ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY

Transkript

1 ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY s názvem SOUBOR PRO PROTEOMICKOU SEPARACI A ANALÝZU CEITEC MU vyhotovené podle 156 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách, v platném znění (dále jen Zákon o VZ) 1. ODŮVODNĚNÍ ÚČELNOSTI VEŘEJNÉ ZAKÁZKY a) Popis potřeb, které mají být splněním veřejné zakázky naplněny Zakázka je zadávána a financována z Operačního programu Výzkum a vývoj pro inovace v rámci projektu CEITEC středoevropský technologický institut, registrační číslo projektu CZ.1.05/1.1.00/ Jejím cílem je naplnění plánovaného účelu projektu, který společně připravují nejvýznamnější brněnské univerzity a výzkumné instituce, a to vybudování evropského centra excelence v oblasti věd o živé přírodě a pokročilých materiálů a technologií. Projekt mý být ukončen nejpozději do b) Popis předmětu veřejné zakázky Předmětem veřejné zakázky je dodávka souboru instrumentace umožňujícího proteomické separace a analýzy chromatografickými a elektromigračními postupy. Kapalinový chromatograf umožní separace biomolekul na střednětlakých kolonách obsahujících měkké a perfúzní sorbenty. Instrumentace pro elektromigrační separace a analýzu bude sloužit k separaci komplexních proteinových směsí preparativní izoelektrickou fokusací v gelu a technikami 1D a 2D elektroforézy. Sestava instrumentace je koncipována jako komplementární a rozšíří inovativně i kapacitně možnosti Centrální laboratoře Proteomika projektu CEITEC - Středoevropský technologický institut. c) Popis vzájemného vztahu předmětu veřejné zakázky a potřeb zadavatele Separace a identifikace proteinových směsí je jedním za základních úkolů Centrální laboratoře Proteomika projektu CEITEC. Použití chromatografických a elektroforetických metod je nezbytným předpokladem pro maximální efektivitu následných hmotnostně spektrometrických analýz. Soubor pro proteomickou separaci a analýzu umožní zkvalitnit služby poskytované nejenom kolegům z ostatních laboratoří CEITEC, ale i externím uživatelům. d) Předpokládaný termín splnění veřejné zakázky Předmět veřejné zakázky bude realizován na základě smlouvy o dodávce, jež bude uzavřena po ukončení zadávacího řízení. Zařízení bude dodáno nejpozději do 6 týdnů ode dne

2 podpisu smlouvy s dodavatelem. Projekt jako celek bude ukončen nejpozději do e) Popis rizik souvisejících s plněním veřejné zakázky, která zadavatel zohlednil při stanovení zadávacích podmínek Zadavatel spatřuje riziko zejména v prodlení se zadáním zakázky, čímž může být částečně ohroženy plánované cíle projektu CEITEC. 2. ODŮVODNĚNÍ POŽADAVKŮ NA TECHNICKÉ KVALIFIKAČNÍ PŘEDPOKLADY ODŮVODNĚNÍ VYMEZENÍ OBCHODNÍCH PODMÍNEK Zadavatel dále zdůvodňuje vymezení obchodních podmínek veřejné zakázky ve vztahu ke svým potřebám a k rizikům souvisejícím s plněním veřejné zakázky, a to: a) Záruční lhůtu delší než 24 měsíců Cílem nastavení záruční doby na 36 měsíců je snaha zadavatele docílit optimální TCO ceny (total-cost-of-ownership) minimalizací možných budoucích plateb za práci servisního technika v období, kdy budou možné závady na celém systému stále ještě kryty zárukami od dodavatele. 4. ODŮVODNĚNÍ VYMEZENÍ TECHNICKÝCH PODMÍNEK Zadavatel dále zdůvodňuje vymezení technických podmínek veřejné zakázky ve vztahu ke svým potřebám a k rizikům souvisejícím s plněním veřejné zakázky. Zdůvodnění jednotlivých požadavků je uvedeno v příloze tohoto dokumentu. 5. ODŮVODNĚNÍ STANOVENÍ ZÁKLADNÍCH A DÍLČÍCH HODNOTÍCÍCH KRITÉRIÍ A ZPŮSOBU HODNOCENÍ NABÍDEK a) Zadavatel dále zdůvodňuje stanovení základních a dílčích hodnotících kritérií ve vztahu ke svým potřebám. Zadavatel zvolil jako základní hodnotící kritérium nejnižší nabídkovou cenu, neboť při dodržení stanovených technických podmínek je toto kritérium dostatečnou zárukou výběru kvalitní nabídky za nejnižší cenu. V Brně, dne Mgr. Jan Sedláček Manažer veřejných zakázek CEITEC MU Příloha odůvodnění vymezení technických podmínek

3 PODROBNÉ ODŮVODNĚNÍ VYMEZENÍ TECHNICKÝCH PODMÍNEK Základní požadavky zadavatele Zadavatel požaduje dodávku souboru instrumentace umožňujícího proteomické separace a analýzy chromatografickými a elektromigračními postupy. Kapalinový chromatograf umožní separace biomolekul na střednětlakých kolonách obsahujících měkké a perfúzní sorbenty. Instrumentace pro elektromigrační separace a analýzu bude sloužit k separaci komplexních proteinových směsí preparativní izoelektrickou fokusací v gelu a technikami 1D a 2D elektroforézy. Sestava instrumentace je koncipována jako komplementární a rozšíří inovativně i kapacitně možnosti Centrální laboratoře Proteomika projektu CEITEC - Středoevropský technologický institut. Požadované technické a funkční vlastnosti Požadovaná hodnota Zdůvodnění parametrů Kapalinový chromatograf FPLC Modulární systém skládající se z následujících komponent: pumpy dva moduly, dynamického gradientního systému, mixeru pro in-line ph gradient, ventilu pro nástřik vzorku, detekčního modulu UV a vodivost, modulu pro výměnu kolon, kontrolního LCD displeje a sběrače frakcí a softwaru pro nastavení systému, měření spekter při separaci a vyhodnocování vzorků Možnost rozšíření systému v budoucnu o další moduly: pevná konstrukce na budoucí moduly, vč. zaslepení aktuálně nepoužívaných sektorů Nutné pro flexibilní sestavování aparatury dle požadavků aktuálního experimentu. Nezbytné pro budoucí upgrade. Zaměnitelné dvoupísté pumpy Nutné pro reprodukovatelné tlaky Celkový průtok min. od 0,001 do 20 ml/min Nutné pro mikro aplikace až po práci na perfúzních kolonách. Tlaky LED monitoring na modulech pump, který ukazuje aktuální parametry a nastavenou cestu vzorku pro snadné propojení jednotlivých částí až do max psi Nutné pro práci na perfúzních sorbentech Nutné ke sledování aktuálně probíhajících kroků Vysokotlaký dynamický gradientní mixer Nutný pro rychlou tvorbu gadientu Automatický ventil pro nástřik vzorku, kontrolovaný softwarem Smyčka pro nástřik vzorku musí umožňovat nástřik vzorku manuálně stříkačkou nebo pumpou nebo autosamplerem Nutný pro optimální průběh aplikací Nutná pro přesnou aplikaci vzorku na kolonu

4 Sada smyček pro nástřik vzorku o objemu 1, 2, 5 ml a 100, 250, 500 µl Systém musí obsahovat UV/VIS detektor pro současné monitorování vlnových délek min. mezi nm a současně v jednom modulu i měření a monitorování vodivosti, tak aby se minimalizoval mrtvý objem Systém musí zahrnovat zaměnitelné alespoň dvě analytické cely (např. o dráze 5 mm a 10 mm), event. celu preparativní Měření vodivosti v min. rozsahu od 0,001 do 999mS/cm Nezbytné pro variabilní dávkování vzorku Rozsah nezbytný pro detekce proteinů a peptidů ve viditelném a UV spektru Nezbytná možnost měnit cely na základě typu experimentu Nutné pro kvalitní monitoring experimentu Modul pro automatickou in-line přípravu pufru a generování ph gradientu pro rychlý ph scouting nutné pro přípravu pufru online Maximální rychlost gradientu až 20 ml/min Zajistí kvalitní výstupy separace ph modul pro měření ph v rozsahu 1-14, s integrovanou kalibrací a integrovaným bypass portem, pokud ph sonda není využívaná v aplikaci ph monitoring je jedním ze základních parametrů Modul pro výměnu kolon, který dovoluje napojení až pěti kolon a rychlé testování kolon bez nutnosti jejich průběžného odpojování. Modul musí umožňovat reverzní tak solventu. Systém musí zahrnovat držáky na kolony v min. počtu 5 ks a rovněž držáky na menší kolony/cartridge v min. počtu 5 ks Nutné pro optimalizaci separace volbou typu kolony Nutné pro optimální průběh separace Systém musí umožňovat detekci bublin Nezbytné pro kvalitní separaci Dodávka systému musí zahrnovat PC, monitor min 24'', software pro ovládání hardwaru, měření dat a jejich analýzu software musí umět zobrazit a porovnat minimálně 3 chromatogramy najednou software musí umět zobrazit číslování jednotlivých sbíraných frakcí software musí umožňovat výpočet plochy pod křivkou Součástí dodávky musí být minimálně 5 softwarových licencí a neomezená aktualizace nových verzí softwaru systém musí obsahovat také automatický sběrač frakcí, který musí být jednoduše softwarově i hardwarově integrovatelný do systému Umožňuje paralelní práci několika uživatelů Nutný pro preparativní separace

5 sběrač frakcí musí obsahovat: držáky na zkumavky s minimální kapacitou 150 mikrozkumavek ml a držáky na minimálně 80 zkumavek mm v průměru, držák na sbírání frakcí minimálně do čtyř 96-ti jamkových destiček sběrač frakcí musí umožňovat sběr frakcí na základě počtu kapek v minimálním rozmezí kapek anebo na základě časových intervalů v minimálním rozmezí 2s 5 hodin sběr frakcí může být řízen na základě detekce spekter (píků), časového intervalu anebo kombinace obou Autosampler s chlazením nutné pro optimalizaci počtu frakcí flexibilní nastavení parametrů sběru frakcí nutné flexibilní nastavení parametrů sběru frakcí nutné Požadován automatický, přesný a reprodukovatelný nástřik vzorku, snadno instalovatelné příslušenství dovolující nástřik v širokém rozmezí objemů (5 µl 5 ml) a chlazení vzorku chránící teplotně citlivé vzorky během manipulace Nutný univerzální autosampler pro variabilní proteomické aplikace Kompatibilita s FPLC Nutné pro propojení s FPLC Držáky Rozměr zkumavky včetně víčka Objem smyčky Rozplňovací stříkačka min. 84 zkumavek objemu1.5 ml a 24 zkumavek objemu10 ml maximum 47 mm, minimum 32 mm 2,000 µl (standard), možnost 50, 100, 200, 250, 500, 1,000, a Nutné pro optimální funkci Nutné rozmezí zajišťující flexibilitu 10,000 µl Nutné pro propojení s FPLC 1,000 µl (standard) možnost 250 nebo 2,500 µ stříkaček Nutná pro optimální funkci Zdroj tlaku Vestavěný kompresor Nutný pro optimální funkci Přepínací čas dávkovače <100 ms Nutný pro optimální funkci Promývání Externí zásobní lahev Nutné pro optimální funkci Preparační možnosti Velkoobjemový držák (24 x 10 ml zkumavek), 2.5 ml stříkačka, 0.50 mm ID jehla, velký PEEK injekční píst, 10 ml smyčka Nezbytné parametry umožňující preparativní aplikace Analytické možnosti Chlazení vzorku 250 µl stříkačka, analytická jehla, 100 a 200 µl smyčka Peltierovo chlazení: v rozsahu: 4 15 C Nezbytné parametry pro analytické aplikace Nutné pro kvalitní separace

6 Kapacita chlazení 20 C pod teplotu okolí Nutné pro kvalitní separace 9 programovatelných Protokoly protokolů Nutné pro optimální funkci Metoda nástřiku nástřik celého objemu smyčky, nástřik části objemu smyčky, nástřik dle objemu (ul) flexibilní Objem nástřiku vzorku 5 1,500 µl (standard) Nutné pro optimální aplikace Nástřik ze zkumavky Max 9 x Nutné pro optimální aplikace Priorita vzorku programovatelná Nutné pro optimální funkci Zařízení pro vyřezávání proteinových spotů z gelu Systém pro vysekávání spotů z elektroforetických gelů a blotovacích membrán, včetně počítače, monitoru min. 24'', černobílé laserové tiskárny a plné verze software Nutné pro analýzu proteomu a následnou identifikaci proteinu Přesnost systému ±0.1 mm Nutný pro optimální aplikaci Rychlost 600 spotů za hodinu Nutné pro rozsáhlé experimenty Kapacita Jeden velký gel 25 x 20.5 cm nebo až 4 malé gely 13.3 x 8.7 cm bez nutnosti ořezávání Nutné pro klasické velikosti gelů v proteomice Účinnost vysekávání >99.5% při prvním vyseknutí Nezbytné pro optimální funkci CCD kamera Vnitřní průměr vysekávací jehly Použitelný pro Připojení k počítači Cela pro gelovou elektroforézu (12 velkých gelů) 12-bit, chlazená na 0 C ; rozlišení: x pixelů, rozlišení: 100 µm 1.5 mm a 1.0 mm 1-D a 2-D gely mm silné; VIS aplikace (Coomassie Blue, barvení stříbrem); UV aplikace (např. SYPRO Ruby); PVDF a nitrocelulosové membrány USB Nutné vysoké rozlišení pro lokalizaci spotů Nutné rozmezí pro optimální funkci Nutné parametry pro univerzální aplikace v proteomické analýze Vysokokapacitný systém pro proteinovou elektroforézu včetně recirkulační pumpy pro připojení k externímu chlazení Uniformní elektrické pole zajištěné deskovými elektrodami Nutná kapacita pro proteomické experimenty s replikáty Nutné osvědčené uspořádání elektrod

7 Systém zahrnuje skla na 16 gelů o rozměru min. 20 x 20 x 1mm a externí oběhový termostat Nezbytné pro práci s instrumentací Kapacita 1-12 gelů Nutný počet gelů Velikost gelů Tloušťka gelů Chlazení Skener elektroforetických gelů 20 x 20,5 cm nebo 25 x 20,5 cm Nutný parametr pro optimální rozlišení 1.0; 1.5 nebo 2.0 mm Nutný parametr pro optimální rozlišení Objem pufru 22,5 l Nutný pro velké gely externí oběhový termostat o objemu min. 8l, rozsah -35 C 200 C, programovatelný, kapacita pumpy l/min Kalibrovaný densitometr pro 1D a 2D gely barvené Coomassie Blue nebo stříbrem, včetně PC, monitoru min. 24'' a software Zdroj světla LED Nutný pro zajištění uniformního chlazení Nezbytné zařízení pro klasické typy gelů Nezbytný předpoklad kvalitní analýzy Vlnová délka nm Nutné pro optimální vizualizaci Absorbance OD (transmise); RD (reflexe) Nezbytný předpoklad kvalitní analýzy Skenovaná plocha max. 29 x 33 cm Nutné pro velké gely Rozlišení Hustota pixelů Rozlišení PC kompatibilita Izoelektrický fokusátor (2ks) 700 dpi Nezbytně nutné pro optimální snímání 12-bit Nezbytně nutné pro optimální snímání 36.3 µm Nezbytně nutné pro optimální snímání Windows XP a 7 Systém pro izoelektrickou fokusaci s vestavěným zdrojem napětí a s 12 drážkami, kde každá drážka má vlastní nezávisle programovatelnou dvojici elektrod Napětí Proud ,000 V, nastavení po 1 V nezávisle pro každou z dvanácti drážek µa, nastavení po 1 µa nezávisle pro každou z dvanácti drážek Unikátní možnost současné aplikace stripů o různých rozsazích a koncentraci vzorku.

8 Výkon Teplota 0 1 W nezávisle pro každou z dvanácti drážek 10 25ºC ± 0.5ºC při teplotě max. 23ºC; 15 25ºC ± 0.5ºC C při teplotě max. 31ºC Displej Dotykový QVGA Nutné pro dotykové ovládání Kapacita programů Fokusační elektrody Fokusační misky Délka IPG stripu Kapacita Cela pro gelovou elektroforézu (12 malých gelů) Vysokokapacitní externě temperovatelný systém pro proteinovou elektroforézu 2 GB, odpovídá přibližně 20,000 datových a programových řádků positivní a negativní 7, 11, 13, 17, 18, 24 cm dle fokusačního držáku: 7, 11, 13, 17, 18, and 24 cm 1-12 IPG stripů Nutné pro optimalizaci experimentu Kapacita 1-12 gelů Velikost gelů Tloušťka gelů Objem pufru min. 8.3 x 7.3 cm pro ručně nalité gely 0.5, 0.75, 1.0, nebo 1.5 mm L Chlazení Zdroj napětí pro gelovou elektroforézu (2ks) Univerzální zdroj napětí pro elektroforetické aplikace Výstup Nastavení výstupu musí být řipraveno pro připojení k externímu chladicímu oběhovému termostatu 500 V, 2.5 A, 500 W V, nastavitelné po 1 V; A, nastavitelné po A; W, nastavitelné po 1 W Nutné uniformní chlazení zaručuje reprodukovatelnost experimentu. Nezbytné elektroforetické zdroje pro všechny aplikace

9 Typ výstupu Timer Displej Real-time Počet výstupu Bezpečnostní prvky Cela pro gelovou elektroforézu (2 velké gely) Elektroforetická vana včetně příslušenství (spacery, nalévací stojánek) a skel na 4 gely Vybavení umožňující 2D elektroforézu Kapacita Velikost gelu Objem horního pufru Objem spodního pufru Konstantní napětí, konstantní proud, konstantní výkon 1 min 99 hr 59 min, plně nastavitelný, možnost pauzy 128 x 64 pixel, LCD Nutné pro dostatečně kvalitní zobrazení dat editace, real-time hodiny, obnovení po výpadku proudu 4 paralelní sety konektorů Detekce nepřipojení, detekce změny připojení, detekce protékání, přepěťová/zkratová ochrana, ochrana proti přetížení Nezbytné pro bezpečnost za vysokých napětí (až 10 tis. V) Nutné pro optimalizaci experimentu v malém. 1-4 gely 18.3 x 20 cm ručně nalévané max. 350 ml max. 1,2 l