12. Zhášení fluorescence

Podobné dokumenty
7. Měření fluorescence při excitaci kontinuálním světlem ( steady-state )

Fluorescenční rezonanční přenos energie

Vlastní fluorescence proteinů

Luminiscence. Luminiscence. Fluorescence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) chemicky (chemiluminiscence)

Ustálená fluorescence (Steady State Fluorescence)

Luminiscence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) fluorescence, fosforescence. chemicky (chemiluminiscence)

Barevné principy absorpce a fluorescence

4 Přenos energie ve FS

Moderní nástroje pro zobrazování biologicky významných molekul pro zajištění zdraví. René Kizek

(Návod k praktiku) Produkty. I.typ II.typ. X 1 Σ + g nm nm. Kyslík

Interakce fluoroforu se solventem

Barevné principy absorpce a fluorescence

Anizotropie fluorescence

Barevné hry se světlem - co nám mohou říci o biomolekulách?

Spektrometrické metody. Luminiscenční spektroskopie

FLUORIMETRICKÉ STANOVENÍ FLUORESCEINU

ATOMOVÁ SPEKTROMETRIE

6. Metody molekulové spektroskopie spektrofotometrie, luminiscenční metody

ENERGETICKÉ INTERAKCE DONOR-AKCEPTOROVÝCH PÁRŮ PRO PŘEMĚNU SLUNEČNÍ ENERGIE

KOMPLEXY EUROPIA(III) LUMINISCENČNÍ VLASTNOSTI A VYUŽITÍ V ANALYTICKÉ CHEMII. Pavla Pekárková

Metody spektrální. Metody molekulové spektroskopie. UV-vis oblast. Evropský sociální fond Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti

ATOMOVÁ SPEKTROMETRIE

Optické spektroskopie 1 LS 2014/15

Fluorescence (luminiscence)

Emise vyvolaná působením fotonů nebo částic

Typy přechodů. Luminiscence a struktura látek E. Základní pravidla. Struktura organických molekul a luminiscence základní pravidla

Diskutujte, jak široký bude pás spojený s fosforescencí versus fluorescencí. Udělejte odhad v cm -1.

1. Principy fluorescenční spektroskopie

aneb Fluorescence chlorofylu jako indikátor stresu

Barevné hry se světlem - co nám mohou říci o biomolekulách?

VYSOKÉ UČENÍ TECHNICKÉ V BRNĚ

Úvod do spektrálních metod pro analýzu léčiv

Základy vakuové techniky

Elektromagnetické záření. lineárně polarizované záření. Cirkulárně polarizované záření

Luminiscence. Luminiscence. Fluorescence. emise světla látkou, která je způsobená: světlem (fotoluminiscence) chemicky (chemiluminiscence)

Struktura atomů a molekul

Försterův rezonanční přenos energie (FRET)

Vybrané technologie povrchových úprav. Základy vakuové techniky Doc. Ing. Karel Daďourek 2006

Nekovalentní interakce

Přednáška IX: Elektronová spektroskopie II.

Přednáška 4. Úvod do fyziky plazmatu : základní charakteristiky plazmatu, plazma v elektrickém vf plazma. Doutnavý výboj : oblasti výboje

PŘENOS ENERGIE VE STUDIU HYDROFOBNÍCH DOMÉN KOLOIDNÍCH SYSTÉMŮ

Nekovalentní interakce

Otázky k předmětu Optické spektroskopie 1

Doporučená literatura

- Rayleighův rozptyl turbidimetrie, nefelometrie - Ramanův rozptyl. - fluorescence - fosforescence

Ing. Pavel Hrzina, Ph.D. - Laboratoř diagnostiky fotovoltaických systémů Katedra elektrotechnologie K13113

Úvod do laserové techniky KFE FJFI ČVUT Praha Michal Němec, Plynové lasery. Plynové lasery většinou pracují v kontinuálním režimu.

Fluorescenční sondy. Fluorescenční sondy. Indikátory pro anorganické ionty. Fluorescenční sondy pro využití v analytické chemii, medicíně a biologii

FIA fluorescenční imunoanalýza (fluorescence immuno-assay) CIA chemiluminiscenční imunoanalýza

SPEKTRÁLNÍ METODY. Ing. David MILDE, Ph.D. Katedra analytické chemie Tel.: ; (c) David MILDE,

Metody analýzy povrchu

Nukleární Overhauserův efekt (NOE)

Metody analýzy povrchu

ČASOVĚ ROZLIŠENÁ FLUORESCENCE SYSTÉMŮ POLYMER-TENZID

Úvod do fyziky tenkých vrstev a povrchů. Spektroskopie Augerových elektron (AES), elektronová mikrosonda, spektroskopie prahových potenciál

Rychlost chemické reakce A B. time. rychlost = - [A] t. [B] t. rychlost = Reakční rychlost a stechiometrie A + B C; R C = R A = R B A + 2B 3C;

13. Spektroskopie základní pojmy

Chemická kinetika. Chemické změny probíhající na úrovni atomárně molekulové nazýváme reakční mechanismus.

Spektroskopie subvalenčních elektronů Elektronová mikroanalýza, rentgenfluorescenční spektroskopie

Spektroskopické metody. převážně ve viditelné, ultrafialové a blízké infračervené oblasti

Výběr fluoroforu.

Pokročilé biofyzikální metody v experimentální biologii

7 Fluorescence chlorofylu in vivo

02 Nevazebné interakce

METODY ANALÝZY POVRCHŮ

Molekulová spektroskopie 1. Chemická vazba, UV/VIS

1. Příloha 1 Návod úlohy pro Pokročilé praktikum z biochemie I

Luminiscenční analýza Použití luminiscenční spektroskopie v analytické chemii

Od kvantové mechaniky k chemii

Inovace profesní přípravy budoucích učitelů chemie

CHARAKTERIZACE MATERIÁLU II

VYSOKÉ UČENÍ TECHNICKÉ V BRNĚ

VYSOKÉ UČENÍ TECHNICKÉ V BRNĚ

Plazmové metody. Základní vlastnosti a parametry plazmatu

Dynamické procesy & Pokročilé aplikace NMR. chemická výměna, translační difuze, gradientní pulsy, potlačení rozpouštědla, NMR proteinů

Luminiscence. Luminiscence = studené světlo Inkandescence = teplé světlo

Barva produkovaná vibracemi a rotacemi

Kapitoly z fyzikální chemie KFC/KFCH. VII. Spektroskopie a fotochemie

Přednášky z lékařské biofyziky Biofyzikální ústav Lékařské fakulty Masarykovy univerzity, Brno

ABSORPČNÍ A LUMINISCENČNÍ SPEKTROMETRIE V UV/Vis OBLASTI SPEKTRA

Teorie Molekulových Orbitalů (MO)

Při reálném chromatografickém ději nikdy nedojde k ustavení rovnováhy mezi oběma fázemi První ucelená teorie respektující uvedenou skutečnost byla

Laserová technika prosince Katedra fyzikální elektroniky.

Pokročilé cvičení z fyzikální chemie KFC/POK2 Vibrační spektroskopie

Fotovodivost. Destička polovodiče s E g a indexem lomu n 1. Dopadající záření o intenzitě I 0 a hν E g. Do polovodiče pronikne záření o intenzitě:

ABSORPČNÍ A LUMINISCENČNÍ SPEKTROMETRIE V UV/Vis OBLASTI SPEKTRA

INSTRUMENTÁLNÍ METODY

Počítačový model plazmatu. Vojtěch Hrubý listopad 2007

Typy molekul, látek a jejich vazeb v organismech

Časově rozlišená fluorescence

Absorpční fotometrie

Víceatomové molekuly s jedním centrálním atomem

Mezimolekulové interakce

9. Chemické reakce Kinetika

Rentgenová spektrální analýza Elektromagnetické záření s vlnovou délkou 10-2 až 10 nm

Fluorescenční mikroskopie

Molekuly 2. Víceatomové molekuly s jedním centrálním atomem. Hybridizace. Hybridizace sp 3. Hybridizace

Transkript:

12. Zhášení fluorescence

Dynamické zhášení fluorescence (collisional quenching) Jeli molekula fluoroforu v excitovaném stavu, srážka s jinou molekulou (např. I, O 2, akrylamid) může způsobit nezářivý přechod do základního stavu S 1 S 0 k A k E k N k Q.[Q] Pravděpodobnost srážky je přímo úměrná koncentraci zhášedla Bez zhášedla V přítomnosti zhášedla Kvantový výtěžek (intenzita) fluorescence F 0 QY = N N E A = k E ke + k N F QY = N N E A = k E + ke k + N k Q [ Q] τ 0 = 1 k + E k N Střední doba života τ = 1 ke + kn + k Q [ Q]

Dynamické zhášení fluorescence SternVolmerova rovnice F0 τ 0 = = 1+ K [ Q] = 1+ k τ [ Q] Q q 0 F τ K Q SternVolmerova zhášecí konstanta k q bimolekulární zhášecí konstanta (typické hodnoty 10 9 10 10 M 1 s 1 ) k 0 = 4πN A (R f +R q ) (D f +D q ) k q = f Q.k 0 k 0... difúzní bimolekulární rychlostní konstanta f Q... účinnost zhášení (pro standardně používaná zhášedla bývá f Q 1) Smoluchowského rovnice N A... Avogadrova konstanta POZOR NA JEDNOTKY! R f,r q... kolizní poloměr (účinný průřez) molekul fluoroforu a zhášedla D f,d q... difúzní koeficienty fluoroforu a zhášedla Nízké hodnoty k q zpravidla značí nepřístupnost fluoroforu, vysoké hodnoty zpravidla ukazují na vazebnou interakci

Statické zhášení (static quenching) Fluorofor vytvoří komplex s jinou molekulou komplex již neemituje fluorescenci (např. fluorescein + antifluorescein). [ FQ] [ F][ Q] K = D. Celková koncentrace fluoroforu [F] T je dána [F] T = [F] + [FQ] Dosazením dostáváme [ F] T [ F] 1 = [ F][ Q] [ Q] [ F] T [ ] F* FQ* hν A hν E hν A F + Q FQ K D = 1. F a prostou úpravou s uvážením, že intenzita fluorescence F je přímo úměrná koncentraci volného fluoroforu [F] dostáváme F F 0 = 1+ K [ Q] (14.35) SternVolmerova rovnice (srovnej s dyn. zhášením) D Statické zhášení mění intenzitu fluorescence (množství emitujících molekul) ale ne střední dobu života! Statické zhášení taktéž poskytuje informace o přístupnosti fluoroforu

Rozlišení statického a dynamického zhášení Lakowicz Principles of Fluorescence Spectroscopy, 2.ed., Kluwer/Plenum, 1999 1) Změnou teploty 2) Změřením τ

Současné statické a dynamické zhášení Díky statickému zhášení je schopná emitovat pouze nezkomplexovaná frakce fluoroforů f = I/I 0 = 1/(1 + K S [Q]) Pokud navíc dochází ke koliznímu zhášení, pak je část těchto molekul zhasnuta díky kolizím, takže f 0 /f = 1 + K D [Q] Takže pro výslednou intenzitu fluorescence můžeme psát F 0 /F = (1 + K S [Q]) (1 + K D [Q]) = 1 + (K D +K S ) [Q] + K D K S [Q] 2 SternVolmerův graf je tedy zakřiven nahoru, což je indikací současného statického a dynamického zhášení. k Lineární je potom graf (F 0 /F 1) / [Q] vs. [Q] F* q [Q] FQ* k (F 0 /F 1) / [Q] = (K D +K S ) + K D K S [Q] N +k E F + Q K S FQ 1 F 0 /F τ 0 /τ (F 0 /F1) / [Q] K D +K S směrnice = K D K S 0 [Q] 0 [Q]

Sféra akce I pro zhášedlo, které zháší fluorescenci kolizně můžeme při vysokých koncentracích pozorovat zakřivení SternVolmerova grafu nahoru. Při vysokých koncentracích roste pravděpodobnost, že se nějaké zhášedlo nachází v momentě excitace dostatečně blízko fluoroforu (v tzv. sféře akce V Q ) a neumožní mu emitovat fluorescenci (podobně jako při statickém zhášení), lze spočítat z Poissonovské distribuce a je rovna exp ([Q]N A V Q ) Pro vysoké koncentrace zhášedla je tedy i při dynamickém mechanismu zhášení přesnější psát F0/F = (1 + K Q [Q]) exp([q]n A V Q ) Typické hodnoty N A V Q jsou 13 M 1, což odpovídá sféře akce o poloměru zhruba 1 nm.

Heterogenní populace fluoroforů Předpokládejme, že fluorescence je tvořena dvěma populacemi fluoroforů, takže v nepřítomnosti zhášedla F 0 = F 0a + F 0b = f a F 0 + (1f a ) F 0 kde f a je frakční příspěvek komponenty a ke steadystate intenzitě. V přítomnosti zhášedla je intenzita fluorescence rovna f af F = 1+ K a 0 [ Q] + ( 1 f a ) F0 1+ K [ Q] b Graf F 0 /F vs. [Q] je pak zakřiven směrem dolů. Pokud je jedna z frakcí zcela nepřístupná, tj. K b = 0, pak se dá rovnice upravit na F0 1 1 = + F F f K Q f 0 a a [ ] a a lineární je tedy graf F 0 /(F 0 F) vs. 1/[Q]. F 0 /F F 0 / (F 0 F) 2.0 1.8 1.6 1.4 1.2 K A =5 M 1, f A =1 K A =5 M 1, K B = 0.5 M 1, f A =0.5 K A =5 M 1, K B = 0, f A =0.5 1.0 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 6 5 4 3 2 1 1/f A [Q] (M 1 ) K A =5 M 1, f A =1 K A =5 M 1, K B = 0, f A =0.5 0 0 2 4 6 8 10 1/[Q]

Quenchingresolved spektra F F 0 ( λ) ( λ) = 1 + i f i ( λ) [ Q] K i http://pfast.phys.uri.edu/background/background.php

Mechanismy způsobující zhášení 1) Intersystémová konverze Zhášedlo při srážce s fluoroforem v excitovaném singletním stavu způsobí jeho přechod do excitovaného tripletního stavu. Tripletníčas má dlouhou dobu života, takže může být velmi účinně zhášen celou řadou dalších mechanismů, a také pravděpodobnost zářivého přechodu z T 1 do S 0 je malá. k ISC F* + Q F T * Q k N teplo teplo Zhášedla způsobující intersystémovou konverzi molekulární kyslík O 2 jodid

Mechanismy způsobující zhášení 2) Přenos elektronu indukovaný světlem (photoinduced electron transfer, PET) Tyto mechanismy se uplatňují např. ve fotosyntéze nebo v solárních článcích Valeur B. Molecular Fluorescence, Wiley, 2002

Mechanismy způsobující zhášení 3) Tvorba excimerů a exciplexů Excimer = excitovaný dimer jsou tvořeny při srážce excitované molekuly se stejnou neexcitovanou molekulou M* + M (MM)* Exciplex = excitovaný komplex jsou tvořeny při srážce excitované molekuly s jinou molekulou v základním stavu M* + Q (MQ)* Tvorba excimerů a exciplexů je proces řízený difúzí a závisí tedy na koncentraci látek, na viskozitě prostředí a na teplotě. Excimer nebo exciplex může relaxovat do základního stavu nezářivě, nebo emitovat na jiných vlnových délkách. monomer dimer http://www.invitrogen.com/site/us/en/home/ References/MolecularProbesThe Handbook/TechnicalNotesandProduct Highlights/LipidMixingAssaysof MembraneFusion.html

Mechanismy způsobující zhášení 4) Přenos protonu indukovaný světlem (photoinduced proton transfer) Acidobazické vlastnosti molekuly nejsou stejné v základním a excitovaném stavu. Nejzajímavější jsou případy, kdy kyseliny nebo báze jsou silnější v excitovaném stavu než v základním. V těchto případech může excitace způsobit přenos protonu. Ar = aromatický systém Valeur B. Molecular Fluorescence, Wiley, 2002

APLIKACE

Senzory Senzory mohou být založeny jak na dynamickém tak na statickém zhášení Senzor TNT Senzor ph Steadystate fluorescence quenching of CALIXPET in chloroform solution (1.0 10 6 M) with TNT (1.485 10 4 M to 1.11 10 3 M; top to bottom); excited at 325 nm in the right angle geometry. Insets A and B refer to uncorrected and corrected Stern Volmer plots, respectively. Costa et al., Sensors and Actuators B: Chemical 161: 251 260, 2012 http://www.nuigalway.ie/nanoscale/stars.html

Intramolekulární Senzory zhášení Detekce kyslíku Zhášení tryptofanové fosforescence Strambini et al., Photochem. Photobiol. 80(3):462470. 2004 http://www4.dcu.ie/chemistry/asg/schazmb2/index.shtml

Prostorová přístupnost Porovnáváme fluorescenci v přítomnosti zhášedla s fluorescenci bez zhášedla F0 F =1+ K Q [ Q] SternVolmerova zhášecí konstanta závisí na přístupnosti fluoroforu. k q = K Q /τ Bimolekulární zhášecí konstanta Lakowicz Principles of Fluorescence Spectroscopy, 2.ed., Kluwer/Plenum, 1999

Konformační změny Mg 2+ MgATP Na 2 ATP F404 W411 F571 W385 F404 A W411 F571 W385 F404 W411 F571 W385 F683 ATP F426 F683 ATP F426 F683 ATP F426 S732 S732 S732 I627 I627 I627 V648 V648 V648

Vliv náboje + + + + + + Absorpční (excitační) spektrum fluoresceinu Zhášení fluoresceinu pomocí I 10 K SV (M 1 ) 8 6 4 Fluo Fluo 2 400 420 440 460 480 500 excitation wavelength (nm)

Elektrostatický potenciál na Quenching by iodide povrchu proteinů + + Quenching of W683 K Q (M 1 ) KI K Q (M 1 ) acrylamide K Q (KI)/ K Q (AA) no substrate 10,3 ± 1,2 5,7 ± 0,4 1,8 Na 2 ATP 12,2 ± 1,4 4,0 ± 0,4 3,1

Změny po navázání ligandu geometrie F404 W411 F571 W385 ATP F683 F426 S732 F404 A W411 F571 W385 F683 ATP F426 S732 F404 W411 F571 W385 ATP F683 F426 S732 I627 I627 I627 V648 V648 V648 Mg 2+ MgATP Na 2 ATP ESP

Geometrie vs. ESP

Změny po navázání ATP + 0

Shrnutí Dynamické zhášení srážka fluoroforu v excitovaném stavu s molekulou zhášedla způsobí přechod fluoroforu do základního stavu bez vyzáření fotonu. Statické zhášení fluorofor vytvoří se zhášedlem komplex, který není schopen emitovat fluorescenci. V nejjednodušším případě je pro oba typy zhášení závislost intenzity fluorescence na koncentraci zhášedla popsaná SternVolmerovou rovnicí. Rozlišení typu zhášení změřením doby života fluorescence, změnou teploty Mechanismy zhášení intersystémová konverze, přenos elektronu nebo protonu indukovaný světlem, tvorba excimerů a exciplexů. Aplikace senzory, analýza terciální struktury biomolekul.