Možnosti využití zobrazovací fluorescence chlorofylu a

Podobné dokumenty
Fluorescence (luminiscence)

aneb Fluorescence chlorofylu jako indikátor stresu

Zoologická mikrotechnika - FLUORESCENČNÍ MIKROSKOPIE

Fluorescenční mikroskopie

Měření fluorescence chlorofylu hedery helix

FLUORESCENČNÍ MIKROSKOP

Metoda Live/Dead aneb využití fluorescenční mikroskopie v bioaugmentační praxi. Juraj Grígel Inovativní sanační technologie ve výzkumu a praxi

7. Měření fluorescence při excitaci kontinuálním světlem ( steady-state )

FLUORIMETRICKÉ STANOVENÍ FLUORESCEINU

Spektrální charakteristiky

SPEKTROSKOPICKÉ VLASTNOSTI LÁTEK (ZÁKLADY SPEKTROSKOPIE)

LRR/BUBCV CVIČENÍ Z BUNĚČNÉ BIOLOGIE 3. TESTY ŽIVOTASCHOPNOSTI A POČÍTÁNÍ BUNĚK

DELFIA Dissociation-Enhanced Lanthanide Fluorescent ImmunoAssay

Téma: Testy životaschopnosti a Počítání buněk

VAKUOLY - voda v rostlinné buňce

nano.tul.cz Inovace a rozvoj studia nanomateriálů na TUL

Principy a instrumentace

2 Nd:YAG laser buzený laserovou diodou

Úloha č. 1: CD spektroskopie

Praktikum z experimentálních metod biofyziky a chemické fyziky I. Vypracoval: Jana Čurdová, Martin Kříž, Vít Marek. Dne: 2.3.

Fluorescenční vyšetření rostlinných surovin. 10. cvičení

Základní pojmy a vztahy: Vlnová délka (λ): vzdálenost dvou nejbližších bodů vlnění kmitajících ve stejné fázi

Fyzikální podstata DPZ

Správa barev. Měřící přístroje. Správa barev. Vytvořila: Jana Zavadilová Vytvořila dne: 14. února

Několik pokusů s LED. ZDENĚK POLÁK Jiráskovo gymnázium v Náchodě. Abstrakt. Použití LED. Veletrh nápadů učitelů fyziky 17

Barevné principy absorpce a fluorescence

Vyjádření fotosyntézy základními rovnicemi

Pokročilé cvičení z fyzikální chemie KFC/POK2 Vibrační spektroskopie

7 Fluorescence chlorofylu in vivo

ZÁKLADNÍ ČÁSTI SPEKTRÁLNÍCH PŘÍSTROJŮ

Luminiscence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) fluorescence, fosforescence. chemicky (chemiluminiscence)

Fotosyntéza (2/34) = fotosyntetická asimilace

Optoelektronické senzory. Optron Optický senzor Detektor spektrální koherence Senzory se CCD prvky Foveon systém

Luminiscence. Luminiscence. Fluorescence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) chemicky (chemiluminiscence)

BUNĚČNÁ STĚNA - struktura a role v rostlinné buňce

Stručný úvod do spektroskopie

Fotosyntéza Ekofyziologie. Ondřej Prášil Mikrobiologický ústav AVČR Laboratoř fotosyntézy v Třeboni

1. Teorie mikroskopových metod

Luminiscence. Luminiscence. Fluorescence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) chemicky (chemiluminiscence)

Charakteristiky optoelektronických součástek

PROTOKOL O PROVEDENÍ LABORATORNÍ PRÁCE

MĚŘENÍ PLANCKOVY KONSTANTY

25 A Vypracoval : Zdeněk Žák Pyrometrie υ = -40 C C. Výhody termovize Senzory infračerveného záření Rozdělení tepelné senzory

Využití fluorescence sinic a řas při hodnocení kvality vod. RNDr. Štěpán Zezulka, PhD.

A5M13VSO MĚŘENÍ INTENZITY A SPEKTRA SLUNEČNÍHO ZÁŘENÍ

MOLEKULÁRNÍ METODY V EKOLOGII MIKROORGANIZMŮ

VLIV SPEKTRÁLNÍHO SLOŽENÍ FOTOSYNTETICKY AKTIVNÍ RADIACE NA INDUKCI FOTOSYNTÉZY TERMOOPTICKÝ JEV

ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY

F l u o r e s c e n c e

Určení koncentrace proteinu fluorescenční metodou v mikrotitračních destičkách

FOTOSYNTÉZA. Mgr. Alena Výborná Gymnázium, SOŠ a VOŠ Ledeč nad Sázavou VY_32_INOVACE_01_1_07_BI1

Fotoelektrické snímače

LI-6400; Gazometrická stanovení fotosyntetických parametrů

FOTOSYNTÉZA. Princip, jednotlivé fáze

The acquisition of science competencies using ICT real time experiments COMBLAB. Krásný skleník. K čemu je dobrá spektroskopie?

1. Změřte Hallovo napětí v Ge v závislosti na proudu tekoucím vzorkem, magnetické indukci a teplotě. 2. Stanovte šířku zakázaného pásu W v Ge.

Dokumentace projektu. Fotoluminiscence. Autorky: Kateřina Limburská, Tereza Fleková Vedoucí projektu: Zdeněk Polák

Název: POZOROVÁNÍ PLASTIDŮ,VAKUOL, BUNĚČNÉ STĚNY Autor: Paed.Dr.Ludmila Pipková

Úloha 3: Mřížkový spektrometr

A:Měření odporových teploměrů v ultratermostatu B:Měření teploty totálním pyrometrem KET/MNV (8. cvičení)

Světlo. Kalibrace světelného senzoru. Tematický celek: Světelné a zvukové jevy. Úkol:

INTELIGENTNÍ KULTIVACE ROSTLIN

Spektroskopické metody. převážně ve viditelné, ultrafialové a blízké infračervené oblasti

Měření odrazu světla

1 Bezkontaktní měření teplot a oteplení

Teprve půlka přednášek?! já nechci

Molekulová spektroskopie 1. Chemická vazba, UV/VIS

PSI (Photon Systems Instruments), spol. s r.o. Ústav přístrojové techniky AV ČR, v.v.i.

FYZIOLOGIE ROSTLIN VÝŽIVA ROSTLIN 1) AUTOTROFNÍ VÝŽIVA ROSTLIN 2) HETEROTROFNÍ VÝŽIVA ROSTLIN

Měření šířky zakázaného pásu polovodičů

Ing. Jiří Fejfar, Ph.D. Dálkový průzkum Země

Fyziologie rostlin - maturitní otázka z biologie (3)

Autor: Katka Téma: fyziologie (fotosyntéza) Ročník: 1.

Stanovení povrchových vlastností (barva, lesk) materiálů exponovaných za podmínek simulující vnější prostředí v QUV panelu

ZPRACOVÁNÍ OBRAZU přednáška 3

TELEVIZNÍ ZÁZNAM A REPRODUKCE OBRAZU

INTELIGENTNÍ KULTIVACE ROSTLIN

Technická specifikace předmětu veřejné zakázky

RYCHLÁ KINETIKA FLUORESCENČNÍ INDUKCE

Derivační spektrofotometrie a rozklad absorpčního spektra

PRÁCE S MIKROSKOPEM Praktická příprava mikroskopického preparátu

Zobrazovací jednotky. 1 z :53. LED technologie.

fotometr / radiometr

Mikroskopické metody Přednáška č. 3. Základy mikroskopie. Kontrast ve světelném mikroskopu

Moderní metody rozpoznávání a zpracování obrazových informací 15

Problémové okruhy ke zkoušce A3M38VBM Videometrie a bezkontaktní měření ls 2014 Optické záření- základní vlastnosti optického záření a veličiny a

Speciální spektrometrické metody. Zpracování signálu ve spektroskopii

Barevné principy absorpce a fluorescence

DETEKTORY pro kapalinovou chromatografii. Izolační a separační metody, 2018

INVESTICE DO ROZVOJE VZDĚLÁVÁNÍ. Příklady použití tenkých vrstev Jaromír Křepelka

Lupa a mikroskop příručka pro učitele

Zeemanův jev. Michael Jirásek; Jan Vejmola Gymnázium Český Brod, Vítězná 616 SPŠE V Úžlabině 320, Praha 10

16. Franck Hertzův experiment

Obrazové snímače a televizní kamery

Obrazové snímače a televizní kamery

Příloha C. zadávací dokumentace pro podlimitní veřejnou zakázku Mikroskopy pro LF MU TECHNICKÉ PODMÍNKY (technická specifikace)

Úvod do spektrálních metod pro analýzu léčiv

Spektrální analyzátor Ocean optics

MĚŘENÍ ABSORPCE SVĚTLA SPEKOLEM

Transkript:

Možnosti využití zobrazovací fluorescence chlorofylu a Chlorofyl a je unikátní pigment rostlin, který oddělením náboje zahajuje přeměnu energie absorbovaných fotonů v chemicky vázanou energii ve fotosyntéze. Větší část pohlcené energie je však přeměněna v teplo a menší podíl je vyzářen v podobě fluorescence (obrázek 1). Protože intenzita fluorescence fotosyntetického aparátu je nepřímo úměrná fotosyntézou využitému světlu, představuje měření fluorescence slibný nástroj nejen ve výzkumu fotosyntézy. S teoretickou podstatou fluorescence chlorofylu a a jejím měřením máte možnost se seznámit v úloze 7 Měření fotosyntézy pomocí chlorofylové fluorescence. V této úloze si ukážeme možnosti využití zobrazovací fluorescence, tedy fluorescence s plošným rozlišením. I. úkoly 1/ Změřte a interpretujte propustnost kutikuly listů pro herbicid DCMU (Diuron) pomocí zobrazovací fluorescence chlorofylu a. Porovnejte listy dvou druhů rostlin a určete, jak se liší propustnost jejich kutikul. 2/ Pozorujte chloroplasty v lístku mechorostu pomocí fluorescenčního mikroskopu (díky fluorescenci chlorofylu v chloroplastech). Lze pozorovat pohyb chloroplastů vlivem ozářenosti listu? Obrázek 1. Fluorescence izolovaného chlorofylu. Zatímco roztok chlorofylu pohlcuje světlo různých vlnových délek (nejvíce modré a červené), září jasně červeně (vlnová délka přibližně 690 nm). V roztoku chlorofylu je podíl fluorescence vzhledem k pohlcenému množství světla značný. V živých buňkách je mnohem menší (3 7 % pohlcených fotonů), protože významnou část energie fotonů využívá fotosyntéza a část je řízeně převedena na teplo. Převzato z http://plantsinaction.science.uq.edu.au 1

II. postup A / Odeberte listy ze dvou druhů rostlin s předpokládanou odlišnou propustností kutikuly. B/ Pomocí korkovrtu vyřízněte asi 2cm terčíky ve třech opakováních (v případě zájmu můžete odebrat vzorky zvláště pro svrchní a spodní stranu listu). C/ Terčíky umístěte na vlhkou buničitou vatu do Petriho misky. D/ Na střed terčíků vytvořte mikropipetou 60 µl kapky vody (kontrola) nebo 10-3 M roztoku DCMU. E/ Umístěte Petriho misku do zobrazovacího fluorimetru FluorCam a podle pokynů vedoucího úlohy měřte v pravidelných intervalech fluorescenci chlorofylu. F/ V mezičasech pozorujte fluorescenci jednotlivých chloroplastů v lístcích mechorostu měříku (Plagiomnium sp.) pomocí fluorescenčního mikroskopu Olympus BX 61. Pokuste se vytvořit fotografie fluoreskujících chloroplastů v různý čas od osvětlení. Je vidět změna polohy chloroplastů v buňce při intenzivním osvětlení? G/ Vytvořte protokol, který bude interpretovat 1/ propustnost kutikuly a 2/ pozorování chloroplastů. Vedoucí úlohy pokud o to projevíte zájem vám bude rád k dispozici. H/ Pokud jste vyvolená skupina, vytvořte prezentaci a pokuste se ji úspěšně prezentovat na závěrečném semináři. III. otázky k zamyšlení před úlohou (Pokud se zamýšlet nechcete, nemohu vás nutit. O otázkách si s vámi na začátku pohovořím. Pokud ale budete jevit zájem a kreativitu, bude naše spolupráce jistě radostnější ). a/ Proč vidíme fluorescenci chlorofylu v roztoku na obrázku 1, když není použit žádný filtr? b/ Dovedete vysvětlit, proč vlnová délka fluorescence je (krom vícefotonové absorbce) delší, než vlnová délka excitace, tedy záření, které fluorescenci vyvolalo? Pokud budete někde hledat, jako dobré heslo vám poslouží Stokesův posun. c/ Znáte jinou látku/objekt, než chlorofyl, který jeví fluorescenci? d/ Máte představu jak tlustá je a z čeho se skládá kutikula rostlin? Na kterých rostlinných částech kutikulu najdeme? e/ Proč voda (DCMU) na povrchu listu neproteče přes průduchy do listu? f/ Kolik navážíte DCMU pro přípravu 100 ml 10-3 M roztoku? Lze tuto otázku řešit bez dalších informací? g/ Při pozorování chloroplastů ve fluorescenčním mikroskopu si můžete všimnout, že červená fluorescence není po povrchu chloroplastu rozmístěna rovnoměrně. Víte proč? Jak se nazývají ultrastukturní součásti chloroplastů? h/ Pravděpodobně jste slyšeli, že chloroplasty se v buňce pohybují. Proč to dělají a jaký je mechanismus jejich pohybu? KONTAKT: Jiří Kubásek, jirkak79@gmail.com, 723 027 301. 2

IV. zobrazovací (2D) fluorescenční měření (FluorCam) Měření fluorescence chlorofylu u rostlin má dlouhou historii. My začneme v době, kdy technika dosáhla vyspělosti, která umožnila pozorovat časoprostorovou variabilitu fluorescence v ploše. Zní to složitě, ale základní princip je jednoduchý: Videokamera je schopna zobrazovat plošné rozlišení jasu objektů, jak všichni víme. Pokud před kameru předřadíme filtr, který k citlivému prvku (CCD či CMOS senzor) pustí pouze vlnové délky, které produkuje fluorescence (λ > 680nm), můžeme snadno mapovat fluorescenci s plošným a časovým rozlišením, jak ukazuje obrázek 2. Je vhodné, pokud excitační zdroj nevyzařuje záření, které má spektrální překryv s fluorescencí. Není to však zcela nutné. Pulzně modulovaným měřením (PAM) dokážeme celkem úspěšně oddělit pozaďovou ozářenost od fluorescence i v případě překryvu. Tento popis je velmi zjednodušený. O dalších předpokladech a způsobech měření fluorescence si řekneme osobně. Pro zvídavější doporučuji shlédnout a pročíst legendu obrázku 5. Obrázek 2. Schématické znázornění plošného měření fluorescence chlorofylu. Kamera zaznamenává v pravidelných intervalech fluorescenci chlorofylu (ca 680 730 nm), která je vybuzena LED panely o kratší vlnové délce. Filtr předřazený před objektiv kamery brání vstupu excitačního záření ke snímacímu prvku kamery. Součástí je řídící elektronika jak kamery, tak světelných panelů a vyhodnocovací počítač. IV.I. Měření propustnosti rostlinné kutikuly pro fotosyntetický herbicid DCMU Kutikula rostlin je složena z voduodpuzujících látek (kutin, vosky) a má také velmi malou propustnost pro plyny a vodní páru. Představuje tak významnou barieru, která chrání list před vyschnutím. Zároveň ale kutikula brání vstupu CO 2 do listu, který je potřebný pro fotosyntézu a růst. Proto jsou v pokožce listu běžně uzavíratelné otvůrky průduchy. Jejich okraj je tvořen dvěmi svěracími buňkami, které změnou vnitrobuněčného tlaku (turgoru) mění tvar a průduch se otevírá (při vzrůstu tlaku) nebo uzavírá (při poklesu). Propustnost kutikuly pro vodu a jiné látky je často určující pro přežití rostlin v suchozemském prostředí, protože při zcela zavřených průduších stále prochází nenulové množství vody právě kutikulou. Propustnost pro minerální živiny a jiné látky je zase důležitá v zemědělství (hnojení na list, aplikace herbicidů). Měření propustnosti kutikuly je nesnadné například proto, že většinou nevíme, jaký podíl toku (např. vody) se uskutečňuje přes průduchy (a jen někdy máme k dispozici kutikulu bez průduchů). Elegantní metodou je měření prostupu netěkavé látky, která inhibuje fotosyntézu a zvyšuje tak fluorescenci. Takový je právě námi použitý fotosyntetický herbicid DCMU. Kapky vody na listu díky svému povrchovému napětí a hydrofobnosti kutikuly nejsou schopny protéci přes průduchy směrem do listu (list je takto evolučně vybaven, protože kapky stojící na listech jsou v přírodě běžné). Ve vodě rozpuštěná DCMU difunduje jen přes kutikulu, se kterou jsou kapky v kontaktu. 3

DCMU (3-3,4-dichlorophenyl-1,1-dimethylmočovina) blokuje fotosystém II, který pak není schopen předávat redukované přenašeče na fotosystém I. Důsledkem je zvýšená intenzita fluorescence chlorofylu, jako alternativní cesty disipace (přeměny) energie. Přepočet rychlosti změny fluorescence na skutečnou propustnost kutikuly je nesnadný a časově i matematicky přesahuje rámec úlohy. Záleží na mnoha faktorech, jako je rozpustnost DCMU v kutikulárních voscích/vodě, tloušce listu, obsahu a rozmístění chloroplastů v listu, koncentraci DCMU, při které v chloroplastech zcela ustává fotosyntéza a dalších. My si proto znázorníme jen relativní porovnání propustnosti různých listů či stran listu pro DCMU. Relativní rychlost inhibice fotosyntézy následně vyneseme do grafu. Obrázek 3. Kapky vody nebo roztoku herbicidu o objemu ca. 60 µl nanesené na listové terčíky citrusovníku (Citrus sp.). List je otočen spodní stranou nahoru (spodní dvě řady terčíků) nebo svrchní stranou nahoru (horní dvě řady). Na čtveřice terčíků v prostředních řadách je aplikován herbicid DCMU v koncentraci 10-3 mol l -1. Na okrajové řady je aplikována čistá voda jako kontrola. Vpravo je strukturní vzorec DCMU. Obrázek 4. Fluorescence chlorofylu listových terčíku z obrázku 3 ve falešných barvách (viz barevná škála). Vlevo těsně po nanesení kapek, vpravo druhý den. Vidíme, že na čtveřicích terčíků v prostředních řadách došlo k výraznému nárůstu fluorescence z důvodu zablokování fotosyntézy herbicidem. Drobné zvýšení jasu na levém obrázku je z důvodu efektu čočky vodních kapek. 4

IV.II. vyhodnocování fluorescenčního měření Změna fluorescence je nepřímo úměrná změně (blokování) fotosyntézy. Zatímco u zdravého listu klesá fluorescence během souvislého osvětlení (obrázek 5 od času 20 s, zelená křivka) u části listové čepele, kde je fotosyntéza zablokována, zůstává fluorescence stálá (červená křivka). Většinou nehodnotíme přímo fluorescenci, nýbrž tzv. Fluorescenční parametry. Tyto jsou poměrem intenzit pro daný vzorek (a různé osvětlení) a mají tedy relativní povahu. Tím dokážeme odfiltrovat nežádoucí změny fluorescence například vlivem rozdílného obsahu chlorofylu ve vzorku a hodnoty jsou pak mnohem robustnější. Zájemce o hlubší pochopení měření fluorescence opět odkazuji k návodu k úloze 7 - Měření fotosyntézy pomocí chlorofylové fluorescence. Jeden z možných protokolů pro měření změny fluorescence listu na světle je na obrázku 5. Obrázek 5. Indukce fluorescence v části listové čepele s fotosyntézou inhibovanou DCMU (červeně) a kontrolního listu (zeleně). V čase nula na list svítí slabé měřící světlo, které vyvolává jen slabou fotosyntézu. Nízká je tedy i fluorescence, protože fotosyntéza je schopná zpracovat relativně nejvíce fotonů. V čase ca. 5 s je na list aplikován 1 sekundu trvající saturační záblesk o intenzitě vyšší, než plné sluneční světlo. Protože fotosyntéza není schopna takto intenzivní světlo využít, relativně více fotonů převádí svou energii v teplo. Proto naroste skokově i fluorescence (první vysoký pík). Další skokový nárůst fluorescence zaznamenáváme v našem případě v čase 20 s, kdy je rozsvíceno tzv. aktinické světlo. To pohání fotosyntézu, kterou však plně nenasycuje. Aktinické světlo svítí až do času 320 s, kdy je zhasnuto. Běhom tohoto času jsou aplikovány v pravidelných intervalech saturační záblesky (menší píky na křivce). Právě během těchto 300 sekund vidíme nejlépe odlišné chování listů. U kontrolního listu po ozáření roste fotosyntéza a fluorescence proto rychle klesá. Naproti tomu u listu s DCMU výrazný pokles nevidíme, což je důkazem, že herbicid téměř kompletně zablokoval fotosyntézu a nahromaděná energie se vyzáří zpět fluorescencí. 5

V. sledování fluorescence chlorofylu na mikroskopické úrovni (fluorescenční mikroskop Olympus BX61) Pro fluorescenční mikroskopii vlastně platí stejný základní princip jako pro předchozí metodu, jen na menší prostorové škále. Následující odstavec proto, částečně jinými slovy, popisuje jen drobné odlišnosti. Fluorescenční mikroskop (obrázek 6) je zařízení značně univerzální. Umožňuje volit různé vlnové délky excitace jak ve viditelném, tak ultrafialovém oboru záření a podobně i různá spektra emise. Pozorování fluorescence chlorofylu zdaleka není hlavním proudem fluorescenční mikroskopie. V našem případě pozorujeme fluorescenci chlorofylu v oblasti červeného světla o vlnové délce ca. 680 až 730 nm. Excitační světlo proto musí mít kratší vlnovou délu, aby 1/ vybudilo chlorofyl a 2/ nepronikalo k našemu oku (či detektoru). Budeme používat modré nebo zelené světlo. Zajímavé je, že excitační světlo prochází v našem uspořádání (Olympus BX61) skrze objektiv směrem ke vzorku a emitované světlo opačným směrem. Tuto odlišnost od klasické mikroskopie v procházejícím světle uvidíme snadno při našem pozorování. Zelené světlo intenzivně ozařuje vzorek na sklíčku, ale přes okulár k našemu oku neproniká. Náš fluorescenční mikroskop ovšem není fluorimetrem, takže nám neumožňuje intenzitu fluorescence měřit a vyhodnocovat. Chloroplasty a jejich červenou fluorescenci vidíme na obrázku 7. Obrázek 6. Princip fluorescenčního mikroskopu. Excitační filtr vybere ze spektra světelného zdroje požadovanou vlnovou délku, které se nepřekrývá ze spektrem fluorescence. Dichroické zrcadlo odráží excitační záření přes objektiv směrem ke vzorku. Vzorkem produkovaná fluorescence postupuje opačným směrem. Pro fluorescenční obor však nejeví dichroické zrcadlo významnou odrazivost a propouští fluorescenci směrem k lidskému oku/detektoru kamery. Emisní filtr slouží k ještě efektivnějšímu odfiltrování excitačního záření. To je až o několik řádů intenzivnější než fluorescence, a pokud by pronikalo k detektoru, bránilo by pozorování fluorescence. Zdroj: https://cs.wikipedia.org. Obrázek 7. Lístek měříku Plagiomnium sp. pozorované v procházejícím bílém světle (vlevo) a jako červená fluorescence chlorofylu a (vpravo). V případě fluorescenčního snímku bylo použito zelené excitační světlo, které nevstupuje do zorného pole díky použití dolnopropustného filtru. Pozorování a fotografování tedy probíhá jen ve spektru, které produkuje fluorescence chlorofylu. 6