Má tajemný clusterin u dětí v septickém stavu aktivitu chaperonu? J. Žurek, P.Košut, M. Fedora



Podobné dokumenty
Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL

Struktura a funkce biomakromolekul KBC/BPOL

Bílkoviny a rostlinná buňka

Regulace translace REGULACE TRANSLACE LOKALIZACE BÍLKOVIN V BUŇCE. 4. Lokalizace bílkovin v buňce. 1. Translační aparát. 2.

Proteiny Genová exprese Doc. MVDr. Eva Bártová, Ph.D.

TRANSLACE - SYNTÉZA BÍLKOVIN

Nukleové kyseliny Replikace Transkripce translace

Exprese genetické informace

Exprese genetické informace

Biologie buňky. systém schopný udržovat se a rozmnožovat

Lodish et al, Molecular Cell Biology, 4-6 vydání Alberts et al, Molecular Biology of the Cell, 4 vydání

(molekulární) biologie buňky

Autophagie a imunitní odpověd. Miroslav Průcha Klinická imunologie Nemocnice Na Homolce, Praha

Zkušební okruhy k přijímací zkoušce do magisterského studijního oboru:

Základy molekulární biologie KBC/MBIOZ

DUM č. 11 v sadě. 37. Bi-2 Cytologie, molekulární biologie a genetika

BUŇKA ZÁKLADNÍ JEDNOTKA ORGANISMŮ

Nukleové kyseliny Replikace Transkripce translace

Výskyt MHC molekul. RNDr. Ivana Fellnerová, Ph.D. ajor istocompatibility omplex. Funkce MHC glykoproteinů

Struktura proteinů. - testík na procvičení. Vladimíra Kvasnicová

2. Z následujících tvrzení, týkajících se prokaryotické buňky, vyberte správné:

Antigeny. Hlavní histokompatibilitní komplex a prezentace antigenu

BÍLKOVINY. V organismu se nedají nahradit jinými sloučeninami, jen jako zdroj energie je mohou nahradit sacharidy a lipidy.

Struktura biomakromolekul

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Translace, techniky práce s DNA

Exprese genetického kódu Centrální dogma molekulární biologie DNA RNA proteinu transkripce DNA mrna translace proteosyntéza

VÝZNAM FUNKCE PROTEINŮ V MEDICÍNĚ

Struktura biomakromolekul

Nukleové kyseliny. DeoxyriboNucleic li Acid

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Struktura a funkce biomakromolekul

ÚVOD DO TRANSPLANTAČNÍ IMUNOLOGIE

Fyziologie AUTOFAGIE. MUDr. JAN VARADY KARIM FNO

Přírodní polymery proteiny

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Nukleové kyseliny Replikace Transkripce, RNA processing Translace

Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK. Anotace. Název školy: Gymnázium, Zábřeh, náměstí Osvobození 20. Číslo projektu:

Biosyntéza a degradace proteinů. Bruno Sopko

Nukleové kyseliny. Nukleové kyseliny. Genetická informace. Gen a genom. Složení nukleových kyselin. Centrální dogma molekulární biologie

V organismu se bílkoviny nedají nahradit žádnými jinými sloučeninami, jen jako zdroj energie je mohou nahradit sacharidy a lipidy.

Testové úlohy aminokyseliny, proteiny. post test

19.b - Metabolismus nukleových kyselin a proteosyntéza

ve srovnání s eukaryoty (životnost v řádu hodin) u prokaryot kratší (životnost v řádu minut) na životnost / stabilitu molekuly mají vliv

rní tekutinu (ECF), tj. cca 1/3 celkového množstv

Biologie buňky. proteiny, nukleové kyseliny, procesy genom, architekura,funkce, mitoza, buněčná smrt, kmenové buňky, diferenciace

Biochemie I. Úvodní přednáška

Genomické databáze. Shlukování proteinových sekvencí. Ivana Rudolfová. školitel: doc. Ing. Jaroslav Zendulka, CSc.

Nukleové kyseliny Replikace Transkripce, RNA processing Translace

Molekulární mechanismy řídící expresi proteinů

DUM č. 10 v sadě. 37. Bi-2 Cytologie, molekulární biologie a genetika

Centrální dogma molekulární biologie

Vybrané funkční vlastnosti bílkovin v potravinách. Aleš Rajchl Ústav konzervace potravin

d) Kanály e) Přenašeče a co-transportéry, mediátory difúze a sekundární aktivní transport f) Intracelulární transport proteinů

Syllabus přednášek z biochemie

Obecná biologie - přednášky

Molekulární základy dědičnosti. Ústřední dogma molekulární biologie Struktura DNA a RNA

PREZENTACE ANTIGENU A REGULACE NA ÚROVNI Th (A DALŠÍCH) LYMFOCYTŮ PREZENTACE ANTIGENU

jedné aminokyseliny v molekule jednoho z polypeptidů hemoglobinu

Vzdělávací materiál. vytvořený v projektu OP VK CZ.1.07/1.5.00/ Anotace. Citrátový cyklus. VY_32_INOVACE_Ch0218.

Intracelulární Ca 2+ signalizace

Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti. Vztah struktury a funkce nukleových kyselin. Replikace, transkripce

Garant předmětu GEN: prof. Ing. Jindřich Čítek, CSc. Garant předmětu GEN1: prof. Ing. Václav Řehout, CSc.

DUM č. 3 v sadě. 37. Bi-2 Cytologie, molekulární biologie a genetika

Nukleové kyseliny. obecný přehled

Biopolymery. struktura syntéza

Specifická imunitní odpověd. Veřejné zdravotnictví

Autofagie a výživa u kriticky nemocného pacienta

Gymnázium Vysoké Mýto nám. Vaňorného 163, Vysoké Mýto

Molekulární diagnostika pletencové svalové dystrofie typu 2A

Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/

RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA

NUKLEOVÉ KYSELINY. Základ života

Biologie buňky. proteiny, nukleové kyseliny, procesy genom, architekura (membrána), funkce mitoza, buněčná smrt, kmenové buňky, diferenciace

Buňky, tkáně, orgány, soustavy

Sylabus témat ke zkoušce z lékařské biologie a genetiky. Struktura, reprodukce a rekombinace virů (DNA viry, RNA viry), význam v medicíně

7. Regulace genové exprese, diferenciace buněk a epigenetika

Metabolismus bílkovin. Václav Pelouch

MOLEKULÁRNÍ BIOLOGIE PROKARYOT

AUG STOP AAAA S S. eukaryontní gen v genomové DNA. promotor exon 1 exon 2 exon 3 exon 4. kódující oblast. introny

UNIVERZITA KARLOVA V PRAZE 3. LÉKAŘSKÁ FAKULTA (tématické okruhy požadavků pro přijímací zkoušku)

5. Lipidy a biomembrány

Využití metod strojového učení v bioinformatice David Hoksza

Inovace studia molekulární a buněčné biologie

Lekce z analýz genových expresních profilů u MM a návrh panelu genů pro ČR. Mgr. Silvie Dudová

BIOLOGIE BUŇKY. Aplikace nanotechnologií v medicíně zimní semestr 2016/2017. Mgr. Jana Rotková, Ph.D.

Vazebné interakce protein s DNA

Nukleové kyseliny Replikace Transkripce, RNA processing Translace

Fotosyntéza. Ondřej Prášil

Základy imunologických metod: interakce antigen-protilátka využití v laboratorních metodách

Struktura a funkce biomakromolekul

MATURITNÍ TÉMATA - CHEMIE. Školní rok 2012 / 2013 Třídy 4. a oktáva

Stavba dřeva. Základy cytologie. přednáška

Kontrola genové exprese

Gymnázium, Brno, Elgartova 3

Následná aktivita: překlad vět, varianta A a B, varianta B pro žáky se SPCHU (příloha 3, a 4)

Základy molekulární a buněčné biologie. Přípravný kurz Komb.forma studia oboru Všeobecná sestra

STRUKTURA PROTEINŮ

Transkript:

Má tajemný clusterin u dětí v septickém stavu aktivitu chaperonu? J. Žurek, P.Košut, M. Fedora Klinika dětské anesteziologie a resuscitace, Lékařská fakulta MU, Fakultní nemocnice Brno

DNA transkripce RNA translace PROTEIN replikace cellular proteins folding, assembly, targeting aminokyseliny, peptidy degradace (turnover) cellular proteins FUNKČNÍ (NATIVE) PROTEIN regulace konformace/ funkce cellular proteins

Spojení biogenese a degradace: non-native native protein Non-native protein: Protein, který není řádně složen, není ve funkčním stavu biogenesis znamená narození bílkovin - přechod mezi non-native k native states - skládání, transport k a přes biologické membrány, chemická nebo strukturální modifikace degradace reprezentuje smrt proteinu, nebo přechod z native k non-native stavu, k základním komponentám - odstraňování proteinů Oba procesy mají svou značku kvality

Buněčný stres Native protein teplo/chlad chemikálie intracelulární změny non-native protein aggregated protein various cellular proteins

Degradace rozvolnění proteolysa proteolysa Protein určený k degradaci * * * peptidy AMK antigen prezentace * Různé buněčné mechanismy

Chaperone-like activity teplo, oxidační stres, chemikálie, mutace labilita proteinů ztráta nativní konformace alternativní agregační forma váží se na proteiny nově vzniklé nebo s narušenou strukturou (ne na fungující) napomáhají vzniku funkční konformace proteinu (stavbě sekundární až kvartérní) mohou zabránit nesprávnému uspořádání nebo je i zvrátit

Chaperone families Eukaryotes Archaea Bacteria - - Trigger Factor NAC NAC - Hsp70 system [Hsp70 system] Hsp70 system prefoldin prefoldin - chaperonins (group II) chaperonins (group II) chaperonins (Group I) small Hsps small Hsps [small Hsps] Hsp90 - [Hsp90] AAA ATPases AAA ATPases AAA ATPases - - SecB - - [PapD/FimC] Hip, Hop, Bag, clusterin, cofactors A-E, calnexin, calreticulin, etc. etc. - -

Molecular chaperones rodina několika strukturálně odlišných proteinů heat shock proteins (HSPs) - GroEL, DnaK, HSP90, HSPs (15 30 kda) HSP70, GroEL umožňují poškozeným proteinům návrat do původního stavu crystallins, small HSPs stabilizují proteiny; neumožňují návrat k původnímu stavu

Místo působení chaperonů je velmi důležité: cytosol membrana organely extracelulárně periplasmaticky např. calnexin; např. clusterin váže velké molekuly extracelul. proteinů vazba na ribosomy solubilní? asociace s určitými strukturami např. chaperonin pro vlastní vazbu např., PapD/FimC - potřeba pro pilus skladbu

The precursor polypeptide chain (top) is cleaved proteolytically to remove the 22-mer secretory signal peptide (magenta) and subsequently between residues 227/228 to generate the (orange)- and (light blue)-chains. These are assembled in anti-parallel to give a heterodimeric molecule (bottom) in which the cysteine-rich centers (red) are linked by five disulfide bridges (red ellipses) and are flanked by two predicted coiled-coil -helices (green) and three predicted amphipathic -helices (dark blue). The six sites of N linked glycosylation are indicated as yellow spots.

proteiny jsou syntetisovány v ribosomech, musí se složit - proteiny v rozložených polypeptidových řetězcích folding - folding - kotranslace - kompletní polypeptidový řetězec assembly

Cíl práce role clusterinu během SIRS a septických stavů u dětí korelace s mortalitou dynamika hladin clusterinu

SIRS Sepse Těžká sepse Septický šok MODS (Multiple Organ Dysfunc. Sy.)

Demografická data n median Min max Muži/Ženy 22/16 Věk (měs.) 38 86.61 1 219 Váha (kg) 38 27.70 2,5 84 PELOD score 38 13.24 1 41 Clusterin (ug/ml) 38 43,43 1,5 129,92 vstupní hodnota Clusterin (ug/ml) MUŽI Věk Mean SD 0-19 let 89,9 16,4 Clusterin (ug/ml) ŽENY Věk Mean SD 0-19 let 93 23

Clusterin vs. exitus Median přeživší 85.04 ug/ml vs. zemřelí 37.36 ug/ml; p= 0,05

n Exitus SIRS Sepse Těžká sepse Septický šok MODS 38 5 11 3 11 13 10 Dynamika Clusterinu (ug/ml) a klinický stav Exitus SIRS Sepse Těžká sepse Septický šok MODS median 37,36 44,3 47,8 40,1 33,2 31 min-max 1,5-53,5 1,5-75,3 34-79,7 19,7-84,6 1,5-76 1,5-80 p value 0,05 1 1 0,29 0,03 <0,001 p-values;fisher's Exact Test

Clusterin a septický šok p= 0,03

Clusterin a MODS p <0,001

Závěr Prokázali jsme signifikantní pokles hladiny Clusterinu u dětí v korelaci s mortalitou a závažností septického stavu.

Klinická budoucnost clusterinu Kontrola buněčných interakcí Regulace apoptosy Působí jako membránový policista Transport lipidů Regulace komplementového systému

Děkuji za pozornost