BiochemNet vytvoření sítě pro podporu spolupráce biomedicínských pracovišť a zvýšení uplatnitelnosti absolventů biochemických oborů v praxi Laboratorní workshop s teoreticko praktickou ukázkou molekulárně biologických technik ve spolupráci s firmou ROCHE Termín: 28. května 2013 (úterý, mezi 8:00 15:00 hod.) a 29. května 2013 (středa, mezi 8:00 15:00 hod.) Místo konání: Ústav biochemie pavilon A15 místnost 227, Kampus MU Brno Bohunice, Masarykova Univerzita, Přírodovědecká fakulta, Kamenice 5, Brno Program: Stanoviště 1 (Mgr. Lucie Vondráčková): Ukázka automatické a manuální izolace DNA Roche umožní izolaci DNA z plné krve na automatickém izolátoru nukleových kyselin MagNA Pure Compact viz www.magnapure.com pomocí izolačního kitu MPC total NA isolation kit I) resp. manuální izolaci DNA z plné krve pomocí kolonkové izolační soupravy High Pure PCR Template Preparation Kit. Výstupem bude vyeluovaná lidská DNA. Stanoviště 2 (Ing. Viktor Horváth, Ph.D.): Demonstrační diagnostická real time qpcr detekce trombofilních mutací Roche dodá real time PCR přístroj LightCycler 2.0 www.lightcycler.com, dále kit pro molekulární PCR detekci trombofilní mutace Leidenský faktor V. V rámci experimentu se naprogramuje PCR profil dle doporučení výrobce kitu, napipetuje se PCR reakce do reakčních kapilár (master mix, kontrolní DNA, beztemplátová kontrola) a uskuteční se real time qpcr detekce s vyhodnocením genotypu pomocí analýzy křivek tání (což je v dnešní době standard v oblasti molekulární PCR diagnostiky) Stanoviště 3 (Mgr. Petr Lněnička): Ukázka analýzy detekce genové exprese housekeepingového genu pomocí real time PCR Roche zabezpečí real time PCR přístroj LightCycler 96 resp. LightCycler Nano, lidskou cdna, dále master mix pro real time qpcr pro detekci genové exprese s TaqMan sondami a UPL detekční systém např. pro vybraný housekeepingový gen (sonda + primery). Výstupem kvantifikační analýzy bude stanovení cq hodnot u detekovaného genu pomocí analyzačního software dodávaného s přístrojem Předpokládaný čas teoretické přednášky o prováděné metodice a experimentální práce u každého stanoviště je 1,5 hod.
Pro koho je laboratorní workshop určen: Laboratorní workshop je určen zejména studentům biochemických oborů partnerských univerzit. Tito studenti budou na workshop registrováni přednostně. První den workshopu (28. 5. 2013) bude zaměřen na studenty, kteří jsou v daných technikách začátečníky nebo o nich mají pouze základní povědomí. Druhý den (28. 5. 2013) se zaměří na studenty, kteří se s problematikou již setkali a mají o ní pokročilejší znalosti. Počet míst: Počet míst na každém laboratorním workshopu je 18. Časový harmonogram: 28. května 2013 a 29. května 2013 (8 15:00 hod.) 8.00 hod. 8.15 hod. Registrace účastníků 8.15 hod. 8.40 hod. Úvodní slovo o Roche s.r.o. (Mgr. Dalimil Žůrek, Roche s.r.o.) 8.40 hod. 8.50 hod. Úvod do organizace dne, rozdělení účastníků do skupin, krátké seznámení s programem na jednotlivých stanovištích a představení vedoucích stanovišť) odchod do laboratoří, přechody mezi jednotlivými laboratořemi zajistí zaměstnanci PřF MU Brno. 8.50 hod. 10.20 hod. Práce v skupinách na jednotlivých stanovištích (viz program). Teoretický výklad metodiky kombinovaný s praktickým experimentem. 10.20 hod. 10.40 hod. Coffee break 10.40 hod. 12.10 hod. Práce v skupinách na jednotlivých stanovištích (viz program). Teoretický výklad metodiky kombinovaný s praktickým experimentem. 12.10 hod. 12.55 hod. Přestávka na oběd (oběd formou bufetu zajištěn) 13.00 hod. 14.30 hod. Práce v skupinách na jednotlivých stanovištích (viz program). Teoretický výklad metodiky, kombinovaný s praktickým experimentem. 15.00 hod. Ukončení akce
Životopisy vedoucích jednotlivých stanovišť Mgr. Petr Lněnička Datum narození: 13. 6. 1977 1991 1995 Gymnázium Na vítězné pláni, Praha 1997 2003 Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova, magisterské studium Obor: biologie odborná, Specializace: molekulární biologie Téma diplomové práce: Analýza funkce proteinu OrfI a serin / threoninových proteinkinas Streptomyces granaticolor 1999 2003 Laborant, student Laboratoř buněčné signalizace MBÚ AV ČR, Vídeňská 1083, Praha 4, PSČ 142 20 2003 2007 Vědecký pracovník Laboratoř buněčné signalizace MBÚ AV ČR, Vídeňská 1083, Praha 4, PSČ 142 20 2007 2012 Klinický bioanalytik pro lékařskou genetiku; vědecký pracovník Laboratoř molekulární genetiky ÚBLG 1LF UK a VFN, Albertov 4, Praha 2, PSČ 228 00 2012 dosud KAM AS a aplikační specialista pro sekvenaci Roche s.r.o.
Ing. Viktor Horváth, Ph.D. Datum narození: 5. 8. 1978 1992 1996 Gymnázium L.Novomeského, Bratislava, SR 1996 2001 Chemickotechnologická fakulta STU v Bratislava, SR inžinierske štúdium Obor: biochemie a mikrobiologie Téma diplomové práce: Biologický účinok chinazolínových derivátov in vitro 2001 2002 Virologický ústav, Slovenská Akadémia Vied, Bratislava, SR doktorandské štúdium 2002 2006 Biofyzikální ústav AV ČR, Brno a Přírodovědecká fakulta MU, Brno doktorandské studium Obor: Fyziologie živočichů Téma dizertační práce: Protinádorový účinek platinových adamantanových derivátů in vitro 2002 2006 Laboratoř cytokinetiky Biofyzikální ústav AV ČR, Královopolská 135, Brno, 612 65 2006 2009 Key Account Manager Roche Applied Science, Roche s.r.o., Praha 2009 dosud Senior Key Account Manager Roche Apllied Science, Roche s.r.o., Praha
Mgr. Lucie Vondráčková Datum narození: 16. 2. 1977 1991 1995 Gymnázium Voděradská, Praha 1995 2000 Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova, magisterské studium Obor: biologie odborná, Specializace: genetika Téma diplomové práce: Chromozomální změny u pacientů s chronickou myeloidní leukémií 2000 2001 Studentka, Laboratoř molekulární biologie Biologický ústav 1. LF UK, Praha 2002 2008 Key Account Manager, Sigma Aldrich, s.r.o., Praha 2008 dosud Key Account Manager, Roche, s.r.o., Praha