CURRICULUM VITAE OSOBNÍ ÚDAJE Jméno a příjmení: Datum a místo narození: Rodinný stav: Jaroslav Doležel 22. 7. 1954, Olomouc ženatý Adresa: Ježkova 7, 779 00 Olomouc-Svatý Kopeček, Tel.: 585 385 163 Hlavní pracovní poměr: Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i., Šlechtitelů 31, 783 71 Olomouc; Tel.: 585 285 703; Email: dolezel@ueb.cas.cz VZDĚLÁNÍ A AKADEMICKÁ KVALIFIKACE 2013: profesor, obor Molekulární biologie a genetika, Masarykova univerzita, Brno 2001: docent, obor Botanika, Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci, habilitační práce: Využití průtokové cytometrie pro analýzu genomů rostlin 2001: DrSc., obor genetika, AV ČR, Praha, disertační práce: Analýza genomů rostlin pomocí průtokové cytometrie 1983: CSc., obor genetika, Ústav experimentální botaniky ČSAV, disertační práce: "Karyologie explantátových kultur česneku (Allium sativum L.)" 1978: Ing., obor zahradnický, agronomická fakulta Vysoké školy zemědělské v Brně, diplomová práce: Průzkum možností využití experimentální embryologie při vzdálené hybridizaci u rodu Allium (prospěl s vyznamenáním) DOSAVADNÍ PRAXE 2013 dosud: profesor, Katedra buněčné biologie a genetiky, Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci (vedlejší pracovní poměr) 2013 dosud: vědecký ředitel, Centrum regionu Haná pro biotechnology a zemědělský výzkum, Olomouc 2010 dosud: vedoucí, Centrum strukturní a funkční genomiky rostlin, Ústav experimentální botaniky AV ČR, Olomouc 1993 dosud: vedoucí vědecký pracovník, Ústav experimentální botaniky AV ČR, Olomouc 2002 2013: docent, Katedra buněčné biologie a genetiky, Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci (vedlejší pracovní poměr) 1997 2010: vedoucí pracoviště, Ústav experimentální botaniky AV ČR, Olomouc 1994 2010: vedoucí Laboratoře molekulární cytogenetiky a cytometrie, Ústav experimentální botaniky AV ČR, Olomouc 1992 2002: odborný asistent, Katedra buněčné biologie a genetiky, Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci (vedlejší pracovní poměr) 1986 1992: vědecký pracovník, Oddělení šlechtitelských biotechnologií, Ústav experimentální botaniky ČSAV, Olomouc 1985 1986: studijní pobyt, ENEA, C.R.E, Casaccia, Řím, Itálie 1983 1985: vědecký pracovník, Oddělení šlechtitelských biotechnologií, Ústav experimentální botaniky ČSAV, Olomouc 1
ZAHRANIČNÍ STÁŽE 2007: International Institute of Tropical Agriculture, Kampala, Uganda (1 týden) 2007: International Institute of Tropical Agriculture, Ibadan, Nigérie (1 týden) 1999: International Institute of Tropical Agriculture, Ibadan, Nigérie (2 týdny) 1997: Malaysian Institute for Nuclear Technology Research, Bangi, Malajsie (3 týdny) 1996: Universidad Nacional Autonoma de Mexico, Mexiko (2 x 3 týdny) 1994: ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie (3 měsíce) 1989: National Nuclear Research Institute, Accra, Ghana (6 týdnů) 1993: Tree Improvement Research Centre, Kitwe, Zambie (3 týdny) 1993: ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie (3 měsíce) 1990: ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie (4 měsíce) 1988: Tree Improvement Research Centre, Kitwe, Zambie (4 týdny) 1987: National Nuclear Research Institute, Accra, Ghana (6 týdnů) VÝZKUMNÁ ČINNOST Jako jeden z prvních na světě vypracoval metodu stanovení velikosti jaderného genomu rostlin pomocí průtokové cytometrie. Významně přispěl její standardizaci a širokému uplatnění, které zahrnuje genetiku a fyziologii rostlin, systematiku, taxonomii a populační biologii. Důležité praktické uplatnění tato metoda našla při šlechtění rostlin. Založil nový obor genomiky, tzv. chromozomovou genomiku, která kombinuje izolaci chromozomů pomocí průtokové cytometrie s postupy genomiky. Využitím unikátní metody izolace chromozomů přispěl k přečtení složitých genomů hospodářsky významných plodin, včetně pšenice. Chromozomová genomika se široce uplatňuje při studiu struktury a evoluce dědičné informace rostlin a při mapování a izolaci důležitých genů. Vytvořil úspěšný program studia dědičné informace banánovníku, jehož plody jsou základní potravinou v mnoha rozvojových zemích. Podílel se na přečtení jeho dědičné informace a založil genotypovací centrum, které má důležitou úlohu při charakterizaci a záchraně genového bohatství pěstovaných odrůd a planých druhů banánovníku. Účastní se mezinárodních projektů zaměřených na šlechtění této důležité plodiny kde zavádí nejnovější metody molekulární biologie. Jeho současný výzkum je zaměřený na studium uspořádání dědičné informace v trojrozměrném prostoru buněčného jádra a vlivu tohoto uspořádání na funkci dědičné informace, regulaci růstu a vývoje rostlin a jejich reakci na faktory vnějšího prostředí. ŘEŠENÍ VÝZKUMNÝCH PROJEKTŮ Dosud byl řešitelem 16 výzkumných projektů národních agentur, dvou projektů Mezinárodní agentury pro atomovou energii a jednoho projektu EU (INTAS) Dosud byl spoluřešitelem 13 výzkumných projektů národních agentur, dvou projektů EU (7. rámcový program a COST), jednoho projektu USDA a jednoho projektu NSF Je řešitelem tří projektů a spoluřešitelem jednoho projektu národních agentur PEDAGOGICKÁ ČINNOST 2015 dosud: 1/3 semestrální přednášky Cytometrie (2 hod/týden), Přírodovědecká fakulta Univerzity Karlovy, Praha 2005 dosud: semestrální přednáška Anatomie genomu (2 hod/týden), Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého, Olomouc 2
2005 dosud: semestrální přednáška Cytometrické techniky (1 hod/týden), Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého, Olomouc 1992 dosud: semestrální přednáška Cytotaxonomie a cytogenetika (2 hod/týden), Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého, Olomouc VEDENÍ STUDENTSKÝCH PRACÍ Bakalářské práce: tři obhájené Diplomové práce: šest obhájeno Doktorské disertační práce: 15 obhájeno, dva studují ČLENSTVÍ V OBOROVÝCH RADÁCH DOKTORSKÝCH STUDIJNÍCH PROGRAMŮ 2014 dosud: Doktorský studijní obor Experimentální biologie, Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci 2013 dosud: Doktorský studijní program Life Sciences, Masarykova univerzita, Středoevropský technologický institut, Brno 2010 dosud: Doktorský studijní obor Anatomie a fyziologie rostlin, Mendelova univerzita v Brně 2009 dosud: Doktorský studijní obor Molekulární biologie, Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci 2007 dosud: Doktorský studijní obor Botanika, Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci 2004 dosud: Doktorský studijní obor Biofyzika, Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci VÝUKA NA ODBORNÝCH KURZECH V ZAHRANIČÍ 2017: Frontiers in Genomics, Center for Genomic Sciences, National Autonomous University of Mexico, Cuernavaca, Mexiko 2016: Workshop Plant Cytogenetics, Cytogenomics, Gene Discovery and Crop Improvement, Nanjing Agricultural University, Nanjing, China 2013: Flow Cytometry in Plant Science, Namik Kemal University, Faculty of Agriculture, Tekirdag, Turecko 2010: Flow Cytometry for Research in Plant Science, Faculty of Science, Mahidol University, Bangkok, Thajsko 2010: Plant Flow Cytometry, Universiti Sains Malaysia, Centre for Chemical Biology, Penang, Malajsie 2008: 26 th National School of Cytometry, Urbino, Itálie 2003: Modern Approaches on the Principles and Applications of Cell Sorting and Flow Cytometry, Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable, Montevideo, Uruguay 2002: 19 th National School of Cytometry, Urbino, Itálie 1998: 2 nd International School of Cytometry, Jagiellonian University, Krakow, Polsko 1997: 15 th FAO/IAEA Interregional Training Course on Advances in Technologies for Induced Mutations in Crops, Seibersdorf, Vídeň, Rakousko 1997: Workshop on DNA Flow Cytometry, Malaysian Institute for Nuclear Technology Research, Bangi, Malajsie 1995: 14 th FAO/IAEA Interregional Training Course on Advances in Plant Mutation Techniques, Seibersdorf, Vídeň, Rakousko 3
1994: Theoretical and Practical Course on Plant Flow Cytometry, ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie 1994: 13 th FAO/IAEA Interregional Training Course on the Induction and Use of Mutations in Plant Breeding, Seibersdorf, Vídeň, Rakousko 1993: 12 th FAO/IAEA Interregional Training Course on the Induction and Use of Mutations in Plant Breeding, Seibersdorf, Vídeň, Rakousko PŮSOBENÍ V GRANTOVÝCH AGENTURÁCH 2017 dosud: MŠMT (odborný poradní orgán programu Inter-Excelence, podprogram Inter-COST) 2017 dosud: NAZV (pracovní skupina Programu aplikovaného výzkumu Ministerstva zemědělství) 2017 2018: ERC (člen hodnotícího panelu Advanced grants ) 2005 2013: GAČR (předseda oborové komise, místopředseda oborové komise, člen oborové komise, předseda hodnotícího panelu, místopředseda hodnotícího panelu, člen hodnotícího panelu) 1995 1999: GAČR (člen hodnotícího panelu, člen oborové komise, předseda podoborové komise, člen podoborové komise, předseda podoborové komise) RECENZENT MEZINÁRODNÍCH VĚDECKÝCH ČASOPISŮ Annals of Botany, AoB PlantsBiologia Plantarum, BMC Genomics, BMC Plant Biology, Breeding Science, Caryologia, Cellular and Molecular Biology Letters, Chromosoma, Chromosome Research, Crop Science, Cytometry, Cytogenetics and Genome Research, Euphytica, Folia Geobotanica, Frontiers in Plant Science, Gene, Genome, Hereditas, Journal of Applied Genetics, Journal of Evolutionary Biology, Journal of Experimental Botany, Journal of Histochemistry and Cytochemistry, Molecular Breeding, Lindeleyana, Physiology and Molecular Biology of Plants, Planta, Plant Biology, Plant Biotechnology Journal, Plant Cell, Tissue and Organ Culture, Plant Cell Reports, Plant Ecology and Diversity, Plant Genome, Plant Systematics and Evolution, Protoplasma, Scientia Horticulturae, Scientific Reports, Sexual Plant Reproduction, Theoretical and Applied Genetics. PUBLIKAČNÍ ČINNOST Editor odborných knih Molnár-Láng, M., Ceoloni, C., Doležel, J. (eds.): Alien Introgression in Wheat. Pp. 381. Springer, 2015. Leitch, I.J., Greilhuber, J., Doležel, J., Wendel, J.F. (eds.): Plant Genome Diversity, Volume 2. Pp. 353. Springer-Verlag, Wien, 2013. Wendel, J.F., Greilhuber, J., Doležel, J., Leitch, I.J. (eds.): Plant Genome Diversity, Volume 1. Pp. 279. Springer-Verlag, Wien, 2012. Doležel, J., Greilhuber, J., Suda, J. (eds.): Flow Cytometry with Plant Cells. Pp. 454. Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim, 2007. Členství v redakční radě knižní série 2001 2008: Člen redakční rady knižní série: Plant Genome: Biodiversity and Evolution, Sharma, A.K. and Sharma A. (Eds.). Science Publishers, Inc., Enfield, USA. Volume 1, Part A: Phanerogams (2003), Volume 1, Part B : Phanerogams (Higher Group) (2005), Volume 1, Part C : Phanerogams (Angiosperm-Dicotyledons) (2006), Volume 1, Part D : Phanerogams (Gymnosperm) and (Angiosperm-Monocotyledons) (2006), Volume 1, Part E: Phanerogams Angiosperms (2008), Volume 2, Part A: Lower Groups (2004) a Volume 2, Part B: Lower Groups (2006). 4
Editor zvláštních čísel mezinárodních vědeckých časopisů 2014: Green for Good II, Frébort, I., Doležel, J. (Eds.), Biotechnology Advances, Vol. 32, No. 1, 2013. 2010: Genome Size, Greilhuber, J., Doležel, J., Leitch, I.J., Loureiro, J., Suda, J. (Eds.), Journal of Botany, Vol. 2010, 2010. 2004: Genome Analysis using Flow Sorted Chromosomes, Doležel, J., Carter, N., Ferguson-Smith, M. (Eds.), Chromosome Research, Vol. 12, No. 1, 2004. Členství v redakčních radách mezinárodních časopisů 2008 dosud: Genes and Genetic Systems, The Genetics Society of Japan, Mishima, Japonsko 2006 dosud: The Nucleus, Central Institute of Medicinal & Aromatic Plants, Lucknow, Indie 2002 dosud: Journal of Applied Genetics, Institute of Plant Genetics, Poznan, Polsko 2006 2018: International Journal of Plant Genomics, Hindawi Publishing Corp., New York, USA 1995 2013: Chromosome Research, Springer, Heidelberg, Německo 1998 2013: Biologia Plantarum, Institute of Experimental Botany, Praha Počet a ohlas publikací Články ve vědeckých časopisech: 307 Kapitoly ve vědeckých knihách: 44 Počet citací (Web of Science, 27.8.2018): 11984 h-index (Web of Science, 27.8.2018): 52 ČLENSTVÍ V ODBORNÝCH SPOLEČNOSTECH 2006 dosud: International Society for Horticultural Science, Leuven, Belgie (člen) 2005 dosud: The Genetics Society of America, Bethesda, USA (člen) 2001 dosud: Česká společnost pro analytickou cytologii, Brno (zakládající člen, předseda, místopředseda) 1999 dosud: European Cytogeneticists Association, Clermont-Ferrand, Francie (člen) 1997 dosud: International Society for Analytical Cytology, Northbrook, USA (člen) 1990 dosud: Česká společnost histo- a cytochemická, Brno (člen) JINÉ AKTIVITY 2015 dosud: koordinátor programu Strategie AV21 Potraviny pro budoucnost 2014 dosud: člen Vědecké rady Mendelovy univerzity v Brně, Brno 2013 dosud: člen Vědecké rady Akademie věd České republiky, Praha 2013 dosud: člen Rady Biologického centra AV ČR, v.v.i., České Budějovice 2010 dosud: člen komise AV ČR pro obhajoby disertačních prací pro titul doktor věd v oboru Genetika a genomika 2008 dosud : člen komise AV ČR pro obhajoby disertačních prací pro titul doktor věd v oboru Botanika a fyziologie rostlin 2007 dosud: volený člen Akademického sněmu AV ČR 2007 dosud: člen Rady Biofyzikálního ústavu AV ČR, v.v.i., Brno 2007-2011: místopředseda Rady Ústavu experimentální botaniky AV ČR, v.v.i., Praha 2006 dosud: Vědecko-pedagogická rada oboru Biologie a ekologie, Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci 5
2005 dosud: člen koordinačního výboru Mezinárodního konsorcia pro sekvenování genomu pšenice 2005 dosud: člen řídícího výboru Konsorcia pro genomiku banánovníku, Montpellier, Francie 2000-2006: člen Vědecké rady Odboru genetiky a šlechtění Výzkumného ústavu rostlinné výroby, Praha 1998-2007: předseda Pracovní skupiny pro genetiku a šlechtění Globálního programu pro šlechtění banánovníku (PROMUSA), Montpellier, Francie 1987-1997: expert FAO/IAEA pro oblast rostlinné genetiky a biotechnologií, programy technické spolupráce s rozvojovými zeměmi, Vídeň, Rakousko OCENĚNÍ 2014: Obdržel Cenu ministra školství, mládeže a tělovýchovy ČR za mimořádné výsledky výzkumu, experimentálního vývoje a inovací za rok 2014 2013: Obdržel Leadership Award od Mezinárodního konsorcia pro sekvenování genomu pšenice (Bethesda, USA) 2012: Obdržel cenu Praemium Academiae AV ČR 2004: Zvolen řádným členem Učené společnosti České republiky 2004: Obdržel bronzovou medaili Za zásluhy o rozvoj Univerzity Palackého v Olomouci 1999: Obdržel Cenu Učené společnosti České republiky 6