Mikroskopické stanovení sinic Státní zdravotní ústav, 28.6.2012 Petr Pumann
Státní zdravotní ústav Rozpoznat řasy od sinic
Woronichinia naegeliana Botryococcus (zelená řasa) Státní zdravotní ústav
Důležité skupiny planktonních sinic kokální vláknité Chroococcales Oscillatoriales Nostocales
Aerotopy, plynové měchýřky
http://www.amyhremleyfoundation.org/i mages/conservation/gasvesicles-07m.gif http://coel.ecgf.uakron.edu/~ju/images/gasvesicle-sem.jpg
heterocyt
heterocyty
akineta heterocyty
Kokální sinice Státní zdravotní ústav Vodních květů Microcystis M. wesenbergii M. aeruginosa M. viridis M. flos-aquae M. ichthyoblabe Woronichinia naegeliana Planktonní Pikoplanktonní Synechococcus Synechcystis Cyanobium Nanoplanktonní Aphanocapsa Aphanothece Snowella Coelomoron Coelosphaerium Cyanogranis
Microcystis Státní zdravotní ústav Foto: J.Duras
Microcystis spp., Woronichinia naegeliana,
Microcystis spp., Woronichinia naegeliana, zelené řasy
Microcystis aeruginosa 2A Microcystis viridis Microcystis viridis Microcystis aeruginosa Microcystis wesenbergii Microcystis aeruginosa Státní zdravotní ústav
Státní zdravotní ústav Planktolyngbya limnetica, Microcystis wesenbergii, Microcystis viridis
Microcystis wesenbergii Microcystis flos-aquae?
Microcystis sp. Microcystis viridis
Microcystis wesenbergii
Microcystis viridis M. aeruginosa M. flos-aquae M. ichthyoblabe Státní zdravotní ústav
Woronichinia naegeliana
Woronichinia naegeliana Botryococcus (zelená řasa)
Ceolemoron pusillum Snowella lacustris
Cyanogranis ferruginea Aphanocapsa Aphanocapsa Aphanocapsa
Aphanothece?
Aphanocapsa sp. Státní zdravotní ústav
Aphanothece stagnina sinice (spíše u dna) Foto: Jindřich Duras
Aphanothece stagnina sinice (spíše u dna) Foto: Jindřich Duras
Aphanothece stagnina spíše u dna Foto: Jindřich Duras
Vláknité sinice Státní zdravotní ústav Oscillatoriales Důležité taxony Vodní květy Planktothrix P. agardhii P. rubescens P. isothrix Nanoplankton Limnothrix Pseudanabaena Planktolyngya Nárosty (občas uvolňování do volné vody) Phormidium, Oscillatoria, Geitlerinema, Nostocales Důležité taxony Anabaena Aphanizomenon Anabaenopsis Cylindrospermopsis Raphidiopsis Gleotrichia echinulata Probíhají významné změny v taxomonii (rozsekání a přeskupení rodů Anabaena, Aphanizomenon)
Planktothrix agardhii
Planktothrix agardhii Trachelomonas Státní zdravotní ústav
Planktothrix agardhii
Planktolyngbya limnetica Státní zdravotní ústav
Pseudanabaena Limnothrix Státní zdravotní ústav
Státní zdravotní ústav Nárostové sinice - utržené
zelené nárosty
Stanovení živých organismů Utržené nárostové sinice tzv. oscilatorieta procházející světlo nahoře mrtvá Asterionella, dole mrtvá centrická rozsivka Stanovení živých organismů fluorescence nahoře mrtvá Asterionella, dole mrtvá centrická rozsivka
Utržené nárostové sinice tzv. oscilatorieta
Utržené nárostové sinice tzv. oscilatorieta
Utržené nárostové sinice tzv. oscilatorieta detail Oscillatoria limosa
nárostové sinice rodu Pseudanabaena (ale to se pouhým okem nepozná)
Anabaena flos-aquae Komárek, J. (1996): Klíč k určování vodních květů sinic v České republice. - pp. 22-85 in Maršálek et al.: Vodní květy sinic. Nadatio Flos-aquae, Brno.
Anabaena flos-aquae - detail akinet Komárek, J. (1996): Klíč k určování vodních květů sinic v České republice. - pp. 22-85 in Maršálek et al.: Vodní květy sinic. Nadatio Flos-aquae, Brno.
Anabaena sp.
Aphanizomenon sp.
Aphanizomenon flos-aquae
Aphanizomenon flos-aquae
Aphanizomenon flos-aquae
Státní zdravotní ústav Aphanizomenon aphanizomenoides
Anabena spiroides Státní zdravotní ústav
Státní zdravotní ústav
Pseudanabaena limnetica Aphanizomenon gracile Anabaenopsis Státní zdravotní ústav
Planktothrix agardhii Aphanizomenon Státní zdravotní ústav
Státní zdravotní ústav příměs vláknitých sinic Raphidiopsis?; Planktothrix
Hostivař, 6.8.2007 12:00; šířka všech vláken kolem 2,5 µm Raphidiopsis mediterranea Aphanizomenon issatschenkoi
Anabaena bergii Státní zdravotní ústav
Státní zdravotní ústav Anabaena bergii
Znaky vlákno je zakončeno špičatou buňkou ke konci vlákna se buňky prodlužují Státní zdravotní ústav
Státní zdravotní ústav Anabaena tenericaulis
Anabaena tenericaulis Nygaard 1949 Tabule převzata od Elišky Zapomělové Máchovo fishpond, Czech Republic Trichome width 2-3 m Akinetes 13-40 x 5-6.7 m (Nygaard in Starmach 1966)
Gloeotrichia echinulata (vzácná sinice vodních květů - 3. potvrzený nález na území ČR po 2.světové válce) Foto: Jindřich Duras
Gloeotrichia echinulata Foto: Jindřich Duras
Gloeotrichia echinulata Foto: Josef Hess
Cylindrospermopsis raciborskii Planktothrix agardhii
Státní zdravotní ústav Kvantifikace
ČSN 75 7717 kokální sinice? Státní zdravotní ústav
Státní zdravotní ústav ČSN 75 7717 vláknité sinice
Představa o přítomných sinicích údaje z odběrového protokolu (pozorování typických kolonií ve vodním sloupci, průhlednost,..) smyslové posouzení vzorku v laboratoři taxonomická determinace (většinou nutné zahustit - membránová filtrace) Státní zdravotní ústav
Postup pro stanovení kokálních sinic - podrobně Státní zdravotní ústav
Státní zdravotní ústav
Dezintegrace přidání KOH mechanicky standardně 5 ml vzorku, ale někdy nemusí být dostatečné Státní zdravotní ústav
Státní zdravotní ústav
Státní zdravotní ústav Alternativy homogenizátor Převzato z literatury Potter-Evehjem Bernard C, Monis P, Baker P (2004): Disaggregation of colonies of Microcystis (Cyanobacteria): efficiency of two techniques assessed using an image analysis system. Journal of Applied Phycology 16(2): 117-123. ALE dělali jen na dobře dezintegravtelných taxonech na M.viridis a M. wesenbergii moc nefunguje
Ultrazvukový homogenizátor Dobrý ale drahý (ve srovnání s injekční stříkačkou) Je nutné větší množství vzorku (což je však spíš výhoda) Státní zdravotní ústav http://www.maneko.cz/images/karta/stredni/v211_maneko.jpg
Státní zdravotní ústav Zahušťování
Odstřeďování před po Státní zdravotní ústav
Zahušťování - ultrafiltrace snadno přenosné, rychlé, nemusí se rozbíjet aerotopy ALE při vyšším oživení se ucpává ztráty (alespoň u mě ) není možno koupit Státní zdravotní ústav
Státní zdravotní ústav
Počítání v Cyrusově, Burkrově komůrce je možno využít fluorescenci kontrolovat dezintegraci kontrolovat, zda se nevznáší část buněk u krycího skla Státní zdravotní ústav
Státní zdravotní ústav
Státní zdravotní ústav
Dělící se buňky A B C D E 1 buňka 1 buňka 1 buňka 2 buňky 2 buňky Státní zdravotní ústav Cyanobakterie, 21.1.2004, Brno
Státní zdravotní ústav
Metodické problémy - velmi malé buňky Státní zdravotní ústav
Cyanogranis Romeria Koloniální sinice s drobnými buňkami Merismopedia Aphanothece Merismopedia Cyanodictyon Cyanocatena Aphanocapsa Státní zdravotní ústav
Velmi malé buňky pro koupací vody nepočítají se buňky menší než 2µm Planktolyngbya??????? Státní zdravotní ústav
Možnost využít tenké sklo a/nebo fluorescenci využít lepších optických vlastností tenkého krycího skla není dodržena standardní výška komůrky stanovení pouze orientační (cca 90% původního objemu) Státní zdravotní ústav
Vláknité sinice - podrobně Státní zdravotní ústav
Lugol! Problém - lyze buněk při přepravě a zpracování Státní zdravotní ústav
Zahuštění nutno častěji zahušťovat než kokální sinice při zahušťování centrifugací Lugolem fixovaných vzorků nebývá problém s velkými ztrátami ALE... Státní zdravotní ústav
Státní zdravotní ústav
Problém nezřetelné buňky především pro Planktothrix a Aphanizomenon 1 buňka = 5 µm Státní zdravotní ústav
Státní zdravotní ústav
počítání 250µm Státní zdravotní ústav
Taxon 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20? Aphanizomenon gracile 250
Státní zdravotní ústav 200µm
Taxon 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20? Aphanizomenon gracile 250 Planktothrix agardhii 200
Státní zdravotní ústav 180µm
Taxon 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20? Aphanizomenon gracile 250 Planktothrix agardhii 200 Aphanizomenon flos-aquae 180
Problém Planktothrix nehomogenita při plnění komůrky Státní zdravotní ústav
Výpočet Počet buněk/ml = B Pk Vz (Vd+VKOH) Pp Vp Vk Vd B počet napočítaných buněk Pp propočítaná plocha komůrky vyjádřená v mm2, počtem polí, pásů, aj. Pk celková plocha komůrky uvedená ve stejných jednotkách jako Pp Vd objem vzorku použitý k dezintegraci v ml VKOH objem přidaného dezintegračního činidla v ml (KOH, formalín, Lugolovo činidlo, HCl*) Vp objem vzorku použitého ke koncentraci v ml Vz objem zahuštěného vzorku v ml Vk objem komůrky v ml** *V případě Lugolova činidla nebo formalínu většinou můžeme zanedbat. ** Pro komůrku Cyrus I je objem 0,01ml. Státní zdravotní ústav
Případ Pseudanabaena mucicola podle ČSN 75 7717 se nepočítá, protože bývá vzhledem k biomase Microcystis zanedbatelná Státní zdravotní ústav
Zabezpečování kvality (Příloha C) Státní zdravotní ústav Interní kontrola ověření výtěžnosti zahuštění podchycení ztrát při dezintegraci Externí kontrola zpracovávat část vzorků společně s další laboratoří vhodné především pro vzorky, které se nevydávají pro MPZ (Anabaena, Aphanizomenon) Kvalifikace pracovníků determinace alespoň 20 vzorků s různým složením pod dohledem zkušeného pracovníka kvantifikace alespoň 5 různých vzorků sinic pod dohledem
Objemová biomasa Státní zdravotní ústav u přírodních koupacích vod je výrazně lepší jen pro některé taxony měřit nebo tabelované hodnoty? neměřit je rychlejší a vede k větší shodě mezi laboratořemi zvláště pro některé taxony mohou být údaje velmi proměnlivé MPZ zatím docela tragédie změny objemu po přidání Lugolu (Hawkins et al (2005). Harmful Algae 4: 1033-1043