Kupnf smlouva uzavlend podle $ 2079 a ndsl. zdkona i. 89/201 2 Sb., obianslqt zdkonfk, (ddle jen,, obianslcy zdkonik" )

Transkript

1 EVROPSKA UNIE EVROPSKV FOND PRO REGIONALNI ROZVOJ INVESTICE DO VAS[ BUDOUCNO5TI MINISTEBSTVO SKOLSTVf, MLADEZE A TELOVVCHOVY Kupnf smlouva uzavlend podle $ 2079 a ndsl. zdkona i. 89/201 2 Sb., obianslqt zdkonfk, (ddle jen,, obianslcy zdkonik" ) 1. Smluvni strany Kupuiici: VETERINANNi A FARMACEUTICKA UNIVERZITA BRNO Zastoupena: Prof. MVDr.Ing. Pavlem Suchfm, CSc. rektorem Ve vdcech smluvnich opr6vndn zastupovat: prof. MVDr, Jiii Smola, CSc., ieditel CEITEC - Stiedoevropsky technolo gickj, institut, VFU Brno. Sidlo: Palack6ho ti.i13. Brno. PSC: t1o: azt 57 r24 DIC CZ Z6s cek ve vdcech technick,meno a prllment ovm zarazenl Ing. Gabriela Boiilov6, Ph.D. Adresa pro dorudov6ni korespondence: Veterin6mi a farmaceutick6 univerzita Brno, Palack6ho ti. ll3,612 42Brco (d6le jen,,kupujici") stav hygieny a technologie masa, FVHE VFU Brno t a Proddvaiici; Obchodni firma: Life Technologies Czech Republic s.r.o. Se sidlem: V Celnici , Praha 1 zastoupena: Mgr. Filip DrZik, obchodni zitslupce povdien plnou moci ICO: DIC: C Bankovni spojeni: Unicredit Bank Czech Republic a.s, Na Piikopd , Praha 1, d. r;;fiu: Zilstun ce oro d 6vai i ciho oor6vndniz z astup ovat ve vd cech techni ckf ch : lmeno a prrlment Dracovnt zarazenl telefon Mgr. Filip DrLik Obchodni z6stupce fi lip. drzik@thermofi sher. com

2 EVROPSKA UNIE EVROPSKY FOND PRO REGIONALNI ROZVOJ INVESTICE DO VASI BUDOUCNOSTI MINISTERSTVO SKOLSTVi, MLADEZE A TELoVVcHoVY Telefonick6 a ov6 spojeni: , Fax: , czor ch. com Adresa pro dorudov6ni korespondence: Life Technologies Czech Republic s.r.o., V Celnici l03l/ Praha 1 (d6le j en,,prod6v ajici") 1 Piedmdt a riiel smloury 2.2. z.j. ^t 2.4. Kupni smlouvou se prod6vajici zavazuje, Ze kupujicimu dodd zboli, kter6 je piedmdtem koupd aumolni mu k ndmu nabyfr. vlastnick6 pr6vo a kupujici se zavazuje, /,e zboli pievezme a zaplati prod6vajicimu kupni cenu. Vlastnick6 pr6vo ke zboli piech zi na kupujiciho okamzikem podpisu pied6vaciho protokolu obdma stranami smlouvy. Timto okamzikem piechhzi na kupujiciho rovndz nebezpedi Skody na zboli. Pokud prod6vajici odesil6 zbozi nebo jej dodhvd prostiednictvim dopravce, piechhzi nebezpedi Skody na zboli okamzikem pievzeli kupujicim. Prod6vajici se v souladu s $ 2087 (obdansky z6konik) zavazuje, /,e umolni kupujicimu nablit vlastnick6 pr6vo ke zbozijeho pievzetim v mistd plndni kupujicim v souladu s touto smlouvou. ZboLim (piedmdtem plndni) se pro ridely t6to Smlouvy rozumi dod6vka AFLP analyz6ru. Podrobn6 technickd specifikace zaiizeni je uvedena v dokumentu,,technickd specifikace6', ktery tvoii jako nediln6 soud6st piilohu d. 1, t6to Smlouvy. ZboLi bude prod6vajicim kupujicimu dod6no jako celek Soud6sti dod6vkv zbozi je tak6: dod6vka a doprava zboli do mista plndni dle dl Smlouvy; odborn6 instalace zboli a jeho uvedeni do plnd funkdniho a provozuschopn6ho stavu zaskoleni obsluhy (urden6ho pracovnika/pracovnikri) a jeho/jejich n6ielit6 seznttmeni s irdrzbou zboli, aplikadni Skoleni obsluhy v mistd instalace provedeni v5ech piedepsanych zkousek, revizi, seiizeni, vystaveni nutnych protokolt, atestri piipadne jinj'ch pr6vnich nebo technickych dokladri, kter,jzmi bude prok6z6no dosazeni piedepsan6 kvality a piedepsanych technickych parametru piedmdtu plndni; pied6ni technick6 dokumentace s piesnyrn popisem piedmdtu plndni v desk6m jazyce, dokumentace bude z6stupci kupujiciho pied6na nejpozddji pii pied6ni piedmdtu plndni 2.6. Udelem t6to Smlouvy je zakoupeni AFLP analyzlru v r6mci realizace veiejn6 zaklzky,,ceitec - AFLP analyzer" v r6mci nize uveden6ho projektu OP VaVpI ie5en6ho na VFU Brno: Registr aini ifs lo pr oj ektu : Ndzev projektu: cz,l.05 I L 1.00/ CEITEC - Stiedo evropsky technolo gickli institut

3 ' ilji J.'+TYs"s"i 3"'3#' EVROPSKA UNIE EVROPSKY FOND PRO REGIONALNI ROZVOJ INVESTICE DO VASI BUDOUCNOSTI 2.7. Prod6vajici prohlasuj e, Le dodhvane zboli je nov6, nem6 i'6dn6 vady faktick6 ani pr6vni, l-revarrlou nu tr6- zilstavy ani i.6dn6jin6 pr6va tietich osob Prod6vajici prohlasuj e, Le je opr6vndny kpiijeti vsectr zlvazktt vypljvajicich ztelo smlouvy. 3. Misto a lhrity Pln6ni 3.1. Prod6vajici se zayazuje dodat kupujicimu zboliuveden6 v El' 2'4 t6to smlouvy do mista plndni, tj. do mista dod6ni zioli d\e dl. 3.2.t6to smlouvy jako celek' 3,2. Smluvni strany se dohodly, Ze mistem plndni je budova d' 13 - Ustav hygieny a technologie masa FVHE, nachlzejici se v are6lu veterin6rni a farmaceutick6 univerzity Brno, Palackeho ti.i13,brno ' 3.3. Prod6vajici se zavazule dodat kupujicimu zboli uveden6 v teto Smlouvy do mista plndni, tj, do mista dod6ni zboli dle il.3.2. t6to Smlouvy jako celek, a to v co nejkratsim mozn6m terminu, nejpozdiji vsak do 30 dnri od podpisu t6to Smlouvy. 4, Kupni cena 4.1. Kupni cena (celkov6 cena za cely piedmdt plndni.a celou dobu plndni t6to Smlouvy) t. ti"dtt6u6 jako cena nejvy5e piipustn6, a to ve vy5i: 4.1.r ,00 C7'K (slovy: tiimilionydvdst6sedmdes6tdevdttisicsestsetledesftdvd CZK) bez DPH a 4.r, ,02 CZK (slovy: tiimilionydevdtsetsedesftosmtisictiistadevadesdtjednakoruna CZK\ vietnd DPH a dva hal6ie 4,L3. DPH: ,02 CZK (21% DPH) V takto stanoven6 kupni cend jsou zahmuty vesker6 n6klady prod6vajiciho souvisejici s dod6nim zboli (napr, vj,rotni a poirznvaci n6klady, DPH' pro5koleni obsluhy kupujiciho, n6klady na dopravu do mista plndni, n6klady na instalaci v mistd pindni' clo, apod.). Pokud z6kon d Sb., o dani zpirdan' hodnoty, ve zndni pozddj5ich piedpisfr (d6le t L,,z6kon plndni Prod6vajiciho zm6ndn, bude dafi zpiidan6 hodnoty v Procentni k datu uskutedndni zdanitelneho pln s inflaci, zmdnou hodnoty kurzu des faktory s vlivem na mdnovy kutz a stabilitu mdny' 4.2. podrobny rozpis kupnf ceny, ktery zahmuje piehled v5ech soud6sti i piislu5enstvi piedmetu plndni, je uveden v piiloie d. 2.smlouvy ve formd polozkov6ho rozpoitu vychtnejiiiho z podrobne technicke specifrkace a dal5ich ujednani t6to Smlouvy. J

4 t EVROPSKA UNIE EVROPSKV FOND PRO REGIONALNI ROZVOJ INVESTICE DO VAS{ BUDOUCNOSTI MINISTEFSTVO SKOLSTVI MLADEZE A TELOVYCHOVY 5. Platebnf podminky 5.1. Zaplaceni kupni ceny bude provedeno bezhotovostni formou po pievzeti zbozi uveden6ho uil, Z.q t6to smlouvy na zhklade, prod6vajicim vystaven6ho dadov6ho dokladu (faktury), a to na bankovni ridet uvedeny na tomto daflov6m dokladu (faktuie). Kupujici neposkl'tuj e z lohy' 5.2. Daiovf doklad (fakturu) dorudi prod6vajici kupujicimu ve dvou vytiscich neprodlend, neipozb6li vsak do 3 dnri po pied6ni a pievzeti piedmdtu koupd. Kupujici zaplati kupni..trn dle dariov6ho dokladu (faktury) do 30 dnfi ode dne jeho prokazateln6ho obdrzeni Dariovy doklad (faktura) musi obsahovat n lelrtosti stanoven6 z6konem (,' Sb., o dani zpiidane hodnoty, ve zndni pozddj5ich piedpisri a zhkonem (, I Sb., o irdetnictvi, ve zndni pozddj5ich piedpisri. Prod6vajici je d6le povinen na tomto dariov6m dokladu (faktuie) uv6st k piedmdtu platby n6sledujici irdaje: nhzev a sidlo opr6vndn6 a povinn6 osoby, to jest Kupujiciho a Prod6vajiciho, Ie a DIC Kupujiciho a Prod6vajiciho dislo smlouvy, dislo platebniho dokladu (faktury), den odesl6ni, den splatnosti a datum skutedn6ho zdaniteln6ho pln6ni, oznadeni pendzniho ristavu a dislo itdtu, na kterf m6 kupujici platit, nhzev projektu,,ceitec - Stiedoevropsky technologicky institut, reg. iislo cz.r.05 I r.1.00/ , fakturovanou dfstku bez dand, sazbu dand, dari a celkovou d6stku vdetnd dand z piidane hodnoty, ozna( eni piedmdtu Plndni, razitko a podpis opr6vndn6 osoby prod6vajiciho. Soud6sti daiov6ho dokladu (faktury) bude originfl dodaciho listu podepsany pii pievzeti zboliz6stupcem kupujiciho opr6vndnjnn zastupovat ve v6cech technickych Kupujici je opr6vndn pied uplynutim lhrity splatnosti vr6tit daiovy doklad (fakturu), kteif -neobsahuj e pozadovan6 n6lezitosti, neni dolozen pozadovanyrni nebo irplnjmi doklady, nebo obsahuje nespr6vn6 cenov6 ridaje' 5.5. Ve vr6cen6m daf,ovem dokladu (faktuie) musi kupujici vyznadit drivod vr6ceni daiov6ho dokladu (faktury). Prod6vajici je povinen vystavit novy daf,ovy doklad (fakturu) s tim, Ze opr6vndnym vr6cenim daiov6ho dokladu (faktury) piest6v6 bdlei puvodni lhfita splatnosti daiov6ho dokladu (faktury) a bei:i nov6 lhfita stanoven6 v dl. 5,2, t6to Smlouvy ode dne prokazateln6ho dorudeni opraven6ho a v5emi n6lezitostmi opatien6ho daflov6ho dokladu (faktury) kupujicimu. 4

5 EVROPSKA UNIE EVROPSKV FOND PRO REGIONALNI ROZVOJ INVESTICE DO VAS{ BUDOUCNO5TI MINISTEFSTV,O SKOLSTVI, MLADEZE A TELOVYCHOVY 6. Dodacf podminky a piedrini aplevzetizboli , Prod6vajici je povinen: dodat kupujicimu zboli dle dl. 2,4. t6to Smlouvy nov6, nepouzit6, plnd funkdni; zajistit, aby dodanl zboli vdetnd jeho baleni, konzervace a ochrany pro piepravu splioval o p oladavky pii slu5n j'ch pl atnj'ch i SN. Prod6vajici se zavazuje dodat ke zboli kupujicimu jako nedilnou soud6st dod6vky zboli zejmdna dokumentaci ve smyslu $ 9 odst. I a $ 10 zdkona d Sb., o ochrand spotiebitele, ve zndni pozddjsich pr6vnich piedpisfi. ZboLi pied6 prod6vajici kupujicimu nejpozddji v posledni den lhrity plndni stanoven6 v dl, 3.3. t6to Smlouvy v mistd plndni, kter6 je sjedn6no v il t6to Smlouvy. Prod6vajici je opr6vndn dodat zbolije5td pied sjednanou thritou plndni. Nejpozddji 1 pracovni den piedem oznhmi prod6vajici zdstupci kupujiciho opr6vndn6mu zastupovat ve vdcech technickjzch telefonicky a em datum a hodinu, kdy zboli pied6. Za okamzik ozntrmeni se povazuje den dorudeni t6to ovd zprhvy adresdtovi. ZboZi bude proddvajicim kupujicimu pied6no jako celek, a to vdetnd dokladfi a dokumentfi ve smyslu il.6.2, t6to Smlouvy. Dod6vkazboLi bude provedena v souladu s il t6to Smlouvy. Kupujici neni povinen pievzit d6stedn6 plndni nebo zbozi, ke kter6mu prod6vajici nedod6 piislu5n6 doklady a dokumenty ve smyslu il t6to Smlouvy. Pii pied6ni zboli btde za irdasti obou smluvnich stran provedena v mistd plndni jeho prohlidka, jejiz soud6sti bude zejmlna kontrola uplnosti a stavu v5ech polozek zboli uvedenych v dl t6to Smlouvy. Prohlidku zboli za kupujiciho provede z6stupce kupujiciho opr6vndnjz zastupovat ve vdcech technickych. Po proveden6 prohlidce: Kupujici zboli pievezme, nevykazuje-li zboli Lhdn6 vady. Za kupujiciho pievezme zboli z6stupce kupujiciho opr6vndny zastupovat ve vdcech technickych, ktery pii pievzeti zboli doplni na v5echny vytisky dodaciho listu piedlozen6 prod6vajicim datum, piipoji svfij podpis a ponech6 si jeden vjrtisk dodaciho listu. Prodixajici je povinen piedat kupujicimu doklady, jez jsou nutn6 ku1ivhni zboli Kupujici neni povinen pievzit doddvku, kterd vykazuje vady a nedodilky, byt' by samy o sob6 ani ve spojeni s jinymi nebrinily i6dn6mu ulivhni dodfvky. NevyuZije-li kupujici sv6ho pr6va nepievzit dod6vku vykazujici vyse uveden6 vady a nedoddlky, bude seps6n protokol, vndmz bude uveden soupis tdchto vad a nedoddlkri vdetnd zpirsobu a terminu jejich odstrandni Kupujici m6 prdvo zboli nepievzit, pokud zboli nebude dod6no v pozadovan6m mnozstvi, jakosti, druhu a provedeni, jez urduje tato Smlouva, nebo prod6vajici nepied6 kupujicimu doklady a dokumenty ve smyslu dl. 6,2, t6to Smlouvy. O odmitnuti bude seps6n obdma stranami protokol o odmitnuti, v ndmz bude uveden soupis tdchto vad vdetnd zprisobu a terminu jejich odstrandni. Pied6nim zboli prod6vajicim kupujicimu se rozumi vylozeni zboli prod6vajicim v mistd plndni dle dl. 3.2, t6to Smlouvy z dopravniho prostiedku a pievzeti tohoto zboli kupujicim. Pied6nim zboli ve vratnych obalech (napi. palety) se rozumi slozeni zboli ve vratnych obalech prod6vajicim v mistd plndni z dopravniho prostiedku na

6 L I EVROPSKA UNIE EVROPSKV FOND PRO REGIONALNI ROZVOJ INVESTICE DO VASI BUDOUCNO5TI MINISTERSTVO SKOLSTVI, MLADEZE A TELOVYCHOVY misto urden6 z6stupcem kupujiciho opr6vndnjrm zastupovat ve vdcech technickych a pi ev zeti tohoto zb oli kupuj i cim Je-lt zboli piev6zeno a dod6v6no ve vratnych obalech, nest6vaji se obaly majetkem kupujiciho. Kupujici neni povinen zaslat, nebo dopravit obaly na sv6 n6klady zpdt k prod6vajicimu. Zhstupce kupujiciho opr6vndny zastupovat ve vdcech technickych sepi5e v tomto piipadd s prod6vajicim ve dvou vyhotovenich z6pis o ulozeni obalfi (d-6le jen,,zhpis"). Zdpis bude obsahovat adresu prodavajiciho, datum ulozeni obahi, druh, -mno Lstvi a hodnotu obalfi v CZK a smluveny termin ukondeni doby ulozeni obalti. Ztryis bude podeps6n z6stupcem kupujiciho opr6vndnym zastupovat ve vdcech technickj'ih a prod6vajicim. Smluvni strany se dohodly na tom, Ze kupujici neni povinen ulozen6 obaly vydat prod6vajicimu pied uplynutim smluven6 doby jejich ulozeni. Pii pievzeti obalfi zuloleni piedlozi prod6vajici kupujicimu svrij vftisk z6pisu a kupujici doplni oba vytisky shodnd o tyto irdaje: datum vraceni obalfi kupujicim prod6vajicimu, typ voz\dla a jeho st6tni pozn vaci znadku, ditelnd jm6na a piijmeni z6stupce kupujiciho opr6vndn6ho zastupovat ve vdcech technickych a prod6vajiciho, kteii pot6 oba vjtisky z6pisu podepisi. Po doplndni a podpisu z6pisu si jeden jeho vj.tisk ponech6 z6stupce kupujiciho opr6vndny zastupovat ve vdcech technickych a druhy vjtisk proddvajici Prodfvajici je povinen dodrzet pit realizaci plndni podle tdto Smlouvy n6sledujici technick6 podminky: 6.9J. Technici a technick6 ritvary prod6vajiciho, kteii se budou podilet na plndni piedmdtu t6to Smlouvy, budou na takove technick6 itrovni, aby bylo zabezpe(eno bezprobl6mov6 plndni zak6zky, vdetnd zaji5tdni BOZP Prod6vajici zabezpedi relevantni technick6 vybaveni a opatieni k zajistdni praci nutnych k realizaci plndni teto Smlouvy Piedmdt plndni t6to Smlouvy bude realtzovdnv souladu s platnfmi zdkony Cn a isttt a dle obecnd zhvaznych a doporudenych piedpisri, vlfdnich naiizeni, metodik a v souladu se zadf1aci dokumentaci veiejnd zaklzky,,ceitec - AFLP analyzer" vyhl65en6 kupujicim jako zadavatelem t6to veiejne zak zky. Materi6ly, polotovary, dily a zaiizeni, kter6 budou prod6vajicim pouzity, musi souhlasit jak s technickou specifikaci, tak s technicklmi normami, a musi mit piislu5n6 certifik6ty o vlastnostech a jakosti. Piipou5ti se pouze prvni jakost materi6lrir' 7. Odpovddnost za vady zboli azhruka za jakost 7.L Zfirudni doba na zbohi se sjedn6v6 na dobu 24 m6sicti a bdli od pievzeti zboli kupujicim. V piipadd, Le m6 bjt vdc uvedena do provozu prod6vajicim nebo jinou o.obon, bdli zfirudni doba al ode dne uvedeni do provozu. Pokud je v technick6 ii qirobni dokumentaci vyrobce, piip. vjin6m prohl65eni souvisejicim se zbolim, stanovena: 7.1,1, krat5i zfirudni doba, plati ustanoveni o zhruce dle piedchozi vdty tohoto dl6nku Smlouvy; ustanoveni o zlruce dle technick6 di vyrobni delsi zdrvdni doba, Plati dokumentaci vyrobce. 6

7 ''^)li Tyfi'f3-t3#i' EVROPsKA UNIE EVROPSKY FOND PRO REGIONALNf ROZVOJ INVESTICE DO VASI BUDOUCNOSTI Pro Inovace 7 '2. Kupujici uplatni pr6vo z odpovddnosti proddvajiciho za vady zbo4i a ze zarvky za jakost zbozi pisemnyn ohl65enim na ov6 adrese prod6vajiciho nebo na adrese prodhvajiciho pro dorudov6ni uveden6 v il. 1. teto Smlouuy 1Aat" t6l,,ohlt$eni kupujiciho"). Toto ohl65eni kupujiciho bude obsahovat zejmena oznadeni zboli a popis vady Vpiipadd vadn6ho plndni je kupujici povinen sddlit prod6vajicimu, jak6 pr6vo si zvolil dle il Na oh165eni vad zbolije prod6vajici povinen odpovdddt do dvou dnri ode dne dorudeni tohoto ohl6seni a v piipadd potieby (kter6 bude vyslovn6 uvedena v ohld5enf) je prod6vajici povinen zajistit, aby se dostavil do sidla zadavatele servisni technik, a to nejpozddji do 2 pracovnfch dnf ode dne dorudeni ohl65eni V piipadd vadn6ho plndni m6 kupujici pr6vo: a) na odstrandni vady doddnim nov6 vdci bez vady nebo dod6nim chybdjici vdci, b) na odstrandni vady opravou v6ci, c) na piimdienou slevu z kupni ceny, nebo d) odstoupit od smlouvy. 7,5. Prod6vajici je povinen odstranit vady zboli nebo vady, na kter6 se vztahuje z1ruka za jakost zbozi nejpozddji do 30 dnri ode dne ohl6seni kupujiciho dle il t6to Smlouvv. 7 '6' Doba od uplatndni prdva z odpovddnosti prodav ajiciho za vady zbozi a ze zhruky za jakost zboli, se az do vle5eni situace vznikle porusenim Smlouvy do z6rudni doby nepodit6, 7 '7 ' Do doby odstrandni vady neni povinen kupujici platit d6st kupni ceny, kter6 piim6iend odpovid6 jeho pr6vu na sler,u z kupni ceny Vpiipadd, ie prodhvajici neodstrani vady ve lhttd stanoven6 vil. 7.5., m6 pr6vo kupujici odstranit vady na n6klady prod6vajiciho Kupujici m6 pr6vo na rihradu nutnych n6kladri, kter6 mu vznikly vsouvislosti s uplatndnim pr6v z odpovddnosti prod6vajiciho za vady zbozi a ze ziruky za jakost zbozi' Kupujici uplatni svfij n6rok na irhradu tdchto n6kladri pisemnou vyzvou na adresu prod6vajiciho pro dorudov6ni. Prod6vajici je povin.tr ptorr6rt irhradu do 21 dnrh od dorudeni teto vyzvy. 7"10' Prod6vajici se touto smlouvou zavazuje kposkytovhnibezplatneho 26ru(niho servisu po dobu twttni zitrudni doby, a to nejm6nd 2x rodnd. Prodrivajici je povinen v prubdhu zfrudni doby rovndz prov6ddtbezplatnd vesker6 servisni rikony, iiircnz provedenim podmifiuj e platnost zdruky, 7 'IL Po uplynuti zfirudni doby se prod6vajici zavazuje k poskytov 6ni pozdrudniho servisu kupujicimu' VySe ceny poztrudniho selisu bude odpovidat cend v mistd a dase obvykl6. Ve stanoven6 cend pr6ce servisniho technika budou zahmuty n6klady s ni souvisejici, a to konkr6tnd piijezd a doprava servisniho technika do mista plndni.

8 I EVROPSKA UNIE I t,)jij.'+ty3i"t3*'3.,,-"u(' EVROPSKY FOND PRO REGIONALNI ROZVOJ INVESTICE DO VASI BUDOUCNOSTI 8. Smluvni pokuty 8.1. Za nesplndni zhvazku zteto Smlouvy se sjedn6vaji n6sledujici smluvni pokuty: 8.1.1, za prodleni se splndnim povinnosti prod6vajiciho dodat zboli ve lhfitd stanovene v il t6to Smlouvy je prod6vajici povinen zaplatit kupujicimu za kaldy zapo(,aty den prodleni smluvni pokutu ve vysi 0,05oh z hodnoty d6stky kupni ceny uvedene v dl t6to Smlouvy; za prodleni s odstrandnim vad v terminu stanoven6m v il t6to Smlouvy je prod6vajici povinen zaplatrt kupujicimu za kaldy zapodaty den prodleni smluvni pokutu ve vy5i 0,0loh z hodnoty d6stky kupni ceny uveden6 v dl t6to Smlouvy Kupujici uplatni n6rok na smluvni pokutu a jeji vj'si pisemnou vyzvou u prod6vajiciho na jeho adrese pro dorudov6ni. Prodhvajici je povinen zaplatil uplatndnou smluvni pokutu do 10 dnri od dorudeni t6to vyzvy. 8.3, Kupujici m6 pr6vo poladovat smluvni pokutu bez zietele k tomu, zda mu porusenim povinnosti prod6vajiciho vznikla Skoda. V piipadd, Ze vyse Skody pievy5i smluvni pokutu, m6 kupujici pr6vo na n6hradu t6to Skody. I 9. ZhnikSmlouvy Smluvni strany se dohodly na tom, 2e tato Smlouva zantkh vedle piipadfi stanovenych zhkonem () Sb., obdanskj'z6konik tak6: 9.1. dohodou smluvnich stran spojenou se vz jemnym vyrovn6nim ridelnd vynalozenych n6kladri jednostrannjzm odstoupenim od Smlouvy ze strany kupujiciho pro jeji podstatn6 poruseni prodfvajicim, kterym se rozumi: prodleni prod6vajiciho s dod6nim jak6hokoliv kusu zboli, del5i nez 10 dnri, opakovan6 poruseni povinnosti prod6vajiciho vyplyvajici zttto smlouvy, piidemz opakovanym porusenim povinnosti se rozumi nejmend tieti poruseni povinnosti prod6vajiciho, na ktere byl proddvajici kupujicim pisemn6 upozom n sankce a n6hrady Skod)'s tim spojen6. Odstoupenim kupujiciho do dildiho pln6ni tato smlouvanezanik.

9 I MINISTEFSTVO SKOLSTVI, MLADEZE A TELovVcHovY EVROPSKA UNIE EVROPSKY FOND PRO REGIONALNI ROZVOJ INVESTICE DO VASI EUDOUCNOSTI 10. Vy55i moc 10.1, Za okolnosti vyludujici odpovddnost smluvnich stran zaprodleni s plndnim smluvnich z6vazki dle t6to Smlouvy (vy5si moc) jsou povalovhny takov6 piekhlky, ktere nastanou nez6visle na vtili povinn6 smluvni strany abrdniji ve splndni jeji povinnosti z teto Smlouvy, jestlize nelze rozumnd piedpoklildat, Le by povinn6 smluvni strana takovou piekdzku nebo jeji n6sledky odvr6tila nebo piekonala, a d6le, Le by v dobd vzniku smluvnich zivazki z tlto Smlouvy vznik nebo existenci tdchto piekllek piedpokl6dala. I0.2. Za piekhlky dle bodu t6to Smlouvy se vyslovnd povaluji Livelni pohromy, jak6koliv embarga, obdansk6 v6lky, povst6ni, v6ledn6 konflikty, teroristick6 ritoky, nepokoje nebo epidemie. Za Livelni pohromy se zejm6na povaluji polhr, irder blesku, povoderi nebo zhplava, vichiice nebo krupobiti, sesuv nebo ziiceni lavin, skal, zemin nebo kameni, Za okolnost vyludujici odpovddnost prod6vajiciho se vyslovnd nepovazuje jakjzkoliv probl6m prod6vajiciho s plndnim jeho subdodavateltr Nastanou-li okolnosti vyludujici odpovddnost jedn6 ze smluvnich stran, kter6 zprisobi di mohou zpfisobit podstatne zpolddni jak6hokoliv terminu podle t6to Smlouvy, di z6nik nebo zruseni ztwazki podle t6to Smlouvy, jsou smluvni strany povinny se neprodlend o tdchto okolnostech vyludujicich odpovddnost informovat a vstoupit do jedn6ni ohlednd ieseni vznikl6 situace. Prod6vajici ani kupujici nejsou oprdvndni takto vznikle situace jakkoliv zneulit ve svrij prospdch a jsou povinni v dobr6 viie usilovat o dosazeni piijateln6ho ieseni pro obd smluvni strany v co nejkrat5i dobd. V piipadd poruseni t6to povinnosti spolupracovat kteroukoliv smluvni stranou, je tato smluvni strana v prodleni s plndnim svych povirurosti dle t6to Smlouvy V piipadd, Ze nedojde k dohodd smluvnich stran, terminy plndni jednotlivych povinnosti podle t6to Smlouvy dotden6 okolnosti vyludujici odpovddnost se prodluzuji o dobu, po kterou okolnost vyludujici odpovddnost trvala Odpovddnost nevyluduje piekhlka, kterh vznikla teprve v dobd, kdy povinn6 strana byla v prodleni s plndnim sv6 povinnosti, di vznikla z jejichhospod6isklich pomdru. 10,6. Udinky okolnosti vyludujici odpovddnost jsou omezeny pouze na dobu, dokud trv6 piislu5n6 piek Lka, s niz jsou tyto ridinky spojeny. ll. Zvl[Stni ujednrini VSechny pr6vni vztahy, ktere vzniknou pii reahzaci z vazki vyplyvajicich z L6to Smlouvy, se iidi pr6vnim i6dem eesk6 republiky. ILz. Tuto Smlouvu lze mdnit pouze pisemnym, dislovanym, oboustrannd potvrzenym ujedn6nim, vyslovnd nazvanym dodatek ke Smlouvd podepsanym zhstupci obou smluvnich stran, Jin6 zdpisy, protokoly apod. se za zmdnu Smlouvy nepovazuji. V piipadd zmdny z6stupce kupujiciho nebo proddvajiciho opr6vndn6ho zastupovat ve vdcech technickych nebude vyhotoven dodatek ke Smlouv6; smluvni strana, u ktere ke zmdnd z6stupce doslo, je povinna tuto zmdnu oznlmtt druh6 smluvni strand. Udinnost zmlny nast6vd okamzikem dorudeni oznhmeni piislu5n6 smluvni strand.

10 T EVROPSKA UNIE EVROPSKY FOND PRO REGIONALNI ROZVOJ INVESTICE DO VASI BUDOUCNOSTI j MINISTEFSTVO SKOLSTVI, MLADEZE A TELOVVCHOVY Zhstupce kupujiciho opr6vndny zastupovat ve vdcech technickych mrize dinit pouze rikony, ke kterym ho opravriuje tato Smlouva. Ukony jim udindn6 nad takto vymezeny r6mec jsou neplatn6. rr.4. subdodavatel it Ridicimu ors6nu OP VaV OP piipadn6 subdodavatele prod6vajiciho. - Pravidla pro publicitu v r6mci OP VaVpI (dostupnou na na vsech prod6vajicimu Smluvni strany sjednaly, Ze dorudov6ni se prov6di na dorudovaci adresy uveden6 v il. 1. t6to Smlouyy, d to prostiednictvim osoby, kter6 prov6di piepravu z6silek (kurj'rni sluzba), nebo prostiednictvim drzitele postovni licence podle zvla5tniho pr6vniho piepisu, doporudend s dodejkou, nebo osobnd proti potvrzeni o pievzeti. V piipadd, Ze smluvni strana odmitne dorudovanou z6silku pievzit, plati den odmitnuti pievzeti za den dorudeni. V piipad6, Ze smluvni strana nevyzvedne z6silku v irlozni dobd u drlitele po5tovni licence, m6 se zato, Le zhsllka byla dorudena tietim dnem od ulozeni a to, i kdyz se smluvni strana o ulozeni nedozvdddla. Ujedn6ni tohoto dl6nku se nevztahuji na dorudov6ni sjednan6 v dl, 6.4. a7.2, t5to Smlouvy V piipadd z nrku prod6vajiciho je tento povinen ihned sd6lit kupujicimu tuto skutednost event. sddlit sv6ho pr6vniho n6stupce. V piipadd zmeny sidla, mista podnik6ni, nebo dorudovaci adresy prod6vajiciho je prod6vajici povinen neprodlend tuto skutednost ozn6mit kupujicimu. Pokud prod6vajici tuto povinnost nesplni, plati pro dorudov6ni pisemnosti adresa uvedend v il. 1. t6to Smlouvy Prod6vajici souhlasi se zveiejndnim obsahu t6to Smlouvy, kromd ustanoveni, kterd obsahuji obchodni taj emstvi V piipadd, Ze nastane rozpor mezi touto Smlouvou a jejimi piilohami, budou piednostnd aplikov6na ustanoveni t6to Smlouvy Smluvni strany vyluduji moznost odkazu na v5eobecn6 obchodni podminky kter6koli smluvni strany. 1L12. Prod6vajici prohla5uje, Ze touto Smlouvou btde vhz6n i v piipadd, Le po uzavieni Smlouvy dojde k podstatn6 zmdnd okolnosti, zptrsobujici jeho znevyhodndni pii plndni 10

11 EVROPSKA UNIE EVROPSKY FOND PRO REGIONALNI ROZVOJ INVE5TICE DO VASI BUDOUCNOSTI MINISTERSTVO SKOLSTVI. IVLADEZE A TELoVVcHoVY smluvnich ujedn6ni, a piebir na sebe nebezpedi zmdny tdchto okolnosti dle zhkona d. 89/2012 Sb Tato Smlouva m6 11 odislovanjrch stran a piiloha (,. l,kterh tvoii nedilnou soud6st t6to Smlouvy, md 12 odislovanj'ch stran a piiloha (.2,kterh tvoii nedilnou souddst t6to Smlouvy, m6 3 odislovan6 strany. 11.I4. Tato Smlouva nabyv6 platnosti a ridinnosti dnem jejiho podpisu obdma smluvnimi stranami. 11,15. Smlouva je vyhotovena ve dtlech vytiscich, z nichl obdrzi tii vytisky kupujici a jeden vjtisk prod6vajici Na dfikaz souhlasu se zndnim ce16 t6to Smlouvy piipojuji obd smluvni strany sv6 podpisy. K t6to Smlouvd jsou piipoj eny 2 piilohy, kter6 tvoii jeji nedilnou soud6st: Piiloha d. 1 -,,Technick6 specifikace" Piiloha (,. 2 -,,PoloZkovy rozpodet" V Bmd, dne:!,lt. illf v..., dne A1-8 o-a4f- Zakupujiciho Zaproddvajiciho Brno zast. ieditelem VDr. Jiiim Smolou, CSc., C VFU Bmo Life Technologies Czech Republlc s.r.o. V Celnicl 1031/4, Praha I Eo: , Dter C Tef.; ,,Fax:

12 MINI$TEFSTVo SKoLSTVI, MLADEZE A TELovYcHovY EVROPSKA UNIE EVROPsKY FOND PRO REGIONALNI ROZVOJ INVESTICE DO VASI BUDOUCNOSTI,,Technick6 specifikace6( Pf{loha i, 1 Kupni smlouvy i. 9770/00026 Poiet stran: l2

13 { Technickd specifikace nabizen6ho zaiizeni Geneticky analy zhtor Applied Bio systems 3500/3500D)U3 500x1 a) Obecnd charakteristika v tradici genetickych analyzfitoru ABI PRISM@ 310, ABI PRISM a ABI PRISM@ 3700, Applied Biosystems piedstavuje nejnovdj5i model v produktov6 linii piistrojri pro kapil6rni elektrofor6zu. Piistroj ABI 3500, ktery na5e firma uvedla na trh v roce Tento model se stal u n6s velmi oblibenjm typem genetick6ho analyzhtoru pro svou flexibilitu a atraktivni dizajnv mnoha ruznych laboratoiich vddeck6 i klinicke komunity. analyzy Geneticky analyziltor Applied Biosystems 3500/3500D)V3500x1 je syst6m pro analyzrt DNA na principu elektroforetick6ho rozddleni fragmentri DNA v tenkych kapil6r6ch naplndnych speci6lnim polymerem. Polyrner je do kapil6r napkiovdn automaticky a automaticky je do kapil6r nanesen vy5etiovany vzorek, Tim se vyraznd zjednodusuje obsluha a odpad6 nutnost n6rodn6ho nal6v6ni gelfi a nan63eni vzorkfi na gel, jako je tomu u systdmfi poulivajicich vertik6lni elektrofor6zu na polyakrylamidovych gelech. Syst6m 3500 je optimalizovhn pro mnoho aplikaci vdetnd srovn6vaciho sekvenov6ni a DNA fragmentov6 Analyzaprobih6 v 8 ( u modelu 3500) nebo 24 kapil6r6ch ( model 3500x1) soudasnd' Tim je d6na dostatein6 kapacita piistroje pro v6tbi soubory vzorkfi (v rezimu rychleho sekvenov6ni a, 96 vzorkfr dennd). Zhrovei piistroj lze vyulivat s vysokou efektivitou bez zvysov 6ni provoznich n6kladri, kter6 vznikh u syst6mfi s vyssim podtem kapil6r tim, Ze podet vzorkt neodpovid6 podtu kapildr a tim doch zi ke bez zbylednym ztrhthm polymeru, pufru apod. Tato modelov6 iada taky poskytuje variant 3500DX ktery je prvnim -CB tvp certifikovanj'm piistrojem na trhu v teto kategorii uidenym pro akreditovan6 diagnostick6 laboratoie. V piipadd postupn6ho n6rfistu pozadavkfi na vy35i kapacitu piistroje, lze prov6st upgrade piistroje 3500 na model 3500XL s24 kaplisramt. Tim lze dosfhnout tiin6sobn6ho zvy5eni kapacity piistroje bez nutnosti investice do novych piistrojt, UZivatelfim se nabizi moznost vybdru mezi podavadem pro 384 nebo 96 vzorkt, col' umoziuje ndkolikadenni automaticky provoz bez nutnosti prfibizn6 kontroly. V5echen spotiebni materi6l je vyrdbdn a dod6v6n jako ready-to-use materi I v podobd

14 samostojicich kontajnerfi pro vsechny chemik6lie, Tento typ spotiebniho materi6lu vyulivajici piistup,,plug-and-play" piedstavuje velice efektivni zpfisob pr6ce s chenik6liemi pii kter6m je moznost kontaminace omezena ra minimum. Chemik6lie a spotiebni materi6l vdetne kapil6ry jsou ulozeny v kontejnerech (kapilfira m6 tak6 vlastni r6medek) kterd vyrazne usnadiuji skladov6ni. Detekce sekvenovanych oblasti je zalolsna na hodnoceni fluorescence z fluorescendnd oznadenych primeru nebo dideoxynukleotidfr (termin6toru) pouzitych pro sekvenadni reakci. Pro fragmentadni a mutadni analyzu (SSCP, VNTR, polymorfismus mikrosatelittr apod.) lze pouzit zna(, eny ch primerri V obou piipadech pouliti citliveho CCD chipu umozf,uje soubdznd detekovat vicebarevnou fluorescenci z riznych fluorochromfi. Tak lze v jedn6 sekvenadni analyze stanovit soudasnd poiadi v5ech ilyrbazl Piistroj vtulivl inovovanymodel laseru a to solidstate laser ktery m6 v porovnani se starsimi modely Ion-argon laser znadne prodlouzenou Zivotnost, NabizenS verze piistroje je vybavena ovl6dacim softwatem, ktery umoziluje F1 l,.q jr.-i 'Ti: 5,' Ir6n t+ dat probih6 soudasnd pii speci6lnich programri. Tak a orezentaci ziskanfch dat. K hodnoceni z(skanrich dat se vyuiivs v'fkonn6ho softwaru, kteni je prrib6in6 vyvijen a zdokonalovdn a jehoz kvality byly prokdzdny na vfkonnrich automatickrich DNA sekvendtorech ABI iady 3L0 a 3L00, 3700 a Krom6 zdkladnfho softwaru pro sekvenadni i fragmentadnf analfzu jsou k dispozici dal5i softwarov6 produkty urden6 pro dalsi zpracovdni ziskanrich dat - sklsddni dlouh,ich sekvenci, porovndv5ni sekvencf mezi iadou vzork0, vyhleddv5ni piekrrivajicfch se oblasti apod, analyzovat najednou Sest typri fluorochromfi. Diky tomu v aplikacich fragmentadni analyzy lze v multiplexov6m uspoi6d6ni hodnotit vice markerfi. Pir analyze fragmentt lze soudasnd hodnotit celou iadu cilovych oblasti. Piid6nim znaien6ho velikostniho standartu lze dos6hnout nejenom piesn6ho stanoveni velikosti sledovanych fragmentfi, ale hodnoceni velikosti emitovan6ho zffteni umoziuie kvantifrkovat mnozstvi P CR produktfi. Rizeni celdho procesu i zpracovftni pouziti vykonn6ho poditade Dell pracujicim pod Windows 7 a lze maxim lnd vyulit kapacitu piistroje i poditade pii zpracovdni ilfil,h^i

15 Shrnuti unikdtnich vlastnosti nabizendho pffstroje 3500: o 8 kapiliir - dostatednd kapacita i efektivni provoz o moznost vrihodn6ho upgradu na model Applied Biosystems 35OOXL s 24 kapildrami o automatickli provoz bez nutnosti obsluhy po vice nei24 hodin o jednoduch6 nastavenia ovldddni piistroje o automatick6 pln6nipolymerem a aplikace vzork0 z 96- nebo 384-jamkov6 destidky o jednotnri typ separadniho polymeru ABI PRISM pro fragmentadni i sekvenadni analfzy o moznost detekce 6-ti fluorochrom0 v jedn6 reakci o moznost provdd6t r0zn6 aplikace v jedn6 s6rii vzork0 o ready-to-use chemikdlie a postiebni materidl o ve5kerd manipulace a vrimriena chemiksliiprobihd syst6mem,,plug-and-play" o jednoduch6 skladovdni dfky balenichemikdliiv zdsobnlich kontejnerech o Solid-state laser s prodlouienou Zivotnosti o Robustni softv6r umoinujici vysokou flexibilitu nabizen6ho piistroje o 5irok6 aplikadni a servisnifiremni podpora o zdkladni obsluzn6 zaikolenijako souddst instalace I

16 b) Provozni parametry pifstroje - kapacita a rychlost ana zy Provozni pordmetry pfistroje Applied Biosystems 3500 Typ protokolu PouZiti Podet anal. bdziv jednd analyze Rapid sequencing Cas na jednu analyzv : Sekvenov6ni kr6tkfch oblasti a detekce mutaci. oiesnost >98.5o/o minut pii 50'C kapil6ry 36 cm, POP 7 Podet anal vzorkri/den x24 analyz Podet anal. bazilden 192 analyz 500bhzi Podet anal. vzorkilbazihok 250 dni x 192 vzorkri : vzorkri :I92 : :24milionl8bazi Standard Sequencing Cas na 1 anali/zu* Long read sequencing Cas na 1 atalyzu* De novo sekvenov6ni, vyhled6v6ni heterozygotnich oblasti, piesnost >98,50, 2,5 hodiny pii 50'u kapildry 50 cm, POP 7 De novo sekvenov6ni, vytv6ieni sekvenadnich knihoven piesnost >98,5o/o, 3,5 hodiny pii 50'C kapilfirv 80 cm, POP x9 analyz 72 arralyz 700bhzi 250 dni x72 vzorktt : vzorkt -1a : :12,6 milionfi bazi x 6 analyz 48 analyz 950bhzi 250 dni x 48 vzorkfi : vzorkfi :48 : ,4 milionri bazi

17 I Frasmentadni nr anal{ Typ protokolu PouZiti D6lka anal. fragmentir DNA Sizing Urdov6ni velikosti DNA produktfr) s piesnosti Ib6ze (pro fragmenty <400bazi) bazi v denaturujicfn prostiedi do2000bazi v nativnim Podet anal vzorkfi/den 8 kapildr analyz Podet anal. genotypri/ den analyzals markerfi v jedn6 analyze : : Cas na 1 podle d6lky fragmentu analyzu* 20 minut - kapilara 22 crn 30minut-kapilfua33 cm Typ protokolu PouZiti D6lka anal. Podet anal SNPs vzorkri/den Mutation Detekce SNPs pomoci do 100 b6zi Validation/ kitu SNaPshot Screening Cas na 1 analyzu* I0-20 minut (podle d6lkv fragmentri) 8 kapil6ry x96 analyz Podet anal. genotypr3r/rok 250 dni analyz 18 markeni vjedn6 analyze Podet anal. Podet anal. SNPs/den SNPs/rok 768 analyz 768 analyz 10 SNPs v dni, 10 atnlvze SNPs v I analuze :768 :7680 : dasy pro jednu anallizu zahrnujii dobu potiebnou pro vlim6nu polymeru, napln6ni kapildry, "nasat(" nov6ho vzorku a stabilizaci polymeru pied elektrofor6zou. c) Soui6sti syst6mu Genetickri analyzdtor Applied Biosystems3500/3500x1 se skl6d6 z ndsledujicich komponent: o pilstrojprokapilsrnielektrofo16zu o iidicistanice pro ovlsddni piistroje a anallizu dat o software pro popis vzork0, iizeni piistroje a sb6r dat o analytickf software provdd6jicf: - Sequence Analysis Software s KB base callerem- pro urdovdn(baz( pii sekvenov6ni - GeneMapper Analysis Software - pro detekci a validaci velikosti fragment0 DNA - Variant Reporter software- pro detekci a analtzu mutaci, SNP validaci a validaci sekvenci - SeqScape software- urden pro detekci mutacia identifikaci alel Sestavy kapiliir Vnitin6 nepotazen6 kapildry o vnitin[m pr0m6ru 50pm jsou dod6v6ny v sestavdch po osmi kapilsrdch. Tyto sestavy jsou dostupn6 v r0znrich d6lk5ch, aby poskytovaly podporu pro mnoho typ0 aplikaci a d6l(cich technik. Kapildry jsou specifikovan6 pro minimslne 200 analriz a jsou navrzeny pro pouiitise standardnimi 96-a 384-jamkovfmi destidkami, Separadnimedium Genetickli analyzdtor Applied Biosystems 3500/3500x1 mfrze vyuzivat jako separadni medium un verzslnf polymer POP-7 (Performance Optimized Polymer). Pied kazdou anallizou jsou kapi15ry automaticky napln6ny novfm polymerem, kterf dynamicky potahuje st6ny kapilsr za ridelem eliminace elektroosmotick6ho toku, Reagencie Applied Biosystems poskytuje ndsledujicireagencie pro pouzitina syst6mu 3500 :

18 o Reagencie pro sekvenadni analrizu: - BigDye" Terminator Kit vers L.1 - BigDye" Terminator Kit vers dgtp BigDye'" Terminator Kit - BigDye" Primer Kit - pro sekvenovdniklonovanlich templ6t0. Reagencie pro fragmentovou anallizu: - Linkage Mapping Set 1D20, MD10 or HDs - panel znadenrich primer0 pro analrizu mikrosatelit0 v lidsk6m genomu v rozmezi 5-20 cm. - SnaPshot - kit pro anahi zu SNPs (Single nucleotide polymorphism) o Velikostnistandardyprofragmentatnfanalfzu - GeneScan'" 400 HD Size Standard - GeneScan" 500 Size Standard - GeneScan" 1000 Size Standard - GeneScan" Size Standard Specializovan6 a plikadni kity o Zemdddlstvi: AFLP Genotyping Kit (kit pro genotypizaci rostlin), Animals Parentage Testing Stockmark Kit (kit pro identifikaci a urdovdni paternit u skotu, koni, ps0). Wzkum nemoci: Cystic Fibrosis Mutation Detection Kit, HLA Typing Kits,,.. o ldentifikace osob: Microsatelite Polymorphisms Detection Kits o ldentifikace mikroorganizm0-16 S RNA Microbial Sequencing ldentification Kit (sekvenadni identifikace mikroorganism0), AFLP Genotyping Kits for Small Genome (kit na genotypizaci mikrobidlnich genom0),

19 I I J t d)software Genetickli analyzdtor Applied Biosystems 3500/35O0xl zahrnuje software pro ulozeni informaci o vzorcich, sb6r a analyzu dat. Soubory obsahujici vrisledky ze sekvenov6ni jednotlivyich vzorkir jsou vytvoteny ve standardnim formdtu ABIF, kteni podporovdn iadou vvrobc0 specializovanrich programfr pro analfzu sekvence DNA' Softwarov6 zpracovdniziskanych dat se d6je v n6kolikastupriov6m rezimu' Data Collection Software. iidichod piistroje a shromazd'uje zdkladnidata (,,raw data") z CCD detektoru. zajistuje komunikaci mezi poditadem a vnitinim iidicim programem piistroje. r,,sample sheet" uchovdvd informace o analyzovanlich vzorcich - n6zev, popis, pouzitri aplikadni postup, datum analyzy, dophiujicipozndmky aj' o,,injection list" - protokol vlastni anahizy. Uddv6 v jak6m poiadi se budou vzorky zpracovdvat, jak6 parametry budou nastaveny pro d6lku injektdze vzork0, teplotu a nap6tipii elektrof or6ze, dobu m6ieniapod' o v6tiina parametrfi je defaultov6 nastavena v tzv. modulech. Hodnoty lze ov5em modifikovat, jak pro jednotliv6 vzorky, tak pro celou s6rii m6ienlich vzorki' o pr0b6h cel6 analrizy se v5emi parametry je zachycen v tzv.,,log filu" pro pozdejsi kontrolu o novd verze tohoto softwaru umoziuje kontrolu pr0b6hu anahizy na tzv',,gel image" obraa) analyzovanlich oblasti ve form6 virtu6ln iho gelu o ziskans data jsou automaticky nebo manudln6 pieddna ke zpracovdni aplikadnimu softwaru AplikaEni software Zpracov5vd data ziskan5 prostiednictvim Data Collection Softwaru. Pracuje nezdvisle na chodu piistroje a m0ze byit spust6n i na vzddlenem poditadi-v chrdn6n6m licendnim reiimu' Sequencing Analysis Software: o zpracovdvd data sekvenadnich analliz o zaji5t'uje urdenijednotlivlich typ0 bdzi (tzv. basecalling) o pomoci matricov6ho algoritmu provddifiltraci piekrlivajicich se signsl0 v jednotlivrich spektrslnich kan6lech o pomoci,,mobility files" koriguje nerovnom6rnri pohyb jednotlivtch fragmentfr vyvolanf piipojenim molekuly fluorochromu o urduje sprdvn6 poiadia rozmist6nibitz(ve vlisledn6m grafick6m vfstupu (tzv spacing) o vyhled6vd automaticky zaddtek sekvenovan6 oblasti. umozfruje editovdni analyzovan6 sekvence o viisledkem je soubor s graficklim vlistupem (elektroferogram) ve formdtu ABIF o a soubor se sekvenciv textov6m (ASCI) nebo FASTA formstu pro dal5izpracov6ni a vyhleddvsni sekvenci ve veiejnfch datab6zich. GeneMapper software. zpracovdvd data pro fragmentadni anallizu o pomoci matricov6ho algoritmu prov6difiltraci piekrfvajiclch se sign6l0 v jednotlivfch spektrdlnich kandlech

20 ' s vfsledku m6ienf velikostniho standardu, kterri je piiddvdn ke kaid6mu vzorku, stanovi kalibradni kiivku a na jejim podklad6 stanovivelikosti viech analyzovanrich fragment; o stanovf velikost fragmentu v bdzfch s piesnosti t ]. bdze pro fragmenty do velikosti 35Opb o vypodit6 velikost signslu pro jednotliv6 fragmenty - jednak jako vfiku ziskan6ho piku, jednak integracijako plochu pfku. Tyto parametry lze pouilt pro kvantitativnistanoveni. o V\istupem programu je elektorforetogram zfskanrich dat a numerick6 hodnoty viech spoditanlich parametr0 v tabulkov6 podob6. Oba vfstupu jsou dynamicky provdz1ny, takze lze kliknutlm na jednotliv6 piky zvyraznit odpovidajicf iddky ve vfsledkov6 tabulce a obriicen6. o Tabulkov6 vlisledky lze exportovat ve form6tu,csv do jintch program0 Variant Seq software: o zpracovdvd data vytvoiend programem sequencing Analysis software. je urden piedev5im pro komparativnia de novo sekvenovdni. o provddi porovndvdni sekvencf z rlznych analyz v piim6 i komplementdrni podob6 o umozriuje assembling sekvencf - vytvdieni sekvendnich knihoven, vyhleddvdni piekryvnrich a vektorovlich oblasti, o umoi6uje pracovat jak se sekvencemi z analyz ziskaniich na piistrojich tak s ridaji o sekvencich importovanfmi v,,textov6 podob6" ze sekvenadnich datab6zijako je GenBank aj. o v piipad6 zpracovdnidat ze soubor0 analyzovanlich na piistrojfch ABI prism umoziuje okamzitli pfistup i k vfslednyim elektroferogramrim, coz urychluje a zjednodusuje dpravy a korekce dat ziskanyich napiiklad v r0znyich anallizdch. o pii zpracovdni dat z analliz provedenfch na piistrojich Applied Biosystems zohledriuje filtrovdnf dat na zdklad6 kvality ziskan6 sekvence. ' umoztiuje rych16 a automatick6 zpracovdnivelk6ho mnoistvivzork0 formou piipravenfch projektfr s pieddefinovanlimi parametry pro zpracovdnisekvenci a jejich vyhodnoceni, Do takto definovanrich projektri lze pouhri m kliknutim nahrdt analyzovan6 sekvence a spustit jejich zpracovdnf ' program vytviiiivlastnidatabdzi ve form6,,reference data groups" - soubory analyz, ziskanyich sekvenci, jejich variant apod. o pii analfze napi. SNPs analyzuje typy sekvendnich variant dan6ho lokusu, jejich detnost. o pii mutadnim sekvenovdnf porovndvd nalezen6 sekvence s ridaji v referendnidatab6zi o umoztiuje automatick6 tvorbu souhrnnfch vrisledk0 zpracovdnisekvenadnich dat ve form6 reportt - informace o vzorcfch, o pr0b6hu analyzy, o nalezenrich sekvenadnich variantdch, o moznfch variantdch v sekvenci aminokyselin k6dovan6ho proteinu.

21 / e) Moinost integrace piistroje Applied Biosystems 3500 do automatizovan'ich I laboratornich syst6mfr. Pii prdci s pilstrojem Applied Biosystems 3500/3500x1 se pouzivd pro ukliiddni analyzovanlich vzork0 do autosampleru standardnich typ0 mikrotitradnich destidek v kapacit6 pro 96 vzork0 (form6t 8*12) nebo destidek s kapacitou 384 vzork0. V6t5ina automaticklich syst6m0 pro isolaci DNA, pipetovdni a piipravu vzorkri (napi. laboratorni roboty firmy Gilson, Tecan, aj.) je schopna standardn6 pracovat s t6mito typy destidek. Podobn6 i termocyklery v6tiiny renomovanyich firem umozriuji pracovat s t6mito typy spotiebnfho materidlu pfi amplifikaci vzork0. Vzhledem k tomu, lze piistroje Applied Biosystems 35000/3500x1 zadlenit do sestavy s automatick,i mi syst6my pro piipravu vzork0. PiistrojApplied Biosystems 3500/3500x1 lze tak6 zapojit do ndkterrich laboratornich a informadnich syst6m0 (LIMS), coi umoifiuje propojit v'isledky ze sekvenadni anal'izy s dalsimi ridaji, kte16 se vztahuji k analyzovan6mu vzorku. f) Ziikladni technick6 parametry piistroje Applied Biosystems 3500/3500x1 Laser Napdti pii elektrofor6ze Do 20 kv Solid-state single line, single mode laser s primdrniexcitaci pii 505 nm. Provozni teplota 18'C az 65oC Konfigurace poditade Dell - Optiplex XE Minitower 3 GHz (nebo vy55i) Operadni System: Windows 7 v anglickl verzi Instalovand RAM: 4 GB Kapacita pevn6ho disku: dvojity minim6lne 500 GB hard disk Monitor: 17" barevnilcd monitor Provozni prostiedi Teplota: 15"C - 35"C Vlhkost: 20% - 80% (nekondenzujici) PoZadavky na elektrick6 zapojeni Napdti V nebo Y +l- I0oA, HZ +l- I0 % Proud; do 1-5 amps Maximdlni pilkon: 2000 watts Rozmdry Servis a ziruka Podpora Sifka 1se zavienymi dviiky): 61 cm Sifka 1s otevienymi dviiky): 122 cm (lev6 i pravhdviika se oteviraji soudasnd) Hloubka: 61 om Vjr5ka: 72 cm V6ha: PiibliZnd 82 kg Zhrukajeden rok na dily a prhci. Plus jeden rok prodlouzen6 z6t'gka. Celosvdtovd aplikadni podpora a servis je nabizen odbornri mi technickri mi specialisty a v6dci. Objednaci infotmace Geneticky analyzhtor Applied Biosystems 3500 : kat.d. qqosa:a

22 V objedn6vce je zahmuto: UZiv atel sk y manvdl G en eti cky analy zhtor Appli e d B i o s yst em s 3500 sequencing Analysis Software@ nebo GeneMapper@ Software - dle vfb6ru Quick Start Guide pro sekvenadni nebo fragmentovou analyzu Metodickf pruvodce pro sekvenadni nebo fragmentadni analyzuna Applied Biosystems Applied Biosystems Sequencing Analysis a GeneMapper@ Analysis Software Manual ZLruka jeden rok napritci a dily

23 h) Poiadavky na instalaci piistroje Applied Biosystems 3500 piistrojappried Biosystems 3500 nevyz.au;" pro svr3rj provoz z6dn6 specifick6 prostiedi. Je schopen pracovat v prostiedi s rozsahem t"piot od 15 do 30 e C' s nekondenzujici vlhkosti 20-8OYo, Rozm6ry piistroje jsou 5/h/v: 61-cm/61cm f7zcm' :TlrT';:ilii;"rt s pod(taiem cca 82 kg a mtze brit umist6n na standardni raboratorni st0l s kovovou konstrukci siln6jsipr..ouiideskou s hloubkou cca 80 cm' aby byl zaruden dostateinri odvod tepl6ho vzduchu z v6traciho otvoru -Piistrojnesm(britpostavennamist6kampiimodopadSs une6niz6ieni,aby nedochdzelo k ztr6t6 signslu ve vzorcich Elektrickezapojeni., t-^try^^! ^y;ol -Piistrojpracujeponap6tim22ov,50Hz'Prirm6rn6proudov6zat(ienipiistroje v pracovnim rezimu je 11A' - Vzhledem k tomu, ze pii spoust6ni piistroje dochdzi velk6mu proudov6mu zatizenije nutn6, aby elektrickri piivod by ji5t6n jistidem o hodnot6 25A' -Prozapojenipiivodnihokabe upiistrojejenutn6zakondenie ektrick6hopi(vodu zssuvkou typu NEMA L6-30R, kterou Vdm nase firma dod6 a piipadn6 i zapoji. -ZSsuvkapropiipojeniksitibynem6 abvtd6leneil.,3modmista,kambudepifstroj postaven. Nelze pouiivat prodluzovani kabely' Ventilace - Piistroj v cinnosti je zdrojem pom6rn6 velk6ho tepeln6ho vykonu (6300 Btu/ hod tj' cca 2oow).Nenipotiebn6piipojitpiistrojkexternimuodtahov6muzaiizeni. - Pro sprsvnt provoz piistroje a presnost nam6ienlich dat je vhodn6, aby teplota v mistnosti s piistrojem nekolisala v pr0b6hu dne o vice nez 2"c'ztoho dfrvodu je doporudeno v mfstnostech vystaventch v6t5im teplotnim vri kyv0m' instalovat vhodnou klimatizaci' -PriprovozupiistrojenevznikajiIdtkySkodIiv6lidsk6muzdravinebopo5kozujiciZivotni prostied i. Napojeni na vodu nebo PlYn -UpiistrojeAppliedBiosystems3500neninapojeninavoduani aboratornip yny pozadovdno

24 MINISTEFSTVO SKOLSTVI, MLADEZE A relovychovy EVROPSKA UNIE EVROPSKY FOND PRO REGIONALNI ROZVOJ INVESTICE DO VASI BUDOUCNOSTI OP Vfzkum a vlvoj pro inovace Piiloha C, 2 Kupnf smlouvy i. 9770/00026 Poiet stran: 3 Piiloha i. 2: PoloZkovf rozpoiet

25 s Pro ziskani slevy, prosime, uv6d6jte v2dy dislo nasi cenove nabidkv Life Technologies Czech Republic s.r.o V Celnici 1031/ Praha 1 eeskd reoublika Fax +42O 227 2O4 750 Tel czorders@lifetech.com www, lifetechnoloqies.con Platn6 od : Platn6 do : Podminky piepravy : Carriage and insurance paid VETERINARNI A FARMACEUTICKA UNIVERZITA BRNO /. PALACKEHO BRNO Czech Republic Na z6klad6 VaSi iiidku AB 35OO GENETIC ANALYZER 1 cena Kd3,238, ,00 Kd2,914, Kb2,914, OO SEQ & FRAG INSTALL 1 KIT K6164, K60.00 K MNL,INSTRUMENT LOG 1 BOOK 44 Kd6, Kd0.00 Kd WELL RETAINER & BASE 1 STD Kd4, K60,00 K SW,SEOA, SS, VR & GM 1 Kd246, Kd172, K6172, EDOOO651 POWER CORD EUROPE 1 Kd0.00 0,00 K60.00 K TRAINDNE3 2 DAYS GENETIC ANALYSIS 1 Kd20, Kd20,S40.00 Kc20, ZG6OSC35OO EXT WARRANTY,3sOO,OPM 1 K6202, K6172,142.OO K6,172, Mezisoudet bez DPH Kc3,279, DPH : Kd688, A Dart or: Therm*CI F$*her scientific Strana 1 / 5

26 )enovd nabidka: s June 10,2015 Celkem : Kc3,968,391,02 Filip Drzik Obchodni z6stupce ZaLite Technologies Life TechnoloEies Czech Repub!ic s.r.o. V Celnici 103U4, J10 00 Praha 1 fcor DIC: C Tef.r , Faxt 227 2Q4 750 A part or: ThernmFfrsher S C I E N T I FI C Strana 2 / 5