Doc. RNDr. Petr Ilík, Ph.D.

Transkript

1 Doc. RNDr. Petr Ilík, Ph.D. Katedra biofyziky, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci Tř. 17. listopadu 12, Olomouc Odborný životopis Narozen Adresa 9. března 1968, Uherské Hradiště tř. Svobody 26, Olomouc, tel , ilik@prfnw.upol.cz Vzdělání vysokoškolské, v letech , Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci, Katedra experimentální fyziky, státní zkouška v oboru Biofyzika a chemická fyzika v roce 1991 Zaměstnání doktorské studium v letech , obor Biofyzika a chemická fyzika na Katedře experimentální fyziky Přírodovědecké fakulty Univerzity Palackého v Olomouci, disertační práce Vysokoteplotní změny fluorescence chlorofylu a in vivo a jejich použití k charakteristice stavu fotosyntetického aparátu rostlin, školitel prof. RNDr. Jan Nauš, CSc., titul udělen v r habilitace v oboru Biofyzika, Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity v Brně, habilitační práce Fluorescenční teplotní křivka indikátor funkčního stavu a struktury thylakoidních membrán chloroplastů, jmenování v roce 2003 Katedra experimentální fyziky, Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci : vědeckovýzkumný pracovník : odborný asistent dosud: docent Stáže v zahraničí Department of Plant Physiology and Biochemistry, Faculty of Biochemistry, Biophysics and Biotechnology, Jagiellonian University, Kraków, Polsko ( : celkem 7 měsíců) Bioenergetics Laboratory, University of Geneva, Geneva, Švýcarsko (2006: 1 týden) 1

2 Výzkumné zaměření biofyzika fotosyntézy, luminiscence chlorofylu in vivo, fotosyntetické procesy u rostlin vystavených stresovým faktorům (vyšší teploty, ozářenost), funkce thylakoidních membrán v chloroplastech Granty Grant 0354/1993 (FRVŠ): Změny teplotní závislosti fluorescence chlorofylu v procesu zelenání (člen řešitelského týmu; 1993) Grant 0355/1993 (FRVŠ): Rozvoj fluorescenční metody pro rychlé sledování působení vybraných herbicidů na kulturní rostliny a plevele (člen řešitelského týmu; 1993) Grant 0356/1993 (FRVŠ): Rozložení fluorescenčních charakteristik a pigmentů v koruně smrku s ohledem na obsah CO2 ve vzduchu (člen řešitelského týmu; 1993) Grant 503/93/0747 (GAČR): Diagnostické metody pro optimalizaci pěstování polních plodin (člen řešitelského týmu; ). Grant 204/94/0788 (GAČR): Vysokoteplotní funkční změny v thylakoidních membránách chloroplastů (člen řešitelského týmu; ) Grant 202/96/1666 (GAČR) Použití termoluminiscence chlorofylu ke sledování změn funkce fotosyntetického aparátu v thylakoidních membránách chloroplastů (člen řešitelského týmu; ) Grant 204/98/P205 (GAČR) Studium vysokoteplotních změn v thylakoidních membránách chloroplastů pomocí fluorescence chlorofylu (hlavní řešitel; ) Grant (UP Olomouc) Vliv různé intenzity, spektrálního složení ozářenosti a světelné historie na vysokoteplotní inhibici funkce fotosystému II (hlavní řešitel; 1999) Grant CEZ:J14/98:N (MŠMT) Stresová a patologická biologie, biochemie a bioenergetika rostlin (člen řešitelského týmu; ). Grant H1561 (FRVŠ) Inovace laboratoře experimentálních metod biofyziky (člen řešitelského týmu; 2001) Grant GA522/03/0754 (GAČR) Fotoinhibice a fotoochrana u lišejníků v extrémních podmínkách (spoluřešitel; ) Grant GA522/06/0979 Mechanismy odolnosti rostlin proti ROS indukovaným ve fotosyntetickém aparátu během fotoinhibičního stresu (spoluřešitel: ) Výzkumný záměr MSM (MŠMT) Variabilita složek a interakcí v rostlinném patosystému a vliv faktorů prostředí na jejich projev (člen řešitelského týmu; ) Grant VaVpI (MŠMT) Centrum regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum (člen řešitelského týmu; ) Grant OP VK CZ.1.07/2.2.00/ (MŠMT) Inovace a zvýšení atraktivity studia biofyziky (hlavní řešitel, ) 2

3 Grant TA (TA ČR) Vývoj metody a konstrukce přístroje pro rychlé monitorování vysokoteplotní stability rostlin (hlavní řešitel, ) Organizační činnost předseda Vědeckopedagogické rady oboru Fyzika na PřF UP ( ) vedoucí oddělení biofyziky Katedry experimentální fyziky PřF UP (od roku 2009) zástupce vedoucího Katedry experimentální fyziky PřF UP (od roku 2006) vedoucí Katedry biofyziky PřF UP (od roku 2011) předseda komise pro státní zkoušky bakalářského studia oboru Biofyzika (od roku 2006) člen oborové rady doktorského studijního programu oboru Biofyzika na ÚFB JU v Českých Budějovicích (od roku 2005) člen oborové rady doktorského studijního programu Aplikovaná fyzika oboru Biofyzika na PřF OU v Ostravě (od r. 2010) člen komise pro státní rigorózní zkoušky oboru Biofyzika na PřF UP (od roku 2000) člen komise pro státní zkoušky magisterského studia oborů Biofyzika a chemická fyzika a oboru Biofyzika (od roku 2004) člen Kolegia oboru Fyzika na PřF UP (od roku 2003) Ocenění 1993: Cena ministra školství, mládeže a tělovýchovy Talent 93 za vědecké výsledky 2006: Cena děkana PřF UP za odbornou publikaci Členství v profesních organizacích International Society of Photosynthesis Research American Society for Photobiology Česká společnost experimentální biologie rostlin Federation of European Societies of Plant Biology Recenzní a oponentská činnost recenzent článků v časopisech Functional Plant Biology Journal of Plant Physiology Electrophoresis Environmental and Experimental Botany Photosynthetica 3

4 Optics Communications Pesticide Biochemistry and Physiology Acta Physiologia Plantarum Photochemical and Photobiological Sciences posuzovatel grantových návrhů GA ČR, GA AV, FRVŠ, MŠMT oponent bakalářských, diplomových, disertačních a habilitačních prací na PřF UP v Olomouci, PřF MU v Brně, ÚFB JU v Českých Budějovicích a Technické univerzitě v Liberci Publikační činnost - 29 původních článků v mezinárodních impaktovaných vědeckých časopisech - 3 články v národních vědeckých časopisech - 5 plnohodnotných příspěvků ve sbornících z mezinárodních konferencí - více než 40 plakátových sdělení na mezinárodních a národních konferencích Scientometrické charakteristiky publikační činnosti (k ) Součet impact faktorů podle WOS (pro r. 2008) 69,08 Citace podle WOS 250 Citace podle WOS (bez autocitací) 145 Hirschův index 10 Přehled publikací Práce publikované v zahraničních recenzovaných vědeckých časopisech Šišková K., Kubala M., Dallas P., Jančík D., Thorel A., Ilík P., Zbořil R. (2010) Effect of surface modification on fluorescence and morphology of CdSe nanoparticles embedded in 3D phosphazene-based matrix: Nanowire-like quantum dots. Journal of Materials Chemistry (v tisku, IF 2008 : 4,65) Ilík P., Kotabová E., Špundová M., Novák O., Kaňa R., Strzałka K. (2010) Lowlight-induced violaxanthin de-epoxidation in shortly preheated leaves: uncoupling from ph-dependent non-photochemical quenching. Photochemistry and Photobiology 86, (IF 2008 : 2,29) Lípová L., Krchňák P., Komenda J., Ilík P. (2010) Heat-induced disassembly and degradation of chlorophyll-containing protein complexes in vivo. Biochimica et Biophysica Acta Bioenergetics 1797, (IF 2008 : 4,45) Ilík P., Hlaváčková V., Krchňák P., Nauš J. (2010) A low-noise multi-channel device for the monitoring of systemic electrical signal propagation in plants. Biologia Plantarum 54, (IF 2008 : 1,43) Frolec J., Ilík P., Krchňák P., Sušila P., Nauš J. (2008) Irreversible changes in barley leaf chlorophyll fluorescence detected by the fluorescence temperature 4

5 curve in a linear heating/cooling regime. Photosynthetica 46, (IF 2008 : 1.00) Kotabová E., Kaňa R., Kyseláková H., Lípová L., Novák O., Ilík P. (2008) A pronounced light-induced zeaxanthin formation accompanied by an unusually slight increase in non-photochemical quenching. A study with barley leaves treated with methyl viologen at moderate light. Journal of Plant Physiology 165, (IF 2008 : 2,44) Ilík P., Schansker G., Kotabová E., Váczi P., Strasser R.J., Barták M. (2006) A dip in the chlorophyll fluorescence induction at s in Trebouxia-possessing lichens reflects a fast reoxidation of photosystem I. A comparison with higher plants. Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics 1757, (IF 2008 : 4,45) Lazár D., Ilík P., Kruk J., Strzalka K., Nauš J. (2005) A theoretical study on effect of the initial redox state of cytochrome b 559 on maximal chlorophyll fluorescence level (F M ). Implications for photoinhibition of photosystem II. Journal of Theoretical Biology 233, (IF 2008 : 2.45) Sušila P., Lazár D., Ilík P., Tomek P., Nauš J. (2004) The gradient of exciting radiation within a sample affects relative heights of steps in the fast chlorophyll a fluorescenec rise. Photosynthetica 42, (IF 2008 : 1.00) Kouřil R., Lazár D., Ilík P., Skotnica J., Krchňák P., Nauš J. (2004) Hightemperature induced chlorophyll fluorescence rise in plants at C: experimental and theoretical approach. Photosynthesis Research 81, (IF 2008 : 2,68) Kaňa R., Špundová M., Ilík P., Lazár D., Klem K., Tomek P., Nauš J., Prášil O. (2004) Effect of herbicide clomazone on photosynthetic processes in primary barley (Hordeum vulgare L.) leaves. Pesticide Biochemistry and Physiology 78, (IF 2008 : 1,28) Špundová M., Popelková H., Ilík P., Skotnica J., Novotný R., Nauš J. (2003) Ultrastructural and functional changes in the chloroplasts of detached barley leaves senescing under dark and light conditions. Journal of Plant Physiology 160, (IF 2008 : 2,44) Tomek P., Ilík P., Lazár D., Štroch M., Nauš J. (2003) On the determination of Q B -non-reducing photosystem II centers from chlorophyll a fluorescence induction. Plant Science 164, (IF 2008 : 1,97) Ilík P., Kouřil R., Kruk J., Myśliwa-Kurdziel B., Popelková H., Strzałka K., Nauš J. (2003) Origin of chlorophyll fluorescence in plants at C. Photochemistry and Photobiology 77, (IF 2008 : 2,29) Ilík P., Krchňák P., Tomek P., Nauš J. (2002) 2-D gel densitometer for highcontrast and selective imaging of chlorophyll-containing protein complexes separated by non-denaturing polyacrylamide gel electrophoresis. Journal of Biochemical and Biophysical Methods 51, (IF 2008 : 1,99) Kouřil R., Ilík P., Tomek P., Nauš J, Poulíčková A. (2001) Chlorophyll fluorescence temperature curve on Klebsormidium flaccidum cultivated at different temperature regimes. Journal of Plant Physiology 158, (IF 2008 : 2,44) 5

6 Lazár D., Tomek P., Ilík P., Nauš J. (2001) Determination of the antenna heterogeneity of Photosystem II by direct simultaneous fitting of several fluorescence rise curves measured with DCMU at different light intensities. Photosynthesis Research 68, (IF 2008 : 2,68) Tomek P., Lazár D., Ilík P., Nauš J. (2001) On the intermediate steps between the O and P steps in chlorophyll a fluorescence rise measured at different intensities of exciting light. Australian Journal of Plant Physiology 28, (IF 2008 : 2,25) Ilík P., Kouřil R., Fiala J., Nauš J., Vácha F. (2000) Spectral characterization of chlorophyll fluorescence in barley leaves during linear heating. Analysis of hightemperature fluorescence rise around 60 C. Journal of Photochemistry and Photobiology. B: Biology 59, (IF 2008 : 1,84) Kouřil R., Ilík P., Nauš J., Schoefs B. (1999) On the limits of applicability of spectrophotometric and spectrofluorimetricmethods for the determination of chlorophyll a/b ratio. Photosynthesis Research 62, (IF 2008 : 2,44) Skotnica J., Fiala J., Ilík P., Dvořák L. (1999) Thermaly induced chemiluminescence of barley leaves. Photochemistry and Photobiology 69, (IF 2008 : 2,29) Lazár D., Ilík P., Nauš J. (1997) An appearance of K-peak in fluorescence induction depends on the acclimation of barley leaves to higher temperature. Journal of Luminescence 72-74, (IF 2008 : 1.63) Lazár D., Ilík P. (1997) High-temperature induced chlorophyll fluorescence changes in barley leaves. Comparison of the critical temperatures determined from fluorescence induction and from fluorescence temperature curve. Plant Science 124, (IF 2008 : 1,97) Ilík P., Nauš J., Špunda V., Čajánek M., Cikánek D., Pospíšil P. (1997) High temperature chlorophyll fluorescence rise within C. Spectroscopic study with intermittent light grown barley leaves. Journal of Photochemistry and Photobiology. B: Biology 39, (IF 2008 : 1,84) Špunda V., Čajánek M., Ilík P., Kalina J., Nauš J. (1997) Appearance of longwavelength excitationform of chlorophyll a in PS I fluorescence during greening of barley leaves under continuous light. Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology 40, (IF 2008 : 1,84) Ilík P., Vystrčilová M., Nauš J., Kalina J. (1997) Chlorophyll fluorescence temprature curves of spruce needles from different whorls of the tree. Photosynthetica 34, (IF 2008 : 1.00) Ilík P., Nauš J., Cikánek D., Novotný R. (1995) Chlorophyll fluorescence changes at high temperatures induced by linear heating of greening barley leaves. Photosynthesis Research 44, (IF 2008 : 2,68) Nauš J., Klinkovský T., Ilík P., Cikánek D. (1994) Model studies of chlorophyll fluorescence reabsorption at chloroplast level under different exciting light conditions. Photosynthesis Research 40, (IF 2008 : 2,68) Nauš J., Kuropatwa R., Klinkovský T., Ilík P., Lattová J., Pavlová Z. (1992) Heat injury of barley leaves detected by the chlorophyll fluorescence temprature curve. Biochimica et Biophysica Acta 1101, (IF 2008 : 4,45) 6

7 Práce publikované v tuzemských recenzovaných časopisech Krchňák P., Ilík P., Nauš J. (2002) Konstrukce aparatury pro monochromatické snímkování plošných objektů v procházejícím světle a její použití k analýze elektroforeogramů. Jemná mechanika a optika 1, Nauš J., Ilík P. (1997) Fluorescence Temperature Curve and Fluorescence Reabsorbtion of Chlorophyll a in Leaves. Acta Universitatis Carolinae Biologica 41, Nauš J., Kuropatwa R., Mašláň M., Ilík P. (1993) Natural light stress of barley leaves detected by chlorophyll fluorescence temperature curve. Acta Universitatis Palackianae Olomuciensis, Facultas Rerum Naturalium, Physica 32, Plnohodnotné práce publikované ve sbornících z konferencí Ilík P., Krchňák P., Tomek P., Popelková H., Nauš J. (2001) High-contrast imaging of chlorophyll-containing protein complexes separated by native polyacrylamide gel electrophoresis. In: Proceedings of the 12 th International Congress on Photosynthesis (CD-ROM), S1-028, 4 pages CSIRO Publishing, Collingwood Kaňa R., Kotabová E., Ilík P., Nauš J., Prášil O. (2005) Irreversible changes in photosynthetic rate induced by heating above 40 C. In: A. van der Est, D. Bruce (eds.), Photosynthesis: Fundamental Aspects to Global Perspectives, Allen Press, Fiala J., Ilík P., Skotnica J., Nauš J. (1998) Spectral changes of chlorophyll fluorescence during linear heating of barley leaves. In: G. Garab (ed.), Photosynthesis: Mechanisms and Effects, Vol. I, , Kluwer Academic Publishers, Dordrecht Ilík P., Nauš J., Cikánek D., Špunda V., Čajánek M., Novotný R., Žák D. (1995) An investigation of high-temperature region of chlorophyll fluorescence temperature curve. In: P. Mathis (ed.), Photosynthesis: from Light to Biosphere, Vol. IV, , Kluwer Academic Publishers, Dordrecht Kuropatwa R., Nauš J., Klinkovský T., Ilík P., Kalina J., Mašláň M., Žák D., Lattová J., Pavlová Z. (1992) The clorophyll fluorescence temperature curve as a plant damage and light acclimation diagnostic tool. In: M. Murata (ed.), Research in Photosynthesis, Vol. IV, , Kluwer Academic Publishers, Dordrecht Učební texty spoluautor učebního textu Holubová: Fyzika pro chemiky. UP Olomouc

8 Pedagogická činnost Přednášky, cvičení, praktika, semináře pro studenty bakalářského, magisterského a doktorského studia: PřF UP v Olomouci Fyzika pro chemiky semestrální přednáška (3 hod. př., 1 hod. cv.) (2 semestry, ) Experimentální metody biofyziky semestrální přednáška (3 hod.) (3 semestry v letech 1997, 1999, 2001) Fotosyntéza semestrální přednáška (3 hod.) (11 semestrů v letech 1996 dosud) Bioenergetika semestrální přednáška (2 hod.) (6 semestrů v letech 2002 dosud) Luminiscence chlorofylu semestrální přednáška (2 hod.) (1 semestr v roce 2000) Fyzika (1 hod. cv.) (3 semestry, ) Praktikum experimentálních metod biofyziky (3 hod.) (11 semestrů v letech 1995 dosud) Praktikum z fyziky pro chemiky (5 hod.) (4 semestry, ) Experimentální metody fotosyntézy semestrální přednáška (6-9 hod. v semestru)(6 semestrů v období 1996 dosud) Stres ve fotosyntéze (3 12 hod. v semestru) (6 semestrů v letech ) Praktikum experimentálních metod lékařské biofyziky (8 hod. v semestru) (4 semestry v letech 2002 dosud) Proseminář z biofyziky (2 hod. v semestru) (2 semestry v letech 2008 dosud) Biofyzikální ústav AV ČR v Brně Molekulární základy fotosyntézy (5 hod. ročně, ) Vedení studentů a prací, oponentura prací vedení 9 bakalářských (6 obhájeno), 11 diplomových prací (8 obhájeno) školitel 3 studentů doktorského studia oboru Biofyzika na PřF UP (E. Kotabová , obhájeno 2008; L. Lípová 2004 studium ukončeno, H. Kyseláková 2005 dosud) vedení 3 středoškolských studentů v rámci projektu Badatel na PřF UP, 2 studenti úspěšné zakončení projektu vedení 1 středoškolského studenta v rámci projektu OP VK Otevřená věda II (AV ČR) konzultant 15 diplomových a 13 doktorských prací oponent 1 bakalářské, 8 diplomových a 4 doktorských prací a 2 habilitačních prací 8