Přehled publikační činnosti k 3.8.2005: Jindřich Jindřich Celkem níže prezentovaných prací/přednášek/grantů: A. Monografie, kapitoly v monografiích 0 B. Učební texty 3 C. Disertační práce D. Původní vědecké páce D. Práce publikované v odborných časopisech vydávaných v zahraničí 9 D.. Práce publikované v odborných časopisech vydávaných v zahraničí nerecenzované abstrakty z kongresů a konferencí D2. Práce publikované v odborných časopisech vydávaných v České republice 5 D2.. Práce publikované v odborných časopisech vydávaných v České republice nerecenzované abstrakty z kongresů a konferencí E. Ostatní odborné práce E. Příspěvky ve sbornících z českých konferencí E.2 Příspěvky ve sbornících z mezinárodních konferencí 5 E.3 Výzkumné zprávy E.4 Popularizační práce 3 E.5 Recenze E.6 Expertní činnost F. Zvané přednášky 0 G. Účast na řešení grantů a výzkumných projektů 9 H. Patenty 4 B. Učební texty Celkem: 4. Klán, P.; Jindřich, J. WWW pro zelenáče. Praha: Neokortex, 2003. 38 s. Učební texty ke kurzům online na serveru moodle.orgchem.cz: 2. Chemická informatika a. C270P0 Chemická informatika (přednášky + cvičení) b. C270P62 Chemická informatika (přednášky + cvičení) 3. C270P69 Supramolekulární chemie (přednášky) C. Disertační práce Jindřich, J. Acyklické analogy nukleosidů a nukleotidů obsahující atom fluoru. Disertační práce, Ústav organické chemie a biochemie, ČSAV, Praha, 992. D. Původní vědecké páce Způsob řazení: chronologicky a v rámci jednoho roku dle abecedy.
2 D. Práce publikované v odborných časopisech vydávaných v zahraničí Celkem: 9 IF Jelinek, I.; Chvojka, T.; Vrkoslav, V.; Jindrich, J.; Lorenc, M.; Niznansky, D.; Nemec, I.; Kral, V.; Dian, J. Nanostructured porous silicon - Optical properties, surface modification 0.576 and sensor applications Chimia 2005, 59, 222-225. Valasek, M.; Pecka, J.; Jindrich, J.; Calleja, G.; Craig, P.R.; Michl, J. Oligomers of 2 "extended viologen", p-phenylene-bis-4,4 '-(-aryl-2,6-diphenylpyridinium), as candidates 3.462 for electron-dopable molecular wires J. Org. Chem. 2005, 70, 405-42. Chvojka, T.; Vrkoslav, V.; Jelinek, I.; Jindrich, J.; Lorenc, M.; Dian, J. Mechanisms of 3 photoluminescence sensor response of porous silicon for organic species in gas and liquid 2.083 phases Sens. Actuator B-Chem. 2004, 00, 246-249. Pumera, M.; Jelinek, I.; Jindrich, J.; Benada, O. beta-cyclodextrin-modified monolithic 4 stationary phases for capillary electrochromatography and NANO-HPLC chiral analysis of 0.836 ephedrine and ibuprofen J. Liq. Chromatogr. Relat. Technol. 2002, 25, 2473-2484. Holec, T.; Chvojka, T.; Jelinek, I.; Jindrich, J.; Nemec, I.; Pelant, I.; Valenta, J.; Dian, J. 5 Determination of sensoric parameters of porous silicon in sensing of organic vapors Mater..383 Sci. Eng. C-Biomimetic Supramol. Syst. 2002, 9, 25-254. Pumera, M.; Jelinek, I.; Jindrich, J. Determination of cyclodextrins and their derivatives by 6 capillary electrophoresis with indirect UV and conductivity detection Fresenius J. Anal..924 Chem. 200, 369, 666-669. Pumera, M.; Matalova, R.; Jelinek, I.; Jindrich, J.; Juza, J. Comparison of association 7 constants of cyclodextrins and their tert-butyl derivatives with halogenbenzoic acids and.383 acridine derivatives. Molecules 200, 6, 22-229. Dian, J.; Holec, T.; Jelinek, I.; Jindrich, J.; Valenta, J.; Pelant, I. Time evolution of 8 photoluminescence response from porous silicon in hydrocarbon gas sensing Phys. Status 0.860 Solidi A-Appl. Res. 2000, 82, 485-488. Pumera, M.; Jelinek, I.; Jindrich, J.; Coufal, P.; Horsky, J. Determination of cyclodextrin 9 content using periodate oxidation by capillary electrophoresis J. Chromatogr. A 2000, 89, 3.359 20-206. Hartmann, K.; Kuffer, M.; Balzarini, J.; Naesens, L.; Goldberg, M.; Erfle, V.; Goebel, F.D.; De Clercq, E.; Jindrich, J.; Holy, A.; Bischofberger, N.; Kraft, W. Efficacy of the acyclic 0 nucleoside phosphonates (S)-9-(3-fluoro-2-phosphonylmethoxypropyl)adenine (FPMPA) 4.00 and 9-(2-phosphonylmethoxyethyl)adenine (PMEA) against feline immunodeficiency virus J. Acquir. Immune Defic. Syndr. Hum. Retrovirol. 998, 7, 20-28. Jindrich, J.; Harata, K.; Lindberg, B.; Pitha, J.; Seffers, P. Synthesis of 2(),3()-O- (propane-,2-diyl)- and 2(),3()-O-(3-hydroxypropane-,2-diyl)cyclomaltoheptaose.45 Carbohydr. Res. 997, 300, 36-363. Holy, A.; Dvorakova, H.; Jindrich, J.; Masojidkova, M.; Budesinsky, M.; Balzarini, J.; 2 Andrei, G.; Declercq, E. Acyclic nucleotide analogs derived from 8-azapurines: Synthesis 5.076 and antiviral activity J. Med. Chem. 996, 39, 4073-4088. Jindrich, J.; Josef, P.; Lindberg, B. Separation Of Cyclodextrins And Their Derivatives By 3.45 Thin-Layer And Preparative Column Chromatography Carbohydr. Res. 995, 275, -7. Jindrich, J.; Pitha, J.; Lindberg, B.; Seffers, P.; Harata, K. Regioselectivity Of Alkylation Of Cyclomaltoheptaose (Beta-Cyclodextrin) And Synthesis Of Its Mono-2-O-Methyl, Mono-2-4.45 O-Ethyl, Mono-2-O-Allyl, And Mono-2-O-Propyl Derivatives Carbohydr. Res. 995, 266, 75-80. Thormar, H.; Balzarini, J.; Holy, A.; Jindrich, J.; Rosenberg, I.; Debyser, Z.; Desmyter, J.; 5 Declercq, E. Inhibition Of Visna Virus-Replication By 2',3'-Dideoxynucleosides And Acyclic 4.26 Nucleoside Phosphonate Analogs Antimicrob. Agents Chemother. 993, 37, 2540-2544. Balzarini, J.; Holy, A.; Jindrich, J.; Naesens, L.; Snoeck, R.; Schols, D.; Declercq, E. Differential Antiherpesvirus And Antiretrovirus Effects Of The (S) And (R) Enantiomers Of 6 4.26 Acyclic Nucleoside Phosphonates - Potent And Selective Invitro And Invivo Antiretrovirus Activities Of (R)-9-(2-Phosphonomethoxypropyl)-2,6-Diaminopurine Antimicrob. Agents
3 Chemother. 993, 37, 332-338. Merta, A.; Votruba, I.; Jindrich, J.; Holy, A.; Cihlar, T.; Rosenberg, I.; Otmar, M.; Herve, T.Y. Phosphorylation Of 9-(2-Phosphonomethoxyethyl)Adenine And 9-(S)-(3-Hydroxy-2-7 Phosphonomethoxypropyl)Adenine By Amp(Damp) Kinase From L20 Cells Biochem. Pharmacol. 992, 44, 2067-2077. Balzarini, J.; Holy, A.; Jindrich, J.; Dvorakova, H.; Hao, Z.; Snoeck, R.; Herdewijn, P.; Johns, D.G.; Declercq, E. 9-[(2Rs)-3-Fluoro-2-Phosphonylmethoxypropyl] Derivatives Of 8 Purines - A Class Of Highly Selective Antiretroviral Agents Invitro And Invivo Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 99, 88, 496-4965. Luger, P.; Denner, L.; Cerny, M.; Jindrich, J.; Trnka, T. 6-Crown-5 Derivative Of,6- Anhydro-Beta-D-Glucopyranose - Structure Of [,6-Anhydro-2,4-Di-O-(3,6,9-9 Trioxaundecane-,-Diyl)-Beta-D-Glucopyran Ose]Sodium Tetraphenylborate Acta Crystallogr. Sect. C-Cryst. Struct. Commun. 99, 47, 66-70. 3.436 0.452 0.728 D.. Práce publikované v odborných časopisech vydávaných v zahraničí nerecenzované abstrakty z kongresů a konferencí Celkem: Reisinger, A.; Pecka, J.; Jindrich, J.; Miller, J.R.; Kirby, J.P.; Pospisil, L.; Michl, J. Synthesis and properties of thiol-terminated pyridinium wires. Abstr. Pap. Am. Chem. Soc. 2000, 220, U27-U27. 000.0 D2. Práce publikované v odborných časopisech vydávaných v České republice Celkem: 5 2 3 4 5 Vesely, J.; Ledvina, M.; Jindrich, J.; Trnka, T.; Saman, D. Synthesis of 2-amino-2-deoxybeta-D-galactopyranosyl( -> 4)-2-amino-2-deoxy-beta-D-galactopyranosides: Using various 2-deoxy-2-phthalimido-D-galactopyranosyl donors and acceptors Collect. Czech. Chem. Commun. 2004, 69, 94-938. Vesely, J.; Ledvina, M.; Jindrich, J.; Saman, D.; Trnka, T. Improved synthesis of,2-transacetates and,2-trans ethyl -thioglycosides derived from 3,4,6-tri-O-acetyl-2-deoxy-2- phthalimido-d-hexopyranosides Collect. Czech. Chem. Commun. 2003, 68, 264-274. Jindrich, J.; Holy, A.; Dvorakova, H. Synthesis Of N-(3-Fluoro-2-Phosphonomethoxypropyl) (Fpmp) Derivatives Of Heterocyclic Bases Collect. Czech. Chem. Commun. 993, 58, 645-667. Jindrich, J.; Dvorakova, H.; Holy, A. Synthesis Of Isomeric N-(3-Fluoro-2-Hydroxypropyl) And N-(2-Fluoro-3-Hydroxypropyl) Derivatives Of Purine And Pyrimidine-Bases Collect. Czech. Chem. Commun. 992, 57, 466-482. Jindrich, J.; Cerny, M.; Trnka, T.; Budesinsky, M. Syntheses With Anhydro Sugars.39. The Synthesis Of 4-O-Oligoethylene Glycol Derivatives Of,6-Anhydro-Beta-D-Glucopyranose And Crown-Ethers Formed By Their Intramolecular Cyclization Collect. Czech. Chem. Commun. 99, 56, 2950-2963. IF.062.062.062.062.062 D2.. Práce publikované v odborných časopisech vydávaných v České republice nerecenzované abstrakty z kongresů a konferencí Celkem:
4 Jindrich, J.; Horsky, J.; Jelinek, I. Cyclodextrins and their derivatives - Synthesis and utilization Chem. Listy 997, 9, 956-032. IF 0.348 E. Ostatní odborné práce Způsob řazení: chronologicky a v rámci jednoho roku dle abecedy. E. Příspěvky ve sbornících z českých konferencí Celkem:. Trojan, T.; Jindřich, J. Synthesis of 6 I -Alkenoylamino-6 I -deoxy Derivatives of β-cyclodextrin as Modifiers of Porous Silicon Sensoric Response. Books of Abstracts "Cukrblik 2005 - Current Chemistry and Biochemistry of Saccharides", Prague 2005. 2. Řezanka, M, Jindřich, J.; Tišlerová, I. Easy Preparation of Regioisomers of Mono-Osubstituted Cyclodextrins. Books of Abstracts "Cukrblik 2005 - Current Chemistry and Biochemistry of Saccharides", Prague 2005. 3. Beran, A.; Jindřich, J. Synthesis of Allyl Type Alkylation Reagents and Their Use for Complexation Driven Regioselective Alkylation of Cyclodextrins. "Cukrblik 2005 - Current Chemistry and Biochemistry of Saccharides", Prague 2005. 4. Jindřich, J.; Píša P. CHROMuLAN - řídicí a vyhodnocovací software pro chromatografické separace. Sborník "Pokroky v chromatografii a elektroforéze 2005 & Chiranal 2005", Olomouc 2005. 5. Pudilová, H.; Jindřich, J. Synthesis Of Cyclodextrin Dimers - Carriers Of Photodynamic Sensitisers. "Pokroky v organické, bioorganické a farmaceutické chemii", Nymburk 2004. 6. Beran, A.; Jindřich, J. Syntéza alkylačních činidel allylového typu a jejich použití pro komplexací řízenou regioselektivní alkylaci β-cyklodextrinu. "Pokroky v organické, bioorganické a farmaceutické chemii", Nymburk 2004. 7. Trojan, T. Jindřich, J. Syntéza 6 I -alkenoylamino-6 I -deoxyderivátů β-cyklodextrinu jako modifikátorů senzorické odezvy porézního křemíku. "Pokroky v organické, bioorganické a farmaceutické chemii", Nymburk 2004. 8. Pudilová, H.; Jindřich, J. Synthesis of Cyclodextrin Dimers - Carriers of Photodynamic Sensitizers. Books of Abstracts "Cukrblik 2004 - Current Chemistry and Biochemistry of Saccharides", Prague 2004. 9. Kusák, M.; Jindřich, J.; Tišlerová, I. Synthesis Of Regioselectively 3 I -O-Alkylated β- Cyclodextrin Derivatives Using Wittig Reaction. Books of Abstracts "Cukrblik 2003 - Current Chemistry and Biochemistry of Saccharides", Prague 2003. 0. Kusák, M.; Jindřich, J.; Tišlerová, I. Synthesis Of Regioselectively 3 I -O-Alkylated β- Cyclodextrin Derivatives Using Wittig Reaction. "Pokroky v organické, bioorganické a farmaceutické chemii", Liblice 2002.. Jindřich, J. 2 I -O-Allyl-β-cyklodextrin prekursor pro synthesu 2 I -O-substituovaných cyklodextrinů. Cukrblik 99 - Současná glykobiologie, chemie a biochemie sacharidů v Čechách. Praha 999. E2. Příspěvky ve sbornících z mezinárodních konferencí Celkem:. Jindřich, J.; Kusák, M.; Tišlerová, I. Synthesis Of Regioselectively 3 I -O-Alkylated β- Cyclodextrin Derivatives Using Wittig Reaction. 2th International Cyclodextrin Symposium, Montpellier, France, 2004. 2. Kusák, M.; Jindřich, J.; Tišlerová, I. Synthesis Of Regioselectively 3 I -O-Alkylated β- Cyclodextrin Derivatives Using Wittig Reaction. The Carbohydrate Workshop 2003, Güstrow, Germany, 2003. 3. Chvojka, T.; Holec, T.; Jelínek, I.; Němec., I.; Jindřich, J.; Lorenc, M.; Koutníková, J.; Král, V.; Dian, J. Optical Porous Silicon Based Sensors with Chemically Modified Surface for Detection
5 of Organic Vapors. Proceedings from "Photonics Prague 2002", Prague, Czech Republic, 2002. 4. Jindřich, J. Synthesis Of Regioselectively Mono-Substituted β-cyclodextrin Derivatives. 3rd German - East European Carbohydrate Workshop, Güstrow, Germany, 200. 5. Jindřich, J. 2 I -O-Allyl-β-cyclodextrin Useful Precursor For Synthesis Of 2 I -O Substituted Cyclodextrin Derivatives. 2nd German - East European Carbohydrate Workshop, Güstrow, Germany, 999. E.3. Výzkumné zprávy V rámci řešených grantových projektů (viz bod G) bylo odevzdáno přiměřené množství výzkumných zpráv či jejich částí. E.4 Popularizační práce Klán, P.; Jindřich, J. Aktualizovaný přehled chemických on-linových databází. CHEMagazín 2003, XIII, (6), 22. Klán, P.; Jindřich, J.; Rieger, S. Aktuální chemický adresář Webu. Chemické listy 200, 95, 453. Klán, P.; Jindřich, J. Databáze fyzikálních vlastností chemických látek CHEMagazín 2000, X, (6). E.5 Recenze Opakované recenze manuskriptů pro odborný časopis: o Collect. Czech. Chem. Commun. E.7 Expertní činnost Posudky návrhů grantů pro grantové agentury: GAČR, FRVŠ, GAAV F. Zvané přednášky G. Účast na řešení grantů a výzkumných projektů 2004-2006 Syntéza lineárních pyridin-fenylenových oligomerů pro použití v molekulární elektronice, GAČR 203/04/092, spolupracovník. 2004-2006 Fluorosenzory na bázi porézního křemíku derivatizovaného cyklodextrin. GAUK 424/2004/B CH, spolupracovník. 2002-2004 Fotodynamické sensitizery vázané na cyklodextrinové nosiče, GAČR 203/02/483, spolupracovník. 200-2003 Syntéza oligomerů s pyridiniovými kruhy pro výstavbu molekulárních elektronických obvodů. GAČR 203/0/0644, spolupracovník. 2000-2002 Syntéza nových typů lineárních polymerů s navázaným cyklodextrinem a jejich využití v kapilární elektroforéze, GAČR 203/00/564, řešitel. 2000-2002 Syntéza cyklických oligosacharidů obsahujících 2-amino-2-deoxy-hexopyranosy a studium jejich komplexační aktivity, GAČR 203/00/007, spolupracovník. 999-2004 Výzkumný záměr MSM30000, spolupracovník. 999- Koordinátor projektu CHROMuLAN (http://chromulan.org) freeware open source software pro akvizici a vyhodnocování chromatografických dat.
6 998-2000 Syntéza nových derivátů cyklodextrinů a jejich využití v kapilární elektroforéze, GAUK 22/998/B CH/PřF, řešitel. 996-997 Syntéza mono-2 A -O substituovaných derivátů cyklodextrinů a jejich využití v kapilární elektroforéze, GAUK 25/96/B/CH, řešitel. H. Patenty. Ústav organické chemie a biochemie AVČR, Praha 6. Di(2-propyl)estery -fluor-2-fosfonomethoxy-3-p -toluensulfonyloxypropanů, způsob jejich přípravy a použití. Jindřich Jindřich, Holý Antonín. Česká republika. Patentový spis 284678. 2. Ústav organické chemie a biochemie AVČR, Praha 6. N-(3-Fluor-2-hydroxypropyl)deriváty purinových a pyrimidinových heterocyklických bází a způsoby jejich přípravy. Holý Antonín, Jindřich Jindřich, Dvořáková Hana. Česká republika. Patentový spis 285924. 3. Ústav organické chemie a biochemie AVČR, Praha 6. N-(3-Fluor-2-fosfonylmethoxypropyl)deriváty purinových a pyrimidinových heterocyklických bází, způsoby jejich přípravy a použití. Holý Antonín, Jindřich Jindřich, De Clercq Erik, Balzarini Jan. Česká republika. Patentový spis 285420. 4. Cyclodextrins Derivatized By Compounds Containing Carbon-Carbon Double Bonds. Pitha Josef, Jindřich Jindřich. U.S. Patent Application 09,36,378. V Praze, dne 3.9.2005 RNDr. Jindřich Jindřich, CSc.