Základy buněčné signalizace

Podobné dokumenty
Takahashi K & Yamanaka S. Cell 126, 2006,

Struktura a funkce biomakromolekul

INTRACELULÁRNÍ SIGNALIZACE II

PŘENOS SIGNÁLU V BUŇCE. Nela Pavlíková

Mechanismy hormonální regulace metabolismu. Vladimíra Kvasnicová

PŘENOS SIGNÁLU DO BUŇKY, MEMBRÁNOVÉ RECEPTORY

STRUKTURNÍ SKUPINY ADHEZIVNÍCH MOLEKUL

Regulace enzymových aktivit

VÝZNAM REGULACE APOPTÓZY V MEDICÍNĚ

Jaderné receptory. ligand. cytoplazmatická membrána. jaderný receptor DNA. - ligandem aktivované transkripční faktory

Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ

EXTRACELULÁRNÍ SIGNÁLNÍ MOLEKULY

Obecná a srovnávací odontologie. Vývojové souvislosti 1: vznik a vývoj zubu jako produkt genetických regulačních kaskád, odontogenní regulační kód

Regulace metabolických drah na úrovni buňky

Intracelulární Ca 2+ signalizace

Apoptóza Onkogeny. Srbová Martina

VÝZNAM FUNKCE PROTEINŮ V MEDICÍNĚ

Úvod do studia biologie kmenových buněk. Jiří Pacherník tel:

Tyranovec královský Onychorhynchus coronatus SIGNALIZACE BUNĚČNÁ. B10, 2015/2016 Ivan Literák

TRANSPORT PŘES MEMBRÁNY, MEMBRÁNOVÝ POTENCIÁL, OSMÓZA

Bunka a bunecné interakce v patogeneze tkánového poškození

Struktura, vlastnosti a funkce nukleových kyselin, DNA v jádře, chromatin.

Intermediární metabolismus. Vladimíra Kvasnicová

1. Napište strukturní vzorce aminokyselin D a Y a vzorce adenosinu a thyminu

Toxikologie PřF UK, ZS 2016/ Toxikodynamika I.

Struktura a funkce biomakromolekul

Tyranovec královský Onychorhynchus coronatus SIGNALIZACE BUNĚČNÁ. B11, 2016/2017 Ivan Literák

Indukovaná pluripotence. Petr Vodička Liběchov 16/11/2016

Rich Jorgensen a kolegové vložili gen produkující pigment do petunií (použili silný promotor)

Výzkumný ústav veterinárního lékařství v Brně

AMPK AMP) Tomáš Kuc era. Ústav lékar ské chemie a klinické biochemie 2. lékar ská fakulta, Univerzita Karlova v Praze

Kosterní svalstvo tlustých a tenkých filament

Fyziologie srdce I. (excitace, vedení, kontrakce ) Milan Chovanec Ústav fyziologie 2.LF UK

9. Léčiva CNS - úvod (1)

PROKARYOTA např. baktérie

Genetická kontrola prenatáln. lního vývoje

Hematologie. Nauka o krvi Klinická hematologie Laboratorní hematologie. -Transfuzní lékařství - imunohematologie. Vladimír Divoký

Hormony, neurotransmitery. Obecné mechanismy účinku. Biochemický ústav LF MU 2016 (E.T.)

Lekce z analýz genových expresních profilů u MM a návrh panelu genů pro ČR. Mgr. Silvie Dudová

Bakalářské práce. Magisterské práce. PhD práce

RECEPTORY CYTOKINŮ A PŘENOS SIGNÁLU. Jana Novotná

růstu a buněčného dělění

Lipidy a biologické membrány

Molekulární mechanismy diferenciace a programované buněčné smrti - vztah k patologickým procesům buněk. Aleš Hampl

Nukleové kyseliny Replikace Transkripce, RNA processing Translace

Řízení dějů v buňce. Buněčná signalizace - soubor dějů - mají podíl na vzájemné komunikaci buněk

Propojení metabolických drah. Alice Skoumalová

Obecný metabolismus.

Monitorování léků. RNDr. Bohuslava Trnková, ÚKBLD 1. LF UK. ls 1

Publikováno z 2. lékařská fakulta Univerzity Karlovy v Praze (

(Vývojová biologie) Embryologie. Jiří Pacherník

Glykolýza Glukoneogeneze Regulace. Alice Skoumalová

Elementy signálních drah. cíle protinádorové terapie

Integrace metabolických drah v organismu. Zdeňka Klusáčková

VÝZNAM FYZIOLOGICKÉ OBNOVY BUNĚK V MEDICÍNĚ

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

Přehled pedagogické činnosti - doc. RNDr. Tomáš Obšil, Ph.D.

Syntéza a postranskripční úpravy RNA

STRUKTURA A FUNKCE BIOLOGICKÝCH MEMBRÁN Základní biologická struktura

Nukleové kyseliny Replikace Transkripce translace

Buněčný cyklus - principy regulace buněčného růstu a buněčného dělění

BUŇEČNÝ CYKLUS A JEHO KONTROLA

Buněčný cyklus. Replikace DNA a dělení buňky

Biologie buňky. systém schopný udržovat se a rozmnožovat

Existence trade-offs záleží na proximátních mechanismech ovlivňujících znaky

BIOLOGICKÁ MEMBRÁNA Prokaryontní Eukaryontní KOMPARTMENTŮ

(molekulární) biologie buňky

OBOROVÁ RADA BIOCHEMIE A PATOBIOCHEMIE

Regulace glykémie. Jana Mačáková

Genová etiologie nemocí

Farmakologie. -věda o lécích používaných v medicíně -studium účinku látek na fyziologické procesy -biochemie s jasným cílem

Miroslav Průcha Ostrava 30.ledna 2018

DUM č. 3 v sadě. 37. Bi-2 Cytologie, molekulární biologie a genetika

Regulace metabolizmu lipidů

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Molekulární diagnostika

Regulace enzymové aktivity

KOMPLEMENT ALTERNATIVNÍ CESTA AKTIVACE KLASICKÁ CESTA AKTIVACE (LEKTINOVÁ CESTA) (humorálních, protilátkových):

glukóza *Ivana FELLNEROVÁ, PřF UP Olomouc*

Mgr. Šárka Vopěnková Gymnázium, SOŠ a VOŠ Ledeč nad Sázavou VY_32_INOVACE_02_3_20_BI2 HORMONÁLNÍ SOUSTAVA

Základní morfogenetické procesy

Struktura chromatinu. Co je to chromatin?

Metabolismus aminokyselin. Vladimíra Kvasnicová

Hořčík. Příjem, metabolismus, funkce, projevy nedostatku

Univerzita Karlova v Praze - 1. lékařská fakulta. Buňka. Ústav pro histologii a embryologii

Chemie nukleotidů a nukleových kyselin. Centrální dogma molekulární biologie (existují vyjímky)

2. Z následujících tvrzení, týkajících se prokaryotické buňky, vyberte správné:

Intermediární metabolismus CYKLUS SYTOST-HLAD. Vladimíra Kvasnicová

Gymnázium a Střední odborná škola, Rokycany, Mládežníků 1115

Autofagie a výživa u kriticky nemocného pacienta

IV117: Úvod do systémové biologie

Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK CZ.1.07/1.5.00/ Anotace. Metabolismus lipidů - odbourávání. VY_32_INOVACE_Ch0212


Lipidy. RNDr. Bohuslava Trnková ÚKBLD 1.LF UK. ls 1

Vápník. Deficience vápníku: - 0,4-1,5% DW. - cytoplasmatická koncentrace vápníku velmi nízká (0,1-0,2µM)

VÁPNÍK A JEHO VÝZNAM

DMPK (ZNF9) V DIFERENCOVANÝCH. Z, Kroupová I, Falk M* M

Interakce viru klíšťové encefalitidy s hostitelským organismem a patogeneze infekce

BUNĚČNÁ MOTILITA A MOLEKULÁRNÍ MOTORY

Rostlinné hormony brasinosteroidy a jejich úloha ve vývoji a růstu rostlin

Transkript:

Základy buněčné signalizace MUDr. Jan láteník, hd. Ústav lékařské biochemie a laboratorní diagnostiky 1.LF UK Uměle zkonstruovaný myší zub Ikeda e. et al.: Fully functional bioengineered tooth replacement as an organ replacement therapy, NAS 106, 2009, 13475-13480. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/mc2720406/figure/f1/ 1

Somatické buňky lze přeprogramovat na pluripotentní kmenové buňky! řeprogramování co to je? fibroblast is neurony kardiomyocyty hepatocyty Takahashi K & Yamanaka S. Cell 126, 2006, 663-676 Komunikace mezi buňkami: 1. Syntéza a 2. uvolnění signální molekuly buňkou která signalizuje 3. Transport signálu k cílové buňce 4. Detekce signálu specifickým receptorovým proteinem 5. Spuštění jedné nebo více signálních drah (transdukce signálu) 6. Specifický účinek na buněčný metabolismus, vývoj, diferenciaci atp. 7. Odstranění/ukončení signálu 2

Na jakou vzdálenost signál působí: + AUTOCRINE Signální molekula (ligand): eptidy/proteiny ACTH, inzulin, glukagon, růstové faktory, cytokiny a mnoho jiných Malé lipofilní molekuly: steroidy, thyroidní hormony, prostaglandiny Malé hydrofilní molekuly AMK nebo deriváty AMK - katecholaminy, histamin, serotonin, glutamát, GABA, glycin aj. lyny: NO 3

Receptor Vždy protein Vazba ligandu + konformační změna převod signálu (signální transdukce) Specifita vzhledem k vazbě ligandu následnému účinku Dvě třídy signálních molekul 4

Receptory pro signální molekuly na povrchu buňky Iontové kanály Receptory spřažené s G-proteiny Receptory s enzymatickou aktivitou Receptory pro signální molekuly na povrchu buňky Iontové kanály prona +, K +, Ca 2+, Cl - např. Receptor proacetylcholin, GABA, glutamát, glycin Receptory spřažené s G-proteiny Receptory s enzymatickou aktivitou 5

Svalový receptor pro acetylcholin Receptory pro signální molekuly na povrchu buňky Iontové kanály Receptory spřažené s G-proteiny Seven-spanning Receptory s enzymatickou aktivitou 6

Molekulární vypínače G-proteiny: Molekulární přepínače založené na GTasové aktivitě 7

Cílové molekuly pro G-proteiny: - membránové enzymy - iontové kanály Druhý posel: Cyklický adenosinmonofosfát (cam) Cyklický guanosinmonofosfát (cgm) Inositol-1,4,5-trisfosfát 1,2-diacylglycerol Calcium (NO, kyslíkové radikály) 8

Cyklický AM a proteinkinasa A R C R C Neaktivní KA + 4 cam cam R cam C R cam cam C Aktivní KA KA aktivuje štěpení zásobního triacylglycerolu v tukové buňce 9

Signalizace přes fosfolipázu C Calcium v buňce: V cytoplasmě jen 0.1-0.2 μm, cca 1 μm je již signál Zdroj signálu je: zvnějšku: ligandem aktivované Ca 2+ kanály napětím řízené Ca 2+ kanály ze zásob v ER: I3 receptor/kanál ryanodinový receptor/kanál závislý na membránovém potenciálu (kosterní sval) závislý na Ca 2+ (srdce, CNS) 10

Kalmodulin (148 AMK) obr.: Berridge et al., Nature 1998: 395, 645-648. O tom jakou informaci Ca 2+ signál nese, rozhoduje jeho LOKALIZACE FREKVENCE AMLITUDA 11

Receptory pro signální molekuly na povrchu buňky Iontové kanály Receptory spřažené s G-proteiny Receptorys enzymatickou aktivitou: samymajíenzymovouaktivitu: receptorové tyrosinkinázy(př. inzulin, EGF) asociovanés tyrosinkinázou(př. cytokiny, interleukiny) Receptorové tyrosinkinázy př.: Ras/MAK 12

Růstový faktor Monomerní receptor-tk GD Neaktivní Ras Vazba ligandu, dimerizace receptoru, autofosforylace 13

SH3 GRB2 SH2 SH3 GRB2 SH2 Sos (Guanine Nucleotide Exchange factor) 14

GT GRB2 SH2 SH3 Sos (Guanine Nucleotide Exchange factor) GT GRB2 SH2 SH3 Sos (Guanine Nucleotide Exchange factor) Ras aktivován 15

Ras GT H 2 N GRB2 Raf (Ser/Thr kináza) COOH Ras GT H 2 N GRB2 Raf (Ser/Thr kináza) COOH MEK (Ser/Thr i Tyr kináza) 16

Ras GT H 2 N GRB2 Raf (Ser/Thr kináza) MAKKK: MA Kinase Kinase Kinase COOH MEK (Ser/Thr i Tyr kináza) MAKK: MA Kinase Kinase ERK 1/2 (MAK: Mitogen Activated rotein kinase) Obr. z katalogu Cell Signaling Technology 17

Signalizace do buněčného jádra 18

Jak signál ovlivňuje funkce proteinů Modifikace struktury/ funkce stávajících proteinů Změna spektra /množství proteinů v buňce... regulace genové exprese Regulace genové transkripce u eukaryot 19

Model interakce více aktivátorů transkripce s mediátorovým komplexem obr.: Lodish et al.: Molecular Cell Biology, 5. vyd., W.H.Freeman & Co., N.Y. 2004. Eukaryotické transkripční faktory: Rozdělení podle strukturních motivů: homeodomény zinkové prsty ( zinc fingers ) leucinové zipy ( leucine zippers ) bhlh (basic Helix-Loop-Helix) proteiny 20

Eukaryotické transkripční faktory: Rozdělení podle způsobu exprese/regulace: inducibilní konstitutivní ligandem aktivované Inducibilní TFs: př. A1 (Activator rotein 1) Jun Fos TGACTCA TRE [TA (phorbol ester) response element] Jun Jun Jun ATF Jun family: c-jun, JunB, JunD Fos family: c-fos, FosB, Fra-1, Fra-2 21

Konstitutivní TFs: př. CREB (cam/ca 2+ response element binding protein) Ser133 CREB CREB TGACGTCA CRE [cam/ca 2+ response element] Ligandem-aktivované TFs: Nadrodina jaderných receptorů obr.: Lodish et al.: Molecular Cell Biology, 5. vyd., W.H.Freeman & Co., N.Y. 2004. 22

Receptory pro glukokortikoidy a estrogeny jsou ligandem aktivované transkripční faktory, které translokují do jádra obr.: Lodish et al.: Molecular Cell Biology, 5. vyd., W.H.Freeman & Co., N.Y. 2004. Signalizace do buněčného jádra do jádra jde ligand receptor transkripční faktor jiná signální molekula (kinasa, druhý posel) 23

Kaskáda transkripční odpovědi Second messengers Kinase activation & Nuclear translocation Constitutive transcription factors Inducible transcription factors Target genes obr.: láteník et al., Life Sci. 2000: 67, 335-364. Amplifikace signálu GARLAND UBLISHING 1998 24

Integrace signálu Buňka reaguje na souhrn signálů: 25

Cross-talk signálních drah Cross-talk signálních drah 26

Analýzy genomu (Science 291, 2001): Lidský kinom: 518 kinas (Science 298, 2002) Zdroj obr.: Cell Signaling Technology 27

MASTER SWITCH : Jeden gen/protein vládnoucí všem... rotein A rotein B rotein C rotein D Horb, M.E., et al.: Experimental conversion of liver to pancreas. Current Biology, 13, 105-115, (2003). Transientní exprese jediného genového konstruktu, kódující modifikovaný klíčový TF dx1, změní trvale jaterní buňku na pankreatickou, produkující inzulin, glukagon a amylasu... 28

Somatické buňky lze přeprogramovat na pluripotentní kmenové buňky! fibroblast Oct3/4, Sox2, Klf4, c-myc is neurony kardiomyocyty hepatocyty Takahashi K & Yamanaka S. Cell 126, 2006, 663-676 Obr. z: Yamanaka S. Cell 137, 2009, 13-17. 29

A blueprint of stem cell-based tooth regeneration with a scaffold-free approach. Schematic procedures of stem cell-based scaffold-free tooth regeneration in humans. The procedures include induction of iscs or epithelial derived stem cells into epithelial (epi.) sheets and induction of iscs or dental mesenchymal (mes.) stem cells into mesenchymal masses with odontogenic potential, tissue recombination, in vitro organ culture of the recombinants to the late bud or early cap stage, implantation of bioengineered tooth germs into the lost tooth sites of patients, and regeneration of functional replacement teeth. Zhang and Chen Cell Regeneration 2014 3:8 doi:10.1186/2045-9769-3-8 When dental stem cell therapies become routine it will be historic, and the most fantastic time to practice as a dentist. http://singularityhub.com/2012/05/10/toothless-no-more-researchers-using-stemcells-to-grow-new-teeth/ Citát: prof. eter Murray, College of Dental Medicine, Nova Southeastern University 30