JAN S U D A PUBLIKAČNÍ ČINNOST

JAN S U D A PUBLIKAČNÍ ČINNOST VĚDECKÉ MONOGRAFIE 1. Doležel J., Greilhuber J. & Suda J., eds. (2007): Flow Cytometry with Plant Cells. Analysis of Genes, Chromosomes and Genomes. Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim., xxiv+455 pp. ISBN-10: 3-527-31487-3, ISBN-13: 978-3-527-31487-4. KAPITOLY V MONOGRAFIÍCH 5. Husband B.C., Baldwin S.J. & Suda J. (2013): The incidence of polyploidy in natural plant populations: major patterns and evolutionary processes. In: Greilhuber J., Doležel J., Wendel J. & Leitch I.J. (eds.): Plant Genome Diversity Volume 2: Physical Structure, Behaviour and Evolution of Plant Genomes, pp. 255-276. Springer Verlag. 4. Doležel J., Greilhuber J. & Suda J. (2007): Flow cytometry with plants an overview. In: Doležel J., Greilhuber J. & Suda J. (eds.): Flow Cytometry with Plant Cells. Analysis of Genes, Chromosomes and Genomes, pp. 41-65. Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim. 3. Suda J., Kron P., Husband B. C. & Trávníček P. (2007): Flow cytometry and ploidy: applications in plant systematics, ecology and evolutionary biology. In: Doležel J., Greilhuber J. & Suda J. (eds.): Flow Cytometry with Plant Cells. Analysis of Genes, Chromosomes and Genomes, pp. 103-130. Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim. 2. Loureiro J., Suda J., Doležel J. & Santos C. (2007): FLOWER: A plant DNA flow cytometry database. In: Doležel J., Greilhuber J. & Suda J. (eds.): Flow Cytometry with Plant Cells. Analysis of Genes, Chromosomes and Genomes, pp. 423-438. Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim. 3. Suda J. & Trávníček P. (2006): Estimation of relative nuclear DNA content in dehydrated plant tissues by flow cytometry. In: Robinson J.P., Darzynkiewicz Z., Dobrucki J., Hyun W., Nolan J., Orfao A. & Rabinovitch P. (eds.): Current Protocols in Cytometry. Unit 7.30, pp. 7.30.1-7.30.14. John Wiley & Sons, New York. Kapitoly ve flórách: 4. Suda J. (2002): Violaceae Batsch, Ericaceae Juss., Vacciniaceae S.F. Gray, Pyrolaceae Dum., Monotropaceae Nutt., Empetraceae Lindl. In: Kubát K., Hrouda L., Chrtek J. jun., Kaplan Z., Kirschner J. & Štěpánek J. (eds.): Klíč ke květeně České republiky, pp. 207-214, 231-233, 233-234, 234-236, 236, 237. Academia, Praha. 3. Tan K. & Suda J. (2002): Hesperis, Aethionema. In: Strid A. & Tan K. (eds.): Flora Hellenica. Volume 2, pp. 152-155, 261-265. A.R.G.Gantner Verlag K.G., Ruggell. 4. Suda J. (2001): Teucrium, Inula, Taraxacum. In: Tan K. & Iatrou G. (2001): Endemic Plants of Greece. The Peloponnese, pp. 284-288, 366-368, 392-394. Gads Forlag, København. 1. Tan K. & Suda J. (2000): Cheilanthes Swartz, Alcea L., Plantago L. In: Guner A. et al. (eds.): Flora of Turkey and the East Aegean Islands, vol. 11, pp. 1-2, 71-72, 210-211. Edinburgh University Press, Edinburgh. 1

PŮVODNÍ VĚDECKÉ PRÁCE V MEZINÁRODNÍCH ČASOPISECH S IMPAKT FAKTOREM (HODNOTA IMPAKT FAKTORU UVEDENA PRO ROK 2011) 65. Těšitelová T., Jersáková J., Roy M., Kubátová B., Těšitel J., Urfus T., Trávníček P. & Suda J. (2013): Ploidy-specific symbiotic interactions: divergence of mycorrhizal fungi between cytotypes of the Gymnadenia conopsea group (Orchidaceae). New Phytologist xx: xx-xx (accepted). (IF = 6,645) 64. Kolář F., Lučanová M., Vít P., Urfus T., Chrtek J., Fér T., Ehrendorfer F. & Suda J. (2013): Diversity and endemism in deglaciated areas: ploidy, relative genome size and niche differentiation in the Galium pusillum complex (Rubiaceae) in Northern and Central Europe. Annals of Botany xx: xx-xx (in press, 14 pp.) (IF = 4,030) 63. Jersáková J., Trávníček P., Kubátová B., Krejčíková J., Urfus T., Liu Z.-J., Lamb A., Ponert J., Schulte K., Čurn V., Vrána J., Leitch I.J. & Suda J. (2013): Genome size variation in the subfamily Apostasioideae: filling the phylogenetic gap in orchids. Botanical Journal of the Linnean Society 172/1: 95-105. (IF = 2,821) 62. Krejčíková J., Sudová R., Lučanová M., Trávníček P., Urfus T., Vít P., Weiss-Schneeweiss H., Kolano B., Oberlander K., Dreyer L.L. & Suda J. (2013): High ploidy diversity and distinct patterns of cytotype distribution in a widespread species of Oxalis in the Greater Cape Floristic Region. Annals of Botany 111/4: 641-649. (IF = 4,030) 61. Krejčíková J., Sudová R., Oberlander K.C., Dreyer L.L. & Suda J. (2013): Cytogeography of Oxalis pescaprae in its native range: where are the pentaploids? Biological Invasions xx: xx-xx (in press, 6 pp.) (IF = 2,896) 60. Suda J. & Herben T. (2013): Ploidy frequencies in plants with ploidy heterogeneity: fitting a general gametic model to empirical population data. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences 280/1751: no. 20122387. (10 pp.) (IF = 5,415) 59. Trávníček P., Jersáková J., Kubátová B., Krejčíková J., Bateman R.M., Lučanová M., Krajníková E., Těšitelová T., Štípková Z., Amardeilh J.-P., Brzosko E., Jermakowicz E., Cabanne O., Durka W., Efimov P., Hedrén M., Hermosilla C.E., Kreutz C.A.J., Kull T., Tali K., Marchand O., Rey M., Schiestl F.P., Čurn V. & Suda J. (2012): Minority cytotypes in European populations of the Gymnadenia conopsea complex (Orchidaceae) greatly increase intraspecific and intrapopulation diversity. Annals of Botany 110/5: 977-986. (IF = 4,030) 58. Kolář F., Fér T., Štech M., Trávníček P., Dušková E., Schönswetter P. & Suda J. (2012): Bringing together evolution on serpentine and polyploidy: spatiotemporal history of the ecologically differentiated diploidtetraploid complex of Knautia arvensis (Dipsacaceae). PLoS ONE 7/7: e39988. (13 pp.) (IF = 4,092) 57. Herben T., Suda J., Klimešová J., Mihulka S., Říha P. & Šímová I. (2012): Ecological effects of cell-level processes: genome size, functional traits and regional abundance of herbaceous plant species. Annals of Botany 110/7: 1357-1367. (IF = 4,030) 56. Kolář F., Lučanová M., Těšitel J., Loureiro J. & Suda J. (2012): Glycerol-treated nuclear suspensions an efficient preservation method for flow cytometric analysis of plant samples. Chromosome Research 20/2: 303-315. (IF = 3,087) 55. Kohout P., Sýkorová Z., Čtvrtlíková M., Rydlová J., Suda J., Vohník M. & Sudová R. (2012): Surprising spectra of root-associated fungi in submerged aquatic plants. FEMS Microbiology Ecology 80/1: 216-235. (IF = 3,408) 54. García P.E., Winkler M., Flatscher R., Sonnleitner M., Krejčíková J., Suda J., Hülber K., Schneeweiss G.M. & Schönswetter P. (2012): Extensive range persistence in peripheral and interior refugia characterizes Pleistocene range dynamics in a widespread Alpine plant species (Senecio carniolicus, Asteraceae). Molecular Ecology 21/5: 1255-1270. (IF = 5,522) 2

53. te Beest M., Le Roux J.J., Richardson D.M., Brysting A.K., Suda J., Kubešová M. & Pyšek P. (2012): The more the better? The role of polyploidy in facilitating plant invasions. Annals of Botany 109/1: 19-45. (IF = 4,030) 52. Doubková P., Suda J. & Sudová R. (2012): The symbiosis with arbuscular mycorrhizal fungi contributes to plant tolerance to serpentine edaphic stress. Soil Biology & Biochemistry 44/1: 56-64. (IF = 3,504) 51. Gallagher R.V., Leishman M.R., Miller J.T., Hui C., Richardson D.M., Suda J. & Trávníček P. (2011): Invasiveness in introduced Australian acacias: the role of species traits and genome size. Diversity and Distributions 17/5: 884-897. (IF = 4,830) 50. Hörandl E., Dobeš C., Suda J., Vít P., Urfus T., Temsch E.M., Cosendai A.-C., Wagner J. & Ladinig U. (2011): Apomixis is not prevalent in subnival to nival plants of the European Alps. Annals of Botany 108/2: 381-390. (IF = 4,030) 49. Doubková P., Suda J. & Sudová R. (2011): Arbuscular mycorrhizal symbiosis on serpentine soils: the effect of native fungal communities on different Knautia arvensis ecotypes. Plant and Soil 345/1-2: 325-338. (IF = 2,733) 48. Trávníček P., Kubátová B., Čurn V., Rauchová J., Krajníková E., Jersáková J. & Suda J. (2011): Remarkable coexistence of multiple cytotypes of the fragrant orchid (Gymnadenia conopsea agg.): evidence from flow cytometry. Annals of Botany 107/1: 77-87. (IF = 4,030) 47. Sonnleitner M., Flatscher R., García P.E., Rauchová J., Suda J., Schneeweiss G.M., Hülber K. & Schönswetter P. (2010): Distribution and habitat segregation on different spatial scales among diploid, tetraploid and hexaploid cytotypes of Senecio carniolicus (Asteraceae) in the Eastern Alps. Annals of Botany 106/6: 967-977. (IF = 4,030) 46. Le Roux J.J., Geerts S., Ivey P., Krauss S., Richardson D.M., Suda J. & Wilson J.R.U. (2010): Molecular systematics and ecology of invasive Kangaroo Paws in South Africa: management implications for a horticulturally important genus. Biological Invasions 12/12: 3989-4002. (IF = 2,896) 45. Sudová R., Rydlová J., Münzbergová Z. & Suda J. (2010): Ploidy-specific interactions of three host plants with arbuscular mycorrhizal fungi: Does genome copy number matter? American Journal of Botany 97/11: 1798-1807. (IF = 2,664) 44. Suda J. & Leitch I.J. (2010): The quest for suitable reference standards in genome size research. Cytometry Part A 77A/8: 717-720. (IF = 3,729) 43. Ekrt L., Holubová R., Trávníček P. & Suda J. (2010): Species boundaries and frequency of hybridization in the Dryopteris carthusiana (Dryopteridaceae) complex: a taxonomic puzzle resolved using genome size data. American Journal of Botany 97/7: 1208-1219. (IF = 2,664) 42. Suda J. & Pyšek P. (2010): Flow cytometry in botanical research: introduction. Preslia 82/1: 1-2. (IF = 2,521) 41. Loureiro J., Trávníček P., Rauchová J., Urfus T., Vít P., Štech M., Castro S. & Suda J. (2010): The use of flow cytometry in the biosystematics, ecology and population biology of homoploid plant. Preslia 82/1: 3-21. (IF = 2,521) 40. Kubešová M., Moravcová L., Suda J., Jarošík V. & Pyšek P. (2010): Naturalized plants have smaller genomes than their non-invading relatives: a flow cytometric analysis of the Czech alien flora. Preslia 82/1: 81-96. (IF = 2,521) 39. Suda J., Trávníček P., Mandák B. & Berchová-Bímová K. (2010): Genome size as a marker for identifying the invasive alien taxa in Fallopia section Reynoutria. Preslia 82/1: 97-106. (IF = 2,521) 38. Dušková E., Kolář F., Sklenář P., Kubešová M., Rauchová J., Fér T., Suda J. & Marhold K. (2010): Genome size correlates to growth forms, habitat and phylogeny in the Andean genus Lasiocephalus (Asteraceae). Preslia 82/1: 127-148. (IF = 2,521) 3

37. Trávníček P., Eliášová E. & Suda J. (2010): The distribution of cytotypes of Vicia cracca in Central Europe: the changes that have occurred over the last four decades. Preslia 82/1: 149-163. (IF = 2,521) 36. Serçe S., Ekbiç E., Suda J., Gündüz K. & Kiyga Y. (2010): Karyological features of wild and cultivated forms of myrtle (Myrtus communis, Myrtaceae). Genetics and Molecular Research 9/1: 429-433. (IF = 1,184) 35. Qin Q., McCallum E.J, Kaas Q., Suda J., Saska I., Craik D.J. & Mylne J.S. (2010): Identification of candidates for cyclotide biosynthesis and cyclisation by expressed sequence tag analysis of Oldenlandia affinis. BMC Genomics 11: 111. (11 pp.) (IF = 4,073) 34. Hülber K., Sonnleitner M., Flatscher R., Berger A., Dobrovsky R., Niessner S., Nigl T., Schneeweiss G.M., Kubešová M., Rauchová J., Suda J. & Schönswetter P. (2009): Ecological segregation drives fine scale cytotype distribution of Senecio carniolicus (Asteraceae) in the Eastern Alps. Preslia 81/3: 309-319. (IF = 2,521) 33. Leitch I.J., Kahandawala I., Suda J., Hanson L., Ingrouille M.J., Chase M.W. & Fay M.F. (2009): Genome size diversity in orchids consequences and evolution. Annals of Botany 104/3: 469-481. (IF = 4,030) 32. Suda J., Loureiro J., Trávníček P., Rauchová J., Vít P., Urfus T., Kubešová M., Dreyer L.L., Oberlander K.C., Wester P. & Roets F. (2009): Flow cytometry and its applications in plant population biology, ecology and biosystematics: new prospects for the Cape flora. South African Journal of Botany 75/2: 389. (IF = 1,659) 31. Kolář F., Štech M., Trávníček P., Rauchová J., Urfus T., Vít P., Kubešová M. & Suda J. (2009): Towards resolving the Knautia arvensis agg. (Dipsacaceae) puzzle: primary and secondary contact zones and ploidy segregation at landscape and microgeographic scales. Annals of Botany 103/6: 963-974. (IF = 4,030) 30. Slovák M., Vít P., Urfus T. & Suda J. (2009): Complex pattern of genome size variation in a polymorphic member of the Asteraceae. Journal of Biogeography 36/2: 372-384. (IF = 4,544) 29. Dixon C.J., Schönswetter P., Suda J., Wiedermann M. & Schneeweiss G.M. (2009): Reciprocal Pleistocene origin and postglacial range formation of an allopolyploid and its sympatric ancestors (Androsace adfinis group, Primulaceae). Molecular Phylogenetics and Evolution 50/1: 74-83. (IF = 3,609) 28. Lepší M., Vít P., Lepší P., Boublík K. & Suda J. (2008): Sorbus milensis, a new hybridogenous species from Northwestern Bohemia. Preslia 80/2: 229-244. (IF = 2,521) 27. Loureiro J., Doležel J., Greilhuber J., Santos C. & Suda J. (2008): Plant flow cytometry far beyond the Stone Age. Cytometry Part A 73A/7: 579-580. (IF = 3,729) 26. Popp M., Gizaw A., Nemomissa S., Suda J. & Brochmann C. (2008): Colonization and diversification in the African sky islands by Eurasian Lychnis L. (Caryophyllaceae). Journal of Biogeography 35/6: 1016-1029. (IF = 4,544) 25. Kubátová B., Trávníček P., Bastlová D., Čurn V. & Suda J. (2008): DNA-ploidy level variation in native and invasive populations of Lythrum salicaria L. (Lythraceae) at large geographic scale. Journal of Biogeography 35/1: 167-176. (IF = 4,544) 24. Doležel J., Greilhuber J. & Suda J. (2007): Estimation of nuclear DNA content in plants using flow cytometry. Nature Protocols 2/9: 2233-2244. (IF = 9,924) 23. Schönswetter P., Lachmayer M., Lettner C., Prehsler D., Rechnitzer S., Reich D.S., Sonnleitner M., Wagner I., Hülber I., Schneeweiss G.M., Trávníček P. & Suda J. (2007): Sympatric diploid and hexaploid cytotypes of Eastern Alpine Senecio carniolicus (Asteraceae) are separated along an altitudinal gradient. Journal of Plant Research 120/6: 721-725. (IF = 1,746) 22. Suda J., Krahulcová A., Trávníček P., Rosenbaumová R., Peckert T. & Krahulec F. (2007): Genome size variation and species relationships in Hieracium subgen. Pilosella (Asteraceae) as inferred by flow cytometry. Annals of Botany 100/6: 1323-1335. (IF = 4,030) 4

21. Leong-Škorničková J., Šída O., Jarolímová V., Sabu M., Fér T., Trávníček P. & Suda J. (2007): Chromosome numbers and genome size variation in Indian species of Curcuma L. (Zingiberaceae). Annals of Botany 100/3: 500-526. (IF = 4,030) 20. Eidesen P.B., Alsos I.G., Popp M., Stensrud Ø., Suda J. & Brochmann C. (2007): Nuclear vs. plastid data: complex Pleistocene history of a circumpolar key species. Molecular Ecology 16/18: 3902-3925. (IF = 5,522) 19. Kron P., Suda J. & Husband B.C. (2007): Applications of flow cytometry to evolutionary and population biology. Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics 38: 847-876. (IF = 14,373) 18. Suda J., Weiss-Schneeweiss H., Tribsch A., Schneeweiss G., Trávníček P. & Schönswetter P. (2007): Complex distribution patterns of di-, tetra- and hexaploid cytotypes in the European high mountain plant Senecio carniolicus Willd. (Asteraceae). American Journal of Botany 94/8: 1391-1401. (IF = 2,664) 17. Schönswetter P., Suda J., Popp M., Weiss-Schneeweiss H. & Brochmann C. (2007): Circumpolar phylogeography of Juncus biglumis (Juncaceae) inferred from AFLP fingerprints, cpdna sequences, nuclear DNA content and chromosome numbers. Molecular Phylogenetics and Evolution 42/1: 92-103. (IF = 3,609) 16. Kyncl T., Suda J., Wild J., Wildová R. & Herben T. (2006): Population dynamics and clonal growth of Spartocytisus supranubius (Fabaceae), a dominant shrub in the alpine zone of Tenerife, Canary Islands. Plant Ecology 186/1: 97-108. (IF = 1,829) 15. Suda J., Krahulcová A., Trávníček P. & Krahulec F. (2006): Ploidy level versus DNA ploidy level: an appeal for consistent terminology. Taxon 55/2: 447-450. (IF = 2,703) 14. Suda J. & Trávníček P. (2006): Reliable DNA ploidy determination in dehydrated tissues of vascular plants by DAPI flow cytometry: new prospects for plant research. Cytometry Part A 69A/4: 273-280. (IF = 3,729) 13. Krahulcová A. & Suda J. (2006): A modified method of flow cytometric seed screen simplifies the quantification of progeny classes with different ploidy levels. Biologia Plantarum 50/3: 457-460. (IF = 1,974) 12. Mahelka V., Suda J., Jarolímová V., Trávníček P. & Krahulec F. (2005): Genome size discriminates between closely related taxa Elytrigia repens and E. intermedia (Poaceae: Triticeae) and their hybrid. Folia Geobotanica 40/4: 367-384. (IF = 1,500) 11. Herben T., Suda J. & Munclinger P. (2005): The ghost of hybridization past: niche pre-emption is not the only explanation of apparent monofyly in island endemics. Journal of Ecology 93/3: 572-575. (IF = 5,044) 10. Suda J., Kyncl T. & Jarolímová V. (2005): Nuclear DNA amounts in Macaronesian angiosperms: forty percent of Canarian endemic flora completed. Plant Systematics and Evolution 252/3-4: 215-238. (IF = 1,335) 9. Bureš P., Yi-Feng W., Horová L. & Suda J. (2004): Genome size variation in Central European species of Cirsium (Compositae) and their natural hybrids. Annals of Botany 94/3: 353-363. (IF = 4,030) 8. Suda J., Malcová R., Abazid D., Banaš M., Procházka F., Šída O. & Štech M. (2004): Cytotype distribution in Empetrum (Ericaceae) at various spatial scales in the Czech Republic. Folia Geobotanica 39/2: 161-171. (IF = 1,500) 7. Rosenbaumová R., Plačková I. & Suda J. (2004): Variation in Lamium subg. Galeobdolon (Lamiaceae) insights from ploidy levels, morphology and isozymes. Plant Systematics and Evolution 244/3-4: 219-244. (IF = 1,335) 6. Mandák B., Pyšek P., Lysák M. A., Suda J., Krahulcová A. & Bímová K. (2003): Variation in DNA-ploidy levels of Reynoutria taxa in the Czech Republic. Annals of Botany 92/4: 265-272. (IF = 4,030) 5. Suda J., Kyncl T. & Wildová R. (2003): Nuclear DNA amount in Macaronesian angiosperms. Annals of Botany 92/1: 153-164. (IF = 4,030) 5

4. Maldonado San Martín A.P., Adamec L., Suda J., Mes T.H.M. & Štorchová H. (2003): Genetic variation within the endangered species Aldrovanda vesiculosa (Droseraceae) as revealed by RAPD analysis. Aquatic Botany 75/2: 159-172. (IF = 1,516) 3. Suda J. (2003): Sympatric occurrences of various cytotypes of Vaccinium sect. Oxycoccus (Ericaceae). Nordic Journal of Botany 22/5: 593-601. (IF = 0,551) 2. Suda J. (2002): New DNA ploidy level in Empetrum (Empetraceae) revealed by flow cytometry. Annales Botanici Fennici 39/2: 133-141. (IF = 1,014) 1. Suda J. & Lysák M. A. (2001): A taxonomic study of the Vaccinium sect. Oxycoccus (Hill) W.D.J. Koch (Ericaceae) in the Czech Republic and adjacent territories. Folia Geobotanica 36/3: 303-319. (IF = 1,500) PŮVODNÍ VĚDECKÉ PRÁCE V ČASOPISECH S RECENZNÍM ŘÍZENÍM (BEZ IF) 9. Suda J. (2011): Průtoková cytometrie a její využití v botanice. Zprávy České Botanické Společnosti 46, Materiály 25: 21-42. 8. Greilhuber J., Doležel J., Leitch I.J., Loureiro J. & Suda J. (2010): Genome size. Journal of Botany, article ID 946138. (4 pp.) 7. Bastlová D., Květ J., Kubátová B., Trávníček P., Čurn V. & Suda J. (2008): Variabilita ve fenologii a ploidních hladinách původních a invazních populací kypreje vrbice (Lythrum salicaria) v širším geografickém měřítku. Zprávy České Botanické Společnosti 43, Materiály 23: 103-112. 6. Holá D., Suda J., Kočová M., Rothová O., Salava J. & Chodová D. (2007): Endopolyploidy pattern and efficiency of photosynthetic electron transport in Kochia scoparia (L.) Schrad. biotypes resistant/sensitive to atrazine and/or ALS inhibitors. Herbologia 8/2: 71-83. 5. Abazid D., Sudová R. & Suda J. (2004): Rod Empetrum (šicha) na rašeliništích Krkonoš. Opera Concortica 41: 148-152. 4. Tan K., Suda J. & Raus T. (2003): Proposal to conserve the name Inula verbascifolia (Willd.) Hausskn. against I. verbascifolia Poir. (Asteraceae) and with a conserved type. Taxon 52/2: 358-359. 3. Abazid D. & Suda J. (2000): Rod Oxycoccus (klikva) v Krkonoších taxonomická revize, rozšíření a cenologie jednotlivých druhů a ploidních úrovní (předběžné výsledky). Opera Concortica 37: 166-167. 2. Suda J. (1999): Výskyt Linaria arvensis na Blatensku. Zprávy České Botanické Společnosti 34/1: 73-75. 1. Suda J. (1997): Taxonomická problematika rodu Oxycoccus v České republice se zvláštním zřetelem k území Šumavy. Zprávy České Botanické Společnosti 32/2: 189-195. UČEBNICE A UČEBNÍ TEXTY 3. Vilímová J. & Suda J. (2012): Organismy strom života. Nakladatelství P3K, Praha, 52 pp. ISBN 978-80- 87186-88-6. 2. Suda J. (2004): Příručka k terénnímu cvičení Dobronice cévnaté rostliny. ms., 53 pp. (https://is.cuni.cz/studium/predmety/index.php?id=37653cd6bb1ff49fbc1591cf653c7677&tid=&do=downlo ad&did=36176&kod=mb120p20) 1. Marhold K. & Suda J. (2002): Statistické zpracování mnohorozměrných dat v taxonomii (Fenetické metody). Karolinum, Praha, 159 pp. ISBN 80-246-0438-8. 6

PŘEDNÁŠKY TYPU INVITED SPEAKERS 6. Suda J.: Polyploidy, microevolution and species level systematics: advances made by DNA flow cytometry. Botany 2013, New Orleans, LA, USA, 27.-31.7. 2013. 5. Suda J.: Use of flow cytometry in research on apomictic plants. 19 th International Symposium of the German Botanical Society, Vienna, Austria, 16.-19.9. 2010. 4. Suda J.: The use of flow cytometry in plant biosystematics. XI Conference of International Organization of Plant Biosystematics, Aurangabad, India, 2.-4.9. 2010 (keynote lecture). 3. Suda J.: Flow cytometry and its applications in plant population biology, ecology and biosystematics: new prospects for the Cape flora. 35 th Annual Conference of the South African Association of Botanists, Stellenbosch, South Africa, 19.-23.1. 2009 (keynote lecture). 2. Suda J.: Does insular environment affect genome size? Evidence from Macaronesian flora. XVII International Botanical Congress, Vienna, Austria, 17.-23.7. 2005. 1. Suda J.: Relative genome size estimation in herbarium vouchers by DAPI flow cytometry. Genome size workshop: research discipline in development, Vienna, Austria, 22.7. 2005. Zvané přednášky na zahraničních univerzitách: 9. Suda J.: The impact of flow cytometry on plant population biology, ecology and biosystematics. University of Innsbruck, Austria, 20.6. 2012. 8. Suda J. Intraspecific variation in ploidy level and genome size. University of Vienna, Austria, 5.11. 2010. 7. Suda J.: The use of flow cytometry in plant biosystematics. University of Delhi, India, 7.9. 2010. 6. Suda J.: Applications of flow cytometry to plant biosystematics, ecology and evolutionary biology. University of Vienna, Austria, 29.6. 2009. 5. Suda J.: Applications of flow cytometry in plant biosystematics, ecology and evolutionary biology. University of Zurich, Switzerland, 6.4. 2009. 5. Suda J.: Applications of flow cytometry in plant biosystematics, ecology and evolutionary biology. Workshop to NUFU project Afro-alpine 'sky islands': genetic versus taxonomic biodiversity, climate change, and conservation, Kampala, Uganda, 19.7. 2008. 3. Suda J.: The impact of flow cytometry on plant biosystematics, ecology and population biology. University of Stellenbosch, South Africa, 17.8. 2007. 2. Suda J.: Applications of flow cytometry in plant biosystematics, ecology and evolutionary biology. University of Oslo, Norway, 26.10. 2006. 1. Suda J.: Applications of flow cytometry in plant biosystematics, ecology and evolutionary biology. University of Vienna, Austria, 3.4. 2006. DISERTAČNÍ, RIGORÓZNÍ, HABILITAČNÍ PRÁCE 2. Suda J. (2007): The impact of flow cytometry on plant biosystematics, ecology, and population biology. 22 pp. + papers 1-21. Depon. in: Knihovna katedry botaniky PřF UK, Praha. (habilitační práce) 1. Suda J. (2004): An employment of flow cytometry into plant biosystematics. 50 pp. + papers 1-8 + appendix. Depon. in: Knihovna katedry botaniky PřF UK, Praha. (dizertační práce) http://www.ibot.cas.cz/fcm/suda/presentation/disertation.pdf 7

ÚČAST NA ŘEŠENÍ GRANTŮ Řešitel: (celková výše financí pro PřF UK: 24 154 tis.) 20. 2012-2015 (GAČR P506/12/1320): Změní orchideje náš pohled na celogenomové procesy? Komplexní studium hyporeduplikace. 19. 2011-2012 (MŠMT MEB061101): Polyploidní evoluce v kapské květenné oblasti na příkladu rodu šťavel (program Aktion). 18. 2010-2013 (GAČR P506/10/0643): Polyploidní evoluce v kapské květenné oblasti: rod Oxalis jako modelová skupina. 17. 2010-2013 (GAČR P506/10/0704): Migrační nebo postglaciální původ diverzity v odledněných oblastech: příběh polyploidního komplexu Galium pumilum agg. 16. 2009-2012 (GAČR 206/09/0843): Procesy ovlivňující vznik a evoluční úspěšnost polyploidů: co umožňuje koexistenci různých cytotypů v populacích Gymnadenia conopsea? 15. 2007 (FRVŠ 805/2007): Inovace výuky na přírodovědeckých fakultách českých vysokých škol přednáškový cyklus prof. B. C. Husbanda (University of Guelph, Ontario): Evoluční ekologie a populační genetika rostlin. 14. 2006-2008 (GAAV B601110627): Evoluční vztahy a diferenciace reliktních hadcových populací Knautia arvensis s.l. (Dipsacaceae) ve střední Evropě. 13. 2006-2008 (GAČR, 206/06/0598): Evoluční dynamika diploidně-polyploidních komplexů cévnatých rostlin. 12. 2005-2006 (GAUK 212/2005): Evoluční vztahy a diferenciace cytotypů u ohroženého zvonku Campanula gentilis. 11. 2005-2006 (GAUK 201/2005): Okruh Pimpinella saxifraga jako modelová skupina pro studium populační struktury a cytotypové diferenciace u víceploidních druhů. 10. 2005 (FRVŠ 947/2005): Rozšíření praktické výuky průtokové cytometrie na Přírodovědecké fakultě Univerzity Karlovy: příklad integrujícího kurzu pro studenty bakalářského, magisterského i doktorandského stupně. 9. 2004-2006 (GAUK 250/2004/B-BIO/PřF): Endemické hybridogenní druhy jeřábů (Sorbus) české květeny kritické zhodnocení pomocí moderních biosystematických metod. 8. 2004 (FRVŠ 912/2004): Inovace Laboratoře cytometrických metod pro praktickou výuku studentů. 7. 2003 (FRVŠ 2829/2003): Velikost jaderného genomu v rodu Reynoutria stabilní nebo variabilní? 6. 2002-2003 (GAUK 149/2002/B-BIO/PřF): Velikost jaderného genomu klíč k poznání vzájemných příbuzenských vztahů středoevropských taxonů Hieracium subgen. Pilosella? 5. 2002 (FRVŠ 2268/2002): Biosystematická studie polyploidního komplexu Campanula patula L. 4. 2001-2003 (GAUK 140/2001 B BIO): Biosystematická studie rodu Empetrum. 3. 2001(University of Copenhagen): Botanical exploration of the Mali i Thatë Mts. (SE Albania). 2. 2001 (FRVŠ 1788/2001): Využití průtokové cytometrie v taxonomickém studiu rodu Galeobdolon. 1. 1998 (GAUK 99/1998/B BIO): Zhodnocení společného výskytu rostlin různých ploidních úrovní rodu Oxycoccus metodou průtokové cytometrie. 8

Spoluřešitel: (celková výše financí pro PřF UK: 4 405 tis.) 5. 2008-2010 (GAAV IAA601410806): Mikrospeciační procesy a migrační historie skupiny Melampyrum subalpinum agg. (řešitel M. Štech). 4. 2007-2010 (GAČR 206/07/1555): Diverzita flóry Balkánu a východního Středomoří v českých a moravských herbářových sbírkách národní dědictví světového významu (III) (řešitel J. Štěpánek). 3. 2004-2006 (GAČR 206/04/0081): Evolučně konzervativní a proměnlivé elementy v populační biologii rostlin (řešitel T. Herben). 2. 2004-2006 (GAČR 206/04/0995): Diverzita evropské flóry v českých a moravských herbářových sbírkách z přelomu 18. a 19. století národní dědictví světového významu (II) (řešitel J. Štěpánek). 1. 2001-2003 (GAČR 206/01/0687): Diverzita tropické flóry v českých herbářích národní dědictví světového významu: sbírky Th. Haenkeho, K.B. Presla a K. Domina (řešitel J. Štěpánek). Člen týmu: 20. 2013-2015 (MŠMT CZ.1.07/2.3.00/30.0048): Integrace experimentální a populační biologie pomocí nových metod vmezioborové problematice cesta k excellenci s mladými vědci (OP Vzdělávání pro konkurenceschopnost, řešitel J. Doležal). 19. 2013-2014 (MŠMT 7AMB13AT015): Heteroploidní a homoploidní hybridizace vzácných českých a rakouských endemických zástupců rodu Knautia (program Aktion, řešitel T. Fér). 18. 2011 (FRVŠ 444): Výuková laboratoř molekulární biologie a cytogenetiky rostlin (řešitel T. Fér). 17. 2010-2013 (GAČR 506/10/1363): Fylogeneze subtribu Hieraciinae (Asteraceae) modelový příklad kontrastních evolučních strategií v blízce příbuzných liniích (řešitel J. Chrtek). 16. 2009-2011(GAČR 521/09/0202): Evoluce velikosti genomu a původ polyploidie v ekonomicky významné čeledi zázvorovité (Zingiberaceae) (řešitel O. Šída). 15. 2008-2010 (GAAV KJB601110813): Mikroevoluční procesy v okrajových populacích rostlin s plodní heterogenitou: Hieracium echioides jako modelový systém (řešitel P. Trávníček). 14. 2008-2010 (GAAV KJB600050812): Význam arbuskulární mykorhizní symbiózy pro růst rostlin v hadcových půdách: Knautia arvensis (Dipsacaceae) jako modelová rostlina (řešitel R. Sudová). 13. 2007-2011 (NUFU): AFROALP II: Afro-alpine 'sky islands': genetic versus taxonomic biodiversity, climate change, and conservation (řešitel C. Brochmann). 12. 2007-2010 (GAČR 206/07/0273): Fylogeneze rodu Lasiocephalus (Asteraceae) historie kolonizování prostředí rovníkových páramos (řešitel K. Marhold). 11. 2007-2009 (GAAV KJB601110709): Významný český endemitní rožec Cerastium alsinifolium evoluční historie, reprodukční úspěšnost a důsledky křížení s Cerastium arvense (řešitel P. Vít). 10. 2006-2011 (MŠMT 2B06178): Priority druhové ochrany cévnatých rostlin (Národní program výzkumu II, řešitel Z. Münzbergová). 9. 2006-2008 (GAUK 145/2006): Biosystematická studie okruhu Anthoxanthum odoratum sensu lato v České republice a přilehlých územích (řešitel P. Trávníček). 8. 2006-2008 (GAUK 147/2006): Cytotypová a genetická struktura sympatrických populací Vicia cracca (řešitel P. Trávníček). 7. 2005-2007 (GAČR 206/05/0323): Srovnávací ekologie generativního rozmnožování zavlečených rostlin (řešitel L. Moravcová). 6. 2005-2007 (GAČR 206/05/0970): Monografie rodu Taraxacum na úrovni sekce (řešitel J. Kirschner). 9

5. 2004 (FRVŠ 1879/2004): Využití izoenzymové analýzy při studiu způsobů reprodukce rodu Galeobdolon (řešitel R. Rosenbaumová). 4. 2003-2005 (GAAV B611130373): Separace vlivu velikosti populace a kompetitivního prostředí na fitness druhu (řešitel Z. Münzbergová). 3. 2002-2004 (GAČR 206/02/0582): Evoluce v hybridogenní populaci rodu Tragopogon: liší se vývoj v Čechách a v USA? (řešitel F. Krahulec). 2. 2000 (FRVŠ 1793/2000): Ekologická diferenciace středoevropských zástupců Erigeron acris agg. (řešitel O. Šída). 1. 2000 (FRVŠ 1797/2000): Fylogenetická klasifikace cévnatých rostlin multimediální srovnání (řešitel L. Hrouda). + vedoucí 7 studentských projektů GAUK (116710 Kabátová, 120810 Rooks, 410111 Krejčíková, 418411 Hanzl, 601212 Kalůsková, 913213 Hanzl, 670213 Šemberová) OSTATNÍ PUBLIKACE 5. Greilhuber J., Doležel J., Leitch I. J., Loureiro J. & Suda J., eds. (2010): Genome size. Journal of Botany, 157 pp. 4. Čada V. & Suda J. (2009): Příroda Chanovicka. Obec Chanovice, 144 pp. 3. Suda J. (2000): Flora of North America North of Mexico. Vol. 3. Magnoliidae and Hamamelidae (review). Folia Geobotanica 35/1: 101-102. 2. Chán V., ed. (1999) (spoluautor J. Suda): Komentovaný Červený seznam květeny jižní části Čech. Příroda 16: 1-284. 1. Suda J. (1999): Taxonomic problems in cranberries Oxycoccus (Ericaceae). Botanical Electronic News 232. http://www.ou.edu/cas/botany-micro/ben/ben232.html. Popularizační články v časopisu Živa: 37. Jersáková J., Ponert J., Trávníček P. & Suda J. (2013): Apostasoideae nejtajemnější podčeleď orchidejí. Živa 61/3: xx-xx. 36. Suda J. & Herben T. (2012): Katedra botaniky Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy v Praze. Živa 60/4: LXXXII (suppl.). 35. Suda J. (2012): Výzkum kapské květeny. Živa 60/4: 193-194. 34. Suda J. & Kaplan Z. (2012): Rostlinný endemismus a endemity české květeny. Živa 60/4: 168-174. 33. Suda J. (2012): Editorial. Živa 60/4: 150. 32. Kabátová K., Vít P. & Suda J. (2012): Lekníny známé neznámé. Živa 60/2: 60-63. 31. Suda J. (2012): Čeká nás katastrofický rok 2012? Živa 60/1: I (suppl.). 30. Krejčová N., Urfus T. & Suda J. (2011): Jak častý je hybridní koniklec Hackelův? Živa 59/4: 159-160. 29. Kalůsková J., Šlechtová A. & Suda J. (2010): Ostře sledovaný hvozdík písečný český. Živa 58/4: 156-157. 28. Suda J. (2009): Darwinova odporná záhada po 130 letech aneb souvisí polyploidie s rozmanitostí krytosemenných rostlin? Živa 57/5: 204-208. 27. Rauchová J. & Suda J. (2009): Zvonek jemný přehlížená vzácnost naší květeny. Živa 57/4: 160-162. 26. Suda J. (2009): Na startovní čáře. Živa 57/1: I-II (suppl.). 10

25. Suda J. & Sudová R. (2007): Kapsko botanický ráj (6). Namaqualand: když rozkvete poušť. Živa 55/6: 261-264. 24. Suda J. & Sudová R. (2007): Kapsko botanický ráj (5). Cibuloviny na každém kroku. Živa 55/5: 213-216. 23. Suda J. & Sudová R. (2007): Kapsko botanický ráj (4). Trio typických kapských čeledí. Živa 55/4: 164-168. 22. Suda J. & Sudová R. (2007): Kapsko botanický ráj (3). Vegetační mozaika: od fynbos po vždyzelené lesy a sukulentní karoo. Živa 55/3: 117-120. 21. Suda J. & Sudová R. (2007): Kapsko botanický ráj (2). Proč je kapská květena tak jedinečná? Živa 55/2: 69-72. 20. Suda J. & Sudová R. (2007): Kapsko botanický ráj (1). Kapská oblast se představuje. Živa 55/1: 22-24. 19. Vít P. & Suda J. (2006): Endemické jeřáby perly mezi českými dřevinami. Živa 54/6: 251-255. 18. Suda J. (2006): Nebojte se biosystematiky. Živa 54/1: V-VI (suppl.). 17. Rosenbaumová R. & Suda J. (2005): Pitulníky: botanická tajenka a její (roz)luštění. Živa 53/6: 253-255. 16. Suda J. (2005): XVII. mezinárodní botanický kongres ve Vídni. Živa 53/5: LVIII (suppl.). 15. Suda J. (2005): Co se skrývá za rostlinnou průtokovou cytometrií? Živa 53/1: 46-48. 14. Suda J. (2004): Za kvetoucími skvosty podzimního Peloponésu. Živa 52/5: 213-216. 13. Chrtek J., Suda J., Krahulec F. & Krahulcová A. (2004): Chlupáčky včera, dnes a zítra. Živa, zvláštní výtisk: 14-16. 12. Suda J. (2003): Šichy a jejich příbuzenstvo. Živa 51/3: 110-114. 11. Suda J. (2002): Květena Kanárských ostrovů recenze. Živa 50/6: LXXXVIII (suppl.). 10. Suda J. (2002): Co víme a nevíme o klikvách z botanického i kulinářského pohledu. Živa 50/3: 114-117. 9. Suda J. (2002): Pavel Kovář * 1.6. 1952. Živa 50/3: XXXV (suppl.). 8. Suda J. (2001): Jsme kulturní národ? Živa 49/5: LXXVII-LXXIX (suppl.). 7. Suda J., Bauer P., Brabec J. & Hadinec J. (2001): Znovunalezené druhy naší květeny. Třezalka pěkná. Živa 49/3: 113-115. 6. Suda J. (2001): Znovunalezené druhy naší květeny lnice rolní. Živa 49/1: 17-19. 5. Suda J. (2000): Parazitická ozorna obecná evropský příbuzný raflézie. Živa 48/6: 256-257. 4. Suda J., Bauer P., Brabec J. & Hadinec J. (2000): Znovunalezené druhy naší květeny žabníček vzplývavý. Živa 48/5: 205-207. 3. Suda J. (2000): Psaní popularizačních článků aneb proč v Živě publikuji méně, nežli bych chtěl. Živa 48/3: XLVI (suppl.). 2. Suda J. (1999): Konference rostlinných taxonomů. Živa 47/6: LXXXII (suppl.). 3. Suda J. (1999): Zelené klenoty Andalusie. Živa 47/4: 164-168. V Praze 1. 5. 2013 Jan Suda 11