Pracoviště zdravotnické laboratoře: 1. bioptický úsek - úsek B 2. cytologický úsek - úsek C 3. detašované pracoviště Jičín Oblastní nemocnice Jičín a.s. Bolzanova 512, 506 43 Jičín 4. detašované pracoviště Jilemnice Masarykova městská nemocnice Jilemnice Metyšova 465, 514 15 Jilemnice 5. molekulárně-genetický úsek - úsek G Laboratoř uplatňuje flexibilní přístup k rozsahu akreditace upřesněný v dodatku. Aktuální seznam činností prováděných v rámci požadovaného flexibilního rozsahu je k dispozici na www.biopticka.cz. Vyšetření: 1. bioptický úsek - úsek B 823 - Laboratoř patologie 1. Histologická vyšetření tkání SOP-01 Tkáně 2. Histologická vyšetření tvrdých tkání 3. Vyšetření tělesných tekutin metodou cytologie a minibiopsie 4. Imunohistochemická vyšetření antigenů* Dodatek: Flexibilní rozsah akreditace 4 SOP-02 SOP-03 SOP-05 Pořadová čísla postupů vyšetření Tvrdé tkáně Tělesné tekutiny (výpotek, moč) a negynekologické nátěry Tkáně, tvrdé tkáně, buňky Laboratoř může modifikovat existující zkušební metody (normované i vlastní vyvinuté postupy) a/nebo rozšířit rozsah zkoušených parametrů a/nebo předmětu zkoušek v dané oblasti akreditace při zachování principu měření. U vyšetření v dodatku neuvedených nemůže laboratoř uplatňovat flexibilní přístup k rozsahu akreditace Strana 1 z celkového počtu 10 stran
2. cytologický úsek - úsek C Vyšetření: 1. Vyšetření gynekologické cytologie 2. Vyšetření gynekologické cytologie v tenké vrstvě (LBC) metodikou Thin Prep PAP Test 817 - Laboratoř lékařské cytologie SOP-06 SOP-17 Gynekologické cytologické nátěry Gynekologický cytologický preparát 3. detašované pracoviště Jičín Vyšetření: 1. Peroperační histologická vyšetření tkání 823 - Laboratoř patologie SOP-04 Tkáně 4. detašované pracoviště Jilemnice Vyšetření: 1. Peroperační histologická vyšetření tkání 823 - Laboratoř patologie SOP-04 Tkáně Strana 2 z celkového počtu 10 stran
Vyšetření: 5. molekulárně genetický úsek - úsek G 802 - Lékařská mikrobiologie 1. Detekce mikroorganismů SOP-18 a virů pomocí PCR 1) 2. Detekce virů pomocí SOP-19 real-time PCR 2) 3. Detekce a genotypizace HPV pomocí reverzní hybridizace 1. Analýza chromozomálních aberací metodou fluorescenční in-situ hybridizace (FISH) 2. Analýza somatických a germinálních alterací tumor supresorových genů, onkogenů a dalších genů přímým sekvenováním 3) 3. Detekce mutací onkogenů SOP-20 816 - Laboratoř lékařské genetiky SOP-07 SOP-09 Řezy z fixovaných tkání pomocí reverzní hybridizace 4) SOP-10 4. Detekce delecí a insercí genů souvisejících s HNPCC pomocí MLPA 5) SOP-11 Nefixované buněčné materiály 5. Analýza klonality receptorových genů B a T lymfocytů pomocí fragmentační analýzy 6) 6. Detekce translokací zasahujících gen IgH pomocí PCR 7) 7. Detekce translokací pomocí SOP-14 SOP-15 RT-PCR 8) SOP-16 8. Detekce mutací pomocí masivně paralelního sekvenování 9) SOP-22 9. Detekce alterací genů bez závažného transgeneračního dopadu pomocí real-time PCR 10) SOP-23 Strana 3 z celkového počtu 10 stran
1. Detekce HR-HPVa HPV typů 16,18,45 pomocí hybrid capture 2 2. Detekce HR-HPV a Chlamydia trachomatis pomocí metodiky TMA/ Aptima 817 - Laboratoř lékařské cytologie SOP-08 SOP-21 Stěry ze sliznic fixované Stěry ze sliznic fixované Vyšetřované mikroorganismy a viry: 1) Bartonella spp., Borrelia burgdorferi, Brucella spp., Francisella tularensis, Mycobacterium spp., Mycobacteruim tuberculosis complex, Tropheryma whipplei, Yersinia pseudotuberculosis, JCV, BKV, HSV1, HSV2, EBV, HHV6, HHV8, HPV 2) Adenovirus, ParvovirusB19, BKV Vyšetřované geny: 3) ALOX12B, ALOXE3, APC, ATP7B, BHD, BRAF, BRCA1, BRCA2, CDK4, CDKN2A, C-KIT, CYLD, EGFR, FOXL2, GNAS1, HFE, HRAS, IL28B, JAK2, KRAS, KRT1, KRT10, MET, MLH1, MSH2, MSH6, NF2, NRAS, PDGFRA, PRKAR1A, PTCH1, TGM1, TP53, UGT1A1, VHL 4) KRAS, BRAF, EGFR, NRAS 5) MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 6) Geny 9) KRAS, NRAS, BRAF, EGFR, BRCA1, BRCA2 10) F2, F5, HLA Vyšetřované translokace: 7) t(11;14)(q13;q32)(igh-bcl1), t(14;18)(q32;q21)(igh-bcl2) 8) t(17;22)(q22;q13)(col1a1-pdgfb),t(12;15)(p13;q25)(etv6-ntrk3), t(7;17)(p15;q21)(jazf1- JJAZ1), t(11;19) (q21;p13) (CRTC1-MAML2), t(11;15)(q21;q26) (CRTC3-MAML2), t(x;18)(syt-ssx1/ssx2) Vysvětlivky a zkratky: HR-HPV HPV HNPCC MLPA PCR RT-PCR High risk human papillomavirus (vysoce rizikový lidský papilomavirus, lidský papillomavirus s vysokým onkogenním potenciálem) Human papillomavirus (lidský papillomavirus) Hereditární nepolypózní kolorektální karcinom Multiplex ligation-dependent probe amplification Polymerase chain reaction (polymerázová řetězová reakce) Reverse transcription polymerase chain reaction (reverzní transkripce následovaná polymerázovou řetězovou reakcí) Strana 4 z celkového počtu 10 stran
*Seznam protilátek pro vyšetření antigenů, metoda SOP-05 Actin, Muscle Specific Actin E Smooth Muscle Actin Actin S Cytokeratin, Pan AE 1-3 α-1-fetoprotein (AFP) AFP Anti- ALK 1 ALK-1 Anti-Human P 504S AMACR Androgen Receptor AR bcl-2 Bcl 2 bcl-6 Bcl 6 Epithelial Antigen Ber-EP4 Beta-catenin Beta-catenin Kappa BJK Lambda BJL B Cell Specific Octamer Binding Protein (BOB-1) BOB-1 C4d C4d Calcitonin Calcitonin Caldesmon Caldesmon Calponin Calponin Calretinin Calretinin Anti-Cytokeratin CAM 5,2 CAM 5,2 CD 1a CD 1 a CD 10 CD 10 CD 105, Endoglin CD 105 CD 117, c-kit CD 117 CD 13 CD 13 CD 138 (Syndecan-1) CD 138 CD14 CD 14 CD 15 CD 15 CD 16 CD 16 CD 163 CD 163 CD 2 CD 2 CD 20 CD 20 (L26) CD 21 CD 21 CD 23 CD 23 CD 25 CD 25 CD 3 CD 3 CD 30 CD 30 Endothelial Cell CD 31 CD 33 CD 33 Endothelial Cell Marker CD 34 CD 35 CD 35 CD 4 CD 4 CD 42b (GPIb) CD 42b CD 43 CD 43 CD 5 CD 5 CD 56(NCAM) CD 56 CD 57 CD 57 CD 61 CD 61 CD 68 CD 68 CD 7 CD 7 CD 79a CD 79a Strana 5 z celkového počtu 10 stran
CD 8 CD 8 CD 99 CD 99 CD 123 CD 123 CD X2 protein CD X2 Carcinoembryonie Antigen (CEA CEA c-erbb Oncoprotein (internal domain) CERB Anti-Human Cytokeratin 10 CK 10 Cytokeratin 10/13 CK 10/13 Cytokeratin 14 CK 14 Cytokeratin 17 CK 17 Cytokeratin 18 CK 18 Cytokeratin 19 CK 19 Cytokeratin 20 CK 20 Cytokeratin 5 CK 5 Cytokeratin 5/6 CK 5/6 Cytokeratin 7 CK 7 Cytokeratin 8, Low Molecular Weight CK 8 Cytokeratin CK MNF 116 Cytomegalovirus CMV Follicular Dendritic Cell CNA.42 COX-2 COX-2 Cyklin A Cyklin A Cyklin D1 Cyklin D1 D2-40 D2-40 Desmin Desmin Dog 1 Dog-1 Epstein-Barr Virus, LMP EBV E-cadherin (G-10) E-CAD Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) EGFR Epithelial Membráne Antigen (EMA) EMA Estrogen Receptor ER Factor XIIIa Factor XIII Factor VIII Related Antigen Factor VIII GATA-3 GATA 3 Galectin 3 Galect 3 Gastrin Gastrin GCDFP-15 GCDFP 15 Glial Fibrillary Acidit Protein GFAP Anti-glutamine synthetase Glutamin synth. Glycophorin A Glykofor A Human Chorionic Gonadotropin HCG Leukaemia, Hairy Cell HCL HER-2/neu HER HercepTestTM HERCEP HHV 8 (Human Herpes Virus Type 8) HHV 8 Melanosome HMB 45 Human Placental Lactogel hpl HSA (Hepatocyte Specific Antigen) HSA (Hep Par1) Chromogranin A Chromog IgA (Immunoglobulin A) Ig A IgD (Immunoglobulin D) Ig D IgG (Immunoglobulin G) Ig G Strana 6 z celkového počtu 10 stran
IgM (Immunoglobulin M) Ig M mouse anti-human IgG 4 IgG 4 Inhibin, alpha Inhibin Anti-Insulin Insulin anti-ini-1 INI - 1 Cytokeratin HMW K 903 Anti- LCT Lactaza Laminin Laminin Lin28 LIN 28 Lysozyme Lysozym Mast Cell Tryptase MAST MCM3 Protein MCM 3 Melan-A Melan A Mesothelin Mesotelin Mammaglobin MGA AntimMitochondrial Antigen MIA Ki-67 Antigen MIB (Ki-67) Microphthalmia Transcription Factor MITF MLH 1 MLH 1 Myeloperoxidase MPOX MSH 2 MSH 2 MSH 6 MSH 6 MUC 2 MUC 2 MUC 5 AC MUC 5 AC MUC 6 MUC 6 Anti- MyoD1 Myo D1 Myogenin Myogenin Myosin, Smooth Musle Myosin Nanog Nanog Neurofilament 200 kd NF-200 Neurofilament NF-2F11 Anti-Melanoma Associated Antigen NKI/C3 nm23 Protein nm 23 c-erbb Oncoprotein (external domain) NOVO NSE (Neuron Specific Enolase) NSE OCT ¾ OCT ¾ Oct-2 Oct-2 Cytokeratin OSCAR OSCAR p16 Protein p 16 p21 WAF1 p 21 p 27 kip1 p 27 p40 (P) p 40 p53 Protein p 53 p63 Protein p 63 anti-p120 catenin p 120 PSAP (Prostatic Acid Phosphatase) PAPh Parvalbumin Parvalbumin PAX 5 PAX 5 PAX 8 PAX 8 PD-1 PD-1 Perforin Perforin Peripherin Peripherin Strana 7 z celkového počtu 10 stran
CD 68 / PG-M1 PG-M1 Anti-PLAG1 PLAG-1 Placental Alkaline Phosphatase PLAP PMS2 PMS 2 Progesterone Receptor PR Prostate Specific Antigen (PSA) PSA S 100 S 100 SALL 4 SALL 4 SDHB SDHB Serotonin Serotonin SOX 11 SOX 11 Amti-Stat5 A/B Stat 5 Synaptophysin Synap CD45,Leucocyte Common Antigen T 200 (LCA, CD 45) Terminal Deoxynucleotidyl Transferase TdT TFE 3 TFE 3 Thyroglobulin TG Thyroid Peroxidase (TPO) TPO TRAcP(Tartrate-Resistant Acid Phosphatase) TRAcP Anti-Thyroid Transcriotion Faktor (TTF-1) TTF 1 Tyrosinase Tyros CD45RO UCHL 1 Vimentin Vimentin Wilms Tumor 1 (WT 1) Protein WT 1 Anti ATRX* ATRX* Anti-Clusterin* Clusterin* Anti-Mucin* HIK* Anti Bcl-2* Bcl2 E17* cd k4* cdk4* PRAME* PRAME* Anti-Human IMP3 * IMP3* Anti-Human LMO2* LMO2* VEGF Receptor 2 (55B11) * VEGFR-2* NUT* NUT* NKX3.1* NKX3.1* Prostein* Prostein* anti-braf V600E* BRAF* Langerin* Langerin* Anti-SOX 9* SOX 9* Anti-Brachyury/Bry* Brachyury* Claudin 1* Claudin 1* MUM 1 protein* MUM 1* Anti TIA-1* TiA* Anti Arginase-1* Arginase-1* Anti Hemoglobin A* Hemoglobin* Anti Pancreatic Amylase* Pancreatic Amylase* Anti Pancreatic Lipase* Pancreatic Lipase* Parathyroid Hormone* PTH α-1-antitrypsin (AAT)* AAT* Fli-1* MRQ-1 Fli 1* GLUT-1* GLUT 1* Strana 8 z celkového počtu 10 stran
PDGFR alpha* PDGFR alpha* SOX-10* SOX 10* Adrenocorticotropin (ACTH)* ACTH* Mouse anti-claudin-5* 4C3C2 Claudin-5* Anti-Claudin 5* Claudin-5* Anti - c- Myc * Y69 c-myc* E-Cadherin (RM)* EP6 E-Cad EP6* Granzym B* 11F1 Granzym B* Anti Histone H3* Histone H3* MDM2* IF2 MDM2* BAP1 (C-4) monoclonal antibody* C-4 BAP 1* CD 11c* 5D11 CD 11c* Anti-Human CD15* Carb-3 CD 15-Carb3* CD 56 Rabbit Monoclonal Antibody* MRQ-42 Anti - C Reactive Protein* Y284 Anti HNF1 beta antibody* 4A1 Anti-Islet 1 antibody [1H9] * 1H9 Anti NKX6-1 antibody* polyclonal Ani- LEF1 antibody* EPR2029Y Anti-LYVE1 antibody - Lymphatic Vessel Marker* - polyclonal MCPyV large T-antigen Antibody* CM2B4 Nerve Growth Factor Receptor (NGFR)* MRQ-21 Olig2 Antibody* polyclonal Anti-Smoothelin* R4A TLE1 (M-101) monoclonal antibody* M -101 TrkA (14G6) Rabbit mab* 14G6 Collagen Type IV* PHM-12 anti-muc1 Mouse Monoclonal Primary Antibody* - H23 CD 56 MRQ-42* CRP* HNF 1* Islet 1* NKX 6-1* LEF 1* LYVE 1* Merkel Cell* NGFR* Olig* Smoothelin* TLE 1* TrkA* Collagen IV* MUC 1* Strana 9 z celkového počtu 10 stran
Cytochrome P450 Aromatase Antibody* H4 Phosphohistone H3 (PHH3) * polyclonal Anti - SATB2* CL0276 Anti - SATB2 antibody* polyclonal Stat6 (S-20)* YE361 Stat 6 (S-20)* polyclonal p450 Aromatase* PHH 3* SATB 2* mono SATB 2* poly Stat 6* mono Stat 6* poly Strana 10 z celkového počtu 10 stran