Přítomni: viz. prezenční listina Zápis ze zasedání Vědecké rady MOÚ dne 6.5.2014 Jednání VR zahájil náměstek ředitele MOÚ pro vědu, výzkum a výuku, doc. MUDr. Marek Svoboda, Ph.D. A) PREZENTACE GRANTOVÝCH PROJEKTŮ I. Nové projekty: 1. IGA: NT/14600-3/2013, MOÚ hlavní řešitel Korelace obrazu MR spektroskopie v oblasti hipokampu a poškození kognitivních funkcí u pacientů po ozařování mozkovny Hlavní řešitel: MUDr. Petr Pospíšil Předmětem projektu je posouzení korelace změn koncentrace neuronálního markeru NAA v oblasti hipokampu pomocí moderních neurozobrazovacích metod (MRS) a alterace kognitivních funkcí po paliativním ozáření mozkovny. Východiska: Poškození kognitivních funkcí způsobené RT - významně negativní dopad na kvalitu života Hipokampus hraje hlavní roli v dlouhodobé paměti explicitní - uchovávání konkrétních vzpomínek a faktických znalostí Optimalizace léčby pacientů s mozkovými MTS - zejména těch s perspektivou delšího přežití Snaha minimalizovat radiační poškození šetřením některých částí mozku - oblast hippokampu Cíle: Nalezení vzájemné souvislosti mezi biochemickými pochody (projevující se změnou prostorového rozložení koncentrace metabolitu NAA) v oblasti hipokampu a alterací kognitivních funkcí po ozáření Přispět tak k zavedení šetrnějších způsobů radioterapie do klinické praxe (hippocampal avoidance radiotherapy) 2. IGA: NT/14120-3/2013, MOÚ spoluřešitel Využití pokročilých MR technik v diagnostice recidivy high-grade gliomů po komplexní onkologické léčbě. Hlavní řešitel: prof. MUDr. Pavel Šlampa, CSc. Hlavním řešitelem je doc. Jančálek NCh klinika a ICRC FN u sv. Anny, projekt má za sebou první rok řešení. Projekt řeší využití funkční MR v diagnostice recidivy či pseudoprogrese po konkomitantní chemoradioterapii u high-grade gliomů. Souhrnná publikace od řešitelského kolektivu na toto téma vyšla v časopise s IF. Noví pacienti jsou do souboru zařazovaní bez větších problémů. 3. GA ČR: 14-24931P Název: Elektrochemické metody pro bioanalýzu nukleových kyselin a jejich aplikace v diagnostice nádorových onemocnění. Hlavní řešitel: Mgr. Martin Bartošík, Ph.D. Prezentoval 2 hlavní subprojekty v rámci projektu elektrochemická detekce mikrorna
krátké RNA molekuly regulující genovou expresi vazbou na mrna ovlivňují tedy syntézu onkoproteinů i tumor supresorových proteinů elektrochemická analýza DNA metylace epigenetická modifikace, při které je metylován 5 -uhlík na cytosinu reguluje genovou expresi změněné metylační vzorce DNA mohou vést ke karcinogenezi Cíle: detekce mikrorna optimalizovat nedávno vyvinutý protokol pro detekci specifických sekvencí mikrorna (2 publikace v rámci RECAMO) zvýšit citlivost metody aplikovat protokol pro reálné vzorky porovnat s jinými metodami analýza DNA metylace optimalizovat publikovaný protokol pro rozlišení metylcytosinu a cytosinu v krátké DNA použít delší fragmenty, např. promotory genů Financování projektu (cca 230 tis. Kč na materiál a služby ročně) Materiál: chemikálie na značení mikrorna magnetické kuličky a membrány pro purifikaci vzorků syntéza modifikovaných vazebných sond metylační kity, PCR chemikálie elektrody a příslušenství Metody: elektroanalytické techniky srovnávací metody (real-time PCR, digital PCR,...) 4. GA ČR: 14-19250S Název: Nový panel proteinů korelujících se stavem lymfatických uzlin u low-grade nádorů prsu: Klinická verifikace a úloha v invazivně nádorových buněk. Hlavní řešitel: Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. Cílem projektu je : klinická validace identifikovaného panelu proteinů na širším souboru nádorů prsu z Tkáňové banky MOÚ (N=500) Funkční studie: Studium úlohy identifikovaných proteinů v prometastatických mechanismech na a) buněčné úrovni b) molekulární úrovni II. Ukončené projekty:
1. IGA: NT/11214-4/2010, MOÚ hlavní řešitel - Identifikace a funkční charakterizace mikrorna s prediktivním významem u pacientů s glioblastomem - Hlavní řešitel: doc. RNDr. Ondřej Slabý, Ph.D. Cílem projektu bylo: Identifikovat mirna asociované s více agresivním fenotypem GBM, které by umožňovaly predikovat celkové přežívání, čas do progrese onemocnění a odpověď na standardně užívanou léčbu u pacientů s GBM. Popsat jejich zapojení do mechanizmů chemoradiorezistence GBM. 2. IGA: NT/11089-4/2010, MOÚ spoluřešitel - Diagnostický význam amplifikace genů hterc a MYCC při vzniku a vývoji cervikálních intraepiteliálních dysplázií a karcinomu děložního hrdla - Hlavní řešitel: MUDr. Lucie Mouková, Ph.D. 3. IGA: NT/11128-4/2010, MOÚ spoluřešitel - Endoluminální radiofrekvenční ablace tumorů postihujících žlučové cesty - Hlavní řešitel: MUDr. Igor Kiss, Ph.D. 4. GA ČR: P301/11/2076, MOÚ spoluřešitel - Vazba na DNA, stresem indukovaná exprese a transaktivační aktivita izoforem proteinu p73 - Hlavní řešitel: Mgr. Jitka Holčáková, Ph.D. Vazba na DNA, stresem indukovaná exprese a transaktivační aktivita izoforem proteinu p73 Řešitel: Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i., Mgr. Hana Pivoňková, Ph.D. Cíl projektu: systematicky prozkoumat DNA vazebné vlastnosti izoforem p73 (včetně vlivu struktury DNA a jejího poškození), porovnání s ostatními členy p53 rodiny, jejich vzájemnou interferenci při vazbě na DNA a při buněčné odpovědi na stresové stimuly. Cíle spoluřešitele při řešení grantového projektu: 1. Příprava expresních vektorů se sekvencemi pro izoformy p73 2. Příprava specifických protilátek pro izoformy p63/p73 3. Příprava p73 rekombinantních proteinů 4. Analýza interakcí proteinů p53 rodiny Plnění cílů grantového projektu: 1. Příprava expresních vektorů pro bakteriální, eukaryotický a bakulovirový systém se sekvencemi: TAp73α, β, γ, δ a ΔNp73α, β, γ, δ 2. Příprava specifických monoklonálních a polyklonálních protilátek rozeznávajících TA/ΔNp63 a ΔNp73, úspěšně testovány pro použití na western blot, imunohistochemické barvení a imunoprecipitaci. Protilátky byly použity v publikacích: Veselska R, Neradil J, Nekulova M, Dobrucka L, Vojtesek B, Sterba J, Zitterbart K. Intracellular distribution of the ΔNp73 protein isoform in medulloblastoma cells: a study with newly generated rabbit polyclonal antibodies. Histol Histopathol. 2013 Jul;28(7):913-24.
Loljung L, Coates PJ, Nekulova M, Laurell G, Wahlgren M, Wilms T, Widlöf M, Hansel A, Nylander K. High expression of p63 is correlated to poor prognosis in squamous cell carcinoma of the tongue. J Oral Pathol Med. 2014 Jan;43(1):14-9. doi: 10.1111/jop.12074. Nekulova M, Holcakova J, Nenutil R, Stratmann R, Bouchalova P, Müller P, Mouková L, Coates PJ, Vojtesek B. Characterization of specific p63 and p63-n-terminal isoform antibodies and their application for immunohistochemistry. Virchows Arch. 2013 Sep;463(3):415-25. doi: 10.1007/s00428-013-1459-4 B) PLÁN IPO 2014 Doc. Svoboda informoval o odevzdání průběžné zprávy o výzkumu v MOÚ na MZ ČR 01/14 (termín pro sepsání 14 dnů!!!) Vlastní zpráva 261 stran Poděkování Skupina dr. Vojtěška / RECAMO Skupina doc. Slabého /KKOP 4 klinická pracoviště opakovaně urgována, 2 nedodala zprávu vůbec Poskytnuto 6 888 000 Kč Nedočerpáno 18 230 Kč (0,2 %) Financovány 4 nové projekty PPV IPO 2014-7 189 000 Kč přiděleno zřizovatelem 25/03/2014 (a to bez znalosti bodové produkce za výsledky výzkumu v roce 2012!!!) Režie 360 000 Kč 50 % přímo tvůrcům uvolněno 80 % 3 549 000 Kč 20 % ponecháno jako rezerva po dopočítání bodové produkce 50 % Programy NVVV Program podpory výzkumu (PPV) 2 032 000 Kč (včetně osobních nákladů a odvodů) Program publikační podpory (PPP) 362 995 Kč (odměny pouze pro nejúspěšnější týmy, správně dedikující) Program technické podpory (PTP) 1 154 000 Kč (digitalizace, cestovné, statistik, služby, osobní) PROGRAM PODPORY VÝZKUMU 8 projektů / 6 financováno 2 externí hodnotitelé Standardizované hodnocení Vědecká / výzkumná kvalita projektu (max 50 bodů) Úplnost a kvalita řešitelského týmu (max 11 bodů) Technická realizovatelnost (Ano/Ne)
C) PUBLIKAČNÍ AKTIVITA ZAMĚSTNANCŮ MOÚ 2013 Celkem 119 in extenso prací v českých a zahraničních recenzovaných časopisech Z toho 62 prací v časopisech s IF Souhrnný IF dosáhl výše 384,149 (2012 267,575) Ostatní články (nerecenzovaná periodika): 23 Monografie: 2 zahraniční a 4 české Přednášková činnost a posterové prezentace: Zahraniční akce: 47 Tuzemské akce: 178 Afiliace a dedikace PŘÍKAZ ŘEDITELE 2/2013, platnost od 1.6.2013. Všechny publikace musí nést dedikaci, tj. vyjádření podpory: IPO (institucionální podpora): CZ: "Podpořeno MZ ČR - RVO (MOÚ, 00209805)." EN: "Supported by MH CZ - DRO (MMCI, 00209805)." Všech relevantních projektů realizovaných v MOÚ, které práci autora/spoluatorů podpořily (např. granty, rozvojové projekty, včetně banky biologického materiálu, pokud se se vzorky od pacientů pracovalo). Které všechny publikace? Všechny původní a přehledové práce publikované v recenzovaných odborných časopisech, a to bez ohledu na skutečnost, zda se jedná o časopisy domácí nebo zahraniční, s impakt faktorem (IF) nebo bez něj, vydávané v elektronické nebo tištěné podobě, které vznikly z prostředků MOÚ (včetně dat, včetně financí poukázaných na účet MOÚ z jiných institucí) a/nebo na nich pracoval/i autor (spoluator/spoluautoři) v rámci svého pracovního úvazku v MOÚ. Odpovědnost za vykazování afiliace a dedikací Za uvedení afiliace a dedikace/í do publikace je zodpovědný ten zaměstnanec MOÚ, který je v pořadí autorů uvedený jako první. Nelze-li dedikaci/e uvést, je nutné to oznámit pracovníkům ÚsVVP před přijetím publikace do tisku nebo zveřejněním v elektronické podobě. Zaměstnanci zodpovědní za vykazování afiliace a dedikace/í, předají vedoucímu Odborné knihovny MOÚ příslušnou publikaci v elektronické podobě do 30 dnů od jejího vydání. Vykazování afiliace jiných institucí a dedikací projektů realizovaných mimo MOÚ MOÚ neomezuje počet vykazovaných afiliací/dedikací. Odpovědnost za správné vykazování afiliací pracovištím mimo MOÚ nesou jejich zaměstnanci, kteří se na dané publikaci autorsky/spoluautorsky podílejí. D) EVROPSKÉ PROJEKTY RECAMO, 2010-2014: stav proběhla DR, odevzdaná SelfEvaluation report, bude vizitace zde, připravuje se NPU, odevzdání 15.5.2014 IntegRECAMO: do 2015, personální zabezpečení RECAMO RELICEO: zdržení stavební připravenosti, průběžné plnění dílčích indikátorů (není to zcela hladké)
BBMRI_CZ: Významný posun, schválen BBMRI.ERIC, projekt realizován se spolupříjemci, řada mezinárodních aktivit, může být prostor pro Horizon2020 cestou BBMRI.ERIC. E) OSTATNÍ BOD 2014 Doc. Svoboda informoval o průběhu BOD 2014. Bylo prezentováno 341 příspěvků, 275 přednášek, 59 bloků, zúčastnilo se 39 vystavovatelů a proběhlo 11 přidružených jednání. Sběr do tkáňové banky Projekt neoadjuvance karcinomu prsu Vytváříme protokol pro odběry vzorků do TB Serum/plasma zdravých osob Vytvoření kontrolní kohorty Jiné Agentura zdravotnického výzkumu MZ ČR MOÚ zaslalo návrhy na členy panelů Výzva se předpokládá v letošním roce Je žádoucí, aby bylo podáno co největší množství kvalitních grantových projektů (zapojení pracovníků s vědeckou hodností) Klinické hodnocení fáze I/II 11-C Methionin Poslední pacient zařazen 03/2014 Termín příští vědecké rady je 7.10.2014. Zapsala: Radka Babáková Kontroloval: doc. MUDr. Marek Svoboda, Ph.D.