THE PREPARATION OF PLANTS VECTORS WITH HISCUP GENE AND TRANSFORMATION OF FLAX PŘÍPRAVA ROSTLINNÝCH VEKTORŮ S GENEM HISCUP A TRANSFORMACE LNU SETÉHO
|
|
- Pavel Pravec
- před 9 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 THE PREPARATION OF PLANTS VECTORS WITH HISCUP GENE AND TRANSFORMATION OF FLAX PŘÍPRAVA ROSTLINNÝCH VEKTORŮ S GENEM HISCUP A TRANSFORMACE LNU SETÉHO Jan Fišer 1,2), Martina Nováková 1,2), Martina Macková 1,2), Tomáš Macek 2,1), Kateřina Tupá 1) 1) Institute of Chemical Technology in Prague, Faculty of food and biochemical technology, Department of Biochemistry and Microbiology, Technicka 5, Prague, Czech Republic 2) Joint Laboratory of ICT and IOCB, Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, The Academy of Science of the Czech Republic, Flemingovo nam. 2, Prague, Czech Republic Abstract: The problems with finding suitable plants for phytoremediation can be solved by preparation of transgenic plants which could express a binding domain for heavy metals. CUP gene encodes for a yeast protein metallothionein, which has a high affinity to heavy metals. This gene was fused with histidine tail (HisCUP) for isolation of expressed metallothionein by Ni-NTA agarose. The goal of this work is the preparation of plant vectors with HisCUP gene and their use for the transformation of flax (Linum usitatissimum). Plasmid pnov2819 (Syngenta) was chosen as a first vector. This vector contains gene for phosphomannose isomerase enabling a selection of transgenic plants on medium with mannose. The cassette with HisCUP gene was inserted into it under the control of light-induced promoter of RUBISCO protein. The second vector was plasmid pgreen0029 with gene for resistance to antibiotic kanamycin. Gene HisCUP was inserted into this plasmid under the constitutive promoter of cauliflower mosaic virus (CaMV 35S). Firstly, transient expression was accomplished by prepared vectors in tobacco (Nicotiana tabacum). The presence of mrna of HisCUP gene was confirmed in both constructs. Metallothionein was isolated using Ni-NTA agarose and detected by an antibody specific to histidine tail but its presence was not confirmed. Permanent transformation of flax was performed by germ Agrobacterium tumefaciens with individually prepared constructs. Regenerants were obtained after transformation of both constructs but they have died during the selection on mannose or kanamycin and transgenic plants with HisCUP gene were not obtained. Keywords: Phytoremediation, metallothionein, heavy metals, HisCUP, transgenic plants, mannosa Abstrakt: Problémy s nalezením rostlinných druhů vhodných pro fytoremediaci těžkých kovů mohou být vyřešeny přípravou transgenních rostlin exprimujících ve zvýšené míře vhodné vazebné domény. CUP gen kóduje kvasničný protein metalothionein, který má vysokou afinitu k těžkým kovům. Pro klonování byl tento gen spojen s histidinovou kotvou (HisCUP) umožňující isolaci exprimovaného metalothioneinu pomocí Ni-NTA agarosy. Cílem této práce je připravit rostlinné konstrukty s genem HisCUP a transformovat jimi len setý (Linum usitatissimum). Jako první vektor byl zvolen plasmid pnov2819 (Syngenta) obsahující gen pro fosfomannosaisomerasu umožňující selekci transgenních rostlin na médiu s mannosou. Do něj byla vložena kazeta s genem HisCUP pod kontrolou světlem indukovaným promotorem proteinu RUBISCO. Druhým rostlinným vektorem byl plasmid pgreen0029 nesoucí gen pro rezistenci transformovaných rostlin k antibiotiku kanamycinu. Do tohoto vektoru byl gen HisCUP vložen pod kontrolou konstitutivního promotoru viru květákové mozaiky CaMV 35S. S připravenými konstrukty byla nejdříve provedena transientní exprese v rostlinách tabáku (Nicotiana tabacum). Byla prokázána přítomnost mrna genu HisCUP z obou konstruktů, ale metalothionein se po izolaci na Ni-NTA agarose a imunochemické detekci prokázat nepodařilo. Trvalá transformace rostlin lnu setého byla provedena bakterií Agrobacterium tumefaciens nesoucí jednotlivé připravené konstrukty. Byly získány regenerující rostliny po transformaci oběma konstrukty, ale ty během selekce na mannose či kanamycinu postupně uhynuly. Získat transgenní rostlinu lnu setého pomocí připravených konstruktů se nepodařilo ani v jednom případě.
2 Klíčová slova: Fytoremediace, metalothionein, těžké kovy, HisCUP, transgenní rostliny, mannosa Úvod Minulé století bylo ve znamení obrovského vědeckého a technického pokroku. Avšak během globálního vývoje vyvstaly také některé nové výzvy, zejména na poli ochrany a péče o životní prostředí. Téměř každá vláda na světě se zastává životního prostředí bez kontaminantů pro své občany. Avšak požadavek růstu státní ekonomiky a rozvoje průmyslu a zemědělství převažuje nad požadavkem bezpečného, čistého a přirozeného životního prostředí. Proto se od začátku průmyslové revoluce dramaticky zrychlilo i znečišťování půdy polutanty, mj. i těžkými kovy (Chhotu a Fulekar, 2009). Zdrojem kontaminace těžkými kovy jsou i přirozené geologické procesy, ale především antropogenní aktivity (Dembitsky, 2003). Patří sem hlavně produkce paliv, hornictví, tavení rud, válečné operace, aplikace zemědělských chemikálií, produkce průmyslových a komunálních odpadů či spalování uhlí (Zhen-Guo a kol., 2002). Konvenční metody remediace půdy zahrnují vykopání a transport kontaminované půdy a následné promývání, imobilizaci nebo extrakci fyzikálně-chemickými metodami. Tyto metody jsou finančně velice náročné a při nízké koncentraci znečištění ekonomicky nevýhodné (Cherain a Oliveira, 2005). Tyto překážky mohou být řešeny využitím metod, jako je např. bioremediace. Při bioremediaci jsou pro rozklad kontaminujících látek na jednodušší produkty využívány bakterie (Cunnigham a Ow, 1996). Tato metoda je nejvhodnější pro místa kontaminovaná organickými polutanty. Protože těžké kovy nejsou předmětem degradace, je bioremediace limitována v prostředí znečištěném těžkými kovy (Marschner, 1995). Mnohem větší potenciál pro dekontaminaci těžkých kovů má tzv. fytoremediace. Při této metodě jsou využívány rostliny pro degradaci, zadržení či metabolizaci jak organických, tak anorganických kontaminantů (Cunnigham a kol., 1995; Cunnigham a Ow, 1996). Vedle ekonomické výhodnosti této technologie jde především o to, že fytoremediace je šetrná k životnímu prostředí, zachovává půdní úrodnost a je použitelná na velké plochy s možnou aplikací pro řadu toxických látek. Oproti konvenčním metodám se však jedná o poměrně dlouhodobé opatření (Kumar a kol., 1995). Výhodou fytoremediace oproti bioremediaci je, že rostliny jsou autotrofní organismy s velkým množstvím biomasy, vyžadují jen skromný přísun živin a navíc zabraňují rozšiřování kontaminace větrnou a vodní erozí (Pulford a Watson, 2003). Rostliny také dodávají živiny rhizosférním bakteriím a tak umožňují růst mikrobiálních konsorcií pro další detoxifikaci (Cherain a Oliveira, 2005). Získaná biomasa by dále mohla být využita pro produkci bioenergie (výroba bioplynu, spalování, zplynování, výroba bionafty) (Ginneken a kol., 2007). Předpokládá se, že z popela po spálení biomasy se vzácnými kovy by tyto kovy mohly být získány. Tento proces byl nazván phytomining (Nicks a Chambers, 1994). Rostliny mají schopnost akumulovat esenciální kovy (Ca, Co, Cu, Fe, K, Mg, Mn, Mo, Na, Ni, Se, V a Zn) z půdního roztoku, jejichž různou koncentraci potřebují pro svůj růst a vývoj. Tato schopnost dovoluje rostlinám akumulovat i další neesenciální kovy (Al, As, Au, Cd, Cr, Hg, Pb, Pd, Pt, Sb, Te, Tl a U), které nemají žádnou známou biologickou funkci (Djingova a Kuleff, 2000). Avšak esenciální kovy v nadbytku a neesenciální těžké kovy jsou pro rostliny toxické (Williams a kol., 2000). Jsou příčinou vzniku oxidativního stresu a ovlivňují funkce enzymů. Navíc, na rozdíl od organických polutantů, nemohou být těžké kovy chemicky nebo biologicky degradovány, ale pouze uloženy do různých rostlinných kompartmentů či imobilizovány nebo odstraněny fyzikálně-chemickými metodami (Ghosh a Singh, 2005). U většiny rostlin se akumulace těžkých kovů pohybuje v rozmezí hodnot 0,1 100 mg/kg sušiny. Vyšší schopnost akumulovat těžké kovy byla zaznamenána jen u některých rostlin, tzv. hyperakumulátorů. Kritérium pro hyperakumulaci se liší pro různé kovy a je představováno koncentrací kovu v sušině, která je větší než normální fyziologická úroveň (Baker a kol., 1994). Hyperakumulující rostliny disponují účinnými transportními a detoxifikačními mechanismy, díky nimž jsou schopny koncentrovat ve svých pletivech kov (iont kovu) v koncentracích 50 až 500
3 vyšších oproti půdním koncentracím (Clemens a kol., 2002). Kovy jsou obvykle ukládány ve vakuole po vazbě k různým typům sloučenin snižujících jejich toxicitu a umožňující jejich transport (Cherain a Oliveira, 2005). Aby rostliny mohly být využity při fytoremediaci, musí extrahovat vysokou koncentraci těžkých kovů do kořenů, tu dále přenášet do nadzemních částí, které jsou skliditelné, a produkovat velké množství biomasy (Ghosh a Singh, 2005). Hyperakumulující rostliny jsou však obecně úzce vázány na určitý biotop nebo produkují velmi malá množství biomasy (např. Thlaspi rotundifolium akumulující mg Pb/kg má přírůstek biomasy 50 mg za pět měsíců), což je diskvalifikuje při fytoextrakci kovů z půdy (Clemens a kol., 2002; Macek a kol., 2008; Banuelos a kol., 2002). Řešení nabízí technologie genových manipulací rychle rostoucích rostlin s velkou produkcí biomasy, široce větveným kořenovým systémem a jednoduchou agrotechnikou. Jedním z nejvýznamnějších detoxifikačních mechanismů kovů v rostlinách a obecně eukaryotních buňkách je chelatace kovů ligandy bohatými na sulfhydrylové skupiny, jakými jsou např. glutathion, fytochelatiny a metalothioneiny. Řada modelových studií potvrzuje, že zavádění genů kódujících účinné heterologní ligandy, včetně metalothioneinů, do genomů rostlin může vést ke zvýšenému příjmu kovů a jejich translokaci do nadzemních částí modifikovaných rostlin (Kotrba a kol., 2009). Metalothioneiny jsou proteiny vytvářené pomocí translačního aparátu a jsou charakterizovány jako nízkomolekulární, na cystein bohaté proteiny vázající kovy. Binz a Kägi vytvořili klasifikaci, kde vzali v úvahu taxonomické parametry a vzor distribuce cysteinových zbytků v sekvenci metalothioneinového proteinu. Tak vzniklo celkem 15 rodin MT, z nichž patnáctá, připadající na rostlinné metalothioneiny, byla rozdělena na 4 typy podle distribuce jejich cysteinových zbytků a oblastí bez cysteinů. Dosud je jediným rostlinným metalothioneinem izolovaným z přirozeného zdroje metalothionein Ec z obilek rostliny Triticum aestivum. Všechny další aminokyselinové sekvence rostlinných metalothioneinů jsou odvozeny ze sekvencí mrna nebo cdna. Nadprodukce rekombinantních metalothioneinů zvyšuje v rostlinách rezistenci ke kovům, podporuje jejich akumulaci a může být považována za slibný přístup k vytvoření rostlin vhodných k fytoremediaci (Binz a Kagi, 1999; Fišer a kol., 2010). Metodika a výsledky Gen CUP1 kóduje nízkomolekulární protein metalothionein, který má vysokou afinitu k těžkým kovům. Je bohatý na aminokyselinu cystein, na jejíž SH skupinu jsou těžké kovy vázány. Pro usnadnění izolace metalothioneinu a dodání další vazebné domény byl gen CUP1 spojen s histidinovou kotvou (6 His), která umožňuje využít Ni-NTA agarosu k izolaci metalothioneinu. Gen HisCUP byl získán z plasmidu ptrchiscup pomocí PCR reakce s modifikovanými primery, které na svých 5 koncích obsahovaly místa pro restrikční enzymy NcoI a BglII. Plasmid ptrchiscup byl již dříve použit pro transformaci tabáku a byla prokázána zvýšená akumulace těžkých kovů v nadzemních částech (Macek a kol., 2002). Jako rostlinné vektory pro transformaci lnu setého (Linum usitatissimum) byly vybrány plasmidy pnov2819 a pgreen0019. Plasmid pnov2819 (Syngenta) obsahuje v T-DNA gen pro fosfomannosaisomerasu, která umožňuje selekci transgenních rostlin na médiu s mannosou. Mannosa-6-fosfát vznikající v rostlinách rostoucích na médiu s mannosou je toxická z důvodu odčerpávání fosfátu a již není dále metabolizována. Fosfomannosaisomerasa je schopna přeměnit mannosu-6-fosfát na fruktosu-6-fosfát, která je dále metabolizována v glykolýze (Ondřej a kol., 1999). Do plasmidu pnov2819 byla vložena kazeta RbcS vyštěpená z plasmidu ImpactVector restrikčními enzymy HindIII a PacI a obsahující promotor (P-RbcS) a terminátor (T-RbcS) proteinu RUBISCO. P-RbcS je promotorem malých podjednotek proteinu RUBISCO a je indukován světlem. Oproti promotoru viru květákové mozaiky je až osmkrát silnější a proteiny z genů pod tímto promotorem tvoří až 10 % celkových proteinů v listech (Outchkourov a kol., 2003).
4 Gen HisCUP byl následně vložen mezi zmíněný promotor a terminátor pomocí připravených míst pro restrikční enzymy. Konstruktem pnov2819/rbcs/hiscup byla transformována bakterie Agrobacterium tumefaciens C58-C1 (pch32). Tato bakterie je přirozeným rostlinným patogenem a dokáže vnést část své plasmidové DNA (T-DNA) do genomu rostlinné buňky. Toho se využívá v genovém inženýrství k přípravě transgenních rostlin. Jako druhý rostlinný vektor byl vybrán plasmid pgreen0019. V T-DNA tohoto vektoru je kódována rezistence k antibiotiku kanamycin. Antibiotika jsou k selekci transgenních rostlin využívána již od prvních pokusů a jsou známy metodické postupy jejich využití pro optimální výsledek transformace. Toto se stále nedá tvrdit o použití mannosy jako selekčního činidla, protože jednotlivé rostliny se chovají velmi odlišně na médiu s mannosou a postup transformace a selekce transgenních rostlin je nutno optimalizovat. Gen HisCUP pro přípravu toho konstruktu byl připraven s místy pro restrikční enzymy HindIII a EcoRI. Pomocí nich byl vložen do plasmidu psk/35s, který obsahuje promotor (CaMV 35S) a terminátor viru květákové mozaiky. Z tohoto plasmidu byla kazeta s genem HisCUP vyštěpena a vložena do plasmidu pgreen0019. Připraveným konstruktem pgreen0019/35s/hiscup byly opět transformovány bakterie Agrobacterium tumefaciens C58-C1 (pch32). Trvalá transformace rostlin je časově velice náročná z důvodu dlouhé regenerace a selekce transgenních rostlin. Proto se často pro ověření exprese námi požadovaného genu v rostlinách využívá tzv. transientní exprese. Jedná se o metodu, při které nedochází ke vzniku transgenních rostlin, ale pouze k dočasné expresi vnášeného genu. K té dochází díky přítomnosti vysoké koncentrace plasmidové DNA z bakterie A. tumefaciens v rostlinné buňce. Po několika dnech pak dojde k umlčení exprese procesem zvaným gene scilencing. Transientní exprese se provádí vtlačením agrobakteriální suspenze spodní stranou do listů. Po třech až čtyřech dnech se listy ostříhají a detekuje se v nich produkt genu. Transientní exprese byla provedena s oběma připravenými konstrukty, pnov2819/rbcs/hiscup a pgreen0019/35s/hiscup, pomocí bakterie A. tumefaciens C58-C1 (pch32) na rostlinách tabáku viržinského (Nicotiana tabacum). Tato rostlina má oproti lnu větší plochu listů a je proto pro tuto metodu vhodnější. Listy tabáku byly po 4 dnech ostříhány a dezintegrovány tekutým dusíkem. Metalothionein byl izolován afinitní chromatografií pomocí Ni-NTA agarosy, na kterou se metalothionein váže svou histidinovou kotvou. K eluci byl použit imidazol. Se získanými frakcemi byla provedena tricin SDS elektroforéza a po přenesení proteinů na nitrocelulózovou membránu byl metalothionein detekován imunochemicky myší protilátkou proti histidinové kotvě. V rostlinném materiálu se po infiltraci bakterií A. tumefaciens s jednotlivými připravenými konstrukty nepodařilo metalothionein prokázat. Dále byla z rostlinného materiálu izolována celková RNA pro ověření přítomnosti transkriptu genu HisCUP. Izolovaná RNA byla purifikována pomocí Dnasy od kontaminující DNA izolované souběžně s RNA. Z purifikované RNA byla připravena komplementární cdna pomocí oligot primeru. Připravená cdna byla použita k polymerázové řetězové reakci s primery amplifikující 300 bp dlouhý úsek genu HisCUP. Na agarosovém gelu s produktem PCR reakce byl tento pruh přítomen a tím byla ověřena transkripce genu HisCUP v konstruktu pgreen0019/35s/hiscup a poté byla stejným způsobem ověřena i v konstruktu pnov2819/rbcs/hiscup. Pro trvalou transformaci byla vybrána rostlina lnu setého (Linum usitatissimum). Jedná se o rostlinu se zvládnutou agrotechnikou a navíc podmínky mírného pásma jí vyhovují. To umožňuje i případné využití této rostliny k polním pokusům. Výhodou technického lnu je i fakt, že se nepoužívá v potravinářském průmyslu, a tudíž se snadněji uvede do používání než rostliny ke krmení zvířat či výživě lidí. Pro transformaci byly využívány hypokotyly sterilně vypěstovaných rostlin lnu setého. Ty byly infikovány bakterií A. tumefaciens C58-C1 (pch32) s připraveným konstruktem
5 pnov2819/rbcs/hiscup nebo pgreen0019/35s/hiscup. Hypokotyly byly poté kultivovány na médiu s rostlinnými regulátory růstu benzylaminopurinem (BAP), kyselinou α-naftyloctovou (NAA) a vhodnou koncentrací selekčního činidla. Hypokotyly transformované pomocí konstruktu pnov2819/rbcs/hiscup byly selektovány na médiu s koncentrací mannosy 10 g/l. Dostatečnost této koncentrace byla experimentálně ověřena na rostlinách lnu setého. Hypokotyly transformované konstruktem pgreen0019/35s/hiscup byly selektovány na koncentraci 200 mg kanamycinu/l média. Při transformaci oběma konstrukty se podařilo získat regenerující rostliny, které byly po dosažení délky přibližně 1 cm odstřihnuty a přeneseny na kořenící médium, na kterém by transgenní rostliny měly vytvořit kořeny. Závěr Molekulárně genetickými metodami byly připraveny dva konstrukty pro přípravu transgenních rostlin. Do obou byl vložen kvasničný gen HisCUP, který kóduje nízkomolekulární protein metalothionein spojený s histidinovou kotvou. Metalothioneiny mají vysokou afinitu k těžkým kovům a bylo potvrzeno, že vnesením heterologního vazebného ligandu do rostlin může být dosaženo zvýšené akumulace těžkých kovů. Jako první byl použit rostlinný vektor pnov2819 (Syngenta), který využívá gen pro fosfomannosaisomerasu k selekci transgenních rostliny na mannose. Gen HisCUP byl do tohoto vektoru klonován pod kontrolou světlem indukovaným promotorem proteinu RUBISCO. Druhým vektorem byl zvolen plasmid pgreen0019. Zde je pro selekci transgenních rostlin využita rezistence ke kanamycinu a gen HisCUP byl pod kontrolou konstitutivního promotoru viru květákové mozaiky. Exprese genu HisCUP v rostlinách tabáku viržinského byla ověřována metodou transientní exprese pomocí bakterie A. tumefaciens C58-C1 (pch32) s připraveným konstruktem pnov2819/rbcs/hiscup nebo pgreen0019/35s/hiscup. Po izolaci RNA z rostlinného pletiva se podařilo prokázat expresi genu HisCUP v případě obou připravených konstruktů. Dále byl metalothionein izolován afinitní chromatografií pomocí Ni-NTA agarosy. Získané frakce byly rozděleny tricin SDS elektroforesou a metalothionein byl po přenesení na nitrocelulosovou membránu detekován imunochemicky protilátkou proti histidinové kotvě. Metalothionein se v rostlinném pletivu detekovat nepodařilo. Pro trvalou transformaci byly vybrány rostliny lnu setého. Sterilní hypokotyly byly infikovány bakterií A. tumefaciens C58-C1 (pch32) s připraveným konstruktem pnov2819/rbcs/hiscup nebo pgreen0019/35s/hiscup. Poté byly rostlinné explantáty selektovány na médiu s mannosou nebo kanymycinem. Asi 1 cm dlouhé regenerující rostliny byly odstřiženy a přeneseny na kořenící médium. Zde by transgenní rostliny měly vytvořit kořeny. Poděkování: Tato práce byla podporována granty 1M06030, MSM , Z , MSMT č. 21/2011, FRVS 1401/2011. Literatura: Baker A. J. M., McGrath S. P., Sidoli S. M. D., Reeves R. D The possibility of in situ heavy metal decontamination of polluted soils using crops of metal-accumulating plants. Resour. Consery. Recyc. 11, pp Banuelos G. S., Lin Z. Q., Terry N Phytoremediation of selenium-contaminated soils and wasters: Fundamental and future prospect. Rev. Environ. Health 17, pp Binz P. A., Kägi J. H. R Metallothionein: molecular evolution and classification. In. Metallothionein IV. Klaassen I. V. C. (ed.), Birkhäuser Verlag Basel/Switzerland, pp Clemens S., Palmgren M., Krämer U A long way ahead: understanding and engineering plant metal accumulation. Trend Plant Sci. 7, pp
6 Cunnigham S. D., Berti W. R., Huang J. W Phytoremediation of contaminated soils. TIBTECH 13, pp Cunnigham S. D., Ow D. W Promises and prospects of phytoremediation. Plant Physiol. 110, pp Dembitsky V NAtural occurrence of arseno compounds in plants, lichens, fungi, algal species, and microoganisms. Plant Sci. 165, pp Djingova R., Kuleff I Instrimental techniques for trace analysis. In: Trace elements: Their distribution and effect in the environment. Vernet J. P. (ed.), Elsevier Scinece Ltd. United Kingdom, pp Fišer J., Macková M., Nováková M., Macek T Genetické modifikace rostlin pro zvýšení akumulace těžkých kovů. LCaŘ 126, pp Ghosh M., Sing S. P A review on phytoremediation of heavy metals and utilization of byproducts. Appl. Ecol. Res. 3, pp Ginneken L. V., Meers E., Guisson R., Ruttens A., Elst K., Tack F. M. G., Vangronsveld J., Diels L., Dejonghe W. (2007). Phytoremediation for heavy metal contaminated soils combined with bioenergy production. JEELM 15, pp Cherain S., Oliveira M. M Transgenic plants in phytoremediation: Recent advances and new possibilities. Environ. Sci. Technol. 39, pp Chhotu D. J., Fulekar M. H Phytoremediation of heavy metals: Recent techniques. Afr. J. Biotechnol. 8, pp Kotrba P., Najmanová J., Macek T., Macková M Genetically modified plants in phytoremediation of heavy metal and metalloid soil and sediment pollution. Biotechnol. Adv. 27, pp Kumar P. B. A. N., Dushenkov V., Motto H., Raskin I Phytoextraction: The use of plants to remove heavy metals from soils. Environ. Sci. Technol. 29, pp Macek T. Macková M., Pavlíková D., Száková J., Truksa M., Singh Cundy A., Kotrba P Accumulation of cadmium by transgenic tobacco. Acta Biotechnologica 22, pp Macek T., Kotrba P., Svatoš A., Nováková M., Demnerová K., Macková M Novel roles for genetically modified plants in environmental protection. Trends Biotechnol. 26, pp Marschner H Mineral nutrition of higher plants. 2nd (eds), Academic Press, New York Nicks L., Chambers M. F. (1994). Nickel farm. Discover. September, pp. 19. Ondřej M., Drobník J., Gartland K. M. A., Gartland J. S Genové inženýrství. Učební text v rámci programu TEMPUS PHARE, VŠCHT Praha. Outchkourov N. S., Peters J., de Jong J The promoter-terminator of chrysanthenum rbcs1 directs very high expression levels in plants. Planta 216, pp Pulford I., Watson C Phytoremediation of heavy metal-contaminated land by trees a review. Environ. Int. 29, pp Williams L. E., Pittman J. K., Hall J. K. (2000). Emerging mechanism for heavy metal transport in plants. Biochim. Biophys. Acta 1465, pp Zhen-Guo S., Xian-Dong L., Chun-Chun W., Huai-Man Ch., Hong Ch Lead Phytoextraxtion from contaminated soil with high-biomass plant species. J. Environ. Qual. 31, pp
VYUŢITÍ GENETICKY MODIFIKOVANÝCH ROSTLIN PRO REMEDIACI KONTAMINOVANÝCH ZEMIN
VYUŢITÍ GENETICKY MODIFIKOVANÝCH ROSTLIN PRO REMEDIACI KONTAMINOVANÝCH ZEMIN Martina Nováková, Martina Macková, Jan Fišer, Jáchym Šuman, Veronika Kurzawová, Tomáš Macek suram@vscht.cz Vysoká škola chemicko-technologická
PREPARATION OF TRANSGENIC FLAX WITH YEAST GENE FOR INCREASING HEAVY METAL ACCUMULATION
PREPARATION OF TRANSGENIC FLAX WITH YEAST GENE FOR INCREASING HEAVY METAL ACCUMULATION PŘÍPRAVA TRANSGENNÍCH LNŮ OBSAHUJÍCÍCH GEN PRO ZVÝŠENOU AKUMULACI TĚŢKÝCH KOVŮ Jan Fišer 1,2), Martina Nováková 1,2),
Transgenní rostliny využitelné ve fytoremediacích
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze Transgenní rostliny využitelné ve fytoremediacích Ing. Jitka Viktorová, Ph.D. Ing. Martina Nováková, Ph.D. Prof. Ing. Tomáš Macek, CSc. Ing. Neumannová, Ing.
10. Minerální výživa rostlin na extrémních půdách
10. Minerální výživa rostlin na extrémních půdách Extrémní půdy: Kyselé Alkalické Zasolené Kontaminované těžkými kovy Kyselé půdy Procesy vedoucí k acidifikaci (abnormálnímu okyselení): Zvětrávání hornin
Molekulární biotechnologie č.12. Využití poznatků molekulární biotechnologie. Transgenní rostliny.
Molekulární biotechnologie č.12 Využití poznatků molekulární biotechnologie. Transgenní rostliny. Transgenní organismy Transgenní organismus: Organismus, jehož genom byl geneticky modifikován cizorodou
Minerální výživa na extrémních půdách. Půdy silně kyselé, alkalické, zasolené a s vysokou koncentrací těžkých kovů
Minerální výživa na extrémních půdách Půdy silně kyselé, alkalické, zasolené a s vysokou koncentrací těžkých kovů Procesy vedoucí k acidifikaci půd Zvětrávání hornin s následným vymýváním kationtů (draslík,
BIOLOGICKÉ LOUŽENÍ KAMÍNKU Z VÝROBY OLOVA
BIOLOGICKÉ LOUŽENÍ KAMÍNKU Z VÝROBY OLOVA Dana Krištofová,Vladimír Čablík, Peter Fečko a a) Vysoká škola báňská Technická univerzita Ostrava, 17. listopadu 15, 708 33 Ostrava Poruba, ČR, dana.kristofova@vsb.cz
Klonování DNA a fyzikální mapování genomu
Klonování DNA a fyzikální mapování genomu. Terminologie Klonování je proces tvorby klonů Klon je soubor identických buněk (příp. organismů) odvozených ze společného předka dělením (např. jedna bakteriální
Tkáňové kultury rostlin. Mikropropagace
Tkáňové kultury rostlin Mikropropagace IN VITRO KULTURY (EXPLANTÁTOVÉ KUTLURY, ROSTLINNÉ EXPLANTÁTY) Izolované rostliny, jejich orgány, pletiva či buňky pěstované in vitro ve sterilních podmínkách Na kultivačních
EFFECT OF CADMIUM ON TOBACCO CELL SUSPENSION BY-2
EFFECT OF CADMIUM ON TOBACCO CELL SUSPENSION BY-2 Štěpán Z., Klemš M., Zítka O., Havel L. Department of Plant Biology, Faculty of Agronomy, Mendel University in Brno, Zemědělská 1, 613 00 Brno, Czech Republic
Zkušební okruhy k přijímací zkoušce do magisterského studijního oboru:
Biotechnologie interakce, polarita molekul. Hydrofilní, hydrofobní a amfifilní molekuly. Stavba a struktura prokaryotní a eukaryotní buňky. Viry a reprodukce virů. Biologické membrány. Mikrobiologie -
Exprese rekombinantních proteinů
Exprese rekombinantních proteinů Exprese rekombinantních proteinů je proces, při kterém můžeme pomocí různých expresních systémů vytvořit protein odvozený od konkrétního genu, nebo části genu. Tento protein
Úloha protein-nekódujících transkriptů ve virulenci patogenních bakterií
Téma bakalářské práce: Úloha protein-nekódujících transkriptů ve virulenci patogenních bakterií Nové odvětví molekulární biologie se zabývá RNA molekulami, které se nepřekládají do proteinů, ale slouží
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
I n v e s t i c e d o r o z v o j e v z d ě l á v á n í Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním
Příprava vektoru IZOLACE PLASMIDU ALKALICKÁ LYZE, KOLONKOVÁ IZOLACE DNA GELOVÁ ELEKTROFORÉZA RESTRIKČNÍ ŠTĚPENÍ. E. coli. lyze buňky.
Příprava vektoru IZOLCE PLSMIDU LKLICKÁ LYZE, KOLONKOVÁ IZOLCE DN E. coli plasmidová DN proteiny proteiny + + vysrážená plasmidová lyze buňky + snížení ph chromosomální DN centrifugace DN chromosomální
FYTOREMEDIACE LÉČIV A JEJICH REZIDUÍ
FYTOREMEDIACE LÉČIV A JEJICH REZIDUÍ Petr Soudek Ústav experimentální botaniky Akademie věd ČR Centralizovaný rozvojový projekt MŠMT č. C29: Integrovaný systém vzdělávání v oblasti výskytu a eliminace
Fakulta životního prostředí v Ústí nad Labem. Pokročilé metody studia speciace polutantů. (prozatímní učební text, srpen 2012)
Fakulta životního prostředí v Ústí nad Labem Pokročilé metody studia speciace polutantů (prozatímní učební text, srpen 2012) Obsah kurzu: 1. Obecné strategie speciační analýzy. a. Úvod do problematiky
Těžké kovy ve vodních rostlinách
Těžké kovy ve vodních rostlinách Ing. Michaela Hillermannová GEOtest Brno, a.s., Šmahova 112, 659 01 Brno Fytoremediace Remediace proces odstraňování polutantů z životního prostředí Ex-situ In-situ Fytoremediace
Aplikace kalů z ČOV na zemědělskou půdu s ohledem zejména na obsah těžkých kovů v kalech
Aplikace kalů z ČOV na zemědělskou půdu s ohledem zejména na obsah těžkých kovů v kalech Charakteristika kalů z ČOV z hlediska použití na zemědělské půdě Čistírenské kaly jsou složitou heterogenní suspenzí
Rekombinantní protilátky, bakteriofágy, aptamery a peptidové scaffoldy pro analytické a terapeutické účely Luděk Eyer
Rekombinantní protilátky, bakteriofágy, aptamery a peptidové scaffoldy pro analytické a terapeutické účely Luděk Eyer Virologie a diagnostika Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i., Brno Alternativní
Transformace chlorbenzoových kyselin rostlinnými buňkami
Transformace chlorbenzoových kyselin rostlinnými buňkami Blanka Vrchotová, Martina Macková, Jan Tříska, Tomáš Macek Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Fakulta potravinářské a biochemické technologie,
Mendelova genetika v příkladech. Transgenoze rostlin. Ing. Petra VESELÁ, Ústav lesnické botaniky, dendrologie a geobiocenologie LDF MENDELU Brno
Mendelova genetika v příkladech Transgenoze rostlin Ing. Petra VESELÁ, Ústav lesnické botaniky, dendrologie a geobiocenologie LDF MENDELU Brno Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem
Monitorování hladiny metalothioneinu a thiolových sloučenin u biologických organismů vystavených působení kovových prvků a sloučenin
Laboratoř Metalomiky a Nanotechnologií Monitorování hladiny metalothioneinu a thiolových sloučenin u biologických organismů vystavených působení kovových prvků a sloučenin Ing. Kateřina Tmejová, Ph. D.,
6. Mikroelementy a benefiční prvky. 7. Toxické prvky Al a těžké kovy, mechanismy účinku, obranné mechanismy rostlin
1. Základní úvod do problematiky Historie studia minerální výživy rostlin, obecné mechanismy příjmu minerálních živin, transportní procesy na membránách. 2. Příjem minerálních živin kořeny rostlin a jejich
MIKROBIOLOGIE V BIOTECHNOLOGII
Biotechnologie MIKROBIOLOGIE V BIOTECHNOLOGII Využití živých organismů pro uskutečňování definovaných chemických procesů pro průmyslové nebo komerční aplikace Organismus je geneticky upraven metodami genetického
Rich Jorgensen a kolegové vložili gen produkující pigment do petunií (použili silný promotor)
RNAi Rich Jorgensen a kolegové vložili gen produkující pigment do petunií (použili silný promotor) Místo silné pigmentace se objevily rostliny variegované a dokonce bílé Jorgensen pojmenoval tento fenomén
Mendělejevova tabulka prvků
Mendělejevova tabulka prvků V sušině rostlin je obsaženo přibližně 45% uhlíku, 42% kyslíku, 6,5% vodíku, 1,5% dusíku a 5% minerálních prvků. Tzv. organogenní prvky (C, O, H, N) představují tedy 95% veškerých
MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÉ METODY V ENVIRONMENTÁLNÍ MIKROBIOLOGII. Martina Nováková, VŠCHT Praha
MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÉ METODY V ENVIRONMENTÁLNÍ MIKROBIOLOGII Martina Nováková, VŠCHT Praha MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE V BIOREMEDIACÍCH enumerace FISH průtoková cytometrie klonování produktů PCR sekvenování
MIKROBIOLOGIE V BIOTECHNOLOGII
Biotechnologie MIKROBIOLOGIE V BIOTECHNOLOGII Termín biotechnologie byl poprvé použit v roce 1917 Procesy, při kterých se na tvorbě výsledného produktu podílejí živé organismy Širší definice: biotechnologie
1. Metodika. Protokol č. F1-4 Metodika: Srovnávací analýza efektivity přípravy rekombinantního proteinu ve fermentoru
Protokol č.: F1-4 Datum: 20.12.2010 Metodika: analýza efektivity přípravy výběr z výsledků ze zkušebních provozů výroby antigenů. Vypracoval: Ing. Václav Filištein, Mgr. Tereza Chrudimská, Spolupracující
Genové knihovny a analýza genomu
Genové knihovny a analýza genomu Klonování genů Problém: genom organismů je komplexní a je proto obtížné v něm najít a klonovat specifický gen Klonování genů Po restrikčním štěpení genomové DNA pocházející
Molekulární základy dědičnosti. Ústřední dogma molekulární biologie Struktura DNA a RNA
Molekulární základy dědičnosti Ústřední dogma molekulární biologie Struktura DNA a RNA Ústřední dogma molekulární genetiky - vztah mezi nukleovými kyselinami a proteiny proteosyntéza replikace DNA RNA
Zdrojem je mrna. mrna. zpětná transkriptáza. jednořetězcová DNA. DNA polymeráza. cdna
Obsah přednášky 1) Klonování složených eukaryotických genů 2) Úprava rekombinantních genů 3) Produkce rekombinantních proteinů v expresních systémech 4) Promotory 5) Vektory 6) Reportérové geny Zdrojem
Izolace nukleových kyselin
Izolace nukleových kyselin Požadavky na izolaci nukleových kyselin V nativním stavu z přirozeného materiálu v dostatečném množství požadované čistotě. Nukleové kyseliny je třeba zbavit všech látek, které
Fytoremediace I. Petr Soudek Laboratoř rostlinných biotechnologií Ústav experimentální botaniky Akademie věd České Republiky
Fytoremediace I. Petr Soudek Laboratoř rostlinných biotechnologií Ústav experimentální botaniky Akademie věd České Republiky ZDROJE KONTAMINACE Těžké kovy ZDROJE KONTAMINACE Radionuklidy ZDROJE KONTAMINACE
AUG STOP AAAA S S. eukaryontní gen v genomové DNA. promotor exon 1 exon 2 exon 3 exon 4. kódující oblast. introny
eukaryontní gen v genomové DNA promotor exon 1 exon 2 exon 3 exon 4 kódující oblast introny primární transkript (hnrna, pre-mrna) postranskripční úpravy (vznik maturované mrna) syntéza čepičky AUG vyštěpení
Metody práce s proteinovými komplexy
Metody práce s proteinovými komplexy Zora Nováková, Zdeněk Hodný Proteinové komplexy tvořeny dvěma a více proteiny spojenými nekovalentními vazbami Van der Waalsovy síly vodíkové můstky hydrofobní interakce
PROBLÉMY ŽIVOTNÍHO PROSTŘEDÍ PŮDA
PROBLÉMY ŽIVOTNÍHO PROSTŘEDÍ PŮDA 2010 Ing. Andrea Sikorová, Ph.D. 1 Problémy životního prostředí - půda V této kapitole se dozvíte: Jak vznikla půda. Nejvýznamnější škodliviny znečištění půd. Co je to
DETECTION OF FUNGAL CONTAMINATIONS IN POWDERED PEPPER USING MOLECULAR BIOLOGICAL METHODS
DETECTION OF FUNGAL CONTAMINATIONS IN POWDERED PEPPER USING MOLECULAR BIOLOGICAL METHODS DETEKCE HOUBOVÝCH KONTAMINACÍ V PRÁŠKOVÉ PAPRICE POMOCÍ MOLEKULÁRNĚ BIOLOGICKÝCH METOD Trojan V., Hanáček P., Havel
SLEDOVÁNÍ VÝSKYTU GENOTOXICKÝCH LÁTEK V POVODÍ ŘEKY SVRATKY V SOUVISLOSTI S URANOVÝM PRŮMYSLEM
SLEDOVÁNÍ VÝSKYTU GENOTOXICKÝCH LÁTEK V POVODÍ ŘEKY SVRATKY V SOUVISLOSTI S URANOVÝM PRŮMYSLEM Jana Badurová, Hana Hudcová, Radoslava Funková, Helena Mojžíšková, Jana Svobodová Toxikologická rizika spojená
ISOLATION OF PHOSPHOPROTEOM AND ITS APPLICATION IN STUDY OF THE EFFECT OF CYTOKININ ON PLANTS
ISOLATION OF PHOSPHOPROTEOM AND ITS APPLICATION IN STUDY OF THE EFFECT OF CYTOKININ ON PLANTS IZOLACE FOSFOPROTEOMU A JEHO VYUŽITÍ PŘI STUDIU ÚČINKU CYTOKININŮ NA ROSTLINU Černý M., Brzobohatý B. Department
Transformace ptdna tabáku genem E7/GUS a eliminace selekčního genu za využití homologní rekombinace
Transformace ptdna tabáku fúzním genem E7/GUS a eliminace selekčního genu za využití homologní rekombinace Jiřich ich BřízaB 1,, Josef Vlasák 1, Štěpán n Ryba, Viera Ludvíkov ková 3, Hana Niedermeierová
Molekulární biotechnologie. Nový obor, který vznikl koncem 70. let 20. století (č.1)
Molekulární biotechnologie Nový obor, který vznikl koncem 70. let 20. století (č.1) Molekulární biotechnologie je založena Na přenosu genů z jednoho organismu do druhého Jeden organismus má gen, který
Abiotický stres - sucho
FYZIOLOGIE STRESU Typy stresů Abiotický (vliv vnějších podmínek) sucho, zamokření, zasolení půd, kontaminace prostředí toxickými látkami, chlad, mráz, vysoké teploty... Biotický (způsobený jiným druhem
Dusík. - nejdůležitější minerální živina (2-5% SH)
Dusík - nejdůležitější minerální živina (2-5% SH) - dostupnost dusíku ovlivňuje: - produkci biomasy a její distribuci - ontogenetický vývoj - hormonální rovnováhu (cytokininy, ABA) - rychlost fotosyntézy
Aplikace nano-sorbentů pro stabilizaci Pb a Zn v kontaminované půdě
Aplikace nano-sorbentů pro stabilizaci Pb a Zn v kontaminované půdě Martina Vítková, Z. Michálková, L. Trakal, M. Komárek Katedra geoenvironmentálních věd, Fakulta životního prostředí, Česká zemědělská
BAKTERIÁLNÍ REZISTENCE
BAKTERIÁLNÍ REZISTENCE Petr Zouhar, Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.; UK v Praze, PřF, Katedra fyziologie V této úloze se v hrubých rysech seznámíte s některými metodami používanými v běžné molekulárně
Nové přístupy v modifikaci funkce genů: CRISPR/Cas9 systém
Nové přístupy v modifikaci funkce genů: CRISPR/Cas9 systém Lesk a bída GM plodin Lesk a bída GM plodin Problémy konstrukce GM plodin: 1) nízká efektivita 2) náhodnost integrace transgenu 3) legislativa
2. Z následujících tvrzení, týkajících se prokaryotické buňky, vyberte správné:
Výběrové otázky: 1. Součástí všech prokaryotických buněk je: a) DNA, plazmidy b) plazmidy, mitochondrie c) plazmidy, ribozomy d) mitochondrie, endoplazmatické retikulum 2. Z následujících tvrzení, týkajících
OBORU MINERÁLNÍ BIOTECHNOLOGIE
Státní závěrečné zkoušky OBORU MINERÁLNÍ BIOTECHNOLOGIE akademický rok 2016/2017 magisterské studium Moderní metody biotechnologie 1. Základy cytogenetiky stavba a funkce chromozómů, organizace chromozómů
ROZLIŠENÍ KONTAMINOVANÉ VRSTVY NIVNÍHO SEDIMENTU OD PŘÍRODNÍHO POZADÍ
E M ROZLIŠENÍ KONTAMINOVANÉ VRSTVY NIVNÍHO SEDIMENTU OD PŘÍRODNÍHO POZADÍ Tento materiál byl vytvořen v rámci projektu OPVK Modernizace výuky technických a přírodovědných oborů na UJEP se zaměřením na
Terapeutické klonování, náhrada tkání a orgánů
Transfekce, elektroporace, retrovirová infekce Vnesení genů Vrstva fibroblastů, LIF Terapeutické klonování, náhrada tkání a orgánů Selekce ES buněk, v nichž došlo k začlenění vneseného genu homologní rekombinací
Molekulárn. rní. biologie Struktura DNA a RNA
Molekulárn rní základy dědičnosti Ústřední dogma molekulárn rní biologie Struktura DNA a RNA Ústřední dogma molekulárn rní genetiky - vztah mezi nukleovými kyselinami a proteiny proteosyntéza replikace
Síra. Deficience síry: řepka. - 0,2-0,5% SH, nedostatek při poklesu obsahu síranů pod 0,01% SH
Síra řepka - 0,2-0,5% SH, nedostatek při poklesu obsahu síranů pod 0,01% SH - toxicita není příliščastá (nad 4000 mg SO 4 2- l -1 ), poškození může vyvolat SO 2 (nad 1-1,5 mg m 3 1 ) fazol Deficience síry:
Metody používané v MB. analýza proteinů, nukleových kyselin
Metody používané v MB analýza proteinů, nukleových kyselin Nukleové kyseliny analýza a manipulace Elektroforéza (délka fragmentů, čistota, kvantifikace) Restrikční štěpení (manipulace s DNA, identifikace
Metody používané v MB. analýza proteinů, nukleových kyselin
Metody používané v MB analýza proteinů, nukleových kyselin Nukleové kyseliny analýza a manipulace Elektroforéza (délka fragmentů, čistota, kvantifikace) Restrikční štěpení (manipulace s DNA, identifikace
Hořčík. Příjem, metabolismus, funkce, projevy nedostatku
Hořčík Příjem, metabolismus, funkce, projevy nedostatku Příjem a pohyb v rostlině Příjem jako ion Mg 2+, pasivní, iont. kanály Mobilní ion v xylému i ve floému, možná retranslokace V místě funkce vázán
Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/28.0018
Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a Státním rozpočtem ČR InoBio CZ.1.07/2.2.00/28.0018 2.4 GENETICKÉ MANIPULACE in vitro - nekonvenční techniky, kterými lze modifikovat rostlinný
RESEARCH OF ANAEROBIC FERMENTATION OF ORGANIC MATERIALS IN SMALL VOLUME BIOREACTORS
RESEARCH OF ANAEROBIC FERMENTATION OF ORGANIC MATERIALS IN SMALL VOLUME BIOREACTORS Trávníček P., Vítěz T., Dundálková P., Karafiát Z. Department of Agriculture, Food and Environmental Engineering, Faculty
Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ
Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ Ivo Frébort 5. Metody molekulární biologie II DNA footprinting hledání interakcí DNA s proteiny Polymerázová řetězová reakce (Polymerase chain reaction PCR) Malé
VÝVOJ DNA ČIPŮ PRO DETEKCI GENETICKY MODIFIKOVANÝCH ORGANISMŮ
VÝVOJ DNA ČIPŮ PRO DETEKCI GENETICKY MODIFIKOVANÝCH ORGANISMŮ Lucie Vištejnová 2, Jan Hodek 1, Patrik Sekerka 2, Jaroslava Ovesná 1, Kateřina Demnerová 2 1. Výzkumný ústav rostlinné výroby, Drnovská 507,
GENOTOXICITA A ZMĚNY V GENOVÉ EXPRESI
GENOTOXICITA A ZMĚNY V GENOVÉ EXPRESI INDUKOVANÉ PŮSOBENÍM ORGANICKÝCH LÁTEK Z PRACHOVÝCH ČÁSTIC V OVZDUŠÍ Kateřina Hanzalová Oddělení genetické ekotoxikologie Ústav experimentální medicíny AV ČR v.v.i.
DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU
Úvod IntellMed, s.r.o., Václavské náměstí 820/41, 110 00 Praha 1 DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KOLOREKTÁLNÍHO KARCINOMU Jednou z nejvhodnějších metod pro detekci minimální
Doprovodný materiál k práci s přípravným textem Biologické olympiády 2014/2015 pro soutěžící a organizátory kategorie B
Doprovodný materiál k práci s přípravným textem Biologické olympiády 2014/2015 pro soutěžící a organizátory kategorie B Níže uvedené komentáře by měly pomoci soutěžícím z kategorie B ke snazší orientaci
Tématické okruhy pro státní závěrečné zkoušky
Tématické okruhy pro státní závěrečné zkoušky Obor Povinný okruh Volitelný okruh (jeden ze dvou) Forenzní biologická Biochemie, pathobiochemie a Toxikologie a bioterorismus analýza genové inženýrství Kriminalistické
VÝZKUM MOŽNOSTÍ POUŽITÍ ENERGETICKÝCH ROSTLIN PRO FYTOREMEDIACE
VÝZKUM MOŽNOSTÍ POUŽITÍ ENERGETICKÝCH ROSTLIN PRO FYTOREMEDIACE RESEARCH ON THE USE OF ENERGY CROPS FOR PHYTOREMEDIATION J. Kára, P. Hutla, I. Hanzlíková Výzkumný ústav zemědělské techniky, v. v. i., Praha.
Ing. Dagmar Sirotková. Přístupy k hodnocení BRO
Ing. Dagmar Sirotková Přístupy k hodnocení BRO BRO BRO BRO BRO BRO BRO BRO BRO BRO BRO Pojmy Biologicky rozložitelný odpad jakýkoli odpad, který podléhá aerobnímu nebo anaerobnímu rozkladu Biologický odpad
Cílená konstrukce bioaugmentačních preparátů a jejich pozice v procesu efektivních bioremediací
Cílená konstrukce bioaugmentačních preparátů a jejich pozice v procesu efektivních bioremediací Průmyslová ekologie 2011 Bioaugmentace cílené vnesení mikrobiální populace v podobě tzv. biopreparátu (inokula)
Využití a registrace popela ze spalování biomasy jako hnojiva Tomáš Rosenberg
Klastr bioplyn, z.s.p.o. Hájecká 215 273 51 Červený Újezd tel : +420 732711998 e-mail: info@klastrbioplyn.cz Využití a registrace popela ze spalování biomasy jako hnojiva Tomáš Rosenberg Popel ze spalování
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Genomika (KBB/GENOM) Fyzické mapování Fyzické cytogenetické a fyzické molekulární mapy Ing. Hana Šimková, CSc. Cíl přednášky
ROZDĚLENÍ A POŽADAVKY NA KATEGORIE FUNKCE VÝROBKU, KATEGORIE SLOŽKOVÝCH MATERIÁLŮ. Jana Meitská Sekce zemědělských vstupů ÚKZÚZ Brno
ROZDĚLENÍ A POŽADAVKY NA KATEGORIE FUNKCE VÝROBKU, KATEGORIE SLOŽKOVÝCH MATERIÁLŮ Jana Meitská Sekce zemědělských vstupů ÚKZÚZ Brno KATEGORIE HNOJIVÝCH VÝROBKŮ (DLE FUNKCE) 1. Hnojivo 2. Materiál k vápnění
Název: Vypracovala: Datum: 7. 2. 2014. Zuzana Lacková
Název: Vypracovala: Zuzana Lacková Datum: 7. 2. 2014 Reg.č.projektu: CZ.1.07/2.4.00/31.0023 Název projektu: Partnerská síť centra excelentního bionanotechnologického výzkumu MĚLI BYCHOM ZNÁT: informace,
PERSPEKTIVES OF WEGETABLE WASTE COMPOSTING PERSPEKTIVY KOMPOSTOVÁNÍ ZELENINOVÉHO ODPADU
PERSPEKTIVES OF WEGETABLE WASTE COMPOSTING PERSPEKTIVY KOMPOSTOVÁNÍ ZELENINOVÉHO ODPADU Mach P., Tesařová M., Mareček J. Department of Agriculture, Food and Environmental Engineering, Faculty of Agronomy,
Inovace studia molekulární a buněčné biologie
Investice do rozvoje vzdělávání Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. Investice do rozvoje vzdělávání
Základy pedologie a ochrana půdy
Základy pedologie a ochrana půdy 6. přednáška VZDUCH V PŮDĚ = plynná fáze půdy Význam (a faktory jeho složení): dýchání organismů výměna plynů mezi půdou a atmosférou průběh reakcí v půdě Formy: volně
INTERACTIONS OF MICROORGANISMS AND PLANTS IN THE ENVIRONMENT CONTAMINATED BY PCBS INTERAKCE ROSTLIN A MIKROORGANISMŮ V PROSTŘEDÍ KONTAMINOVANÉM PCB
INTERACTIONS OF MICROORGANISMS AND PLANTS IN THE ENVIRONMENT CONTAMINATED BY PCBS INTERAKCE ROSTLIN A MIKROORGANISMŮ V PROSTŘEDÍ KONTAMINOVANÉM PCB Petr Štursa 1), Martina Macková 1, 2), Lucie Kochánková
VYLUHOVATELNOST RTUTI SEKVENČNÍ EXTRAKCÍ. VLASTA ŠTEFANIDESOVÁ a TÁŇA TREFILOVÁ
VYLUHOVATELNOST RTUTI SEKVENČNÍ EXTRAKCÍ VLASTA ŠTEFANIDESOVÁ a TÁŇA TREFILOVÁ Vysokoškolský ústav chemie materiálů, Vysoká škola báňská Technická univerzita Ostrava, tř. 17. listopadu 15, 708 33 Ostrava
TESTOVÁNÍ GMO Praktikum fyziologie rostlin
Teoretický úvod: TESTOVÁNÍ GMO Praktikum fyziologie rostlin 1 Teoretický úvod: TESTOVÁNÍ GMO Obecně na úvod Určitě jste už slyšeli pojem geneticky modifikovaný organismus (GMO). Úprava vlastností přirozeně
Klonování gen a genové inženýrství
Klonování gen a genové inženýrství Genové inženýrství užite né termíny Rekombinantní DNA = DNA, ve které se nachází geny nejmén ze dvou zdroj, asto ze dvou zných druh organism Biotechnologie = manipulace
Bakalářské práce. Magisterské práce. PhD práce
Bakalářské práce Magisterské práce PhD práce Témata bakalářských prací na školní rok 2017-2018 1 Název Fenotypová analýza vybraných dvojitých mutantů MAPK v podmínkách abiotického stresu. Školitel Mgr.
DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KARCINOMU PANKREATU
Úvod IntellMed, s.r.o., Václavské náměstí 820/41, 110 00 Praha 1 DIAGNOSTICKÝ KIT PRO DETEKCI MINIMÁLNÍ REZIDUÁLNÍ CHOROBY U KARCINOMU PANKREATU Jednou z nejvhodnějších metod pro detekci minimální reziduální
Bakalářské práce. Magisterské práce. PhD práce
Bakalářské práce Magisterské práce PhD práce Témata bakalářských prací na školní rok 2015-2016 1 Název Funkční analýza jaderných proteinů fosforylovaných pomocí mitogenaktivovaných proteinkináz. Školitel
Vliv selenu, zinku a kadmia na růstový vývoj česneku kuchyňského (Allium sativum L.)
Vliv selenu, zinku a kadmia na růstový vývoj česneku kuchyňského (Allium sativum L.) Botanická charakteristika: ČESNEK KUCHYŇSKÝ (ALLIUM SATIVUM L.) Pravlastí je Džungarsko (severní Čína) v Střední Asii,
Využití metod strojového učení v bioinformatice David Hoksza
Využití metod strojového učení v bioinformatice David Hoksza SIRET Research Group Katedra softwarového inženýrství, Matematicko-fyzikální fakulta Karlova Univerzita v Praze Bioinformatika Biologické inspirace
Izolace RNA. doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD..
Izolace RNA doc. RNDr. Jan Vondráček, PhD.. Metodiky izolace RNA celková buněčná RNA ( total RNA) zahrnuje řadu typů RNA, které se mohou lišit svými fyzikálněchemickými vlastnostmi a tedy i nároky na jejich
spolupráce Vás zve na seminář: Abstrakt potenciál oblasti číslem k financování. projektu aplikacích. nicméně zůstává z důvodu administrativních
Vás zve na seminář: Projekt NANOLABSYS s názvem Mezináro odní spolupráce v oblasti "in vivo" zobrazovacích technik Prof. Ing. René Kizek, Ph.D. Abstrakt Rozvoj lidského potenciálu v oblasti výzkumu a inovací,
Interakce proteinu p53 s genomovou DNA v kontextu chromatinu glioblastoma buněk
MASARYKOVA UNIVERZITA V BRNĚ Přírodovědecká fakulta Ústav experimentální biologie Oddělení genetiky a molekulární biologie Interakce proteinu p53 s genomovou DNA v kontextu chromatinu glioblastoma buněk
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354
I n v e s t i c e d o r o z v o j e v z d ě l á v á n í Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním
CONTRIBUTION TO UNDERSTANDING OF CORRELATIVE ROLE OF COTYLEDON IN PEA (Pisum sativum L.)
CONTRIBUTION TO UNDERSTANDING OF CORRELATIVE ROLE OF COTYLEDON IN PEA (Pisum sativum L.) PŘÍSPĚVEK K POZNÁNÍ KORLAČNÍ FUNKCE DĚLOHY U HRACHU (Pisum sativum L.) Mikušová Z., Hradilík J. Ústav Biologie rostlin,
Magnetotaktické bakterie
Magnetotaktické bakterie G- bakterie, objeveny v 60.l. 20.stol. koky, bacily, vibria, spirily; pohyb bičíky obligátně mikroaerofilní nebo anaerobní negativní aerotaxe výskyt: svrchní sedimenty ve vodě
NÁVRH A PŘÍPRAVA PEPTIDŮ A LIPOPEPTIDŮ S ANTIMIKROBIÁLNÍM ÚČINKEM A STUDIUM JEJICH BIOLOGICKÝCH VLASTNOSTÍ
NÁVRH A PŘÍPRAVA PEPTIDŮ A LIPOPEPTIDŮ S ANTIMIKROBIÁLNÍM ÚČINKEM A STUDIUM JEJICH BIOLOGICKÝCH VLASTNOSTÍ A. Macůrková R. Ježek P. Lovecká V. Spiwok P. Ulbrich T. Macek Antimikrobiální peptidy přírodní
STARÉ ZÁTĚŽE. ÚKZÚZ sleduje hladiny obsahů hladiny obsahů (nikoli hladiny kontaminace) RP a látek v zemědělských půdách
STARÉ ZÁTĚŽE (www.mzp.cz, 1. 9. 2014) Za starou ekologickou zátěž je považována závažná kontaminace horninového prostředí, podzemních nebo povrchových vod, ke které došlo nevhodným nakládáním s nebezpečnými
Molekulární biotechnologie č.9. Cílená mutageneze a proteinové inženýrství
Molekulární biotechnologie č.9 Cílená mutageneze a proteinové inženýrství Gen kódující jakýkoliv protein lze izolovat z přírody, klonovat, exprimovat v hostitelském organismu. rekombinantní protein purifikovat
Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ
Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ Ivo Frébort 4. Metody molekulární biologie I Izolace DNA a RNA Specifické postupy pro baktérie, kvasinky, rostlinné a živočišné tkáně U RNA nutno zabránit kontaminaci
PCR IN DETECTION OF FUNGAL CONTAMINATIONS IN POWDERED PEPPER
PCR IN DETECTION OF FUNGAL CONTAMINATIONS IN POWDERED PEPPER Trojan V., Hanáček P., Havel L. Department of Plant Biology, Faculty of Agronomy, Mendel University of Agriculture and Forestry in Brno, Zemedelska
Inovace studia molekulární a buněčné biologie
Inovace studia molekulární a buněčné biologie Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky. OBVSB/Obecná virologie Tento projekt je spolufinancován Evropským
Replikace, transkripce a translace
Replikace, transkripce a translace Pravděpodobnost zařazení chybné báze cca 1:10 4, reálně 1:10 10 ; Proč? Výběr komplementární base je zásadní pro správnost mezigeneračního předávání genetické informace
Příprava rekombinantních molekul pro diagnostické účely
1 Příprava rekombinantních molekul pro diagnostické účely doc. RNDr. Milan Bartoš, Ph.D. bartosm@vfu.cz Přírodovědecká fakulta MU, 2014 2 Obsah přednášky 1) Pojem rekombinantní DNA 2) Historické milníky
Modifikace dědičné informace rostlin I. modifikace
Modifikace dědičné informace rostlin I Klasická genetická modifikace Lukáš Fischer, KEBR Legislativa: Genetická modifikace (GM) = vnesení genetické informace (úseku DNA) či změna > 20 nt způsobem, který
Chemie životního prostředí III Pedosféra (07) Znečištění půd
Centre of Excellence Chemie životního prostředí III Pedosféra (07) Znečištění půd Ivan Holoubek RECETOX, Masaryk University, Brno, CR holoubek@recetox. recetox.muni.cz; http://recetox.muni muni.cz Pedosféra