ALGORITMUS ANALÝZY SNÍMKŮ Z DIGITÁLNÍHO FOTOSCREENERU VIrA



Podobné dokumenty
DETEKCE HRAN V BIOMEDICÍNSKÝCH OBRAZECH

PRAKTIKUM III. Oddělení fyzikálních praktik při Kabinetu výuky obecné fyziky MFF UK

ANALÝZA JASOVÝCH PROFILŮ PŘI EXCENTRICKÉ FOTOREFRAKCI - POROVNÁNÍ ALGORITMŮ PRO LOKALIZACI ZORNICE

Novinky ve vývoji individuálních progresivních čoček. Petr Ondřík Rodenstock ČR, s.r.o.

Řešení binokulárních refrakčních anomálií

Praktický úvod do skiaskopie a oftalmoskopie

Zásady centrování brýlových čoček I. LF MU Brno Brýlová technika

Kalkulátor torické nitrooční čočky envista

F. Pluháček. František Pluháček Katedra optiky PřF UP v Olomouci

Četnost brýlové korekce v populaci

Gullstrandovo schématické oko

Problematika disertační práce a současný stav řešení. Ing. Aneta Zatočilová

Detektor anomálií DNS provozu

ZKUŠEBNÍ PROTOKOLY. B1M15PPE / část elektrické stroje cvičení 1

vzorek vzorek

Optika pro mikroskopii materiálů I

Spektrální charakteristiky

Š E D O T Ó N O V Á A B A R E V N Á K A L I B R A C E

Jan Kaiser ČVUT, Fakulta elektrotechnická, katedra Radioelektroniky Technická 2, Praha 6

PROGRAM RP45. Vytyčení podrobných bodů pokrytí. Příručka uživatele. Revize Pragoprojekt a.s

Pokročilé vyhodnocování mikrotvrdosti programem MICRONESS

Geometrická optika. Optické přístroje a soustavy. převážně jsou založeny na vzájemné interakci světelného pole s látkou nebo s jiným fyzikálním polem

NULUX EP. Ideální korekce se stává skutečností

Jméno: Michal Hegr Datum: Oko

Gullstrandovo schématické oko

2 (3) kde S je plocha zdroje. Protože jas zdroje není závislý na směru, lze vztah (5) přepsat do tvaru:

SLEDOVÁNÍ POHYBU OČÍ POMOCÍ KAMERY CAMERA BASED EYE TRACKING

Charakteristiky videomateriálu. Digitalizace Barevné schéma Barevná hloubka Rozlišení Framerate Streamování

Měření rozložení optické intenzity ve vzdálené zóně

Experimentáln. lní toků ve VK EMO. XXX. Dny radiační ochrany Liptovský Ján Petr Okruhlica, Miroslav Mrtvý, Zdenek Kopecký.

ZJIŠŤOVÁNÍ DOHLEDNOSTI NA CHODCE ZA VIDITELNOSTI SNÍŽENÉ TMOU PŘÍLOHA Č. 2

Defektoskopie. 1 Teoretický úvod. Cíl cvičení: Detekce měřicího stavu a lokalizace objektu

Jaromír Běláček, Jiří Tichý, Miroslav Dostálek

Budoucnost brýlových čoček EyeLT - EyeLens Technology Petr Ondřík Rodenstock ČR

Úloha č.9 Měření optických kabelů metodou OTDR (Optical Time Domain Reflectometry)

HILGER s.r.o., Místecká 258, Ostrava-Hrabová, Telefon: (+420) , (+420) ,

=10 =80 - =

Digitální mikroskop s kamerou 2MP USB 1000X 8 LED + pohyblivý stojánek

Fraktální analýza prahovaných a neprahovaných signálů (View+HT) HT 1D

Automatické rozpoznávání dopravních značek

PROTOKOL O ZKOUŠCE 101 / 2009

Interpolace obrazu pro experimentální měřiče plošného teplotního rozložení

Domácí a venkovní IP kamery / Kamery do auta / Fotopasti / Makety kamer. Kamery. 3/2019 (N)

ELCOM, a.s. Pavel Růčka E ELCOM, a.s.

Plusoptix A09 informace

Ústav technologie, mechanizace a řízení staveb. Teorie měření a regulace. LCD displeje. p. 1q. ZS 2015/ Ing. Václav Rada, CSc.

Panoramatická fotografie

Radiometrie se zabývá objektivním a fotometrie subjektivním měřením světla.

Praktická geometrická optika

oční (osový) astigmatismus

Základní pojmy Zobrazení zrcadlem, Zobrazení čočkou Lidské oko, Optické přístroje

Měření malé deformace předmětu pomocí metody korelace. polí koherenční zrnitosti

Analýza a zpracování digitálního obrazu

FYZIKA. Oční vady. 9. ročník

Termovizní měření. 1 Teoretický úvod. Cíl cvičení: Detekce lidské kůže na snímcích z termovizní i klasické kamery

Zásady centrování brýlových čoček II. LF MU Brno Brýlová technika

Gymnázium Vincence Makovského se sportovními třídami Nové Město na Moravě

Gullstrandovo schématické oko

Měření a analýza parametrů rohovky

Grafika na počítači. Bc. Veronika Tomsová

Světlo jako elektromagnetické záření

Jménem celého našeho týmu Vás vítám na naší prezentaci týmového projektu. Petr Kolář, Jan Šír, Kristýna Juchelková, Jakub Vraný

Modelování blízkého pole soustavy dipólů

Multimediální systémy. 02 Reprezentace barev v počítači

Presbyopie a související

F. Pluháček. František Pluháček Katedra optiky PřF UP v Olomouci

Digitální fotografie. Mgr. Milana Soukupová Gymnázium Česká Třebová

Metody preventivního vyšetřování zraku

DIGITÁLNÍ FOTOGRAFIE

Derivační spektrofotometrie a rozklad absorpčního spektra

Digitalizace a zpracování obrazu

STUDIUM HLADINOVÉHO ELEKTROSTATICKÉHO

VYSOKÉ UČENÍ TECHNICKÉ V BRNĚ FAKULTA STROJNÍHO INŽENÝRSTVÍ

1 Jasové transformace

ZPRACOVÁNÍ OBRAZU PRO VYHODNOCENÍ SEGREGACE DRÁTŮ

Cejchování kuželové pětiotvorové sondy pro vysokorychlostní aerodynamická měření

MULTIMEDIÁLNÍ A HYPERMEDIÁLNÍ SYSTÉMY

20x optický zoom, velmi rychlé a citlivé automatické zaostřování, vysoce citlivý snímač s vysokým rozlišením 720p.

MY PROGRESIVNÍ ČOČKY JAK NA TO

Maticová optika. Lenka Přibylová. 24. října 2010

Měření charakterizace profilu a tloušťky vrstev optickou metodou

A HYPERMEDIÁLNÍ MULTIMEDIÁLNÍ SYSTÉMY OBRAZOVÁ DATA SVĚTLO ZPRACOVÁNÍ OBRAZU OBRAZ. Jak pořídit statický obraz

Inovace a zkvalitnění výuky prostřednictvím ICT Technické vybavení Digitální fotoaparáty Ing. Jakab Barnabáš

Měření vlastností optických vláken a WDM přenos

08 - Optika a Akustika

Kamera do auta s IR osvětlením a podporou SD karet HQS-205A

Libor Kasl 1, Alois Materna 2

ČESKÉ VYSOKÉ UČENÍ TECHNICKÉ V PRAZE

ŠABLONY INOVACE OBSAH UČIVA

Kalibrační proces ve 3D

GIS ANALÝZA VLIVU DÁLNIČNÍ SÍTĚ NA OKOLNÍ KRAJINU. Veronika Berková 1

Kontaktní čočky Biofinity Energys

Reranking založený na metadatech

4. Napjatost v bodě tělesa

Jsou všechny žárovky stejné?

Seminární práce Lidské oko Fyzika

Meo S-H: software pro kompletní diagnostiku intenzity a vlnoplochy

ČOS vydání ČESKÝ OBRANNÝ STANDARD ÚSŤOVÉ REKTIFIKAČNÍ DALEKOHLEDY ZBRANÍ TYPY, ZÁKLADNÍ PARAMETRY

OTDR Optical time domain reflection

Defektoskopie a defektometrie

Transkript:

ALGORITMUS ANALÝZY SNÍMKŮ Z DIGITÁLNÍHO FOTOSCREENERU VIrA J.Dušek*, V. Mrňávek**, M. Dostálek*** * Ústav biofyziky a informatiky, 1. Lékařská fakulta, Karlova univerzita, Praha ** Katedra radioelektroniky, Fakulta elektrotechnická, České vysoké učení technické, Praha *** Centrum pro funkční poruchy vidění, Nemocnice Litomyšl, Litomyšl Abstrakt Článek popisuje algoritmus analýzy snímků z digitálního fotoscreeneru VIrA vytvořený v programovém prostředí MATLAB. Videometrický systém VIrA (Video Infrared Ambliodetector) se skládá ze dvou částí. První měřící část je složena z digitálního fotoaparátu SONY DSC F828 pracujícího v režimu focení nightshot a zdroje měřícího infračerveného světla. Fotoaparát je vybaven speciální předsádkou pro umožnění focení za podmínek fotoexcentrické refrakce. Druhou částí je pak obrazová analýza která je popisovaná v tomto článku. Výsledkem analýzy je výstupní protokol o vyšetření pacienta. 1 Úvod Centrum pro funkční poruchy vidění Nemocnice v Litomyšl provádí od roku 2000 rutinní populační fotoscreening amblyogenních očních vad u 9 až 12 měsíčních dětí ze své spádové oblasti. K fototestům je používán přístroj založený na upraveném fotoaparátu Yashica 109, který snímky zaznamenává na běžný kinofilm. Hodnocení analogových záznamů (fotografií) excentrické fotorefrakce s bodovým zdrojem měřícího světla je pouze orientační. Je zatíženo chybami, které souvisí s použitou metodou fotorefrakce dle [1], ale především se subjektivním hodnocením snímků, prakticky bez možnosti proměření sledovaných parametrů. Podobně jako v jiných oblastech obrazové medicínské dokumentace, nabízí digitální formát záznamu a následná obrazová analýza další možnosti zkvalitnění v hodnocení a archivaci fotoscreeningu. První práce Schaeffela a kol na tomto poli [2] nalezly uplatnění v komerčně dostupném refraktoru PowerRef II firmy PlusOptix (Mnichov, D). Námi navržený algoritmus obrazové analýzy digitálních fotorefrakčních snímků je založený na úplnější a stabilnější extrakci dat z obrazových informací a ověřuje možnost individuální kalibrace měření refrakce. 2 Materiál a metody Digitální fotoscreener VIrA (Video Infrared Ambliodetector) se sestává z měřícího infračerveného systému, kontrolního počítače a dvou fixačních monitorů jak je uvedeno na obrázku 1. Měřící infračervený systém je složen z digitálního fotoaparátu SONY DSC-F828 (pracující v nightshot režimu citlivému na blízké infračervené světlo) se speciálně upravenou předsádkou pro excentrickou fotorefrakci, obsahující zdroj světla. Předsádka umožňuje pořídit fotky očí ve třech meridiánech (0, 120, 240 ). Zdroj světla je konstruován jako vícebodový podobně jako používá Schaffel [3]. Jsou použity LED diody HSDL 4230. Ty jsou střídavě zapínány pouze v době měření (sejmutí jednoho snímku) a to ve skupinách po třech. Vlnová délka v oblasti infračerveného spektra je volena záměrně, tak aby nerozptylovala pacientovu pozornost. Pacientova pozornost je v době odběru snímku fixována pomocí fixačního videa na blízký nebo vzdálený monitor. Varianta dvou monitorů je volena kvůli kalibraci pomocí známé vzdálenosti mezi oběma monitory. Jako blízký monitor je použit Fujitsu Siemens Pocket PC POCKET LOOX 710 a jako vzdálený pak LCD display řídícího počítače. Je odebrána sada šesti snímků tři pro tři meridiány blízkého fixačního monitoru a tři pro tři meridiány vzdáleného monitoru. Obrázky jsou přehrány do řídícího počítače kde probíhá jejich analýza. Program pro analýzu byl napsán v programovém prostředí Matlab, které je vhodné pro návrh a řešení podobných úloh. Ukázka screenshotu programu je na obrázku 2.

Blízký fixační displej Vzdálený fixační displej L V Digitální fotoaparát Fotorefrakční předsádka L B Pacient 3 2 1 Obrázek 1: Schéma přístroje VIrA Obrázek 2: Grafická ukázka testovacího skriptu Korneální a retinální reflexy jsou detekovány v obou očích a na všech obrázcích. Použitím Hirsbergerova principu [4] je korneální reflex (I. Purkyňův obrázek) použit pro detekci horizontální a vertikální heterotropie. Jako ekvivalent vergence je použita vzdálenost mezi středem I. Purkyňova obrázku a středem čočky. Refrakční stav oka je potom dán analýzou rozložení jasového retinálního reflexu obdrženého za podmínek excentrické fotorefrakce. Blokové schéma obrazové analýzy je na obrázku 3. Prvním krokem obrazové analýzy je detekce obou zornic. Pro tuto detekci je vypočítán vertikální a horizontální profil maximálních jasových hodnot v obraze. V horizontálním profilu se detekují dvě maxima každé pro jedno oko. Následně jsou z celého osmi-mega pixelového obrázku vybrány dvě oblasti zájmu které slouží pro další zpracování (každá obsahuje jedno oko). Na tyto oblasti zájmu je aplikováno prahování a jsou tak určeny pixely s maximálním jasem, které reprezentují I. Purkyňovi obrázky (PO). Následně jsou spočítány dle [5] těžiště zornic a je určena pixelová vzdálenost mezi těžištěm levého a pravého oka tzv. interpupilární vzdálenost (Centres Distance - CD). Průměrná skutečná interpupilární vzdálenost (pupila distance - PD) může být určena podle speciálního empirického vzorce (vstupní hodnotou je věk dítěte) nebo manuálně měřidlem. Poměr PD/CD je použit jako kalibrační konstanta K z pixelů na milimetry. Středy (těžiště) I. Purkyňových obrázků jsou počítány stejně jako středy (těžiště) zornic [5]. Dále je spočtena hodnota vertikální a horizontální vzdálenosti mezi středy I. Purkyňových obrázků a středy zornic (Horizontal and Vertical Deviation - HVD). Je stanoveno dominantní oko jako oko s nejmenší horizontální vzdáleností. Úhel deviace je stanoven pomocí Hirsbergrova vzorce: β = HD K H, (1) kde β je měřený úhel [ ], HD je horizontální vzdálenost mezi I. PO a středem zornice [px], H je Hisgergrův index [ /mm] a K je konverzní konstanta [mm/px]. Jako ukazatel horizontální a vertikální heterotropie je použit rozdíl těchto hodnot mezi pravým a levým okem. Hodnoty jsou v úhlech. Pro další analýzu je z obrázků odstraněn I.PO a nahrazen průměrem jasu okolních pixelů. Z těchto modifikovaných obrazů je spočten průměrný jas v zornici a průměry obou zornic, vše pro levé a pravé oko Základem další analýzy je vypočítání průměrovaného vertikálního jasového profilu (obrázek 4). Pro každý meridián je spočten jeden profil. Počítání v meridiánech 120 a 240 probíhá stejně jako pro 0 meridián jen je napřed obraz rotován do pozice 0. Profil je počítán jako průměrná hodnota jasových horizontálních řad pixelů zornice. Profil je dále proložen přímkou pomocí lineární regrese. Směrnice profilu odpovídá refrakčnímu stavu oka v příslušném meridiánu. Pro další analýzu jsou hodnoty směrnice vyneseny do vektorogramu v příslušné úhlové hodnotě daného meridiánu. Vzdálenost koncového bodu příslušného vektoru je dána velikostí směrnice proložené přímky. Díky modelování paprskové optiky je výsledný kužel vystupují z pacientova oka podobný ve zjednodušeném případě elipse. Vedlejší poloosa elipsy udává sférickou a rozdíl mezi hlavní a vedlejší poloosou cylindrickou vadu. Natočení elipsy pak úhel astigmatismu. Z příslušného vektorgramu je metodou nejmenších čtverců (MSE) rekonstruována charakteristická elipsa. Pro rekonstrukci je díky symetrii využito šesti bodů (tři původní a tři symetrické). Příklad rekonstrukce ukazuje obrázek 5. Kalibrace profilů je provedena pomocí dvou sad měření na vzdáleném a blízkém fixačním monitoru. Kalibrační veličinou je známá vzdálenosti mezi monitory. Tato hodnota definuje hodnotu defokusu (v dioptriích) a je použita pro kalibraci. Poté je akomodace

přepočtena jako defokus do nekonečna (jako např. do 6m). Poslední počítanou hodnotou je rozdíl mezi sférickou a cylindrickou složkou levého a pravého oka. 3 Výsledky Hlavním výsledkem jsou vypočítané hodnoty sférické a cylindrické vady obou očí včetně osy astigmatismu. Dalším důležitým parametrem jsou průměrné hodnoty jasu obou očí. Dalším výsledkem Set of 6 images (3 near fixation 3 far fixation) inputs outputs Pupil Detection Pupil Gravity Center Pupilar Centres Distance (CD) Manual Control and Correction of Pupilar Distance I. PI Detection I. PI Gravity Center PD/CD Ratio for Pixel to mm Conversion Pupilar Distance (PD) Determination Based on the Age of Patient Horizontal and Vertical I.PI Deviation (HVD) from the Centre of Pupils HVD to Angle Conversion using Hirsberger index Hirsberger index Dominatnt Eye Identification (using HVD) PI -Purkynje Image Gaze Corection HVD Difference Between Both Eyes I. PI Removal Average Brightness Intensity of Pupil Pupil Diameter Evaluation Average Brightness Intensity Profile from the Pupil Image Eye Characteristic Ellipse Fitting Using MSE Method Fixation Displays Distance Calibration Line Determination for Intensity Profile Slope to Diopter Conversion Defocus Cylindrical Dioptric Power and Angle Determination Defocus Spherical Dioptric Power Determination Refractive Power Difference Between Both Eyes Obrázek 3: Blokové schéma obrazové analýzy 120 90 45 0 90 I 0.15 0.1 0.05 0-0.05 270 270-0.1-0.15-0.2-0.4-0.3-0.2-0.1 0 0.1 0.2 0.3 Obrázek 4: Vertikální průměrovaný jasový profil Obrázek 5: Rekonstrukce charakteristické elipsy

obrazové analýzy jsou hodnoty sférické a cylindrické anisometropie, vertikální a horizontální heterotropie a průměry zornic. Vždy je stanoven rozdíl mezi levým a pravým okem. Všechny tyto hodnoty jsou následně sumarizovány v přehledném výsledkovém protokolu který generuje Matlab jako HTML stránku (viz obrázek 6). Součástí protokolu jsou také pacientovy identifikační údaje (jméno, příjmení, datum narození ) a také kontrolní výřezy obou očí z digitálního fotoscreeneru. U každého z nich jsou uvedeny vypočtené údaje o sférické, cylindrické dioptrické vadě a ose astigmatismu. Dále je zde přehledně uveden výsledek testu a doporučení (zda jsou příslušné hodnoty v normě, nebo je třeba pacienta dále sledovat či pozvat na detailnější vyšetření). Obrázek 6: Výsledkový protokol pacienta 4 Závěr Navržená a realizovaná analýza obrazu pro digitální fotoscreener VIrA je dostatečně přesná aby byla schopna detekovat ambliogenní oční vady u malých dětí. Výsledky analýzy jsou reprodukovatelné a dostatečně robustní. Ve výsledném protokolu o vyšetření pacienta je možné detekovat především nesymetrické hodnoty některých ukazatelů, které ukazují na možné závažné onemocnění např. různé typy tumorů. Také je v protokolu uvedena sada parametrů amblogenních očních vad. Systém je otevřen a nadále vyvíjen. Především je zdokonalována část obrazové analýzy. Dalšími kroky bude co možná největší zpřesnění kalibrace a statistické vyhodnocování významnosti a

užitečnosti počítaných parametrů. Dále budou statisticky sledovány doporučení systému pro pacienty a porovnány s výsledky detailnějších vyšetření. Poděkování Tento výzkum byl podporován organizací MICEP (Medical Information Centre for European Projects), institutem 1. Lékařské fakulty Karlovy univerzity v Praze. MICEP byl založen grantem MŠMT č. 207020. Více informací na www.micep.cuni.cz Literatura [1] BOBIER, W. R., BRADDICK, O. J.(1985): Eccentric photorefraction in Optical analysis and empirical measures, Am. J. Optom. Physiol. Opt. 62, pp. 614-620. [2] SCHAEFFEL, F., FARKAS, L., HOWLAND, H. C. (1987): Infrared photoretinoscope Appl. Opt. 26, pp. 1505-1509. [3] ROORDA, A., CAMPBELL, M. C. W., BOBIER, W.R. (1997): Slope-based eccentric photrefraction: theoretical analysis of different light source configurations and effects of ocular aberrations, J. Opt. Soc. Am. A., 14, pp. 2547-2556. [4] HIRSCHBERG J. (1885): Ueber Messung des Schielgrades und Dosirung der Schieloperation, Centralbl. Prakt. Augenh, 8, pp. 325-327. [5] SONKA, M., HLAVAC, V., BOYLE, R., (1998): Image Processing and Machine Vision, PWS Publishing, Pacific Grove CA, USA, pp. Kontaktní adresy J. Dušek Jaroslav.dusek@lf1.cuni.cz V. Mrňávek Mrnavv1@fel.cvut.cz M. Dostálek Dostalek@lit.cz