PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA JIHOČESKÉ UNIVERZITY

Podobné dokumenty
Soulad studijního programu. Molekulární a buněčná biologie

Soulad studijního programu. Ochrana a tvorba krajiny. Biologie, ekologie a životní prostředí

Děkan Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích R o z h o d n u t í

MATEMATICKÁ BIOLOGIE

Děkan Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích

Výuka genetiky na Přírodovědecké fakultě UK v Praze

Standard studijního programu Hydrobiologie A. Specifika a obsah studijního programu:

Excelence doktorského studia na AF MENDELU pro navazující evropskou vědecko výzkumnou kariéru CZ.1.07/2.3.00/ Klíčová aktivita č.

Standard studijního programu Experimentální biologie rostlin

Výuka genetiky na Přírodovědecké fakultě MU

Směrnice děkana č. 2/2010. Doktorský studijní program Kinantropologie na Fakultě sportovních studií Masarykovy univerzity

P 7310 Filologie SLOVANSKÉ LITERATURY

P 8109 Obecná teorie a dějiny umění a kultury DĚJINY VÝTVARNÉHO UMĚNÍ

dekan Prírodovedecké fakulty JU Branišovská31, CZ Ceské Budejovice Dekan

Libor Hájek, , Centrum regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum, Přírodovědecká fakulta, Šlechtitelů 27, Olomouc

Standard studijního programu Experimentální biologie

Rámcová pravidla doktorského studia Filmové a televizní fakulty Akademie múzických umění v Praze platná od 1. listopadu 2017

P 7310 Filologie TEORIE A DĚJINY LITERATUR ZEMÍ ASIE A AFRIKY

Podmínky přijetí ke studiu v doktorských studijních programech na Fakultě stavební VŠB-TU Ostrava

Informace o studiu v doktorských studijních programech

Jaro 2010 Kateřina Slavíčková

přednášek domácího nebo zahraničního hosta na pracovišti. Součástí volitelné části studijního plánu je i podíl studenta na pedagogické činnosti

Podmínky přijetí ke studiu v doktorských studijních programech na Fakultě stavební VŠB-TUO platné od

Kritéria pro hodnocení přijímacích zkoušek v roce 2008

VÝBĚROVÁ ŘÍZENÍ CENTRUM REGIONU HANÁ PROJEKT EXCELENTNÍ VÝZKUM (OP VVV)

Podmínky pro hodnocení žáka v předmětu biologie

Směrnice děkana č. 2/2010. Doktorský studijní program Kinantropologie na Fakultě sportovních studií Masarykovy univerzity

Studijní obor: Bioanalytik odborný pracovník v laboratorních metodách

Doktorské studium

ŘÁD CELOŽIVOTNÍHO VZDĚLÁVÁNÍ na Vysoké škole chemicko-technologické v Praze ze dne 18. září 2017

Vysoká škola ekonomická v Praze Fakulta managementu v Jindřichově Hradci Opatření děkana Fakulty managementu č. 7/2016

DOKTORSKÉ ( POSTGRADUÁLNÍ ) STUDIUM NA FARMACEUTICKÉ FAKULTĚ UK

Článek 1 Obecná ustanovení

Směrnice děkana 8/2014 Organizace studia v doktorských studijních oborech

P 7311 Anglistika-amerikanistika ANGLICKÁ A AMERICKÁ LITERATURA

Zápis ze zasedání Vědecké rady Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích dne

P 7311 Anglistika-amerikanistika ANGLICKÁ A AMERICKÁ LITERATURA Vstupní požadavky Uchazeč o studium by měl být absolventem magisterského studia

Soulad studijního programu. Bioanorganická chemie

Standard studijního programu Didaktika chemie

Podmínky pro hodnocení žáka v předmětu biologie

Podmínky pro hodnocení žáka v předmětu biologie

Směrnice děkana č. 3/2013. Hodnocení práce studentů doktorských studijních programů na FSI VUT v Brně. Část první

OBOROVÁ RADA BIOCHEMIE A PATOBIOCHEMIE

Kritéria pro hodnocení přijímacích zkoušek v roce 2010

Informace o studiu v doktorských studijních programech

Přírodní vědy. Doplňující pedagogické studium - geografie - učitelství pro SŠ a ZŠ

Hydrobiologie. Entomologie

Katedra chemie (130)

Fakultní školy. Přírodovědecká fakulta. Univerzity Palackého v Olomouci 2. prosince 2013

PRAVIDLA PRO ORGANIZACI STUDIA V DOKTORSKÝCH

Studijní program je těsně vázán na vědeckou činnost Katedry experimentální fyziky PřF UP či praxí Forma studia

Soulad studijního programu. Organická chemie. 1402T001 Organická chemie

Pravidla pro organizaci doktorského studia na Institutu mezinárodních studií Fakulty sociálních věd Univerzity Karlovy platná od ZS 2017/2018

Informace o studiu. Životní prostředí a zdraví Matematická biologie a biomedicína. studijní programy pro zdravou budoucnost

Řád celoživotního vzdělávání na Vysoké škole chemicko-technologické v Praze ze dne 25. června 2010

Podmínky přijímacího řízení ke studiu navazujících magisterských studijních oborů na Přírodovědecké fakultě UK pro akademický rok 2017/2018

Bc Doktorský studijní program (obor) a témata disertačních prací Vysoká škola

INFORMACE O STUDIJNÍCH PROGRAMECH A OBORECH NA PEDAGOGICKÉ FAKULTĚ PRO AKADEMICKÝ ROK 2017/2018

Aplikované vědy. Hraniční obory o ţivotě

Podmínky pro přijímací řízení pro akademický rok 2016/2017

Opatření k doktorskému studiu na Fakultě mezinárodních vztahů VŠE v Praze ze dne

Podmínky pro přijímací řízení pro akademický rok 2015/16

Název: Přijďte mezi vědce Ústavu biologie obratlovců AV ČR, v. v. i. Anotace:

Excelence doktorského studia na AF MENDELU pro navazující evropskou vědecko výzkumnou kariéru CZ.1.07/2.3.00/ Klíčová aktivita č.

Maturitní témata BIOLOGIE

Úvod do doktorského studia Agronomické fakulty MENDELU 30. září 2011

CEBIO smysl a cíl národní biotechnologické platformy

IV. ZMĚNY VNITŘNÍHO MZDOVÉHO PŘEDPISU UNIVERZITY PARDUBICE

Výukové environmentální programy s mezipředmětovými vazbami

UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE

Směrnice děkana č. 1/2005 FCH VUT v Brně upravující studium v rámci Celoživotní vzdělávání na Fakultě chemické Vysokého učení technického v Brně

Maturitní témata - BIOLOGIE 2018

Č. j.: TF/5/14 V Praze dne

Soulad studijního programu. Anorganická chemie / Inorganic Chemistry

část A Přijímací řízení pro uchazeče o studium v doktorských studijních programech v českém jazyce bude probíhat celkem ve dvou kolech:

Proč a jak se stát studentem

Podmínky pro přijímací řízení

Studijní program Foresight for Environment and Development. Geoinformatika

Jak by mohlo vypadat ideální doktorandské studium?

ŘÁD DOKTORSKÉHO STUDIA

Požadavky OR studijního programu Demografie

S T U D I J N Í P L Á N Y

Mikrobiologický ústav AV ČR (MBÚ)

Směrnice děkana č. 10/2011. K uskutečňování doktorských studijních programů. Část první

Studium optiky a optometrie na Fakultě biomedicínského inženýrství ČVUT

Učební osnovy předmětu Biologie

analýzy dat v oboru Matematická biologie

Název školy: Střední odborná škola stavební Karlovy Vary Sabinovo náměstí 16, Karlovy Vary Autor: Hana Turoňová Název materiálu:

NAŘÍZENÍ DĚKANA č. 3/2017

Zápis ze zasedání Vědecké rady Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích dne

S B Í R K A INTERNÍCH AKTŮ ŘÍZENÍ DĚKANA FAKULTY BEZPEČNOSTNÍHO MANAGEMENTU POLICEJNÍ AKADEMIE ČESKÉ REPUBLIKY

JIHOČESKÁ UNIVERZITA v Českých Budějovicích. Ekonomická fakulta

Interdisciplinární vzdělávání pracovníků výzkumu a vývoje

Podmínky pro přijetí ke studiu do doktorských studijních programů ESF pro akademický rok 2018/2019

Studijní obor doktorského studia Politologie (P0312D20548)

Předkládá doc. Ing. Vladimír Kočí, Ph.D., MBA děkan. Projednáno Vědeckou radou Fakulty technologie ochrany prostředí VŠCHT Praha dne

Studijní obor Zdravotní laborant. Studijní program Specializace ve zdravotnictví

Směrnice na podporu mobilit CZ studentů Fakulty stavební

DEN OTEVŘENÝCH DVEŘÍ Studium na Lesnické a dřevařské fakultě Mendelovy univerzity v Brně

Soulad studijního programu

Transkript:

PŘÍRODOVĚDECKÁ FAKULTA JIHOČESKÉ UNIVERZITY Informace pro zájemce o studium v doktorských studijních programech VZNIK A SOUČASNÝ STAV Jihočeská univerzita byla založena na podzim 1991. Biologickou fakultu zřídil Akademický senát univerzity dne 8. listopadu 1991. Od 1.8.2007 vznikla z Biologické fakulty Přírodovědecká fakulta. Odborné studium, výrazně zaměřené na biologické obory, bylo v rámci této změny rozšířeno o chemické, fyzikální a matematické studijní programy. Součástí nabízených studijních programů je také víceoborové vzdělávání budoucích učitelů. Většina přednášejících a školitelů je původně z ústavů Akademie věd ČR a získala vědecké a pedagogické zkušenosti na zahraničních univerzitách; kromě nich již působí na fakultě řada mladších kolegů včetně absolventů fakulty. Přírodovědecká fakulta JU je akreditována ke všem třem úrovním vysokoškolského studia (bakalářskému, magisterskému a doktorskému). Fakulta úzce spolupracuje s Biologickým centrem a dalšími ústavy Akademie věd České republiky a má dobré předpoklady rozvíjet celý rozsah biologických oborů, jakož i obory matematické, fyzikální a chemické. Prakticky to znamená, že kromě vlastního vybavení fakulty mohou studenti využívat vybavení ústavů Akademie při svých bakalářských, magisterských a doktorských pracích. Ve studijním roce 2009/2010 má fakulta celkem 1020 studentů, z toho je 194 doktorandů. STUDIUM V DOKTORSKÝCH STUDIJNÍCH PROGRAMECH Smyslem doktorského studia je uvést studenty do vědecké práce. Během studia si doktorandi doplní potřebné znalosti ve zvoleném oboru studia, osvědčí pedagogické schopnosti a pod vedením zkušeného pracovníka vypracují doktorskou disertační práci. Práce nebo její část musí být před obhajobou přijata k tisku nebo již publikována v renomovaném mezinárodním časopisu. Absolventi mohou nalézt uplatnění především na vysokých školách, ve vědeckých a výzkumných ústavech i ve státní správě a ve větších firmách na místech, kde je potřebná detailní znalost vztahů mezi vědou, administrativou a ekonomikou. Fakulta podporuje vysílání studentů a úspěšných absolventů na dobré zahraniční univerzity a jiná vědecká pracoviště. Přijímací řízení Přijímací řízení do doktorského studia se standardně koná v červnu až začátkem července. Lhůta pro podání přihlášek ke studiu v doktorských studijních programech včetně náležitostí, jež musí přihláška obsahovat, podmínky přijetí a termín(y) přijímacího řízení se vyhlašují na internetových stránkách PřF JU (viz http://www.prf.jcu.cz/files/rozhodnuti_dekana_a_prodekanu/prijdok.pdf), na úřední desce fakulty, případně v tisku či jiným způsobem (pro akademický rok 2009/10 je lhůta předložení přihlášek ke studiu 15.5. 2009). Současně se zveřejňují předem známá témata doktorských prací včetně potenciálních školitelů. Přihlásit se mohou absolventi pětiletého vysokoškolského studia biologie nebo příbuzných oborů na přírodovědeckých nebo oborově blízkých fakultách. 1

Uchazeči se mohou přihlásit ke studiu v jednom z akreditovaných studijních oborů (viz tabulka). Studovat lze v prezenční i kombinované formě. Studentům v prezenční formě studia náleží stipendium vyplácené dle příslušných směrnic po standardní dobu studia. Standardní doba studia všech oborů je 3 nebo 4 roky, od akademického roku 2007/8 se noví studenti přijímají pouze do 4letého studia. Studijní program Studijní obor Katedra zajišťující studium Fyziologie a imunologie fyziologie a vývojová biologie fyziologie živočichů fyziologie a anatomie rostlin Biologie parazitologie parazitologie hydrobiologie biologie ekosystémů entomologie zoologie biologie ekosystémů biologie ekosystémů Zoologie zoologie zoologie Botanika botanika botaniky Ekologie* ekologie* biologie ekosystémů Molekulární a buněčná molekulární a buněčná biologie a molekulární biologie biologie genetika genetiky *obor Ekologie programu Ekologie byl nahrazen oborem Biologie ekosystémů programu Biologie a již se neotvírá Přijímací řízení se koná před komisí jmenovanou děkanem PřF. Uchazeč musí prokázat předpoklady ke studijní přípravě na soustavnou vědeckou nebo náročnou řídící práci a tyto doložit dosavadními studijními výsledky, diplomovou prací, publikační činností a konkrétní představou o zaměření doktorského studia a doktorské disertační práce. Uchazečům, kteří splňují požadavky, navrhne přijímací komise školitele, případně i školitele-specialistu a u mimofakultních školitelů také fakultního garanta, a zaměření disertační práce. Komise dále stanoví předměty, které kromě povinné zkoušky z angličtiny musí student v průběhu studia absolvovat. O přijetí ke studiu rozhoduje děkan fakulty na základě návrhu přijímací komise. Průběh studia Studium v doktorském studijním programu sleduje a hodnotí oborová rada ustanovená pro každý obor studia. Studium probíhá podle individuálního plánu pod vedením školitele. Uchazeči přijatí ke studiu se ve stanoveném termínu zapíší. Do 1 měsíce od zahájení studia předloží student oborové radě prostřednictvím studijního oddělení Plán doktorského studia, který vypracoval s navrženým školitelem na základě závěrů přijímacího řízení. Po schválení plánu studia oborovou radou děkan jmenuje školitele (a současně i školitele-specialistu a fakultního garanta, jsou-li oborou radou navrženi). V průběhu, nejpozději však do konce prvního roku studia prezentuje student na semináři kritický rozbor problematiky disertační práce (záměry, metodiku, časový plán, atd.) a vypracuje literární rešerši problematiky. Každoročně student vypracuje zprávu o průběhu studia, ve které mj. popíše pokroky ve své vědecké práci a plnění ostatních povinností. Zprávu schvaluje školitel a hodnotí oborová rada. Mezi hlavní povinnosti studenta patří: a) samostatná práce, kterou si student zapisuje na každý semestr studia jako předmět Doktorandská praxe a jejíž úspěšnost školitel každý semestr potvrzuje udělením zápočtu, b) účast na seminářích určených školitelem, včetně každoroční prezentace vlastních výsledků, 2

c) pedagogická činnost, kterou po dohodě se školitelem určí vedoucí katedry v celkovém rozsahu 90 hodin (resp. 100 hodin u 4letých programů) za dobu studia (povinnost pedagogické práce platí pouze pro studenty prezenční formy studia), d) úspěšné absolvování stanovených předmětů a angličtiny ve stanoveném rozsahu, e) prezentace vlastních výsledků na mezinárodní konferenci, f) absolvování zahraniční stáže (u 4letých programů) g) publikace alespoň části výsledků doktorské práce (podrobné podmínky pro úspěšné absolvování studia stanoví studijní řád). Ukončení studia státní doktorská zkouška a obhajoba disertační práce Standardní doba studia v doktorském studijním programu je 3 nebo 4 roky. Do doby studia se nezapočítává případné přerušení studia, jež může celkově činit až 2 roky. Obvykle ve druhé půli či ke konci studia koná student státní doktorskou zkoušku před komisí jmenovanou děkanem. Při ní prokazuje hlubší znalosti svého oboru studia a přehled v příbuzných disciplínách, jakož i schopnost a připravenost k samostatné činnosti v oblasti výzkumu. Studium končí obhajobou doktorské disertační práce. Disertační práce musí obsahovat původní a uveřejněné výsledky nebo výsledky přijaté k uveřejnění ve vědeckém časopisu, který dosáhl v posledních čtyřech letech impaktního faktoru nejméně 0,5. Disertační práce může být napsána česky, slovensky nebo anglicky. Fakulta preferuje disertační práce, které sestávají z publikací a rukopisů publikací doplněných o společný úvod a shrnutí výsledků se závěry. Úspěšným absolventům doktorského studia je udělen titul doktor (Ph.D.). INFORMACE O JEDNOTLIVÝCH STUDIJNÍCH OBORECH Botanika Garant: Prof. RNDr. Karel Prach, CSc. Kontakt: tel. 387772220; e-mail: prach@prf.jcu.cz Spolupracující instituce: Botanický ústav AV ČR, Průhonice u Prahy a Třeboň Charakteristika: Studijní obor poskytuje školení studentů ve všech základních botanických disciplínách zahrnujících problematiku nižších i vyšších rostlin. Výuka je zajišťována zkušenými odborníky z různých botanických specializací, z nichž většina má pracovní úvazky jak na BF JU, tak v AV ČR, a mladými absolventy fakulty, kteří dosáhli odpovídající vědecké úrovně, kterou prokázali ukončením svého vědeckého vzdělání. Zadávaná témata disertačních prací zasahují do oblastí všech směrů botanického výzkumu (některá témata jsou napojena na stěžejní úkol vypracování květeny ČR), dále na významné krajinářské, hydrobiologické a všeobecně ekologické projekty. Při této práci jsou využívány nejmodernější laboratorní i terénní metodiky, od genetických přes fyziologické a populační přístupy až po metody studia společenstev, ekosystémů a krajiny. Studenti jsou zapojeni do významných tuzemských i mezinárodních projektů. Získané znalosti umožní absolventům uplatnění na specializovaných botanických, ekologických, vodohospodářských a krajinářských pracovištích, v základním výzkumu a ve školství. Studenti se naučí aplikaci moderních metodických přístupů v botanice a zpracování výsledků ve formě odborné publikace či ústního projevu v angličtině. Okruhy témat doktorských prací: Taxonomie a ekologie sinic a řas. Studium variability populací. Fytogeografie a chorologie vyšších rostlin. Geobotanika. Koexistence druhů v rostlinném společenstvu. Invazní rostliny. Sukcese vegetace. Archeobotanika. 3

Ekologie/Biologie ekosystémů Garant: Prof. Ing. Hana Šantrůčková, CSc. Kontakt: tel. 387772361; e-mail: hana.santruckova@prf.jcu.cz Spolupracující instituce: Biologické centrum AV ČR, v.v.i. - Entomologický ústav, České Budějovice, Biologické centrum AV ČR, v.v.i. - Ústav půdní biologie, České Budějovice Charakteristika: Studijní program zajišťuje školení studentů v problematice a metodách současné ekologie, zaměřené především na mechanismy určující chování ekologických soustav. Jedná se o propojení živočišné a rostlinné ekologie, a to jak v terestrickém, tak akvatickém prostředí. Zvláště jsou studovány mezipopulační vztahy na všech úrovních organizace ekologických systémů, a na evoluční souvislosti studovaných jevů. Velký důraz je kladen na experimentální přístup, na schopnost absolventů správně naplánovat uspořádání pokusů a pokusy správně statisticky vyhodnotit. Důraz je kladen i na ekologickou teorii. Výzkumy, na nichž jsou založeny disertační práce, probíhají v úzké spolupráci s ústavy AV ČR. Okruhy témat doktorských prací: Populační ekologie vybraných druhů. Ekologie společenstev rostlin i bezobratlých živočichů. Teoretická ekologie, matematické modelování ekologických soustav, metody statistické analýzy ekologických dat. Mechanismy koexistence druhů. Kořeny rostlin a jejich symbiotické organismy. Ekologie společenstev půdních organismů. Procesy přeměn uhlíku, dusíku a dalších biogenních prvků v půdě a ekosystému. Plynné metabolity biologických procesů a jejich emise do atmosféry. Entomologie Garant: Doc. RNDr. Oldřich Nedvěd, CSc. Kontakt: tel. 387772253; e-mail: nedved@prf.jcu.cz Spolupracující instituce: Biologické centrum AV ČR, v.v.i. - Entomologický ústav, České Budějovice Charakteristika: Studijní obor poskytuje školení studentů v základních entomologicky orientovaných disciplinách a jejich širším vědním základě zajištěné školiteli aktivně působícími v entomologickém výzkumu a využívajícími moderní metody a přístrojové vybavení. Zadávaná témata disertačních prací zasahují do oblasti základního výzkumu biologie hmyzu, a to jak v rovině obecné a teoretické (arachno)entomologie (morfologie, fyziologie, genetika, ekologie, systematika a fylogeneze), tak i v rovině výzkumu aplikovaného (např. integrovaná ochrana rostlin a ochrana biodiverzity). Získané znalosti umožní absolventům uplatnění jak na specializovaných pracovištích např. rostlinolékařské služby, v lesnictví a pracovištích ochraně přírody a životního prostředí, tak i v základním výzkumu a ve školství. Studenti se naučí aplikaci moderních metodických přístupů v entomologii a zpracování výsledků ve formě odborné publikace či ústního projevu v angličtině. Okruhy témat doktorských prací: Vliv přírodních rostlinných látek na vývoj a endokrinní regulaci hmyzu. Studium ultrastruktury a ontogenetických změn kutikuly hmyzu. Vztah herbivorů a rostlin v ekosystému tropického deštného lesa. Vztah diapauzy a chladové odolnosti vybraných druhů ploštic. Taxonomie vybraných skupin hmyzu (např. Ephemeroptera, Diptera). Afidofágní hmyz a jeho použití v biologickém boji. 4

Fyziologie a vývojová biologie Obor zahrnuje dvě zaměření: 1. Fyziologie a vývojová biologie živočichů Garant: Doc. RNDr. Dalibor Kodrík, CSc. Kontakt: tel. 387775271; e-mail: kodrik@entu.cas.cz Spolupracující instituce: Biologické centrum AV ČR, v.v.i. - Entomologický ústav, České Budějovice Charakteristika: Studijní obor poskytuje školení studentů v základních fyziologicky orientovaných disciplínách zajištěné školiteli aktivně působícími ve fyziologickém výzkumu a využívajícími moderní metody a přístrojové vybavení. Zadávaná témata disertačních prací zasahují do oblasti základního výzkumu molekulární, celulární a organismické fyziologie se zaměřením na fyziologii ekologickou, s možností aplikace v různých lékařských a biologických oborech. Získané znalosti umožní absolventům uplatnění ve specializovaných biologických, lékařských a veterinárních laboratořích, v základním výzkumu a ve školství. Studenti se naučí používat moderních fyziologických metod založených na automatickém odběru dat a počítačovém zpracovávání výsledků a prezentaci získaných výsledků ve formě odborných publikací a přednášek v angličtině. Okruhy témat doktorských prací: Metabolické regulace. Mechanismy chladové odolnosti. Řízení a symptomy diapauzy bezobratlých a zimního spánku savců. Mechanismy anaerobního metabolismu ryb. Utilizace živin u fytofágů a její ovlivnění obrannými látkami rostlin. Srovnávací endokrinologie (zejména brain-gut peptides ). Mechanismus působení hormonů na buněčné a molekulární úrovni. Řízení sekrece hmyzích hormonů. Praktické využití agonistů a antagonistů hmyzích hormonů. 2. Anatomie a fyziologie rostlin Garant: Doc. Ing. Jiří Šantrůček, CSc. Kontakt: tel. 387772353; e-mail: jsan@umbr.cas.cz Spolupracující instituce: Biologické centrum AV ČR, v.v.i. - Ústav molekulární biologie rostlin, České Budějovice Charakteristika: Studijní obor poskytuje školení studentů v hlavních oblastech fyziologie a anatomie rostlin. Je zajištěný školiteli aktivně působícími ve fyziologickém, anatomickém, biochemickém a biofyzikálním výzkumu, kteří využívají moderní metody a přístrojové vybavení. Zadávaná témata disertačních prací zasahují do základního výzkumu zejména v oblastech fyziologie, biochemie a fotochemie fotosyntézy, struktury a funkce biomembrán a interakcí mezi rostlinou a vnějším prostředím. Získané znalosti umožní absolventům uplatnění v základním výzkumu, v zemědělském a lesnickém výzkumu, ve speciálních biotechnologických provozech a ve školství. Studenti se naučí aplikaci moderních metodických přístupů a zpracování výsledků ve formě odborné publikace či ústního projevu v angličtině. Okruhy témat doktorských prací: Produkce a interakce proteinu psbh ze sinice Synechocystis. Studium struktury fotosystému II. Mechanismy světlem indukované degradace proteinů fotosystému II. Studium struktury a funkce malých proteinů fotosystému II. Adaptace řas k extrémním podmínkám. 5

Hydrobiologie Garant: Doc. RNDr. Jaroslav Vrba, CSc. Kontakt: tel. 387775872; e-mail: vrba@hbu.cas.cz Spolupracující instituce: Biologické centrum AV ČR, v.v.i. - Hydrobiologický ústav, České Budějovice Charakteristika: Studijní program zajišťuje školení studentů v problematice a metodách současné hydrobiologie a limnologie, zaměřené především na produkční procesy v ekosystémech údolních nádrží a jezer, chemické procesy a transformaci živin ve sladkých vodách a mikrobiální procesy probíhající ve sladkovodních nádržích. V rámci programu je možné orientovat se na specifické dílčí otázky základního výzkumu složek ekosystémů údolních nádrží a jezer nebo na holistický přístup a aplikace využitelné v praktické oblasti řízení jakosti vody ve vodním hospodářství. Specifické otázky lze řešit kultivací organismů za kontrolovaných podmínek ve zjednodušených modelových systémech. Velký důraz je kladen na monitorovací a experimentální přístupy, na schopnost absolventů správně naplánovat uspořádání odběrů a pokusů a správně je statisticky vyhodnotit. Výzkum je založen na využívání moderních metod a přístrojového vybavení. Výzkumy, na nichž jsou založeny dizertační práce, probíhají v úzké spolupráci s ústavy AV ČR. Absolventi budou schopni plánovat a provádět vlastní původní vědecký výzkum v oboru limnologie a publikovat a zobecňovat jeho výsledky. Získaná kvalifikace umožní uplatnění ve vědě a výzkumu, stejně jako ve veřejném i privátním sektoru vodohospodářských podniků a organizací. Okruhy témat doktorských prací: Zdroje živin v povodí a jejich transport vodními toky do nádrží a jezer. Studium chemismu a mikrobiologie sedimentů údolních nádrží a jezer a význam z hlediska koloběhu živin. Matematické modelování hydrodynamiky, eutrofizace a složení vody v nádržích. Potravní biologie ryb, distribuce ryb v nádržích a interakce ryby zooplankton. Struktura populací zooplanktonu ve vztahu k podmínkám prostředí nádrží a jezer. Životní strategie a migrace perlooček rodu Daphnia. Ekologické interakce ve fytoplanktonu údolních nádrží. Extracelulární enzymy ve vodním prostředí: ekologický význam, zdroje, kinetika. Faktory ovlivňující dynamiku a složení společenstev bakterií v nádržích a jezerech. Potravní interakce planktonních prvoků s bakteriemi a fytoplanktonem. Potravní vztahy dravých planktonních korýšů. Molekulární a buněčná biologie a genetika Garant: Doc. RNDr. Marek Jindra, CSc. Kontakt: tel. 387775232; e-mail: jindra@entu.cas.cz Spolupracující instituce: Biologické centrum AV ČR, v.v.i. - Entomologický ústav, České Budějovice, Biologické centrum AV ČR, v.v.i. - Parazitologický ústav, České Budějovice, Biologické centrum AV ČR, v.v.i. - Ústav molekulární biologie rostlin, České Budějovice, Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v.v.i., Liběchov Charakteristika: Samostatné myšlení, dobrá angličtina, a především motivace objevit něco nového i za cenu ztráty vlastního pohodlí jsou nezbytnými předpoklady pro úspěch v tomto oboru. Studenti jsou vedeni k samostatné vědecké práci v oblastech molekulární, buněčné a vývojové biologie. Musí zvládnout molekulární a genetické metody práce na různých modelových organismech od prvoků a kvasinek až po rostliny a živočichy, jakož i ústní a písemnou presentaci výsledků v angličtině. Projekty studentů zajišťují školitelé aktivní ve výzkumu na mezinárodní úrovni. Témata disertačních prací vyplývají ze zaměření grantových projektů školitele, a opírají se o kvalitní přístrojové vybavení jakož i mezinárodní spolupráci; většina studentů absolvuje stáž v laboratoři zahraničního partnera. Cílem projektů je zpravidla přispět k objasnění některé ze základních otázek současné biologie, např. regulace buněčných funkcí nebo diferenciace. Studenti jsou dále školeni ve 6

specializacích molekulární cytogenetika, genové inženýrství a genetika živočichů a rostlin, přičemž zvláštní pozornost je věnována technikám genetických modifikací. Absolventi tohoto oboru mají široký teoretický a metodický základ, který umožňuje jejich uplatnění především v základním, ale také průmyslovém výzkumu, v lékařství, zemědělství a ve školství. Okruhy témat doktorských prací: Struktura proteinů a nukleových kyselin. Funkce mitochondriálních proteinů, mechanismus transkripce a editování RNA u parazitických prvoků (Trypanosoma, Leishmania). Evoluce struktury telomer. Pohlavní chromosomy. Transkripční faktory a regulace genové exprese. Buněčný cyklus a proliferace (růstové faktory, onkogeny a tumor supresory). Vývoj a diferenciace (modely Drosophila melanogaster a Caenorhabditis elegans). Molekulární podstata fotosyntézy. Geny kódující hedvábí. Molekulární mechanismus cirkadiánních rytmů. Transgenní přístupy u rostlin a živočichů. Funkční genomika rostlinných virů. Repetitivní sekvence eukaryontních genomů. Vývoj DNA čipů. Parazitologie Garant: Prof. MVDr. Iva Dyková, DrSc. Kontakt: tel. 387775415; e-mail: iva@paru.cas.cz Spolupracující instituce: Biologické centrum AV ČR, v.v.i. - Parazitologický ústav, České Budějovice Charakteristika: Studijní program poskytuje školení studentů v základních parazitologicky orientovaných oborech zajištěné školiteli aktivně působícími v parazitologickém výzkumu a využívající moderního přístrojového vybavení. Zadávaná témata disertačních prací zasahují do oblasti základního výzkumu biologie parazitických organizmů a jejich vztahu k hostitelům a do oborů lékařské a veterinární parazitologie. Získané znalosti umožní absolventům uplatnění ve specializovaných lékařských a veterinárních laboratořích, v základním výzkumu a ve školství. Okruhy témat doktorských prací: Humání parazitózy: protozoární infekce imunodeficientních jedinců, vztah hostitelů a parazitů včetně imunitní odpovědi. Protozoa a Myxosporea cizopasící u ryb: morfologie, životní cykly a patogenita; amfizoické améby. Biologie, ekologie a diverzita všech hlavních skupin helmintů cizopasících u ryb. Molekulární biologie a biochemie parazitů: fylogenetické vztahy vybraných skupin protozoí založené na analýze ribosomálních RNA genů; struktura mitochondriální DNA u různých druhů protistů. Molekulární ekologie krevsajících vektorů zaměřená na mechanismy přenosu patogenů: protein-sacharidové interakce, imunitní reakce u přenašečů nákaz. Zoologie Garant: Doc. RNDr. František Sedláček, CSc. Kontakt: tel. 387772258; e-mail: sedlacek@usbe.cas.cz Spolupracující instituce: Biologické centrum AV ČR, v.v.i. - Ústav půdní biologie, České Budějovice, Biologické centrum AV ČR, v.v.i. - Parazitologický ústav, České Budějovice, Ústav biologie obratlovců AV ČR, v.v.i., Brno, Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v.v.i., Liběchov Charakteristika: Studijní obor poskytuje školení studentů v základních zoologicky orientovaných disciplínách zajištěné školiteli aktivně působícími v zoologickém a ekologickém výzkumu a využívajícími moderní metody a přístrojové vybavení. Zadávaná témata disertačních prací zahrnují problematiku a metody současné biologie a ekologie živočichů, zaměřené především na fylogenezi živočichů, tropickou ekologii, koevoluce parazitů a hostitelů, morfologii členovců, 7

ekologii a etologii ptáků, ekologii savců, neuroetologii a sociobiologii savců, ekologii ryb a populační biologii a biodiverzitu obojživelníků. Různé zaměření disertačních prací studentů přispěje k vytvoření širokého teoretického základu, který absolventům studia umožní uplatnění v oblasti základního i aplikovaného výzkumu, ochrany životního prostředí (např. správy národních parků a chráněných krajinných oblastí), zemědělství a lesnictví, školství a kultury (např. muzea a zoologické zahrady). Okruhy témat doktorských prací: Fylogeneze vybraných skupin živočichů (např. Platyhelminthes, Arthropoda, Vertebrata). Experimentální a evoluční analýza hmyzího aposematismu a vztahu k ptačím predátorům. Vliv kolísavých teplot na vývoj a přežívání heterotermních živočichů; vnitrodruhová geografická variabilita parametrů chladové odolnosti a diapauzy. Populační a potravní ekologie ryb. Fylogeneze a historická ekologie vybraných skupin ryb (Cichlidae). Etologie, populační biologie a speciace obojživelníků. Hnízdní biologie, potravní ekologie a habitatové preference vybraných druhů ptáků. Etologie a sociobiologie podzemních savců (Arvicolidae, Bathyergidae). Smyslová ekologie a neuroetologie drobných savců. KDE ŽIJEME - NĚCO MÁLO O STUDENTSKÉM A STUDIJNÍM ZÁZEMÍ Společný areál ústavů AV ČR a JU je v části Českých Budějovic zvané Čtyři Dvory, na okraji města na levém břehu Vltavy. Asi dva kilometry od areálu je chráněné území Vrbenské rybníky, kde hnízdí řada druhů potápek a kachen včetně zrzohlávek a hoholů, jsou tam kolonie racků a volavek popelavých, můžete narazit na stopy vydry, atd. Za fakultou začíná mozaika polí, lesů, luk, hor a vesnic, které vidíte z řady oken fakulty či kolejí. Na druhou stranu fakulta není daleko od centra města - lze se tam dostat za půl hodiny pěšky, hromadnou dopravou i rychleji. Další informace o fakultě lze nalézt na internetových stránkách fakulty na adrese: Adresa: Jihočeská univerzita, Přírodovědecká fakulta Branišovská 31, 370 05 České Budějovice http:// www.prf.jcu.cz studijní oddělení: tel. 387772262, e-mail: voldrich@prf.jcu.cz kancelář děkana: tel. 387772244, fax 385300366, e-mail: sekret@prf.jcu.cz proděkan pro vědu a doktorské studium: Prof. Ing. Miloslav Šimek, CSc., tel. 387775767, e-mail: misim@upb.cas.cz děkan: Prof. RNDr. Libor Grubhoffer, CSc., tel. 387772244, e-mail: dekan@prf.jcu.cz (verze září 2009) 8