Stanovisko habilitační komise

Transkript

1 Stanovisko habilitační komise k návrhu Matematicko-fyzikální fakulty UK na jmenování uchazeče RNDr. Ondřeje Kyliána, Ph.D. docentem pro obor: Fyzika - Fyzika molekulárních a biologických struktur Složení komise: Předseda: Členové: Oponenti: prof. RNDr. Milan Tichý, DrSc. MFF UK P r f- RNDr. Jaroslav Vlček, CSc. Fakulta aplikovaných věd ZCU prof. Ing. Stanislav Pekárek, CSc. Fakulta e l ekto té čimická ČVUT RNDr. doc. Milan Hrabovský, CSc. Ústav fyziky plazmatu AV ČR doc. RNDr. Josef Blažek, CSc. Pedagogická fakulta JČU prof- RNDr. Stanislav Novák, CSc. Univerzita JEP Ústí nad Labem RNDr. Ing. doc. Rudolf Novák, DrSc. Fakulta strojní ČVUT doc. Mgr. Pavel Kudrna, Dr. Matematicko-fyzikální fakulta UK Název habilitační práce: Biolékarské aplikace nerovnovážného plazmatu Generováno svsliimcm Habilion

2 . Základní údaje o uchazeči.. Jméno, příjmení (dřívější příjmení), tituly, místo a datum narození RNDr. Ondřej Kylián, Ph.D., Praha, Průběh vzdělání a získání vědeckých hodností Získané tituly magistr: 998, Univerzita Karlova v Praze, Matematicko-fyzikální fakulta doktor: 23. Univerzita Karlova v Praze, Matematicko-fyzikální fakulta doktor přírodních věd: 23, Univerzita Karlova v Praze, Matematicko-fyzikální fakulta.3. Průběh zaměstnání : Ústav fyziky atmosféry, AV ČR, odborný pracovník, úvazek 3% : Matematicko-fyzikální fakulta, Univerzita Karlova v Praze, vědecký pracovník, úvazek 5% : European Commission, Joint Research Centre, Institute for Health and Consumer Protection, Itálie, úvazek % : Matematicko-fyzikální fakulta, Univerzita Karlova v Praze, vědecký pracovník, úvazek % současné pracoviště a pracovní zařazení: Od : Matematicko-fyzikální fakulta, Univerzita Karlova v Praze, odborný asistent, úvazek % l.4. Zahraniční pobyty 999 : tříměsíční stáž na Technické Universitě Gent (Belgie) 24-28: Grant Holder a následně Contractual Agent ve Společném výzkumném centru Evropské komise v Ispre (Itálie) 2. Pedagogická činnost 2. l. Výuka v pregraduálním studiu Akad. rok 29/2 Akad. rok 2/2 Akad. rok 2 /22 Akad. rok 22/23 Přednášky (hodin ročně) Semináře (hodin ročně) Praktická výuka - stáže, cvičení, laboratorní práce (hodin ročně) CŽV (hodin ročně} strana 2

3 2.2. Vedeni absolventů pregraduálního a doktorského studia Akad. rok 29/2 Akad. rok 2/2 Akad. rok 2 /22 Akad. rok 22/23 Bc. vedení 2 z toho absolventi Mgr. vedení z toho absolventi Ph.D. vedení 2 z toho absolventi 2.3. Stručná charakteristika hlavních vyučovacích předmětů Fyzika I (mechanika a molekulová fyzika) - NOFY2 Cvičení k základní přednášce pro obor Obecná fyzika zaměřené na mechaniku a molekulovou fyziku. Fyzikální praktikum I pro obor Obecná fyzika - NOFY66 Základní praktikum pro obor Obecná fyzika zaměřené na experimenty z mechaniky a molekulové fyziky. Fyzikální praktikum IV pro obor Obecná fyzika - NOFY3 Základní praktikum pro obor Obecná fyzika zaměřené na experimenty z atomové a jaderné fyziky. Aplikace nerovnovážného plazmatu v lékařství - NBCM39 V této přednášce jsou probírány aktuální problémy související s použitím nízkoteplotního plazmatu pro biolékařské aplikace. Přednáška je zaměřena jednak na popis možných interakcí plazmatu s různými biologickými systémy a to s důrazem na sterilizaci povrchů a na terapeutické účinky plazmatu, jednak na shrnutí různých postupů přípravy biofunkčních povrchů. Krásná fyzika nehezky složitých látek - NBCM82 Seminář je určen posluchačům. až 3. ročníku. Je zaměřen na perspektivní a aktuální témata z fyziky molekulárních a biologických systémů. Na práci semináře se spolupodílejí učitelé MFF UK pracující v oblasti chemické fyziky, biofyziky, fyziky polymerů a povrchů. Cílem je podat informativní přehled o základech užívaných teoretických a experimentálních přístupů v této oblasti fyziky. Diagnostika nízkoteplotního plazmatu - NBCM4 V tomto semináři je na konkrétních příkladech podán přehled diagnostických metod používaných pro určování základních parametrů plazmatu během depozice a úpravy povrchů. Důraz je kladen zejména na praktické seznámení se s používanými diagnostickými metodami. Samostatná laboratorní práce - NBCM8 V tomto předmětu, vhodném pro posluchače. a 2. ročníku jako příprava na bakalářskou práci, mají studenti za úkol vyřešení zadaného dílčího experimentálního úkolu v podmínkách vědecké laboratoře. Fyzikální metody a technika v biomedicíně I - NAFY34 Předmět seznamuje posluchače s fyzikálními principy spektroskopických a zobrazovacích metod, diagnostických a léčebných přístrojů a zařízení. Spektroskopie a zobrazovací techniky využívající elmag. záření (gamma, rtg, optické,

4 mikrovlnné, radiofrekvenční). Akustické přístroje. Lasery a jejich využití. Základy kryotechniky, kryosondy. hypertermie aj. Bakalářský seminář KMF - NBCM43 Náplní tohoto semináře jsou aktuální problematika fyziky makromolekul a referáty studentů o bakalářské práci Autorství učebnic a dalších studijních pomůcek Učebnice a skripta Atlasy e-learningové programy Specifické studijní pomůcky 3. Vědecko-výzkumná činnost.l. Publikace vědecko-výzkumného charakteru a tvůrčího charakteru české a slovenské cizojazyčné celkem posl. 5 let hlavní autor celkem posl. 5 let hlavní autor monografie kap. v monografiích periodika s IF rec. časopisy bez IF 6 4 rec. sborníky bez IF 5 3 krit. edice pramenů koment. překlady 3.2. Vydavatel monografie 3.3. Nejvýznamnější práce uchazeče ) Rossi F, Kylián O, Hasiwa M: Decontamination of surfaces by low pressure plasma discharges 26 PLASMA PROCESSES AND POLYMERS 3, Jedná se o jednu z prvních publikací, které experimentálně prokázaly možnost nejen sterilizace bakteriálních spor nerovnovážným plazmatem, ale i účinného odstraňování a inaktivace různých biomolekul (bakteriálních endotoxinů a bílkovin). Ohlas tohoto článkuje možné dokumentovat 4 citacemi v odborných časopisech. 2) Kylián O, Benedikt J, Sirghi L, Reuter R, Rauscher H, voň Keudell A, Rossi F: Removal of Model Protein s Using Beams of Argon lons, Oxygen Atoms and Molecules: Mimicking the Action of Low-Pressure Ar/O2 ICP Discharges 29 PLASMA PROCESSES AND POLYMERS 6, Zásadním přínosem této práce bylo, že se pomocí experimentů s kalibrovanými zdroji atomárního kyslíku a argonových iontů podařilo experimentálně prokázat dominantní roli chemického odprašování při eliminaci bílkovin z povrchů. Tento závěr je velmi důležitý zejména s ohledem na možnou optimalizaci sterilizačního procesu.

5 3} Kylián O, Polonskyi O, Kratochvil J, Artemenko A, Choukourov A, Drábik M, Solař P, Slavínská D. Biederman H: Control oť Wettability of Plasma Polymers by Application of Ti Nano- Clusters 22 PLASMA PROCESSES AND POLYMERS 9, 8-87 V této práci byla poprvé použita metoda umožňující nezávislou kontrolu chemického složení povrchu a jeho nanodrsnosti založená na kombinaci nanočástic deponovaných plynně-agregačními zdroji a magnetronovým naprašováním polymerních vrstev. Dále se podařilo prokázat, že tímto způsobem je možné regulovat smáčivost povrchů Citace Celkový počet citací dle WOS bez auto čita čí Pozn.: Za autocitaci je považováno, je-li uchazeč na seznamu autorů citovaného i citujícího díla Počet citovaných práci dle WOS Počet citací prací uchazeče vydaných v posledních pěti letech dle WOS bez autocitaci H-index uchazeče dle WOS Údaje 3.4. až dle jiné metodiky celkový počet citací bez autocilací počet citovaných prací počet citací prací uchazeče vydaných v posledních pěti letech bez autociíací H-index uchazeče 3.5. Celkové hodnocení publikační činnosti uchazeče Habilitant publikuje na konferencích od roku 999, první časopisecké publikace vznikly v roce 2. Získal zkušenosti ve spektroskopické diagnostice výbojového plazmatu, tímto tématem se zabývají některé starší práce, jichž byl spoluautorem. Zhruba od roku 26 se dr. Kylián zabývá interakcí nízkoteplotního plazmatu s povrchem, zejména s ohledem na biolékařské aplikace. Některé z těchto publikací jsou již součástí habilitační práce. Podle jednoho z oponentů má habilitační práce výrazně multidisciplinární charakter. Lze ji rozdělit do tří částí, jejichž společným tématem je využití nízkoteplotního plazmatu pro biologické aplikace : - sterilizace předmětů nízkoteplotním plazmatem (kap. 2), - depozice tenkých vrstev plazmových polymerů (kap. 3), - nanočástice a nanoklastry pro lékařské aplikace (kap, 4). Vlastní habilitační spis je tvořen souborem 7 odborných prací publikovaných v prestižních zahraničních časopisech, na nichž se uchazeč podílel jako spoluautor a které vznikly během jeho aktivního působení ve Společném výzkumném centru EK v italské Ispře a na Katedře makromolekulami fyziky MFF UK v Praze. V osmi případech je uchazeč uveden jako první autor. Tomuto souboru předchází komentář v rozsahu 33 stránek. Mezi časopisy, ve kterých habilitant se svými spolupracovníky publikoval, jsou Plasma Processes and Polymers, Journal of Physics D: Applied Physics, New Journal of Physics, IEEE Transactions on Plasma Science, Surface and Coatings Technology, Thin Solid Films, and Bio

6 Macromoíecules. Masivní citační ohlas prací Ondřeje Kyliána začíná rokem 28 (5 citací) a narůstá do roku 22 (78 citací). Novější práce zatím nedosáhly takového stupně ohlasu, přesto WoS eviduje v roce 23 7 citací na práce se spoluautorstvím habilitanta. Dle databáze WoS existuje k dnešnímu dni (24-2-6) na 64 autorových článků 633 citací, z toho 49 bez autocitací Řeáítelství grantů, výzkumných záměrů a center Řešitel Roky realizace Název a číslo grantu, VZ nebo VC 28 IHCP 28 Exploratory Research grant Poskytovatel European Commíssion, Joint Research Centre Spoluřešitel Roky realizace Název a číslo grantu, VZ nebo VC Poskytovatel Člen řešitelského týmu Roky realizace Q5-2QOB Název a číslo grantu, VZ nebo VC KAŇ 27- Nanokompozitní vrstvy a nanočásíice vytvářené v nízkotlakém plazmatu pro povrchové modifikace LD 32- Nanokornposity, nanostrukturované vrstvy a plasmová modifikace zlepšující polymerní nanomateriály pro balení potravin LD266- Zvýšení biokompatibility materiálů plazmovými technikami za atmosférického tlaku pro biolékařské aplikace S- Aplikace nízkoteplotního plazmatu v klastrovém zdroji s agregací v plynu pro nanášení nanočástic, nanostrukturovaných a nanokompozitních vrstev BIODECON - Biological decontamination of surfaces using plasmas discharges Poskytovatel AVČR MŠMTČR MŠMTČR GAČR European Commission 3.7. Autorství (případně spoluautorství) patentů Patenty Patenty v České republice v zahraničí (kde? -EU, USA, JVAsie,...) podané přijaté Patenty aplikované v praxi (stručná charakteristika) Licenční smíouva pro Českou republiku zahraničí (kde? - EU, USA, JVAsie,...) v jednání uzavřena 3.8. Stručná charakteristika hlavních témat vědecko-výzkumné činnosti uchazeče Hlavními obory výzkumné činnosti uchazeče jsou zejména studium interakce plazmatu s povrchy, sterilizace pomocí nízkotlakého plazmatu a příprava a studium vlastností tenkých vrstev plazmových polymerů. Mimoto se v posledních letech zabývá i přípravou kovových i polymerních nanočástic pomocí vakuových metod ajejich možnému využití v biolékařských aplikacích. Publikace pana dr. Ondřeje Kyliána dokumentují jeho hluboké teoretické i experimentální znalosti v oboru nízkoteplotního plazmatu, zejména v oblasti interakce nízkoteplotního plazmatu strana 6

7 s povrchy a v oblasti plazmové polymerace. Publikované výsledky prokazují, že plazmatem za sníženého tlaku lze účinně sterilizovat mnoho biologických patogenů, např. bakteriální spory nebo různé druhy biomolekul. Dále publikace uchazeče identifikují chemické odprašování jako hlavní mechanismus odstraňování biologického materiálu z povrchu v aktivním plazmatu a navrhují metodu monitorování procesu sterilizace a postup pro deaktivaci bakteriálních endotoxinů. Dokumentují vytvoření vrstev s vysokým podílem primárních aminoskupin a povlaků odolných proti adhezi bílkovin krevní plazmy. Dále v nich byla nalezena metoda pro přípravu nanočástic nylonu s kontrolovatelnou velikostí a představena metoda umožňující přípravu povrchů s definovanou nanodrsností a chemickým složením založená na využití plynových agregačních zdrojů nanočástic. Bylo předvedeno vytvoření povrchů s velmi velkou i velmi malou smáčivostí a dále byl stanoven vliv drsnosti povrchu na osídlování povrchu buňkami podobnými kostním na oxidu titanu. Úspěšné aplikace těchto znalostí na řešení některých problémů biolékařské praxe spojených s modifikací povrchů prokazují, že autor má i potřebné biologické a biochemické znalosti. Práce dr. Kyliána přinesly řadu nových poznatků a seznámení s novými experimentálními postupy. Jak samotné publikace tak způsob interpretace výsledků v nich dokazují autorovu schopnost jasné a srozumitelné formulace i složitých odborných problémů. Přínosy habilitanta pro biomedicínu jsou nesporné. Z jeho publikací je zřejmé, že se autor v problematice velmi dobře orientuje. Publikované práce autora již získaly značnou odezvu v široké vědecké komunitě. Dle databáze WoS existuje k dnešnímu dni na 64 autorových článků 633 citací, z toho 49 bez autocitací. Toto úctyhodné číslo svědčí o kvalitě autorových prací ajeho širokém záběru. 4. Další tvůrčí činnost relevantní k oboru jmenování 4.. Další profesní kvalifikace 4... Dosažená kvalifikace v oboru a datum dosažení (atestace, advokátní zkoušky apod.) Výlučnost práce v oboru (provádění zvláště náročných výkonů, zavedení nových metod či zdokonalení stávajících atd.) tlaku Uchazeč je spoluautor následujících funkčních vzorů: Nanočásticový zdroj založený na magnetronu hrníčkového typu HV nanoklastrový zdroj na bázi planárního magnetronu 8 mm HV nanoklastrový zdroj na bázi dvoupalcového magneíronu Aparatura pro určování bariérových vlastností polymerních fólií na bázi dynamického měření 4.2. Autorství významných uměleckých děl či organizace tvůrčích akcí Nejvýznamnější díla nebo jiné realizace (vystoupení, koncerty, překlady krásné literatury a poezie atd.) Hlavní přínos k umělecké činnosti v daném oboru (kupř. vytvoření nové technologie, stylu či založení školy) strana 7

8 Organizace významných akcí (workshopy, festivaly, symposia, výstavy atd.) Recenze a jiné ohlasy na umělecká díla a tvůrčí Činnost (katalogy výstav a dalších uměleckých akcí, monografie věnované uchazeči jako umělci, recenze v odborných časopisech atd.) 4.3. Popularizující publikace popularizující monografie kapitoly v popul. monografiích studie v nerecenz. časopisech a sbornících recenze v tisku a nerecenz. časopisech překlady edice sborníků články v tisku 5. Ostatní činnosti české a slovenské cizojazyčné 5.. Aktivní účast na mezinárodních vědeckých konferencích 5... Přednášející ve smyslu invited speaker (v příloze doložit zvacími dopisy nebo programy tří nejvýznamnějších akcí) (Německo) ) 35th IEEE International Conference on Plasma Science, červen, 28 - Karlsruhe 2) 7th International Colloquium on Plasma Processes, červen, 29 - Pare Chanot, Marseille (Francie) 3) 3th International Conference on Plasma Surface Engineering,.-4. září, 22 - Garmisch- Partenkirchen (Německo) Jako organizátor konference, člen jejího přípravného výboru ) 4th International Workshop on Polymer/Metal Nanocomposites, Septernber 2-4, 29 - Praha (Česká Republika) 2) Symposium Plasma Deposition of Thin Films and Coatings, které je součástí konference EUROMAT 23, září, 23, Seville (Španělsko) Předseda sekce konference (chairman) ) 7th International Colloquium on Plasma Processes, červen, 29 - Pare Chanot, Marseille (Francie) 2) EUROMAT 23, záři, 23, Seville (Španělsko) 3) 22nd Annual Student Conference Week of Doctoral Students, června, 23 - Praha (Česká Republika) 5.2. Členství ve vědeckých nebo uměleckých radách 5.3. Členství v redakčních radách vědeckých časopisů strana S

9 5.4. Významná ocenění za vědeckou činnost v oboru Best young scientist of JRC-IHCP Evropské komise v roce Jiné 6. Závěr stanoviska habilitační komise Odůvodnění a závěr Pan RNDr. Ondřej Kylián, Ph.D. (dále habilitant) předložil habilitační práci s názvem "Biolékařské aplikace nerovnovážného plazmatu". Habilitační spis je tvořen souborem 7 odborných prací publikovaných v prestižních zahraničních časopisech, na nichž se uchazeč podílel jako spoluautor a které vznikly během jeho aktivního působení ve Společném výzkumném centru EK v italské Ispře a na Katedře makromolekulami fyziky MFF UK v Praze. V osmi případech je uchazeč uveden jako první autor. Tomuto souboru předchází komentář v rozsahu 33 stránek. Habilitant dále předložil informace o dosaženém vzdělání, přehled zahraničních pobytů, přehled a doklady o praxí, výkaz pedagogické činnosti, seznam publikací a strukturovaný životopis. Z podkladů je zřejmé, že se habilitant významně podílí na pedagogické činnosti, což je nezbytnou podmínkou udělení vědecko-pedagogické hodnosti docent. Ročně přednáší cca 3 hodin, vede semináře v rozsahu cca hodin ročně a praktika v rozsahu cca 4 hodin ročně. V akademickém roce 22/23 vedl 2 doktorandy, l diplomovou Mgr. práci ajednu bakalářskou práci, kterou student úspěšně zakončil. Jeho publikační aktivita je vynikající, 64 články v prestižních převážně zahraničních vědeckých periodikách s impakt faktorem, stejně tak jako odezva na tyto práce, která čítá k datu citací bez autocitací. H-index habilítanía ke stejnému datuje 5. Habilitant rovněž přednáší na mezinárodních vědeckých konferencích, jako dokumenty předložil zvací dopisy na 3 významné konference. Dvě mezinárodní konference spoluorganizoval a na třech konferencích působil jako vedoucí sekce (chairman). Získal rovněž ocenění Best young scientist of JRC-IHCP Evropské komise v roce 26. Z hlediska přenosu výsledků vědy do praxe je habilitant spoluautorem 4 funkčních užitných vzorů. Habilitant vedl mezinárodní vědecký grant "HCP 28 Exploratory Research grant" a byl spoluřešitelem projektu BIODECON; poskytovatelem obou byla Evropská komise. Dále se podíle! na řešení 4 grantů s tuzemskými poskytovateli (GAČR, AV ČR, MŠMT ČR). Habilitační komise došla na základě výše uvedených faktů k závěru, že pan RNDr. Ondřej Kylián, Ph.D. se významně podílí na výuce na Matematicko-fyzikální fakultě Univerzity Karlovy v Praze a je zároveň ve svém oboru "Fyzika - Fyzika molekulárních a biologických struktur" uznávaným vědeckým pracovníkem, jehož publikace nacházejí široký ohlas v mezinárodní vědecké komunitě. Habilitační komise proto doporučuje, aby habilitační řízení pana RNDr. Ondřeje Kyliána, Ph.D. pokračovalo obhajobou před vědeckou radou Matematicko-fyzikální fakulty Univerzity Karlovy v Praze a aby po úspěšné obhajobě byl panu RNDr. Ondřeji Kyliánovi, Ph.D. udělen vědeckopedagogický titul docent. strana 9

10 Výsledek hlasování habilitační komise_ Počet přítomných Hlasovalo pro Hlasovalo proti /") Zdržel se V Praze dne ^ L/- (jména a podpisy členů komise) Předseda: prof. RNDr. Milan Tichý, DrSc. Členové: prof. RNDr. Jaroslav Vlček, CSc. prof. Ing. Stanislav Pekárek, CSc. RNDr. doc. Milan Hrabovský, CSc. doc. RNDr. Josef Blažek, CSc.