Karyotypová evoluce štírků rodu Chthonius (Pseudoscorpiones: Chthoniidae) v oblasti Alp
|
|
- Arnošt Bláha
- před 6 lety
- Počet zobrazení:
Transkript
1 Univerzita Karlova v Praze Přírodovědecká fakulta Katedra zoologie Diplomová práce Karyotypová evoluce štírků rodu Chthonius (Pseudoscorpiones: Chthoniidae) v oblasti Alp Karyotype evolution of Pseudoscorpions of the genus Chthonius (Pseudoscorpiones: Chthoniidae) in the Alps Autor: Bc. Jana Kotrbová Vedoucí diplomové práce: RNDr. František Šťáhlavský, PhD. Konzultant diplomové práce: Mgr. Věra Opatová, PhD. Praha 2015
2 Ráda bych poděkovala svému školiteli RNDr. Františku Šťáhlavskému, PhD. a své konzultantce Mgr. Věře Opatové, PhD. za odbornou pomoc, cenné rady a trpělivost při vedení mé diplomové práce. Poděkování dále patří i mé rodině, která mně studium umožňuje a plně mě v něm podporuje. Prohlášení o původnosti práce Prohlašuji, že jsem předkládanou diplomovou práci na téma Karyotypová evoluce štírků rodu Chthonius (Pseudoscorpiones: Chthoniidae) v oblasti Alp vypracovala samostatně s použitím citované literatury. V Praze Podpis...
3 Abstrakt Diplomová práce přináší cytogenetickou a molekulárně fylogenetickou analýzu 13 (respektive 15) druhů štírků rodu Chthonius z oblasti Alp. Studovaný materiál zahrnuje celkem tři podrody Chthonius (Chthonius), Chthonius (Ephippiochthonius) a Chthonius (Globochthonius). Cytogenetické metody odhalily, že se diploidní počet chromosomů u analyzovaných druhů z oblasti Alp pohyboval v rozmezí Pohlavní chromosomální systém byl zjištěn u všech zkoumaných samců v podobě X0, kdy pohlavní chromosom je vždy metacentrický a představuje největší chromosom v jádře. Dále byla u samců tohoto rodu potvrzena achiasmatická meióza charakteristická pro tuto čeleď štírků. Morfologické typy chromosomů a velikostní diferenciace chromosomů v karyotypu naznačují, že hlavními chromosomovými přestavbami v karyotypové evoluci štírků rodu Chthonius jsou centrické a tandemové fúze, které způsobují snižování počtu chromosomů. Objevují se i pericetrické inverze, které způsobují změnu akrocentrických chromosomů na dvojramenné. U druhů Chthonius (Ch.) tenuis a Ch. (Ch.) raridentatus byla zjištěna variabilita v počtu a morfologii chromosomů. Vzhledem k synpatrickému výskytu s typickými karyotypovými formami se pravděpodobně jedná o vnitrodruhovou variabilitu. U několika vybraných jedinců byla provedena metoda C-pruhování, která potvrdila umístění konstitutivního heterochromatinu v oblasti centromer, které korespondují s heteropyknotickými knoby na standardních chromosomových preparátech. Molekulárně fylogenetické analýzy byly rekonstruovány s použitím genů cox1 a H3 a nastínily vztahy mezi jednotlivými druhy štírků rodu Chthonius, které jsou mnohem komplikovanější, než se předpokládalo. Monofílie jednotlivých mofrologicky definovaných podrodů se v rámci fylogenetických analýz nepotvrdila a vztahy mezi jednotlivými druhy jsou v mnoha případech stále nejasné, což naznačuje, že řada druhů definovaná za pomoci morfologických znaků vyžaduje další revize.
4 Abstract This master s thesis focuses on cytogenetic and molecular phylogenetic analysis of 13 (respectively 15) pseudoscorpions species of the genus Chthonius from the Alps. Studied material includes three subgenera Chthonius (Chthonius), Chthonius (Ephippiochthonius) and Chthonius (Globochthonius). Cytogenetic methods revealed that the diploid number of chromosomes in the analyzed species from the Alps ranged between All examined males show X0 sex chromosomal system. The sex chromosome is always metacentric and the largest one in the nucleus. Furthermore, the achiasmatic meiosis characteristic for this pseudoscorpion family was confirmed in males of this genus. Morphological types of chromosomes and the size differentiation of chromosomes in karyotype indicate that the main chromosome rearrangements in karyotype evolution in the genus Chthonius are centric and tandem fusion, causing reduction in the number of chromosomes. Ocasinally, pericentric inversion causing a change of acrocentric chromosomes into double-arm ones, has been detected. A possible variability in the number and morphology of the chromosomes has been found in Chthonius (Ch.) tenuis and Ch. (Ch.) raridentatus species. However, given the synpatric occurence of the rare forms with the typical karyotype forms, it could represent an intraspecific variability. In a few selected individuals, where the C-banding method was applied, the location of constitutive heterochromatin in centromere region corresponding to heteropycnotic knobs on standard chromosome preparations has bee confirmed. Molecular phylogenetic analyses were reconstructed using cox1 and H3 genes. The results outlined the relationships between the different species of pseudoscorpions of the genus Chthonius, which are more complicated then previously expected. Monophyly of the morfologicaly defined subgenera was not recovered in present phylogenetic analyses, and the relationships among the species are in many cases still unclear. This indicates that a number of species defined by traditional morphology requires further revision.
5 Obsah 1 Úvod Literární přehled Alpské pohoří oblast výskytu endemických druhů Štírci rodu Chthonius Cytogenetika Cytogenetika štírků Cytogenetika čeledi Chthoniidae Cíle diplomové práce Materiál a metodika Sběr materiálu Cytogenetické metody Příprava chromosomových preparátů C-pruhování Analýza karyotypu Molekulárně fylogenetické metody Izolace DNA Polymerázová řetězcová reakce (PCR) Editace sekvencí a alignment Fylogenetické analýzy Maximum likelihood Bayesovská analýza Výsledky Cytogenetické analýzy Rekonstrukce fylogenetických vztahů Použitý materiál, sekvenace a tvorba alignmentu Fylogenetické analýzy Diskuze Charakteristika karyotypů rodu Chthonius Karyotypová evoluce rodu Chthonius Karyotypová variabilita a možné využití v taxonomii Druhová diverzita a evoluční vztahy u Alspkých druhů rodu Chthonius Závěr Literatura Přílohy... 72
6 1 Úvod Štírci v rámci pavoukovců představují morfologicky velmi uniformní skupinu drobných predátorů, jejichž velikost těla se nejčastěji pohybuje kolem 2mm (Weygoldt 1969). Malá velikost těla a uniformní vzhled tradičně komplikují pochopení skutečné druhové diverzity tohoto řádu. To je případ i čeledi Chthoniidae (a jejího rodu Chthonius). Jedná se o čeleď ve světě druhově bohatě zastoupenou. V Evropě se co do počtu druhů řadí na druhé místo, hned za čeledí Neobisiidae, která je druhově nejbohatší čeledí v Evropě. Pro obě tyto skupiny štírků je charakteristická absence forézie, což výrazně snižuje možnosti jejich šíření (Poinar Jr et al., 1998). Samotný rod Chthonius představuje druhově bohatě zastoupenou skupinu v Alpách, odkud je známo 44 druhů, z toho 12 endemických (Gardini 2013, 2014). Jedná se o velice drobné štírky, jejichž vzhled je spíše uniformní a vyznačují se sedentérním způsobem života. Vzhledem k těmto charakteristikám, je pravděpodobné, že by se v rámci tohoto rodu mohla zjistit skrytá druhová diverzita. Ta je pouze prostřednictvím morfologie těžko odhalitelná. Ke zjištění a popisu kryptické druhové diverzity obecně se v poslední době hojně využívají různé analýzy DNA, které byly nicméně u štírků zatím využity pouze okrajově (např. Wilcox et al. 1997, Van Heerden et al. 2013). Další možností k odhalení kryptických druhů jsou cytogenetické analýzy, které mohou poskytovat informace o karyotypech jednotlivých druhů. Druhy štírků mohou vykazovat specifické karyotypy, které je dobře charakterizují a odlišují od druhů jiných. K tomu je však potřeba znát karyotypové charakteristiky studovaných druhů a dobře popsat případnou karyotypovou variabilitu. V tomto případě narážíme u štírků na nedostatek podrobných analýz, navíc na limitovaném materiálu pocházejícím třeba i jen z jediné lokality. Cytogenetické analýzy již pomohly odhalit kryptický druh štírka Roncus montsenyensis (Zaragoza a Šťáhlavský 2008). Z doposud zjištěných informací vyplývá, že celková variabilita počtu chromosomů v rámci čeledi Chthoniidae je 2n=10-37 (Šťáhlavský a Král 2004, Šťáhlavský 2015). Všechny doposud analyzované druhy vykazovaly X0 systém určení pohlaví. V rámci zkoumaných druhů z Evropy bylo zjištěno, že častým typem přestaveb v evoluci karyotypu jsou pericentrické inverze, centrické fúze a tandemové fúze (Šťáhlavský a Král 2004). Tyto typy přestaveb vedou nejen ke snižování počtu chromosomů, ale také k výrazné velikostní diferenciaci karyotypu. 6
7 Z výše uvedených předpokladů týkajících se existence kryptické druhové diverzity a vzhledem k nedostatku podrobnějších analýz, které by zahrnovaly kombinaci cytogenetických údajů s rekonstrukcí fylogeneze pomocí molekulárních znaků jsem se rozhodla analyzovat karyotypy štírků rodu Chthonius. Práce se zaměřila na oblast Alp, kde se u morfologicky uniformní skupiny štírků dá předpokládat přítomnost možných kryptických druhů. Pro rekonstrukci karyotypové evoluce a lepší pochopení případné vnitrodruhové variability byly do práce zařazeny také molekulárně fylogenetické analýzy, které mohou přesněji specifikovat fylogenetické vztahy analyzovaných taxonů. 7
8 2 Literární přehled 2.1. Alpské pohoří oblast výskytu endemických druhů Alpy jsou nejrozsáhlejší a nejvyšší horský systém v Evropě, ze kterého je zároveň znám i největší počet endemických druhů rostlin i živočichů (Schmitt 2009). Alpy se táhnou mohutným obloukem o délce 1200 km od Ligurského moře na jihozápadě až po Panonskou nížinu na severovýchodě. Celé pohoří se dělí na Východní Alpy a Západní Alpy, a to výraznou příčnou linií nižších částí probíhající od Bodamského jezera nacházejícího se na severu mezi Švýcarskem, Německem a Rakouskem, dále linie prochází údolím řeky Rýn směrem na jih ke Komskému jezeru v Itálii (Šlégl 1999, Kwiatek 2010). Z hlediska geologické stavby můžeme Východní Alpy rozdělit na Centrální krystalické Alpy, Severní vápencové Alpy a Jižní vápencové Alpy (Šlégl 1999). Alpy vznikly před 30 miliony let působením tzv. alpinského vrásnění (alpinská orogeneze). Alpy jsou produktem dvou fází orogeneze, křídové a následující třetihorní orogeneze (Schmid et al. 2004). Na těchto dlouhodobých procesech se podílela nejen desková tektonika, zejména tedy srážení euroasijské a africké litosférické desky v průběhu druhohor a starších třetihor, ale také eroze a různé deformace zemského povrchu. To vše mělo za následek nejenom vyvrásnění nejvyššího evropského pohoří, ale také rozsáhlého pásu mohutných horských systémů, Pyrenejí a Karpat (Biju-Duval et al. 1977, Šlégl 1999, Willet 1999). V období pleistocénu došlo ke glaciální modulaci-pokrytí ledovcem, po jeho ústupu zůstala údolí se strmými stěnami a průřezem ve tvaru písmene U (zformovaná ledovcovými splazy jazyky ledovce), morénami a ledovcovými jezery (Kwiatek 2010). Jak je již výše zmíněno formování Alpského pohoří do současné podoby trvalo miliony let. V období před 2,4 miliony let vzrostlo arktické ledovcové pokrytí, které produkovalo postupně větší ledovcové štíty napříč Eurasií a Severní Amerikou. Během doby ledové byla hlavní pohoří Evropy pokryta rozsáhlými ledovci. Mezi hlavními ledovcovými štíty a jižními horskými bloky byl prostý permafrost, tundra a chladné stepi, které se rozšiřovaly směrem na východ přes Rusko k Uralu. Lze předpokládat, že tato geografie měla velký vliv na pohyb jednotlivých druhů, které tak reagovaly na změny klimatu (Hewitt 1999). Nejen nízké teploty, ale také nedostatek srážek omezil distribuci mnoha živočišných a rostlinných druhů během glaciálních fází v období Pleistocénu (Shmitt 2007). V současné době je většina rostlinných a živočišných druhů rozšířena 8
9 napříč Evropou, ale v době vrcholu glaciace před lety obývaly refugia především na jihu. Během plio-pleistocenních klimatických oscilací umožňovala topografická rozmanitost alpského masivu vznik různých typů glaciálních refugií (Holderegger a Thiel-Egenter 2009), která sloužila jako centra pro následnou kolonizaci po ústupu ledovce (Hewitt 2004, Schmitt 2009). Často jsou popisovány tři typy glaciálních refugií nacházejících se právě v Alpách, které se nazývají nunataky, periferní refugia a nížinná refugia (Holderegger a Thiel-Egenter 2009). Nunataky jsou nezaledněná místa na horských vrcholcích, poskytující prostorově omezené vhodné prostředí (=mikrorefugium), (Rull 2009), alespoň v letních měsících během období glaciálů. Například vysoké horské vrcholky nad ledovcovým štítem evropských Alp se mohly chovat jako nunataky. Taková refugia byla zejména důležitá pro méně mobilní taxony, jako jsou rostliny nebo mnoho druhů hlemýžďů, kteří by nemohli přejít širokou oblast nevhodného prostředí. Periferní glaciální refugia horských druhů se nachází na okraji horského systému. Takovéto periferní glaciální refugium bylo například umístěno podél okraje dříve zaledněných horských systémů, jako jsou Karpaty, Pyreneje nebo evropské Alpy. Nížinné glaciální refugium je oblast mimo horský systém a mimo ledovcové štíty. Takováto refugia poskytla vhodné podmínky prostředí pro organismy, které se objevily v přilehlých horských systémech před nástupem zalednění (Holderegger a Thiel-Egenter 2009). K dalšímu velkému zásahu do horské bioty Alp došlo v období zhruba před lety, kdy se klima oteplilo, led ustoupil a druhy rozšířily svůj rozsah výskytu z refugia směrem na sever. Je zřejmé, že druhy reagovaly individuálně na oteplení podle konkrétního nastavení jejich podmínek pro přežívání v daném prostředí (Hewitt 1999). V Mladším Dryasu, před zhruba lety, přišly vlny chladu a sucha. Když se během tohoto posledního glaciálního cyklu klima ochladilo, areály druhů se posunuly na jižní okraj evropského kontinentu a následně rekolonizovaly severní oblasti během interglaciálů (Schmitt 2007, Borer 2012). Naproti tomu, takové posuny jsou méně dokumentované u taxonů adaptovaných na chladné podmínky, tak jako u těch se současnou alpskou distribucí. V minulosti tyto druhy byly více rozšířené, než jsou dnes, hlavně během dob ledových, kdy se některé z nich vyskytovaly na rozsáhlých evropských stepích (Borer 2012). Poté, co se polární fronta přesunula znovu severně, klima se oteplilo 9
10 a vegetace postupovala rychleji přes Evropu. Před lety se vegetační vzor široce podobal tomu dnešnímu, ale některé vegetační změny pokračují až do současné doby. Daleko na severu Skandinávie zůstaly ledovcové štíty pouze na vrchovinách přibližně od doby před lety. Podobně glaciální bloky na jihu Pyrenejí a Alp se zmenšily a vytvořily menší bariéry pro šíření druhů. Takové náhlé oteplení dovolilo rychlé přesuny druhů přes celou Evropu, zejména tam, kde místa nebyla narušena ledovcem (Hewitt 2004). Vysokohorské systémy, jako jsou právě mimo jiné i Alpy, nabízejí širokou škálu habitatů. Díky altitudinální zonaci ekosystémů se zpravidla vyznačují bohatou druhovou diverzitou a výraznou měrou endemismu. Ten je tradičně vysvětlován geografickou izolací organismů se specializovanými ekologickými preferencemi v relativně malých areálech (Schmitt 2009). Velmi často toto pozorujeme v tzv. sky islands nacházejících se ve vysokohorských systémech. Sky islands jsou habitaty ve vysokých nadmořských výškách, které jsou geograficky izolované mezi různými pohořími (Warshall 1995, McCormack et al. 2009). Pojem sky island byl poprvé použit ve spojitosti s horskými pohořími obklopenými pouští v jihovýchodní Arizoně, která slouží jako útočiště izolovaných horských lesů (Warshall 1995). Existují také habitaty nízkých nadmořských výšek působící jako bariéry pro šíření mezi jednotlivými sky islands, tak jako je tomu u oceánských souostroví. Ve světě je známo přibližně 20 sky islands komplexů s odlišným původem, prostorovým uspořádáním, stářím a historií klimatu. Stejně jako u oceánských souostroví geologické procesy formující sky islands zahrnují vulkanickou aktivitu, erozi a horský zdvih. Tyto procesy poskytují časový odkaz pro stanovení stáří sky islands a zahrnují významné důsledky pro jejich vývoj (Warshall 1995, McCormack et al. 2009). Díky existenci sky islands komplexů je ve vysokohorských systémech přítomno značné množství endemitů. Předpokládá se, že valná většina endemických druhů se v těchto oblastech diferencovala in situ prostřednictvím izolace. Druhy ze sky islands komplexů v mírných oblastech opakovaně měnily svou distribuci v důsledku změn klimatu vyvolanou pleistocénními glaciálními cykly. Změny související se snížením teplot opakovaně umožnily druhům sestoupit do nižších poloh, což způsobilo, že dříve izolované populace mohly opět přijít do kontaktu. Během tohoto procesu může dojít ke 10
11 vzniku hybridních zón. Řada druhů vykazuje hybridní zóny v Evropě, které jsou produktem post-glaciální kolonizace severu Evropy z jižních oblastí (Hewitt 1999). Takto recentně vzniklé druhy mohou být často morfologicky velmi podobné a jejich rozlišení je možné až za pomoci molekulárních metod (Haubrich a Schmitt 2007). U tzv. "jižních druhů" (tzn. teplomilné druhy s rozšířením v oblastech zalesněných refugií poblíž Středozemního moře) některé genetické a morfologické studie ukazují jejich izolaci v několika jižních refugiích během chladných fází pleistocénu a následné severní migrace během interglaciálů, kdy se klima znovu oteplilo. Takové rozsáhlé expanze jsou často spojovány s poklesem genetické diverzity (např. Hewitt 1996, 1999; Schmitt 2007). Molekulární biogeografie "severských druhů" (tzn. chladnomilných druhů s vysokohorskou distribucí) je zcela odlišná od "jižních druhů". Většina z jejich aktuálních distribučních oblastí (tj. Alpy a další evropská pohoří, stejně jako větší zeměpisné šířky) byla značně pokryta masivními ledovci během dob ledových (Haubrich a Schmitt 2007, Schmitt 2009). Tyto glaciální intervaly v pozdním kvartéru trvaly podstatně déle (asi let), než příslušné interglaciály (asi let) (Rull 2009). Proto tyto alpské a chladnomilné druhy nezaujímaly většinu svých současných rozsahů, ale předpokládá se, že značná část těchto druhů narazila na vhodné podmínky pro své rozšíření a mísení populací během glaciálních období, což vede ke snížení genetické diverzity (Haubrich a Schmitt 2007, Schmitt 2009, Schmitt et al. 2014). Po oteplení klimatu v inerglaciálu následoval opět ústup do refugií ve vyšších polohách. Jednotlivá refugia se nacházela na poloostrovech, jako je Pyrenejský, Balkánský a Apeninský, a některá z refugií byla také pravděpodobně poblíž Kavkazu a Kaspického moře (Hewitt 1996, 1999). Nicméně na severu existovala také refugia, která se nacházela v okolí nebo v centru Skandinávského pohoří (Scheel a Hausdorf 2012). Současná uspořádání habitatů v rámci sky islands jsou postglaciální (méně než let) (Warshall 1995, McCormack et al. 2009). Takovéto opakované posuny areálu výskytu, izolace a následné areálové expanze daly vzniknout komplexním fylogeografickým patternům (Hewitt 1996, 1999, 2000), v mnohých případech dlouhodobá izolace v refugiích spojená s redukcí velikosti populací vedla ke vzniku nových druhů (Alarcón 2012, Bálint et al. 2008, Scheel a Hausdorf 2012), jejichž následné rozšíření koreluje se schopností překonávat geologické bariéry v rámci disperse (Essl et al. 2011). Například flóra mediteránních hor nabízí mnoho příkladů úzce příbuzných druhů s disjunktními populacemi, které ukazují omezený genový tok 11
12 v závislosti na geografických bariérách nebo genetickém driftu (Alarcón 2012). Mnoho živočišných a rostlinných druhů je endemických pro některé oblasti Alp. Takové distribuční modely byly interpretovány jako důkaz pro pleistocénní refugia v rámci Alp (Scheel a Hausdorf 2012). V současném rozšíření alpských endemitů se poměrně často setkáváme s organismy, které díky velmi nízké schopnosti disperze nebo úzce specializovaným ekologickým nárokům mají areály výskytu velmi omezené (Tribsch 2004). Mezi takovéto organismy patří například hlemýždi druhu Charpentieria italia (Scheel a Hausdorf 2012) nebo motýli druhu Erebia melampus. Jedinci tohoto druhu motýla jsou většinou sedentérní a tvoří rozsáhlé a stabilní populace v Alpách (Haubrich a Schmitt 2007). Organismy, které byly schopny efektivního šíření, případně se po ústupu ledovce šířili z několika samostatných refugií, však mohou mít areál rozšíření podstatně větší. Například ježek Erinaceus osídlil většinu Evropy se třemi genomy postupujícími severně z pyrenejského, italského a balkánského refugia (Hewitt 1999) Štírci rodu Chthonius Štírci (Pseudoscorpiones) jsou čtvrtým nejpočetnějším řádem v rámci třídy pavoukovci (Araneae) a zároveň se řadí mezi starobylou skupinu suchozemských členovců. Nejstarší štírci byli objeveni z období středního devonu (Schawaller et al. 1991). V současné době je popsáno více než druhů, které jsou dále rozděleni do 439 rodů a 26 čeledí (Harvey 2007, 2011). Tito velice drobní živočichové dosahující velikosti v rozmezí 0,5-12 mm jsou volně žijící predátoři, kteří se vyskytují téměř ve všech suchozemských biotopech na celém světě. Nejčastěji žijí v půdě, pod kameny, pod kůrou nebo v dutinách stromů. Bývají však často nalézáni i v jeskyních, v hnízdech obratlovců či sociálního hmyzu (Beier 1969). Některé skupiny štírků mají tendenci k foretickému chování, které spočívá v přichycení se pomocí makadel k jiným, více mobilnějším organismům. Tím pádem některé druhy hmyzu, savců či snad i ptáků umožňují štírkům osídlit vzdálenější stanoviště, na která by se sami jen těžko dostali (Zeh a Zeh 1992, Judson 2005). Přestože jsou štírci druhově bohatou skupinou, znalosti o jejich skutečné druhové diverzitě jsou spíše omezené jen na lépe prozkoumané oblasti. Mezi taková místa patří zejména Evropa, kde je udávána největší druhová diverzita v jižních oblastech. To je dáno 12
13 nejen intenzivním studiem (zejména v Itálii), ale také obecným pravidlem, že počet druhů roste od pólů směrem k rovníku (Harvey 2007). Čeleď Chthoniidae představuje velice drobné štírky, jejichž velikost těla nepřesahuje 5 mm (Weygoldt 1969). Štírci z této čeledi jsou řazeni do nadčeledi Chthonioidea. Tato nadčeleď je považována za monofyletickou skupinu, ale samotná čeleď Chthoniidae pravděpodobně monofyletická není (Harvey 1992, Murienne et al. 2008). Štírci této skupiny jsou hojní v půdní hrabance, pod kameny a řada druhů se úspěšně adaptovala na život v jeskyních (Harvey 2011, Legg a Jones 1988). Čeleď Chthoniidae je zastoupena zhruba 650 druhy a 28 rody po celém světě, v Evropě je druhou nejpočetnější skupinou štírků s více než 214 druhy a 5 rody, které se vyskytují po celém jejím území (Harvey 2011). Nejpočetnějším rodem této skupiny štírků je rod Chthonius přibližně s 260 popsanými druhy. Stejně jako u dalších druhů štírků obývajících půdní hrabanku se jedná o organismy se sedentérním způsobem života, u kterých, na rozdíl od druhů obývajících tlející dřevo či dutiny stromů, není doložena forézie (Poinar Jr et al., 1998). Z tohoto důvodu lze očekávat, že se u této skupiny štírků vyskytuje skrytá druhová diverzita. Vysoký počet druhů štírků rodu Chthonius je patrný i v Alpách. Rod Chthonius je v Alpách zastoupen celkem 44 druhy, rozdělenými do tří podrodů, Ephippiochthonius, Chthonius a Globochthonius (Gardini 2013, 2014). Řada těchto druhů byla nově popsána, případně vyjmuta z předešlé synonymie na základě recentních morfologických revizí tohoto rodu (Gardini 2013, 2014). Dostatečné množství faunistických údajů z Alp navíc ukazuje, že areály rozšíření jednotlivých druhů se v dané oblasti mohou výrazně lišit (Gardini 2000). Řada jich patří mezi alpské endemity s velmi omezeným areálem výskytu jako druh štírka Chthonius monguzzii (Gardini 2013). Setkáváme se samozřejmě i s druhy, které mají velké areály rozšíření a zasahují svým výskytem i do jiných částí Evropy, například Chthonius tetrachelatus (Gardini 2013). Pokud ale bereme v úvahu sedentérní způsob života štírků rodu Chthonius a relativní morfologickou uniformitu v rámci blízce příbuzných druhů, jeví se jako velmi pravděpodobné, že druhy s takto širokým rozšířením mohou zahrnovat kryptickou druhovou diverzitu, kterou zatím nelze na základě striktně morfologických znaků detekovat. Jinými možnostmi, které by odhalily skrytou druhovou diverzitu, můžou být cytogenetické a molekulární analýzy. Mnoho štírků vykazuje vysokou druhově specifickou variabilitu v karyotypech, jak již bylo zjištěno zejména u rodů Neobisium 13
14 a Roncus z čeledi Neobisiidae. Cytogenetické a molekulární analýzy odhalily kryptickou druhovou diverzitu těchto skupin štírků např. v Karpatech (Šťáhlavský et al. 2008) Cytogenetika Cytogenetika štírků Štírci jsou řádem pavoukovců, pro který je charakteristická podobnost vnější morfologie u mnoha taxonů. Zároveň však štírci vykazují vysokou mezidruhovou variabilitu karyotypů. Cytogenetika je vědní disciplína zabývající se studiem struktury, funkce a evoluce chromosomů. Zkoumá také chování chromosomů během dělení buněk (Michalová a Zemanová 2005). Cytogenetika má poměrně dlouhou historii a je tradiční součástí genetických oborů. Pro tuto práci je důležitá ta část cytogenetiky, zabývající se studiem karyotypů a jednotlivých chromosomů v mitotickém nebo v meiotickém dělení. Postupné zdokonalování metod a technik v cytogenetice má velký význam pro možnost srovnávání karyotypů různých druhů a dalších taxonů (Zima et al. 2004). Samotnému studiu karyotypů musí předcházet získání vhodných tkání. U bezobratlých živočichů se může jednat o gonády. Po získání těchto tkání následuje příprava chromosomových preparátů, po které je možno přejít k samotnému studiu chromosomů (viz. Materiál a metodika). Znalost cytogenetiky členovců se rozšířila v posledních několika desetiletích. Přesto jsou znalosti a informace o karyotypech některých skupin neúplné nebo jsou stále nedostupné. To platí zejména pro některé pavoukovce. Většina znalostí o karyotypech je omezena na 4 řády (pavouci (Araneae), roztoči (Acari), sekáči (Opiliones) a štíři (Scorpiones)), zatímco znalosti o cytogenetice a potažmo karyotypech ostatních řádů jsou z větší části založené pouze na malém množství druhů nebo jsou dokonce stále neznámé (Král 1994, Šťáhlavský a Král 2004). Štírci patří v tomto ohledu mezi řády, které jsou karyologicky prozkoumány stále poměrně nedostatečně. V současné době jsou známy karyotypy 51 druhů z 25 rodů z 8 čeledí (Atemnidae, Garypinidae, Geogarypidae, Cheliferidae, Chernetidae, Chthoniidae, Neobisiidae, Olpiidae) (Šťáhlavský 2015). Jedny z prvních informací o chromosomech štírků byly zveřejněny Sokolowem (1926). Ten v rámci analýzy spermatogeneze popsal průběh meiózy a základní údaje o chromosomech u druhů Neobisium carcinoides (Neobisiidae) a Dendrochernes cyrneus (Chernetidae). Později v podobně zaměřené práci Boissin a Manier (1966) popsali základní informace 14
15 o počtu chromosomů druhu Hysterochelifer meridianus (Cheliferidae). Podrobnější popisy karyotypů nicméně publikoval teprve Troiano (1990, 1997), který zveřejnil podrobné údaje o 6 druzích rodu Roncus z čeledi Neobisiidae z oblasti severní Itálie. Troiano naznačil ve svých pracích možné způsoby karyotypové evoluce v rámci rodu Roncus a upozornil na výrazné rozdíly karyotypů u jinak morfologicky podobných druhů a tudíž na možné využití cytogenetických metod při studiu diverzity štírků (Troiano 1990, 1997). Výrazné mezidruhové rozdíly u štírků potvrzují i všechny následující práce a jasně z nich vyplývá, že karyotypy u štírků se výrazně diverzifikovaly a vykazují vysokou rozmanitost v diploidních počtech chromosomů (viz Šťáhlavský 2015). Existují i práce popisující nový druh štírka, který byl popsán za využití odlišnosti karyotypu. Takovým příkladem je druh Roncus montsenyensis (2n=16) pocházející z Montseny Natural Parku ze Španělska. Tento duh štírka je velice podobný druhu R. cadinensis (2n=38), ale byly zjištěny drobné morfologické rozdíly a zcela odlišný diploidní počet a morfologie chromosomů (Zaragoza a Šťáhlavský 2008). Jednotlivé čeledi štírků jsou různě variabilní v diploidním počtu chromosomů. Diploidní počet některých druhů štírků z čeledi Olpiidae je nejnižším diploidním počtem u štírků a dokonce jedním z nejnižších v rámci třídy Pavoukovci. Jejich zjištěný diploidní počet chromosomů se pohybuje v rozmezí 7-23 (Šťáhlavský et al. 2006). Naopak nejvyšší zjištěný diploidní počet chromosomů se nachází v rámci čeledi Atemnidae. U této čeledi se 2n pohybuje v rozmezí (Šťáhlavský et al. 2012). U štírků samci představují heterogametické pohlaví, které se vyskytuje v podobě dvou systémů chromosomálního určení, a to X0 a XY, z nichž X0 systém pravděpodobně představuje původní stav u štírků. Pohlavní chromosom X si zachovává konzervativní metacentrickou morfologii u většiny studovaných druhů štírků. Pohlavní chromosomy jsou morfologicky dobře rozlišitelné a pozorovatelné při samčí meióze (Šťáhlavský a Král 2004, Šťáhlavský et al. 2006) Cytogenetika čeledi Chthoniidae Většina doposud zkoumaných čeledí štírků je řazena do podřádu Iocheirata, zatímco z podřádu Epiocheirata byla studována pouze jediná čeleď Chthoniidae (Šťáhlavský a Král 2004). Tato čeleď je jedinou evropskou skupinou a nejrozmanitějším členem v rámci podřádu Epiocheirata (Harvey 1992). Z evropských zástupců čeledi Chthoniidae bylo prostudováno 9 druhů štírků, 1 z rodu Mundochthonius a 8 z rodu Chthonius, z nichž 4 náleží do podrodu Chthonius a 4 do podrodu Ephippiochthonius. U studovaných samců této skupiny štírků byla odhalena achiasmatická meióza 15
16 prostřednictvím chromosomů z profáze I. Takovýto způsob meiózy se zdá být charakteristický pro celou čeleď Chthoniidae. V rámci třídy pavoukovci byla achiasmatická meióza popsána u štírů, dále u některých roztočů a pavouků (Šťáhlavský a Král 2004). Achiasmatická meióza je charakterizována absencí fází diplotene a diakinese v meiotické profázi I, z důvodu nepřítomnosti chiasmat mezi homologickými chromosomy. Chiasmata nejsou přítomna, protože nedochází k tzv. crossing-overu (např. Suomalainen 1973, Nokkala a Nokkala 1983). U samců rodu Chthonius bylo zjištěno, že se diploidní počet chromosomů pohybuje v rozmezí od 21 do 37. Všechny doposud analyzované druhy vykazují X0 pohlavní chromosomální systém. V analyzovaných karyotypech tohoto rodu převládají akrocentrické chromosomy. Doposud zjištěné výsledky naznačují, že zástupci čeledi Chthoniidae se příliš neliší v počtu chromosomů a jejich morfologii, jako jiné čeledi štírků, které byly karyologicky studované. Přesto však štírci z čeledi Chthoniidae mohou poskytovat pro případné využitív taxonomii dostatečně rozmanité karyotypy vykazující variabilní morfologii a diploidní počet chromosomů. Předpokládá se, že předek samčího karyotypu štírků rodu Chthonius se skládá ze 17 párů akrocentrických autosomů, které se postupně zmenšují a metacentrického pohlavního chromosomu X. Karyotypová evoluce tohoto rodu je pak pravděpodobně charakterizována redukcí počtu chromosomů, tandemovými a centrickými fúzemi a postupnými změnami akrocentrických chromosomů na dvouramenné prostřednictvím pericentrických inverzí (Šťáhlavský a Král 2004). 16
17 3 Cíle diplomové práce Karyotypová charakteristika štírků rodu Chthonius v oblasti Alp Zjistit možný vliv geografické izolace na karyotypovou diferenciaci této skupiny Rekonstruovat fylogenetické vztahy mezi analyzovanými druhy rodu Chthonius Posoudit, do jaké míry zjištěné vývojové vztahy odpovídají tradiční klasifikaci založené na morfologických znacích a do jaké míry jsou tyto znaky schopny reflektovat reálnou (potencionálně kryptickou) diverzitu 17
18 4 Materiál a metodika 4.1 Sběr materiálu Štírci byli získáváni prosíváním hrabanky pomocí prosívadla nebo individuálním sběrem pod kameny. Pro výrobu chromosomových preparátů bylo sbíráno z lokality standardně 5 jedinců, kteří byli uchováváni živí v lahvičkách s navlhčenou vatou. Na lokalitách, kde se podařilo najít více jedinců, byla většina z nich uložena do 98% lihu. Materiál pochází z období z lokalit pokrývajících velkou část území Alp a celkově zahrnuje přibližně 500 jedinců. Bohužel vzhledem k malé velikosti analyzovaných druhů se podařilo získat data (o karyotypech nebo DNA) pouze u 143 jedinců z 66 lokalit (Tab. 6, Obr. 18A-L, přílohy). Živí štírci byli zpracováváni na chromosomové preparáty co nejdříve po návratu do Čech. K vlastní analýze karyotypu byli přednostně použiti dospělí samci, kteří poskytují výrazně kvalitnější výsledky, než samice. Část jedinců sbírána do čistého lihu byla využita ke kontrole determinace a k doplňující izolaci DNA. 4.2 Cytogenetické metody Příprava chromosomových preparátů Počet a morfologii chromosomů lze pozorovat jen v určitých fázích buněčného dělení, proto je důležité vybrat vhodnou tkáň, ve které dochází k vysoké intenzitě buněčného dělení (Zima et al. 2004). U štírků se běžně využívají gonády a k analýze karyotypu slouží mimo standardně používané mitotické metafáze také chromosomy meiotického dělení (např. Šťáhlavský a Král 2004, Šťáhlavský et al. 2006). Pro přípravu chromosomových preparátů byla využita metoda plate spreading (Traut 1976). Tato technika je zvláště vhodná pro přípravu chromosomů z malých živočichů, jelikož při ní dochází k minimálním ztrátám materiálu. Samotná preparace začala podélným roztržením pleurální stěny zadečku pomocí pinzety, poté byl celý štírek ponořen do hypotonického roztoku (0,075 M KCl). Drobné gonády byly ponechány v tělní dutině, aby se zabránilo jejich ztrátě během následujícího postupu. Po 20 minutách hypotonizace se celý štírek s gonádami fixoval v čerstvě připravené fixáži (metanol: kyselina octová v poměru 3:1) po dobu 20 minut. Během této doby byla fixáž dvakrát změněna za čerstvou. Po fixaci byly gonády vyjmuty a odstraněny ze zadečku do kapky 60% kyseliny octové na čistém mikroskopickém sklíčku. Zde dochází k rozpuštění tkáně a vytvoření 18
19 jemné suspenze. Sklíčko se poté rychle umístilo na teplou histologickou desku (s povrchovou teplotou 40 C) a kapka rozptýlené tkáně byla roztírána na sklíčku pomocí wolframové jehly, dokud nedošlo k odpaření. Preparáty byly vysušeny přes noc a obarveny 5% roztokem Giemsy v Sörensenově fosfátovém pufru (4.75 g Na2 HPO4 12 H2O a 4.54 g KH2PO4 v 1000 ml H2O, ph = 6.8) po dobu 30minut (Šťáhlavský a Král 2004) C-pruhování C-pruhování představuje standardní cytogenetickou techniku, sloužící k vizualizaci konstitutivního heterochromatinu, který se nachází převážně v oblasti centromer chromosomů. Prostřednictvím této metody lze lépe odhalit pozici centromery, což umožňuje následně přesnější analýzu karyotypu (rozpoznání morfologie chromosomů) (Zima et al. 2004). U vybraných chromosomových preparátů (viz Příprava chromosomových preparátů) byla provedena metoda C-pruhování podle standardního postupu (Sumner 1972). Před vlastním postupem C-pruhování došlo k odmytí Giemsy prostřednictvím roztoku metanolu s kyselinou octovou v poměru 3:1. Preparáty byly nejprve 1 hodinu sušeny při teplotě 60 C v sušárně, následně se nechaly zchladnout přibližně 15 minut. Poté na skla působil roztok 0,2N HCl po dobu 45 minut. V tomto kroku dochází k rozvolňování struktury chromosomů. Po vyndání z roztoku se preparáty opláchly destilovanou vodou a nechaly oschnout přibližně 3 hodiny a mezitím se připravil nasycený roztok Ba(OH)2. Suchá skla se inkubovala 3-5 minut při 50 C v roztoku Ba(OH)2. Následně byly preparáty opláchnuty v destilované vodě při teplotě C, aby došlo k odmytí hydroxidu barnatého z povrchu skla. Dále se preparáty nechaly zhruba 3 hodiny osychat. Vysušená skla se inkubovala v 2x SSC pufru při teplotě 60 C po dobu minut. Opět následovalo opláchnutí preparátů v destilované vodě při pokojové teplotě. Druhý den po C-pruhování bylo provedeno barvení pomocí DAPI (4',6-diamidin-2-fenylindol). Jedná se o fluorochrom, který se specificky váže na AT bohaté oblasti chromosomů, což slouží k lepší vizualizaci konstitutivního heterochromatinu. Samotný postup barvení probíhal 7 minut v 1% Triton X/1x PBS, poté se preparáty nechaly oschnout a následně se přidalo Dabco (25μl/sklo). Preparáty byly překryty krycím sklem, u kterého byly okraje orámovány lakem na nehty. Takto vytvořené chromosomové preparáty byly prohlíženy mikroskopem Olympus AX70 19
20 Provis a porovnala se stejná jádra jako při prohlížení skel před C-pruhováním podle zaznamenaných souřadnic Analýza karyotypu Vytvořené chromosomové preparáty byly prohlíženy pomocí mikroskopu Olympus AX70 Provis, s využitím imerzního objektivu 100x. Nejlepší chromosomy byly vyfoceny pomocí kamery Olympus DP71. V mitóze nebyly centromery vždy zcela zřetelné, proto se k analýze karyotypu přednostně využily chromosomy z meiotických fází pachytene, postpachytene nebo metafáze II, kde byla pozice centromery jasnější. U vyfotografovaných chromosomů se zjišťovaly standardní karyotypové charakteristiky jako je počet, relativní velikost a morfologie chromosomů, a to pomocí doplňku Levan (Sacamato a Zacaro 2009) k programu ImageJ 1.48 ( který umožňuje přímou klasifikaci morfologických typů chromosomů a jejich relativní velikost. Údaje získané z měření jednotlivých jader byly uloženy v tabulce MS Excel a jednotlivá měření konkrétních druhů byly následně zprůměrované (Tab. 7, přílohy). Určení morfologie chromosomů probíhalo dle klasifikace Levan et al. (1964). Relativní délka chromosomů byla vypočítána pro haploidní sadu zahrnující pohlavní chromosom X. Z naměřených chromosomů byly sestaveny karyogramy a nakonec na základě získaných průměrných hodnot z měření chromosomů byly vytvořeny idiogramy. 4.3 Molekulárně fylogenetické metody Izolace DNA Na izolaci DNA byli vybráni, jak jedinci po přípravě chromosomových preparátů, tak jedinci uloženi přímo v terénu do čistého lihu. Samotná izolace byla prováděna podle protokolu z izolační sady Genomic DNA Mini Kit (Tissue) od firmy Geneaid. Působení proteinázy K bylo prodlouženo z předepsaných 30 minut na 4 4,5 hodiny, aby byla izolace efektivnější. V kroku 2 byli štírci vyjmuti z izolované směsi a uloženi do lihu. Konečná vyizolovaná DNA byla uchovávána při teplotě -20 C Polymerázová řetězcová reakce (PCR) Metoda PCR umožňuje amplifikovat konkrétní úsek DNA, který může být poměrně malý. Daný fragment DNA je označen dvěma primery ležícími na opačných vláknech DNA. U štírků byly k rekonstrukci vzájemných fylogenetických vztahů 20
21 analyzovaných taxonů použity fragmenty mitochondriálních genů pro cytochrom oxidázu I (cox1) a jaderných genů pro histon H3 (H3). Jaderný gen H3 byl využit pouze u vybraných jedinců zastupujících morfologické druhy, případně velmi divergentní neurčené linie na základě předběžných vysledků cox1. Použité sekvence primerů jsou uvedeny v tabulce níže (Tab. 1). Gen Název Orientace Sekvence primeru Zdroj cox1 LCO1490 forward 5 -GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG - 3 Folmer et al cox1 HCO2198 reverse 5 -TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3 Folmer et al H3 H3AF1 forward 5 - ATGGCTCGTACCAAGCAGACVGC - 3 Colgan et al H3 H3AR1 reverse 5 - ATATCCTTRGGCATRATRGTGAC - 3 Colgan et al Tab. 1: Seznam sekvencí primerů použitých pro tuto metodu. Všechny amplifikace byly prováděny v objemu 25µl reakční směsi s následujícími dílčími hodnotami. PCR H2O.7µl PPP Master Mix (Top-Bio s.r.o.)..12,5µl Forward primer...1µl Reverse primer.1µl DNA.3,5µl Protokol PCR pro každý gen je popsán v následujících tabulkách. V tabulce 2 pro cytochrom oxidázu I, v tabulce 3 pro histon H3. Krok Teplota Čas Počet 1. Počáteční denaturace 94 C 5 min 1x 2. Denaturace 94 C 35 sek 35x 3. Nasedání primerů C 35 sek 35x 4. Prodlužování 72 C 45 sek 35x 5. Konečné prodlužování 72 C 5 min 1x 6. Chlazení 12 C 21
22 Tab. 2: PCR program pro cox1 Krok Teplota Čas Počet 1. Počáteční denaturace 95 C 5 min 1x 2. Denaturace 95 C 30 sek 35x 3. Nasedání primerů C 30 sek 35x 4. Prodlužování 72 C 1 min 35x 5. Konečné prodlužování 72 C 5 min 1x 6. Chlazení 12 C Tab. 3: PCR program pro H3 Kvalita daného PCR produktu byla zkontrolována prostřednictvím elektroforézy. Každý vzorek (3µl) byl nanesen na 1% agarózový gel (1g agarózy, 100 ml 1x TBE), do kterého bylo přidáno určité množství ethidium bromidu (2 µl na 1g agarózy a 100ml 1x TBE) v závislosti na množství gelu. Dále se na gel nanesl délkový standard DNA (GeneRulerTM 100bp DNA Ladder, Fermentas), díky kterému se zjistila délka fragmentu. PCR produkty byly následně odeslány k přečištění a oboustranné sekvenaci do firmy Macrogen (Support-Europe) Editace sekvencí a alignment Získané sekvence byly editovány v programu Geneious ( Případná přítomnost stop kodonu indikující chybnou editaci nebo přítomnost pseudogenu byla vyloučena překladem na aminokyseliny u obou genů. Vzhledem k přítomnosti gapů v předběžném alignmentu se po upravení a zkontrolování sekvencí vytvořil finální alignment pro jednotlivé geny (cox1, H3) prostřednictvím online verze programu Translator X (Abascal et al. 2010) určený pro alignment protein kodujících sekvencí beroucí v potaz jejich překlad na aminokyseliny. Pro zjištění potencionální saturace na třetích pozicích kodonů pro gen cox1 byl vytvořen graf zobrazující transverze a tranzice v rámci ingroupu. Míra saturace a využití sekvencí pro fylogenetické analýzy byla ověřena pomocí testu navrženého Xia et al. (Xia et al. 2003, Xia a Lemey 2009) a programem DAMBE (Xia 2013). Počet variabilních pozic v rámci jednotlivých fragmentů byl zjištěn v programu MEGA (Tamura et al. 2013). Výsledné finální alignmenty obou genů byly spojeny do finální konkatenované matrice v programu Geneious. 22
23 4.4 Fylogenetické analýzy Substituční nukleotidové modely a rozdělení na jednotlivé partice byly zjištěny pro jednotlivé geny použitím programu Partition Finder (Lanfear et al. 2012). Následně byly provedeny fylogenetické analýzy pomocí dvou metod Maximum likelihood (ML) a Bayesovskou analýzou (BA), pro tyto metody byly zvoleny outgroupy Mundochthonius sp. a Roncus lubricus Maximum likelihood Metoda maximální pravděpodobnosti byla prováděna prostřednictvím programu RaxmlGUI 1.3 (Silvestro a Michalak 2012). Nezávislé GTR+I+GAMMA substituční modely byly zvoleny pro všechny genové partice. Gapy v těchto analýzách nebyly brány v úvahu. Strom s nejlepší hodnotou ML byl vybrán na základě 100 iterací, podpora nodů byla zjištěna na základě 1000 replik Bayesovská analýza Bayesovská analýza byla provedena v programu MrBayes (Ronquist a Huelsenbeck 2003). Nejlepší partiční schéma a korespondující evoluční modely byly definovány pro oba fragmenty genů. Dvě nezávislé analýzy o délce 5x10 7 generací s 8 MCMC (Markov Chain Monte Carlo) řetězců pro každou analýzu byly analyzovány na online fylogenetickém serveru CIPRES (phylo.org Miller et al. 2010). Průběžné výsledky analýz byly ukládány každých 1000 generací. Míra konvergence mezi jednotlivými analýzami i v rámci nich byla zjištěna na základě hodnoty střední odchylky ( 0.01) v programu TRACER (Rambaut a Drummond 2009). Výsledné fylogenetické stromy byly následně vizualizovány a editovány v programu FigTree (Rambaut 2012). 23
24 5 Výsledky 5.1. Cytogenetické analýzy Chthonius (Chthonius.) alpicola Beier, 1951 U tohoto druhu se podařilo získat údaje o karyotypu u jediného samce z údolí řeky Rio Bianco (Obr. 18A, přílohy). Diploidní počet chromosomů druhu Ch. (Ch.) alpicola je 21. Karyotyp samce tohoto druhu obsahuje 10 párů akrocentrických autosomů a 1 metacentrický pohlavní chromosom X (Obr. 1A, B). První tři akrocentrické páry autosomů v jádře jsou nápadně delší (13.23 %, 12,49 % a %), než následující páry autosomů, které plynule zmenšují svou velikost od 7.98 % do 2.97 % haploidní sady (Tab. 7A, přílohy). Pohlavní chromosom X představuje největší chromosom karyotypu. Dosahuje velikosti % v haploidní sadě chromosomů. A B Obr. 1: Chthonius (Ch.) alpicola Beier, 1951: A karyogram sestavený z chromosomů ve fázi postpachytene, B idiogram vytvořený na základě průměrných hodnot zjištěných měřením délky chromosomů, osa y znázorňuje velikost chromosomů v % a osa x počet chromosomů haploidní sad. Měřítko=10µm 24
25 Chthonius (Chthonius.) carinthiacus Beier, 1951 Jedinci druhu Ch. (Ch.) carinthiacus, u kterých se podařilo získat informace o karyotypu, pochází ze tří oblastí ve střední a východní části Alp (Obr. 18B, přílohy). Jedná se o čtyři jedince, jejichž diploidní počet byl ve všech případech 35 chromosomů. Karyotyp tohoto druhu štírka zahrnuje 17 párů akrocentrických autosomů a 1 metacentrický pohlavní chromosom X. Z karyogramu i z idiogramu (Obr. 2A, B) je patrné, že velikost autosomů se postupně zmenšuje bez výraznějších odchylek. Autosomy se pohybují v rozmezí velikostí od 7.29 % do 2.34 % haploidní sady. Pohlavní chromosom X zaujímá svou velikostí 23.3 % haploidní sady (Tab. 7B, přílohy). A B Obr. 2: Chthonius (Ch.) carinthiacus Beier, 1951: A karyogram sestavený z chromosomů ve fázi pachytene, B idiogram vytvořený na základě průměrných hodnot zjištěných měřením délky chromosomů, osa y znázorňuje velikost chromosomů v % a osa x počet chromosomů haploidní sady. Měřítko=10µm 25
26 Chthonius (Chthonius.) ischnocheles Hermann, 1804 Druh štírka Ch. (Ch.) ischnocheles byl pro karyologickou analýzu zastoupen dvěma jedinci ze dvou různých lokalit. Jeden ze zastoupených jedinců pochází ze Švýcarska z oblasti Bienne v těsné blízkosti jezera Bielersee a druhý jedinec z Francie z oblasti Glére (Obr. 18C, přílohy). Diploidní sada tohoto druhu štírka obsahuje 31 chromosomů. V karyotypu se vyskytuje 13 párů akrocentrických a 2 páry metacentrických autosomů (pár č. 1 a č. 13) a 1 metacentrický pohlavní chromosom X. Z karyogramu, stejně jako z idiogramu (Obr. 3A, B) je patrné, že dochází k postupnému snižování velikosti autosomů. Velikost autosomů se pohybuje v rozmezí od 8.47 % do 3.66 % haploidní sady. Pohlavní chromosom X velikostně představuje % haploidní sady (Tab. 7C, přílohy). A B Obr. 3: Chthonius (Ch.) ischnocheles Hermann, 1804: A karyogram sestavený z chromosomů ve fázi pachytene, B idiogram vytvořený na základě průměrných hodnot zjištěných měřením délky chromosomů, osa y znázorňuje velikost chromosomů v % a osa x počet chromosomů haploidní sady. Měřítko=10µm. 26
27 Chthonius (Chthonius.) cfr. ischnocheles Hermann, 1804 Štírci uvedení pod tímto označením představují skupinu jedinců morfologicky podobnou předcházejícímu druhu Chthonius (Ch.) ischnocheles. Pro karyologické analýzy bylo využito celkem dvanáct jedinců, z nichž jedenáct pochází ze střední části Alp z Itálie a jeden ze západní části Alp ze Švýcarska (Obr. 18D, přílohy). Detailní údaje o karyotypu se podařilo získat pouze u jedince pocházejícího ze Švýcarska, který vykazoval diploidní počet 35 chromosomů a karyotyp obsahoval 14 párů akrocentrických, 2 páry metacentrických (pár č. 1 a č. 13) a 1 pár submetacentrických autosomů (pár č. 3) a 1 metacentrický pohlavní chromosom X. U ostatních jedinců se nepodařilo získat údaje o měření, ale je patrné, že se u těchto jedinců vyskytují stejné morfologické typy chromosomů a všichni mají stejný počet chromosomů. Z vyobrazeného karyogramu (Obr. 4A), je zřejmá postupně se snižující velikost jednotlivých autosomů. Autosomy postupně zmenšují svou velikosti od 7.47 % do 1.45 % haploidní sady, kde poslední autosom je výrazně menší, než předcházející. Pohlavní chromosom X svou velikostí představuje % haploidní sady (Obr. 4B, Tab. 7D, přílohy). 27
28 A B Obr. 4: Chthonius (Ch.) cfr. ischnocheles Hermann, 1804: A karyogram sestavený z chromosomů ve fázi pachytene, B idiogram vytvořený na základě průměrných hodnot zjištěných měřením délky chromosomů, osa y znázorňuje velikost chromosomů v % a osa x počet chromosomů haploidní sady. Měřítko=10µm 28
29 Chthonius (Chthonius) raridentatus Hadži, 1930 Analyzovaní jedinci druhu Chthonius (Ch.) raridentatus pochází z východní části Alp ze Slovinska a Rakouska. Údaje o karyotypu byly získány z deseti jedinců pocházejících z šesti lokalit. (Obr. 18E, přílohy). Diploidní sada všech jedinců obsahuje 29 chromosomů. Na základě změřených údajů byly zjištěny dva morfologické typy karyotypu. Karyotypová rasa I (Obr. 5A) tohoto druhu převažuje u většiny analyzovaných samců a obsahuje 12 párů akrocentrických, 1 pár metacentrických (pár č. 2) a 1 pár subtelocentrických autosomů (pár č. 5) a 1 metacentrický pohlavní chromosom X. Karyotypová rasa II (Obr. 5D) zjištěný pouze u dvou jedinců ze dvou lokalit obsahuje 12 párů akrocentrických a 2 páry metacentrických autosomů (pár č. 1 a 2) a 1 metacentrický pohlavní chromosom X. V karyotypech obou forem karyotypů došlo k velikostní diferenciaci, kdy první tři autosomy jsou delší, než ostatní autosomy v jádře, a to v průměru až tři a půlkrát. Co se týká karyotypové rasy I, tak tři největší autosomy dosahují velikosti 10,91 %, 10,12 % a 9,84 % haploidní sady. Velikost zbývajících autosomů se postupně zmenšuje od 9,84 % do 2.60 % haploidní sady. Pohlavní chromosom X dosahuje 22,37 % své velikosti v haploidní sadě (Obr. 5E, Tab. 7E, přílohy). U karyotypové rasy II dosahuje velikost tří největších autosomů 10,91 %, 9,55 % a 9,39 % haploidní sady a ostatní autosomy se zmenšují od 7,39 % do 2,90 %. Pohlavní chromosom X zaujímá svou velikostí 20,01 % haploidní sady (Obr. 5F, Tab. 7F, přílohy). U tohoto druhu štírka byla provedena metoda C-pruhování (Obr. 5C), která umožnila přesné určení pozice konstitutivního heterochromatinu a potvrzení pozice centromer v oblasti pozitivně heteropyknotických bloků u chromosomů bez aplikace C-pruhování (srovnej Obr. 5B a 5C). C-pruhování u tohoto druhu neodhalilo žádné další bloky konstitutivního heterochromatinu mimo oblasti centromer. 29
30 A B C D E F Obr. 5: Chthonius (Ch.) raridentatus Hadži, 1930: A karyotypová rasa I, karyogram sestavený z chromosomů ve fázi pachytene, B pachytene, C pachytene, C-pruhování, D karyotypová rasa II, postpachytene, E a F idiogramy vytvořené na základě průměrných hodnot zjištěných měřením délky chromosomů, osa y znázorňuje velikost chromosomů v % a osa x počet chromosomů haploidní sady. Velká černá šipka ukazuje na pohlavní chromosom X, malá černá šipka na velké metacentrické autosomy. Měřítko=10µm. 30
31 Chthonius (Chthonius) rhodochelatus Hadži, 1933 Informace o karyotypu druhu Chthonius (Ch.) rhodochelatus se podařilo získat u jediného exempláře tohoto druhu. Tento jedinec pochází z oblasti nedaleko italského jezera Lago di Santa Giustina (Obr. 18F, přílohy). V diploidní sadě tohoto jedince bylo přítomno 35 chromosomů. Karyotyp obsahuje 15 párů akrocentrických, 1 pár metacentrických (pár č. 13) a 1 pár submetacentrických autosomů (pár č. 14) a 1 metacentrický pohlavní chromosom X. Z karyogramu a zároveň i z idiogramu (Obr. 6A, B) je patrné, že dochází k postupnému snižování velikosti autosomů. Velikost autosomů se plynule zmenšuje od 6.73 % do 2.92 % haploidní sady. Pohlavní chromosom zaujímá svou velikostí % haploidní sady (Tab. 7G, přílohy). A B Obr. 6: Chthonius (Ch.) rhodochelatus Hadži, 1933: A karyogram sestavený z chromosomů ve fázi pachytene, B idiogram vytvořený na základě průměrných hodnot zjištěných měřením délky chromosomů, osa y znázorňuje velikost chromosomů v % a osa x počet chromosomů haploidní sady. Měřítko=10µm 31
32 Chthonius (Chthonius) cfr. rhodochelatus Hadži, 1933 Druh štírka Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus představuje jedince morfologicky podobného předcházejícímu druhu Chthonius (Ch.) rhodochelatus. Na rozdíl od něj je nicméně jejich velikost těla větší a karyotyp je výrazně odlišný. Z tohoto důvodu jsou zde uvedeni pod tímto označením. Podařilo se získat údaje o karyotypech čtyř jedinců ze čtyř lokalit v centrální části Alp (Obr. 18G, přílohy). Diploidní počet chromosomů druhu Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus je 35. Karyotyp samců zahrnuje 15 párů akrocentrických a 2 páry metacentrických autosomů (pár č. 2 a 13) a 1 metacentrický pohlavní chromosom X. V rámci tohoto karyotypu nebyla zjištěna žádná nápadná velikostní diferenciace autosomů (Obr. 7A, B).. Jejich velikost se plynule zmenšuje od 6,25 % do 3.24 % haploidní sady. Pohlavní chromosom svou velikostí představuje % haploidní sady (Tab. 7H, přílohy). A B Obr. 7: Chthonius (Ch.) cfr. rhodochelatus Beier, 1951: A karyogram sestavený z chromosomů ve fázi pachytene, B idiogram vytvořený na základě průměrných hodnot zjištěných měřením délky chromosomů, osa y znázorňuje velikost chromosomů v % a osa x počet chromosomů haploidní sady. Měřítko=10µm 32
33 Chthonius (Chthonius) tenuis L. Koch, 1873 Druh Ch. (Ch.) tenius byl pro karyologické analýzy bohatě zastoupen 35 jedinci z různých oblastí v Itálii, Rakousku, Slovinsku a Švýcarsku (Obr. 18H, přílohy). U tohoto druhu byla zjištěna variabilita v počtu a morfologii chromosomů. Cělkově bylo možno rozlišit pět rozdílných karyotypů, zde označovaných jako karyotypové rasy I-V. U většiny jedinců byla nalezena karyotypová rasa I, u které je 2n=35. Tato karyotypová rasa obsahuje 16 párů akrocentrických a 1 pár metacentrických autosomů (pár č. 9) a 1 metacentrický pohlavní chromosom X. Z karyogramu i z idiogramu (Obr. 8A, B), je zřejmé, že autosomy postupně zmenšují svoji velikost konkrétně od 6.41 % do 2.56 % haploidní sady. Pohlavní chromosom X dosahuje velikosti % haploidní sady (Tab. 7CH, přílohy). U některých zástupců tohoto druhu byly nalezeny karyotypové rasy II-IV s 2n=33. Tyto rasy se liší morfologií některých chromosomů. Karyotypová rasa II (Obr. 9A) obsahuje 15 párů akrocentrických a 1 pár metacentrických autosomů (pár č. 1) a 1 metacentrický pohlavní chromosom X. Z idiogramu (Obr. 9D), je patrné, že jeden metacentrický autosom je nápadně delší než ostatní v daném jádře, a to v průměru dvakrát (10,95 %). Zbylé autosomy se postupně zmenšují od 6.46 % do 2.90 % haploidní sady. Pohlavní chromosom X představuje svou velikostí % haploidní sady (Tab. 7I, přílohy). Karyotypová rasa III (Obr. 9B) obsahuje 13 párů akrocentrických, 2 páry metacentrických (pár č. 1 a 11) a 1 pár subtelocentrických autosomů (pár č. 4) a 1 pohlavní chromosom X. Z idiogramu (Obr. 9E) je patrné, že první metacentrický autosom je nápadně delší (11,18 %), než ostatní autosomy, které se zmenšují od 5,95 % do 3,13 % haploidní sady. Pohlavní chromosom X zaujímá svou velikostí 20,44 % haploidní sady (Tab. 7J, přílohy). Karyotypová rasa IV (Obr. 9C) s diploidním počtem 33 chromosomů obsahuje 16 párů akrocentrických autosomů a 1 pohlavní chromosom X. První autosom je nápadně delší (pár č.1, 10,61 %), jak je patrné z idiogramu (Obr. 9F), než ostatní autosomy zmenšující se v rozmezí od 6,59 % do 2,72 % haploidní sady. Pohlavní chromosom X představuje 22,86 % haploidní sady (Tab. 7K, přílohy). U jediného samce druhu Ch. (Ch.) tenuis byl zjištěn ještě nižší diploidní počet chromosomů 21. Karyotypová rasa V obsahuje 7 párů akrocentrických a 3 páry metacentrických autosomů (pár č. 1, 3 a 4) a 1 metacentrický pohlavní chromosom X. Z vyobrazeného karyogramu (Obr. 10A) je patrné, že dva autosomy jsou nápadně delší (19,06 % a 16,28 %), téměř až pětkrát než ostatní. Zbylé autosomy snižují postupně svou velikost od 9.44 % do 2.88 % haploidní sady. Pohlavní chromosom dosahuje svou velikostí % haploidní sady (Tab. 7L, přílohy). 33
34 A B Obr. 8: Chthonius (Ch.) tenuis L. Koch, 1873: A karyogram karyotypové rasy I (2n=35) sestavený z chromosomů ve fázi postpachytene, B idiogram stejné formy vytvořený na základě průměrných hodnot zjištěných měřením délky chromosomů, osa y znázorňuje velikost chromosomů v % a osa x počet chromosomů haploidní sady. Měřítko=10µm. 34
35 A B C D E F Obr. 9: Chthonius (Ch.) tenuis L. Koch, 1873: A postpachytene jedince karyotypové rasy II, B pachytene jedince karyotypové rasy III, C - postpachytene jedince karyotypové rasy IV, D, E, F idiogramy karyotypových ras II, III, IV vytvořené na základě průměrných hodnot zjištěných měřením délky chromosomů, osa y znázorňuje velikost chromosomů v % a osa x počet chromosomů haploidní sady. Černá šipka ukazuje na pohlavní chromosom X. Měřítko=10µm 35
36 A B Obr. 10: Chthonius (Ch.) tenuis L. Koch, 1873: A karyogram jedince karyotypové rasy V (2n=21) sestavený z chromosomů ve fázi postpachytene, B idiogram vytvořený na základě průměrných hodnot zjištěných měřením délky chromosomů, osa y znázorňuje velikost chromosomů v % a osa x počet chromosomů haploidní sady. Měřítko=10µm 36
37 Chthonius (Ephippiochthonius) boldorii Beier, 1934 Daný druh štírka byl zastoupen šesti jedinci, z kterých byly získány údaje o karyotypu. Tito zástupci pochází z oblastí středních a západních Alp z Itálie a Rakouska (Obr. 18CH, příloha). V diploidní sadě bylo přítomno u všech zkoumaných jedinců 35 chromosomů. Karyotyp druhu Ch. (E.) boldorii obsahuje 16 párů akrocentrických a 1 pár subtelocentrických autosomů (pár č. 2) a 1 metacentrický pohlavní chromosom X. Z vyobrazeného karyogramu i idiogramu (Obr. 11A, B) vyplývá, že autosomy plynule zmenšují svojí velikost, konkrétně od 7.38 % do 2.43 % haploidní sady. Velikost pohlavního chromosomu dosahuje 19,99 % haploidní sady (Tab. 7M, přílohy). A B Obr. 11: Chthonius (E.) boldorii Beier, 1934: A karyogram sestavený z chromosomů ve fázi pachytene, B idiogram vytvořený na základě průměrných hodnot zjištěných měřením délky chromosomů, osa y znázorňuje velikost chromosomů v % a osa x počet chromosomů haploidní sady. Měřítko=10µm 37
38 Chthonius (Ephippiochthonius) fuscimanus Simon, 1900 Druh štírka Chthonius (E.) fuscimanus byl pro karyologické účely zastoupen dvěma jedinci, kteří pochází ze střední části Alp z Itálie z oblasti Selva di Cadore (Obr. 18I, přílohy). Diploidní sada obsahovala 35 chromosomů u obou analyzovaných jedinců. Karyotyp tohoto druhu zahrnuje 17 párů akrocentrických autosomů a 1 metacentrický pohlavní chromosom X. Z karyogramu i z idiogramu (Obr. 12A, B) je patrné, že dochází k postupnému zmenšování velikosti autosomů. Velikost jednotlivých autosomů se snižuje postupně od 6.7 % do 3.33 % haploidní sady. Pohlavní chromosom zaujímá svou velikostí % v haploidní sadě (Tab. 7N, přílohy). A B Obr. 12: Chthonius (E.) fuscimanus Simon, 1900: A karyogram sestavený z chromosomů ve fázi postpachytene, B idiogram vytvořený na základě průměrných hodnot zjištěných měřením délky chromosomů, osa y znázorňuje velikost chromosomů v % a osa x počet chromosomů haploidní sady. Měřítko=10µm 38
39 Chthonius (Ephippiochthonius) tetrachelatus Preyssler, 1790 Údaje o karyotypu tohoto druhu se podařilo získat z jediného samce ze západní části Alp ze Slovinska (Obr. 18J, přílohy) a byl podroben C-pruhování, které lépe odhalilo pozici konstitutivního heterochromatinu v jádře (srovnej Obr. 13A, 13B). Diploidní sada druhu Ch. (E.) tetrachelatus obsahuje 35 chromosomů. Karyotyp tohoto druhu štírka zahrnuje 15 párů akrocentrických, 1 pár subtelocentrických (pár č. 7) a 1 pár submetacentrických autosomů (pár č. 9) a 1 metacentrický pohlavní chromosom X. Z karyogramu i z idiogramu (Obr. 13C, D) je nápadná postupně se zmenšující velikost jednotlivých autosomů, která se pohybuje v rozmezí od 7.45 % do 2.96 % haploidní sady. Velikost pohlavního chromosomu dosahuje % haploidní sady (Tab. 7O, přílohy). 39
40 A B C D Obr. 13: Chthonius (E.) tetrachelatus Preyssler, 1790: A pachytene, B pachytene, C-pruhování, C karyogram sestavený z chromosomů ve fázi pachytene, D idiogram vytvořený na základě průměrných hodnot zjištěných měřením délky chromosomů, osa y znázorňuje velikost chromosomů v % a osa x počet chromosomů haploidní sady. Černá šipka ukazuje na pohlavní chromosom X. Měřítko=10µm 40
41 Chthonius (Ephippiochthonius) nanus Beier, 1953 U druhu Chthonius (E.) nanus se podařilo získat údaje o karyotypu ze dvou jedinců pocházejících z oblasti Imperia v západní části Alp v Itálii (Obr. 18K, přílohy). V diploidní sadě analyzovaných jedinců bylo přítomno 25 chromosomů. Karyotyp tohoto druhu obsahuje 11 párů akrocentrických a 1 pár metacentrických autosomů (pár č. 1) a 1 metacentrický pohlavní chromosom X. Z vyobrazeného karyogramu (Obr. 14A) je patrný výskyt nápadně velkého metacentrického chromosomového páru, který je v průměru až šestkrát delší (20,91 %) (Obr. 14B). Ostatní autosomy se zmenšují od 6.26 % do 2.96 % haploidní sady. Pohlavní chromosom svou velikostí zaujímá % haploidní sady (Tab. 7P, přílohy). A B Obr. 14: Chthonius (E.) nanus Beier, 1953: B karyogram sestavený z chromosomů ve fázi metafáze II, C idiogram vytvořený na základě průměrných hodnot zjištěných měřením délky chromosomů, osa y znázorňuje velikost chromosomů v % a osa x počet chromosomů haploidní sady. Měřítko=10µm 41
42 Chthonius (Globochthonius) poeninus Mahnert, 1979 Druh tohoto štírka byl zastoupen jediným samcem, který poskytl údaje o karyotypu. Tento zástupce pochází z italské oblasti Castello v blízkosti jezera Lago di Lugano ve střední části Alp (Obr. 18L, přílohy). Diploidní sada druhu Ch. (G.) poeninus obsahuje 25 chromosomů. Karyotyp tohoto druhu zahrnuje 11 párů akrocentrických a 1 pár metacentrických autosomů (pár č. 2) a 1 metacentrický pohlavní chromosom X. U tohoto druhu nebyly zaznamenané výrazně odlišné velikostní rozdíly autosomů a dochází k postupnému snižování jejich velikosti bez nápadnějších odchylek (Obr. 15A, B). Autosomy se plynule zmenšují od 8.04 % do 3.37 % své velikosti haploidní sady. Pohlavní chromosom dosahuje % své velikosti v haploidní sadě (Tab. 7Q, přílohy). A B Obr. 15: Chthonius (G.) poeninus Mahnert, 1979: B karyogram sestavený z chromosomů ve fázi metafáze II, C idiogram vytvořený na základě průměrných hodnot zjištěných měřením délky chromosomů, osa y znázorňuje velikost chromosomů v % a osa x počet chromosomů haploidní sady. Měřítko=10µm 42
43 Průběh samčího meiotického dělení Přestože se v rámci žádného jedince nepodařilo získat kompletní sadu jednotlivých fází meiotického cyklu, dá se z jednotlivých dílčích pozorování vytvořit celková představa o průběhu meiózy a chování chromosomů během hlavních fází (Obr. 16, A-D). Je zřejmé, že meióza u všech zkoumaných druhů štírků z rodu Chthonius vykazovala stejný průběh. V interfázi jsou chromosomy dekondenzované a těžko rozpoznatelné. Pohlavní chromosom X je v této fázi isopyknotický a není ho tudíž možné odlišit od autosomů (Obr. 16A). V zygotene dochází k počátku párování homologických chromosomů a díky intenzivnější spiralizaci začínají být viditelné chromatidy. Pohlavní chromosom X je v této fázi možno odlišit od autosomů díky zvýšené kondenzaci a intenzivnějšímu probarvení (pozitivní heteropyknóza) (Obr. 16B). Během časné pachytene jsou již homologické chromosomy spárované a dobře patrné. Na autosomech jsou patrné heteropyknotické knoby, které odpovídají svou polohou centromerám (viz např. Obr. 13, srovnej A a B). Pohlavní chromosom X je stále nápadný svou pozitivní heteropyknózou a většinou tvoří shluk na periferii jádra (Obr. 16C). Během samotné fáze pachytene jsou vytvářeny bivalenty, ale u sledovaných jader v této fázi byla patrná absence chiazmat mezi homologickými páry chromosomů. Všichni analyzovaní samci rodu Chthonius tudíž mají tzv. achiasmatickou meiózu. V pozdní pachytene jsou chromatidy pohlavního chromosomu X již dobře patrné, jsou isopyknotické a konce chromatid spolu asociují (Obr. 16D). Vzhledem k absenci crossing-overu v meióze, chybí fáze diplotene a diakineze, které jsou charakterizovány terminalizací chiazmat. U štírků rodu Chthonius lze naproti tomu sledovat tzv. postpachytene, kdy postupně dochází k oddělování jednotlivých bivalentů. Během postpachytene je pohlavní chromosom X stále isopyknotický a konce chromosomu již spolu neasociují (Obr. 16E). V průběhu druhého, tzv. ekvačního meiotického dělení byla nejčastěji pozorována metafáze II. V této fázi jsou dobře patrné oddělené chromatidy, avšak stále jsou spojené v oblasti centromery (Obr. 16F). Vzhledem k chromosomovému určení pohlaví typu X0 je pohlavní chromosom přítomen pouze v jedné ze sesterských metafází II a je isopyknotický (Obr. 16F). 43
44 A B C D E F Obr. 16: Sekvence vybraných fází achiazmatické meiózy štírků rodu Chthonius: A interfáze, B zygotene, C časná pachytene, D-časná postpachytene, E postpachytene, F metafáze II. Černá šipka ukazuje na pohlavní chromosom X, šedá šipka ukazuje asociaci konců ramen pohlavního chromosomu X. Měřítko=10µm. 44
45 5.2 Rekonstrukce fylogenetických vztahů Použitý materiál, sekvenace a tvorba alignmentu Na molekulárně fylogenetické analýzy bylo použito 87 jedinců (Tab. 6, přílohy). Pro sekvenace a samotnou tvorbu alignmentu bylo použito 87 sekvencí pro gen cox1 a 34 sekvencí pro gen H3. Osekvenované fragmenty genů cox1 (603bp) a H3 (351bp) byly spojeny do konkatenované matrice Chthonius_concat (celková délka 954bp). Variabilita pro gen cox1 uváděla 357 variabilních pozic v alignmentu (285 parsimony informative), pro gen H3 zjištěná variabilita představovala 98 variabilních pozic v alignmentu (74 parsimony informative). Grafické zobrazení akumulací tranzicí a transverzí v rámci alignmentu (Obr. 18, přílohy) v programu DAMBE (Xia 2013) odhalilo mírnou saturaci na třetích pozicích v alignmentu. Sekvence však byly podle programu vhodné pro fylogenetické analýzy. Alternativně, pro vyloučení potencionálního negativního vlivu saturace byly v programu MEGA z alignmentu odebrány třetí pozice v alignemntu pro gen cox1. Zredukovaná matrice Chthonius_red byla tvořena 753bp, z toho sekvence pro gen cox1 tvořily 402bp a sekvence pro gen H3 351bp. Variabilita pro tuto matrici Chthonius_red pro gen cox1 vykazovala 161 variabilních pozic v alignmentu (100 parsimony informative) a pro gen H3 98 variabilních pozic v alignmentu (74 parsimony informative) Fylogenetické analýzy Prostřednictvím programu Partition Finder (Lanfear et al. 2012) byly zjištěny tyto evoluční modely (Tab. 4) týkající se matric Chthonius_concat a Chthonius_red pro Bayesovskou analýzu: Chthonius_concat model Chthonius_red model cox1_pos1 GTR+I+G cox1 GTR+I+G cox1_pos2 HKY+I+G H3_pos1 GTR+I cox1_pos3 HKY+G H3_pos2 JC H3_pos1 GTR+I H3_pos3 SYM+I+G H3_pos2 JC H3_pos3 SYM+I+G Tab. 4: Evoluční modely navržené programem Partition Finder pro matrice Chthonius_concat a Chthonius_red. 45
46 Pro finální strom z matrice Chthonius_concat (Obr. 17) byla použita topologie získaná z fylogenetické analýzy BA, doplněna o podpory nodů z analýzy ML ( lnl ). U finálního stromu z matrice Chthonius_red (Obr. 21, přílohy) byla také použita topologie z analýzy BA opět doplněna o podpory nodů z ML analýzy (-lnl ). Výsledné topologie získané z obou matric ( Chthonius_concat a Chthonius_red ) se díky velmi nízké podpoře v bazálních částech stromu velmi lišily. V rámci terminálních skupin druhů/druhů byly nody relativně dobře podpořeny oběma metodami a vykazovaly podobnu topologii. Výsledky z matrice Chthonius_concat se vyznačovaly větší kongruencí topologií mezi analýzami BA a ML, i větší podporou nodů, než výsledný strom redukované matrice Chthonius_red. Proto jsou nadále vyvozovány závěry z výsledků stromu matrice Chthonius_concat a výsledky z matrice Chthonius_red jsou umístěny v přílohách pro porovnání. Následující popis výsledků se vztahuje ke stromu matrice Chthonius_concat (Obr. 17). Obě metody poskytly podobnou topologii v podpořených kládech, ale lišily se v jejich uspořádání. Na rozdíl od BA analýzy byl zvolený outgroup Mundochthonius sp. zařazen analýzou ML do vnitřní druhové skupiny Chthonius (Chthonius) carinthiacus, ale bez dostatečné podpory. Ve stromu BA byly druhové skupiny Chthonius (Ephippiochthonius) tyrrhenicus a Chthonius (Globochthonius) poeninus nalezeny jako sesterské ke zbytku. Tři hlavní klády byly rozlišeny v rámci BA, podle ML bylo rozlišeno hlavních kládů pět, ale ani v jednom případě uspořádání kládů nedosáhlo dostatečné podpory. Ani v jedné z analýz nebylo potvrzeno tradiční morfologické rozdělení rodu Chthonius na dva podrody Chthonius a Epiphiochthonius, všichni sekvenovaní zástupci podrodu Epiphiochthonius, s výjimkou druhu Ch. (E.) tyrrhenicus umístěném na bázi stromu, byli seskupeni v rámci jednoho kládu bez dostatečné podpory. Obě analýzy podpořily monofílii druhů Ch. (Ch.) alpicola, Ch. (Ch.) ischnocheles, Ch. (Ch.) raridentatus, Ch. (Ch.) ilvensis a Ch. (E.) fuscimanus. V rámci BA analýz byli všichni jedinci druhu Ch. (Ch.) tenuis seskupeni v jednom kládu společně s druhy Chthonius (Ch.) globifer a Ch. (Ch.) alpicola, topologie však nemá dostatečnou podporu pro potvrzení monofilie Ch. (Ch.) tenuis ani pro rozřešení vztahů mezi jednotlivými druhy. Druhý klád obsahoval monofyletickou skupinu tvořenou Ch. (Ch.) ischnocheles, Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles a jednu linii (jedinec G55) Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus, kde Ch. (Ch.) ischnocheles je sesterskou skupinou dvěma zbývajícím liniím. Tato skupina byla nalezena jako sesterská skupina k monofyletickému druhu Ch. (Ch.) raridentatus, 46
47 bohužel bez dostatečné podpory. Třetí klád obsahoval druhy Ch. (Ch.) carinthiacus, Ch. (Ch.) ilvensis a druhou linii Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus, nový druh Chthonius sp. a většinu druhů podrodu Ephippiochthonius, nízká podpora nodů však neumožňuje vyvozování závěrů o jejich evolučních vztazích. Jedinou výjimkou je pozice druhu Ch. (E.) fuscimanus, který byl nalezen jako vnitřní skupina podpořeného kládu obsahujícího část jedinců druhu Ch. (E.) boldorii. 47
48 Obr. 17: Fylogenetický strom vytvořený fylogenetickou analýzou BA, u nějž byla použita topologie získaná z analýzy BA, doplněna o podpory nodů z analýzy ML. Podpořené klády oběma analýzami (BA a ML), jsou vyznačeny, kde byla podpora 0,90 a více pro BA analýzu a 70% a více pro ML analýzu.
49 6 Diskuze 6.1 Charakteristika karyotypů rodu Chthonius Z čeledi Chthoniidae bylo doposud karyologicky studováno 11 druhů štírků, z nichž se do rodu Chthonius řadí 8 druhů pocházejících z Evropy (Rumunsko, Česká republika a Řecko) (Šťáhlavský a Král 2004). Hlavním cílem předložené práce byla karyotypová charakteristika štírků rodu Chthonius (Chthoniidae) z oblasti Alp a potvrzení či doplnění doposud publikovaných cytogenetických charakteristik této skupiny štírků. Informace o karyopech se podařilo získat celkem u 85 samců řadících se ke 13 taxonům. V rámci podrodu Chthonius (Chthonius) bylo analyzováno 8 druhů, z podrodu Chthonius (Ephippiochthonius) 4 druhy a z podrodu Chthonius (Globochthonius) 1 druh. Cytogenetická data získaná v rámci diplomové práce na tomto rozsáhlejším materiálu potvrzují již dříve zjištěné charakteristiky tohoto rodu. U samců rodu Chthonius byla již dříve zjištěna achiasmatická meióza (Šťáhlavský a Král 2004). Byla popsána nepřítomnost diplotene a diakineze z důvodu absence chiasmat mezi homologickými chromosomy a tím pádem také crossing-overu, proto hovoříme o achiasmatické meióze. Tento typ meiotického dělení byl v této diplomové práci potvrzen. U samic této skupiny štírků se zatím nepodařilo získat údaje o průběhu meiózy, které by dokládaly přítomnost či absenci chiasmat u tohoto pohlaví. Existuje však předpoklad, že absence chiasmat je omezena pouze na jedno pohlaví, většinou heterogametické (White 1973). Z tohoto důvodu i Šťáhlavský a Král (2004) předpokládají, že achiasmatická meióza se vyskytuje pouze u samců rodu Chthonius. Nicméně u štírů se uvažuje o možnosti přítomnosti achiasmatické meiózy i u samic (Adilardi et al. 2015). Obecně u pavoukovců byla achiasmatická meióza objevena u štírů (např. Schneider et al. 2009), některých pavouků (čeledi Dysderidae a Segestriidae) (Benavente a Wettstein 1980, Kořínková a Král 2013) a roztočů ze skupiny Hydrachnellae (Oliver 1977). Dá se tedy předpokládat, že vznik achiasmatické meiózy je v rámci pavoukovců nezávislý. Dalším typickým znakem štírků rodu Chthonius je systém chromosomového určení pohlaví. Pro čeleď Chthoniidae byl na základě doposud zjištěných informací stanoven X0 pohlavní chromosomální systém (Šťáhlavský a Král 2004), který potvrzuje i tato práce. Pohlavní chromosom X je metacentrický a největší chromosom v karyotypu. U všech doposud zkoumaných čeledí štírků, kterými jsou Chernetidae (Šťáhlavský et al. 49
50 2005), Geogarypidae, Garypinidae, Olpiidae (Šťáhlavský et al. 2006), Atemnidae (Šťáhlavský et al. 2012) a Neobisiidae (Troiano 1990, 1997, Šťáhlavský et al. 2013) se tento systém chromosomového určení pohlaví vyskytuje také a morfologie pohlavního chromosomu je u různých čeledí štírků většinou obdobná. Výrazná výjimka týkající se morfologie pohlavního chromosomu X byla objevena u druhu Olpium pallipes (Olpiidae), kde u jedné populace je X akrocentrický. K tomuto stavu pravděpodobně došlo pericentrickou inverzí z původně metacentrického pohlavního chromosomu X (Šťáhlavský et al. 2006). Dalšími výjimkami jsou druhy, jejichž pohlavní chromosom X vykazuje submetacentrickou morfologii. Řadí se sem druh Garypinus dimidiatus, který představuje jediného karyologicky studovaného zástupce čeledi Garypinidae (Šťáhlavský et al. 2006). Dále druhy neotropických štírků Semeiochernes armiger a Cordylochernes scorpioides, oba z čeledi Chernetidae (Šťáhlavský et al. 2009). Může se tak jednat o specifickou změnu morfologie pohlavního chromosomu X v rámci těchto fylogenetických linií štírků. Podobně jako to je doloženo u čeledi Neobisiidae, v rámci které pouze u rodu Roncus (Neobisiidae) byl u některých druhů štírků zjištěn také pohlavní chromosomální systém XY (Troiano 1990, 1997; Zaragoza a Šťáhlavský 2008, Šťáhlavský et al. 2013). Pohlavní chromosomy (X i Y) mohou nicméně mít u různých druhů tohoto rodu různou velikost i morfologii a předpokládá se tudíž, že jde ve skutečnosti o neopohlavní chromosomy vzniklé přestavbami mezi původním pohlavním chromosomem X a autosomy (Šťáhlavský et al. 2013). Systém chromosomového určení pohlaví typu X0 a velký metacentrický pohlavní chromosom X jsou tedy původní pro štírky (např. Troiano 1990, 1997; Šťáhlavský et al. 2012). Štírci rodu Chthonius byly v této diplomové práci podrobeni C-pruhování, jedná se o vůbec první aplikaci této metody u štírků. Konstitutivní heterochromatin byl detekován pouze v oblasti centromer, což umožnilo jejich přesnou lokalizaci a výpočet morfologického typu chromosomů. Což bylo důležité zejména u chromosomů, kde centromery nebyly po přímém barvení Giemsou patrné stejně jako v rámci pavoukovců u Amblypygi (Sember 2007), či roztočů z čeledi Ixodidae (Garcia et al. 2002). Naopak nebyly u štírků prokázány žádné další bloky heterochromatinu (pericentromerického, subtelomerického a telomerického), které jsou popisovány u některých araneomorfních pavouků (Král et al. 2006). Koncentrace konstitutivního heterochromatinu do oblasti centromer lze u štírků považovat za ancestrální znak, stejně jako se to předpokládá u pavouků (Rodríguez-Gil et al. 2007). C-pruhování také potvrdilo hypotézu, že výrazné 50
51 pozitivně heteropyknotické bloky patrné v časných fázích meiózy jsou skutečně centromery (Šťáhlavský et al. 2006). Z C-pruhování se dá navíc usuzovat, že pohlavní chromosom X je tvořen mimo centromerickou oblast zejména euchromatinem a pozitivní heteropyknóza během časných fází meiózy je způsobena pouze jeho intenzivnější spiralizací, stejně jako se to předpokládá u slíďáků (Dolejš et al. 2010). Celkově štírci vykazují velké rozpětí diploidních počtů chromosomů od 7 (Olpiidae) (Šťáhlavský et al. 2006) po 137 (Atemnidae) (Šťáhlavský et al. 2012), nicméně se zdá, že jednotlivé čeledi mají mnohem užší rozpětí počtu chromosomů typické pro různé fylogenetické linie. Například u čeledi Chernetidae se rozpětí 2n pohybuje v rozmezí nebo u čeledi Neobisiidae 2n=16-67 chromosomů (Šťáhlavský 2015). V diplomové práci byla potvrzena variabilita počtu chromosomů u rodu Chthonius, která odpovídá zjištěnému rozpětí v předcházející analýze Šťáhlavského a Krále (2004). Diploidní počet chromosomů se pohyboval v rozmezí V karyotypech všech analyzovaných samců převládají akrocentrické chromosomy. Nejčastější diploidní počet u štírků rodu Chthonius je 35 chromosomů. Šťáhlavský a Král (2004) předpokládají, že tento počet chromosomů, akrocentrická morfologie a jejich plynule zmenšující se velikost je pro štírky tohoto rodu původní. Tento předpoklad plně potvrzují výsledky z Alp u druhů Ch. (Ch.) carinthiacus a Ch. (E.) fuscimanus s 2n=35, které byly také studováni zmíněnými autory a kde jsou přítomny jen akrocentrické chromosomy. U ostatních druhů s diploidním počtem 35 také převládají akrocentrické chromosomy, ale v jejich karyotypu byly nalezeny i jiné morfologické typy autosomů. 51
52 6.2 Karyotypová evoluce rodu Chthonius Šťáhlavský a Král (2004) předpokládají, že se v karyotypové evoluci rodu Chthonius uplatňují centrické a tandemové fúze, což vede ke snižování počtu chromosomů a změně morfologie jednoramenných chromosomů na dvojramenné. Druh 2n PChS Morfologie autosomů Stát Zdroje M SM ST Ch. (Ch.) alpicola 21 X0 20 I vlastní data Ch. (Ch.) carinthiacus 35 X0 34 Cz Šťáhlavský a Král 2004 Ch. (Ch.) carinthiacus 35 X0 34 I vlastní data Ch. (Ch.) diophthalmus 33 X Ro Šťáhlavský a Král 2004 Ch. (Ch.) ischnocheles 31 X Ch, F vlastní data Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles 35 X Ch vlastní data Ch. (Ch.) litoralis 35 X Gr Šťáhlavský a Král 2004 Ch. (Ch.) orthodactylus 33 X Cz vlastní data Ch. (Ch.) raridentatus I vlastní zdroje 29 X0 Slo II 4 24 vlastní zdroje Ch. (Ch.) rhodochelatus 35 X I vlastní data Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus 35 X I vlastní data Ch. (Ch.) tenuis Ch. (Ch.) tenuis I 35 X I vlastní zdroje Ch. (Ch.) tenuis II 2 30 Slo vlastní zdroje Ch. (Ch.) tenuis III 33 X A vlastní zdroje Ch. (Ch.) tenuis IV 32 I vlastní zdroje Ch. (Ch.) tenuis V 21 X I vlastní zdroje Ch. (E.) boldorii 35 X A, I vlastní data Ch. (E.) fuscimanus 35 X0 34 Cz Šťáhlavský a Král 2004 Ch. (E.) fuscimanus 35 X0 34 I vlastní data Ch. (E.) tetrachelatus 35 X Cz Šťáhlavský a Král 2004 Ch. (E.) tetrachelatus 35 X Slo vlastní data Ch. (E.) nanus 25 X I vlastní data Ch. (E.) sp X Gr Šťáhlavský a Král 2004 Ch. (E.) sp X Gr Šťáhlavský a Král 2004 Ch. (G.) poeninus 25 X I vlastní data Tab. 5: Všechny doposud karyologicky analyzované druhy štírků z rodu Chthonius. Vysvětlivky: M-metacentrické chromosomy, SM-submetacentrické chromosomy, ST-subtelocentrické chromosomy, A-akrocentrické chromosomy, PChS-pohlavní chromosomální systém, I-Itálie, Cz-Česká republika, Ro-Rumunsko, Ch-Švýcarsko, Slo-Slovinsko, Gr-Řecko, A-Rakousko, F-Francie. A 52
53 Graf 1: Počet autosomů různých morfologických typů obsažených v diploidní sadě chromosomů (2n) druhů rodu Chthonius. Vysvětlivky: M-metacentrické chromosomy, SM-submetacentrické chromosomy, ST-subtelocentrické chromosomy, A-akrocentrické chromosomy. V předložené práci se bohužel nepodařilo pomocí molekulárně fylogenetické analýzy dvou genů (cox1 a H3) objasnit vzájemné fylogenetické vztahy analyzovaných taxonů. Přesný směr a mechanismy karyotypové evoluce štírků se tedy nepodařilo přesně identifikovat. Z četnosti karyotypu s 35 chromosomy (Tab. 5) se nicméně může usoudit, že tento počet skutečně může být původní. Podobné změny počtu, morfologie a velikosti chromosomů spojené centrickými a tandemovými fúzemi lze navíc dobře pozorovat u druhu Ch. (Ch.) tenuis. U tohoto druhu byly zjištěny karyotypové rasy II, III a IV, u kterých se vyskytoval diploidní počet 33 chromosomů. U prvních dvou karyotypových ras došlo ke snížení počtu chromosomů z předkládaného původního počtu 2n=35 pravděpodobně centrickou fúzí, kdy se původně dva akrocentrické chromosomy spojily za vzniku dvouramenného chromosomu. U třetí karyotypové rasy nejspíše došlo k tandemové fúzi, kdy se centromera jednoho chromosomu připojí k opačnému konci druhého chromosomu za vzniku většinou dlouhého jednoramenného chromosomu. Druhy s nižším diploidním počtem vykazují vícenásobné centrické nebo tandemové fúze. Například druh Ch. (Ch.) alpicola s 2n=21 má ve svém karyotypu přítomné pouze akrocentrické chromosomy, takže se dá předpokládat, že v tomto případě došlo k vícenásobné tandemové fúzi. Z porovnání četnosti morfologických typů chromosomů v karyotypech s různými diploidními počty (Graf 1), že počet metacentrických a submetacentrických chromosomů se v karyotypech nijak výrazně nemění,ale počet 53
54 akrocentrických a subtelocentrických autosomů se v karyotypech s nižším počtem chromosomů snižuje. To by mohlo podporovat vliv tandemových fúzí. V karyotypové evoluci tohoto rodu mohlo dojít také k pericentrickým inverzím, kdy se vytvoří dva zlomy na jednom chromosomu v úseku zahrnujícího centromeru a následně se přetočí úsek mezi oběma zlomy, ale velikost chromosomu se nemění. Tato chromosomová přestavba mohla být příčinou vzniku velikostně malých metacentrických či submetacentrických chromosomů v karyotypech jednotlivých druhů štírků. Další chromosomové přestavby nelze vyloučit, ale vzhledem k jejich velice omezené možnosti identifikace pomocí standardních cytogenetických metod je nelze přesně identifikovat. Mezi takovéto přestavby se řadí paracentrické inverze, tedy inverze nezahrnující centromeru, translokace (výměna odlomených segmentů dvou chromosomů), delece (ztráta části chromosomu) či duplikace (zdvojení části chromosomu). 6.3 Karyotypová variabilita a možné využití v taxonomii Impulzem ke karyotypové analýze štírků rodu Chthonius v Alpách byla snaha o identifikaci možných kryptických druhů. Předpokládá se totiž, že karyotypy u štírků mají značnou mezidruhovou variabilitu a rozdíly mezi nimi tudíž odrážejí existenci různých druhů i u jinak morfologciky uniformních taxonů (např. Troiano 1990, 1997; Zaragoza a Šťáhlavský 2008). Trochu překvapivě se přímé využití porovnání karyotypů v taxonomii a popisu nového druhu využilo pouze jedinkrát v případě kryptického druhu Roncus montsenyensis (Neobisiidae) (Zaragoza a Šťáhlavský 2008). Jedním z problémů komplikujícím využití cytogenetických dat v taxonomii je mimo jiné fakt, že k dispozici je zatím jen malé množství detailněji popsaných karyotypů u štírků a také malá znalost o případné vnitrodruhové variabilitě. Ta je doložená u jiných skupin pavoukovců. Vysoká vnitrodruhová variabilita byla pozorována u některých druhů štírů, například u Tityus bahiensis (2n = 5-19) (Schneider et al. 2009). U sekáčů byla zjištěna variabilita navíc vlivem B chromosomů (Tsurusaki a Shimada 2004). U téměř všech analyzovaných čeledí štírků byla zjištěna karyotypová mezidruhová variabilita (Šťáhlavský 2015). Například u čtyř epigeických a dvou hypogeických druhů patřících do podrodu Roncus analyzovaných Troianem (1990, 1997), u kterých se diploidní počet chromosomů pohyboval v rozmezí To že doposud nebyla u štírků doložená karyotypová vnitrodruhová variabilita, může být 54
55 artefakt toho, že se analyzovalo malé množství exemplářů většinou navíc ze stejných lokalit, jako např. Ch. (E.) fuscimanus a Ch. (Ch.) carinthiacus, který byl navíc v práci Šťáhlavského a Krále (2004) chybně určen jako Ch. (Ch.) tenuis (viz Christophoryová et al. 2012). V této diplomové práci se obdobný problém malého množství analyzovaného materiálu týká druhů Ch. (E.) nanus, Ch. (E.) fuscimanus, Ch. (E.) tetrachelatus, Ch. (G.) poeninus, Ch. (Ch.) rhodochelatus a Ch. (Ch.) alpicola. Naopak mnohem více exemplářů se podařilo získat u druhu Ch. (Ch.) carinthiacus, než v případě zmíněných autorů a u dalších druhů analyzovaných v této diplomové práci. U řady druhů se podařilo zjistit výrazně odlišné karyotypy od ostatních druhů, které jsou tudíž pro jednotlivé druhy dobře charakteristické (např. Ch. (Ch.) ischnocheles, Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles a Ch. (E.) boldorii). Štírci rodu Chthonius vykazovaly vnitrodruhovou karyotypovou variabilitu u druhů Ch. (Ch.) tenuis a Ch. (Ch.) raridentatus. U druhu Ch. (Ch.) tenuis bylo zjištěno pět karyotypových ras, které se lišily v diploidním počtu chromosomů (2n=35; 33; 21) a v morfologii chromosomů. Druh Ch. (Ch.) raridentatus zahrnoval dvě karyotypové rasy se stejným diploidním počtem 29, ale s odlišnou morfologií chromosomů. U tohoto druhu se jedinci s odlišným karyotypem vyskytovaly na stejné lokalitě. V rámci druhu Ch. (Ch.) tenuis se karyotypová rasa III s 2n=33 a karyotypová rasa V s 2n=21 nacházely ve stejné lokalitě jako dva jedinci karyotypové rasy 2n=35. V této diplomové práci se však bohužel na rozdíl od štírů kompletní propojení karyologických dat s analýzou molekulární fylogeneze nepovedlo. U štírků rodu Chthonius, jak bylo zmíněno výše, nebyla nikdy doložena vnitrodruhová variabilita z důvodu malého množství jedinců většinou ze stejných lokalit. Některé druhy a zjištěné karyotypové rasy se vyskytují v geograficky oddělených areálech jako například karyotypová rasa II ze slovinské lokality Bohinska Bistrica (kód J130) a karyotypová rasa III z rakouské lokality Altfinkenstein (kód A31) druhu Ch. (Ch.) tenuis (viz Obr. 18H, přílohy), ale některé byly nalezeny také uvnitř areálů typických karyotypových ras jako například karyotypová rasa V z italské lokality Noli (kód B65) druhu Ch. (Ch.) tenuis (viz Obr. 18H, přílohy), někdy dokonce i syntopicky, takovým příkladem je karyotypová rasa II ze slovinské lokality Roče (kód J121) druhu Ch. (Ch.) rarridentatus (viz Obr. 18E, přílohy). Toto značně komplikuje interpretaci karyologických rozdílů mezi jednotlivými druhy či případnou identifikaci kryptických druhů. Zjištěná vnitrodruhová karyotypová variabilita značně komplikuje možné využití karyologických dat k identifikaci možných 55
56 kryptických druhů. Ideální by tak bylo cytogenetická data kombinovat s dalšími typy analýz. 6.4 Druhová diverzita a evoluční vztahy u Alspkých druhů rodu Chthonius Alpské pohoří nejen v minulosti, ale i dnes má velký vliv na rozšíření nejrůznějších organismů. Fyzikální, pylové a fosilní údaje o klimatických změnách v Evropě naznačují, že většina společenstev byla omezena na refugiální oblasti v jižní Evropě během glaciálních cyklů (Webb a Bartlein 1992, Hewitt 1999). Stejně tak tomu bylo i u alpských štírků, kteří pravděpodobně přežívali nepříznivé podmínky v refugiích v Itálii nebo na Balkáně (Muster et al. 2004). Štírci jsou organismy se sedentérním způsobem života. U rodu Chthonius není známá forézie, tedy možnost šíření jedinců prostřednictvím jiných živočichů na větší vzdálenosti (Poinar Jr et al., 1998). Snížená možnost disperze na větší vzdálenosti, a tím způsobená izolace v refugiích pravděpodobně vedla ke vzniku nových druhů (Bálint et al. 2008, Scheel a Hausdorf 2012). U alpských štírků se dají takové druhy pravděpodobně očekávat, podobně jako u jiné skupiny pavoukovců štírů podrodu Alpiscorpius, kde byla v nedávné době skrýtá druhová diverzita odhalena na základě karyologických metod a analýzy DNA (Plíšková 2014). Takto recentně vzniklé druhy bývají často morfologicky velmi podobné a jejich rozlišení je možné až za pomoci molekulárních metod (Haubrich a Schmitt 2007), či přidání dalšího typu dat nebo metodiky jako například modelování ekologické niky (Bind a Stockman 2008, Hendrixson et al. 2013, Raxworthy et al. 2007), genotypování (Dasmahapatra et al. 2009), nebo případně karyologie (Zaragoza a Šťáhlavský 2008). Delimitace druhů u morfologicky uniformních skupin pouze na základě sekvenčních dat často naráží na obdobné problémy jako každá z výše jmenovaných metod, pokud je použita jednotlivě (Edwards a Knowles 2014). Vzestup používání molekulárních metod v posledních 20ti letech, potřeba rychlého zpracování dat u velkých barcodingových projektů a častá obtížnost získání dobrých morfologických dat případně dat ekologických nebo behaviorálních, které by se daly k delimitaci využít, zapříčinil rozvoj metod pro delimitaci druhů čistě z molekulárních dat. Tyto metody jsou založeny na použití jednoho genu nejčastěji cox1 (GMYC, Pons et al. 2006; ABDG, Puillandre et al. 2012; BIN, Ratnasingham a Hebert 2013) nebo genů více (BPP, Yang a Rannala 2010). V rámci 56
57 pavoukovců byly tyto metody použity převážně u pavouků a štírů, hlavně u morfologicky uniformních skupin jako jsou sklípkani (Mygalomorpha) (Hamilton et al. 2014, Henderixson et al. 2013, Opatova a Arnedo 2014), či pro detekci potenciálních kryptických druhů u ohrožených jeskynních pavouků (Hedin et al. 2005) nebo taxonomicky komplikovaných štírů rodu Alpiscorpius (Parmakelis et al. 2013). U štírků byly pro detekci kryptických druhů v minulosti úspěšně použity fylogenetické analýzy založené převážně na mitochondriální DNA. V komplexu druhů Cordylochernes scorpioides (Chernetidae) byly detekovány dva divergentní klády odpovídající novým druhům s minimální vnitrodruhovou diverzitou (Wilcox et al. 1997). Díky kombinaci mtdna společně s 18S byly rekonstruovány složité evoluční vztahy a odhaleny nové evoluční linie u jeskynních rodů štírků Tyrannochthonius a Lagynochthonius (Chthoniidae) (Harrison et al. 2014). Dvě geograficky izolované linie byly odhaleny i v rámci pouštního foretického druhu Dinocheirus arizonensis (Chernetidae) (Pfeiler et al. 2009). Další práce se zabývala štírčím rodem Horus (Olpiidae), u kterého se zjišťovalo geografické vymezení na základě DNA analýz. Výsledkem bylo, že populace na různých lokalitách jsou geneticky odlišné a s rostoucí vzdáleností mezi lokalitami se zvyšují genetické rozdíly (Van Heerden et al. 2013). V rámci této diplomové práce se však bohužel nepodařilo získat sekvence ze všech karyotypovaných jedinců a v některých případech u druhů vykazujících karyotypovou variabilitu (Ch. (Ch.) tenuis) nejsou některé karyotypové rasy ve fylogenetických analýzách zastoupeny, což zněmožňuje posoudit, zda rozdíl v počtu chromosomů může působit jako účinná reprodukční bariéra vedoucí ke speciaci. Problém získat kvalitní DNA v rámci diplomové práce mohl být způsoben modifikací techniky výroby karyologických preparátů, kdy se kvůli malé velikosti štírků disociovalo v kyselině octové celé tělo štírka a došlo pravděpodobně k rozpuštění i jiných tkání než jen gonád. Úspěšné propojení karyologických dat s analýzou DNA se podařilo v podstatě pouze u dvou taxonů Ch. (Ch.) ischnocheles (jedinci z Itálie) a Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles (jedinci ze Švýcarska). Karyologicky se tyto dva druhy liší v diploidním počtu chromosomů, pro druh Ch. (Ch.) ischnocheles 2n=31 a pro Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles 2n=35 a v morfologii zastoupených chromosomů v karyotypu (viz Obr. 3 a 4, výsledky). Tyto dva druhy jsou ve fylogenetickém stromě umístěny v rámci jednoho kládu společně s jednou linií určené jako Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus, kde Ch. (Ch.) ischnocheles je umístěn jako sesterská skupina ke dvěma výše jmenovaným taxonům. Chthonius (Ch.) 57
58 ischnocheles je evropský druh štírka s velkým areálem rozšíření pokrývající svým výskytem celé Alpy (Gardini 2000) a je možné, že tento druh ve skutečnosti obsahuje doposud nedetekovanou kryptickou diverzitu. Chthonius (Ch.) ischnocheles a Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles si jsou morfologicky velice podobní, existují mezi nimi pouze drobné rozdíly, jako je velikost těla a výraznější granulace makadel u druhu Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles a (Gardini, osobní komentář) tyto nově nalezené rozdíly v morfologii společně s rozdíly v karyotypu zjištěné v rámci této diplomové práce naznačují, že se v tomto případě může potencionálně jednat o dosud nepopsané druhy. Další hojně rozšířený druh v Evropě je Ch. (Ch.) tenuis. Studovaní jedinci v této práci pokrývají téměř celé Alpy, kde je velmi hojným druhem (Gardini 2000). Jak již bylo výše zmíněno, u tohoto druhu byly zjištěny různé karyotypy lišící se v diploidním počtu a morfologii chromosomů. Kvůli problematické amplifikaci DNA (viz výše) je ve fylogenetických analýzách zastoupen bohužel jen karyotyp 2n=35, což zněmožňuje posoudit, zda rozdíly v počtu chromosomů a jejich morfologii u karyotypů s 2n=33 a 2n=21 mohou potenciálně působit jako účinná reprodukční bariéra. V rámci Ch. (Ch.) tenuis byla nalezena celá řada relativně hlubokých linií, výsledky z fylogenetických analýz však bohužel nedosahovaly dostatečné podpory potřebné pro objasnění vnitrodruhových analýz vztahů ani u jedinců s 2n=35. Získaná topologie neumožňuje formování fylogeografických hypotéz, přesto však alespoň naznačuje, že populace Ch. (Ch.) tenuis nejsou geneticky uniformní a geneticky velmi odlišní jedinci se mohou vyskytovat společně (například jedinci I100, I101 a M2 z lokality Zambla v Itálii). V rámci východně se vyskytujícího druhu Ch. (Ch.) raridentatus byly ve fylogenetických analýzách zastoupeny oba detekované karyotypy (2n=29, lišící se morfologií chromosomů). Podle výsledků analýz struktura vnitrodruhové variability odpovídá různým karyotypům. Přestože karyotypová rasa I je v sesterském vztahu ke kládu tvořeným většinou zástupců, kde byla karyotypová rasa II detekována u dvou jedinců, fakt že karyotypová rasa I je zastoupena pouze jedincem J117 znesnadňuje interpretaci výsledků. V tomto případě je možné, že by odlišná morfologie chromosomů mohla hrát důležitou roli ve speciaci Ch. (Ch.) raridentatus, pro potvrzení této hypotézy je však nezbytné získat více materiálu reprezentující karyotypovou rasu I. Za povšimnutí také stojí velká genetická diverzita na lokalitě Bohinjska Bystrica (Slovinsko), kde mimo zástupce karyotypové rasy II (J138, H8) byl nalezen i zástupce H7, který je sesterskou skupinou pro veškerý použitý materiál Ch. (Ch.) raridentatus. 58
59 Druh štírka Ch. (Ch.) carinthiacus byl ve fylogenetické analýze rozdělenna dva klády a umístěn do skupiny společně s Ch. (Ch.) ilvensis a Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus s nepodpořenými vztahy. Samotné klády byly vždy podpořeny, alespoň jednou z analýz, klád obsahující jedince ze Slovisnka a Itálie (bootstrap=79) a jejich relativně dobré geografické vymezení může naznačovat potenciální existenci kryptických druhl v rámci Ch. (Ch.) carinthiacus. Tento druh má v Evropě široké rozšíření (Harvey 2011), jeho určení je minimálně ve střední Evropě velmi problematické (Christophoryová et al. 2012) a pravděpodobně bude vyžadovat plnou revizi podobně jako druh Ch. (Ch.) rhodochelatus (Gardini, osobní komentář). Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus (Gardini, osobní komentář) jsou od sebe odděleny geografickou bariérou jezerem Lago di Maggiore (tato bariéra figuruje i v případě alpských štírů, Plíšková 2014), kde jedinec G55 je jediným zástupcem v těchto analýzách na západ od této bariéry a zbytek se nalézá izolovaně ve východní části Alp. Druh Ch. (Ch.) rhodochelatus kromě Alp zasahuje svým rozšířením až do jižní Evropy (Chorvatsko a Řecko) (Harvey 2011) a nepochybně může představovat komplex druhů. V rámci této práce však nelze vyvozovat žádné závěry i vzhledem k nejasnému určení obou linií jako pouze cfr. rhodochelatus. V rámci výsledků této diplomové práce byl Ch. (E.) fuscimanus zařazen jako vnitřní skupina Ch. (E.) boldorii. Tyto výsledky mohou naznačovat, že Ch. (E.) boldorii by mohl být ve skutečnosti komplexem druhů (Gardini, osobní komentář). Pro vyřešení vztahů se ukazuje potřeba podrobnější revize rozsáhlého materiálu a dále pokusit se stanovit nějaké méně variabilní morfologické znaky, než je velikost epistomu, která je dosti individuální. A v neposlední řadě je potřeba více materiálu pokrývajícího celé areály rozšíření. Rod Chthonius je tradičně rozdělován na několik podrodů, jejichž klasifikace se v průběhu let měnila. Z počátku byl tento rod rozdělen na čtyři podrody Chthonius (Neochthonius) (Chamberlin, 1929), Chthonius (Chthonius) (C. L. Koch, 1843), Chthonius (Globochthonius) (Beier, 1931) a Chthonius (Ephippiochthonius) (Beier, 1930) (Beier 1932). Později došlo k synonimizování podrodu Chthonius (Neochthonius) a Chthonius (Chthonius) pouze na podrod Chthonius (Chthonius) na základě stejného tvaru ruky makadla. Dále přibyly další podrody Chthonius (Microchthonius) (Hadži, 1933), který byl původně uznáván jako samostatný rod. Dalším podrodem je Chthonius 59
60 (Hesperochthonius) (Muchmore 1968) jehož zástupci jsou známi pouze z USA (Harvey 2011). Tato klasifikace na jednotlivé podrody je založena tradičně na morfologii, a to konkrétně na celkovém tvaru ruky makadla, které má či nemá přítomný hrbol na dorzální straně a dle typu ozubení na prstech makadla. Tato klasifikace je v současné chvíli plně akceptována a morfologické práce považují podrody za monofyletické. V této diplomové práci nicméně nebyla monofylie jednotlivých podrodů na základě molekulárně fylogenetické analýzy dvou genů dostatečně podpořena. Výsledky analýz karyotypů v tomto směru nejsou vůbec využitelné, jelikož zde nejsou žádné specifické rozdíly mezi jednotlivými podorody. 60
61 7 Závěr Štírci rodu Chthonius studovaní v Alpách vykazují obdobné karyotypové charakteristiky jako doposud analyzovaní zástupci tohoto rodu. Diploidní počet chromosomů se u této skupiny pohybuje v rozmezí Všechny studované samčí druhy se vyznačují achiasmatickou meiózou a morfologicky variabilními chromosomy v karyotypech. Tato variabilita je pravděpodobně způsobena chromosomovými přestavbami, které figurují v karyotypové evoluci štírků. Nejčastějšími chromosomovými přestavbami jsou pericentrické inverze, centrické a tandemové fúze. V rámci některých druhů štírků rodu Chthonius (Ch. (Ch.) tenuis a Ch. (Ch.) raridentatus) byly zaznamenány karyotypové rasy s odlišnou morfologií chromosomů a odlišným diploidním počtem. Tyto rasy ne vždy tvoří geograficky oddělené populace, ale většinou se vysyktují v oblastech typických karyotypových ras. Propojením cytogenetických a molekulárně fylogenetických metod se nepodařilo přesně identifikovat karyotypovou evoluci štírků rodu Chthonius. Obecně však pravděpodobně dochází ke snižování počtu chromosomů a výše zmíněným chromosomovým přestavbám. Současná zjištění ukazují na potřebu revize rozsáhlejšího materiálu, stanovení jasnějších morfologických znaků, získání většího množství materiálu zahrnujícího celé areály rozšíření a další cytogenetické a molekulárně fylogenetické analýzy. Co se týká molekulárně fylogenetických analýz, tak je potřeba využít k sekvenaci další gen, a to jaderný více konzervativní 28S, který se často používá pro fylogenezi vyšších taxonomických jednotek. 61
62 8 Literatura Abascal F., Zardoya R. a Telford M. J. (2010) TranslatorX: multiple alignment of nucleotide sequences guided by amino acid translations. Nucleic Acids Research, 1-7 Adilardi R.S., Ojanguren-Affilastro A.A., Mattoni C.I. a Mola L.M. (2015) Male and female meiosis in the mountain scorpion Zabius fuscus (Scorpiones, Buthidae): heterochromatin, rdna and TTAGG telomeric repeats. Genetica, 1-9 Alarcón M., Vargas P., Sáez L., Molero J. a Aldasoro J. J. (2012) Genetic diversity of mountain plants: Two migration episodes of Mediterranean Erodium (Geraniaceae). Molecular Phylogenetics and Evolution, 63, Bálint M., Barnard P., Schmitt T., Ujvárosi L. a Popescu O. (2008) Differentiation and speciation in mountain streams: A case study in the caddisfly rhyacophila aquitanica (trichoptera). Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research, 46, Beier M. (1932a): Pseudoscorpionidea I. Subord. Chthoniinea et Neobisiinea. Das Tierreich, Beier M. (1969) Reliktformen in der Pseudoscorpioniden Fauna Europas. Estratto dalle memorie della Societá Entomologica Italiana, 48, Benavente R. a Wettstein R. (1980): Ultrastructural characterization of the sex chromosomes during spermatogenesis of spiders having holocentric chromosomes and long diffuse stage. Chromosoma, 77, Biju-Duval B., Dercourt J. a Le Pichon X. (1977) From the Tethys ocean to the Mediterranean seas: A plate tectonic model of the evolution of the western alpine system. International symposium on the structural history of the Mediterranean basins. Split (Yugoslavia) October 1976, Edition technip, Paris 1977, Boissin L. a Manier J. F. (1966) Spermatogene`se d Hysterochelifer meridianus (L. Koch) (Arachnide, Pseudoscorpion, Cheliferidae). I. E tude caryologique, Bulletin de la Société Zoologique de France, 91,
63 Bond J.E. a Stockman A.K. (2008) An integrative method for delimiting cohesion species: Finding the population-species interface in a group of californian trapdoor spiders with extreme genetic divergence and geographic structuring. Systematic Biology, 57, Borer M. (2012) Climate oscillations and species interactions: large-scale congruence but regional differences in the phylogeographic structures of an alpine plant and its monophagous insect. Journal of Biogeography, 39, Colgan D. J. et al. (1998) Histone H3 and U2 snrna DNA sequences and arthropod molecular evolution. Australian Journal of Zoology, 46(5), Dasmahapatra K.K., Elias M., Hill R.I., Hoffman J.I. a Mallet J. (2009) Mitochondrial DNA barcoding detects some species that are real, and some that are not. Molecular Ecology Resources, 10(2), Dolejš P., Kořínková T., Musilová J., Opatová V., Kubcová L., Buchar J. a Král J. (2010) Karyotypes of central European spiders of the genera Arctosa, Tricca, and Xerolycosa (Araneae: Lycosidae). European Journal of Entomology, 108, 1-16 Edwards D.L. a Knowles L.L. (2014) Species detection and individual assignment in species delimitation: Can integrative data increase efficacy? Proc Biol Sci, 281, Essl F., Dullinger S., Plutzar C., Willner W. a Rabitsch W. (2011) Imprints of glacial history and current environment on correlations between endemic plant and invertebrate species richness. Journal of Biogeography, 38, Folmer O., Black M., Hoeh W., Lutz R. a Vrijenhoek R. (1994) DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I from diverse metazoan invertebrates. Molecular Marine Biology and Biotechnology, 3, Garcia R.N., Garcia-Fernandez C., Garcia S.M.L. a Valente V.L.S. (2002) Mitotic and meiotic chromosomes of a southern brazilian population of Boophilus microplus (Acari: Ixodidae). Iheringia, Série Zoologia, Porto Alegre, 92(1), Gardini G. (2000) Catalogo degli pseudoscorpioni d italia. Fragmenta Entomologica, Roma, Gardini G. (2013) A revision of the species of the pseudoscorpion subgenus chthonius (ephippiochthonius)(arachnida, pseudoscorpiones, chthoniidae) from italy and neighbouring areas. Zootaxa, 3655,
64 Gardini G. (2014) The species of the Chtonius heterodactylus group from the eastern alps and the carpathians. Zootaxa, 3887 (2), Hamilton C.A., Hendrixson B.E. Brewer M.S. a Bond J.E. (2014) An evaluation of sampling effects on multiple DNA barcoding methods leads to an integrative approach for delimiting species: A case study of the north american tarantula genus aphonopelma (araneae, mygalomorphae, theraphosidae). Molecular Phylogenetics and Evolution, 71, Harrison S.E., Guzik M.T. a Austin A.D. (2014) Molecular phylogenetic analysis of western australian troglobitic chthoniid pseudoscorpions (pseudoscorpiones: Chthoniidae) points to multiple independent subterranean clades. Invertebrate Systematics, 28, Harvey M.S. (1992) The Phylogeny and Classification of the Pseudoscorpionida (Chelicerata : Arachnida). Invertebrate Taxonomy, 6, Harvey M.S. (2007) The smaller arachnid orders: diversity, descriptions and distributions from Linnaeus to the present (1758 to 2007). Zootaxa 1668, Harvey M.S. (2011) Pseudoscorpions of the world, version 2.0. Western australian museum, perth. Haubrich K. a Schmitt T. (2007) Cryptic differentiation in alpine endemic, high altitude butterflies reveals down slope glacial refugia. Molecular Ecology, 16, Hedin M. (2015) High-stakes species delimitation in eyeless cave spiders (cicurina, dictynidae, araneae) from central texas. Molecular Ecology, 24, Hendrixson B.E., Derussy B.M., Hamilton C.A. a Bond J.E. (2013) An exploration of species boundaries in turret-building tarantulas of the mojave desert (araneae, mygalomorphae, theraphosidae, aphonopelma). Molecular and Phylogenetics Evolution, 66, Hewitt G. (1996) Some genetic consequences of ice ages, and their role in divergence and speciation. Biological Journal of the Linnean Society, 58, Hewitt G. (1999) Post-glacial recolonization of european biota. Biological Journal of the Linnean Society, 68, Hewitt G. (2000) The genetic legacy of the quaternary ice ages. Nature, 405,
65 Hewitt G. (2004) Genetic consequences of climatic oscillations in the Quaternary. Philosophical Transactions of the Royal Society London B, 359, Holderegger R. a Thiel-Egenter C. (2009) A discussion of different types of glacial refugia used in mountain biogeography and phylogeography. Journal of Biogeography, 36, Christophoryová J. (2012) Prvé nálezy druhov šťúrikov Allochernes powelli, Chthonius carinthiacus, Chthonius tuberculatus a Withius hispanus (Pseudoscorpiones) na Slovensku. 10. Arachnologická konferencia: História a súčasnosť slovenskej arachnológie, Zborník abstraktov, Východná, Christophoryová J., Šťáhlavský F., Krumpál M a Fedor P. (2012) Pseudoscorpions of the Czech Republic and Slovakia: An annotated and revised checklist (Arachnida: Pseudoscorpiones). North-western Journal of Zoology, 8 (1), 1-21 Judson M.L.I. (2005) Baltic amber fossil of Garypinus electri Beier provides first evidence of phoresy in the pseudoscorpion family Garypinidae (Arachnida: Chelonethi). In Logunov D.V. & Penny D. (eds): Proceedings of the 21st European Colloquium of Arachnology, St. Petersburg, 4 9 August 2003, Kořínková T. a Král J. (2013) Karyotypes, Sex Chromosomes, and Meiotic Division in Spiders. Spider Ecophysiology, Král J.(1994) Přehled cytogenetiky pavoukovců. Biologické listy, 59 (4), Král J., Musilová J., Šťáhlavský F., Řezáč M., Akan Z., Edwards R.L., Coyle F.A. a Almerje C.R. (2006) Evolution of the karyotype and sex chromosome systems in basal clades of araneomorph spiders (Araneae: Araneomorphae). Chromosome Research, 14, Kwiatek J. (2010) Europa od A do Z. Readerś Digest Przegląd Sp. Z o. o., Warszawa, 2010, Pp 511 Lanfear R., Calcott B., Ho S.Y.W. a Guidon S. (2012) PartitionFinder: combined selection of partitioning schemes and substitution models for phylogenetic analyses. Molecular Biology and Evolution, 29, Legg G. a Jones R.E. (1988) Pseudoscorpions (Arthropoda: Arachnida). Synopses of the British Fauna (New series), 40,
66 Levan A., Fredga K. a Sandberg A.A. (1964) Nomenclature for centromeric position of chromosomes. Hereditas, 52, McCormack J. E., Huateng H. a Knowles L. L. (2009) Sky islands. Encyclopedia of Islands (Gillespie, RG and D Clague, eds.) University of California Press: Berkeley, CA, Michalová K. a Zemanová Z. (2005) Klasická a molekulární cytogenetika v klinické praxi. Klinická Biochemie a Metabolismus, 13 (34), Miller M. A., Pfeiffer W. a Schwartz T. (2010) Creating the CIPRES Science Gateway for Inference of Large Phylogenetic Trees. Gateway Computing Environments Workshop (GCE), Conference 10, November 14, 2010, New Orleans, LA, USA, 1-8 Murienne J., Harvey M.S. a Giribet G. (2008) First molecular phylogeny of the major clades of Pseudoscorpiones (Arthropoda: Chelicerata). Molecular Phylogenetics and Evolution, 49, Muster Ch., Schmarda T., Blick T. (2004) Vicariance in a cryptic species pair of European Pseudoscorpions (Arachnida, Pseudoscorpiones, Chthoniidae). Zoologischer Anzeiger, 242, Nokkala S. a Nokkala Ch. (1983) Achiasmatic male meiosis in two species of Saldula (Saldidae, Hemiptera). Hereditas, 99, Oliver J.H. (1977) Cytogenetics of mites and ticks. Annual Review of Entomology, 22, Opatova V. a Arnedo M.A. (2014) Spiders on a hot volcanic roof: Colonisation pathways and phylogeography of the canary islands endemic trap-door spider titanidiops canariensis (araneae, idiopidae). PLoS ONE, 9, e doi: /journal.pone Parmakelis A., Kotsakiozi P., Stathi I., Poulikarakou S. a fet V. (2013) Hidden diversity of Euscorpius (Scorpiones: Euscorpiidae) in Greece revealed by multilocus species-delimitation approaches. Biological Journal of the Linnean Society, 110 (4), Pfeiler E., Bitler B.G., Castrezana S., Matzkin L.M. a Markow T.A. (2009) Genetic diversification and demographic history of the cactophilic pseudoscorpion Dinocheirus arizonensis from the Sonoran Desert. Molecular Phylogenetics and Evolution, 52,
67 Plíšková J. (2014) Karyotypová evoluce štírů podrodu Euscorpius (Alpiscorpius) v oblasti Alp. Diplomová práce, Katedra Zoologie PřF UK, Pp 82 Poinar Jr, G.O., Curcic, B.P. a Cokendolpher, J.C. (1998) Arthropod phoresy involving pseudoscorpions in the past and present. Acta Arachnologica, 47, Pons J., Barraclough T.G., Gomez-Zurita J., Cardoso A., Duran D.P., Hazell S., Kamoun S., Sumlin W.D. a Vogler A.P. (2006) Sequence-based species delimitation for the DNA taxonomy of undescribed insects. Systematic Biology, 55, Puillandre N., Lambert A., Brouillet S. a Achaz G. (2012) Abgd, automatic barcode gap discovery for primary species delimitation. Molecular Ecology, 21, Rambaut A. (2012) FigTree v Available in Rambaut A. a Drummond A. J. (2009) TRACER v 1.6. Available in Ratnasingham S. a Hebert P.D. (2013) A DNA-based registry for all animal species: The barcode index number (bin) system. PLoS ONE, 8, e66213 Raxworthy C.J., Ingram C.M., Rabibisoa N. a Pearson R.G. (2007) Applications of ecological niche modeling for species delimitation: A review and empirical evaluation using day geckos (phelsuma) from madagascar. Syst Biol, 56, Rodríguez-Gil S.G., Merani M.S., Scioscia C.L. a Mola L.M. (2007) Cytogenetics in three species of Polybetes Simon 1897 from Argentina (Araneae, Sparassidae) I. karyotype and chromosome banding pattern. BioOne Research Evolved, Journal of Arachnology, 35(2), Ronquist F. a Huelsenbeck J.P. (2003) MrBayes 3: Bayesian phylogenetic inference under mixed models. Bioinformatics, 19, Rull V. (2009) Microrefugia. Journal of Biogeography, 36, Sakamoto Y. a Zacaro A. A. (2009) LEVAN, an ImageJ plugin for morphological cytogenetic analysis of mitotic and meiotic chromosomes. Initial version. Available in Sember A. (2010) Analýza karyotypu u vybraných bičovců řádů Amblypygi a Uropygi. Diplomová práce, Katedra genetiky a mikrobiologie PřF UK, Pp
68 Schawaller W., Shear, W.A a Bonamo P. M. (1991) The First Paleozoic Pseudoscorpions (Arachnida, Pseudoscorpionida). American Museum Novitates, 3009, 1-17 Scheel, B.M. a Hausdorf, B. (2012) Survival and differentiation of subspecies of the land snail charpentieria itala in mountain refuges in the southern alps. Molecular Ecology, 21, Schmid S. M., Fügenschuh B., Kissling E. a Schuster R. (2004) Tectonic map overall architecture of the Alpine orogen. Eclogae Geologicae Helvetiae, 97, Schmitt T. (2007) Molecular biogeography of Europe: Pleistocene cycles and postglacial trends. Frontiers in Zoology, 4, 11 Schmitt T. (2009) Biogeographical and evolutionary importance of the european high mountain systems. Frontiers in Zoology, 6, 9 Schmitt T. (2014) Effects of recent and past climatic shifts on the genetic structure of the high mountain Yellow-spotted ringlet butterfly Erebia manto (Lepidoptera, Satyrinae): a conservation problem. Global Change Biology, 20, Schneider M.C., Zacaro A.A., Pinto-da-Rocha R., Candido D.M. a Cella D.M. (2009): Complex meiotic configuration of the holocentric chromosomes: the intriguing case of the scorpion Tityus bahiensis. Chromosome Research, 17, Silvestro D. a Michalak I. (2012) raxmlgui: a graphical front-end for RAxML. Organisms Diversity and Evolution, 12, Sokolow I. (1926) Untersuchungen über die Spermatogenese bei den Arachniden. II: Über die Spermatogenese der Pseudoscorpione. Z. Zellforschung und Mikroskopische Anatomie, 3, Sumner A.T. (1972) A simple technique for demostrating centromeric heterochromatin. Experimental Cell Research, 75, Suomalainen E., Cook L. M. a Turner J. R. G.(1973) Achiasmatic oogenesis in the Heliconiine butterflies. Hereditas, 74, Šlégl, J. a kolektiv (1999) Světová pohoří Evropa. Knižní klub a Balios, Praha, 1999, 720. publikace,vydání první, 176 stran 68
69 Šťáhlavský F. (2015) The pseudoscorpion cytogenetic database. Available in Šťáhlavský F., Henderickx H. a Král J. (2005) Karyotype Study on Pseudoscorpions of the Genus Lasiochernes Beier (Pseudoscorpiones, Chernetidae). Folia biologica (Kraków), 53, 1-2 Šťáhlavský F., Chritophoryová J. a Henderickx H. (2013) A karyological study of four European species of Roncus (Pseudoscorpiones: Neobisiidae). European Journal of Entomology, 110 (3), Šťáhlavský F. a Král J. (2004) Karyotype analysis and achiasmatic meiosis in pseudoscorpions of the family Chthoniidae (Arachnida: Pseudoscorpiones). Hereditas, 140, Šťáhlavský F., Král J., Harvey M. S. a Haddad C. R. (2006) A karyotype study on the pseudoscorpion families Geogarypidae, Garypinidae and Olpiidae (Arachnida: Pseudoscorpiones). European Journal of Entomology, 103, Šťáhlavský F., Král J., Harvey M. S. a Haddad C. R. (2012) The First Cytogenetic Characterization of Atemnids: Pseudoscorpions with the Highest Chromosome Numbers (Arachnida: Pseudoscorpiones). Cytogenetic and Genome Research, 137, Šťáhlavský F., Vařil T. a Christophoryová J. (2008) Pseudoscorpions of the genera Neobisium and Roncus from Carpathians prospects of karyotype and molecular studies. 24th European Congress of Arachnology, August in Bern, Switzerland, 2008 Šťáhlavský F., Zeh J.A., Zeh D.W. a Král J. (2009) Karyotypes of the Neotropical pseudoscorpions Semeiochernes armiger and Cordylochernes scorpioides (Pseudoscorpiones: Chernetidae). The Journal of Arachnology, 37, Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipinski A. a Kumar S. (2013) MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0. Molecular Biology and Evolution, 30, Traut W. (1976) Pachytene mapping in the female silkworm, Bombix mori L. (Lepidoptera). Chromosoma, 58, Tribsch A. (2004) Areas of endemism of vascular plants in the eastern alps in relation to pleistocene glaciation. Journal of Biogeography, 31,
70 Troiano G. (1990) Karyotype and male meiosis of four species of Roncus L. Koch, 1873 (Pseudoscorpionida, Neobisiidae). Bolletino di Zoologia, 57, 1-9 Troiano G. (1997) Further studies on the karyology of the Pseudoscorpions of the gene Roncus: the karyotype of Roncus gestroi and Roncus bel1uatii. Caryologia, 50(3-4), Tsurusaki N. a Shimada T. (2004) Geographic and seasonal variations of the number of B chromosomes and external morphology in Psathyropus tenuipes (Arachnida: Opiliones). Cytogenetic and Genome Research, 106, Van Heerden J., Taylor P.J. a Van Heerden C. (2013) Genetic Differentiation in Horus Chamberlin (Arachnida: Pseudoscorpiones: Olpiidae) as Indicated by Mitochondrial DNA Analysis. BioOne Research Evolved, African Zoology, 48(2), Warshall P. (1995) The madrean sky island archipelago: a planetary overview. Biodiversity and management of the madrean archipelago: the sky islands of southwestern United States and northwestern Mexico, 264, 6-18 Webb T. a Bartlein P.J. (1992) Global changes during the last 3 million years: Climatic Controls and Biotic Responses. Annual Reviews of Ecology and Systematics, 23, Weygoldt P. (1969) The Biology of Pseudoscorpions. Harvard University Press, Cambridge, Massachusetts, White M.J.D. (1973) Animal cytology and evolution. Cambridge, New York. Pp Wilcox T.P., Hugg L., Zeh J.A. a Zeh D.W. (1997) Mitochondrial DNA Sequencing Reveals Extreme Genetic Differentiation in a Cryptic Species Complex of Neotropical Pseudoscorpions. Molecular Phylogenetics and Evolution, 7 (2), Willet S.D. (1999) Orogeny and orography: The effects of erosion on the structure of mountain belts. Journal of geophysical research, vol. 104, no. B12, Xia X. (2013) DAMBE5: A comprehensive software package for data analysis in molecular biology and evolution. Molecular Biology and Evolution, 30(7),
71 Xia X. a Lemey P. (2009) Assessing substitution saturation with DAMBE in Philippe Lemey, Marco Salemi and Anne-Mieke Vandamme, eds. The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to DNA and Protein Phylogeny. 2nd edition Cambridge University Press. Xia X., Xie M. Salemi, Chen L. a Wang Y. (2003) An index of substitution saturation and its application. Molecular Phylogenetics and Evolution, 26, 1-7 Yang Z. a Rannala B. (2010) Bayesian species delimitation using multilocus sequence data. Proceedings of the National Academy of Sciences, 107, Zaragoza J. A. a Šťáhlavský F. (2008) A new Roncus species (Pseudoscorpiones: Neobisiidae) from Montseny Natural Park (Catalonia, Spain), with remarks on karyology. Zootaxa, 1693, Zeh D.W. a Zeh J.A. (1992) Failed predation or transportation? Causes and consequences of phoretic behavior in the Pseudoscorpion Dinocheirus arizonensis (Psudoscorpionida: Chernetidae). Journal of Insect Behavior, 5(1), Zima J., Macholán M., Munclinger P. a Piálek J. (2004) Genetické metody v zoologii. Karolinum, Praha, 2004, 1. vydání, Pp
72 9 Přílohy Tab. 6: Seznam analyzovaných jedinců jednotlivých druhů štírků s uvedenými lokalitami a GPS souřadnicemi, diploidním počtem chromosomů a geny pro cox1 a H3. Zkratky států: F Francie, I Itálie, A Rakousko, Slo Slovinkso, Ch Švýcarsko, Cz Česká republika. Druh Kód Stát Lokalita GPS 2n cox1 H3 Chthonius (Chthonius) Ch. (Ch.) alpicola A24 I Santa Caterina / Ch. (Ch.) alpicola I95 I Ometto / cox1 H3 Ch. (Ch.) alpicola I97 I Sonvico / cox1 H3 Ch. (Ch.) carinthiacus A32 I Vitorio Veneto / Ch. (Ch.) carinthiacus A36 I Tarvisio / Ch. (Ch.) carinthiacus A38 I Tarvisio / Ch. (Ch.) carinthiacus B22 I Lago di Ledro / Ch. (Ch.) carinthiacus A66 A Barenhtal / cox1 H3 Ch. (Ch.) carinthiacus B95 I Lago di Ledro / cox1 Ch. (Ch.) carinthiacus C105 Slo Triglav / cox1 Ch. (Ch.) carinthiacus C106 Slo Logarska dolina / cox1 Ch. (Ch.) carinthiacus H9 Slo Bohinjska Bistrica / cox1 H3 Ch. (Ch.) carinthiacus I89 I Pannone / cox1 Ch. (Ch.) carinthiacus I96 I Ometto / cox1 H3 Ch. (Ch.) carinthiacus I98 I Sonvico / cox1 H3 Ch. (Ch.) carinthiacus I107 I Morier / cox1 Ch. (Ch.) ischnocheles C44 Ch Bieane / cox1 Ch. (Ch.) ischnocheles C48 F Glère / cox1 H3 Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles C36 I Egna / cox1 Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles C47 Ch Valangin / Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles I48 I Pannone / cox1 Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles I57 I Lichtenberg / Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles I58 I Lichtenberg / cox1 Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles I59 I Lichtenberg / cox1 Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles K23 I Lebenberg / cox1 H3 Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles L28 I Egna / Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles K61 I Domaso / cox1 Ch.(Ch.) cfr. ischnocheles M31 I Vermiglio / Ch.(Ch.) cfr. ischnocheles M33 I Vermiglio / Ch.(Ch.) cfr. ischnocheles M35 I Vermiglio / Ch.(Ch.) cfr. ischnocheles M36 I Vermiglio / Ch. (Ch.) raridentatus A39 A Barenhtal / Ch. (Ch.) raridentatus J39 Slo Kamnik / Ch. (Ch.) raridentatus J116 Slo Roče / Ch. (Ch.) raridentatus J117 Slo Roče / cox1 Ch. (Ch.) raridentatus J120 Slo Roče /
73 Tab. 6 pokračování Druh Kód Stát Lokalita GPS 2n cox1 H3 Ch. (Ch.) raridentatus J121 Slo Roče / Ch. (Ch.) raridentatus J129 Slo over Bohinska Bistrica / Ch. (Ch.) raridentatus J138 Slo Bohinjska Bistrica / cox1 H3 Ch. (Ch.) raridentatus K9 Slo Kamniška Bistrica / cox1 Ch. (Ch.) raridentatus C104 Slo Uneč / cox1 Ch. (Ch.) raridentatus H7 Slo Bohinjska Bistrica / cox1 H3 Ch. (Ch.) raridentatus H8 Slo Bohinjska Bistrica / cox1 Ch. (Ch.) raridentatus J119 Slo Roče / cox1 Ch. (Ch.) raridentatus J153 Slo Roče / cox1 Ch. (Ch.) raridentatus J154 Slo Roče / cox1 Ch. (Ch.) raridentatus J155 Slo Roče / cox1 Ch. (Ch.) raridentatus J156 Slo Roče / cox1 Ch. (Ch.) raridentatus J157 Slo Roče / cox1 Ch. (Ch.) raridentatus J158 Slo Roče / cox1 Ch. (Ch.) raridentatus J159 A Altfinkenstein / cox1 Ch. (Ch.) rhodochelatus C9 I Lago di S. G. Sanzena / Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus C8 I Lago di S. G. Sanzena / cox1 Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus C39 I Nuova Olomio / cox1 Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus I55 I Sondrio / cox1 Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus C10 I Lago di S. G. Sanzena / cox1 H3 Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus E100 I Peron / cox1 H3 Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus G55 I Pella / cox1 Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus K13 I Castello / cox1 Ch.(Ch.) cfr. rhodochelatus M11 I Puria / Ch. (Ch.) tenuis A31 A Altfinkenstein / Ch. (Ch.) tenuis B35 I Imperia / cox1 H3 Ch. (Ch.) tenuis B41 I Imperia / Ch. (Ch.) tenuis B61 I Noli / Ch. (Ch.) tenuis B65 I Noli / Ch. (Ch.) tenuis B66 I Noli / cox1 H3 Ch. (Ch.) tenuis G233 I Melle / Ch. (Ch.) tenuis I50 I Zambla / Ch. (Ch.) tenuis I51 I Sondrio / cox1 H3 Ch. (Ch.) tenuis I53 I Sondrio / Ch. (Ch.) tenuis J130 Slo over Bohinska Bistrica / Ch. (Ch.) tenuis K10 I Dezzo Di Scalve / cox1 H3 Ch. (Ch.) tenuis K17 I Dezzo Di Scalve / cox1 Ch. (Ch.) tenuis K18 I Dezzo Di Scalve / cox1 Ch. (Ch.) tenuis K19 I Dezzo Di Scalve / cox1 Ch. (Ch.) tenuis K20 I Dezzo Di Scalve / cox1 Ch. (Ch.) tenuis L24 I Pont-saint-martin / Ch. (Ch.) tenuis L26 I Pont-saint-martin /
74 Tab. 6 pokračování Druh Kód Stát Lokalita GPS 2n cox1 H3 Castelvechio di Rocca / Ch. (Ch.) tenuis B88 I Barbena cox1 Ch. (Ch.) tenuis B92 F Brançon / cox1 H3 Ch. (Ch.) tenuis B94 I Varaze - Pero / cox1 H3 Ch. (Ch.) tenuis B123 F Chalets des Ayes / cox1 Ch. (Ch.) tenuis C52 Ch Gersau Nersscwyz / cox1 Ch. (Ch.) tenuis C63 Ch Ins / cox1 Ch. (Ch.) tenuis C90 I Fucine / cox1 Ch. (Ch.) tenuis I100 I Zambla / cox1 Ch. (Ch.) tenuis I101 I Zambla / cox1 H3 Ch. (Ch.) tenuis J160 A Altfinkenstein / cox1 Ch. (Ch.) tenuis J161 A Altfinkenstein / cox1 Ch. (Ch.) tenuis J162 A Altfinkenstein / cox1 H3 Ch. (Ch.) tenuis K52 I Selvetta / cox1 Ch. (Ch.) tenuis L9 Ch Mauracker / Ch. (Ch.) tenuis L14 Ch Engelberg / Ch. (Ch.) tenuis L15 Ch Engelberg / Ch. (Ch.) tenuis L16 Ch Engelberg / Ch. (Ch.) tenuis L18 I Forte Di Bard / cox1 Ch. (Ch.) tenuis L19 I Forte Di Bard / Ch. (Ch.) tenuis L20 I Buisson / Ch. (Ch.) tenuis L21 I Buisson / Ch. (Ch.) tenuis L44 I Pont-saint-martin / cox1 Ch. (Ch.) tenuis L52 Ch Mauracker / cox1 Ch. (Ch.) tenuis L56 I Buisson / cox1 Ch. (Ch.) tenuis M2 I Zambla / Ch. (Ch.) tenuis M9 I Loreglia / Ch.(Ch.) tenuis M21 I Trarego Viggiona / Ch.(Ch.) tenuis M22 I Trarego Viggiona / Ch.(Ch.) tenuis M23 I Trarego Viggiona / Ch.(Ch.) tenuis M25 I Isola Di Fondra / Ch.(Ch.) tenuis M28 I Carona / Ch.(Ch.) tenuis M29 I Carona / Ch.(Ch.) tenuis M30 I Carona / Ch.(Ch.) tenuis M39 I Loreglia / Ch. (Ch.) ilvensis B82 I Caprauna / cox1 Ch. (Ch.) ilvensis B96 I Melagno / cox1 H3 Chthonius (Ephippiochthonius) Ch. (E.) boldorii A26 A Altfinkenstein / Ch. (E.) boldorii A28 A Altfinkenstein / Ch. (E.) boldorii A34 I Vitorio Veneto / Ch. (E.) boldorii I49 I Mezzoldo / Ch. (E.) boldorii J132 A Saak /
75 Tab. 6 pokračování Druh Kód Stát Lokalita GPS 2n cox1 H3 Ch. (E.) boldorii J133 A Saak / Ch. (E.) boldorii A69 A Altfinkenstein / cox1 Ch. (E.) boldorii A70 A Altfinkenstein / cox1 Ch. (E.) boldorii B90 I Lago di Ledro / cox1 H3 Ch. (E.) boldorii B91 I Lago di Ledro / cox1 H3 Ch. (E.) boldorii D3 A Tscheppachslucht / Ch. (E.) boldorii D4 A Tscheppachslucht / Ch. (E.) boldorii G5 A Hohenems / cox1 Ch. (E.) boldorii G210 I Loppio / cox1 H3 Ch. (E.) boldorii I92 Ch Tiefencastel / cox1 H3 Ch. (E.) boldorii I93 I Ometto / cox1 H3 Ch. (E.) boldorii I99 I Sonvico / cox1 H3 Ch. (E.) boldorii M10 I Puria / Ch. (E.) fuscimanus C16 I Selva di Cerda / cox1 H3 Ch. (E.) fuscimanus C17 I Selva di Cerda / cox1 Ch. (E.) tetrachelatus J106 Slo Srpenica / cox1 H3 Ch. (E.) nanus B37 I Imperia / Ch. (E.) nanus B39 I Imperia / Ch. (E.) tyrrhenicus B81 I Noli / cox1 H3 Chthonius (Globochthonius) Ch. (G.) poeninus K16 I Castello / cox1 H3 Ch. (G.) globifer L43 I Buisson / cox1 Chthonius sp. Chthonius sp. I81 I Soffranco / cox1 H3 Outgroup Mundochthonius sp. MS27 Cz Praha / cox1 H3 Roncus lubricus RL120 Cz Praha / cox1 H3 75
76 Tab. 7: Výsledky měření jednotlivých druhů štírků rodu Chthonius. Relativní délka chromosomu haploidní sady v % (R.L.), poměr ramének (A.R.) a příslušné směrodatné odchylky (SD R.L., SD A.R.).N značí počet měření pro daný druh. A Ch. (Ch.) alpicola 2n=21(N=5) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 13,23 0,66 >7 12, ,49 0,41 >7 38, ,92 0,75 >7 13,01 4 7,98 1,34 >7 32,37 5 6,1 0,41 >7 18,44 6 5,39 0,18 >7 15,71 7 5,11 0,31 >7 15,64 8 4,82 0,17 >7 8,66 9 3,55 0,65 >7 12, ,97 0,28 >7 8,89 X 27,36 3,49 1,22 0,03 B Ch. (Ch.) carinthiacus 2n=35 (N=1) SD R.L. A.R. R.L. 1 7,29 >7 2 7,04 >7 3 6,78 >7 4 6,66 >7 5 5,97 >7 6 5,87 >7 7 4,57 >7 8 4,37 >7 9 3,89 >7 10 3,85 >7 11 3,41 >7 12 3,25 >7 13 3,14 >7 14 3,06 >7 15 2,67 >7 16 2,54 >7 17 2,34 >7 X 23,3 1,1 SD A.R. C Ch. (Ch.) ischnocheles 2n=31 (N=2) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 8,47 0,56 1,35 0,27 2 7,7 0,24 >7 9,47 3 6,78 0,02 >7 12,36 4 6,32 0,32 >7 3,68 5 5,58 0,22 >7 5,07 6 5,44 0,11 >7 11,04 7 5,4 0,08 >7 3,8 8 5,38 0,11 >7 4,51 9 5,14 0,13 >7 0, ,93 0,17 >7 9, ,82 0,07 >7 7, ,42 0,61 >7 10, ,15 0,36 1,13 0, ,95 0,18 >7 0, ,66 0,13 >7 2,89 X 17,85 2,23 1,1 0,13 76
77 D Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles 2n=35 (N=5) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 7,47 0,58 1,23 0,17 2 7,22 0,56 >7 14,03 3 6,89 0,46 2,32 0,26 4 5,79 0,13 >7 3,94 5 5,64 0,13 >7 12,65 6 5,43 0,13 >7 39,05 7 5,28 0,15 >7 13,36 8 4,99 0,14 >7 10,89 9 4,91 0,14 >7 23, ,78 0,08 >7 12, ,64 0,18 >7 21, ,27 0,20 >7 3, ,05 0,70 1,20 0, ,87 0,16 >7 6, ,27 0,43 >7 33, ,91 0,53 >7 6, ,45 0,43 >7 12,17 X 17,12 1,05 1,13 0,09 E Ch. (Ch.) raridentatus 2n=29 (N=10) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 10,91 0,77 >7 26, ,12 0,75 1,29 0,19 3 9,84 1,08 >7 13,84 4 8,10 1,59 >7 29,96 5 5,66 2,58 >7 28,77 6 5,05 0,49 >7 11,15 7 4,54 0,35 >7 19,62 8 4,08 0,28 >7 18,63 9 3,73 0,29 >7 18, ,59 0,27 >7 18, ,41 0,18 >7 11, ,15 0,15 >7 12, ,86 0,18 >7 10, ,60 0,18 >7 10,44 X 22,37 2,74 1,10 0,09 F Ch. (Ch.) raridentatus 2n=29 (N=15) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 10,91 0,74 1,20 0,14 2 9,55 1,17 1,21 0,16 3 9,39 0,85 >7 13,12 4 7,39 0,64 >7 6,63 5 6,25 0,67 >7 6,18 6 5,20 0,36 >7 5,92 7 4,85 0,39 >7 6,15 8 4,60 0,44 >7 5,76 9 4,43 0,35 >7 5, ,15 0,32 >7 4, ,84 0,26 >7 6, ,38 0,35 >7 4, ,13 0,31 >7 2, ,90 0,34 >7 3,99 X 20,01 3,87 1,20 0,15 G Ch. (Ch.) rhodochelatus 2n=35 (N=4) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 6,73 0,25 >7 4,92 2 5,97 0,22 >7 3,37 3 5,65 0,12 >7 1,77 4 5,51 0,14 >7 2,47 5 5,37 0,09 >7 7,63 6 5,26 0,14 >7 8,11 7 5,03 0,17 >7 4,16 8 4,85 0,28 >7 7,50 9 4,65 0,17 >7 5, ,65 0,17 >7 6, ,36 0,17 >7 7, ,12 0,16 >7 1, ,76 0,60 1,44 0, ,73 0,23 2,16 0, ,71 0,09 >7 3, ,37 0,36 >7 3, ,92 0,19 >7 4,69 X 20,38 1,46 1,1 0,1 H Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus 2n=35 (N=3) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 6,25 0,58 >7 14,48 2 5,62 0,30 >7 4,71 3 5,35 0,39 >7 28,74 4 5,16 0,18 >7 13,81 5 5,15 0,83 1,27 0,37 6 5,03 0,24 >7 8,71 7 4,79 0,20 >7 11,71 8 4,59 0,30 >7 21,35 9 4,48 0,28 >7 21, ,33 0,27 >7 16, ,23 0,19 >7 7, ,13 0,07 >7 4, ,96 0,21 >7 6, ,89 0,15 >7 20, ,85 0,11 1,16 0, ,56 0,16 >7 8, ,24 0,65 >7 7,12 X 22,43 2,60 1,16 0,15 CH Ch. (Ch.) tenuis 2n=35 (N=2) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 6,41 0,43 >7 65,49 2 5,72 0,17 >7 68,91 3 5,43 0,09 >7 22,08 4 5,07 0,13 >7 26,38 5 4,85 0,12 >7 7,34 6 4,60 0,10 >7 11,99 7 4,46 0,09 >7 35,30 8 4,01 0,16 >7 13,64 9 3,93 0,11 1,21 0, ,88 0,07 >7 13, ,80 0,04 >7 2, ,73 0,06 >7 6, ,56 0,06 >7 45, ,30 0,06 >7 10, ,08 0,05 >7 9, ,89 0,00 >7 29, ,56 0,06 >7 14,28 X 28,66 0,16 1,23 0,09 77
78 I Ch. (Ch.) tenuis 2n=33 (N=4) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 10,95 0,46 1,35 0,07 2 6,46 0,62 >7 2,58 3 5,64 0,42 >7 5,14 4 5,26 0,32 >7 2,32 5 5,06 0,09 >7 2,40 6 4,87 0,06 >7 4,15 7 4,63 0,21 >7 3,93 8 4,48 0,17 >7 4,29 9 4,27 0,05 >7 2, ,20 0,08 >7 1, ,12 0,05 >7 3, ,87 0,23 >7 2, ,60 0,20 >7 2, ,45 0,19 >7 2, ,36 0,08 >7 3, ,90 0,19 >7 2,39 X 22,87 0,72 1,17 0,16 J Ch. (Ch.) tenuis 2n=33 (N=4) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 11,18 0,33 1,09 0,10 2 5,95 0,54 >7 14,91 3 5,72 0,32 >7 14,85 4 5,49 0,52 5,01 1,37 5 5,44 0,21 >7 6,13 6 5,17 0,14 >7 5,67 7 4,87 0,22 >7 4,19 8 4,63 0,15 >7 8,03 9 4,51 0,14 >7 5, ,32 0,15 >7 19, ,18 0,49 1,25 0, ,94 0,09 >7 9, ,84 0,06 >7 3, ,67 0,08 >7 10, ,57 0,09 >7 5, ,13 0,57 >7 15,63 X 20,44 0,55 1,15 0,19 K Ch. (Ch.) tenuis 2n=33 (N=3) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 10,61 0,43 >7 29,82 2 6,59 0,14 >7 20,68 3 6,03 0,13 >7 10,61 4 5,53 0,15 >7 5,49 5 5,35 0,20 >7 32,52 6 4,98 0,23 >7 14,73 7 4,86 0,26 >7 10,94 8 4,74 0,17 >7 20,92 9 4,40 0,21 >7 3, ,17 0,02 >7 5, ,86 0,07 >7 18, ,69 0,04 >7 23, ,48 0,08 >7 5, ,30 0,10 >7 16, ,92 0,05 >7 6, ,72 0,14 >7 19,90 X 22,86 1,14 1,29 0,06 L Ch. (Ch.) tenuis 2n=21 (N=2) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 19,06 0,94 1,33 0, ,28 0,34 >7 157,75 3 9,44 0,99 1,09 0,08 4 7,56 0,26 1,35 0,08 5 4,27 0,46 >7 2,74 6 3,76 0,23 >7 3,51 7 3,48 0,20 >7 33,79 8 3,36 0,03 >7 26,84 9 3,16 0,20 >7 10, ,88 0,06 >7 0,66 X 26,78 1,63 1,07 0,04 M Ch. (E.) boldorii 2n=35 (N=6) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 7,38 0,47 >7 6,99 2 6,15 0,70 3,34 0,25 3 6,64 0,38 >7 12,71 4 6,35 0,35 >7 16,02 5 5,83 0,24 >7 7,98 6 5,34 0,18 >7 12,81 7 5,08 0,15 >7 13,06 8 4,87 0,13 >7 8,86 9 4,60 0,20 >7 25, ,13 0,35 >7 31, ,19 0,26 >7 16, ,92 0,29 >7 6, ,55 0,12 >7 9, ,41 0,12 >7 11, ,25 0,23 >7 9, ,86 0,25 >7 9, ,43 0,48 >7 5,91 X 19,99 1,50 1,15 0,10 78 N Ch. (E.) fuscimanus 2n=35 (N=4) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 6,7 0,47 >7 4,84 2 6,01 0,13 >7 46,08 3 5,68 0,12 >7 23,52 4 5,45 0,04 >7 42,19 5 5,22 0,13 >7 21,12 6 4,99 0,08 >7 16,22 7 4,88 0,05 >7 39,91 8 4,81 0,08 >7 33,35 9 4,74 0,06 >7 24, ,56 0,15 >7 40, ,43 0,11 >7 22,5 12 4,32 0,08 >7 29, ,25 0,11 >7 33, ,11 0,17 >7 32,5 15 3,96 0,15 >7 8, ,7 0,11 >7 9, ,33 0,24 >7 25,85 X 18,86 0,8 1,13 0,1
79 O Ch. (E.) tetrachelatus 2n=35 (N=14) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 7,45 0,5 >7 8,61 2 6,25 0,43 >7 6,98 3 5,92 0,39 >7 13,62 4 5,66 0,41 >7 7,08 5 5,37 0,32 >7 6,61 6 5,11 0,37 >7 17,26 7 4,88 1,05 7 6,02 8 4,67 0,24 >7 7,11 9 4,67 0,64 2,64 0, ,56 0,13 >7 3, ,36 0,17 >7 5, ,17 0,18 >7 10, ,92 0,21 >7 7, ,69 0,18 >7 4, ,5 0,17 >7 4, ,28 0,17 >7 9, ,96 0,32 >7 12,62 X 19,59 2,14 1,11 0,08 P Ch. (E.) nanus 2n=25 (N=2) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 20,91 1,41 1,33 0,20 2 6,26 0,42 >7 19,07 3 5,54 0 >7 11,38 4 5,01 0,06 >7 1,59 5 4,64 0,21 >7 17,15 6 4,46 0,02 >7 2,28 7 4,14 0,11 >7 10,61 8 4,05 0,16 >7 14,81 9 3,99 0,17 >7 10, ,65 0,01 >7 1, ,35 0,08 >7 4, ,96 0,2 >7 16,85 X 31,03 1,33 1,12 0 Q Ch. (G.) poeninus 2n=25 (N=2) SD SD R.L. A.R. R.L. A.R. 1 8,04 0,7 >7 16,60 2 7,66 0,26 1,28 0,11 3 6,86 0,66 >7 13,53 4 6,27 0,13 >7 7,07 5 5,49 0 >7 4,31 6 5,39 0,06 >7 0,23 7 5,3 0,05 >7 0,14 8 5,18 0,08 >7 9,33 9 4,86 0,13 >7 9, ,09 0,34 >7 2, ,72 0,03 >7 9, ,37 0,2 >7 0,55 X 33,74 0,62 1,
80 Obr. 18: Mapy výskytu populací karyotypovaných druhů štírků: A Ch. (Ch.) alpicola, B Ch. (Ch.) carinthiacus, C Ch. (Ch.) ischnocheles, D - Ch. (Ch.) cfr. ischnocheles, E Ch. (Ch.) raridentatus karyotypová rasa II, F Ch. (Ch.) rhodochelatus, G Ch. (Ch.) cfr. rhodochelatus, H Ch. (Ch.) tenuis karyotypová rasa II-IV, karyotypová rasa V, CH Ch. (E.) boldorii, I Ch. (E.) fuscimanus, J Ch. (E.) tetrachelatus, K Ch. (E.) nanus, L Ch. (G.) poeninus A B C D E F 2n=4M+24A+X G H 2n=4M+2ST+26A+X 2n=32A+X 2n=2M+30A+X 2n=6M+14A+X 80
81 I CH J K L 81
82 Obr. 19: Mapy výskytu jedinců podrodu Chthonius (Chthonius), podrodu Chthonius (Ephippiochthonius) a podrodu Chthonius (Globochthonius). Vysvětlivky karyotypovaný, karyotypovaný i získaná DNA, pouze získaná DNA. Podrod Chthonius (Chthonius). Druhy Ch.(Ch.) tenuis, Ch.(Ch.) cfr. rhodochelatus, Ch.(Ch.) ischnocheles, Ch.(Ch.) cfr. ischnocheles, Ch.(Ch.) ilvensis, Ch.(Ch.) carinthiacus, Ch.(Ch.) alpicola, Ch.(Ch.) raridentatus, Ch.(Ch.) sp. Podrod Chthonius (Ephippiochthonius). Druhy Ch.(E.) boldorii, Ch.(E.) fuscimanus, Ch.(E.) tetrachelatus, Ch.(E.) nanus, Ch.(E.) tyrrhenicus. 82
83 / Podrod Chthonius (Globochthonius). Druhy Ch.(G.) poeninus, Ch.(G.) globifer. 83
84 Obr. 20: Grafické zobrazení akumulací tranzicí a transverzí v rámci alignmentu vytvořené programem DAMBE (Xia 2013) odhalilo mírnou saturaci na třetích pozicích v alignmentu. Sekvence však byly podle programu vhodné pro fylogenetické analýzy. Vysvětlivky - Xs tranzice a delta v transverze. 84
85 Obr. 21: Fylogenetický strom vytvořený fylogenetickou analýzou BA, u nějž byla použita topologie získaná z analýzy BA, doplněna o podpory nodů z analýzy ML. Podpořené klády oběma analýzami (BA a ML), jsou vyznačeny, kde byla podpora 0,90 a více pro BA analýzu a 70% a více pro ML analýzu.
Cytogenetika. chromosom jádro. telomera. centomera. telomera. buňka. histony. páry bazí. dvoušroubovice DNA
Cytogenetika telomera chromosom jádro centomera telomera buňka histony páry bazí dvoušroubovice DNA Typy chromosomů Karyotyp člověka 46 chromosomů 22 párů autosomů (1-22 od největšího po nejmenší) 1 pár
Evoluce pohlavních chromosomů pavoukovců
ekologie a evol. biologie bezobratlých Evoluce pohlavních chromosomů pavoukovců Jiří Král & František Šťáhlavský Publikace k tématu od roku 2006: Šťáhlavský F., Král J., Harvey M.S. & Haddad C.R. 2006:
World of Plants Sources for Botanical Courses
Pleistocén starší čtvrtohory Pleistocén charakterizován je obecně ochlazením, které je patrné od Oligocénu Obrázek Robert A. Rohde, CC BY-SA 3.0 https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/1/1b/65_myr_climate_change.png
Tribsch A., Schönswetter P. & Stuessy T. (2002): Saponaria pumila (Caryophyllaceae) and the Ice Age in the European Alps. American Journal of Botany
Populační studie Tribsch A., Schönswetter P. & Stuessy T. (2002): Saponaria pumila (Caryophyllaceae) and the Ice Age in the European Alps. American Journal of Botany 89(12): 2024 2033 Proč to studovali?
Populační genetika a fylogeneze jedle bělokoré analyzována pomocí izoenzymových genových markerů a variability mtdna
Mendelova genetika v příkladech Populační genetika a fylogeneze jedle bělokoré analyzována pomocí izoenzymových genových markerů a variability mtdna Roman Longauer, Ústav zakládání a pěstění lesů, MENDELU
Jak měříme genetickou vzdálenost a co nám říká F ST
Jak měříme genetickou vzdálenost a co nám říká F ST 1) Genetická vzdálenost a její stanovení Pomocí genetické rozmanitosti, kterou se populace liší, můžeme určit do jaké míry jsou si příbuznější jaká je
Cvičeníč. 4: Chromozómy, karyotyp a mitóza. Mgr. Zbyněk Houdek
Cvičeníč. 4: Chromozómy, karyotyp a mitóza Mgr. Zbyněk Houdek Chromozomy Geny jsou u eukaryotických organizmů z převážnéčásti umístěny právě na chromozómech v b. jádře. Jejich velikost a tvar jsou rozmanité,
Dědičnost pohlaví Genetické principy základních způsobů rozmnožování
Dědičnost pohlaví Vznik pohlaví (pohlavnost), tj. komplexu znaků, vlastností a funkcí, které vymezují exteriérové i funkční diference mezi příslušníky téhož druhu, je výsledkem velmi komplikované série
RELIÉF A MORFOLOGICKÉ POMĚRY
RELIÉF A MORFOLOGICKÉ POMĚRY Anna Švejdarová Veronika Špačková ALPY nejvyšší pásmové pohoří v Evropě táhnou se přes Slovinsko, Rakousko, Německo, Francii, Švýcarsko, Lichtenštejnsko, Itálii (Monaco) Rozloha
Karyotyp člověka. Karyotyp soubor chromozomů v jádře buňky. Význam v genetickém poradenství ke stanovení změn ve struktuře a počtu chromozomů
Karyotyp soubor chromozomů v jádře buňky Význam v genetickém poradenství ke stanovení změn ve struktuře a počtu chromozomů Historie: 20. léta 20. století přibližný počet chromozomů v buňce člověka 1956
Témata k nostrifikační zkoušce ze zeměpisu střední škola
Témata k nostrifikační zkoušce ze zeměpisu střední škola 1. Geografická charakteristika Afriky 2. Geografická charakteristika Austrálie a Oceánie 3. Geografická charakteristika Severní Ameriky 4. Geografická
Využití DNA markerů ve studiu fylogeneze rostlin
Mendelova genetika v příkladech Využití DNA markerů ve studiu fylogeneze rostlin Ing. Petra VESELÁ Ústav lesnické botaniky, dendrologie a geobiocenologie LDF MENDELU Brno Tento projekt je spolufinancován
3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila. 8) Haploskupiny mtdna a chromozomu Y v ČR
Hledání našeho společného předkap 1) Jak to, že máme společného předka 2) Metodika výzkumu mtdna 3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila 4) Problémy a názory proti 5) Analýza chromozomu Y
CO JE EVROPA 2011 Ing. Andrea Sikorová, Ph.D.
CO JE EVROPA 2011 Ing. Andrea Sikorová, Ph.D. 1 Co je Evropa V této kapitole se dozvíte: Jaká je kultura v Evropě. Má Evropa stejný význam jako Evropská unie. Zda je Evropa samostatným geografickým celkem.
Inovace studia molekulární a buněčné biologie
Inovace studia molekulární a buněčné biologie I n v e s t i c e d o r o z v o j e v z d ě l á v á n í reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním
materiál č. šablony/č. sady/č. materiálu: Autor:
Masarykova základní škola Klatovy, tř. Národních mučedníků 185, 339 01 Klatovy; 376312154, fax 376326089 E-mail: skola@maszskt.investtel.cz; internet: www.maszskt.investtel.cz Kód přílohy vzdělávací VY_32_INOVACE_Z678HO_13_02_17
Biologie - Oktáva, 4. ročník (humanitní větev)
- Oktáva, 4. ročník (humanitní větev) Biologie Výchovné a vzdělávací strategie Kompetence k řešení problémů Kompetence komunikativní Kompetence sociální a personální Kompetence občanská Kompetence k podnikavosti
Chromosomy a karyotyp člověka
Chromosomy a karyotyp člověka Chromosom - 1 a více - u eukaryotických buněk uložen v jádře karyotyp - soubor všech chromosomů v jádře jedné buňky - tvořen z vláknem chromatinem = DNA + histony - malé bazické
Chromozomová teorie dědičnosti. KBI / GENE Mgr. Zbyněk Houdek
Chromozomová teorie dědičnosti KBI / GENE Mgr. Zbyněk Houdek Proč octomilka a T.H. Morgan? Drosophila melanogaster ideální objekt pro genetický výzkum : Rychlý reprodukční cyklus a snadný chov v laboratorních
Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny
Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny Teorie neutrální evoluce Konec 60. a začátek 70. let 20. stol. Ukazuje jak bude vypadat genetická variabilita v populaci a jaká bude rychlost evoluce v případě,
Evropa jeden ze světadílů
Evropa jeden ze světadílů Povrch a poloha Evropy 5. třída ZŠ BŘEŢANY EVROPA Povrch naší planety Země je tvořen pevninou a vodstvem. Více než dvě třetiny povrchu Země jsou pokryty vodstvem. Vodstvo obklopující
"Učení nás bude více bavit aneb moderní výuka oboru lesnictví prostřednictvím ICT ". Základy genetiky, základní pojmy
"Učení nás bude více bavit aneb moderní výuka oboru lesnictví prostřednictvím ICT ". Základy genetiky, základní pojmy 1/75 Genetika = věda o dědičnosti Studuje biologickou informaci. Organizmy uchovávají,
- taxonomicky jeden z nejobtížnějších rodů v Evropě (ca 200-300 druhů)
- produkují taxonomickou diverzitu hybridizací uvnitř skupiny - taxonomicky jeden z nejobtížnějších rodů v Evropě (ca 200-300 druhů) - hlavní příčina taxonomické obtížnosti: relativně běžná hybridizace
Ekologická společenstva
Ekologická společenstva Společenstvo Druhy, které se vyskytují společně v prostoru a čase Složená společenstva jsou tvořena dílčími společenstvy soubory druhů spojené s nějakým mikroprostředím nebo zdrojem
http://www.accessexcellence.org/ab/gg/chromosome.html
3. cvičení Buněčný cyklus Mitóza Modifikace mitózy 1 DNA, chromosom genetická informace organismu chromosom = strukturní podoba DNA během dělení (mitózy) řetězec DNA (chromonema) histony další enzymatické
Rozptyl a migrace. Petra Hamplová
Rozptyl a migrace Petra Hamplová Terminologie Rozptyl a migrace jsou dva nejčastější termíny k označení prostorových pohybů ROZPTYL Krátká vzdálenost Individuální Zpravidla bez návratu Nesměrované Nepravidelné
World of Plants Sources for Botanical Courses
Prostorové šíření organismů Bariéry šíření a prostory pro šíření Bariéry šíření veškeré jevy znesnadňující prostorové šíření nemusí nutně znemožňovat šíření působí jako filtr závisí na prostředí závisí
Základní pojmy I. EVOLUCE
Základní pojmy I. EVOLUCE Medvěd jeskynní Ursus spelaeus - 5 mil. let? - 10 tis. let - 200 tis. let? Medvěd hnědý Ursus arctos Medvěd lední Ursus maritimus Základní otázky EVOLUCE Jakto, že jsou tu různé
Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny
Teorie neutrální evoluce a molekulární hodiny Teorie neutrální evoluce Konec 60. a začátek 70. let 20. stol. Ukazuje jak bude vypadat genetická variabilita v populaci a jaká bude rychlost divergence druhů
Varianty lidského chromosomu 9 z klinického i evolučního hlediska
Varianty lidského chromosomu 9 z klinického i evolučního hlediska Antonín Šípek jr., Aleš Panczak, Romana Mihalová, Lenka Hrčková, Eva Suttrová, Mimoza Janashia a Milada Kohoutová Ústav biologie a lékařské
Mitóza a buněčný cyklus
Mitóza a buněčný cyklus Něco o chromosomech - Chromosom = 1 molekula DNA + navázané proteiny -V diploidní buňce jsou od každého chromosomu 2 kopie (= homologní chromosomy) - Homologní chromosomy nesou
44 somatických chromozomů pohlavní hormony (X,Y) 46 chromozomů
Buněčný cyklus MUDr.Kateřina Kapounková Inovace studijního oboru Regenerace a výţiva ve sportu (CZ.107/2.2.00/15.0209) 1 DNA,geny genom = soubor všech genů a všechna DNA buňky; kompletní genetický materiál
Biologie - Oktáva, 4. ročník (přírodovědná větev)
- Oktáva, 4. ročník (přírodovědná větev) Biologie Výchovné a vzdělávací strategie Kompetence k řešení problémů Kompetence komunikativní Kompetence sociální a personální Kompetence občanská Kompetence k
Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/34.0553 Elektronická podpora zkvalitnění výuky CZ.1.07 Vzděláním pro konkurenceschopnost
Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/34.0553 Elektronická podpora zkvalitnění výuky CZ.1.07 Vzděláním pro konkurenceschopnost Projekt je realizován v rámci Operačního programu Vzdělávání pro konkurence
NÁVAZNOST METOD KLASICKÉ A MOLEKULÁRNÍ CYTOGENETIKY. Vytvořilo Oddělení lékařské genetiky FN Brno
NÁVAZNOST METOD KLASICKÉ A MOLEKULÁRNÍ CYTOGENETIKY TYPY CHROMOSOMOVÝCH ABERACÍ, kterých se týká vyšetření metodami klasické i molekulární cytogenetiky - VYŠETŘENÍ VROZENÝCH CHROMOSOMOVÝCH ABERACÍ prenatální
Vytvořilo Oddělení lékařské genetiky FN Brno
GONOSOMY GONOSOMY CHROMOSOMY X, Y Obr. 1 (Nussbaum, 2004) autosomy v chromosomovém páru homologní po celé délce chromosomů crossingover MEIÓZA Obr. 2 (Nussbaum, 2004) GONOSOMY CHROMOSOMY X, Y ODLIŠNOSTI
EU V/2 1/Z19. Evropa poloha a povrch
EU V/2 1/Z19 Evropa poloha a povrch Výukový materiál (prezentaci PPTX) lze využít v hodinách zeměpisu v 7. ročníku ZŠ. Tématický okruh: Regionální zeměpis světadílů Evropa poloha a povrch. Prezentace slouží
Rozmanitost podmínek života na Zemi Podnebné pásy
Podnebné pásy Tropický mezi obratníky - Vhlké vnitřní tropy: - bez střídání ročních období - silné srážky, -průměrná roční teplota nad 20 C -Vnější tropy: -přechod k subtropům - období dešťů a období sucha
GENETIKA 1. Úvod do světa dědičnosti. Historie
GENETIKA 1. Úvod do světa dědičnosti Historie Základní informace Genetika = věda zabývající se dědičností a proměnlivostí živých soustav sleduje variabilitu (=rozdílnost) a přenos druhových a dědičných
Geomorfologie vybraných skalních útvarů v okolí Bělé pod Bezdězem, Mimoně a České Lípy
Geomorfologie vybraných skalních útvarů v okolí Bělé pod Bezdězem, Mimoně a České Lípy Vedoucí práce: RNDr. Marek Matura, Ph.D. Jakub Koutník, Františka Ektrtová, Andrea Suchánková, Ester Burgerová, Tomáš
3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila. 8) Haploskupiny mtdna a chromozomu Y v ČR
Hledání našeho společného předkap 1) Jak to, že máme společného předka 2) Metodika výzkumu mtdna 3) Analýza mtdna mitochondriální Eva, kdy a kde žila 4) Problémy a názory proti 5) Analýza chromozomu Y
Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/34.0553 Elektronická podpora zkvalitnění výuky CZ.1.07 Vzděláním pro konkurenceschopnost
Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/34.0553 Elektronická podpora zkvalitnění výuky CZ.1.07 Vzděláním pro konkurenceschopnost Projekt je realizován v rámci Operačního programu Vzdělávání pro konkurence
Populační genetika II
Populační genetika II 4. Mechanismy měnící frekvence alel v populaci Genetický draft (genetické svezení se) Genetický draft = zvýšení frekvence alely díky genetické vazbě s výhodnou mutací. Selekční vymetení
World of Plants Sources for Botanical Courses
Speciace a extinkce Speciace Pojetí speciace dominuje proces, při němž vznikají nové druhy organismů z jednoho předka = kladogeneze, štěpná speciace jsou možné i další procesy hybridizace (rekuticulate
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky Populační genetika (KBB/PG)
MENDELOVSKÁ DĚDIČNOST
MENDELOVSKÁ DĚDIČNOST Gen Část molekuly DNA nesoucí genetickou informaci pro syntézu specifického proteinu (strukturní gen) nebo pro syntézu RNA Různě dlouhá sekvence nukleotidů Jednotka funkce Genotyp
Metody studia historie populací. Metody studia historie populací
1) Metody studia genetické rozmanitosti komplexní fenotypové znaky, molekulární znaky. 2) Mechanizmy evoluce mutace, přírodní výběr, genový posun a genový tok 3) Anageneze x kladogeneze - co je vlastně
I. Morfologie toku s ohledem na bilanci transportu plavenin a splavenin
I. Morfologie toku s ohledem na bilanci transportu plavenin a splavenin I.1. Tvar koryta a jeho vývoj Klima, tvar krajiny, vegetace a geologie povodí určují morfologii vodního toku (neovlivněného antropologickou
Kennst du diese Städte, Sehenswürdigkeiten? Mgr. Bc. Miroslava Popelková Německý jazyk- 7. ročník
Kennst du diese Städte, Sehenswürdigkeiten? Mgr. Bc. Miroslava Popelková Německý jazyk- 7. ročník Rhein - Rýn Rýn (německy Rhein, francouzsky Rhin, nizozemsky Rijn, latinsky Rhneus, jméno pochází z keltského
EU PENÍZE ŠKOLÁM NÁZEV PROJEKTU : MÁME RÁDI TECHNIKU REGISTRAČNÍ ČÍSLO PROJEKTU :CZ.1.07/1.4.00/21.0663
EU PENÍZE ŠKOLÁM NÁZEV PROJEKTU : MÁME RÁDI TECHNIKU REGISTRAČNÍ ČÍSLO PROJEKTU :CZ.1.07/1.4.00/21.0663 Speciální základní škola a Praktická škola Trmice Fűgnerova 22 400 04 1 Identifikátor materiálu:
Kameyama Y. et al. (2001): Patterns and levels of gene flow in Rhododendron metternichii var. hondoense revealed by microsatellite analysis.
Populační studie Kameyama Y. et al. (2001): Patterns and levels of gene flow in Rhododendron metternichii var. hondoense revealed by microsatellite analysis. Molecular Ecology 10:205 216 Proč to studovali?
REGIONÁLNÍ GEOGRAFIE LATINSKÉ AMERIKY. 5. přednáška Biogeografie
REGIONÁLNÍ GEOGRAFIE LATINSKÉ AMERIKY 5. přednáška Biogeografie Biosféra Pro její charakter (hlavně druhové složení) jsou určující: klimatické poměry, půda lidské zásahy proto je její rozložení v Latinské
REGIONÁLNÍ GEOGRAFIE LATINSKÉ AMERIKY
REGIONÁLNÍ GEOGRAFIE LATINSKÉ AMERIKY 5. přednáška Biogeografie Biosféra Pro její charakter (hlavně druhové složení) jsou určující: klimatické poměry, půda lidské zásahy proto je její rozložení v Latinské
Malcomber S.T. (2000): Phylogeny of Gaertnera Lam. (Rubiaceae) based on multiple DNA markers: evidence of a rapid radiation in a widespread,
Malcomber S.T. (2000): Phylogeny of Gaertnera Lam. (Rubiaceae) based on multiple DNA markers: evidence of a rapid radiation in a widespread, morphologically diverse genus. Evolution 56(1):42-57 Proč to
Čtvrtohory. pracovní list. Mgr. Libuše VODOVÁ, Ph.D. Katedra biologie PdF MU.
Čtvrtohory pracovní list Mgr. Libuše VODOVÁ, Ph.D. Katedra biologie PdF MU vodova@ped.muni.cz Pracovní list přestavuje soubor sedmi učebních úloh, které byly vytvořeny za účelem procvičení poznatků týkajících
Možné dopady klimatické změny na dostupnost vodních zdrojů Jaroslav Rožnovský
Český hydrometeorologický ústav, pobočka Brno Kroftova 43, 616 67 Brno e-mail:roznovsky@chmi.cz http://www.chmi.cz telefon: 541 421 020, 724 185 617 Možné dopady klimatické změny na dostupnost vodních
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky Populační genetika (KBB/PG)
Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/ Elektronická podpora zkvalitnění výuky CZ.1.07 Vzděláním pro konkurenceschopnost
Registrační číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/34.0553 Elektronická podpora zkvalitnění výuky CZ.1.07 Vzděláním pro konkurenceschopnost Projekt je realizován v rámci Operačního programu Vzdělávání pro konkurence
Výuka genetiky na Přírodovědecké fakultě UK v Praze
Výuka genetiky na Přírodovědecké fakultě UK v Praze Studium biologie na PřF UK v Praze Bakalářské studijní programy / obory Biologie Biologie ( duhový bakalář ) Ekologická a evoluční biologie ( zelený
DUM č. 4 v sadě. 37. Bi-2 Cytologie, molekulární biologie a genetika
projekt GML Brno Docens DUM č. 4 v sadě 37. Bi-2 Cytologie, molekulární biologie a genetika Autor: Martin Krejčí Datum: 02.06.2014 Ročník: 6AF, 6BF Anotace DUMu: Morfologie a rozdělení chromozomů, homologní
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0032 Definice Současný stav Úrovně Indikátory Ochrana Druhová ochrana Genová centra
ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH
ÚSTAV FYZIKÁLNÍ BIOLOGIE JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH ZPRÁVA O UKONČENÍ PROJEKTU Projekt Název projektu: Landscape genetics of Natal Multimammate Mouse (Mastomys natalensis), important rodent
Biologie - Sexta, 2. ročník
- Sexta, 2. ročník Biologie Výchovné a vzdělávací strategie Kompetence k řešení problémů Kompetence komunikativní Kompetence občanská Kompetence sociální a personální Kompetence k podnikavosti Kompetence
VY_32_INOVACE_018. VÝUKOVÝ MATERIÁL zpracovaný v rámci projektu EU peníze školám
VY_32_INOVACE_018 VÝUKOVÝ MATERIÁL zpracovaný v rámci projektu EU peníze školám Registrační číslo projektu: CZ. 1.07. /1. 5. 00 / 34. 0696 Šablona: III/2 Název: Biosféra - prezentace Vyučovací předmět:
Tento výukový materiál vznikl za přispění Evropské unie, státního rozpočtu ČR a Středočeského kraje Mgr.
Tento výukový materiál vznikl za přispění Evropské unie, státního rozpočtu ČR a Středočeského kraje 20.4.2010 Mgr. Petra Siřínková BIOSFÉRA SVĚTOVÝ EKOSYSTÉM suchozemské ekosystémy vodní ekosystémy Probíhá
Fisher M. & al. (2000): RAPD variation among and within small and large populations of the rare clonal plant Ranunculus reptans (Ranunculaceae).
Populační studie Fisher M. & al. (2000): RAPD variation among and within small and large populations of the rare clonal plant Ranunculus reptans (Ranunculaceae). American Journal of Botany 87(8): 1128
Výsledky monitoringu posunů na zlomech v Hornsundu, Špicberky. Josef Stemberk Ústav struktury a mechaniky hornin AV ČR, v.v.i.
Výsledky monitoringu posunů na zlomech v Hornsundu, Špicberky Josef Stemberk Ústav struktury a mechaniky hornin AV ČR, v.v.i. TEKTONICKÉ POHYBY Mechanický pohyb částí zemské kůry a vnějšího pláště, který
Taxonomický systém a jeho význam v biologii
Taxonomie Taxonomický systém a jeho význam v biologii -věda zabývající se tříděním organismů (druhů, rodů, ), jejich vzájemnou příbuzností a podobností. 3 úrovně: 1) charakteristika, pojmenování, vymezení
6. Kde v DNA nalézáme rozdíly, zodpovědné za obrovskou diverzitu života?
6. Kde v DNA nalézáme rozdíly, zodpovědné za obrovskou diverzitu života? Pamatujete na to, co se objevilo v pracích Charlese Darwina a Alfreda Wallace ohledně vývoje druhů? Aby mohl mechanismus přírodního
Populační genetika III. Radka Reifová
Populační genetika III Radka Reifová Genealogie, speciace a fylogeneze Genové genealogie Rodokmeny jednotlivých kopií určitého genu v populaci. Popisují vztahy mezi kopiemi určitého genu v populaci napříč
Název: Přírodní poměry Evropy
Název: Přírodní poměry Evropy Autor: Mgr. Martina Matasová Název školy: Gymnázium Jana Nerudy, škola hl. města Prahy Předmět, mezipředmětové vztahy: geografie, fyzika Ročník: 4. (2. ročník vyššího gymnázia)
Molecular Ecology J. Bryja, M. Macholán MU, P. Munclinger - UK
MODULARIZACE VÝUKY EVOLUČNÍ A EKOLOGICKÉ BIOLOGIE CZ.1.07/2.2.00/15.0204 Molecular Ecology J. Bryja, M. Macholán MU, P. Munclinger - UK Co je molekulární ekologie? Uměle vytvořený obor vymezený technickým
CO JE TO KLIMATOLOGIE
CO JE TO KLIMATOLOGIE 2010 Ing. Andrea Sikorová, Ph.D. 1 Co je to klimatologie V této kapitole se dozvíte: Co je to klimatologie. Co potřebují znát meteorologové pro předpověď počasí. Jaké jsou klimatické
R E G I O N ÁL N Í Z E M ĚP I S
R E G I O N ÁL N Í Z E M ĚP I S INTERAKTIVNÍ VÝUKOVÁ PREZENTACE REGIONŮ II EVROPA PŘÍRODNÍPOMĚRY SKANDINÁVIE Mgr. Iva Švecová DÁNSKO geografickévymezení nížinatá země S Evropy na Jutském poloostrově na
Kameny a voda. Geobotanika
Rozvoj znalostí a kompetencí žáků v oblasti geověd na Gymnáziu Chotěboř a Základní škole a Mateřské škole Maleč Kameny a voda Geobotanika Mgr. Irena Žáková březen 2014 FYTOGEOGRAFIE Vědní obory všeobecné
Základní charakteristika území
NÁRODNÍ PARK ŠUMAVA Základní charakteristika území v r. 1991 (20.3.) vyhlášen za národní park plocha NP: 69030 ha - park plošně největší pro svoji polohu uprostřed hustě osídlené střední Evropy, relativně
Gymnázium a Střední odborná škola, Rokycany, Mládežníků 1115
Gymnázium a Střední odborná škola, Rokycany, Mládežníků 1115 Číslo projektu: CZ.1.07/1.5.00/34.0410 Číslo šablony: Název materiálu: Ročník: Identifikace materiálu: Jméno autora: Předmět: Tématický celek:
MODULARIZACE VÝUKY EVOLUČNÍ A EKOLOGICKÉ BIOLOGIE CZ.1.07/2.2.00/
MODULARIZACE VÝUKY EVOLUČNÍ A EKOLOGICKÉ BIOLOGIE CZ.1.07/2.2.00/15.0204 MODULARIZACE VÝUKY EVOLUČNÍ A EKOLOGICKÉ BIOLOGIE CZ.1.07/2.2.00/15.0204 analýza mikroskopické struktury chromozomů pojem chromozom
Ráj je nemožné vymezit nějakými hranicemi, kolíky či ploty. Lidé si prostor Českého ráje sami ohraničují především citem, a to se ve svém důsledku pro
Ráj je nemožné vymezit nějakými hranicemi, kolíky či ploty. Lidé si prostor Českého ráje sami ohraničují především citem, a to se ve svém důsledku projeví tím, kam nejčastěji chodí a kde již při letmém
DRUHOVĚ NEJBOHATŠÍ LOKALITY NA ZEMI. David Zelený Masarykova univerzita Brno
DRUHOVĚ NEJBOHATŠÍ LOKALITY NA ZEMI David Zelený Masarykova univerzita Brno HLAVNÍ OTÁZKY: Co je to diverzita, biodiverzita a druhová bohatost? alfa, beta a gama diverzita endemismus Kde na Zemi je největší
RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA
RIGORÓZNÍ OTÁZKY - BIOLOGIE ČLOVĚKA 1. Genotyp a jeho variabilita, mutace a rekombinace Specifická imunitní odpověď Prevence a časná diagnostika vrozených vad 2. Genotyp a prostředí Regulace buněčného
REGIONÁLNÍ GEOGRAFIE ANGLOSASKÉ AMERIKY
REGIONÁLNÍ GEOGRAFIE ANGLOSASKÉ AMERIKY 3. přednáška Klima Faktory ovlivňující klima (obecně): astronomické geografické: zeměpisná šířka a délka, vzdálenost od oceánu, reliéf všeobecná cirkulace atmosféry
R E G I O N ÁL N Í Z E M ĚP I S
R E G I O N ÁL N Í Z E M ĚP I S VÝUKOVÁSLEPÁMAPA POLÁRNÍOBLASTI -ARKTIDA Mgr. Iva Svobodová Polární oblasti obecná charakteristika rozsáhlá území obklopující oba zemské póly přesněji vymezené polárním
3 Rozvodovost. Tab. 3.1 Rozvody podle návrhu a pořadí,
3 Rozvodovost Statistika zpracovaná na základě údajů obdržených od Ministerstva spravedlnosti ČR udává 26,1 tisíce rozvedených manželství v roce 2015, nejméně od roku 2000. Téměř třetina rozvodů byla iniciována
VY_12_INOVACE_Vl.4A325 Cestujeme po Evropě 1.notebook
VY_12_INOVACE_Vl.4A325 Cestujeme po Evropě 1.notebook Naše vlast Člověk a jeho svět Forma: práce třídy : interaktivní tabule : CHALUPA, Petr, ŠTIKOVÁ, Věra. Vlastivěda 5: učebnice pro 5. ročník. Brno:
Fyzická geografie. Zdeněk Máčka. Lekce 1 Litosféra a desková tektonika
Fyzická geografie Zdeněk Máčka Lekce 1 Litosféra a desková tektonika 1. Vnitřní stavba zemského tělesa Mohorovičičova diskontinuita Průměrný poloměr Země 6 371 km Gutenbergova diskontinuita Pevné vnitřní
Crossing-over. over. synaptonemální komplex
Genetické mapy Crossing-over over v průběhu profáze I meiózy princip rekombinace genetického materiálu mezi maternálním a paternálním chromosomem synaptonemální komplex zlomy a nová spojení chromatinových
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí. Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/
Propojení výuky oborů Molekulární a buněčné biologie a Ochrany a tvorby životního prostředí Reg. č.: CZ.1.07/2.2.00/28.0032 Genetika populací Studium dědičnosti a proměnlivosti skupin jedinců (populací)
MATURITNÍ OTÁZKY ZE ZEMĚPISU
MATURITNÍ OTÁZKY ZE ZEMĚPISU 1) Země jako vesmírné těleso. Země jako součást vesmíru - Sluneční soustava, základní pojmy. Tvar, velikost a složení zemského tělesa, srovnání Země s ostatními tělesy Sluneční
Univerzita Karlova v Praze Přírodovědecká fakulta katedra fyzické geografie a geoekologie. Pedogeografie a biogeografie.
Univerzita Karlova v Praze Přírodovědecká fakulta katedra fyzické geografie a geoekologie Pedogeografie a biogeografie Půdní profil Pavel BŘICHNÁČ 2. ročník BGEKA zimní semestr 2006/07 Praha 2007 I. Základní
WWW.METEOVIKYROVICE. WWW.METEOVIKYROVICE.WBS.CZ KLIMATICKÁ STUDIE. Měsíc květen v obci Vikýřovice v letech 2006-2009. Ondřej Nezval 3.6.
WWW.METEOVIKYROVICE. WWW.METEOVIKYROVICE.WBS.CZ KLIMATICKÁ STUDIE Měsíc květen v obci Vikýřovice v letech 2006-2009 Ondřej Nezval 3.6.2009 Studie porovnává jednotlivé zaznamenané měsíce květen v letech
Metodické pokyny k pracovnímu listu č Opakování Evropa, povrch
Metodické pokyny k pracovnímu listu č. 20 - Opakování Evropa, povrch Třída: 7. Učivo: Přírodní podmínky Evropy opakování, povrch Obsah inovativní výuky: využití internetu k vyhledávání zeměpisných údajů
Evropa hranice, povrch, vodstvo VY_32_INOVACE_45V1102. Mgr. Hana Kvasničková
Evropa hranice, povrch, vodstvo Mgr. Hana Kvasničková 1 VLASTIVĚDA-EVROPA 5. ročník Poloha, hranice, členitost, povrch, podnebí, vodstvo, rostlinstvo a živočišstvo. Možno využít k výkladu i procvičování
CO JE TO GLOBÁLNÍ OTEPLOVÁNÍ
CO JE TO GLOBÁLNÍ OTEPLOVÁNÍ 2010 Ing. Andrea Sikorová, Ph.D. 1 Co je to globální oteplování V této kapitole se dozvíte: Co je to globální oteplování. Co je to změna klimatu. Co jsou to antropogenní změny.
Opakování Evropy - přírodní poměry. Pobaltí
- sousední světadíly - oceány - ostrovy a poloostrovy - pohoří a nížiny - řeky a jezera Opakování Evropy - přírodní poměry ÚKOL Dunaj: Rýn: Odra: Vypiš státy, kterými tyto řeky protékají! Pobaltí Estonsko,
Evropa země, kde zapadá Slunce
Evropa země, kde zapadá Slunce Euroasie obrovský pevninský blok Kontinent: souvislá část zemské souše Austrálie, Antarktida 5 Eurasie, Afrika, Amerika, Světadíl: samostatný historicko-geografický celek
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/
Inovace studia molekulární a buněčné biologie reg. č. CZ.1.07/2.2.00/07.0354 Tento projekt je spolufinancován Evropským sociálním fondem a státním rozpočtem České republiky Populační genetika (KBB/PG)
Výukový materiál zpracován v rámci projektu EU peníze školám
http://vtm.zive.cz/aktuality/vzorek-dna-prozradi-priblizny-vek-pachatele Autorem materiálu a všech jeho částí, není-li uvedeno jinak, je Mgr. Eva Strnadová. Dostupné z Metodického portálu www.rvp.cz ;
ŠKOLNÍ VZDĚLÁVACÍ PROGRAM. D. Kvasničková a kol.: Ekologický přírodopis pro 7. ročník ZŠ a nižší ročníky víceletých gymnázií, 1. a 2.
Vyučovací předmět : Období ročník : Učební texty : Přírodopis 3. období 7. ročník D. Kvasničková a kol.: Ekologický přírodopis pro 7. ročník ZŠ a nižší ročníky víceletých gymnázií, 1. a 2. část Očekávané