Fyziologie buněčných systémů. A. Kozubík J. Hofmanová

Transkript

1 Fyziologie buněčných systémů A. Kozubík J. Hofmanová

2 ÚEB (oddělení/ specializace) 1) Fyziologie a imunologie ţivočichů Představení kolektivu Východiska Současné zaměření 2) Pracoviště AVČR Metody a přístupy

3 Pracoviště PřF MU Kasárna, Terezy Novákové 64, Brno - Řečkovice

4

5 BFÚ PřF MU ŘEŠENÍ a další postup Diverzifikace na dvou úrovních: 1) Mezioborová (2 systémy), 2) Odborného směřování (2-3 problematiky) Náročné, ale moţné Diverzifikovaný systém pro většinu stabilnější, méně závislý na jakémkoli neočekávaném vývoji

6 Sloţení a zaměření oddělení

7 7

8 Fyziologie buňky (buněčné signalizace) Doc. A. Kozubík Doc. J. Hofmanová Dr. V. Bryja Dr. P. Krejčí Dr. J. Procházková Dr. K. Souček Dr. J. Pacherník (Doc. S. Kozubek, Dr. J. Vondráček, Dr. M. Machala, Dr. Vaculová atd.) Imunologie obratlovců a bezobratlých Doc. A. Lojek Doc. A. Ţákovská Dr. P. Hyršl (Dr. L. Kubala, Dr. M. Číţ, Dr. J. Turánek, atd ) Fyziologie smyslového vnímání Doc. M. Vácha

9 NĚKTERÉ HLAVNÍ CÍLE SOUČASNÉHO VÝZKUMU Poznání mechanismů působení látek lipidové povahy, zejména VNMK a jejich derivátů, v mezi/vnitrobuněčných komunikacích podílejících se v regulaci cytokinetiky (proliferace, diferenciace a apoptózy) v kontextu jejich interakcí s - fyziologickými regulátory růstu, - environmentálními polutanty - vybranými farmaky. Jedním z praktických cílů je vyuţít tyto znalosti v rámci přípravy lipidových nutričních preparátů, případně cytostatik.

10 Organismus jako komplexní hierarchický systém organismální, tkáňová buněčná molekulová Nelze oddělovat (naopak nutno usilovat) studium na jednotlivých úrovních organizace systému Obtížně realizovatelné v rámci jedné laboratoře 10

11 Výzkumné cíle a oblasti praktického využití INICIAČNÍ (INITIATION) ONKOGENEZE fáze: PODPŮRNÁ (PROMOTION) POPULACE NORMÁLNÍCH (NETRANSFORMOVANÝCH) BUNĚK cell signalling (cytokiny vs. eikosanoidy) klinická data, matematické analýzy, experimentální ověření POPULACE TRANSFORMOVANÝCH BUNĚK PROGRESIVNÍ FÁZE (PROGRESSION) ONKOTERAPIE 11

12 Negenotoxické hepatokarcinomy (nádorové promotory, hormony, TCDD) Negativní mutagenicita (Nereagují s DNA) GST-P: glutathion S-transferáza - placentární forma Inhibice oxidativního stresu Indukce reparace DNA Nízká dávka Inhibice proliferace v oblastech GST-P + ohnisek Suprese apoptózy Protekce GJIC Aktivace detoxifikačních systémů v játrech (CYP2C11, P-450 NADPH oxidoreduktáza) Buněčná signalizace (GABA, MAP kinázy) Indukce oxidativního stresu (P-450, ROS, 8-OHdG) Indukce reparace DNA Vysoká dávka Zvýšení proliferace v oblastech GST-P + ohnisek Indukce apoptózy Inhibice GJIC Inhibice CYP2C11 Hormetický efekt na karcinogenezi (Inhibice GST-P + ohnisek a rozvoje nádoru) Promoce karcinogeneze (Indukce GST-P + ohnisek a rozvoje nádoru) Přesné prahování karcinogenicity Fukushima et al., Carcinogenesis,

13 Uţití Výroba Výzkum (vývoj) Aplikovaný (cílený) Základní

14 Přehled metod a metodologií (ucelený systém) Viz Metody

15 FACSCalibur FCM: jedna ze základních metod FACS ARIA SORP II KONFOKÁLNÍ MIKROSKOP LEICA Metodologie založené na nejmodernějších zařízeních

16 Výhody FCM - Moţnost analýz a třídění ţivých buněk!!! (UV lasery) a jejich postoupení pro další - Multicolour analyses - Optimum poměru automatizace / versatilita

17 Metody pouţívané v laboratoři cytokinetiky BFÚ AV ČR, Brno Legenda: FACS - průtoková cytometrie včetně cell sortingu FM - fluorescenční mikroskopie SM - světelná mikroskopie WB - western blotting FM - fluorimetrie (FluoStar) CM - kolorimetrie (FluoStar nebo Elisa reader) LM - luminometrie (VUVEL, Lojek) PAGE - polyakrylamidová elektroforéza RT-PCR - reverse transcription polymerase chain reaction RG - radiografie ELFO agarózová elektroforéza

18 SYLABUS pro studenty 4. ročníku fyziologie ţivočichů a obecné zoologie, mol. biologie, chemie ţivotního prostředí a ekotoxikologie, výběrová přednáška pro doktorandy n - Stručný úvod do teorie systémů n - Negativní a pozitivní zpětná vazba n - Základní pojmy, parametry cytokinetiky (proliferace, diferenciace, apoptóza) n - Typy buněčných populací n - Kmenové a diferencované kompartmenty. Totipotentní, pluripotentní, progenitorové, komitované diferencované buněčné populace n - Autokrinní, parakrinní a endokrinní regulace n - Buněčný cyklus a jeho regulace n - Faktory ovlivňující buněčné dělení, cytokiny, růstové faktory a inhibitory, jejich specifita a rovnováha jejich působení n - Struktura plasmatické membrány a její funkce v regulaci buněčné proliferace a diferenciace n - Vysoce nenasycené mastné kyseliny a eikosanoidy n - Transdukce signálů a exprese genetické informace n - Úloha fosfolipidových komponet v transdukci signálů růst modulujících látek n - Mechanismus účinku hormonů a tkáňových mediátorů ( cytokiny a "chalony"). n - Regulace proliferace, diferenciace, apoptózy

19 Krvetvorný systém a jeho funkce n Hemopoéza ( lymfopoéza, myelopoéza, erytropoéza, megakaryocytopoéza ) n Funkce diferencovaných krevních elementů - monocyty, makrofágy - fagocytóza; n Vztah imunitního systému k dalším fyziologickým funkcím ( zánětu apod.) Homeostáza, zdraví a nemoc n Organismus jako hierarchický systém, spolupůsobení nervové, endokrinní a humorální soustavy n Příklady systémových reakcí jako jsou stres, zánět apod. a jejich význam z hlediska zdraví a nemoci n Škodlivé faktory vnějšího prostředí a jejich vliv na zdraví lidské populace

20 Doporučená literatura Cell Physiology Source Book, ed. N. Sperelakis Academic Press Inc., 1995 B. Alberts et al.: Molecular Biology of the Cell, 3 rd edition, Garland Publish. Inc., New York 1994 Biochemie, B., Voet, J.G. Voetová: Victoria Publishing, Praha, 1990 Molecular Cell biology, J.E. Darnell: Eds. Darnell, Lodish, Baltimore, 2 nd edition, Scientific American Books Inc., New York 1990 J. Neuwirt, E. Nečas: Kmenové buňky a krevní choroby, Avicenum Praha 1981 Základy buněčné biologie úvod do molekulární biologie buňky, B. Alberts, D. Bray, A, Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, P. Walter, Espero Publishing, (orig. 1998) Klinická imunologie, J. Krejsek, O. Kopecký, Nucleus HK, J. Vácha: Problém normálnosti v biologii a lékařství, Avicenum, Praha 1980 J. Šterzl: Imunitní systém a jeho fyziologické funkce, Čs. Imunol. Společnost, Praha 1993

21 POJMY A MODELY

22 Typy buněčných populací podle Gilberta a Lajthy (1965) TYPY PROLIFERUJÍCÍ expandující, neopouštějí populaci, množí se populace coby zdroj buněk pro jiné populace c. konstantní Tranzitní populace, ve které se buňky pomnoží c. konstantní NÁDOR K. B. BLASTY KRVE TYPY NEPROLIFERUJÍCÍ B. C.N.S. stacionární c. konstantní OOCYTY stále ubývá metamyelocyty k. d. erytrocyty granulocyty typ průchozí (tranzitní) c. konstantní 22

23 Tabulka 1 Dělení buněčných populací podle intenzity obnovy u dospělé myši 1. Statické populace bez známek obnovy během života: neurony všech typů srdeční svalové buňky odontoblasty Sertoliho buňky 2. Velmi pomalu se obnovující buněčné populace: Během života se obnoví jen část populace: hladké svalové buňky gliové buňky osteocyty buňky ledvinných tubulů buňky dřeně nadledvinek hlavní buňky žaludeční sliznice intersticiální buňky Leydigovy buňky hnědé tukové tkáně 3. Rychle se obnovující buněčné populace: A. Ne příliš rychle se obnovující populace. Populace, která se během života zcela obnoví, ale za dobu delší než 30 dní: hepatocyty a litorální buňky epitelová výstelka dýchacího traktu buňky slinných žláz buňky pankreatu buňky v kůře nadledvinek parietální buňky žaludeční sliznice pojivové buňky v kůži B. Velmi rychle se obnovující buněčné populace. Všechny se obnoví za dobu kratší než 30 dní: střevní epitel krvetvorné buňky, prekursory krevních buněk epidermis kornea epitelová výstelka ústní dutiny a esofagu povrchový epitel žaludeční sliznice seminiferní epitelová tkáň C. Buňky nádorové

24 MODELY: Buňky tzv. intenzívně proliferujících populací (zejména b. krvetvorné a b. střevních epitelů). a buňky nádorové (PRAKTICKÉ SOUVISLOSTI)

25 Jestliže dojde k celotělové expozici organismu ionizujícím zářením, může dojít k rozvoji tzv. nemoci ozáření manifestaci tzv. RADIAČNÍHO SYNDROMU. Jeho průběh závisí na dávce ozáření

26 Dobový kontext od léta 20. stol. Radiobilogický výzkum především pro vojenské účely. (Nevada, USA) Důsledky: Utlumení a poškození krvetvorby (intenzívně proliferujících populací) imunitních funkcí a celého organismu. Vznik nádorů včetně leukémií atd.,smrt. Jestliže dojde k celotělovému vystavení ionizujícímu záření, dochází k rozvoji tzv. RADIAČNÍHO SYNDROMU provázeného devastujícími účinky na organismus

27 Formy nemoci z ozáření (myš) dávka hlavní oblasti postižení Dřeňová forma Gy.Kmenové buňky K.D. Střevní forma 5 10 Gy.Epitely, zejména střeva Centrálně nervová forma.100 Gy Viz výše včetně C.N.S. Důsledky: silné poškození intenzívně proliferujících populací, organismu, imunitních funkcí a celého systému: proliferativní choroby, leukémie, smrt.

28 Využití ozáření jako modelu pro studium regenerace krvetvorných funkcí Princip, volba dávky, volba druhu laboratorního zvířete (myš) Metoda CFU-S

29 Fosfolipidový metabolismus a působení ionizujícího záření (škodlivých faktorů ţivotního prostředí) (EIKOSANOIDY) Zánět, karcinogeneze 29

30 Typy regulací (růstu a buněčných funkcí) 1) Hormonální (endokrinní) regulace Regulátor hormon je produkován bu ňkami žláz s vnit řní sekrecí do krevního řečiště. Ovliv ňuje funkce buněk, které mohou být značně vzdáleny od míst syntézy hormonu. Hormon je tedy produkován za ú čelem kontroly činnosti buněk než těch, které jej produkují 2) Parakrinní regulace Mechanismus p ůsobení spočívá v tom, že růstový faktor (regulátor) tkáňový mediátor (regulátor místního p ůsobení) je syntetizován jedním typem b. poté je transportován do extracelulárního prostoru a ovliv ňuje f-ce buněk v nejbli žším okolí. ( často jediná možnost vzhledem k velmi krátkému polo času rozpadu). 3) Autokrinní regulace je mo žná tehdy, jestliže jsou bu ňky schopny jak syntetizovat tak i reagovat na určitý (růstový) regulátor. Pozn. : autokrinní model je sou částí konceptu vysvětlujícího abnormální regulaci nádorového r ůstu. P ředpokládá, že nádorov ě změněné buňky produkují stimulační růstové faktory nadm ěrném mno žství, na které samy odpovídají. Tak se autostimulují ve smyslu aktivace proliferace.

31 Apoptóza: programovaná buněčná smrt, nevede k zánětu Nekróza: neprogramovaná buněčná smrt, je příčinou zánětu (odlišný průběh biochemických reakcí, rozdílná morfologie) Proliferace: je ekvivalentem bun ěčného dělení ( tzn. zvýšení po čtu kvalitativně totožných buněk) Diferenciace: rozr ůzňování buněk (vznik kvalitativně odlišných buněk ) Růst zv ětšení objemu buňky, buněčné populace (tkáně nebo organismu). Je d ůsledkem: a) zv ětšení velikosti buněk při zachování konstantní velikosti populace b) zv ětšení počtu buněk (proliferace) bez změn v objemu bun ěk c) zvýšení po čtu buněk i jejich objemu d) odumírání apoptózou nebo nekrózou

32 Polyklonální charakter kostních buněk Přirovnání kmenové buňky ke stromu 32

33 The structure of the hemopoietic system 33

34 Obr. 8. Schéma kvantitativního zastoupení různých prekurzorů krevních buněk v krvetvorné tkáni. 1 Podle Gregorové a Henkelmana (1977) 2 Podle MacVittieho a Porvaznika (1978) 3 Nejsou odvozeny od CFU-S 34

35 35

36

37 Dosažení dynamické rovnováhy 37

38 38

39 treatment: ovlivňovaný systém parametry cytokinetiky: cytostatika, ozařování, proliferace regulační podněty, atd. black box diferenciace... 0 apoptóza VSTUPY modelové systémy in vitro, buňky lišící se růstovou strategií, pacient VÝSTUPY 39

40 některá OBECNÁ VÝCHODISKA, DŮLEŽITÁ PRO POSTIŽENÍ CHOVÁNÍ A SMĚROVÁNÍ BUNĚČNÝCH POPULACÍ, Z NICHŽ LZE VYCHÁZET, MOHOU BÝT TATO: - Zachování rovnováhy v nejširším slova smyslu mezi produkcí buněk (intenzitou proliferace) a jejich úbytkem (např. smrtí apoptózou) je podmínkou pro zachování homeostázy na tkáňové úrovni. - Proto změny v intenzitě proliferace, diferenciace a apoptózy po působení jakýchkoli podnětů, jež mohou tyto procesy ovlivnit, lze chápat jako integrální ukazatele porušení této homeostázy. - Vhodný způsob detekce těch změn, které vedou k trvalejšímu porušení rovnováhy mezi produkcí a úbytkem buněk může celkově odrážet nejen poruchy, které jsou základem tzv. proliferativních chorob (nádorových onemocnění), ale být i ukazatelem procesů vedoucích k obnově porušené rovnováhy. - Parametry, jimiž lze postihnout tyto tendence, by proto měly být předmětem zájmu nejen teoreticky orientovaných pracovníků, ale i laboratoří zabývajících se účinky škodlivých látek vnějšího prostředí, šlechtitelských a zejména klinicky orientovaných laboratoří.

41 41

42 Rovnováha (homeostáza) Výsledek působení mnohočetných zpětných vazeb 42

43 43

44 Příklad interakce dvou faktorů (data: Eur. J. Pharmacol. 316, , 1996.) 44

45 Nesspecifické faktory Nesspecifické faktory REGULACE NORMÁLNÍHO RŮSTU Poly- Oligo- Mono- kumulace katabolitů vyčerpání živin transmem.pot. E m -70 až -90 mv limitní konc. Na + /K +, Ca 2+, Mg 2+ snížení cgmp~ mol.l -1 intracel. zvýšení camp mol.l -1 extr. katabolické steroidy interferon katecholaminy, adrenalin některé mitostat. hormony ACTH některé prostaglandiny inh. myeloidní leukémie inh. epid. karcinomu, ascitu inh. lymfomu, melanomu epidermální, intestinální inh. FGRF, MCIF inh. Atd. BSC-1, BHK-1 inh spec. inhibitory-chalony spec. endogenní inhibitory INHIBICE R Ů S T Startovací stimulátorová síla (odpověď vše nebo nic) spec. intracel. stim. proteiny spec. růstové faktory růstové proteiny, kondic.média poietiny, CSF lektiny (A, conc. A) somatomediny některé prostaglandiny EGF, FGF, NGF, MSA atd. některé hormony - mitogenní inzulín, serotonín hydrokortizon, noradrenalin anbolické steroidy zvýšení cgmp mol.l -1 extr. snížení camp pod 10-8 mol.l -1 i.c. dodání Ca 2+ nad 1,8 mv transmem. pot. E m -10 až -70 mv proteázy, trypsinizace dodání živin odstránění katabolitů Mono- Oligo- Poly- Startovací inhibitorová síla (odpověď vše nebo nic) STIMULACE 1A Schematické znázornění stimulace a inhibice růstu specifickými a nespecifickými faktory. Převaha pozitivního nebo negativního signálu rozhoduje o výsledné stimulaci nebo inhibiciů závisí na metaboluické a růstové aktivitě buněk, typu buněk a dalších podmínkách - viz text. Specifické růstové účinky vnějšího prostředí buněk zahajují specifické růstové faktory (specifické stimulátory) a specifické endogenní inhibitory (chalony). CSF-kolonie stimulující faktor, EGF-epidermální růstový faktor, FGF-fibroblastový růstový faktor, NGF-nervový růstový faktor, MSA-multiplikaci sti-mulující aktivita, camp-cyklický 3 5 -guanosinmonofosfát, BSC-1, BHK-1, MCIF, FGRF-specifické inhibitory daných buněčných linií. Regulace a inhibice růstu normálních a nádorových buněk, Fremuth F., SPN, Praha, 1986

46 Čtyři nejdůležitější skupiny malých organických molekul v buňkách 46

47 D.G.Cornwell and N.Morisaki, Free Radicals in Biology. Vol.6,

50 The early acting growth factor which maximises host defense 50

51 T.M.Dexter and M.Moore STEM CELL COMPARTMENT PROGENITOR CELL COMPARTMENT MATURE ( END ) CELL COMPARTMENT Pre-T cells Eos-CSF T-cells Pluripotent Selfrenewing Stem Cells CFU-S IL-3 (HCGF) CFC-Mix Eos-CFC BPA BFU-E GM-CSF s GM-CFC Meg-CSF s Epo CFU-E Eosinophils RBC Neutrophils Macrophages IL-3 (HCGF) Meg-CFC MCGF Megakaryocyt es/ Platelets Bas-CFC Basophils/Mast cells Pre-B cells B-cells SELF-RENEWAL CAPACITY DIFFERENTIATION AND DEVELOPMENT Fig. 1. The structure of the hemopoietic system

52 Seznam používaných zkratek kmenových buněk: BFU-E - burst forming unit - erythroid (jednotka vytvá řející explozivně vznikající kolonie erytroidní řady). Velmi nezralá kmenová bu ňka erytroidní řady. CFU-BL - colony forming cell - B - lymfocyte (bu ňka vytvářející kolonie lymfocytů B). CFU-C - (GM-CFC) colony forming unit - culture (jednotky vytvá řející kolonie v kultuře). Kmenová bu ňka bílé řady, v poslední dob ě stále častěji používaná zkratka GM-CFC granulocyty macrophage-colony forming cell (bu ňka vutvářející kolonie pro granulocyty a makrofágy). CFU-E - colony forming unit - erythroid (jednotka vutvá řející kolonie erytroidní řady.). Kmenová bu ňka erytroidní řady CFU-Meg- c olony forming unit - megakaryocyte (jednotka vytvá řející kolonie megakaryocytů). Kmenová bu ňka erytroidní řady. CFU-S - colony forming unit - spleen (jednotka vytvá řející kolonie ve lsezině). (CFU - Nejb ěžnější používaná zkratka pro hemopoetickou pluripotentní kmenovou buňku. GEMM) DCPC diffusion chamber progenitor cell (kemnová progenitorová bu ňka proliferující v difúzních kom ůrkách.)

53 53

54 54

55 55

56 SIGNÁL (např. cytokiny) MOLEKULÁRNÍ MECHANISMY působení ω-3 a ω-6 VNMK (mediátory a modulátory buněčné signalizační sítě) lipidové rafty membránová fluidita signální kaskáda vnitrobuněčné funkce sekrece změny metabolismu, membránové fosfolipidy PUFA proteiny jaderné receptory transkripční faktory (NFkB, PPAR, AP-1...) mrna RE genová exprese ROS DNA inserce buněčného růstu diferenciace a apoptózy eikosanoidy lipidová peroxidace LOX P450 COX inhibice (NSAID) n-3 PUFA n-6 PUFA (AA, LA) membránové fosfolipidy kyselina arachidonová Mimobuněčné podněty (cytokiny, hormony, polutanty, záření) (stresory)

57 množství informace (kvantita) (kvalita) využitelnost informace čas Moudrost člověka lze měřit podle starostlivosti, s níž myslí na věci budoucí nebo na konec. G. Ch. Lichtenberg 57

58 Co by mělo být rozhodováno nejdřív: Proč chceme studovat, jaký je opravdový zájem? Na základě čeho se rozhodujeme? Kdy začít a proč? Kde začít? Jaké máme možnosti uplatnění po skončení studia?

59 Nabídka studia bcl., dipl. i DSP na našem oddělení (na pracovištích PřF i AVČR v Brně)