Žádost o akreditaci habilitačního řízení a řízení ke jmenování profesorem. oboru. Botanika

Transkript

1 Žádost o akreditaci habilitačního řízení a řízení ke jmenování profesorem oboru Botanika 2019

2 A-I Základní údaje o žádosti o akreditaci Název vysoké školy: Univerzita Palackého v Olomouci Název součásti vysoké školy: Přírodovědecká fakulta Obor řízení: Botanika Typ řízení: habilitační řízení a řízení ke jmenování profesorem Schvalující orgán: Vědecká rada Univerzity Palackého v Olomouci Datum schválení žádosti: Vědecká rada PřF UP schválení návrhu žádosti o akreditaci habilitačního řízení a řízení ke jmenování profesorem v daném oboru: Vědecká rada UP schválení návrhu žádosti o akreditaci habilitačního řízení a řízení ke jmenování profesorem v daném oboru: Odkaz na elektronickou podobu žádosti: Odkaz na relevantní vnitřní předpisy: Odkaz na údaje o zahájených a uskutečněných řízeních: verze

3 B-I Charakteristika oboru řízení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Název oboru řízení Typ oboru řízení Přírodovědecká fakulta Botanika habilitační řízení a řízení ke jmenování profesorem Charakteristika a vymezení oboru řízení Obor řízení Botanika spadá do oblasti vzdělávání Biologie, ekologie a životní prostředí. Jeho zaměření odpovídá pojetí výuky botanických a biologických programů na PřF UP garantovaných katedrou botaniky PřF UP či kateder příbuzných oborů. S výukou botanických disciplín se začíná již na bakalářském stupni v programech Biologie pro vzdělávání (garance katedry botaniky PřF UP) a Biologie a ekologie (garance katedry zoologie PřF UP). Výuka dále probíhá v navazujícím studiu v programu Učitelství biologie pro střední školy (garance katedry botaniky PřF UP) a odborných programech Botanika a nově i Fytopatologie (garance katedry botaniky PřF UP). V rámci realizace těchto studijních programů studenti řeší témata bakalářských a diplomových prací, které nejenže vychází z pojetí botaniky na garantujícím pracovišti, ale odráží i vědecké a výzkumné činnosti týmů katedry botaniky. Studenti se tak mohou díky řešení těchto prací více profilovat a specializovat ve vědeckých disciplínách jako morfologie a anatomie rostlin, systematická botanika, ekologie rostlin, věda o vegetaci, biotechnologie a genetika rostlin, algologie, mykologie a fytopatologie. V neposlední řadě mohou studenti v rámci učitelského studia biologie řešit i práce zaměřené na didaktiku biologie s akcentem na botanická témata. Obor řízení Botanika primárně vychází z doktorského studijního programu (dále jen DSP) Botanika, který je na PřF UP realizován pod garancí katedry botaniky již od akademického roku 1992/1993. Cílem studia DSP Botanika je výchova a vědecká příprava absolventů přírodovědně, biologicky a zemědělsky orientovaných fakult vysokých škol k samostatné vědecké tvůrčí práci ve vědních oborech interdisciplinárně pokrývajících vědy o rostlinách. V současném pojetí DSP je botanika chápána sensu lato jako nauka o rostlinách (Plant Sciences), tzn. studium, resp. výzkum rostlin na všech úrovních biologické hierarchie. Na tomto myšlenkovém základě se DSP Botanika rozvíjí spolu se snahou o maximální propojení a integraci dílčích botanických disciplín, a to jak z hlediska orientace studentů v moderních botanických tématech, tak i metodického. DSP Botanika tak podobně, jako programy navazující, pokrývá oblasti jako jsou - systematika a ekologie rostlin, věda o vegetaci, algologie, mykologie, fytopatologie, populační biologie rostlin, biotechnologie a genetika rostlin. Tyto zmíněné oblasti jsou klíčové i pro obor řízení Botanika, jimiž se vymezuje. V letech bylo v rámci DSP Botanika na PřF UP úspěšně obhájeno několik desítek (celkem 43) disertačních prací. Nejen garantovaná výuka ve všech stupních VŠ vzdělávání vytyčuje zaměření oboru řízení. Důležitou roli zde sehrává i vědecká a výzkumná činnost garantujícího pracoviště výuky - katedry botaniky PřF UP. Na katedře působí několik vědeckých týmů, které svojí činností plně rozvíjí aktivity a poznání ve zmíněných botanických disciplínách a dosahují mezinárodně významných vědeckých úspěchů. Jejich výzkum doplňuje bohaté spektrum biologického výzkumu na PřF UP a synergicky přispívá k rozvoji fakulty. V současnosti je obor řízení silně vymezen vůči oborům příbuzným právě díky akcentu na botanický základ celého pojetí oboru, který vychází nejen z garantované výuky, ale i z vědeckého zaměření katedry botaniky. V rámci takto pojatého oboru Botaniky proběhlo od roku 2010 na PřF UP a UP 5 habilitačních řízení a 2 řízení jmenování profesorem. 2

4 C-I Požadavky na uchazeče o habilitační řízení/řízení ke jmenování profesorem Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Název oboru řízení Schvalující orgán Přírodovědecká fakulta Botanika Akademický senát Univerzity Palackého v Olomouci Schváleno dne Účinnost od Požadavky kladené na uchazeče habilitačního řízení Řád habilitačního řízení a řízení ke jmenování profesorem na UP v Olomouci: Kritéria, požadavky a náležitosti pro habilitační řízení a řízení ke jmenování profesorem na UP v Olomouci: Požadavky kladené na uchazeče řízení ke jmenování profesorem Řád habilitačního řízení a řízení ke jmenování profesorem na UP v Olomouci: Kritéria, požadavky a náležitosti pro habilitační řízení a řízení ke jmenování profesorem na UP v Olomouci: 3

5 D-I Související vědecká nebo umělecká činnost Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Botanika Přehled řešených grantů a projektů souvisejících s oborem řízení Řešitel/spoluřešitel Doc. Ing. P. Smýkal, Ph.D. /řešitel/ Doc. Ing. P. Smýkal, Ph.D. /řešitel/ Doc. Ing. P. Smýkal, Ph.D. /řešitel/ RNDr. B. Navrátilová, Ph.D. /spoluřešitel/ Mgr. Petr Dvořák, Ph.D.. /řešitel/, Názvy grantů a projektů získaných pro vědeckou nebo Zdroj uměleckou činnost související s oborem řízení nr S, Využití přístupů ekologické genomiky k poznání B, adaptivního významu dormance semen u bobovitých rostlin. GAČR LEGATO (LEGumes for the Agriculture of Tomorrow) A, FP7 nr s, Dormance semen a pukavost lusků jako klíčové B, domestikační znaky luskovin. QJ Nové technologie získávání biologicky aktivních látek z léčivých a aromatických rostlin jako zdrojů účinných látek botanických pesticidů a potravinových doplňků S, O původu mikroskopických druhů výzkum speciačních mechanismů u eukaryotických mikroorganismů GAČR C, NAZV B, GAČR Období Přehled o nejvýznamnější publikační a další vědecké nebo umělecké činnosti s mezinárodním rozsahem Lebeda A., Křístková E., Kitner M., Mieslerová B., Jemelková M., Pink D.A.C., Wild Lactuca species, their genetic diversity, resistance to diseases and pests, and exploitation in lettuce breeding. European Journal of Plant Pathology, 138: Drábková Trojanová, Z., Sedlářová, M., Pospíchalová, R., Lebeda, A., Pathogenic variability of Plasmopara halstedii infecting sunflower in the Czech Republic. Plant Pathology, 67: Dvořák P., Casamatta D.A., Hašler,P., Poulíčková,A. (2015): Putative extremely long evolutionary stasis in bacteria might be explained by serial convergence. PNAS 112(20) E2559. Smýkal P., Coyne C. and 14 co-authors (2015) Legume crops phylogeny and genetic diversity for science and breeding. Critic. Rev. Plant Sci. 34: Smýkal P., Hradilová I., O. Trněný, J. Brus, A. Rathore, M. Bariotakis, R.R. Das, D. Bhattacharyya, C. Richards, C.J. Coyne, S. Pirintsos (2017) Genomic diversity and macroecology of the crop wild relatives of domesticated pea. Scientific Reports 7: Hradilová I, Trněný O, Válková M, Cechová M, Janská A, Prokešová L, Aamir K, Krezdorn N, Rotter B, Winter P, Varshney RK, Soukup A, Bednárř P, Hanáček P and Smýkal P (2017) A combined comparative transcriptomic, metabolomic, and anatomical analyses of two key domestication traits: Pod dehiscence and seed dormancy in pea (Pisum sp.). Front. Plant Sci. 8:542. Smýkal P., Chaloupská M., Bariotakis M., Marečková L., Sinjushin A., Gabrielyan I., Akopian J., Toker C., Kenicer G., Kitner M., Pirintsos S. (2017) Spacial patterns and intraspecific diversity of the glacial relict legume species Vavilovia formosa (Stev.) Fed. in Eurasia. Plant Systematics and Evolution 303: Davidovich, N.A., Davidovich,O.I., Podunay, Y.A., Gastineau R., Kaczmarska I., Poulíčková,A., Witkowski,A.(2017): Ardissonea crystallina has a type of sexual reproduction that is unusual for centric diatoms. 4

6 Scientific reports 7: Duchoslav M., Fialová M., Jandová M. (2017) The ecological performance of tetra-, penta- and hexaploid geophyte Allium oleraceum in reciprocal transplant experiment may explain the occurrence of multiple-cytotype populations. J Plant Ecol 10(3): Tichá, T., Sedlářová, M., Činčalová, L., Trojanová, Z.D., Mieslerová, B., Lebeda, A., Luhová, L., Petřivalský, M. (2018) Involvement of S-nitrosothiols modulation by S-nitrosoglutathione reductase in defence responses of lettuce and wild Lactuca spp. to biotrophic mildews. Planta 247: Informace o dalším zapojení vysoké školy do mezinárodní spolupráce související s oborem řízení Mezinárodní konference: 1. Wild Plant Pathosystems, 1st International Conference, , Palackého Univerzita v Olomouci, Olomouc, Česká republika (hlavní organizátor prof. A. Lebeda) 2. EUCARPIA Conference on Leafy Vegetables Genetics and Breeding, , Palacký University in Olomouc, Olomouc, Czech Republic (hlavní organizátor prof. A. Lebeda, v přípravě) Výsledky realizace mezinárodních odborných projektů: 1. Sjednocení testovacích protokolů odrůd vybraných zelenin na rezistenci k vybraným chorobám pro potřeby kontrolních úřadů a šlechtitelů na evropské úrovni; grant: Harmonization of resistance test to diseases for DUS testing - 2 (Harmores 2) ( ). Výsledky bilaterálních spoluprací (publikace) s Department of Biology, University of North Florida, Jacksonville, USA a Laboratory of Animal Physiology and Evolution, Stazione Zoologica Anton Dohrn, Napoli, Italy: 1. Dvořák, P., Poulíčková,A., Hašler, P., Mattia Belli, Casamatta D.A., Papini A. (2015) Species concepts and speciation factors in cyanobacteria, with connection to the problems of diversity and classification. Biodiversity and Conservation 24: Dvořák,P., Casamatta D., Poulíčková,A., Hašler,P., Ondřej, V., Sanges R. (2014): Synechococcus: 3 billion years of global dominance. Molecular Ecology 23: Výsledky bilaterálních spoluprací (publikace) v oblasti fytopatologie a genových zdrojů rostlin s pracovišti v Německu, Nizozemí, Itálii, Velké Británii, Izraeli, USA, Jihoafrické republice, Kazahstánu: Lebeda, A., Mieslerova, B., Jankovics, T., Kiss, L., van der Linde, E.J.: First detection of tomato powdery mildew caused by Oidium neolycopersici in South Africa. South African Journal of Botany 99, 2015, Jemelková, M., Kitner, M., Křístková, E., Beharav, A., Lebeda, A.: Biodiversity of Lactuca aculeata germplasm assessed by SSR and AFLP markers, and resistance variation to Bremia lactucae. Biochemical Systematics and Ecology 61, 2015, Cohen, Y., Van den Langenberg, K.M., Wehner, T.C., Ojiambo, P., Hausbeck, M., Quesada, L., Lebeda, A., Sierotzki, H., Gisi, U.: Resurgence of Pseudoperonospora cubensis: The causal agent of cucurbit downy mildew. Phytopathology 105, 2015, Parra, L., Maisonneuve, B., Lebeda, A., Schut, J., Christopoulou, M., Jeuken, M., McHale, L., Truco. M-J., Crute, I., Michelmore, R.: Rationalization of genes for resistance to Bremia lactucae in lettuce. Euphytica 210, 2016, Pirondi, A., Kitner, M., Iotti, M., Sedláková, B., Lebeda, A., Collina, M.: Genetic structure and phylogeny of Italian and Czech populations of the cucurbit powdery mildew fungus Golovinomyces orontii inferred by multilocus sequence typing. Plant Pathology 65, 2016, Lebeda, A., Křístková, E., Roháčková, J., Sedláková, B., Widrlechner, M.P., Paris, H.S.: Race-specific resistance of Cucurbita germplasm to Pseudoperonospora cubensis. Euphytica 212, 2016, Trojanová, Z., Sedlářová, M., Gulya, T.J., Lebeda, A.: Methodology of virulence screening and race characterization of Plasmopara halstedii, and resistance evaluation in sunflower a review. Plant Pathology 66, 2017, Lebeda, A., Křístková, E., Sedláková, B., McCreight, J.D., Kosman, E.: Virulence variation of cucurbit powdery 5

7 mildews in the Czech Republic population approach. European Journal of Plant Pathology 152, 2018, Rsaliyev, A.S., Amirkhanova, N.T., Rametov, N.M., Pahratdinova, Zh.U., Ojiambo, P.S., Lebeda, A.: Pseudoperonospora cubensis virulence and pathotype structure in Kazakhstan. Plant Pathology 67, 2018,

8 E-I Související doktorský studijní program Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Botanika Název doktorského studijního programu odpovídajícího oboru řízení Botanika Uskutečňován od 1992/1993 Uskutečňován do P Akademický rok Počet zapsaných studentů Počet úspěšných absolventů Počet neúspěšných studentů 2017/ / / / / / / / Název doktorského studijního programu odpovídajícího oboru řízení Uskutečňován od Uskutečňován do Akademický rok Počet zapsaných studentů Počet úspěšných absolventů Počet neúspěšných studentů 7

9 F-I Přehled akademických pracovníků zajišťujících obor řízení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Botanika Příjmení, jméno Akademické tituly Rok narození Petr Smýkal doc. Ing., Ph.D Barbora Mieslerová doc. RNDr., Ph.D Petr Hašler doc. RNDr., Ph.D Aleš Lebeda prof. Ing., DrSc Aloisie Poulíčková prof. RNDr., CSc F-II Přehled akademických pracovníků s perspektivou habilitace Příjmení, jméno Akademické tituly Rok narození Rok zahájení habilitačního řízení Petr Dvořák Mgr., Ph.D Martin Duchoslav RNDr., Ph.D Miloslav Kitner RNDr., Ph.D Pavel Matušinský Mgr., Ph.D F-III Členové vědecké/umělecké rady vysoké školy Příjmení, jméno, rok narození Akademické tituly Považován za významného odborníka v oboru Ivo Frébort, 1965 Prof. RNDr.., CSc., Ph.D. Biochemie (oblast vzdělávání: Biologie, ekologie a životní prostředí) Eva Zažímalová, 1955 Prof. RNDr., CSc. Anatomie a fyziologie rostlin (oblast vzdělávání: Biologie, ekologie a životní prostředí) Odkaz na úplné složení vědecké/umělecké rady vysoké školy F-IV Členové vědecké/umělecké rady součásti vysoké školy Příjmení, jméno, rok narození Akademické tituly Považován za významného odborníka v oboru Aleš Lebeda, 1951 prof. Ing., DrSc. Botanika (oblast vzdělávání: Biologie, ekologie a životní prostředí) Jaroslav Doležel, 1954 prof. Ing., DrSc. Molekulární biologie a genetika (oblast vzdělávání: Biologie, ekologie a životní prostředí) Odkaz na úplné složení vědecké/umělecké rady součásti vysoké školy 8

10 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Botanika Jméno a příjmení Jaroslav Doležel Tituly prof., ing., DrSc Rok narození 1954 typ vztahu k VŠ pp rozsah 12 do kdy N Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení pp rozsah 12 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ Obor zahradnický, Ing., 1978, Vysoká škola zemědělská, Fakulta agronomická, Brno Genetika, CSc., 1982, Ústav experimentální botaniky ČSAV Genetika, DrSc., 2001, AV ČR Údaje o odborném působení od absolvování VŠ Ústav experimentální botaniky (ÚEB) ČSAV, vědecká aspirantura, ÚEB ČSAV Olomouc, oddělení šlechtitelských biotechnologií, vědecký asistent, ÚEB ČSAV Olomouc, oddělení šlechtitelských biotechnologií, vědecký pracovník, ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie, studijní pobyt, ÚEB Olomouc, oddělení šlechtitelských biotechnologií, samostatný vědecký pracovník, ÚEB AV ČR, Olomouc, vedoucí Laboratoře molekulární cytogenetiky a cytometrie 1994 dosud ÚEB AV ČR Olomouc, vedoucí pracoviště, 1997 dosud PřF UP v Olomouci, odborný asistent, PřF UP v Olomouci, docent, PřF UP v Olomouci, profesor, 2013 dosud Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na Ohlasy publikací VŠ Botanika 2001 Up Olomouc WOS Scopus ostatní Obor řízení k jmenování Rok udělení hodnosti Řízení konáno na profesorem VŠ Molekulární biologie a genetika 2013 MU Brno Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení 1992 dosud: Cytotaxonomie a cytogenetika semestrální přednáška (UP Olomouc) 2005 dosud: Anatomie genomu semestrální přednáška (UP Olomouc) 2005 dosud: Cytometrické techniky semestrální přednáška (UP Olomouc) 2015 dosud: Cytometrie - 1/3 semestrální přednášky (UK Praha) Bakalářské práce: tři obhájené Diplomové práce: šest obhájeno Doktorské disertační práce: 15 obhájeno, dva studují Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení International Wheat Genome Sequencing Consortium (IWGSC): Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome. Science 361(6403): 7191, Thind, A.K., et al.: Rapid cloning of genes in hexaploid wheat using cultivar-specific long-range chromosome assembly. Nature Biotechnology 35: , Mascher, M., et al.: A chromosome conformation capture ordered sequence of the barley genome. Nature 544: , Sánchez-Martín, J., et al.: Rapid gene isolation in barley and wheat by mutant chromosome sequencing. Genome Biology 17: 221, Choulet, F., et al.: Structural and functional partitioning of bread wheat chromosome 3B. Science 345: ,

11 Působení v zahraničí ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie, studijní pobyt, , 12 měsíců National Nuclear Research Institute, Accra, Ghana, expert FAO/IAEA, 1987, 6 týdnů Tree Improvement Research Centre, Kitwe, Zambie, expert FAO/IAEA, 1988, 4 týdny National Nuclear Research Institute, Accra, Ghana, expert FAO/IAEA, 1989, 4 týdny ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie, 1990, 4 měsíce ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie, 1993, 4 měsíce ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie, 1994, 3 měsíce Výuka na specializovaných kurzech v zahraničí, celkem 16 kurzů Podpis datum

12 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Botanika Jméno a příjmení Martin Duchoslav Tituly RNDr. Ph.D. Rok narození 1971 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy 08/22 Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení pp. rozsah 40 do kdy 08/22 Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ 1994: PřF UP Olomouc, speciální biologie a ekologie, specializace Botanika 2000: PřF UP Olomouc, Ph.D. z oboru Botanika Údaje o odborném působení od absolvování VŠ : odborný pracovník, katedra botaniky PřF UP Olomouc : odborný asistent, katedra botaniky PřF UP Olomouc Obor habilitačního řízení Obor řízení k jmenování profesorem Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení BOT/PAVSB Populační ekologie rostlin garant, přednášející, cvičící, BOT/EKRO Ekologie rostlin garant, přednášející, BOT/ESPX Ekologie garant, přednášející, cvičící, BOT/VOV Věda o vegetaci garant, přednášející, BOT/VCR Vegetace ČR garant, přednášející, BOT/ETP Cvičení z ekologie v terénu garant, cvičící, BOT/BSTSB Biostatistika garant, přednášející Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení (posledních 5 let) Hroneš, M., Hrachová Macurová, S., Hradílek, Z., Hekera, P., Duchoslav, M. (2019): Female-biased sex ratio despite the absence of spatial and niche segregation between sexes in alpine populations of dioecious Salix lapponum (Salicaceae). - Alpine Botany ( (20%) Hradilová,I., Duchoslav, M., Brus, J., Pechanec, V., Hýbl, M., Kopecký, P., Smržová, L., Štefelová, N., Václavek, T., Bariotakis, M., Machalová, J., Hron, K., Pirinthos, S., Smýkal, P. (2019): Variation in wild pea (Pisum sativum subsp. elatius) seed dormancy and its relationship to the environment and seed coat traits. - PeerJ 6: e6263. (15%) Popelka, O., Sochor, M., Duchoslav, M. (2019): Reciprocal hybridization between diploid Ficaria calthifolia and tetraploid Ficaria verna subsp. verna: evidence from experimental crossing, genome size and molecular markers. - Bot. J. Linn. Soc. (in press) (40%) Duchoslav, M., Fialová, M., Jandová, M. (2017): The ecological performance of tetra-, penta- and hexaploid geophyte Allium oleraceum in reciprocal transplant experiment may explain the occurrence of multiple-cytotype populations. - Journal of Plant Ecology 10: (50%) Poulíčková, A., Letáková, M., Hašler, P., Cox, E., Duchoslav, M. (2017): Species complexes within epiphytic diatoms and their relevance for the bioindication of trophic status.- Sci. Total. Environ : (30%) Ježilová, E., Hlaváčková-Nožková, V., Duchoslav, M. (2015): Photosynthetic characteristics of three ploidy levels of Allium oleraceum L. (Amaryllidaceae) differing in ecological amplitude. - Plant Spec. Biol. 30: (50%) Duchoslav, M., Staňková, H. (2015): The population genetic structure and clonal diversity of Allium oleraceum (Amaryllidaceae), a polyploid geophyte with common asexual but variable sexual reproduction. - Folia Geobotanica 50: (50%) Fialová, M., Duchoslav, M. (2014): Response to competition of bulbous geophyte Allium oleraceum differing in ploidy levels. - Plant Biology 16: (50%) Duchoslav, M., Šafářová L., Jandová, M. (2013): Role of adaptive and non-adaptive mechanisms forming 11

13 complex patterns of genome size variation in six cytotypes of polyploid Allium oleraceum (Amaryllidaceae) on a continental scale. - Annals of Botany 111: (50%) Působení v zahraničí Podpis datum

14 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Botanika Jméno a příjmení Petr Dvořák Tituly Ph.D., Mgr. Rok narození 1984 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy 06/21 Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení pp. rozsah 40 do kdy 06/21 Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ : Ph.D. studium, Botanika, Univerzita Palackého v Olomouci : Pedagogická kvalifikace pro základní a střední školy, Univerzita Palackého v Olomouci : Magisterské studium, Hydrobiologie, Univerzita Palackého v Olomouci : Bakalářké studium, Biologie a geografie, Univerzita Palackého v Olomouci Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2015 dosud: vědecký pracovník, Katedra botaniky, Univerzita Palackého v Olomouci postdoktor, Department of Organismal Biology, Systematic Biology, Uppsala University (Hanna Johannesson lab) : postdoktor - vědecký pracovník, Katedra botaniky, Univerzita Palackého v Olomouci Obor habilitačního řízení Obor řízení k jmenování profesorem Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 279 Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení Cvičení: Cvičení z fylogeneze a systému nižších rostlin, Biologická klasifikace rostlin, Algologie speciální, Ekologie řas Přednášky: Ekologie řas, Molekulární ekologie Absolventské práce ukončené: - 1 bakalářská, 3 diplomové Absolventské práce běžící: 3 bakalářské, 1 disertační Spolupráce na učebním textu Poulíčková, Dvořák, Hašler: Průvodce mikrosvětem řas. Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Články indexované v Web of Science Dvořák, P., Jahodářová, E., Casamatta, D.A., Hašler, P., Poulíčková, A. (2018): Difference without distinction? Gaps in cyanobacterial systematics; when more is just to much. Fottea 18: (Corresponding author) Jahodářová, E., Dvořák, P., Hašler, P., Holušová, K., Poulíčková, A. (2018): Elainella gen. nov.: a new tropical cyanobacterium characterized using a complex genomic approach. European Journal of Phycology 53: (Corresponding author) 13

15 Jahodářová, E., Dvořák, P., Hašler, P., Poulíčková, A. (2017): Revealing the hidden tropical diversity among cyanobacteria using polyphasic approach, new genus Onodrimia (Synechococcales, Cyanobacteria). Phytotaxa 326: (Corresponding author) Dvořák, P., Hašler, P., Pitelková, P., Tabáková, P., Casamatta, D.A., Poulíčková, A. (2017): A new cyanobacterium from the Everglades, Florida Chamaethrix gen. nov. Fottea 17: (Corresponding author) Dvořák, P., Casamatta, D.A., Hašler, P., Poulíčková, A. (2015): Putative extremely long evolutionary stasis in bacteria might be explained by serial convergence. Proceedings of the National Academy of Sciences, 112:E2559. (Corresponding author) Dvořák, P., Poulíčková, A., Hašler, P., Belli, M., Casamatta, D.A., Papini, A. (2015): Species concepts and speciation factors in cyanobacteria, with connection to the problems of diversity and classification. Biodiversity and Conservation, 24: Dvořák, P., Casamatta, D.A., Poulíčková, A., Hašler, P., Ondřej, V., Sanges, R. (2014): Synechococcus: 3 billion years of global dominance. Molecular Ecology, 23: (Corresponding author) Poulíčková, A., Dvořák, P., Mazalová, P., Hašler, P., (2014): Epipelic microphototrophs: an overlooked assemblage in lake ecosystems. Freshwater science, 33(2): Dvořák, P., Hindák, F., Hašler, P., Hindáková, A., Poulíčková, A. (2014): Morphological and molecular studies of Neosynechococcus sphagnicola, gen. et sp. nov. (Cyanobacteria, Synechococcales). Phytotaxa, 170(1): (Corresponding author) Hašler, P., Dvořák, P., Poulíčková, A. (2014): A new genus of filamentous epipelic cyanobacteria, Johansenia. Preslia, 86(1): Ondřej, V., Dvořák, P. (2012): Bioinformatics: A history of evolution in silico. Journal of biological education, 46(4): Hašler, P., Dvořák, P., Johansen, J.R., Kitner, M., Ondřej, V., Poulíčková, A. (2012): Morphological and molecular study of epipelic filamentous genera Phormidium, Microcoleus and Geitlerinema (Oscillatoriales, Cyanophyta/Cyanobacteria). Fottea, 12(2): Dvořák, P., Hašler, P., Poulíčková, A. (2012): Phylogeography of the Microcoleus vaginatus (Cyanobacteria) from Three Continents A Spatial and Temporal Characterization. PLoS ONE, 7(6):e (Corresponding author) Kapitoly v knihách Dvořák, P. (2017): Genome-wide Analysis of Cyanobacterial Evolution: The Example of Synechococcus. Cyanobacteria: Omics and Manipulation (edited by Dmitry A. Los), pp Caister Academic Press, United Kingdom. (Corresponding author) Dvořák, P., Casamatta, D.A., Hašler, P., Jahodářová, E., Norwich, A.R., Poulíčková, A. (2017): Diversity of the cyanobacteria. In: Modern Topics in the Phototrophic Prokaryotes, Applied and Environmental Aspects (ed.: Patrick C. Hallenbeck), Springer Nature, Switzerland, pp (Corresponding author) Působení v zahraničí Botanischer Garten und Botanisches Museum Berlin-Dahlem, Germany (duben 2015) University of North Florida, Jacksonville, FL, USA (prosinec 2013 březen 2014) Stazione Zoologica Anthon Dohrn Naples, Italy (červenec 2013) John Carroll University, Cleveland OH, USA (leden duben 2010) Podpis datum

16 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Botanika Jméno a příjmení Ivo Frébort Tituly prof. RNDr. CSc. Ph.D. Rok narození 1965 typ vztahu k VŠ PP PP rozsah do kdy N Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení PP PP rozsah do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ 1988 ukončení studia oboru Analytická chemie na PřF UP Olomouc, 1989 RNDr CSc. v oboru Biochemie MU Brno; 1997 Ph.D. v oboru Bioresources Science United Graduate School of Tottori University, Japonsko Údaje o odborném působení od absolvování VŠ Katedra analytické a organické chemie PřF UP - vědecký pracovník Department of Biological Chemistry, Faculty of Agriculture, Yamaguchi University, Japonsko - vědecký pracovník, Ph.D. student Katedra biochemie PřF UP odborný asistent Katedra biochemie PřF UP docent od 2005 Katedra biochemie PřF UP profesor od 2010 Centrum regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum (PřF UP) - ředitel Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Biochemie 1998 VŠCHT Praha WOS Scopus ostatní Obor řízení k jmenování Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 1842/ 1910 profesorem 1541 Biochemie 2005 UK Praha Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení Předseda oborové rady, školitel a garant doktorského studijního programu Biochemie na PřF UP, člen oborové rady doktorského studijního programu Biochemie na PřF MU Brno, člen Vědecké rady UP a Vědecké rady PřF UP; garance a výuka předmětů Molekulární biologie, Struktura a funkce biomakromolekul, Molekulární genetika, Geneticky modifikované organismy, Genové inženýrství Projekt OP VK (hlavní řešitel): CZ.1.07/2.2.00/ Příprava absolventů přírodovědeckých oborů pro uplatnění v evropských biotechnologických institucích Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Pět nejvýznamnějších publikací za posledních 5 let: Hluska T, Šebela M, Lenobel R, Frébort I, Galuszka P (2017) Purification of maize nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase casts doubt on the existence of zeatin cis-trans isomerase in plants. Front. Plant Sci. 8, 1473; IF Pospíšilová H, Jiskrová E, Vojta P, Mrízová K, Kokáš F, Majeská Čudejková M, Bergougnoux V, Plíhal O, Klimešová J, Novák O, Dzurová L, Frébort I, Galuszka P (2016) Transgenic barley overexpressing a cytokinin dehydrogenase gene shows greater tolerance to drought stress. New Biotechnol 33, ; IF Frébortová J, Greplová M, Seidl MF, Heyl A, Frébort I (2015) Biochemical characterization of putative adenylate dimethylallyltransferase and cytokinin dehydrogenase from cyanobacterium Nostoc sp. PCC

17 PLoS ONE 10, e ; IF Dzurová L, Forneris F, Savino S, Galuszka P, Vrabka J, Frébort I (2015) The three-dimensional structure of Lonely Guy from Claviceps purpurea provides insights into the phosphoribohydrolase function of Rossmann fold-containing lysine decarboxylase-like proteins. Proteins 83; IF Mrízová K, Holásková E, Öz MT, Jiskrová E, Frébort I, Galuszka P (2014) Transgenic barley: Aprospective tool for biotechnology and agriculture. Biotechnol Adv 32, ; IF Nejvýznamnější získané výzkumné granty (hlavní řešitel) za posledních 10 let: IAA Role odbourávání cytokininů při fyziologických reakcích u zemědělsky významných rostlin - 6,792 mil. Kč ED0007/01/01 - Centrum regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum - 832,938 mil. Kč EE Podpora zapojení výzkumného týmu Centra regionu Haná do mezinárodní spolupráce - 31,659 mil. Kč GAP501/12/ Sinice Nostoc jako genetický a funkční model pro metabolismus rostlinných hormonů cytokininů - 11,000 mil. Kč LO Udržitelný rozvoj výzkumu v Centru regionu Haná - 393,155 mil. Kč EF16_019/ Rostliny jako prostředek udržitelného globálního rozvoje - 360,814 mil. Kč Působení v zahraničí : Japonsko, Yamaguchi University (4,5 r) - Ph.D. studium, vědecký pracovník 2001: Německo, University of Tübingen (6 m) - postdok 2003: Německo, Free University of Berlin (3 m) - postdok 2007: Japonsko, Osaka University (2 m) - hostující profesor Další kratší stáže: Lund, Lyngby, Groningen, Řím, Berlín, Columbia (USA), Yamaguchi, Osaka, Okinawa Podpis datum

18 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Botanika Jméno a příjmení Petr Hašler Tituly doc., RNDr., PhD. Rok narození 1975 typ vztahu k VŠ PP rozsah 40 do kdy N Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení PP rozsah 40 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ Mgr., PřF UP v Olomouci PhD., obor botanika, PřF UP v Olomouci odborný asistent, Katedra botaniky PřF UP v Olomouci Doc., obor botanika PřF UP v Olomouci docent, Katedra botaniky PřF UP Údaje o odborném působení od absolvování VŠ Katedra botaniky PřF UP 2004 dosud, specializace: biologie sinic, ekologie sinic a řas Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na Ohlasy publikací VŠ Botanika 2011 UP v Olomouci WOS Scopus ostatní Obor řízení k jmenování Rok udělení hodnosti Řízení konáno na profesorem VŠ Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení Cvičení ze systému nižších rostlin BOT/SNCVU, BOT/SNP Fylogeneze a systém nižších rostlin BOT/SNPR, BOT/SNP Biologická klasifikace rostlin BOT/BIKR Aplikovaná algologie BOT/APA Algologie speciální BOT/ALGSB Ekologie řas BOT/EKRSB Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení ŠebelaI, M.; Jahodářová, E.; Raus, M.; Lenobel, R.; Hašler, P. (2018): Intact cell MALDI-TOF mass spectrometric analysis of Chroococcidiopsis cyanobacteria for classification purposes and identification of possible marker proteins. - Plos One 13: e Hašler, P.; Pentecost, A.; Jahodářová, E.; Dvořák, P.; Pouličková, A. (2018): Taxonomic revision of Ulva montana (Lightfoot 1777) and description of a new genus of Lightfootiella (Cyanophyceae, Chroococcaceae). Phytotaxa 362: Hašler, P.; Casamatta, D.; Dvořák, P.; Poulíčková, A. (2017): Jacksonvillea apiculata (Oscillatoriales, Cyanobacteria) gen. & sp. nov.: a new genus of filamentous, epipsamic cyanobacteria from North Florida. - Phycologia 56: Hašler, P.; Ondřej, V.; Švécarová, M.; Sedlářová, M.; Vaidová, B.; Poulíčková, A. (2017): Tritium influence on morphology, reactive oxygen species production and catalase gene expression in Pseudendoclonium basilense and Stigeoclonium nanum (Chlorophyta). Fottea 17:

19 Hašler, P.; Dvořák, P.; Poulíčková, Aloisie (2014): A new genus of filamentous epipelic cyanobacteria, Johansenia.- Preslia 86: Hašler, P.; Dvořák, P.; Johansen, J. R.; et al.(2012): Morphological and molecular study of epipelic filamentous genera Phormidium, Microcoleus and Geitlerinema (Oscillatoriales, Cyanophyta/Cyanobacteria). - Fottea 12: Působení v zahraničí University of North Florida 1 měsíc Podpis datum

20 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Botanika Jméno a příjmení Miloslav Kitner Tituly RNDr., Ph.D. Rok narození 1976 typ vztahu k VŠ pp rozsah 40 do kdy 08/20 Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení pp rozsah 40 do kdy 08/20 Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ Mgr.: Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, Učitelství biologie a chemie pro SŠ, 2000 RNDr.: Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, Botanika, 2003 Ph.D.: Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, Botanika, 2003 Údaje o odborném působení od absolvování VŠ : Laboratoř růstových regulátorů PřF Univerzity Palackého a UEB AV v Olomouci, vědecký pracovník Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Obor řízení k jmenování profesorem Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní h=13 h=13 Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení Podíl na výuce těchto kurzů (hod dotace): KBB/MOLEK Molekulární ekologie (0,5h) BOT/HBIT Houbové organismy a řasy v biotechnologiích (0,2) BOT/KBOT Konzervační botanika (0,5) BOT/MBSB Molekulární biosystematika (0,2) Vedoucí diplomových a bakalářských prací: 1 DP a 3 BP obhájené, 1 BP probíhá Vedoucí doktorských prací: 1 probíhá Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Vybrané publikace od roku 2015 Kitner et al. (submitted). Low genetic variation in Pseudoperonospora humuli populations in Europe suggests long distance dispersal and little local adaptation European Journal of Plant Pathology Ali et al. (submitted). Out of the Transcaucasia: origin of Western and Central Palearctic populations of Microthlaspi perfoliatum. Flora Braun et al. (in press). Phylogeny and taxonomy of Golovinomyces orontii revisited. Mycological Progress Ali et al. (2017). Genetic patterns reflecting Pleistocene range dynamics in the annual calcicole plant Microthlaspi erraticum across its Eurasian range. Flora : Petrželová et al. (2017). Confirmation of Peronospora agrimoniae as a distinct species. European Journal of Plant Pathology 147: Prausová et al. (2016). Adenophora liliifolia: conditions of its populations in Central Europe. Acta Biologica Cracoviensia Series Botanica 58: Kitner et al. (2015). Coincidence of virulence shifts and changes in the population genetic structure of Pseudoperonospora cubensis populations revealed by multilocus analyses. Plant Pathology 64: Sharma et al. (2015). Genome analyses of the sunflower pathogen Plasmopara halstedii provide insights into effector evolution in downy mildews and Phytophthora. BMC Genomics 16:741 Kitner et al. (2015). Genetic diversity in Israeli natural populations of three predominantly self-pollinating wild Lactuca (L. serriola, L. saligna, L. aculeata) species. - Genetic Resources and Crop Evolution 67(2):

21 Působení v zahraničí 2005: Slovinsko, Agricultural Institute of Slovenia & Biotechnological Faculty, University of Slovenia, 2 týdny, stáž 2007: Slovinsko, Agricultural Institute of Slovenia & Biotechnological Faculty, University of Slovenia, 2 týdny, stáž 2009: Německo, Univ. of Hohenheim, Dpt. Botany, Biodiversity and Plant Interaction Group, 2 týdny, stáž 2012: Německo, Biodiversity and Climate Research Centre & the Goethe Univ., Frankfurt am Main, 3 měsíce, stáž 2014: Maďarsko, Plant Protection Inst. of the Centre for Agric. Res. of the Hungarian Acad. of Sciences, 1 měsíc, stáž 2014: Německo, Biodiversity and Climate Research Centre & the Goethe Univ., Frankfurt am Main, 1 měsíc, stáž Podpis datum

22 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Botanika Jméno a příjmení Aleš Lebeda Tituly prof., Ing., DrSc. Rok narození 1951 typ vztahu k VŠ PP rozsah 40 do kdy N Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení PP rozsah 40 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ : Vysoká škola zemědělská v Brně, Agronomická fakulta, obor: zahradnictví : Karlova Univerzita, Přírodovědecká fakulta, postgraduální studium, obor: mykologie (4 semestry) : CSc., Výzkumný ústav rostlinné výroby v Praze-Ruzyni, obor: speciální produkce rostlinná (zaměření na genetiku a šlechtění rostlin na rezistenci) 1993: DrSc., Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně, obor: zemědělská a lesnická fytopatologie 1994: Doc., Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně, obor: zelinářství 1999: Prof., Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně, obor: zemědělská botanika Údaje o odborném působení od absolvování VŠ : vedoucí fytopatologické laboratoře, VŠÚZ Olomouc, Šlechtitelská stanice Smržice; : vedoucí fytopatologické laboratoře, SEMO s.r.o. Smržice; : docent, katedra botaniky Přírodovědecké fakulty Univerzity Palackého v Olomouci; : vedoucí katedry botaniky (KB) PřF UP v Olomouci a fytopatologické laboratoře KB PřF UP; 1999-dosud: profesor 2010-dosud: vedoucí Oddělení fytopatologie a mikrobiologie KB PřF UP v Olomouci. Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na Ohlasy publikací VŠ Zelinářství 1994 Mendelu Brno WOS Scopus ostatní Obor řízení k jmenování Rok udělení hodnosti Řízení konáno na profesorem VŠ Zemědělská botanika 1999 Mendelu Brno Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení BOT/SNPRY Systém a fylogeneze nižších rostlin BOT/OMP Obecná mykologie BOT/OMPEN (Anglické lekce z obecné mykologie) přednášející BOT/FYFA Fytofarmacie BOT/ZFP Základy fytopatologie Dosud vedl 47 bakalářských a diplomových prací. Školitel 26 doktorandů, přičemž 21 z nich studium úspěšně ukončilo. Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Shrnutí: Celkový počet vědeckých a odborných publikací: celkem 1108; z toho 291 publikací v 70 zahraničních resp. mezinárodních vědeckých časopisech (většinou impaktovaných, 310 prací na WOS (All Databases), h-index = 28; 25 prací v 8 domácích vědeckých časopisech; editor/autor 42 vědeckých a odborných monografií, knih a sborníků. Publikační výstupy (příklady ): Lebeda, A., Mieslerová, B., Petřivalský, M., Luhová, L., Špundová, M., Sedlářová, M., Nožková-Hlaváčková, V., Pink, D.A.C., Resistance mechanisms of wild tomato germplasm to infection of Oidium neolycopersici. European Journal of Plant Pathology, 138: Lebeda A., Křístková E., Kitner M., Mieslerová B., Jemelková M., Pink D.A.C., Wild Lactuca species, their genetic diversity, resistance to diseases and pests, and exploitation in lettuce breeding. European Journal of Plant 21

23 Pathology, 138: Lebeda, A., Mieslerova, B., Jankovics, T., Kiss, L., van der Linde, E.J., First detection of tomato powdery mildew caused by Oidium neolycopersici in South Africa. South African Journal of Botany 99: Kitner, M., Lebeda, A., Sharma, R., Runge, F., Dvořák, P., Tahir, A., Choi, Y.-J., Sedláková, B., Thines, M., Coincidence of virulence shifts and population genetic changes of Pseudoperonospora cubensis in the Czech Republic. Plant Pathology 64: Jemelková, M., Kitner, M., Křístková, E., Beharav, A., Lebeda, A Biodiversity of Lactuca aculeata germplasm assessed by SSR and AFLP markers, and resistance variation to Bremia lactucae. Biochemical Systematics and Ecology 61: Kitner M., Majeský A., Křístková E., Jemelková M., Lebeda A., Beharav A Genetic structure and diversity in natural populations of three predominantly selfpollinating wild Lactuca species in Israel. Genetic Resources and Crop Evolution 62(7): Lebeda A., Křístková E., Sedláková B., McCreight J.D., Coffey M.D Cucurbit powdery mildews: methodology for objective determination and denomination of races. Eur. J. Plant. Pathology, 144: Lebeda, A., Křístková, E., Štěpánková, J., Sedláková, B., Widrlechner, M.P., 2016: Response of Cucumis melo accessions to isolates of Pseudoperonospora cubensis with different levels of virulence. Scientia Horticulturae, 200: Lebeda, A., Křístková, E., Roháčková, J., Sedláková, B., Widrlechner, M.P., Paris, H.S., Race-specific resistance of Cucurbita germplasm to Pseudoperonospora cubensis. Euphytica 212: Trojanová, Z., Sedlářová, M., Gulya, T.J., Lebeda, A., Methodology of virulence screening and race characterization of Plasmopara halstedii, and resistance evaluation in sunflower a review. Plant Pathology 66: Thomas, A., Carbone, I., Lebeda, A., Ojiambo, P.S., Virulence structure within the population of Pseudoperonospora cubensis in the United States. Phytopathology, 107: Drábková Trojanová, Z., Sedlářová, M., Pospíchalová, R., Lebeda, A.: Pathogenic variability of Plasmopara halstedii infecting sunflower in the Czech Republic. Plant Pathology 67, 2018, Dhillon, N.P.S., Sanguansil, S., Srimat, S., Schafleitner, R., Manjunath, B., Agarwal, P., Xiang, Q., Masud, M.A.T., Myint, T., Hanh, N.T., Cuong, T.K., Balatero, C.H., Salutan-Bautista, V., Pitrat, M., Lebeda, A., McCreight, J.D.: Cucurbit powdery mildew-resistant bitter gourd breeding lines reveal four races of Podosphaera xanthii in Asia. HortScience 53, 2018, Tichá, T., Sedlářová, M., Činčalová, L., Trojanová, Z.D., Mieslerová, B., Lebeda, A., Luhová, L., Petřivalský, M.: Involvement of S-nitrosothiols modulation by S-nitrosoglutathione reductase in defence responses of lettuce and wild Lactuca spp. to biotrophic mildews. Planta 247, 2018, Lebeda, A., Křístková, E., Sedláková, B., McCreight, J.D., Kosman, E.: Virulence variation of cucurbit powdery mildews in the Czech Republic popualtion approach. European Journal of Plant Pathology 152, 2018, Beharav, A., Hellier, B., Richardson, K.L., Lebeda, A., Kisha, T.: Genetic relationships and structured diversity of Lactuca georgica germplasm from Armenia and the Russian Federation among other members of Lactuca L., subsection Lactuca L., assessed by TRAP markers. Genetic Resources and Crop Evolution 65, 2018, Jemelková, M., Kitner, M., Křístková, E., Doležalová, I., Lebeda, A.: Genetic variability and distance between Lactuca serriola L. populations from Sweden and Slovenia assessed by SSR and AFLP markers. Acta Botanica Croatica 77, 2018, Rsaliyev, A.S., Amirkhanova, N.T., Rametov, N.M., Pahratdinova, Zh.U., Ojiambo, P.S., Lebeda, A.: Pseudoperonospora cubensis virulence and pathotype structure in Kazakhstan. Plant Pathology 67, 2018, Výzkumné projekty (řešitel, spoluřešitel): Dosud řešitelem nebo spoluřešitelem 37 domácích (např. GAČR, NAZV, MŠMT, FRVŠ, MH, OPVK) a zahraničních (např. EU, OECD, Tempus, Socrates/Erasmus, DFG, IAG, HRI) projektů. Např : Harmonization of resistance test to diseases for DUS testing - 2 (Harmores 2) (European Union - CPVO); Leafy vegetables germplasm, stimulating use (European Comission), Contract number): AGRI , Agreement number: 001 AGRI GEN RES 870/2004; projekt EU Gene-Mine; Výzkumný záměr MSM , Variabilita složek a interakcí v rostlinném patosystému a vliv faktorů prostředí na jejich projev Projekt na rozvoj studijního programu: CZ.1.07/2.2.00/ (OPVK Inovace studia botaniky ) CZ.1.07/2.2.00/ (OPVK Botangis ); IGA PrF ( Biodiverzita rostlin a jejich interakce s prostředím interní projekt UP) 22

24 Působení v zahraničí Celkem absolvoval 54 střednědobých a dlouhodobých vědeckých pobytů na zahraničních pracovištích a expedicích (Alžírsko, Austrálie, Čína, Francie, Gruzie, Holandsko, Chile, Indie, Itálie, Izrael, Japonsko, Jihoafrická republika, Kanada, Korea, Kostarika, Mauritius, Německo, Nový Zéland, Peru, Portugalsko, Španělsko, Švédsko, Taiwan, Thajsko, Turecko, Uruguay, USA, Velká Británie); celkem cca 80 měsíců. Podpis datum

25 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Botanika Jméno a příjmení Pavel Matušinský Tituly Mgr., PhD. Rok narození 1974 typ vztahu k VŠ pp rozsah 32 do kdy 08/21 Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení pp rozsah 32 do kdy 08/21 Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ Mgr. ( ), učitelství biologie pro SŠ (Přírodovědecká fakulta, Ostravská Univerzita) Ph.D. ( ), fytotechnika (obor: Speciální produkce rostlinná), (Agronomická fakulta, Mendelova Univerzita v Brně) Údaje o odborném působení od absolvování VŠ učitel na základní škole (Přírodopis-Zeměpis) - ZŠ Kamenec, Ostrava výzkumný a vývojový pracovník - Zemědělský výzkumný ústav Kroměříž, s.r.o., Agrotest fyto, s.r.o. Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Obor řízení k jmenování profesorem Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení V rámci předmětu Molekulární analýzy rostlinného genomu na MZLU přednášky na téma: Využití molekulárních metod ve fytopatologii (Celkem 5x od roku 2008) V rámci předmětu Rostlinolékařství (MZLU) přednáška na téma Rezistence houbových patogenů k fungicidům (2016) V rámci předmětu Molekulární analýzy rostlinného genomu na MZLU: Genetická variabilita houbových patogenů (2018) Fytopatologie obecná vybrané přednášky (letní semestr 2019), UP Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Matusinsky, P. Svačinová, Ivana; Jonavičiené, Akvile; Tvarůžek, Ludvík, Long-term dynamics of causative agents of stem base diseases in winter wheat and reaction of Czech Oculimacula spp. and Microdochium spp. populations to prochloraz. EUROPEAN JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY 148: Matusinsky, P; Vanova, M; Tvaruzek,; Polisenska, I; Janecek, M; Smutny, V Soil Management Technologies and Mycotoxin Contamination of Wheat and Barley Grain. CEREAL RESEARCH COMMUNICATIONS 44(2): Matusinsky, P., Zouhar, M., Pavela, R., Novy P., Antifungal effect of five essential oils against important pathogenic fungi of cereals. INDUSTRIAL CROPS AND PRODUCTS 67: Havis, N.D., James K.M. Brown, Gladys Clemente, Peter Frei, Malgorzata Jedryczka, Joanna Kaczmarek, Maciej Kaczmarek, Pavel Matusinsky, Graham R.D. McGrann, Sylvia Pereyra, Marta Piotrowska, Hind Sghyer, Aurelien Tellier, Michael Hess, Ramularia collo-cygni - an emerging pathogen of barley crops. PHYTOPATHOLOGY 105 (7): Soovali, P., Tikhonova, M., Matusinsky, P., First Report of Ramularia Leaf Spot Caused by Ramularia collo-cygni on Leaves and Seeds of Barley in Estonia. PLANT DISEASE 98 (7): Leisova-Svobodova, L., Minarikova, V., Matusinsky, P., Hudcovicova, M., Ondreickova, K., Gubis, J., Genetic structure of Pyrenophora teres net and spot populations as revealed by microsatellite analysis. 24

26 FUNGAL BIOLOGY 118 (2): Matusinsky, P., Hanusova, M., Stemberkova, L., Marik, P., Minarikova, V., Tvaruzek, L., Langer, I., Spitzer, T., Response of Spring Barley Cultivars to Ramularia Leaf Spot in Conditions of the Czech Republic. CEREAL RESEARCH COMMUNICATIONS, 41 (1): Leisova-Svobodova, L., Matusinsky, P., Kucera, L., Variability of the Ramularia collo-cygni Population in Central Europe. JOURNAL OF PHYTOPATHOLOGY, 160 (11-12): Matusinsky, P., Leisova-Svobodova, L., Gubis, J., Hudcovicova, M., Klcova, L., Gubisova, M., Marik, P., Tvaruzek, L., Minarikova, V., Impact of the seed borne stage of Ramularia collo-cygni in barley seed. JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY, 93 (3): Matusinsky, P., Frei, P., Mikolasova, R., Svacinova, I., Tvaruzek, L., Spitzer, T., Species-specific detection of Bipolaris sorokiniana from wheat and barley tissues. CROP PROTECTION, 29 (11): Matusinsky, P., Svobodova-Leisova, L., Marik, P., Tvaruzek, L., Stemberkova, L., Hanusova, M., Minarikova, V., Vysohlidova, M., Spitzer, T., Frequency of a mutant allele of cytochrome b conferring resistance to QoI fungicides in the Czech population of Ramularia collo-cygni. JOURNAL OF PLANT DISEASES AND PROTECTION, 117 (6): Matusinsky, P., Mikolasova, R., Klem, K., Spitzer, T., Eyespot infection risks on wheat with respect to climatic conditions and soil management. JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY, 91 (1): Matusinsky, P., Mikolasova, R., Klem, K., Spitzer, T., Urban, T., The role of organic vs. conventional farming practice, soil management and preceding crop on the incidence of stem-base pathogens on wheat. JOURNAL OF PLANT DISEASES AND PROTECTION, 115 (1): Matusinsky, P., Mikolasova, R., Spitzer, T., Klem, K., 2008: Colonization of winter wheat stem bases by communities of pathogenic fungi. CEREAL RESEARCH COMMUNICATIONS, 36 (1): Matusinsky, P., Mikolasova, R., Spitzer, T., Klem, K., Tvarůžek, L., Patent: Primery pro detekci Cochliobolus sativus v obilovinách. Č. patentu Působení v zahraničí Justus Liebig Universität in Giessen, Německo, program Erasmus (4 měsíce) Federal Institute for Agriculture in Alpine Regions Gumpenstein, Rakousko, stáž v rámci Ph.D. studia (1 měsíc) Polish Academy of Science, Centre of Plant Agrobiology and Molecular Genetics, Polsko, kurz molekulárně biologických technik (1 týden) Estonian Crop Research Institute Jogeva, Estonsko, pracovní stáž (1 měsíc) Podpis datum

27 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Botanika Jméno a příjmení Barbora Mieslerová Tituly doc. RNDr., Ph.D. Rok narození 1973 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy N Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení pp. rozsah 40 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ V roce 1996 ukončeno studium na PřF UP v Olomouci, obor systematická biologie, Mgr.; doktorandské studium na katedře botaniky PřF UP v Olomouci, 2000 Ph.D.; úspěšně ukončené habilitační řízení na Fakultě agronomické Mendelovy Univerzity v Brně, doc. Údaje o odborném působení od absolvování VŠ Praxe: 1999 dosud - Katedra botaniky PřF UP v Olomouci (vědecký pracovník do 2007, odborný asistent do 2013, docent - dosud). Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Rostlinolékařství 2013 Mendelova Univerzita WOS Scopus ostatní v Brně Obor řízení k jmenování Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ profesorem h- index 14 Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení Vedení bakalářských prací obhájených/celkově 14/19, diplomových prací obhájených/celkově 14/18. Výuka předmětů BOT/BIKR (Biologická klasifikace rostlin), BOT/FYTEX (Fytopatologická exkurze), BOT/GME (Obecná mykologie v anglickém jazyce), BOT/HBIT (Houbové organismy a řasy v biotechnologii), BOT/HVR (Historický vývoj rostlin), BOT/MVP, MVPX (Mikrobiologie a virologie), BOT/MYKEX (Terénní mykologická exkurze), BOT/OMKB (Biologie houbových organismů), BOT/OMP (Obecná mykologie), BOT/SNCVO, SNCVU, SNCVY (Cvičení ze systému nižších rostlin), BOT/SNP, SNPR (Fylogeneze a systém nižších rostlin), BOT/PGSGM (Obecná mykologie), BOT/SPVB (Současné problémy výuky biologie), BOT/ZFPEN (Základy fytopatologie v anglickém jazyce), BOT/ZFP (Základy fytopatologie), BOT/FPP (Fytopatologie pro pokročilé). Člen komise pro Státní doktorské zkoušky AF Mendlova Univerzita v Brně. Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Nožková, V., Mieslerová, B., Luhová, L., Piterková, J., Novák, O., Špundová, M., Lebeda, A. (2019): Effect of heat-shock pre-treatment on tomato plants infected by powdery mildew fungus. Plant Protection Science 55 (1): Lebeda, A., Mieslerová, B., Huszár, J., Sedláková, B. (2017): Padlí kulturních a planě rostoucích rostlin. Agriprint, Olomouc, 368 s. ISBN (35%). Mieslerová, B., Sedlářová, M., Lebeda, A. (2016): Houby a houbám podobné organismy v biotechnologiích. VUP, Olomouc, 200 s. ISBN (70%) 26

28 Lebeda, A., Mieslerova, B., Jankovics, T., Kiss, L., van der Linde, E.J., First detection of tomato powdery mildew caused by Oidium neolycopersici in South Africa. South African Journal of Botany 99: Lebeda, A., Mieslerová, B., Petřivalský, M., Luhová, L., Špundová, M., Sedlářová, M., Nožková-Hlaváčková, V., Pink, D.A.C. (2014): Resistance mechanisms of wild tomato germplasm to infection of Oidium neolycopersici. European Journal of Plant Pathology 138/3, SI: DOI /s (30%) Lebeda, A., Mieslerová, B., Petrželová, I., Korbelová, P. (2013): Occurrence of lettuce downy mildew (Bremia lactucae) and powdery mildew (Golovinomyces cichoracearum) in natural populations of prickly lettuce (Lactuca serriola). Plant Protection Science 49:S24-S32. (35%) Lebeda, A., Mieslerová, B., Petrželová, I., Korbelová, P. (2012): Host specificity and virulence variation in populations of lettuce powdery mildew pathogen (Golovinomyces cichoracearum s. str.) from prickly lettuce (Lactuca serriola). Mycological Progress 12/3: DOI /s (35%) Působení v zahraničí Krátkodobé stáže UWE Bristol, Hungarian Academy of Science Budapešť, Technical University of Munich (Freising-Weihenstephan). Podpis datum

29 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Botanika Jméno a příjmení Aloisie Poulíčková Tituly prof. RNDr. CSc. Rok narození 1961 typ vztahu k VŠ PP rozsah 40 do kdy N Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení PP rozsah 40 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah - Údaje o oboru vzdělání na VŠ RNDr. - PřF Univ. Palackého v Olomouci, systematická biologie a ekologie, 1985; CSc. - Botanický Ústav AVČR Průhonice, botanika, 1990; doc. - PřF Univ. Palackého v Olomouci, botanika, 1998; prof. - Univerzita Palackého v Olomouci, botanika 2009 Údaje o odborném působení od absolvování VŠ Mikrobiologický ústav AVČR Třeboň odborný pracovník; Botanický Ústav AVČR Třeboň odborný pracovník, Univerzita Palackého v Olomouci odborný asistent, docent, profesor 1995-dosud Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací botanika 1998 UP Olomouc WOS Scopus ostatní Obor řízení k jmenování Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Bez profesorem botanika 2009 UP Olomouc auto 1014 Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení Přednášky Systém a evoluce rostlin část řasy, Ekologie řas, Algologie speciální, Vybrané kapitoly z evoluce rostlin, Historický vývoj rostlin Obhájeno 24 bakalářských prací, 43 diplomových prací, 11 Ph.D. prací Garant doktorského studia Botanika v nové akreditaci od r Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Poulíčková, A., Hájková, P., Kintrová, K., Baťková, R., Czudková, M., Hájek, M. (2013): Tracing decadal environmental change in ombrotrophic bogs using diatoms from herbarium collections and transfer functions. Environmental Pollution 179: ; Poulíčková,A., Mazalová,P., Vašut R., Šarhanová,P., Neustupa J., Škaloud P. (2014): DNA Content variation and its signifikance in the evolution of the genus Micrasterias (Desmidiales, Streptophyta). Plos one 9: e86247; Poulíčková,A., Dvořák,P., Mazalová,P., Hašler,P. (2014): Epipelic microphototrophs: an overlooked assemblage in lake ecosystems. Freshwater Science 33: Poulíčková, A., Sato S., Evans K.M., Chepurnov, V.A. and Mann D.G. (2014):Repeated evolution of uniparental reproduction in Sellaphora. - Eur. J. Phycol. 50:62-79.; Poulíčková,A., Letáková,M., Hašler,P., Cox,E. Duchoslav,M. (2017): Species complexes within epiphytic diatoms and their relevance for the bioindication of trophic status. Science of the Total Environment : ; Poulíčková,A. et al. 2019: A new species Pinnularia lacustrigibba sp. nov. within the Pinnularia subgibba group. Diatom Research in press. Publikací 164 (z toho na WOS 88), H-index 19, populárně vědecké příručky 3, VŠ učebnice 1 Projekty 15 (GAČR, FRVŠ, EU Synthesis, Kontakt Rakousko-ČR) Zakladatel a šéfredaktor mezinárodního vědeckého algologického časopisu Fottea (WOS IF 1.476) 28

30 Působení v zahraničí Royal Botanic Garden Edinburgh UK stáž 2004,2005,2006,2008 celkem 10 měsíců; National History Museum London UK stáž 2005 projekt EU SYNTHESYS, studium sbírek 2010, Institute of Limnology Austrian Academy of Science, Mondsee, Rakousko 2001,2002 na projekt Kontakt ČR- Rakousko Přednášky na konferencích 46 (Evropa, Kanada, U.K., USA, Japonsko) Workshop: Ecology of bentic diatoms in oligotrophic habitats 2008 Trento, Itálie principal lector Podpis datum

31 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Botanika Jméno a příjmení Petr Smýkal Tituly doc. Ing., Ph.D. Rok narození 1969 typ vztahu k VŠ PP rozsah 40 do kdy N Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení PP rozsah 40 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. vztahu rozsah UK Praha, PřF, KEBR DPP 150h Údaje o oboru vzdělání na VŠ Docent: PřF UPOL, obor botanika, duben 2017 Ph.D.: PřF UK Praha, fyziologie a anatomie rostlin 1999 Ing.: rostlinné biotechnologie, VŠZ + PřF UK Praha, 1994 Údaje o odborném působení od absolvování VŠ Od docent, PřF UP ( ) PřF UPOL, odborný asistent ( ) Agritec Plant Research s.r.o., Šumperk, vědecký pracovník ( ) Institute für Biologie III, Albrecht Ludwig University of Freiburg, Německo, vědecký pracovník ( ) Institute of Plant Science, Plant Genetics, Swiss Institute of Technology, ETH Zurich, Švýcarsko, vědecký pracovník ( ) Katedra fyziologie a anatomie rostlin, PřF UK Praha, asistent Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na Ohlasy publikací VŠ Botanika 2017 UPOL WOS Scopus ostatní Obor řízení k jmenování Rok udělení hodnosti Řízení konáno na 1120, 1135 profesorem VŠ h=19 Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení BOT/GMBIP Genetika a molekulární biologie interakcí hostitel-patogen garant, přednášející BOT/SRF Šlechtění rostlin přednášející BOT/PVRX Proměnlivost a evoluce rostlin garant, přednášející BOT/OBFF Obecná fytopatologie - přednášející BOT/DAP 1 Diplomová práce 1 garant BOT/DAP2 Diplomová práce 2 garant BOT/DAP3 Diplomová práce 3 garant BOT/DAP4 Diplomová práce 4 garant BOT/SZZOF Státní závěrečné zkoušky z obecné fytopatologie garant BOT/SZZSF státní závěrečné zkoušky ze speciální fytopatologie garant BOT/SZZDF státní závěrečné zkoušky z diagnostiky fytopatogenních organismů garant BOT/SZZFF státní závěrečné zkoušky z fytofarmacie a právních norem v ochraně rostlin garant BOT/SRO Šlechtění rostlin, část obecná přednášející, cvičící BOT/PRX Pěstované rostliny přednášející, cvičící Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Hradilová I, Duchoslav M, Brus J, Pechanec V, Hýbl M, Kopecký P, Smržová L, Štefelová N, Václavek T, Machalová J, Hron K, Bariotakis M, Pirintsos S, Smýkal P. (2019) Variation in wild pea (Pisum sativum subsp. elatius) seed dormancy and its relationship to the environment and seed coat traits. PeerJ 6:e6263 Janská A, Pecková E, Sczepaniak B, Smýkal P, Soukup A. (2018) The role of the testa during the establishment of physical dormancy in the pea seed. Annals of Botany doi: /aob/mcy213 Smýkal P, Trněný O, Brus J, Hanáček P, Rathore A, Roma RD, et al. (2018) Genetic structure of wild pea (Pisum sativum subsp. elatius) populations in the northern part of the Fertile Crescent reflects moderate cross-pollination and strong effect of geographic but not environmental distance. PLoS ONE 13(3):e

32 Trněný O, Brus J, Hradilová I, Rathore A, Das RR, Kopecký P, Coyne CJ, Reeves P, Richards C, Smýkal P. (2018) Molecular evidence for two domestication events in the pea crop. Genes 9, 535; doi: /genes Smýkal P, Nelson MN, Berger JD and von Wettberg EJB (2018) The Impact of Genetic Changes during Crop Domestication. Agronomy 8, 119; doi: /agronomy Smýkal P., Hradilová I., O. Trněný, J. Brus, A. Rathore, M. Bariotakis, R.R. Das, D. Bhattacharyya, C. Richards, C.J. Coyne, S. Pirintsos (2017) Genomic diversity and macroecology of the crop wild relatives of domesticated pea. Scientific Reports 7: Hradilová I, Trněný O, Válková M, Cechová M, Janská A, Prokešová L, Aamir K, Krezdorn N, Rotter B, Winter P, Varshney RK, Soukup A, Bednárř P, Hanáček P and Smýkal P (2017) A combined comparative transcriptomic, metabolomic, and anatomical analyses of two key domestication traits: Pod dehiscence and seed dormancy in pea (Pisum sp.). Front. Plant Sci. 8:542. Smýkal P., Chaloupská M., Bariotakis M., Marečková L., Sinjushin A., Gabrielyan I., Akopian J., Toker C., Kenicer G., Kitner M., Pirintsos S. (2017) Spacial patterns and intraspecific diversity of the glacial relict legume species Vavilovia formosa (Stev.) Fed. in Eurasia. Plant Systematics and Evolution 303: Smýkal P., Coyne C. and 14 co-authors (2015) Legume crops phylogeny and genetic diversity for science and breeding. Critic. Rev. Plant Sci. 34: Grantové projekty : GAČR, Grant Agency of Czech Republic nr S, Využití přístupů ekologické genomiky k poznání adaptivního významu dormance semen u bobovitých rostlin. (odpovědný řešitel) : FP7 LEGATO (LEGumes for the Agriculture of Tomorrow) (odpovědný řešitel za UPOL, WP1 task 1.3 leader) : GAČR, Grant Agency of Czech Republic nr s, Dormance semen a pukavost lusků jako klíčové domestikační znaky luskovin. (odpovědný řešitel) Editor-člen redakční rady: Frontiers in Plant Sciences (IF 3.677), Associate Editor Biologia Plantarum (Springer, IF 1.424), Associate Editor Agronomy (MDPI, IF 1.419), Editorial board member and Guest Editor International Journal of Molecular Sciences (MDPI, IF 3.6), Guest Editor Czech Journal of Genetics and Plant Breeding (IF 0.467), Editorial board member Legumes Perspectives, Editorial board member Legumes Science (Wiley), Editorial board member Field and Vegetable Crops Research (ISSN ), Editorial board member Členství v profesních organizacích: European Federation of Plant Physiologist (FESPP) Czech Society of Experimental Plant Biology (ČSEBR) Pisum Genetics Association International Legume Society člen rady genetických zdrojů České republiky, Národní program konzervace a využívání genetických zdrojů rostlin a agro-biodiversity (NP GZR) člen Oborového verifikačního a hodnotícího panelu (OVHP) pro EP - Zemědělské vědy, Odbor podpory Rady pro výzkum, vývoj a inovace, Úřadu vládu ČR Působení v zahraničí 1992/93 6 měsíců, TEMPUS Fellowship, University of Cordoba, Spain měsíce, TEMPUS, Biogema/Nickersons Ltd., Cambridge Science Park, UK 1999 /2001 Institute of Plant Science, Plant Genetics, Swiss Institute of Technology, ETH Zurich, Švýcarsko 2001/2003 Institute für Biologie III, Albrecht Ludwig University of Freiburg, Německo, vědecký pracovník měsíc, STSM COST522 Fellowship, University of Dundee, UK týdnů, OECD Fellowship, University of Helsinki, Finland měsíc, Royal Society of Edinburgh Fellowship, University of Dundee, UK měsíc, Royal Society of Edinburgh Fellowship, Royal Botanical Garden Edinburgh, UK 2018/19 6 měsíců, Fulbright Scholar Award, University of Vermont, USA Podpis datum

33 F-V Personální zabezpečení akademičtí pracovníci Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název oboru řízení Botanika Jméno a příjmení Eva Zažímalová Tituly prof. RNDr. CSc. Rok narození 1955 typ vztahu k VŠ pracovněprávní žádný rozsah do kdy Typ vztahu k součásti VŠ, na které probíhá řízení pracovněprávní žádný rozsah do kdy Další současná působení jako akademický pracovník na VŠ typ prac. rozsah vztahu Členka vědecké rady UPOL žádný Údaje o oboru vzdělání na VŠ Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Praha - obor chemie odborná, specializace biochemie; ukončeno (prom. chem.) , RNDr. - obhájení práce a titul udělen Údaje o odborném působení od absolvování VŠ : postgraduální studium (aspirantura) v oboru biologie, specializace fyziologie rostlin; Československá akademie věd; obhájeno 1982 (prosinec), titul CSc. udělen v únoru ( a : Narození dcery a syna, mateřské dovolené) : Vědecká pracovnice ÚEB ČSAV. Odborné zaměření: auxin a receptory pro auxin ve vztahu k vývoji rostlinných orgánů (koleoptile a primární listy pšenice) a k vývoji rostlinné buňky (buněčné kultury tabáku). Od r. 1989: Vědecká pracovnice Ústavu experimentální botaniky AV ČR (ÚEB AVČR). Odborné zaměření: spolupůsobení rostlinných signálních látek (fytohormonů) auxinů a cytokininů při regulaci vývoje rostlinné buňky; molekulární mechanismy působení auxinů, přenašeče pro auxiny : Samostatná vědecká pracovnice, od 2005 docentka, Katedra fyziologie/experimentální biologie rostlin Př. f. UK, částečný pracovní úvazek (0,1-0,25) : Zástupkyně ředitelky ÚEB AVČR : Vedoucí Laboratoře hormonálních regulací u rostlin ÚEB AVČR : Ředitelka ÚEB AVČR, v. v. i : Vedoucí vědecká pracovnice, Biologické centrum AV ČR, částečný pracovní úvazek. 2013: Jmenována profesorkou pro obor anatomie a fyziologie rostlin na návrh UniverzityKarlovy : Členka Akademické rady AV ČR (na ÚEB AV ČR částečný pracovní úvazek). Od 2017: Předsedkyně AV ČR (na ÚEB AV ČR částečný pracovní úvazek). Od 2018: Vedoucí vědecká pracovnice, Mikrobiologický ústav AV ČR, částečný pracovní úvazek. Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Anatomie a fyziologie rostlin 2004 Univerzita Karlova Přírodovědecká fakulta WOS Scopus ostatní Obor řízení k jmenování Rok udělení Řízení konáno na VŠ nesleduji profesorem Anatomie a fyziologie rostlin hodnosti 2013 Univerzita Karlova (bez autocitací) Přehled o nejvýznamnější vzdělávací činnosti vztahující se k oboru řízení Pravidelné semestrální přednášky na Př. f. UK: Fytohormony- MB130P15 (od 1994, garant přednášky ). Vybrané kapitoly z biochemie rostlin - MB130P53 (od 2002, garant přednášky ). Vedení (školitel) studentů magisterského (8, všechny práce obhájeny) a doktorského studia (12, dosud obhájených 10) v oborech Anatomie a fyziologie rostlin" a Biochemie" na Př. f. UK. 32

34 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti vztahující se k oboru řízení Celkem 51 prací v časopisech s impaktním faktorem, kapitol v monografiích (zde uveden pouze seznam nejdůležitějších), h-index = 29 (dle WoS), počet citací 4103 (k , dle WoS, bez autocitací), průměrná citovanost práce 78x. Petrášek J, Černá A, Schwarzerová K, Elčkner M, Morris DA, Zažímalová E: Do Phytotropins Inhi bit Auxin Effiux by lmpairing Vesicle Traffic? - PLANT PHYSIOLOGY 131: , Paciorek T, Zažímalová E, Ruthardt N, Petrášek J, Stierhof Y.-D, Kleine-Vehn J, Morris DA, Emans N, Jtirgens G, Geldner N, and Friml J: Auxin inhibits endocytosis and promotes its own efflux from cells. - NATURE 435: , Petrášek J, Mravec J, Bouchard R, Blakeslee JJ, Abas M, Seifertová D, Wisniewska J, Tadele Z, Kubeš M, Čovanová M, Dhonukshe P, Skůpa P, Benková E, Perry L, Křeček P, Lee OR, Fink GR, Geisler M, Murphy AS, Luschnig C, Zažímalová E, Friml J: PIN proteins perforrn a rate-limiting function in cellula r auxin efflux. - SCIENCE 312: , Hoyerová K, Perry L, Hand P, Laňková M, Kocábek T, May S, Kottová J, Pačes J, Napier R, Zažímalová E: Functional characterization of PaLAX l, a putative auxin permease, in heterologous plant systems. - PLANT PHYSIOLOGY 146: , Mravec J, Kubeš M, Bielach A, Gaykova V, Petrášek J, Skupa P, Chand S, Benková E, Zažímalová E, and Friml J: Interaction of PIN and PGP transport mechanisms in auxin distribution-dependent development. - DEVELOPMENT 135: , Pemisová M, Klíma P, Horák J, Válková M, Malbeck J, Souček P, Reichman P, Hoyerová K, Dubová J, Friml J, Zažímalová E, Hejátko J: Cytokinins modulate auxin-induced organogenes is in plants via regulation ofthe auxinefflux. - PROC. NATL. ACAD. SCI. U. S. A. 106: , Růžička K, Šimášková M, Duclercq J, Petrášek J, Zažímalová E, Simon S, Friml J, Van Montagu M, Benková E: Cytokinin regulates roo t meristem activity via modulationofthe polar auxin transport. - PROC. NATL. ACAD. SCI. U.S. A. 106: , Mravec J, Skůpa P, Bailly A, Hoyerová K, Křeček P, Bielach A, Petrášek J, Zhang J, Gaykova V, StierhofY-D, Dobrev PI, Schwarzerová K, Rolčík J, Seifertová D, Luschnig Ch, Benková E, Zažímalová E, Geisler M & Friml J: Subcellular homeostasis of phytohormone auxin is mediated by the ER-localized PIN5 transporter.- NATURE 459: , Jelínková A, Malínská K, Simon S, Kleine-Vehn J, Pejchar P, Kubeš M, Martinec J, Friml J, Zažímalová E, Petrášek J: Probing plant membranes with FM dyes: tracking, dragging or blocking? - PLANT JOURNAL 61: , Robert S, Kleine-Vehn J, Barbez E, Sauer M, Paciorek T, Baster P, Yanneste S, Zhang J, Simon S, Čovanová M, Hayashi K, Dhonukshe P, Yang Z, Bednarek SY, Jones AM, Luschnig C, Aniento F, Zažímalová E, Friml J: ABPl Mediates Auxin Inhibition of Clathrin-Dependent Endocytosis in Arabidopsis. - CELL 143: , Zažímalová E, Murphy AS, Yang H, Hoyerová K, Hošek P: Auxin Transporters- Why So Many? COLD SPRING HARB PERSPECT BIOL 2010;2: a Křeček P, Skůpa P, Libus J, Naramoto S, Tejos R, Friml J, Zažímalová E: Protein family review: The PIN- FORMED (PIN) protein family ofauxin transporters. - GENOME BIOLOGY 2009, 10:249. Kubeš M, Yang H, Richter G, Cheng Y, Mlodzióska E, Wang X, Blakeslee J, Carra ro N, Petrášek J, Zažímalová E, Hoyerová K, Peer W, Murphy A: The Arabidopsis concentration-dependent influx/efflux transporter ABCB4 regulates cellular auxin levels in the root epidermis. - PLAN T JOURNAL 69: , Hošek P, Kubeš M, Laňková M, Dobrev PI, Klíma P, Kohoutová M, Petrášek J, Hoyerová K, Jiřina M, Zažímalová E: Auxin transport on cellular level: New insights supported by mathematical-modelling. - JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 63: , Barbez E, Kubeš M, Rolčík J, Beziat C, Pěnčík A, Wang B, Ruiz Rosquete M, Zhu J, Dobrev PI, Lee Y, Zažímalová E, Petrášek J, Geisler M, Friml J, Kleine-Vehn J: A novel putative auxin carrier family regulates intracellular auxin homeostasis in plants. - NATURE 485: , Leitner J, Petrášek J, Tomanov K, Retzer K, Pařezová M, Korbei B, Bachmair A, Zažímalová E, and Luschnig Ch: Lysine63-linked ubiquitylat ion of PIN2 auxin carrier protein gove rns horrnonally controlled adaptation 33

35 of Arabidopsis root growth. - PROC. NATL. ACAD. SCI. U. S. A. 109: , Simon S, Kubeš M, Baster P, Robert S, Dobrev PI, Friml J, Petrášek J, Zažímalová E: Defining the selectivity ofprocesses along the auxin response chain: a study using auxin analogues. - NEW PHYTOLOGIST 200: , Čovanová M, Sauer M, Rychtář J, Friml J, Petrášek J, Zažímalová E (2013) Overexpression of the AUXIN BINDING PROTEIN1 Modulates PIN-Dependent Auxin Transport in Tobacco Cells. - PLOS ONE 8(7): e doi: /jou rnal.pone ). Yin R, Han K, Heller W, Albert A, Dobrev PI, Zažímalová E, Schil.ffner AR: Kaempferol 3-O-rhamnoside-7-Orhamnoside is an endogenous flavonol inhibito r ofpolar auxin transport in Arabidopssi shoots. - NEW PHYTOLOGIST 201: , Zažímalová E, Petrášek J, Benková E (eds): Auxin and Its Role in Plant Development, pp. 444, DOI / _1, Springer-Verlag Wien Bouguyon E, Brun F, Meynard D, Kubeš M Pervent M, Leran S, Lacombe B, Krouk G, Guiderdoni E, Zažímalová E, Hoyerová K, Nacry P and Gojon A: Multiple mechanisms of nitrate sensing by Arabidopsis nitrate transceptor NRT NATURE PLANTS 1, 2015, DOI: /NPLANTS Kuhn BM, Errafi S, Bucher R, Dobrev P, Geisler M, Bigler L, Zažímalová E, Ringli Ch: 7-Rhamnosylated Flavonols Modulate Homeostasis of the Plant Hormone Auxin and Affect Plan t Development. - JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 291: , Steenackers W, Cesarino I, Klíma P, Quareshy M, Vanholme R, Comeillie S, Kumpf RP, Van de Wouwer D, Ljung,K GoeminneG, Novak O, Zažímalová E, Napier R, Boerjan W, Vanholme B: The allelochemical 3,4- (methylenedioxy)cinnamic acid (MDCA) inhibits lignificatio n and affects auxin homeostasis in Arabidopsis. - PLANT PHYSIOLOGY 172: , Simon S, Skůpa P, Viaene T, Zwievka M, Tejos R, Klíma P, Čarná M, Rolčík J, De Rycke R, Moreno I, Do brev PI, Orellana A, Zažímalová E, Friml J: PIN6 auxin transporter at endoplasmic reticulum and plasma membrane mediates auxin homeostasis and organogenesis in Arabidops is. - NEW PHVTOLOGIST 211 (1): 65-74, Steenackers W, Klíma P, Quareshy M, Cesarino I, Kumpf RP, Corneillie S, Araújo P, Viaene T, Goeminne G, Nowack MK, Ljung K, Friml J, Blakeslee JJ, Novak O, Zažímalová E, Napier R, Boerjan W, Vanholme 8: cis-cinnamic acid is a novel, natu ral auxin efflux inhibitor that promotes lateraj root formation. - PLANT PHYSIOLOGY 173: , Lacek J,R etzer K, Luschnig Ch, Zažímalová E (2017) Polar Auxin Transport. - In: els. John Wiley & Sons Ltd: Chichester. DOI: 1O.1002/ l5902.a pub2 Retzer K, Lacek J, Skokan R, del Genio Chi, Vosolsobě S, Laňková M, Malfnská K, Konstantinova N, Zažímalová E, Napier RM, Petrášek J, Luschnig Ch: Evolutionary Conserved Cysteines Function as cis- Acting Regulators of Arabidopsis PIN-FORMED 2 Distribution - INTERNATIONAL JO URNAL OF MOLECULAR SCIENCES 2017, 18, 2274; doi: /ijms Působení v zahraničí Žádné stáže delší než 3 týdny (vzhledem k onemocnění syna - od jeho čtyř let diabetes typu I - jsem nemohla mimo domov na delší dobu vycestovat) Podpis Eva Zažímalová, v. r. datum

36 G-I Hodnocení nezbytného personálního a dalšího zabezpečení a jeho rozvoje Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Název oboru řízení Přírodovědecká fakulta Botanika Hodnocení nezbytného personálního a dalšího zabezpečení a jeho rozvoje V rámci oboru řízení Botanika došlo v posledních letech k odbornému růstu řady odborných asistentů, kteří se habilitovali v různých oblastech botaniky v rámci již zmíněných vymezení (viz. B-I) a další odborní asistenti (viz. F-II) mají vysoký potenciál k úspěšnému dokončení habilitačních řízení v horizontu několika let. Důraz je a bude kladen i na potenciál dalšího kvalifikačního růstu nových docentů a to s výhledem na řízení jmenování profesory. Právě tento důraz v habilitačních řízeních vytváří předpoklady pro kvalitní a dlouhodobé zabezpečení oboru řízení, ale i výuky botaniky ve všech stupních VŠ vzdělávání. Za posledních 10 let v rámci oboru Botaniky došlo k nárůstu publikačních výsledků a zvýšení jejich kvality a to ve všech vymezených botanických disciplínách. To se odráží v publikování v prestižních časopisech s botanickým či botanice příbuzným zaměřením. Společně se zkvalitněním publikačních výsledků došlo i ke zvýšení efektivity získávání grantových prostředků na vědeckou činnost v oboru řízení, v některých případech i v prostředí evropské kompetice. Vědecká činnost spolu s DSP Botanika byla posílena i masivní investiční podporou (rekonstrukce budov, skleníky a kultivační komory, laboratoře, přístrojové vybavení). Mimo základního výzkumu došlo i k rozvoji vědecké činnosti v aplikovaném výzkumu, která přinesla nové grantové prostředky z rezortních zdrojů (MZe), nové typy výsledků a spolupráce s praxí (zemědělskou, šlechtitelskou). Právě další rozvoj aplikovaného výzkumu je prioritou následujících let s cílem vybudování solidních a prospěšných spoluprací domácích a zahraničních. Spolupráce s praxí má pozitivní dopady nejen na kvalifikační růst akademických pracovníků, ale přenáší pozitiva i do garantované výuky. Důležitým cílem pro rozvoj v dalším období je řešení aktuálních vědeckých témat oboru, orientace v současném vědeckém pokroku, zůstat v oblasti botanických věd i nadále progresivní a podporovat zajímavé vize a nápady. Dalším, rovněž významným aspektem, je internacionalizace. Všechny zmíněné cíle a priority vycházejí ze stabilního prostředí, ve kterém je obor řízení zabezpečován, a je tedy důležité o tuto stabilitu a hlavně kontinuitu nadále usilovat a podporovat ji. Právě stabilita a kontinuita představují význačné předpoklady pro dlouhodobé personální zabezpečení oboru. 35

37 G-II Popis systému zajišťování kvality vzdělávací a tvůrčí činnosti Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Název oboru řízení Přírodovědecká fakulta Botanika Odkaz na poslední zprávu o vnitřním hodnocení Stručný popis systému zajišťování kvality vzdělávací a tvůrčí činnosti b69665bff-ff01-4c10-b925-8f9722d29332%7d&file=zprava_hodnoceni_kvality- 13_12_2018.pdf&action=default Systém zajišťování a vnitřního hodnocení kvality je v souladu se zákonem č. 111/1998 Sb., o vysokých školách a o změně a doplnění dalších zákonů, ve znění pozdějších předpisů, a příslušným nařízením vlády č. 274/2016 Sb., o standardech ve vysokém školství. Výsledkem hodnocení kvality vzdělávací, tvůrčí a s nimi souvisejících činností UP je zavedení systému zajišťování kvality vzdělávací, tvůrčí a s nimi souvisejících činností a postupné aplikace standardů a postupů vnitřního hodnocení kvality na Univerzitě Palackého v Olomouci. Celý systém včetně způsobu přijímání nápravných opatření a následné podoby kontrolování jejich naplňování je definován vnitřním předpisem Pravidla systému zajišťování kvality vzdělávací, tvůrčí činnosti a s nimi souvisejících činností a vnitřního hodnocení kvality vzdělávací, tvůrčí činnosti a s nimi souvisejících činností Univerzity Palackého v Olomouci a na něj navazující vnitřní normou Postupy a metody zjišťování kvality na Univerzitě Palackého v Olomouci. Procesy vzniku a schvalování změn studijních programů upravuje vnitřní norma Akreditace studijních programů, udělování oprávnění uskutečňovat studijní programy a akreditace habilitačních řízení a řízení ke jmenování profesorem na UP. Vnitřní požadavky na studijní programy stanovuje vnitřní norma Standardy pro institucionální akreditaci a standardy studijních programů. Veškeré požadavky na studijní programy jsou plně v souladu se standardy akreditací. Za kvalitu a řádné uskutečňování studijního programu ručí garant programu, který ve spolupráci s orgány příslušné fakulty dbá o obsahovou a metodickou kvalitu studijního programu, o řádné uskutečňování jeho výuky, jakož i o jeho rozvíjení a pravidelné hodnocení. Kvalita studijního programu jakožto kvalita příslušných pracovišť, na nichž je studijní program realizován, stejně jako kvalita akademických a dalších pracovníků podílejících se na jeho zajišťování je pravidelně sledována. Tyto výsledky hodnocení kvality vzdělávací, tvůrčí a s nimi souvisejících činností se zohledňují nejen při procesech akreditace, ale jsou na všech úrovních stěžejním nástrojem pro řízení univerzity. Systém zajišťování a vnitřního hodnocení kvality je z velké části ponechán ve správě jednotlivým fakultám a součástem s metodickým vedením a podporou příslušných útvarů rektorátu univerzity. Vedle komplexních analýz si jednotlivé fakulty či univerzitní zařízení zpracovávají například zprávy o studentském hodnocení výuky (každoročně), provádí šetření mezi absolventy (delší časový horizont) či se zajímají o hodnocení svých služeb v rámci jejich zlepšení a rozšiřování. Garantem systému zajišťování a hodnocení kvality je Rada pro vnitřní hodnocení, jež dohlíží, zda jsou naplňovány požadavky univerzity na kvalitu vzdělávací činnosti ve vzdělávacích programech a provádí její hodnocení. Výsledky hodnocení kvality slouží k monitorování současného stavu a jako podklad pro plánování, další řízení pracoviště a směřování studijního programu. Zveřejňování výsledků hodnocení kvality bylo doposud v gesci jednotlivých fakult, kdy fakulty nejčastěji zpracovávaly a na webových stránkách zveřejňovaly výsledky studentských evaluací. Kompletní Zpráva o vnitřním hodnocení kvality vzdělávací, tvůrčí a s nimi souvisejících činností UP je dostupná na webových stránkách univerzity. Celý systém je neustále se rozvíjejícím nástrojem, který umožňuje pravidelně monitorovat a usměrňovat probíhající činnosti a zároveň zohledňovat specifika jednotlivých fakult a studijních programů. Podrobný popis systému zajišťování kvality na UP je k dispozici na webových stránkách UP: 36

38 Příloha: Podepsané a naskenované osobní listy (část F-V) akademických pracovníků, kteří nemají k Univerzitě Palackého v Olomouci žádný pracovně-právní vztah.

39

40