Přehled pedagogické činnosti - doc. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D. Pedagogická činnost Akademický rok 2003/2004 Přednáška: Biofyzikální chemie (C260P43) volitelná pro všechny obory rozsah: 2/1, Zk, letní semestr (spolu s prof. V. Karpenkem a prof. Z. Pavlíčkem) volitelná pro všechny obory Akademický rok 2004/2005 2005/2006 volitelná pro všechny obory (spolu s prof. V. Karpenkem) volitelná pro všechny obory povinné pro Bc. studijní obory Chemie v přírodních vědách (studijní program Chemie) a Biochemie (studijní program 2006/2007. (spolu s prof. V. Karpenkem) povinné pro Bc. Studijní obory Chemie v přírodních vědách (studijní program Chemie) a Biochemie (studijní program 1
2007/2008 povinná pro Bc. studijní obor Chemie životního prostředí povinné pro Bc. obor Chemie v přírodních vědách (studijní program Chemie) a Bc. obor Biochemie (studijní program 2008/2009 povinná pro Bc. obor Chemie životního prostředí povinné pro Bc. obor Chemie v přírodních vědách (studijní program Chemie) a Bc. obor Biochemie (studijní program 2
2009/2010.. povinná pro Bc. obor Chemie životního prostředí povinné pro Bc. obor Chemie v přírodních vědách (studijní program Chemie) a Bc. obor Biochemie (studijní program 2010/2011.. povinná pro Bc. obor Chemie životního prostředí 2011/2012. 3
povinná pro Bc. studijní obor Chemie životního prostředí 2012/2013 Další pedagogická činnost - Člen zkušební komise pro státní magisterské a státní rigorózní zkoušky v navazujícím magisterském studijním programu/oboru Biochemie. - Člen zkušební komise pro státní bakalářské zkoušky v bakalářském studijním programu/oboru Biochemie. - Člen oborové rady doktorského studijního programu Fyzikální chemie (od roku 2005). - Člen zkušebních komisí pro státní magisterské a státní rigorózní zkoušky v navazujícím magisterském studijním programu Chemie. - Člen zkušebních komisí pro státní bakalářské zkoušky oborů v rámci bakalářského studijního programu Chemie. - Garant navazujícího magisterského studijního oboru Biofyzikální chemie (od roku 2008). Vedení bakalářských prací Veronika Klatovská Eliška Nedbálková Tereza Šafránková Dana Veisová roz. Urychová Příprava tryptofanových mutantů forkhead transkripčního faktoru FoxO4. (obhájeno 2003/2004, obor: KATA) Příprava rekombinantního plasmidu pro expresi ATP-vazebné domény iontového kanálu P2X. (obhájeno 2003/2004, obor: KATA) Cílená mutagenese fosforylačních míst Forkhead transkripčního faktoru FoxO4. (obhájeno 2005/2006, obor: KATA) Cílená mutagenese Trp228 lidského 14-3-3 proteinu. (obhájeno 2006/2007, obor: KATA) 4
Lucie Magrlová Lenka Řežábková Eva Macáková Hana Bártová Miroslava Kopecká Miroslava Kacířová Iva Zusková Kateřina Koláčková Optimalizace purifikačního protokolu pro PhLP ( Phosducin like protein ). (obhájeno 2006/2007, obor: Cílená mutagenese regulátoru G proteinové signalizace RGS3. (obhájeno 2006/2007, obor: Cílená mutagenese a exprese DNA-vazebné domény proteinu FOXO4. (obhájeno 2007/2008, obor: Chemie životního prostředí) Přehled současných znalostí o struktuře a funkci 14-3-3 proteinů. (obhájeno 2007/2008, obor: Chemie životního prostředí) Studium struktury a funkce proteinů účastnících se přenosu signálu v buňce. (obhájeno 2008/2009, obor: KATA) Studium stechiometrie komplexu 14-3-3 proteinu s RGS3 proteinem. (obhájeno 2008/2009, obor: Studium interakce C-konce DNA-vazebné domény FOXO4 s DNA. (obhájeno 2009/2010, obor: Chemie v přírodních vědách) Příprava expresních konstruktů interakčních partnerů fosducinu. (obhájeno 2011/2012, obor: Vedení diplomových prací Evžen Bouřa Anna Pabianová Jan Šilhán Veronika Klatovská Eliška Nedbálková Petr Vácha Studium interakcí C-konce DNA vazebné domény proteinu AFX (FoxO4) s DNA. (obhájeno 2004/2005, obor: Fyzikální chemie) Studium interakcí mezi DNA vazebnou doménou forkhead transkripčního faktoru FoxO4 a 14-3-3 proteinem. (obhájeno 2004/2005, obor: Fyzikální chemie) Studium konformace C-terminálního segmentu 14-3-3 proteinu. (obhájeno 2004/2005, obor: Příprava a charakterizace N-terminálně zkrácené verze enzymu serotonin N-acetyltransferázy. (obhájeno 2005/2006, obor: KATA) Příprava komplexů 14-3-3 proteinu a tryptofanových mutantů regulační domény tyrozin hydroxylázy. (obhájeno 2005/2006, obor: KATA) Příprava DNA vazebné domény transkripčního faktoru FoxO4 pro tryptofanová fluorescenční měření. (obhájeno 2005/2006, obor: Didaktika chemie a biologie) 5
Karel Berka Lucie Kohoutová Pavla Strnadová Dana Veisová Lenka Řežábková Lucie Magrlová Hana Bártová Eva Macáková Miroslava Kopecká Miroslava Kacířová Iva Zusková Modelling of ligand binding site structure of the human MT2 melatonin receptor. (obhájeno 2005/2006, obor: Fyzikální chemie) Úloha ohybu H8-H9 ve vazebných vlastnostech 14-3-3 proteinů. (obhájeno 2007/2008, obor: Využití lanthanoidové luminiscenční spektroskopie ke studiu vazby dvojmocných kationtů na 14-3-3 proteiny. (obhájeno 2007/2008, obor: Studium konformace C-koncového segmentu kvasničných isoforem 14-3-3 proteinů. (obhájeno 2008/2009, obor: KATA) Vliv vazby 14-3-3 proteinu na strukturu RGS domény proteinu RGS3. (obhájeno 2008/2009, obor: Studium interakce 14-3-3 proteinů s proteiny rodiny phosducinů. (obhájeno 2008/2009, obor: Exprese a purifikace kinasové domény ASK1 kinasy. (obhájeno 2009/2010, obor: Chemie životního prostředí) Studium strukturních rozdílů mezi isoformami 14-3-3 proteinů. (obhájeno 2009/2010, obor: Chemie životního prostředí) Příprava vazebných partnerů 14-3-3 proteinů pro strukturní studie. (obhájeno 2010/2011, obor: KATA) Studium struktury komplexu 14-3-3:fosducin. (obhájeno 2010/2011, obor: Biofyzikální chemie) Studium mechanismu rozpoznávání DNA transkripčním faktorem FOXO4. (obhájeno 2011/2012, obor: Biofyzikální chemie) Vedení doktorských disertačních prací Mgr. Evžen Bouřa RNDr. Jan Šilhán Mgr. Lenka Řežábková Molekulární mechanismy regulace forkhead transkripčního faktoru FOXO4. (obhájeno 17. 9. 2008, obor: Fyzikální chemie) Studium molekulárních mechanismů funkce 14-3-3 proteinů. (obhájeno 7. 1. 2009, obor: Fyzikální chemie) Studium úlohy proteinů 14-3-3 v regulaci G-proteinové signalizace. (obhájeno 10. 12. 2012, obor: Fyzikální chemie) 6
Mgr. Petr Vácha Mgr. Dalibor Košek Studium struktury komplexů proteinů 14-3-3. (řešena od roku 2006, obor: Fyzikální chemie) Úloha proteinů 14-3-3 v regulaci enzymové aktivity. (řešena od roku 2011, obor: Fyzikální chemie) Mgr. Miroslava Kacířová Mechanismus regulace funkce fosducinu. (řešena od roku 2011, obor: Fyzikální chemie) 18. 12. 2012 doc. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D. doc. RNDr. Petr Nachtigall, Ph.D. Vedoucí katedry fyzikální a makromolekulární chemie PřF UK 7