Podklad pro habilitační řízení na Přírodovědecké fakultě UK. Úplná strukturovaná bibliografie

Transkript

1 RNDr. Jiří Petrák, Ph.D. Podklad pro habilitační řízení na Přírodovědecké fakultě UK Úplná strukturovaná bibliografie Stručný přehled: 30 publikací v mezinárodních recenzovaných časopisech s definovaným impakt faktorem, z toho 28 původních výzkumných prací a 2 přehledové články. 3 publikace v recenzovaných časopisech bez impakt faktoru Citační ohlas bez autocitací (dle WoS)= 440, h index=13 Monografie: Kapitoly v monografiích: Původní práce v recenzovaných časopisech (s definovaným impakt faktorem): Experimentální práce (28): 1. Sillerova T, Zivny J, Vyoral D, Petrak J. Nutritional hepatic iron overload is not prevented by parenteral hepcidin substitution therapy in mice. Br J Nutr Feb 10:1-3. IF (2010) =3,07 2. Petrak J, Pospisilova J, Sedinova M, Jedelsky P, Lorkova L, Vit O, Kolar M,Strnad H, Benes J, Sedmera D, Cervenka L, Melenovsky V. Proteomic andtranscriptomic analysis of heart failure due to volume overload in a rat aorto-caval fistula model provides support for new potential therapeutic targets - monoamine oxidase A and transglutaminase 2. Proteome Sci Nov 11;9(1):69. IF (2010) =2,48 3. Lorkova L, Pospisilova J, Lacheta J, Leahomschi S, Zivny J, Cibula D, Zivny J,Petrak J. Decreased concentrations of retinol-binding protein 4 in sera of epithelial ovarian cancer patients: a potential biomarker identified by proteomics. Oncol Rep Feb;27(2): IF (2010) =1,68 4. Melenovsky V, Benes J, Skaroupkova P, Sedmera D, Strnad H, Kolar M, Vlcek C, Petrak J, Benes J Jr, Papousek F, Oliyarnyk O, Kazdova L, Cervenka L. Metabolic characterization of volume overload heart failure due to aorto-caval fistula in rats. Mol Cell Biochem Aug;354(1-2): IF (2010) =1,4 1

2 5. Benes J, Kazdova L, Drahota Z, Houstek J, Medrikova D, Kopecky J, Kovarova N, Vrbacky M, Sedmera D, Strnad H, Kolar M, Petrak J, Benada O, Skaroupkova P, Cervenka L, Melenovsky V. Effect of metformin therapy on cardiac function and survival in a volume-overload model of heart failure in rats. Clin Sci (Lond) Jul;121(1): IF (2010) =4,61 6. Benes J Jr, Melenovsky V, Skaroupkova P, Pospisilova J, Petrak J, Cervenka L, Sedmera D. Myocardial morphological characteristics and proarrhythmic substrate in the rat model of heart failure due to chronic volume overload. Anat Rec (Hoboken) Jan;294(1): IF (2010) =1,40 7. Handrkova H, Petrak J, Halada P, Pospisilova D, Cmejla R. Tyrosine 87 is vital for the activity of human protein arginine methyltransferase 3 (PRMT3). Biochim Biophys Acta Feb;1814(2): IF (2010) =2,77 8. Cmejla R, Ptackova P, Petrak J, Savvulidi F, Cerny J, Sebesta O, Vyoral D. Human MRCKalpha is regulated by cellular iron levels and interferes with transferrin iron uptake. Biochem Biophys Res Commun Apr 30;395(2): IF (2010) = 2,59 9. Petrak J, Toman O, Simonova T, Halada P, Cmejla R, Klener P, Zivny J. Identification of molecular targets for selective elimination of TRAIL-resistant leukemia cells. From spots to in vitro assays using TOP15 charts. Proteomics.2009 Nov;9(22): Peslova G, Petrak J, Kuzelova K, Hrdy I, Halada P, Kuchel PW, Soe-Lin S, Ponka P, Sutak R, Becker E, Huang ML, Suryo Rahmanto Y, Richardson DR, Vyoral D. Hepcidin, the hormone of iron metabolism, is bound specifically to alpha-2- macroglobulin in blood. Blood Jun 11;113(24): IF (2010) =10, Singh A, Mohan ML, Isaac AO, Luo X, Petrak J, Vyoral D, Singh N. Prion protein modulates cellular iron uptake: a novel function with implications for prion disease pathogenesis. PLoS One. 2009;4(2):e4468. Epub 2009 Feb 12. Erratum in: PLoS ONE. 2009;4(2). IF (2010) =4, Cmejla R, Cmejlova J, Handrkova H, Petrak J, Petrtylova K, Mihal V, Stary J, Cerna Z, Jabali Y, Pospisilova D. Identification of mutations in the ribosomal protein L5 (RPL5) and ribosomal protein L11 (RPL11) genes in Czech patients with Diamond- Blackfan anemia. Hum Mutat Mar;30(3): IF (2010) =5, Petrak J, Ivanek R, Toman O, Cmejla R, Cmejlova J, Vyoral D, Zivny J, Vulpe CD. Déjà vu in proteomics. A hit parade of repeatedly identified differentially expressed proteins. Proteomics May;8(9):

3 14. Cmejla R, Cmejlova J, Handrkova H, Petrak J, Pospisilova D. Ribosomal protein S17 gene (RPS17) is mutated in Diamond-Blackfan anemia. Hum Mutat Dec;28(12): IF (2010) =5, Petrak J, Myslivcova D, Halada P, Cmejla R, Cmejlova J, Vyoral D, Vulpe CD.Ironindependent specific protein expression pattern in the liver of HFE-deficient mice. Int J Biochem Cell Biol. 2007;39(5): IF (2010) =4, Petrak J, Myslivcova D, Man P, Cmejla R, Cmejlova J, Vyoral D, Elleder M,Vulpe CD. Proteomic analysis of hepatic iron overload in mice suggests dysregulation of urea cycle, impairment of fatty acid oxidation, and changes in the methylation cycle. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol Jun;292(6):G IF (2010) =3, Petrak J, Myslivcova D, Man P, Cmejlova J, Cmejla R, Vyoral D. Proteomic analysis of erythroid differentiation induced by hexamethylene bisacetamide in murine erythroleukemia cells. Exp Hematol Feb;35(2): IF (2010) =3, Babusiak M, Man P, Petrak J, Vyoral D. Native proteomic analysis of protein complexes in murine intestinal brush border membranes. Proteomics Jan;7(1): Cmejlova J, Dolezalova L, Pospisilova D, Petrtylova K, Petrak J, Cmejla R. Translational efficiency in patients with Diamond-Blackfan anemia. Haematologica Nov;91(11): IF (2010) =6, Cmejla R, Petrak J, Cmejlova J. A novel iron responsive element in the 3'UTR of human MRCKalpha. Biochem Biophys Res Commun Mar 3;341(1): IF (2010) =2, Petrak J, Myslivcova D, Man P, Cmejla R, Cmejlova J, Vyoral D. Proteomic analysis of iron overload in human hepatoma cells. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol May;290(5):G IF (2010) =3, Babusiak M, Man P, Sutak R, Petrak J, Vyoral D. Identification of heme binding protein complexes in murine erythroleukemic cells: study by a novel two-dimensional native separation -- liquid chromatography and electrophoresis.proteomics Feb;5(2):

4 23. Suchan P, Vyoral D, Petrák J, Sut'ák R, Rasoloson D, Nohýnková E, Dolezal P,Tachezy J. Incorporation of iron into Tritrichomonas foetus cell compartments reveals ferredoxin as a major iron-binding protein in hydrogenosomes. Microbiology Jul;149(Pt 7): IF (2010) =2, Vyoral D, Babusiak M, Fuchs O, Petrák J. Native electrophoretic separation and femtomolar detection of 65Zn-containing proteins by storage phosphorimaging. J Biochem Biophys Methods Aug 29;57(2): IF (2010) =1, Petrák J, Vyoral D. Detection of iron-containing proteins contributing to the cellular labile iron pool by a native electrophoresis metal blotting technique. J Inorg Biochem Oct;86(4): IF=3, Vyoral D, Petrák J. Iron transport in K562 cells: a kinetic study using native gel electrophoresis and 59Fe autoradiography. Biochim Biophys Acta Jun 22;1403(2): IF (2010) =4, Vyoral D, Petrák J, Hradilek A. Separation of cellular iron containing compounds by electrophoresis. Biol Trace Elem Res Mar;61(3): IF (2010) =3, Vyoral D, Petrák J. Detection and quantitation of 59Fe-labeled proteins using storage phosphorimaging. Anal Biochem Jun 15;260(1): IF (2010) =1,52 Reviews (2) 29. Vyoral D, Petrák J. Hepcidin: a direct link between iron metabolism and immunity. Int J Biochem Cell Biol Sep;37(9): IF (2010) =4, Petrak J, Vyoral D. Hephaestin--a ferroxidase of cellular iron export. Int J Biochem Cell Biol Jun;37(6): Epub 2005 Jan 26. IF (2010) =4,95 4

5 Práce v recenzovaných časopisech (bez impakt faktoru): Ponomarenko EA, Lisitsa AV, Petrak J, Moshkovskiĭ SA, Archakov AI. [Identification of differentially expressed proteins using automatic meta-analysis of proteomics-related articles]. Biomed Khim Jan-Feb;55(1):5-14. (Russian) Fuchs O, Babusiak M, Vyoral D, Petrák J. Role of zinc in eukaryotic cells,zinc transporters and zinc-containing proteins. Review article. Sb Lek. 2003;104(2): Petrák J. [Proteomics and its role in medicine]. Cas Lek Cesk. 2005;144(6):365-70; discussion Review. Czech. PubMed PMID: Práce v recenzovaných sbornících: Sillerova T, Vyoral D, Zivny J, Sefc L, Petrak J. Adminstration of hepcidin in 48-hour intervals does not prevent hepatic iron overload in mice. Peptide Science ed. Fuji N, Kiso Y., Japanese Peptide Society, 2011, ISSN , ISBN Učebnice a učební texty: Přednášky typu invited speaker na mezinárodních konferencích: Enolase and heat-shock proteins again? The first proteomic hit parade of differentially expressed proteins. 4th Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Nanotechnology for Medicine, (GPBNM 2008) Russia, 1-7/6/2008 Aiming shotgun at the heart. Proteomics of a failing pump. 5th Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Nanotechnology for Medicine, Russia, 31/5-5/6/2010 Aiming shotgun at the heart. Proteomics of a failing pump. 4th Central and Eastern Proteomics Conference, Vienna, Austria, 29/8-3/9/2010 Patenty národní a zahraniční, objevy: Účast na řešení grantů. Uvádím zde jen ty granty, kterých jsem byl hlavním řešitelem nebo spoluřešitelem, nikoliv projekty na jejichž řešení jsem se podílel jako člen řešitelského týmu. GAČR : Identifikace přenašečů zinku v buňkách ( , hlavní řešitel) GAČR: Proteomická analýza dědičné hemochromatózy ( , hlavní řešitel) GAČR: Studium metabolických mechanismů progrese srdečního selhání v experimentálním modelu ( , spoluřešitel) IGA MZČR: Terapeutický a diagnostický potenciál hepcidinu ( , hlavní řešitel) 5

6 Disertační, rigorózní práce, habilitační práce (u profesorských řízení). Disertační práce: Jiří Petrák. Metabolismus železa v savčích buňkách (PřFUK, 2000) Ostatní publikace (populární články, recenze atd.). Články popularizující vědu v denníku MF Dnes: Virus, který léčí rakovinu mozku Hlodavci, kteří si dělají turistické značky Úřad zastavil genovou léčbu kvůli leukémii Zapomeňte na hranolky, varují vědci maminky Matkou i po léčbě zhoubné choroby? Lékaři už umí včas najít nádor vaječníku Veřejná pitva: morbidní, či poučné? Bakterie připraví zubaře o práci Pozor na třezalku, může ohrozit léčbu rakoviny Bojíte se karcinogenů? Leckdy jsou obavy nemístné Co chrání před rakovinou Zářící obrazovka - riziko pro epileptiky Pot obsahuje účinné antibiotikum, zjistili vědci Nadějí pro nevidomé je genová terapie Tlouštíkem kvůli nákaze? Vědci zkoušejí křemíkové oko pro nevidomé Rodičovství s myší pomocí Vědci vymýšlejí zelené počítače Ptáci se právem chlubí vlastním peřím Kmenové buňky bojují s mozkovými nádory Automobil umí létat Síla myšlenky hýbe umělou rukou V Praze 20/3/2012 RNDr. Jiří Petrák, Ph.D. 6