Témata BP PS 2013 Téma 1 Buněčné signální dráhy regulující aktivitu nádorového supresoru p53 Školitel: Mgr. Stjepan Uldrijan, CSc. Pracoviště: Biologický ústav LF MU Téma 2 Indukce neurodiferenciace v podmínkách in vitro Školitel: Mgr. Stjepan Uldrijan, CSc. Téma 3 Úloha Wnt dráhy v patogenezi chronické lymfocytární leukémie Školitel: Mgr. Šárka Pavlová, PhD. Konzultant: Mgr. Vítězslav Bryja, Ph.D. Student: Igor Greif Téma 4 Molekulární podstata regulace dlouživého růstu hypokotylu jako odpovědi rostlin na zastínění. Školitelka: Mgr. Gabriela Rotková, Ph.D. Téma 5 Epigenetické znaky apoptotických buněk Školitel: doc. RNDr. Eva Bártová, Ph.D. Konzultant: Mgr. Soňa Legartová Pracoviště: Biofyzikální ústav AV ČR Téma 6 Signalizace přes B-bunečný receptor: důležitá dráha pro patogenezi a terapii B buněčných malignit Školitel: MUDr. Mgr. Marek Mráz, Ph.D. Pracoviště: Centrum molekulární biologie a genové terapie (IHOK, FN Brno) a CEITEC MU Téma 7 Úloha microrna ve vývoji a funkcích imunitního systému Školitel: MUDr. Mgr. Marek Mráz, Ph.D. Téma 8 Strukturní analýza pohlavních chromozomů u rodu Silene Školitel: RNDR. Roman Hobza, Ph.D. Pracoviště: Biofyzikální ústav AV ČR, Oddělení vývojové genetiky Téma 9 Moderní metody funkční genomiky a genetického inženýrství rostlin Školitel: Ing. Vojtěch Hudzieczek Pracoviště: Biofyzikální ústav AV ČR, Oddělení vývojové genetiky Student: Martin Kočka Téma 10 Epigenetické reprogramování u rostlin a živočichů Školitel: Zdeněk Kubát, Ph.D. Pracoviště: Biofyzikální ústav AV ČR, Oddělení vývojové genetiky Téma 11 Epigenetické modifikace u nádorových onemocnění Školitel: Mgr. Václav Brázda, Ph.D. Konzultanti: Doc. RNDr. Miroslav Fojta CSc., prof. Cheryl H. Arrowsmith, Ph.D. Pracoviště: Biofyzikální ústav AV ČR
Téma 12 Použití molekulárně biologických metod k rozlišení infekčních a neinfekčních virových agens způsobujících alimentární onemocnění Školitelka: Mgr. Petra Vašíčková, Ph.D. Téma 13 Použití metody magnetických separací pro detekci mykobakterií z biologického materiálu Školitelka: Mgr. Iva Slaná, Ph.D. Téma 14 Detekce životaschopnosti bakterií pomocí metody realtime PCR Školitelka: MSc. Barbora Klanicová Téma 15 Design real-time PCR testů pro rozlišení klinicky významných bakteriálních kmenů Školitelka: Mgr. Iva Kubíková Téma 16 Pyrosekvenace jako nástroj metagenomických studií Školitel: MVDr. Zoran Jaglič, Ph.D. Téma 17 Analýza výsledků získaných pomocí pyrosekvenováním Školitelka: Ing. Marija Kaevska, Ph.D. Téma 18 Serinové peptidázy helmintů Školitel: RNDr. Martin Kašný, Ph.D. Pracoviště: Ústav botaniky a Zoologie - Odd. parazitologie, PřF MU Téma 19 Genomové projekty realizované na helmintech Školitel: RNDr. Martin Kašný, Ph.D. Téma 20 Paleogenomika brukvovitých rostlin: ancestrální genomy a paleopolyploidie Školitel: doc. Mgr. Martin Lysák, Ph.D. Konzultant: Mgr. Terezie Mandáková, Ph.D. Pracoviště: Laboratoř cytogenomiky rostlin, CEITEC MU Studentka: Michaela Marečková Téma 21 AID pomocník či nepřítel? Školitelka: Mgr. Kristína Zápražná, Ph.D. Pracoviště: Laboratoř lékařské genomiky, CEITEC MU, Černopolní 9, Brno Student: Marie Kašpárková Téma 22 Cereblon v patogenezi hematologických malignit Školitel: Mgr. Lenka Kubiczková Konzultant: RNDr. Sabina Ševčíková, Ph.D.
Téma 23 Mechanismus regulace sebeobnovy embryonálních kmenových buněk signální drahou PI3-K->Akt Pracoviště: ÚEB PřF MU Téma 24 Mitochondrie regulace jejich počtu a aktivity Téma 25 Mitochondrie přístupy a metody studia Téma 26 Warburgůf efekt podstata a mechanismus regulace Téma 27 Postavení NK buněk v imunitním systému a jejich využití v imunoterapii mnohočetného myelomu Školitel: Mgr. Lucie Říhová, Ph.D. Téma 28 Amyloidózy: Molekulární a buněčné mechanismy, laboratorní diagnostika Školitel: Mgr. Anna Potáčová, Ph.D. Téma 29 Korpuskulární bakteriální toxiny Školitel: Doc. MUDr. David Šmajs, Ph.D. Pracoviště: Biologický ústav LF, MU Téma 30 Mapování genotypů původce syfilis v celosvětovém měřítku Školitel: Doc. MUDr. David Šmajs, Ph.D. Téma 31 Korelované mutace v proteinech Školitel: Mgr. Jan Březovský, Ph.D. Pracoviště: Loschmidtovy laboratoře, ÚEB PřF MU Téma 32 Analýza cytomegalovirové reaktivity efektorových gamma-delta buněk u zdravých jedinců Školitel: Mgr. Andrea Knight, Ph.D. Pracoviště: Ústav patologické fyziologie LF MU Téma 33 Výzkum gamma-delta T buněk jako kandidátů pro adoptivní imunoterapii B-buněčných malignit Školitel: Mgr. Andrea Knight, Ph.D. Téma 34 Glutathion v regulaci genové exprese u rostlin Školitel: Mgr. Jaroslav Pavlů Téma 35 Geny zodpovědné za netradiční zabarvení obilek pšenice seté Školitel: MVDr. Ing. Václav Trojan
Téma 36 Studium genetické variability obilnin Školitel: Ing. Tomáš Vyhnánek, Ph.D. Téma 37 Relativní a absolutní kvantifikace proteinů pomocí hmotnostní spektrometrie Školitel: Mgr. Hana Černá, Konzultant: Mgr. Martin Černý, Ph.D. Pracoviště: Ústav molekulární biologie a radiobiologie, Agronomická fakulta, Mendelova univerzita v Brně Téma 38 Posttranslační modifikace proteinů, jejich funkce v organismu a způsoby jejich detekce a purifikace Školitel: Mgr. Martin Černý, Ph.D., Konzultant: Mgr. Jan Skalák, učo 269813, Pracoviště: Ústav molekulární biologie a radiobiologie, Agronomická fakulta, Mendelova univerzita v Brně Téma 39 Evoluce savčího karyotypu Školitel: Prof. Jiří Rubeš, MVD., Ph.D. Pracoviště: Oddělení genetiky a reprodukce, VÚVeL, Brno Student: Šimon Farkoš Téma 40 MikroRNA jako faktor modulující vznik a průběh komplexních onemocnění u člověka Školitel: Doc. MUDr. Julie Bienertová-Vašků, M.D., Ph.D. Student: Pavel Hruška Téma 41 Využití moderních genomických metod v prenatální a preimplantační diagnostice Školitel: Mgr. Kateřina Staňo Kozubík, Ph.D. Pracoviště: Centrum molekulární biologie a genové terapie (CMBGT), (IHOK) FN Brno a LF MU, CEITEC MU Téma 42 Molekulární diagnostika kostních dysplázií Školitel: RNDr. Jitka Kadlecová, Ph.D. Odborný konzultant: Mgr. Diana Grochová, Ph.D. Pracoviště: Cytogenetická laboratoř Brno, s.r.o., Veveří 39, Brno Student: Iva Synková Téma 43 Analýza možnosti vývoje inhibitorů proti včelím virům Školitel: Mgr. Pavel Plevka, Ph.D. Pracoviště: Oddělení strukturní virologie, CEITEC MU Téma 44 Sekvenční analýza možnosti použití pikornavirových inhibitorů proti lidským parechovirům, kobuvirům, kardiovirům a kosavirům Školitel: Mgr. Pavel Plevka, Ph.D. Téma 45 Genetické a epigenetické řízení vývoje květu u vyšších rostlin. Školitel: Mgr. Jaroslav Fulneček, CSc. Pracoviště: Biofyzikální ústav AV ČR, Laboratoř Molekulární Epigenetiky Téma 46 Genové mutace v patogenezi mnohočetného myelomu
Školitel: Mgr. Aneta Mikulášová Téma 47 Chromozomální mozaicizmus ve vztahu ke stárnutí a k vývoji nádorových onemocnění Školitel: Mgr. Aneta Mikulášová Téma 48 Chromotripsis a lidské choroby Školitel: Mgr. Jan Smetana Téma 49 Vzácné mikrodeleční syndromy detekované pomocí molekulárně cytogenetických metod Školitel: Mgr. Hana Filková Pracoviště: OLG FN Brno Téma 50 Využití technik sekvenování nové generace (NGS) v preimplantační genetické diagnostice Školitel: Mgr. Kateřina Kvačková, PhD. Pracoviště: OLG FN Brno Téma 51 Polyploidie v evoluci rostlin Školitel: Doc. RNDr. Jana Řepková, CSc. Téma 52 Sekundární metabolity rostlin přínos pro rostlinu i člověka Školitel: Doc. RNDr. Jana Řepková, CSc. Studentka: Marie Štefková Téma 53 Význam horizontálního přenosu genů v evoluci patogenních bakterí Školitel: Mgr. Marian Varga Konzultant: prof. RNDr. Jiří Doškař, CSc. Student: Simona Dalihodová Téma 54 Využití geneticky modifikovanýcb bakteriofágů v praxi Školitel: Mgr. Martin Benešík Konzultant: doc. RNDr. Roman Pantůček Ph.D. Student: Pavol Bárdy Téma 55 Evoluce klonů Staphylococcus aureus významných v humánní a veterinární medicíně Školitel: doc. RNDr. V. Růžičková, CSc. Téma 56 Význam signalizací regulovaných vápenatými ionty v progresi nádorových onemocnění Školitel: Mgr. Petr Beneš Ph.D. Téma 57 Nádory a epigenetika Školitel: prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Studentka: Martina Karasová Téma 58 Terapeutický potenciál obnovení funkce nádorového supresoru p53 Školitel: prof. RNDr. Jana Šmardová, CSc. Studentka: Martina Burešová Pracoviště: Ústav patologie, LF MU Téma 59 DNA lidské spermie a její poruchy Školitel: Prof. MUDr. Pavel Trávník, DrSc. Pracoviště: Centrum reprodukční medicíny a preimplantační diagnostiky, Viniční 235, Brno Studentka: Tereza Agáta Veselá Téma 60 Využití ips buněk v genové terapii Školitel: Dr. Irena K. Koutná, Ph.D. Pracoviště: Centrum analýzy biomedicínského obrazu, FI MU Téma 61 Využití metod hmotnostní spektrometrie při studiu buněčné signalizace savčích buněk Školitel: Mgr. Vítězslav Bryja, PhD., bryja@sci.muni.cz Odborný konzultant: Mgr. Karel Stejskal (učo 175819), Mgr. Ondřej Bernatík, PhD. Student: Miroslav Hutňan Téma 62 Mezibuněčná signalizace kontrolovaná semaphoriny Školitel: Mgr. Ondřej Bernatík, Ph.D. Student: Petra Paclíková Téma 63 Post-translační modifikace tubulinu a jejich role v buněčné biologii Školitel: Mgr. Igor Červenka, odborný konzultant: Mgr. Vítězslav Bryja, Ph.D. Student: Marek Kravec Téma 64 In vivo a in vitro modely pro studium chronické lymfocytární leukémie Školitel: Mgr. Vítězslav Bryja, Ph.D. Student: Lucie Smyčková Téma 65 Wnt signalizace v nádorech vaječníku Školitel: Mgr. Vendula Pospíchalová, Ph.D. Student: Anna Kotrbová Téma 66 Diagnostika monogenních onemocnění pomocí analýzy volné fetální DNA cirkulující v krvi matky. Školitel: Mgr. Diana Grochová, Ph.D. Pracoviště: Cytogenetická laboratoř Brno, s.r.o., Veveří 39, Brno Student: Rostislav Navrátil Téma 67 Signální úloha kryptochromů v řízení cirkadiánních rytmů a magnetorecepce na hmyzím modelu Školitel: Doc. RNDr. Martin Vácha, Ph.D.
Konzultant: Mgr. David Doležel, Ph.D., Katedra molekulární biologie Přír. fak. Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích Studentka: Zuzana Kaštilová Téma 68 Souhra bezchybných a chybujících opravných mechanizmů DNA v lidských kmenových buňkách. Školitel: Mgr. Vladimír Rotrekl, Ph.D. Pracoviště: Biologický ústav LF Téma 69 Úloha dlouhých nekódujících RNA v živočišných buňkách a kancerogenezi Školitel: MUDr. Mgr. Marek Mráz, Ph.D. Studentka: Veronika Krmeská Téma 70 Bioinformatická analýza kuřecího transkriptomu Školitel: Mgr. Darina Čejková, Ph.D.