Genotoxicita Testy na detekci mutací

Transkript

1 Genotoxicita Testy na detekci mutací

2 Mutageny v životním prostředí 20. století století chemie rok 1990 Chemical Abstracts Services 10 miliónů chemicky definovatelných látek, každý rok přibude asi 700 nových průmyslově užívané chemikálie a nově vyráběné syntetické látky se mohou nekontrolovatelně šířit do životního prostředí a mohl zůsobovat: a) otravy (toxické účinky) např. nemoc ITAI-ITAI (Japonsko-kadmium), nemoc z rýžového oleje (Čínakontaminace PCB), havárie (Seveso-dioxin), armáda použití AgentOrange (polychlorované dioxiny) b) genetické účinky

3 Poškození genofondu v důsledku působení vnějších mutagenů A) fyzikální faktory (10-15 %) B) chemické faktory (70-80 %) C) viry (10 20 %)

4 Genetická toxikologie

5 Mutageny přítomné v životním prostředí A) všeobecně rozšířené mutageny (voda, vzduch, půda) B) profesní expozice (mutageny jen v některých provozech)

6 Kontaminace vody genotoxickými látkami povrchová voda kontaminace dusíkatými hnojivy, pesticidy, herbicidy, insekticidy, fungicidy a jinými chemickými látkami (až 2000 org. látek) desinfekce pitné vody chlorováním vznik nízkomolekulárních látek (chloroform, tetrachloretylen, trichloretylen, chlorbenzen, dibromchlormetan, heptachlor, PCB aj.) vznik nádorů trávícího traktu a močového měchýře

7 Kontaminace ovzduší a půdy genotoxickými látkami Ovzduší: oxid siřičitý (HSO 3 a SO 3 vysoce mutagenní), oxidy dusíku, CO - automobily výskyt PAU, PCB, DDT, toxafen, těžké kovy (Be, Cr, Cd, Ni, As) Průmyslové oblasti: emise benzenu, formaldehydu, vinylchloridu, trichloretylenu, tetrachloretylenu, benzínu ozon, polétavý prach Důsledky: brochnitidy, bronchiální astma, alergická onemocnění, nádory plic Půda: víceuhlíkaté uhlovodíky, PAU, rezidua pesticidů, herbicidů, insekticidů, fungicidů, růstových regulátorů, deriváty organických nitrosloučenin DDT (dichlordifenyltrichloretan, lindan, aldrin, dieldrin, heptachlor těžké kovy

8 Příklady promutagenů v životním prostředí

9 Mutagenní látky v bytovém interiéru bytový interiér mikroklima Možné kontaminace: a) radioaktivita (radon) b) formaldehyd (dřevotříska) c) azbestová vlákna d) pevné i plynné produkty vznikající při vaření e) biologické znečištění (bakterie, plísně, viry) f) pasivní kouření g) zpomalovače hoření, ftaláty

10 Mutagenní látky v potravě rostliny produkují toxiny ochrana před cizopasnými houbami, hmyzem a animálními predátory odhaduje se, že v normální stravě je asi různých přírodních chemických látek chemické látky vykazující karcinogenní účinky byl nalezeny např. v koření (anýz, kmín, bazalka) ovoci, zelenině, kávě, čaji, medu či v houbách průměrně se živící obyvatel přijme denně asi 1500 mg biologicky aktivních přírodních látek (hlodavčích karcinogenů) a asi 2000 mg látek vzniklých při nevhodné kulinářské úpravě

11 Genotoxické látky přítomné v potravě benzpyren a jiné PAU (opékání masa nad otevřeným ohněm) mutagenní sloučeniny vznikající při pyrolýze proteinů a aminokyselin (heterocyklické aminy vznikající při pečení a grilování masa vysoké teploty!!!) nitrozosloučeniny (tepelná úprava masa obsahujícího dusitany) aflatoxiny (plesnivění potravin)

12 PAU vznikající při tepelném zpracování potravin

13 Genotoxické látky přítomné v potravě kofein? umělá sladidla (cyklamáty, sacharin) konzervační látky (nitrofurany) rezidua herbicidů, pesticidů, těžkých kovů mykotoxiny (aflatoxin B1, aflatoxim M1- aflatoxiny v mléku)

14 Příklady mutagenních heterocyklických aminů vznikajících působením tepla na proteiny a AMK

15 PAU vznikající při tepelném zpracování masa závislost na množství tuku a teplotě

16 Příklady genotoxických látek ve vztahu k profesní expozici A) průmysl: vinylchlorid angiosarkom (zhoubný nádor jater) trichloretylen a perchloretylen v organismu přeměna na epoxidy chloropren, epichlorhydrin poškození jater, rakovina kůže a plic černouhelný dehet zdroj PAU, azbest B) zemědělství: pesticidy, organofosfáty, biostimulátory C) zdravotnictví: inhalační anestetika, cytostatika, imunosupresiva, ionizující záření, biologické faktory

17 Kouření a zhoubné bujení Kouření 30 % úmrtnost na rakovinu Hlavní proud tabákového kouře (vdechovaný): 4-aminobifenyl, arzen, benzen, benzidin, benzpyren, beryllium, kadmium, chrom, 2-naftylamin, nitrosaminy, polonium, PAU, vinylchlorid Vedlejší proud tabákového kouře (vydechovaný): koncentrace karcinogenů mnohonásobně vyšší! Metabolickou aktivaci karcinogenů přítomných v tabákovém kouři může ovlivňovat genetický polymorfizmus genů pro enzymy cytochromů P450 (CYP1A1, CYP2D6) a genů pro enzym glutathion-stransferázu pomalí metabolizátoři (PM) extenzivní metabolizátoři (EM)

18 Příklady mutagenních PAU obsažených v černouhelném dehtu

19 Genetická toxikologie interdisciplinární obor vniklý v 70. letech minulého století sleduje poškození DNA a jeho důsledky chemickými látkami přítomnými v životním prostředí jsou používány metody genetické analýzy a tradiční toxikologické přístupy sledují se zejména pozdní účinky chemických látek genetickými metodami

20 Postup při stanovení rizika konkrétní chemické látky 1. hazard identification identifikace rizika (např. identifikace látky s mutagenní aktivitou) 2. dose-response assessment stanovení vztahu dávkaodpoveď 3. exposure assessment stanovení expozice jak mnoho chemikálií je absorbováno ze všech zdrojů 4. risk characterization charakterizace rizika stanovení rizika určitého nepříznivého efektu (např. choroby) vyplývající z předchozích výsledků ve vztahu k jednotlivci či populaci Bezpečná prahová dávka

21

22

23 Testy mutagenity

24

25 Testy na detekci mutací - rozdělení krátkodobé (screeningové) x dlouhodobé testy testy na gametické x somatické mutace testy prováděné in vitro x in vivo testy na detekci genových, chromozomových, genomových mutací, testy na reparaci DNA

26 Hodnocení mutagenity chemických látek Krátkodobé testy (Amesův test, cytogenetická analýza periferních lymfocytů) Dlouhodobé testy na savcích (hlodavci)

27 Amesův test (Salmonella typhimurium)

28 Plotnový test mutagenity podle Amese bakteriální detekční systém indikátorových kmenů Salmonella typhimurium představuje nejvíce rozšířený přístup pro screeningové hodnocení mutagenního potenciálu genotoxických chemických látek a jejich komplexních směsí je používán i pro hodnocení biotransformačních produktů chemických látek v tělních tekutinách (moč, krev) experimentálních zvířat a člověka indikátorové bakteriální kmeny S. typhimurium His- auxotrofie ve vztahu k histidinu existuje celá sada indikátorových bakteriálních kmenů umožňující detegovat specifický mechanismus působení testovaného mutagenního agens (substituce, posunové mutace a interkalační změny) kromě mutace v histidinovém operonu mají kmeny mají další přidatné markery zvyšující citlivost k chemickým látkám: mutace uvrb vyřazení a blokáda syntézy enzymů excizní reparace mutace rfa zasahuje lipopolysacharidovou membránu bakteriálních buněk zvyšuje se permeabilita povrchu bakteriálních buněk přítomnost plazmidu kódujícího rezistenci k ampicilinu či tetracyklinu zvyšuje citlivost k mutagenům

29 Plotnový test mutagenity podle Amese Nejpoužívanější kmeny: TA 98 posunové mutace TA100 - substituce Provedení: a) bez metabolické aktivace -S9 b) s metabolickou aktivací +S9 (homogenát z jater) Nutno provést vždy i negativní kontrolu (kontrolní rozmezí spontánních revertant) a pozitivní kontrolu (použití známých mutagenů)

30 Příklady mutagenů používaných jako pozitivní kontrola u A. testu

31 SOS chromotest univerzální bakteriální detekční systém umožňující hodnotit mutagenitu chemických látek vyvolávající taková poškození DNA nebo inhibici replikace, která v buňkách indukují SOS reparace metoda je založena na biochemické anlýze indukovatelné β-galaktozidázy hodnocené kolorimetricky test využívá specifického bakteriálního kmene Escherichia coli K12 PQ37, indukce SOS funkcí je hodnocena pomocí sfia genu (patří do skupiny SOS genů) exprese sfia genu je monitorována prostřednictvím β galaktozidázy (fúze sfiagenu s lacz genem)

32 Cytogenetické testy mutagenity Získané chromozomové aberace Cytogenetická Analýza Periferních Lymfocytů = CAPL Materiál: Lymphocyty periferní krve, G0 fáze, přetrvání dní Kultivace: 48 hod, zpracování jako při karyotypování Barvení - konvenční metoda!!!! Hodnocení: počet aberantních bb. / 100 hodnocených mitóz Typy aberací: zlomy chromatidové a chromozomové acentrické fragmenty di- a tricentrické chromozomy kruhové chromozomy, výměny Hodnocení nálezů: 5% bez závěru (u jednotlivce), opakování=riziko rozdíly v hodnocení jednotlivců a skupin (2 % hranice u skupin)

33 Párový fragment

34 Kruhový chromozom

35 Dicentrický chromozom

36 Di- a tricentrický chromozom, difragment

37 Dicentrický chromozom, difragment, kruhový chromozom

38 Translokace

39 Chromatidový zlom

40 Chromatidový zlom

41 Spontaneous level of chromosomal aberrations in peripheral blood lymphocytes of control individuals of the Czech Republic population. Rossner P, Sram RJ, Bavorova H, Ocadlikova D, Cerna M, Svandova E. Laboratory of Genetic Toxicology, National Institute of Public Health, Prague, Czech Republic. Toxicol Lett Aug;96-97: In order to assess the potential of cytogenetic determinations on peripheral blood lymphocytes as a mean of monitoring human population subjects to occupational and environmental exposures to genotoxins, accurate baseline data are required. During the past 20 years many results of the cytogenetic studies on peripheral blood lymphocytes from monitored occupationally exposed and non-exposed groups were obtained. At the time of blood drawing a questionnaire was administered. The questions covered a brief medical and family history including age, sex, medication, infectious diseases, smoking habits, X-ray examinations, alcohol consumption etc. Cytogenetic analysis from whole blood was carried out in short-term cultures. The cultivation time was 52 hours with all cells being in the first mitosis. A total of 100 well-spread metaphases containing 46 +/- 1 centromere were examined per donor on coded slides. Four categories of chromosome aberrations were evaluated: Chromatid and chromosome breaks, chromatid and chromosome exchanges. Cells bearing breaks or exchanges were classified as aberrant cells. Gaps were recorded but not scored as aberrations. Results of the cytogenetic analysis from control individuals (N = 5,430) indicated elevation of spontaneous frequency of aberrant cells (AB.C.) with age. We found 1.10% AB.C. (N = 551) in newborns; 0.71% AB.C. (N = 105) in the group 5-6 yr; 1.20% (N = 1,734) in the group 7-15 yr; 1.25% AB.C. (N = 239) in the group yr and 1.59% (N = 2,801) in the group yr.

42 Sesterské chromatidové výměny

43 Mikrojaderný test

44 Vyšetření spermií testy na detekci abnormality tvaru spermie a detekce aneuploidie ve spermiích

45 Testy mutagenity na Drosophila melanogaster test na detekci somatických mutací a rekombinací (SMART) detekce recesivně letálních na pohlaví vázaných mutací (Basc, ClB)

46 Test na detekci somatických mutací a rekombinací (SMART)u Drosophila melanogaster

47 Fenotypové projevy mutace mwh a flr

48 SMART test

49

50 ClB test u Drosophila melanogaster

51 Attached X test Drosophila melanogaster

52 Spot test u myší (somatické mutace) Působení mutagenu na embrya heterozygotní pro geny barvy srsti

53

54 Test na stanovení dominantních letálních mutací

55 Detekce mutací transgenní myši

56 Testy na detekcigenových mutací v savčích buňkách in vitro Materiál: buňky myšího lymfomu L5178Y a buňky čínského křečka línie V-79 Stanovení mutací v tymidinkinázovém lokusu TK Buňky deficientní v TK lokusu (TK-) vykazují rezistenci k pyrimidinovému analogu trifluorotyminu (TFT), neboť tento metaboliot není inkorporován do DNA. V přítomnosti enzymu TK je však TFT zabudován do DNA cytotoxicita Stanovení mutací v HPRT genu (hypoxantinfosforybosyltransferázový gen) HPRT gen (vázaný na X chromozom) kóduje enzym, který normálně fosforyluje guanin nebo hypoxantin. Této fosforylaci podléhá též 6-thioguanin (6TG), který se přeměňuje na 6 thioguaninmonofosfát (toxický). Detekce mutantních buněk vytváří kolonie za přítomnosti 6TG) Frekvence u zdravých lidí je asi 12,5 x 10-6

57 Testy na mutagenitu u rostlin

58 Rostlinné testy na detekci mutagenů Mullerův embryonalně letální test u Arabidopsis thaliana - test na detekci recesivních embyonálně letálních a chlorofylově defektních mutací - sledování embryí budoucí generace v nezralých semenech v šešulích rodičovských rostlin

59 Tradescantia test test na detekci somatických mutací test je založený na výskuytu somatických mutací v trichomech tyčinek květů klonu Tradescantia occidentalis, tento hybridní klon vznikl mezidruhovou hybridizací T. hirsutifloria (modrá barva květů) s a T. subacaulis (růžové květy) po mutaci nebo deleci dominantní alely se fenotypově projeví recesivní alela pro růžové zbarvení klon 4430 citlivý k chem. mutagenů, klon 02 citlivý k účinku ionizujícího záření Působení mutagenu na: řízky, poupata každé květenství: 20 poupat, každý květ 6 tyčinek, každá tyčinka 50 trichomů hodnotí se asi 10 květů Vhodné pro testování herbicidů, fungicidů, insekticidů, exhaláty ovzduší, znečištění vody, půdy

60 Tradescantia test

61 Allium cepa kořínkový test (možno detegovat chromozomální aberace, mikrojádra)

62 Kometový test

63 Kometový test parametry používané k hodnocení úrovně poškození DNA

64 Příklad použití kometového testu