RNDr. Václav Martínek, Ph.D. Seznam publikací k datu 14. 11. 2012 I. Vědecké monografie II. Kapitoly v monografiích III. Původní práce a práce v recenzovaných sbornících III. A. Časopisy s IF 1. Stiborová M., Martínek V., Rýdlová H., Hodek P., Schmeiser H.H., Frei E.: Sudan I is a potential carcinogen for humans: evidence for its metabolic activation and detoxication by human recombinant cytochrome P450 1A1 and liver microsomes. Cancer Res. 2002, 62, 5678-5684. IF 2002 = 8.318 (125 citací) 2. Martínek V., Stiborová M.: Metabolism of carcinogenic azo dye Sudan I by rat, rabbit, minipig and human hepatic microsomes. Collect. Czech. Chem. Commun. 2002, 67, 1883-1898. IF 2002 = 0.848 (9 citací) 3. Stiborova M., Martinek V., Rydlova H., Koblas T., Hodek P.: Expression of cytochrome P450 1A1 and its contribution to oxidation of a potential human carcinogen 1-phenylazo-2- naphthol (Sudan I) in human livers. Cancer Letters 2005, 220, 145-154. IF 2005 = 3.049 (38 citací) 4. Arlt V.M., Stiborova M., Henderson C.J., Osborne M.R., Bieler C.A., Frei E., Martinek V., Sopko B., Wolf C.R., Schmeiser H.H., Phillips D.H.: Environmental pollutant and potent mutagen 3-nitrobenzanthrone forms DNA adducts after reduction by NAD(P)H : quinone oxidoreductase and conjugation by acetyltransferases and sulfotransferases in human hepatic cytosols. Cancer Res. 2005, 65, 2644-2652. IF 2005 = 7.616 (63 citací) 5. Stiborová M., Martínek V., Schmeiser H.H., Frei E.: Modulation of CYP1A1-mediated oxidation of carcinogenic azo dye Sudan I and its binding to DNA by cytochrome b5. Neuroendocrinol Lett 2006, 27(Suppl.2), 35 39 IF 2006 = 0.924 (20 citací) 6. Bren U., Martinek V., Florian J.: Free energy simulations of uncatalyzed DNA replication fidelity- structure and stability of T G and dttp G terminal DNA mismatches flanked by a single dangling nucleotide. J. Phys. Chem. B. 2006, 110 (21), 10557-10566. IF 2006 = 4.115 (37 citací) 1/6
7. Bren U., Martinek V., Florián J.: Decomposition of the solvation free energies of deoxyribonucleoside triphosphates using the free energy perturbation method. J. Phys. Chem. B. 2006, 110 (25): 12782-12788 IF 2006 = 4.115 (32 citací) 8. Sucato CH.A., Upton T.G., Kashemirov B.A., Batra V.K., Martínek V., Xiang Y., Beard W.A., Pedersen L.C., Wilson S.H., McKenna CH.E., Florian J., Warshel A., Goodman M.F.: Modifying the b,g leaving-group bridging oxygen alters nucleotide incorporation efficiency, fidelity, and the catalytic mechanism of DNA polymerase b. Biochemistry, 2007, 46, 461-471. IF 2007 = 3.368 (40 citací) 9. Hodek P., Karabec M., Sulc M., Sopko B., Smrcek S., Martinek V., Hudecek J., Stiborova M.: Mapping of cytochrome P4502B4 substrate binding sites by photolabile probe 3- azidiamantane: Identification of putative substrate access regions. Archives of Biochemistry and Biophysics 2007, 468, 82-91 IF 2007 = 2.578 (3 citace) 10. Martínek V., Bren U., Goodman M. F., Warshel A., Florián J.: DNA polymerase β catalytic efficiency mirrors the Asn279 dctp H-bonding strength. FEBS Letters, 2007, 581 (4), 775-780. IF 2007 = 3.263 (11 citací) 11. Reynisson J., Stiborova M., Martinek V., Gamboa da Costa G., Phillips D., Arlt VM.: Mutagenic potential of nitrenium ions of nitrobenzanthrones: correlation between theory and experiment Environmental and Molecular Mutagenesis. 49:8, 659-667, 2008 IF 2008 = 2.181 (10 citací) 12. Semanska M., Dracinsky M., Martinek V., Hudecek J., Hodek P., Frei E., Stiborova M.: A one-electron oxidation of carcinogenic nonaminoazo dye Sudan I by horseradish peroxidase. Neuroendocrinol Lett 2008, 29(5), 706-711 IF 2008 = 1.359 (2 citace) 13. Poljaková J., Eckschlager T., Hraběta J., Hřebačková J., Smutný S., Frei E., Martínek V., Kizek R., Stiborová M.: The mechanism of cytotoxicity and DNA adduct formation by the anticancer drug ellipticine in human neuroblastoma cells. Biochemical Pharmacology, 2009, 77 (9), 1466-1479 IF 2009 = 4.254 (18 citací) 14. Mrázová B., Martínek V., Martínková M., Šulc M., Frei E., Stiborová M.: Preparation of apocytochrome b(5) utilizing heme transfer to apo-myoglobin. Neuroendocrinol Lett 2009, 30(Suppl), 72-79 IF 2009 = 1.047 (0 citací) 15. Kotrbová V., Aimová D., Ingr M., Bořek-Dohalská L., Martínek V., Stiborová M: Preparation of a biologically active apo-cytochrome b5 via heterologous expression in Escherichia coli. Protein Expression and Purification 2009, 66(2), 203-209 IF 2009 = 1.563 (4 citace) 16. Dračínský M., Cvačka J., Semanská M., Martínek V., Frei E., Stiborová M.: Mechanism of formation of (deoxy)guanosine adducts derived from peroxidase-catalyzed oxidation of the 2/6
carcinogenic nonaminoazo dye 1-phenylazo-2-hydroxynaphthalene (Sudan I). Chem. Res. Toxicol., 2009, 22 (11), 1765-1773 IF 2009 = 3.740 (1 citace) 17. Pontikis G., Borden J., Martínek V., Florián J: Linear energy relationships for the octahedral preference of Mg, Ca and transition metal ions. J. Phys. Chem. A. 2009, 113 (15): 3588-3593 IF 2009 = 2.899 (1 citace) 18. Stiborová M., Martínek V., Svobodová M., Šístková J., Dvořák Z., Ulrichová J., Šimánek V., Frei E., Schmeiser HH., Phillips DH., Arlt VM.: Mechanisms of the different DNA adduct forming potentials of the urban air pollutants 2-nitrobenzanthrone and carcinogenic 3- nitrobenzanthrone. Chem. Res. Toxicol., 2010, 23 (7), 1192-1201 IF 2010 =4.148 (8 citací) 19. Martínek V., Sklenář J., Dračínský M., Šulc M., Hofbauerová K., Bezouška K., Frei E., Stiborová M.: Glycosylation protects proteins against free radicals generated from toxic xenobiotics. Toxicological Sciences, 2010, 117 (2): 359-374 IF 2010 = 5.093 (1 citace) 20. Bren U., Lah J., Bren M., Martínek V., Florian V.: DNA duplex stability: The role of preorganized electrostatics. J. Phys. Chem. B. 2010, 114 (8): 2876-2885 IF 2010 = 3.603 (13 citací) 21. Stiborová M., Mareš J., Frei E., Arlt V.M., Martínek V., Schmeiser H.H.: The human carcinogen aristolochic acid I is activated to form DNA adducts by human NAD(P)H:quinone oxidoreductase without the contribution of acetyltransferases or sulfotransferases. Environ. Mol. Mutagen., 2011, 52 (6): 448-459 IF 2010 = 3.493 (10 citací) 22. Kotrbová V., Mrázová B., Moserová M., Martínek V., Hodek P., Hudeček J., Frei E., Stiborová M.: Cytochrome b 5 shifts oxidation of the anticancer drug ellipticine by cytochromes P450 1A1 and 1A2 from its detoxication to activation, thereby modulating its pharmacological efficacy. Biochem. Pharmacol., 2011, 82: 669-680 IF 2010 = 4.889 (5 citací) 23. Martinek V., Kubickova B., Arlt V.M., Frei E., Schmeiser H.H., Hudecek J., Stiborova M.: Comparison of activation of aristolochic acid I and II with NADPH:quinone oxidoreductase, sulphotransferases and N-acetyltranferases. Neuroendocrinol Lett, 2011, 32: (S1) 57-70 IF 2010 = 1.621 (0 citací) 24. Stiborová M., Indra R., Moserová M., Cerná V., Rupertová M., Martinek V., Eckschlager T., Kizek R., Frei E.: Cytochrome b5 increases cytochrome P450 3A4-mediated activation of anticancer drug ellipticine to 13-hydroxyellipticine whose covalent binding to DNA is elevated by sulfotransferases and N,O-acetyltransferases. Chem. Res. Toxicol., 2012, 25: 1075 1085 IF 2011 = 3.779 (0 citací) 3/6
III. B. Časopisy bez IF 25. Mrázová B., Martínková M, Martínek V, Frei E, Stiborová M Optimization of preparation of apo-cytochrome b5 utilizing apo-myoglobin. Interdisciplinary Toxicology, 2008, 1(2), 190 192 26. Naiman K., Dračínská H, Dračínský M, Martínková M, Martínek V, Hodek P, Štícha M, Frei E, Stiborová M: Cytochrome P450-mediated metabolism of N-(2-methoxyphenyl)- hydroxylamine, a human metabolite of the environmental pollutants and carcinogens o- anisidine and o-nitroanisole. Interdisciplinary Toxicology, 2008, 1(3-4), 218 224 27. Stiborová M., Naiman K, Martínková M, Martínek V, Svobodová M, Schmeiser HH, Frei E: Genotoxic mechanisms for the carcinogenicity of the environmental pollutants and carcinogens o-anisidine and 2-nitroanisole follow from adducts generated by their metabolite N-(2-methoxyphenyl)-hydroxylamine with deoxyguanosine in DNA. Interdisciplinary Toxicology, 2009, 2(1), 24-27 28. Stiborová M., Martínek V., Semanská M., Dračínský M, Cvačka J., Schmeiser H., Frei E.: Oxidation of the carcinogenic non-aminoazo dye 1-phenylazo-2-hydroxynaphthalene (Sudan I) by cytochromes P450 and peroxidases: a comparative study. Interdisciplinary Toxicology, 2009, 2(3), 195-200 III. C. Recenzované sborníky 29. Martínek V., Stiborová M.: Sudan I metabolism by human cytochrome P450 1A1 is stimulated by microsomal cytochrome b 5. Cytochromes P450, Biochemistry, Biophysics and Drug Metabolism: 13 th International Conference on Cytochrome P450 (Ed. Anzenbacher P., Hudecek J.), Monduzzi editore, Prague, 2003, 235-240 30. Semanská M., Martínek V., Hudeček J., Hodek P., Dračínský M., Frei E., Stiborová M.: Study of peroxidase-mediated oxidation of carcinogenic azo dye Sudan I. Chemické listy, 2007, 101, 14, s266-s268 IV. Učebnice a učební texty 31. Sofrová D., Tichá M., Barthová J., Entlicher G., Stiborová M., Novák F., Hudeček J., Hladík J., Krajhanzl A., Martínek V. Biochemie: Základní kurz, Karolinum - Univerzita Karlova v Praze, Praha 2009, ISBN: 978-80-246-1678-0 32. Zaspalová J., Fendrychová A., Volmutová I., Šmejkal P., Martínek V., Hrubý M., Teplý P. Polymery kolem nás, Nakladatelství P3K, Praha 2012, ISBN: 978-80-87186-76-3 p. 42-60 4/6
V. Různé závažné práce VI. Přednášky typu "invited speaker" VII. Přehledy a souborné referáty 33. Stiborová M., Mikšanová M., Martínek V., Frei E.: Heme peroxidases: structure, function, mechanism and involvement in activation of carcinogens. a review. Collect. Czech. Chem. Commun. 2000, 65, 297-325. IF 2000 = 0.960 (14 citací) 34. Chromá L., Macková M., Macek T., Martínek V., Stiborová M.: Rostlinné cytochromy P450 a peroxidasy a jejich úloha při degradaci kontaminantů životního prostředí. Chem. Listy 2001, 95, 212-222. IF 2001 = 0.336 (3 citace) 35. Stiborová M., Hudeček J., Páca J. Jr, Martínek V., Páca J.: Enzymy metabolizující kontaminanty životního prostředí. Chem. Listy 2004, 98, 876-890. IF 2004 = 0.345 (3 citace) VIII. Patenty národní a zahraniční, objevy IX. Disertační, rigorózní práce, habilitační práce 36. Martínek V.: Studium mechanismu působení karcinogenního azobarviva Sudanu I (1- fenylazo-2-naftolu), Disertační práce, PřF UK, Praha 2003 X. Abstrakta ze sjezdů a sympozií Autor 4 přednášek a spoluautor 69 posterových sdělení. XI. Účast na řešení grantů 37. Poznání mechanismu karcinogenního působení o-nitroanisolu a o-anisidinu jako karcinogenů s dosud nepoznanými principy účinku - 203/99/1003 GAČR 1999-2002 (účast na řešení grantu uděleného prof. RNDr. Marii Stiborové, Dr.Sc.). 38. Studium vztahu mezi strukturou, dynamikou a funkcí molekulárních a supramolekulárních systémů z hlediska technických a biomedicinálních aplikací - Výzkumný záměr MSM113100001 MŠMTČR 1999-2004 (účast na řešení grantu uděleného prof. RNDr. Karlu Procházkovi, Dr.Sc., PřF UK). 5/6
39. Studium funkce lidských cytochromů P450 v metabolismu karcinogenního azobarviva Sudanu I a poznání struktury jeho aduktů s nukleovými kyselinami - 204/2001 GAUK 2001-2003 (účast na řešení grantu uděleného prof. RNDr. Marii Stiborové, Dr.Sc.). 40. Studium karcinogenního potenciálu o-nitroanisolu a o-anisidinu pro lidský organismus - 203/03/0283 GAČR 2003-2006 (účast na řešení grantu uděleného prof. RNDr. Marii Stiborové, Dr.Sc.). 41. DNA Polymerase Fidelity Mechanisms: Theory And Experiment 1U19CA105010 NIH (USA) 2004-2008 (nositel grantu prof. Myron F Goodman (USA)). 42. Mechanismus modulace oxidace léčiv a karcinogenů cytochromy P450 1A1/2 působením cytochromu b5; experimentální i teoretické přístupy - 203/09/0812 GAČR 2009-2011 (hlavní řešitel). 43. Enzymy a mechanismy mikrobní degradace nitroaromatických sloučenin - P503/11/0163 GAČR 2011-nyní (účast na řešení grantu uděleného prof. RNDr. Marii Stiborové, Dr.Sc.). 44. Moderní technologie pro identifikaci a optimalizaci nádorových léčiv nové generace - UNCE 204025/2012 2012-nyní (účast na řešení grantu). XII. Ostatní publikace V Praze dne 14.11.2012... RNDr. Václav Martínek, Ph.D. 6/6