na řešení praktických problémů v technologickém parku, případně dalších firmách a ústavech odpovídajícího zaměření a budou mít možnost využít přístrojové vybavení biotechnologické a biomedicínské části parku pro svoje disertační práce. 3 Personální zabezpečení studijního programu Doktorské studium Experimentální biologie je kvalitně personálně zabezpečeno a to včetně zajištění garance studijního programu a klíčových studijních předmětů. Garant studijního programu prof. Strnad publikuje ve vysoce kvalitních zahraničních periodikách ( - vysoký citační index publikovaných prací, u kterých je autorem či spoluautorem (> citací, Hirsch index: 50). Od poloviny 90. let, kdy začal působit na AVČR a posléze i na Univerzitě Palackého v Olomouci, se M. Strnad vedle experimentálního vývoje nových látek s protinádorovými účinky věnuje rovněž rozvoji vědních oblastí, které s danou problematikou úzce souvisí. Jeho počátky vycházejí z rostlinných růstových regulátorů, a to zejména purinových derivátů cytokininů. Podařilo se mu izolovat a charakterizovat řadu nových biologicky aktivních látek z této skupiny fytohormonů, které byly pojmenovány česky topoliny a celá skupina pak aromatické cytokininy. Mezi těmito a dalšími deriváty cytokininů byly nalezen olomoucin, první purinový inhibitor CDK. Týmu jím vedenému se podařilo v krátké době připravit řadu dalších derivátů, např. olomoucin II, bohemin, isopropyl-olomoucin, a samozřejmě roskovitin (dnes znám pod obchodním názvem Seliciclib ). Tento trisubstituovaný deriváty purinu byl licencován firmou Cyclacel Pharmaceuticals (Velká Británie) a dnes končí úspěšně bez významných vedlejších účinků II.b fázi klinického zkoušení pro léčení nádorů. Nové generace antisenescentních látek na bázi cytokininů byly licencovány firmě Pyratine LLC ( Napa, CA, USA) a první z derivátů těchto látek byl pod názvem Pyratine-6 uveden nedávno na trh v USA. Dále je studijní program personálně zajištěn zejména docenty a profesory souvisejících oborů Vzhledem k interdisciplinaritě oboru jsou v komisi rovněž pracovníci LFUP, ale například i Masarykova onkologického ústavu (Dr. Vojtěšek). Program je zajištěn na velmi vysoké kvalitativní úrovni. 4 Výhled personálního zabezpečení studijního programu Doktorské studium Experimentální biologie je velmi kvalitně personálně zabezpečeno, a proto nepředpokládáme jeho další vylepšování. V rámci studia pouze plánujeme vést obhajoby disertačních prací v anglickém jazyce. Jeden z oponentů bude ve většině případů disertací vybrán z kvalitních vědců z mezinárodně uznávaných univerzit. Pokusíme se tak dále zvýšit prestiž tohoto studijního programu. Uvažujeme i o zapojení špičkových zahraničních vědců do komise. 5 Výhled vzdělávací a tvůrčí činnosti ve studijním programu Studijní obor Experimentální biologie se bude v budoucnu směrovat na novou, interdisciplinární a velmi rychle se rozvíjející vědní oblast biologie zaměřenou na studium procesů probíhajících na submikroskopické i mikroskopické úrovni. Studenti získají potřebné informace o biologických, biochemických i biofyzikálních procesech na molekulární i buněčné úrovni, o jejich vzájemné provázanosti, propojení se strukturovaností biologických objektů a o jejich funkčním významu v rámci mnohobuněčného organismu, zejména pak člověka, ale třeba i rostlin. Studium bude stále více zaměřeno na recentní poznatky experimentální biologie a biomedicíny a jejich aplikace, na nové postupy v oblasti klonování DNA, genových technologiích, na genetické manipulace na molekulární úrovni u rostlin i živočichů, na submikroskopické metody studia, imunochemické a imunobiologické postupy zviditelňující buněčné struktury, na genomiku, proteomiku, hormonomiku a metabolomiku, ale i na medicínské aspekty biologie. Velká pozornost bude věnována zejména biomedicíně a medicinální chemii v rámci studia fyziologických a molekulárně-biologických principů lidských onemocnění. Hlavní důraz bude položen na poznání principů a mechanizmů onemocnění (patofyziologie) a s tím souvisejícím vývojem léčiv (farmakologie) směrovaných na molekulární cíle v patologické buňce.

71 V Olomouci dne Prohlášení V případě udělení oprávnění uskutečňovat doktorský studijní program Experimentální biologie bude studijní program garantován a studijní předměty garantovány a vyučovány na odpovídající odborné úrovni po celou dobu platnosti akreditace. Pokud dojde k případnému odchodu některých pracovníků, budou nahrazeni pracovníky s kvalifikací odpovídající daným požadavkům. doc. RNDr. Martin Kubala, Ph.D. děkan Přírodovědecké fakulty Univerzity Palackého v Olomouci

Zobrazit více