ODŮVODNĚNÍ VEŘEJNÉ ZAKÁZKY s názvem ZAŘÍZENÍ PRO ANALÝZU FOTOSYNTÉZY CEITEC MU vyhotovené podle 156 zákona č. 137/2006 Sb., o veřejných zakázkách, v platném znění (dále jen Zákon o VZ) 1. ODŮVODNĚNÍ ÚČELNOSTI VEŘEJNÉ ZAKÁZKY 1. Popis potřeb, které mají být splněním veřejné zakázky naplněny Zakázka je zadávána a financována z Operačního programu Výzkum a vývoj pro inovace v rámci projektu CEITEC středoevropský technologický institut, registrační číslo projektu CZ.1.05/1.1.00/02.0068. Jejím cílem je naplnění plánovaného účelu projektu, který společně připravují nejvýznamnější brněnské univerzity a výzkumné instituce, a to vybudování evropského centra excelence v oblasti věd o živé přírodě a pokročilých materiálů a technologií. Projekt má být ukončen nejpozději do 31. 12. 2015. 2. Popis předmětu veřejné zakázky Předmětem podlimitní veřejné zakázky je dodávka zařízení pro analýzu fotosyntézy. Zakázka se skládá ze dvou položek - Chlorophyll Fluorometr (č. 2) a Přenosného fotosyntetického systému s možností integrace modulu fluorescence chlorofylu (č. 1) Přístroji budou vybaveny laboratoře programu "Genomika a proteomika rostlinných systémů" projektu CEITEC - Středoevropského technologického institutu. 3. Popis vzájemného vztahu předmětu veřejné zakázky a potřeb zadavatele Položka č. 1 - Přenosný systém pro měření výměny plynů CO2 a H2O, respirace a fluorescence chlorofylu v kontrolovaných podmínkách. Přístroj umožňuje různé způsoby měření, od rychlých měření míry fotosyntézy až k multifaktoriálním křivkám odpovědi fotosyntézy na proměnné vnějšího prostředí jako je světlo, CO2 či vlhkost vzduchu. Typickými aplikacemi je vyhodnocení asimilace CO2, vodivosti H2O či respirace CO2 v závislosti na koncentraci CO2, světlu, teplotě, vlhkosti vzduchu nebo denního období. PAM fluorometrie a metoda saturačních pulsů umožňují zjištění detailních informací o využití světelné energie fotosystémem II Y (II) a tím přidání důležité informace o primárních fotosyntetických reakcích k datům získaných na základě gas exchange. Získaná data jsou využívána k výpočtu zřejmého elektronového transportu (ETR). Navíc fluorescenční modul
umožňuje měření quenching koeficientů (qp, qn, NPQ). Fo mód umožňuje aplikaci far red light a zápis Fo'. Položka č. 2 - Fluorescence chlorofylu je velmi citlivý indikátor fotosyntézy. Kvantitativní hodnota kvantového výnosu konverze fotosyntetické energie je získávána pomocí Pulse- Amplitude fluorometrie a metodou saturačních pulsů. Z výsledků měření fluorescence může být odvozeno široké rozpětí fotosyntetických parametrů, což nám umožňuje náhled do fotosyntetického stavu všech fotosynteticky aktivních organismů včetně vyšších rostlin, mechů a kapradin, dále různých typů řas, fytoplanktonu a biofilmů. V naší laboratoři budeme používat pro měření chlorofylu modelovou rostlinu Arabidopsis thaliana, plodiny a izolované chloroplasty. S využitím vysoce citlivých CCD kamer a extrémně silných emitujících diod (LED) je možné měřit fluorescenci chlorofylu a její relevantní parametry s využitím metody saturačních pulsů. 4. Předpokládaný termín splnění veřejné zakázky Předmět veřejné zakázky bude realizován na základě smlouvy o dodávce, jež bude uzavřena s vybraným dodavatelem po ukončení zadávacího řízení a výběru nejvhodnější nabídky. Předpokládaný termín splnění veřejné zakázky je uveden v zadávací dokumentaci. Projekt jako celek bude ukončen nejpozději do 31. 12. 2015. 5. Popis rizik souvisejících s plněním veřejné zakázky, která zadavatel zohlednil při stanovení zadávacích podmínek Zadavatel spatřuje riziko zejména v prodlení se zadáním zakázky, čímž mohou být částečně ohroženy plánované cíle projektu CEITEC. 2. ODŮVODNĚNÍ VYMEZENÍ TECHNICKÝCH PODMÍNEK Zadavatel dále zdůvodňuje vymezení technických podmínek veřejné zakázky ve vztahu ke svým potřebám a k rizikům souvisejícím s plněním veřejné zakázky. Zdůvodnění jednotlivých požadavků je uvedeno v příloze tohoto dokumentu. 3. ODŮVODNĚNÍ STANOVENÍ ZÁKLADNÍCH A DÍLČÍCH HODNOTÍCÍCH KRITÉRIÍ A ZPŮSOBU HODNOCENÍ NABÍDEK Zadavatel dále zdůvodňuje stanovení základních a dílčích hodnotících kritérií ve vztahu ke svým potřebám. Zadavatel zvolil jako základní hodnotící kritérium nejnižší nabídkovou cenu, neboť při dodržení stanovených technických podmínek je toto kritérium dostatečnou zárukou výběru kvalitní nabídky za nejnižší cenu. V Brně, dne 23. 7. 2013 Mgr. Jan Sedláček Manažer veřejných zakázek CEITEC MU
PODROBNÉ ODŮVODNĚNÍ VYMEZENÍ TECHNICKÝCH PODMÍNEK dílčí plnění 1: Systém pro měření výměny plynů Základní požadavky zadavatele Je požadována dodávka systému pro měření výměny plynů (Portable Gas Exchange Fluorescence system) pro výzkumnou skupinu "Stresová signalizace a adaptace rostlin" projektu CEITEC - Středoevropský technologický institut. Požadované technické a funkční vlastnosti Požadovaná hodnota Zdůvodnění parametrů 4-kanálový systém pro měření výměny plynů CO2 a H2O Průtok Měření CO2 Měření H2O 2 bateriové jednotky a přídavný zdroj pro použití systému v laboratoři Teplotní rozsah pro měřící jednotku Měřená plocha listu v rozsahu alespoň 320 až 1350 μmol s-1 v rozsahu alespoň 0 až 1900 ppm minimálně v rozsahu 0 až 98% relativní vlhkosti alespoň 0 až +50 C nejméně 7,5 cm2 Nezbytné pro měření fotosyntézy při kontrolovaných podmínkách. Potřebné pro vysoce přesné určování CO 2 a H 2 O. Nezbytné pro správný tok vzduchu přes kyvetu. Nezbytné pro měření fotosyntézy. Měření výměny plynu spočívá v základním principu, kterým jsou změny koncentrací CO 2 a H 2 O určeny průchodem vzduchu komorou s kontrolovanými klimatickými podmínkami, ve které je umístěn rostlinný vzorek. Nezbytné pro měření fotosyntézy. Měření výměny plynu spočívá v základním principu, kterým jsou změny koncentrací CO 2 a H 2 O určeny průchodem vzduchu komorou s kontrolovanými klimatickými podmínkami, ve které je umístěn rostlinný vzorek. Nezbytné pro nabíjení kontrolní jednotky v laboratoři. Pro kontrolu teploty kyvety v závislosti na experimentálních podmínkách. Potřebné pro práci s listy Arabidopsis. Leaf Chamber Fluorometer je fluorometr PAM (pulse-amplitude modulated), který může být použit pro měření vzorků adaptovaných jak na světlo, tak na tmu. Měřené parametry zahrnují Fo, Fm, F, Fm, and Fo, a kalkulované parametry zahrnují Fv, Fv/Fm, Fv /Fm, ΦPSII, qp, qn, NPQ, a ETR.
Sensor pro měření fotosynteticky aktivního světla Světelná intenzita LED PAM fluorometru je regulována světelnými senzory. Sensor pro měření teploty listu Pro správnou regulaci teploty listu. Sensor pro měření okolní teploty Pro správnou regulaci teploty listu. Integrovaný fluorometr Světelný zdroj a světelný výstup fluorometru je neustále proměnný v průběhu celého měření, proto s integrovaným fluorometrem je možné specifikovat jakoukoli úroveň světla bez potřeby změny nastavení či změny filtrů. Světelné křivky mohou být vytvořeny automaticky s použitím AutoProgramů. Světelný zdroj červné a modré světlo o intenzitě 0 až 2000 μmol m-2 s-1 Potřebné pro minimalizaci vlivu světelného zdroje na teplotu listů. Kromě toho je světlo LED snáze kontrolovatelné pomocí PC. Řídící software Kompatibilní s Win XP/Vista, Win 7 32-bit a 64-bit Nezbytné pro synchronizaci složek a souborů na přístroji a uživatelském PC. USB komunikace Pro možnost připojení k jednotce PC. Dotykový displej min. 1000:1, Jas: 380 cd/m2 Pro umožnění zobrazení min. 12 experimentálních proměnných najednou. PODROBNÉ ODŮVODNĚNÍ VYMEZENÍ TECHNICKÝCH PODMÍNEK dílčí plnění 2: Zobrazovací systém pro měření fluorescence chlorofylu a GFP Základní požadavky zadavatele Je požadována dodávka zobrazovacího systému pro měření fluorescence chlorofylu a GFP pro výzkumnou skupinu "Stresová signalizace a adaptace rostlin" projektu CEITEC - Středoevropský technologický institut. Požadované technické a funkční vlastnosti Požadovaná hodnota Zdůvodnění parametrů Kompaktní systém pro kombinované zobrazování fluorescence chlorofylu i GFP Přidaná možnost zobrazení DAPI a H2DCFDA Integrovaná kamera s vysokou citlivostí rozlišení 1392x1040 (15 fps), 30 fps v rozlišení 640 x 480 Pro provádění screeningu fluorescence chlorofylu a GFP bází u Arabidopsis a izolovaných chloroplastů Nutné pro produkci reaktivních druhů kyslíku a determinovanou buněčnou smrt v rostlinách pěstovaných ve stresujících podmínkách Zajišťuje kvalitu obrazu, která je dostatečná pro různé vědecké zobrazovací aplikace. Zvláště vhodné v situacích, kdy je potřeba vysoké dynamické rozpětí.
Integrační čas kamery Osvícení pomocí LED panelů Požadovaná intenzita pro aktinické světlo Požadovaná intenzita pro superpuls Požadované měřící protokoly mikrosekundy až sekundy o vlnových délkách 627 nm a 470 nm min. 3,800 µmol(photons)/m².s min. 7,500 µmol(photons)/m².s FV / FM, Kautsky induction, quenching analysis, steady state fluorescence, multicolor fluorescence Pro kontrolu měřicích světelných blesků, aktinického světla a saturačních blesků, které jsou generovány světelnými zdroji. Kontrolní jednotka může být integrována v kameře. Panely LED a světelný zdroj vytvářející saturační blesky umožňují nastavení v různých úhlech a vzdálenostech od vzorků. Aktinické světlo řídí fotosyntetické reakce při určitých fyziologických hodnotách (minimun 3,800 µmol(photons).m-2.s-1). Superpulsy přechodně redukují pool plastochinonu během vystavení aktinickému světlu. Parametry kinetiky fluorescence chlorofylu jsou extrémně důležitou technikou neinvazivního studia dynamiky fotosyntézy v intaktních rostlinách, řasách a cyanobakteriích při různých růstových podmínkách. Přídavný UV LED panel Pro měření exprese DAPI a H2DCFDA. nejméně 10x10 cm Minimální plocha pro provádění screeningu na Petriho miskách. Zobrazená plocha 8-poziční výměník filtrů Adjustace police pro měřené rostliny do různých výšek Možnost temnostní adaptace měřených rostlin Automaticky přednastavené protokoly i možnost psaní protokolů vlastních motorizovaný a softwarově řízený Pro detekci různých fluorescenčních markérů: GFP, DAPI, H2DCFDA. Aby bylo možné použít rostliny různého vzrůstu. Aby bylo možné použít různé rostlinné vzorky. Nezbytné pro provádění experimentů. Možnost automatického označování zobrazovaných rostlin nebo jejich vybraných částí Pro usnadnění analýzy dat. Možnost kinetické analýzy všech současně zobrazených vzorků Pro usnadnění analýzy dat. Software kompatibilní s Win, možnost exportu dat Nezbytné pro analýzu dat.