výroční zpráva Ústav patologické fyziologie 1. LF UK

výroční zpráva 2017 Ústav patologické fyziologie 1. LF UK

výroční zpráva 2017 Ústav patologické fyziologie 1. LF UK

Ústav patologické fyziologie 1. LF UK

oobsah 1 Vedení ústavu 7 2 Základní charakteristika a vize ústavu 8 3 Pregraduální výuka 9 4 Postgraduální výuka 10 5 Věda a výzkum 11 6 Společná výzkumná spolupráce s jinými pracovišti, ocenění a akce 18 7 Granty a výzkumné projekty řešené v roce 2017 19 8 Publikace 20 9 Pracovníci ústavu k 31. 12. 2017 24 výroční zpráva 2017

Ústav patologické fyziologie 1. LF UK

1Vedení ústavu přednosta doc. MUDr. Martin Vokurka, CSc. emeritní přednosta prof. MUDr. Emanuel Nečas, DrSc. zástupce přednosty doc. MUDr. Jan Živný, Ph.D. zástupce přednosty pro vědeckou činnost doc. MUDr. Pavel Klener, Ph.D. kontakt U Nemocnice 5 128 53, Praha 2 tel: 224 965 901 e-mail: patfy@lf1.cuni.cz http://patofyziologie.lf1.cuni.cz/ výroční zpráva 2017 7

Ústav patologické fyziologie 1. LF UK 2 Základní charakteristika a vize ústavu Ústav je pedagogickým a vědeckým pracovištěm 1. lékařské fakulty UK. Jeho hlavním úkolem je zabezpečit výuku patologické fyziologie pro pregraduální studenty, rozvíjet vědeckou práci a vychovávat postgraduální studenty. x Cílem je vysoce kvalitní pregraduální výuka zabývající se etiopatogenezí chorobných stavů a spojující poznatky na molekulární a buněčné úrovni s orgánovým a systémovým přístupem. Snahou je integrovat dosavadní teoretické poznatky a připravit studenty na klinické studium, ale zároveň na chápání patologické fyziologie jako klíčové součásti medicínského myšlení, která by měla být rozvíjena celoživotním studiem. V této oblasti se ústav snaží o spolupráci s dalšími ústavy a klinikami fakulty a přípravou respektovaných učebních textů. x Ústav je vědecky aktivní institucí, v níž jsou iniciovány vlastní projekty a vznikají vlastní vědecké výsledky s maximální snahou o vysokou kvalitu a excelenci. Snahou je vytvářet tvůrčí prostředí pro fungující vědecké skupiny a pro jejich zapojení do výzkumu jak v mezinárodním kontextu, tak ve spolupráci s klinickými pracovišti (translační medicína). x Vědeckým zaměřením ústavu je základní biomedicínský výzkum v oblasti experimentální hematologie a krvetvorných kmenových buněk, myších modelů lidských lymfomů a translační hematologie, funkční genomiky a proteomiky, studium příčin a mechanismů nemocí na úrovni funkce buněk a jejich důsledků pro funkci tkání a orgánových systémů, metabolismus železa, studium biomarkerů závažných onemocnění, vytváření počítačových modelů fyziologických a patofyziologických mechanismů. x Na konci roku se na ústav přesunula skupina doc. RNDr. Marie Hubálek Kalbáčové, Ph.D., která se oficiálně stala součástí ústavu od roku 2018. x Ve výchově postgraduálních studentů se ústav snaží připravit odborníky se širokým biologickým, resp. medicínským kontextem, část studentů se současně připravuje na klinikách k atestaci. x Ústav spolupracuje s dalšími pracovišti v ČR i v zahraničí, zásadní je spolupráce především se Všeobecnou fakultní nemocnicí v Praze, pracovišti v BIOCEVu, Ústavem hematologie a krevní transfúze, s pracovišti Akademie věd ČR i zahraničními pracovišti. 8

3Pregraduální výuka ústav zabezpečuje a garantuje pregraduální výuku patologické fyziologie pro tyto studijní programy a obory: xvšeobecné lékařství v českém a anglickém jazyce xzubní lékařství v českém a anglickém jazyce xpředmět Patofyziologie výživy pro bakalářský studijní obor Nutriční terapeut xpředmět Klinická patofyziologie pro navazující magisterský studijní obor Nutriční specialista xve spolupráci s Ústavem patologie 1. LF UK a VFN předmět Patologie a patologická fyziologie pro bakalářské obory fyzioterapie, ergoterapie, adiktologie, nutriční terapeut, všeobecná sestra, porodní asistentka. Na výuce se podílí zejména lékaři, z nichž mnozí mají vědecký titul Ph.D. (CSc.) a klinické zkušenosti či jsou zařazeni do specializační přípravy a postgraduálního studia. Kromě lékařů se na výuce podílejí i odborníci z nelékařských oborů s ukončeným postgraduálním vzděláním v oborech Fyziologie a patofyziologie člověka, Biochemie, Molekulární biologie a genetika. Výuka v programu Všeobecné lékařství probíhá ve dvou semestrech 3. ročníku, je tvořena přednáškami, semináři věnovanými funkčním vyšetřovacím metodám (klinická fyziologie) a semináři věnovanými biologickým základům patogenetických procesů. Důležitá je spolupráce s klinickými pracovišti VFN (I., II. a III. interna, Klinika nefrologie). Během výuky studenti absolvují sérií testů a připravují seminární práce a referáty z oblastí molekulární medicíny. Cílem je zvýšit podíl praktických činností studentů a jejich aktivizace řešením kazuistiky. Ve spolupráci s Fyziologickým ústavem 1. LF UK probíhá výuka na simulačních modelech, studenti absolvují praktickou výuku spirometrie s rozlišením základních ventilačních poruch a plánují se další témata. Součástí zkoušky je test a patofyziologický rozbor kazuistik. Výuka v programu Zubní lékařství probíhá v letním semestru 2. a v zimním semestru 3. ročníku a je zakončena zkouškou. Výuka zahrnuje jak témata všeobecná, důležitá pro medicínské chápaní a studium vnitřního lékařství, tak téma speciální, věnovaná patofyziologii ústní dutiny. Dále na ústavu probíhá výuka volitelných předmětů: xkmenové buňky a regenerační lékařství/stem cells and regenerative medicine (prof. Nečas) vyučovaný v angličtině pro posluchače studující v češtině i angličtině xpatofyziologie v kazuistikách (doc. Vokurka) Oddělení biokybernetiky doc. Kofránka také zajišťuje magisterskou výuku bioinženýrů pro FEL ČVUT v předmětech: Poruchy fyziologických regulací (A6M33PFR/FEL ČVUT) a Modelování a simulace (A6M33MOS/FEL ČVUT). výroční zpráva 2017 9

Ústav patologické fyziologie 1. LF UK 4 Postgraduální výuka na ústavu probíhá doktorské studium v oborech xfyziologie a patofyziologie člověka (školitelé doc. Klener, prof. Nečas, doc. Vokurka, doc. Živný) xbiochemie a patobiochemie (školitelé ing. Krijt, doc. Vokurka) xbiofyzika a biomedicínská informatika (školitelé doc. Kofránek, prof. Maršálek) xneurovědy (školitel prof. Maršálek) xvývojová biologie (školitel dr. Pospíšil) obhájené práce v roce 2017 x MUDr. Bokang Calvin Maswabi, Ph.D., Characterization of hematopoietic cells in patients with mature B-cell malignancies. (školitel doc. MUDr. Jan Živný, Ph.D., konzultant doc. MUDr. Pavel Klener, Ph.D.) 10

5 Věda a výzkum Vedoucí vědečtí pracovníci a vědecké skupiny http://patofyziologie.lf1.cuni.cz/veda-a-vyzkum-vedecke-skupiny Doc. MUDr. Pavel Klener, Ph.D. Laboratoř translační hematologie Prof. MUDr. Emanuel Nečas, DrSc. Laboratoř hematopoezy a kmenových buněk Ing. Jan Krijt, Ph.D. doc. MUDr. Martin Vokurka, CSc. IronLab Laboratoř metabolismu železa RNDr. Petr Přikryl, Ph.D. Laboratoř nefrologické proteomiky a exosomů Doc. MUDr. Jan Živný, Ph.D. Nádorové kmenové buňky a progenitory Mgr. Vít Pospíšil, Ph.D. MicroRNA a transkripční faktory v regulaci hematopoezy a v leukemogenezi Prof. MUDr. RNDr. Petr Maršálek, Ph.D. Skupina pro výpočetní neurovědy Doc. MUDr. Jiří Kofránek, CSc. Oddělení biokybernetiky a počítačové podpory výuky RNDr. Karina Vargová, Ph.D. Laboratoř molekulárních mechanizmů u onemocnění krve Prof. MUDr. Pavel Maruna, CSc. Studium akutních zánětových reakcí výroční zpráva 2017 11

Ústav patologické fyziologie 1. LF UK 5 Popis vědeckých projektů a činnosti laboratoří v roce 2017 LABORATOŘ TRANSLAČNÍ HEMATOLOGIE Skupina vedená doc. Pavlem Klenerem se věnuje zavádění a charakterizaci myších modelů lidských agresivních lymfomů využitelných ke studiu biologie a experimentální terapie za použití ustálených buněčných linií a primárních buněk izolovaných z periferní krve či kostní dřeně pacientů s agresivními lymfoproliferativními chorobami (mantle cell lymfom, difuzní velkobuněčný lymfom, periferní T-lymfom aj.). Skupina se rovněž věnuje odvozování buněčných linií z periferní krve, kostní dřeně, maligních výpotků či infiltrovaných tkání pacientů s agresivními lymfoproliferativními chorobami. Další zájmy představují: experimentální terapie agresivních lymfomů (DLBCL, MCL), nová cílená léčiva: MLN4924 (inhibitor NED-8 aktivačního enzymu) spolupráce s Roswell Park Cancer Institute, polymerně-vázaná cytostatika (doxorubicin, gemcitabin) směrovaná pomocí monoklonálních protilátek (spolupráce s prof. Ulbrichem z Ústavu makromolekulární chemie AV ČR). Dále také antiangiogenní léčebné strategie, CAR T-lymfocyty (spolupráce s dr. Otáhalem), cílená inhibice BCL2 proteinů (ABT-199 +/- homoharringtonin), výzkum molekulárních mechanismů zodpovědných za rezistenci MCL a CLL buněk na protinádorové léky se zaměřením na antinukleotidy cytarabin a fludarabin a v neposlední řadě studium kmenových a progenitorových buněk z kostní dřeně pacientů se zralými lymfoproliferacemi. Členové skupiny rovněž působí na I. interní klinice 1. LF UK a VFN jako lékaři. vědecké výsledky, aktivity v a publikace xdai, Beiying et al. B-cell receptor-driven MALT1 activity regulates MYC signaling in mantle cell lymphoma. Blood. 2017, 129(3), 333-346 xerdmann, Tabea et al. Sensitivity to PI3K and AKT inhibitors is mediated by divergent molecular mechanisms in subtypes of DLBCL. Blood. 2017, 130(3), 310-322 xklener, Pavel et al. Alternating R-CHOP and R-cytarabine is a safe and effective regimen for transplantineligible patients with a newly diagnosed mantle cell lymphoma. Hematological Oncology. 2017, Neuveden, ISSN 0278-0232 xmaswabi, Bokang Calvin et al. Hematopoiesis in patients with mature B-cell malignancies is deregulated even in patients with undetectable bone marrow involvement. Haematologica. 2017, 102(4), E152-E155 národní a mezinárodní spolupráce xprof. M. Trněný (I. interní klinika VFN a 1. LF UK, Praha) xdr. L. Anděra (ÚMG AVČR, Praha) xprof. P. Dundr (Ústav patologie 1. LF UK a VFN Praha) xprof. R. Kodet (Ústav patologie FNM a 2. LF UK, Praha) xfn Motol (Laboratoř CLIP, Childhood Leukemia Investigation Prague) xprof. M. Strnad (Univerzita Palackého v Olomouci) xrndr. T. Etrych (Ústav makromolekulární chemie AV ČR) xv zahraničí skupina spolupracuje s Laboratoří translační onkologie, Universita v Münsteru (prof. Georg Lenz) granty řešené v roce 2017 x AZV 15-27757A (hlavní řešitel doc. Pavel Klener) x GAČR15-02986S (hlavní řešitel RNDr. Tomáš Etrych, Ústav makromolekulární chemie AV ČR, spoluřešitel doc. Pavel Klener) x AZV 17-28980A (hlavní řešitel doc. Pavel Klener) x GAČR 17-14007S (hlavní řešitel prof. Miroslav Strnad, Ústav experimentální botaniky AV ČR, spoluřešitel doc. Pavel Klener) 12

5 Popis vědeckých projektů a činnosti laboratoří v roce 2017 LABORATOŘ HEMATOPOEZY A KMENOVÝCH BUNĚK Skupina prof. Emanuela Nečase studuje interakce krvetvorných kmenových buněk s jejich specifickým mikroprostředím. Zkoumá komplexní reakci krvetvorné tkáně na její poškození ionizujícím zářením nebo cyklofosfamidem a regeneraci krvetvorné tkáně vycházející z přeživších nebo transplantovaných kmenových a progenitorových buněk. Studuje tvorbu nových kmenových buněk jejich asymetrickým a symetrickým sebe-obnovným dělením, účinnost transplantace kmenových a progenitorových buněk ve vztahu k regeneračním pochodům v krvetvorné tkáni. Zabývá se také energetickým metabolismem krvetvorných kmenových buněk a jejich odolností k nedostatku kyslíku. Rovněž se zabývá optimalizací postupů používaných k rozpoznání kmenových a progenitorových buněk v krvetvorné tkáni pokusných myší pomocí průtokové cytometrie. Laboratoř poskytuje podporu jiným výzkumným skupinám i externím pracovištím při aplikaci pokročilých metod cytometrické analýzy, sortování buněk a preklinického in vivo zobrazování. Laboratoř má pracoviště také v biotechnologickém a biomedicínském centru BIOCEV. národní a mezinárodní spolupráce xcapi, 1. lékařská fakulta UK, RNDr. Luděk Šefc, CSc. xnational Pingtung University of Science and Technology, Tchaj-wan, Ko-Tung Chang, Ph.D. granty řešené v roce 2017 xgačr 17-01897S (hlavní řešitel prof. E. Nečas) IRONLAB LABORATOŘ METABOLISMU ŽELEZA Skupina výzkumu metabolismu železa (ing. Jan Krijt, doc. Martin Vokurka) se zabývá regulací systémového metabolismu železa, především studiem signálních drah ovlivňujících expresi hepcidinu jaterního hormonu, jenž reguluje metabolismus železa. Podstatou studia je in vivo sledování změn exprese proteinů participujících v jednotlivých signálních drahách po experimentálním ovlivnění metabolismu železa (přetížení železem, aktivace erytropoezy, zánět), a to jak na transkripční úrovni pomocí real-time PCR, tak na posttranskripční úrovni pomocí imunoblotů a moderních proteomických technik. Projekt využívá experimentální modely hereditární hemochromatózy myši s vyřazenými geny pro HFE, hemojuvelin a Tmprss6 (matriptázu-2). V roce 2017 publikovala práce věnované vlivu erytropoetinu na regulační proteiny metabolismu železa u myši s mutací matriptázy-2 a na erytroidní regulátor metabolismu železa erythroferrone ve slezině a matriptázu-2 v játrech potkanů. Ve spolupráci s Nefrologickou klinikou 1. LF UK a VFN je studován hepcidin u vaskulitid. vědecké výsledky, aktivity v a publikace xfrýdlová, Jana et al. Effect of erythropoietin administration on proteins participating in iron homeostasis in Tmprss6-mutated mask mice. PLoS One. 2017, 12(10), nestránkováno. xgurieva, Iuliia et al. Erythropoietin administration increases splenic erythroferrone protein content and liver TMPRSS6 protein content in rats. Blood Cells, Molecules & Diseases. 2017, 64(May), 1-7. národní a mezinárodní spolupráce x Prof. V. Tesař (Nefrologická klinika VFN a 1. LF UK, Praha), dr. J. Truksa, Laboratoř nádorové rezistence Biotechnologického Ústavu AV ČR. x V zahraničí spolupracuje skupina s Dr. Xin Du, University of California, San Diego, La Jolla, CA, USA, Dr. P. Lee (La Jolla, USA), Marie-Paul Roth (Institut de Recherche en Santé Digestive, Inserm U1220, CNRS U5282, Université de Toulouse III, Toulouse, France) výroční zpráva 2017 13

Ústav patologické fyziologie 1. LF UK 5 Popis vědeckých projektů a činnosti laboratoří v roce 2017 LABORATOŘ NEFROLOGICKÉ PROTEOMIKY A EXOSOMŮ Laboratoř vedená dr. Petrem Přikrylem se zabývá separacemi a identifikací proteinů v tkáních, buňkách a tělních tekutinách. Hlavním zájmem laboratoře je studium a hledání biomarkerů a patofyziologie onemocnění ledvin. K tomu je využívána řada separačních a detekčních technik, jako je: kapalinová chromatografie, hmotnostní spektrometre, 1D a 2D gelová elektroforéza, ELISA, western blot a jiné. V současnosti je laboratoř zejména zaměřena na studium nových diagnostických a prediktivních biomarkerů v močových exosomech u pacientů s autoimunitním onemocněním ledvin (lupus nefritis a ANCA-asociované vaskulitidy) a IgA nefropatie. Močové exosomy obsahují proteiny a nukleové kyseliny, včetně mikrorna, které specificky odrážejí fyziologické a patologické stavy buněk z odlišných částí ledvin. Jejich proteomická analýza a analýza exprese mikrorna může proto vést k nalezení specifických biomarkerů, které se dále stanovují u pacientů v různých stadiích onemocnění a v korelaci dalšími parametry onemocnění, s funkcí a biopsií ledvin, s odpovědí na léčbu a s dlouhodobým vývojem choroby. V roce 2017 proběhlo sekvenování (NGS) mikrorna izolovaných z exosomů pacientů a kontrol, vybrané relevantní mikrorna budou následně validovány. Cílem skupiny je hledat nové biomarkery v moči pacientů s různým onemocněním ledvin a použít je pro jejich konkrétní, neinvazivní klinické testování a monitorování a rozvoj detekce a vyžití exosomů u fyziologických a patologických stavů. vědecké výsledky, aktivity v a publikace xpřikryl, Petr et al. Proteomic Approach for Identification of IgA Nephropathy-Related Biomarkers in Urine. Physiological Research. 2017, 66(4), 621-632 národní a mezinárodní spolupráce xklinika nefrologie 1. LF UK a VFN Praha xlaboratoř chemické robotiky, FCHI VŠCHT Praha granty řešené v roce 2017 xazv 15-31662A (hlavní řešitel doc. Vokurka) NÁDOROVÉ KMENOVÉ BUŇKY A PROGENITORY Skupina doc. Jana Živného se zabývá patofyziologií maligních nádorů a využívá myší model lidské kancerogeneze pro studium biologie nádorových kmenových buněk, jejich senzitivity k experimentálním terapeutikům a pro identifikaci nových nádorových biomarkerů. Skupina se dále zabývá analýzou buněčných mikrovezikulů produkovaných endotelovými buňkami a nádorovými buňkami s cílem identifikovat jejich funkci a využít je při diagnostice nádorů a zánětových stavů. národní a mezinárodní spolupráce xdoc. MUDr. Jan Janota, Ph.D. (Novorozenecké oddělení Thomayerovy nemocnice, Praha) xprof. ing. Stanislav Kmoch, Ph.D. (Ústav dědičných metabolických poruch 1. LF UK a VFN) granty řešené v roce 2017 xazv 16-27800A (hlavní řešitel doc. Janota) 14

5 Popis vědeckých projektů a činnosti laboratoří v roce 2017 MICRORNA A TRANSKRIPČNÍ FAKTORY V REGULACI HEMATOPOEZY A V LEUKEMOGENEZI Nosným tématem skupiny dr. Víta Pospíšila je studium transkripční a post-transkripční regulace genové exprese během normální a patologické krvetvorby. To zahrnuje jednak studium, identifikaci a funkční charakterizaci regulačních DNA oblastí genů tzv. promotorů a zejména až mnoho kilobází vzdálených enhancerů, a nově objevených superenhancerů, jež zodpovídají za aktivaci tkáňově a liniově specifických genů během normální a aberantní aktivaci těchto genů během maligní krvetvorby. Dalším směrem je vývoj citlivé a neinvazivní metody včasné detekce lymfomů postihujících centrální nervovou soustavu pomocí extracelulárních mikrorna v mozkomíšním moku a séru. CNS lymfom je onemocnění s vysokou morbiditou, jež nelze současnými metodami časně detekovat. Naše výsledky ukazují, že mikrorna v mozkomíšním moku a plazmě jsou schopné identifikovat CNS s několikaměsíčním předstihem oproti současně používaným metodám. Třetím navazujícím projektem je charakterizace biologické funkce těchto extracelulárních mikrorna v iniciaci a metastázi nádorů, jež je doposud zcela neznámá. vědecké výsledky, aktivity v a publikace xkrsmanović, Pavle et al. Vigor of survival determinism: subtle evolutionary gradualism interspersed with robust phylogenetic leaping. Theory in Biosciences. 2017, 136(3-4), 141-151. národní a mezinárodní spolupráce xprof. Marek Trněný, Ph.D., I. interní klinika 1. LF UK a VFN xprof. Tomáš Stopka, Ph.D., BIOCEV 1. LF UK xdr. Vladimir Benes, EMBL, Heidelberg, Germany xdr. Peter Laslo, Leeds Institute of Molecular Medicine, UK xdr. Sven Heinz, University of California, San Diego, USA xdr. Christopher Benner, University of California, La Jolla, San Diego, USA granty řešené v roce 2017 AZV 16-31586A (hlavní řešitel dr. Pospíšil) SKUPINA PRO VÝPOČETNÍ NEUROVĚDY Skupina prof. Petra Maršálka studuje normální a patologické slyšení, prostorové slyšení, analogie mezi neuronovými obvody v CNS a umělými neuronovými sítěmi. Použité metody jsou převážně teoretické, jsou studována data získaná pomocí elektrofyziologických a psychofyzikálních experimentů na sluchové dráze. Dále jsou studovány zákaznické akustické sestavy a softwarové a hardwarové emulace a implementace algoritmů užitých při kódování zvuku v multimédiích a v kochleárních implantátech. vědecké výsledky, aktivity v a publikace xmaršálek, Petr et al. Pathological Physiology of the Visual Pathway. Homonymous Visual Field Defects. 1. vyd. Nizozemsko: Springer, 2017, s. 17-29. ISBN 978-3-319-52282-1. národní a mezinárodní spolupráce xelektrotechnická fakulta ČVUT, katedra radioelektroniky: vedoucí doc. RNDr. Petr Páta, Ph.D., vedoucí akustické skupiny ing. František Rund, Ph.D. xuniverzita Pavla Jozefa Šafárika v Košicích (Slovensko), Přírodovědecká fakulta, Ústav informatiky, Oddělení informačných a znalostných systémov, Laboratórium vnímání a kognice, vedoucí doc. Ing. Norbert Kopčo, Ph.D. xmax Planck Institute for the physics of complex systems (Drážďany, Německo) granty řešené v roce 2017 xevropská komise: Multilateral scientific and technological cooperation in the Danube region, No. DS-2016-0026, Plasticity of (spa)tial processing in normal and (c)ochlear (i)mplant hearing (acronym SPACI). (Hlavní řešitel: doc. Bernhard Laback, PhD., Petr Maršálek je vedoucí řešitel za Českou republiku.) výroční zpráva 2017 15

Ústav patologické fyziologie 1. LF UK 5 Popis vědeckých projektů a činnosti laboratoří v roce 2017 ODDĚLENÍ BIOKYBERNETIKY A POČÍTAČOVÉ PODPORY VÝUKY Skupina doc. Jiřího Kofránka se věnuje problematice studiu integrativní fyziologie pomocí počítačových modelů a tvorbě rozsáhlého modelu fyziologických funkcí jako teoretického podkladu pro lékařské simulátory (projekt HumMod). Jedním z dlouhodobých klíčových projektů laboratoře je Atlas fyziologie a patofyziologie (www.physiome.cz), jehož cílem je vytvoření multimediálního interaktivního atlasu vysvětlujícího některé obtížnější partie fyziologie a patofyziologie s využitím animací a simulačních modelů. Další aktivitou je rozvoj softwarových nástrojů pro modelování a tvorbu simulátorů (účast na projektu Open Modelica). vědecké výsledky, aktivity v a publikace xježek, Filip et al. Lumped models of the cardiovascular system of various complexity. Biocybernetics and Biomedical Engineering. 2017, 37(4), 666-678 xkofránek, Jiří et al. Model cirkulace jako výuková pomůcka. In: Medsoft 2017: Sborník příspěvků. Praha: Creative Connections, 2017. s. 117-128 xkofránek, Jiří et al. Napojení zdravotnických systémů na základní registry veřejné správy: ochrana a kontrolované sdílení osobních dat. In: Medsoft 2017: Sborník příspěvků. Praha: Creative Connections, 2017. s. 104-116 xkofránek, Jiří. Bilanční pojetí acidobazické rovnováhy. In: Medsoft 2017: Sborník příspěvků. Praha: Creative Connections, 2017. s. 57-103 granty řešené v roce 2017 xmpo č. projektu FV20628: Lékařský trenažér simulátor virtuálního pacienta LABORATOŘ MOLEKULÁRNÍCH MECHANISMŮ KREVNÍCH CHOROB Nově vznikající laboratoř dr. Kariny Vargové se věnuje studiu regulační sítě onkogenních mikrorna u leukemických B-buněk za využití nové technologie editace genů a spolupracuje s výzkumnou skupinou prof. T. Stopky (BIOCEV) na programu mechanismů remodelace chromatinové struktury během rozhodování o buněčném osudu. Projekt bude využívat ve spolupráci s CAPI magnetickou rezonanci k měření dynamiky růstu tumorů myší. Ze spolupráce je momentálně v recenzním řízení jedna publikace (MiR-155/miR-150 Network Regulates Progression through the Disease Phases of Chronic Lymphocytic Leukemia, v časopisu Blood Cancer Journal). Byl získán projekt UK PRIMUS: Studium regulační sítě onkogenních mikrorna u leukemických B-buněk za využití nové technologie editace genů s plněním od roku 2018. vědecké výsledky, aktivity v a publikace xvargova Karina et al. MiR-155/miR-150 network regulates progression through the disease phases of chronic lymphocytic leukemia. Blood Cancer J. 2017 Jul 21;7(7):e585 xpolgarova Kamila et al. Somatic mutation dynamics in MDS patients treated with azacitidine indicate clonal selection in patients-responders. Oncotarget. 2017 Dec 6. doi:10.18632/oncotarget.22957 xhuskova H et al. Modeling cancer driver events in vitro using barrier bypass-clonal expansion assays and massively parallel sequencing. Oncogene. 2017 Jul 10. doi: 0.1038/onc.2017.215 národní a mezinárodní spolupráce xoddělení Biochemie, Přírodovědecká fakulta, Palackého Univerzita v Olomouci, Prof. Marek Šebela, Ph.D. xcentrum pro fenogenomiku v Biocevu ve Vestci, Prof. Radek Sedláček, Ph.D. xcapi, RNDr. Ludek Sefc, CSc. xomics Genomics, Biocev, Vestec, vedoucí RNDr. Štěpánka Hrdá 16

5 Popis vědeckých projektů a činnosti laboratoří v roce 2017 Prof. MUDr. PAVEL MARUNA, CSc. Prof. Maruna je členem mezioborové skupiny klinických a teoretických pracovníků II. chirurgické kliniky a dalších pracovišť 1. lékařské fakulty UK a Všeobecné fakultní nemocnice v Praze. Dlouhodobá spolupráce a klinické studie pod vedením přednosty I. chirurgické kliniky kliniky kardiovaskulární chirurgie 1. LF UK a VFN Praha je zaměřena na průběh zánětlivé reakce v časném pooperačním období, na studium laboratorních ukazatelů reakce akutní fáze (proteiny akutní fáze, prozánětlivé cytokiny, prokalcitonin a presepsin), a to jak u nekomplikovaných chirurgických pacientů, tak u pacientů s časnými pooperačními infekčními komplikacemi po velkém kardiochirurgickém výkonu. Klinickým cílem výzkumu je nalezení vhodných diagnostických nástrojů a prognostických parametrů pooperačního průběhu u vysoce rizikových pacientů a jejich aplikace do kardiochirurgické praxe. Je připravována nová studie hodnocení zánětlivých parametrů u pacientů s disekujícím aneurysmatem aorty. národní a mezinárodní spolupráce xprof. MUDr. Jaroslav Lindner, CSc. (přednosta II. chirurgické kliniky 1. LF UK a VFN v Praze) xprof. MUDr. Robert Gürlich, CSc. (přednosta Chirurgické kliniky 3. LF UK a FNKV) xmudr. Roman Fraško, CSc. (odborný asistent I. chirurgické kliniky 1. LF UK a VFN v Praze) xpapworth Hospital, Cambridge, Velká Británie (Dr. A.A. Klein) dlouholetá spolupráce skupiny prof. Lindnera včetně společných klinických studií a publikací výroční zpráva 2017 17

Ústav patologické fyziologie 1. LF UK 6 Společná výzkumná spolupráce s jinými pracovišti, ocenění a akce BIOCEV Skupina prof. Emanuela Nečase je zapojena v programu Buněčná biologie a virologie výzkumným projektem Interakce normálních a nádorově změněných hematopoetických kmenových buněk s jejich specifickým mikroprostředím (niche). Z ústavu participují Mgr. P. Páral, Mgr. N. Renešová, ing. M. Molík, ing. T. Heizer. Probíhá spolupráce se skupinou prof. Tomáše Stopky a doc. Jiřího Petráka. Biobanka Cílem projektu vedeného prof. MUDr. Tomášem Stopkou, Ph.D., je zpracovávání a uchovávaní pacientských vzorků (z VFN, ÚHKT) pro vědecké účely. Vzorky zahrnují periferní krev (plasma, sérum), kostní dřeň od pacientů s různými hematologickými malignitami: AML (akutní myeloidní leukémie), MDS (myelodysplastický syndrom), MPS (myeloproliferace), CLL (chronická lymfocytární leukémie), CML (chronická myeloidní leukémie), FL (folikulární lymfom), MM (mnohočetní myelom), kožní T-lymfomy (mycosis fungoides) a Sézaryho syndrom. Tato jedinečná a zaběhlá biobanka umožňuje studování molekulárních mechanismů malignit na primárních vzorcích. Biobanka je otevřená ke spolupráci s dalšími vědeckými institucemi, nemocnicemi. V r. 2017 vznikla za podpory biobanky publikace: Dusilkova N, Basova P, Polivka J, Kodet O, Kulvait V, Pesta M, Trneny M, Stopka T. Plasma mir-155, mir-203, and mir-205 are Biomarkers for Monitoring of Primary Cutaneous T-cell Lymphomas. Int J Mol Sci. 2017 Oct 15;18(10). pii: E2136. doi: 10.3390/ijms18102136. Ústav hematologie a krevní transfuze (ÚHKT) Dlouhodobá spolupráce s ÚHKT pokračovala i v roce 2017. RNDr. Pavel Burda, Ph.D., a RNDr. Nikola Čuřík, Ph.D., z Oddělení molekulární genetiky ÚHKT (vedené Mgr. Kateřinou Machovou Polákovou, Ph.D.) dokončovali v rámci kooperující skupiny projekt studující roli a vzájemné funkční vztahy transkripčních faktorů a mikrorna (mir-150 a mir-155) v normální a leukemické hematopoéze, jejich mutační a epigenetické konsekvence v patogenezi a progresi chronické myeloidní leukemie. Pozornost též v rámci skupiny věnují studiu mechanismů rezistence leukemických buněk na klinicky využívaná léčiva (inhibitory tyrozinkináz). V rámci spolupráce je využíváno know-how, vlídné prostory a přístrojové vybavení ÚPF (RT-qPCR Thermo Fisher Scientific; BD FACS Canto II, Becton Dickenson). Výsledkem spolupráce je recentně přijatý článek v časopise Hematologica s názvem BCR-ABL1 mediated mir-150 downregulation through MYC contributed to myeloid differentiation block and drug resistance in chronic myeloid leukemia. Dr. Čuřík a dr. Burda rovněž participují na zajištění pedagogické činnosti Ústavu patologické fyziologie: pro studenty všeobecného lékařství zajištují jednak klasickou výuku seminářů a též blokovou výuku (téma Modely patologických stavů na zvířatech), též jsou oba aktivní ve výuce pro bakaláře v oboru Nutriční terapie. Stáže na ústavu IFMSA xlaboratoř ing. Krijta a doc. Vokurky: 1 studentka (Nizozemí) 18

7Granty a výzkumné projekty řešené v roce 2017 xmolekulová, buněčná a patofyziologická podstata nemocí II. MŠMT-UK Q26/LF1, 2017-2021 (PROGRES) xexperimentální patologie založená na genové manipulaci kmenových buněk. MŠMT-UK 204021, 2012-2017 (UNCE) xdiferencované, kmenové a nádorově transformované buňky, jejich regulace, signalizace a funkce ve zdraví a nemoci. SVV UK 260371 / 2017 xcílená inhibice BCL2 a MCL1 v experimentální terapii agresivních lymfomů. AZV 15-27757A, 2015 2018 xlidské močové exosomy zdroj nových biomarkerů pro diagnostiku a sledování nemocí ledvin. AZV 15-31662A, 2015 2018 xsměrované systémy pro dopravu léčiv určené k cílené léčbě hematologických malignit (hlavní řešitel RNDr. Tomáš Etrych, Ústav makromolekulární chemie AV ČR). GAČR 15-02986S, 2015 2017 xpoškození endotelu u novorozenců: diagnostický význam biomarkerů a mikropartikulí u onemocnění ovlivňujících novorozeneckou mortalitu a morbiditu (hlavní řešitel doc. MUDr. Jan Janota, Ph.D., Thomayerova nemocnice). AZV 16-27800A, 2016 2019 xvývoj senzitivní metody pro včasnou diagnostiku a sledování lymfomů centrální nervové soustavy pomocí onkogenních mirna v likvoru a plazmě. AZV 16-31586A, 2016 2019 xanalýza sebeobnovných mechanismů v aktivovaných hematopoetických progenitorech GAČR 17-01897S, 2017 2019 xmpo č. projektu FV20628: Lékařský trenažér - simulátor virtuálního pacienta, 2017 2021 xnové prognostické a prediktivní ukazatele u pacientů s lymfomem z plášťových buněk při diagnóze a v průběhu léčby. AZV 17-28980A, 2017 2021 x Modulace CDK a příbuzných molekulárních cílů u agresivních nehodgkinských lymfomů (hlavní řešitel prof. Ing. Miroslav Strnad, DSc., Ústav experimentální botaniky AV ČR) GAČR 17-14007S, 2017 2019 výroční zpráva 2017 19

Ústav patologické fyziologie 1. LF UK 8Publikace IF xbašová, Petra - PEŠTA, Michal - SOCHOR, Marek - STOPKA, Tomáš. Prediction Potential of Serum mir-155 and mir-24 for Relapsing Early Breast Cancer. International Journal of Molecular Sciences. 2017, 18(10), nestránkováno. ISSN 1422-0067. DOI: 10.3390/ijms18102116 IF = 3.226 (2016) xburianova, Iva - KULIHOVA, Katarina - VÍTKOVÁ, Veronika - JANOTA, Jan. Breastfeeding After Early Repair of Cleft Lip in Newborns With Cleft Lip or Cleft Lip and Palate in a Baby-Friendly Designated Hospital. Journal of Human Lactation. 2017, 33(3), 504-508. ISSN 0890-3344. DOI: 10.1177/0890334417706062 IF = 2.007 (2016) xdai, Beiying - GRAU, Michael - JUILLAND, Melanie - KLENER, Pavel - HOERING, Elisabeth - MOLINSKÝ, Jan - SCHIMMACK, Gisela - AUKEMA, Sietse M. - HOSTER, Eva - VOGT, Niklas - STAIGER, Annette M. - ERDMANN, Tabea - XU, Wendan - ERDMANN, Kristian - DZYUBA, Nicole - MADLE, Hannelore - BERDEL, Wolfgang E. - TRNĚNÝ, Marek - DREYLING, Martin - JOEHRENS, Korinna - LENZ, Peter - ROSENWALD, Andreas - SIEBERT, Reiner - TZANKOV, Alexandar - KLAPPER, Wolfram - ANAGNOSTOPOULOS, Ioannis - KRAPPMANN, Daniel - OTT, German - THOME, Margot - LENZ, Georg. B-cell receptor-driven MALT1 activity regulates MYC signaling in mantle cell lymphoma. Blood. 2017, 129(3), 333-346. ISSN 0006-4971. DOI: 10.1182/blood-2016-05-718775 IF = 13.164 (2016) xdusílková, Nina Borisovna - BAŠOVÁ, Petra - POLÍVKA, Jindřich - KODET, Ondřej - KULVAIT, Vojtěch - PEŠTA, Michal - TRNĚNÝ, Marek - STOPKA, Tomáš. Plasma mir-155, mir-203, and mir-205 are Biomarkers for Monitoring of Primary Cutaneous T-Cell Lymphomas. International Journal of Molecular Sciences. 2017, 18(10), nestránkováno. ISSN 1422-0067. DOI: 10.3390/ijms18102136 IF = 3.226 (2016) 20 x ERDMANN, Tabea - KLENER, Pavel - LYNCH, James T. - GRAU, Michael - VOČKOVÁ, Petra - MOLINSKÝ, Jan - TUŠKOVÁ, Diana - HUDSON, Kevin - POLANSKA, Urszula M. - GRONDINE, Michael - MAYO, Michele - DAI, Beiying - PFEIFER, Matthias - ERDMANN, Kristian - SCHWAMMBACH, Daniela - ZAPUKHLYAK, Myroslav - STAIGER, Annette M. - OTT, German - BERDEL, Wolfgang E. - DAVIES, Barry R. - CRUZALEGUI, Francisco - TRNĚNÝ, Marek - LENZ, Peter - BARRY, Simon T. - LENZ, Georg. Sensitivity to PI3K and AKT inhibitors is mediated by divergent molecular mechanisms in subtypes of DLBCL. Blood. 2017, 130(3), 310-322. ISSN 0006-4971. DOI: 10.1182/blood-2016-12-758599 IF = 13.164 (2016)

8 Publikace xfrýdlová, Jana - RYCHTARČÍKOVÁ, Zuzana - GURIEVA, Iuliia - VOKURKA, Martin - TRUKSA, Jaroslav - KRIJT, Jan. Effect of erythropoietin administration on proteins participating in iron homeostasis in Tmprss6-mutated mask mice. PLoS One. 2017, 12(10), nestránkováno. ISSN 1932-6203. DOI: 10.1371/journal.pone.0186844 IF = 2.806 (2016) xgurieva, Iuliia - FRÝDLOVÁ, Jana - RYCHTARČÍKOVÁ, Zuzana - VOKURKA, Martin - TRUKSA, Jaroslav - KRIJT, Jan. Erythropoietin administration increases splenic erythroferrone protein content and liver TMPRSS6 protein content in rats. Blood Cells, Molecules & Diseases. 2017, 64(May), 1-7. ISSN 1079-9796. DOI: 10.1016/j. bcmd.2017.02.007 IF = 1.882 (2016) xhušková, Hana - ARDIN, M. - WENINGER, A. - VARGOVÁ, Karina - BARRIN, S. - VILLAR, S. - OLIVIER, M. - STOPKA, Tomáš - HERCEG, Z. - HOLLSTEIN, M. - ZAVADIL, J. - KORENJAK, M. Modeling cancer driver events in vitro using barrier bypass-clonal expansion assays and massively parallel sequencing. Oncogene. 2017, 36(43), 6041-6048. ISSN 0950-9232. DOI: 10.1038/onc.2017.215 IF = 7.519 (2016) xjarušková, Monika - ČUŘÍK, Nikola - HERCOG, Rajna - POLÍVKOVÁ, Václava - MOTLOVA, Eliska - BENES, Vladimir - KLAMOVÁ, Hana - PECHERKOVA, Pavla - BĚLOHLÁVKOVÁ, Petra - VRBACKÝ, Filip - MACHOVÁ POLÁKOVÁ, Kateřina. Genotypes of SLC22A4 and SLC22A5 regulatory loci are predictive of the response of chronic myeloid leukemia patients to imatinib treatment. Journal of Experimental and Clinical Cancer Research. 2017, 36(April), nestránkováno. ISSN 1756-9966. DOI: 10.1186/s13046-017- 0523-3 IF = 5.189 (2016) xježek, Filip - KULHÁNEK, Tomáš - KALECKÝ, Karel - KOFRÁNEK, Jiří. Lumped models of the cardiovascular system of various complexity. Biocybernetics and Biomedical Engineering. 2017, 37(4), 666-678. ISSN 0208-5216. DOI: 10.1016/j. bbe.2017.08.001 IF = 1.031 (2016) xklener, Pavel - FROŇKOVÁ, Eva - BELADA, David - FORSTEROVÁ, Kristina - PYTLÍK, Robert - KALINOVÁ, Markéta - ŠIMKOVIČ, Martin - SALEK, David - MÓCIKOVÁ, Heidi - PROCHÁZKA, Vít - BLAHOVCOVÁ, Petra - JANÍKOVÁ, Andrea - MARKOVÁ, Jana - OBR, Aleš - BERKOVÁ, Adéla - KUBINYI, Jozef - VÁŠKOVÁ, Martina - MEJSTŘÍKOVÁ, Ester - CAMPR, Vít - JAKŠA, Radek - KODET, Roman - MICHALOVÁ, Kyra - TRKA, Jan - TRNĚNÝ, Marek. Alternating R-CHOP and R-cytarabine is a safe and effective regimen for transplant-ineligible patients with a newly diagnosed mantle cell lymphoma. Hematological Oncology. 2017, Neuveden, ISSN 0278-0232. DOI: 10.1002/hon.2483 IF = 3.118 (2016) xkokavec, Juraj - ZIKMUND, Tomáš - SAVVULIDI, Filipp Geirgievich - KULVAIT, Vojtěch - EDELMANN, Winfried - SKOULTCHI, Arthur I. - STOPKA, Tomáš. The ISWI ATPase Smarca5 (Snf2h) Is Required for Proliferation and Differentiation of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells. Stem Cells. 2017, 35(6), 1614-1623. ISSN 1066-5099. DOI: 10.1002/stem.2604 IF = 5.599 (2016) xkrsmanović, Pavle. Vigor of survival determinism: subtle evolutionary gradualism interspersed with robust phylogenetic leaping. Theory in Biosciences. 2017, 136(3-4), 141-151. ISSN 1431-7613. DOI: 10.1007/s12064-017-0251-4 IF = 0.778 (2016) x LANIKOVA, Lucie - READING, N. Scott - HU, Hao - TASHI, Tsewang - BURJANIVOVA, Tatiana - SHESTAKOVA, Anna - SIWAKOTI, Bhola - THAKUR, Binay Kumar - PUN, Chin Bahadur - SAPKOTA, Amir - ABDELAZIZ, Sarah - FENG, Bing-Jian - HUFF, Chad D. - HASHIBE, Mia - PRCHAL, Josef. Evolutionary selected Tibetan variants of HIF pathway and risk of lung cancer. Oncotarget. 2017, 8(7), 11739-11747. ISSN 1949-2553. DOI: 10.18632/oncotarget.14340 IF = 5.168 (2016) výroční zpráva 2017 21

Ústav patologické fyziologie 1. LF UK 8 Publikace xloukotová, Lenka - KUČKA, Jan - RABYK, Mariia - HÖCHERL, Anita - VENCLÍKOVÁ, Kristýna - JANOUŠKOVÁ, Olga - PÁRAL, Petr - KOLÁŘOVÁ, Věra - HEIZER, Tomáš - ŠEFC, Luděk - ŠTĚPÁNEK, Petr - HRUBÝ, Martin. Thermoresponsive beta-glucan-based polymers for bimodal immunoradiotherapy - Are they able to promote the immune system? Journal of Controlled Release. 2017, 268(December), 78-91. ISSN 0168-3659. DOI: 10.1016/j.jconrel.2017.10.010 IF = 7.786 (2016) xmaswabi, Bokang Calvin - MOLINSKÝ, Jan - SAVVULIDI, Filipp Geirgievich - ZIKMUND, Tomáš - PRŮKOVÁ, Dana - TUŠKOVÁ, Diana - KLÁNOVÁ, Magdalena - VOČKOVÁ, Petra - LATEČKOVÁ, Lucie - ŠEFC, Luděk - ŽIVNÝ, Jan - TRNĚNÝ, Marek - KLENER, Pavel. Hematopoiesis in patients with mature B-cell malignancies is deregulated even in patients with undetectable bone marrow involvement. Haematologica. 2017, 102(4), E152-E155. ISSN 0390-6078. DOI: 10.3324/ haematol.2016.151571 IF = 7.702 (2016) xpolgárová, Kamila - VARGOVÁ, Karina - KULVAIT, Vojtěch - DUSÍLKOVÁ, Nina Borisovna - MINAŘÍK, Ľubomír - ZEMANOVÁ, Zuzana - PEŠTA, Michal - JONÁŠOVÁ, Anna - STOPKA, Tomáš. Somatic mutation dynamics in MDS patients treated with azacitidine indicate clonal selection in patients-responders. Oncotarget. 2017, 8(67), 111966-111978. ISSN 1949-2553. DOI: 10.18632/ oncotarget.22957 IF = 5.168 (2016) xpřikryl, Petr - VOJTOVÁ, Lucie - MAIXNEROVÁ, Dita - VOKURKA, Martin - NEPRAŠOVÁ, Michaela - ZIMA, Tomáš - TESAŘ, Vladimír. Proteomic Approach for Identification of IgA Nephropathy- Related Biomarkers in Urine. Physiological Research. 2017, 66(4), 621-632. ISSN 0862-8408. IF = 1.461 (2016) xsergueeva, Adelina - MIASNIKOVA, Galina - SHAH, Binal N. - SONG, Jihyun - LISINA, Ekaterina - OKHOTIN, Daniel J. - NOURAIE, Mehdi - NEKHAI, Sergei - AMMOSOVA, Tatiana - NIU, Xiao Mei - PRCHAL, Josef - ZHANG, Xu - GORDEUK, Victor R. Prospective study of thrombosis and thrombospondin-1 expression in Chuvash polycythemia. Haematologica. 2017, 102(5), E166-E169. ISSN 0390-6078. DOI: 10.3324/ haematol.2016.158170 IF = 7.702 (2016) xsochor, MArek - BAŠOVÁ, Petra - PEŠTA, Michal - BARTOŠ, Jiří - STOPKA, Tomáš. Oncogenic micrornas to predict relapse in early breast cancer patients. In: Journal of Clinical Oncology. 2017. 35, s. e23021-e23021. ISSN 0732-183X. IF = 24.008 (2016) xstocker, Martin - VAN HERK, Wendy - EL HELOU, Salhab - DUTTA, Sourabh - FONTANA, Matteo S. - SCHUERMAN, Frank A. B. A. - VAN DEN TOOREN-DE GROOT, Rita K. - WIERINGA, Jantien W. - JANOTA, Jan - VAN DER MEER- KAPPELLE, Laura H. - MOONEN, Rob - SIE, Sintha D. - DE VRIES, Esther - DONKER, Albertine E. - ZIMMERMAN, Urs - SCHLAPBACH, Luregn J. - DE MOL, Amerik C. - HOFFMAN-HARINGSMA, Angelique - ROY, Madan - TOMASKE, Maren - KORNELISSE, Rene F. - VAN GIJSEL, Juliette - VISSER, Eline G. - WILLEMSEN, Sten P. - VAN ROSSUM, Annemarie M. C. Procalcitonin-guided decision making for duration of antibiotic therapy in neonates with suspected early-onset sepsis: a multicentre, randomised controlled trial (NeoPIns). The Lancet. 2017, 390(10097), 871-881. ISSN 0140-6736. DOI: 10.1016/S0140-6736(17)31444-7 IF = 47.831 (2016) x TASHI, Tsewang - READING, N. Scott - WUREN, Tanna - ZHANG, Xu - MOORE, Lorna G. - HU, Hao - TANG, Feng - SHESTAKOVA, Anna - LORENZO, Felipe - BURJANIVOVA, Tatiana - KOUL, Parvaiz - GUCHHAIT, Prasenjit - WITTWER, Carl T. - JULIAN, Colleen G. - SHAH, Binal - HUFF, Chad D. - GORDEUK, Victor R. - PRCHAL, Josef - GE, RiLi. Gain-of-function EGLN1 prolyl hydroxylase (PHD2 D4E:C127S) in combination with EPAS1 (HIF-2 alpha) polymorphism lowers hemoglobin concentration in Tibetan highlanders. Journal of Molecular Medicine. 2017, 95(6), 665-670. ISSN 0946-2716. DOI: 10.1007/s00109-017-1519-3 IF = 4.686 (2016) 22

xvargová, Karina - PEŠTA, Michal - OBRTLÍKOVÁ, Petra - DUSÍLKOVÁ, Nina Borisovna - MINAŘÍK, Ľubomír - VARGOVÁ, Jarmila - BERKOVÁ, Adéla - ZEMANOVÁ, Zuzana - MICHALOVÁ, Kyra - ŠPAČEK, Martin - TRNĚNÝ, Marek - STOPKA, Tomáš. MiR-155/miR-150 network regulates progression through the disease phases of chronic lymphocytic leukemia. Blood Cancer Journal. 2017, 7(July), nestránkováno. ISSN 2044-5385. DOI: 10.1038/bcj.2017.63 IF = 6.126 (2016) xvyoral, Daniel - PETRÁK, Jiří. Therapeutic potential of hepcidin - the master regulator of iron metabolism. Pharmacological Research. 2017, 115(January), 242-254. ISSN 1043-6618. DOI: 10.1016/j.phrs.2016.11.010 IF = 4.480 (2016) NON IF xburianová, Iva - MALÝ, Jan - NAVRÁTILOVÁ, Martina - TICHÁ, Eva - VÍTKOVÁ, Veronika - KUDLÁČKOVÁ, J. - ZLATOHLÁVKOVÁ, Blanka - VOKURKOVÁ, Eliška - BORÁKOVÁ, K. - BROŽOVÁ, T. - PÁNEK, M. - PÁNKOVÁ, J. - KANTOR, L. - VRÁNOVÁ, I. - BRONSKÝ, Jiří. Změny obsahu bílkoviny v mateřském mléce po předčasném porodu. Česko-slovenská pediatrie. 2017, 72(8), 472-477. ISSN 0069-2328. xkofránek, Jiří - TRIBULA, Martin - PRIVITZER, Pavol. Model cirkulace jako výuková pomůcka. In: Medsoft 2017: Sborník příspěvků. Praha: Creative Connections, 2017. s. 117-128. ISBN 978-80-86742-47-2. ISSN 1803-8115 xkofránek, Jiří - FELIX, Ondřej - POLÁK, Jiří - BOREJ, Jiří. Napojení zdravotnických systémů na základní registry veřejné správy: ochrana a kontrolované sdílení osobních dat. In: Medsoft 2017: Sborník příspěvků. Praha: Creative Connections, 2017. s. 104-116. ISBN 978-80-86742-47-2. ISSN 1803-8115 xkofránek, Jiří. Bilanční pojetí acidobazické rovnováhy. In: Medsoft 2017: Sborník příspěvků. Praha: Creative Connections, 2017. s. 57-103. ISBN 978-80- 86742-47-2. ISSN 1803-8115 xkučerová, Zdenka. Úloha proteolýzy v lidském těle. Klinická biochemie a metabolismus. 2017, 25(4), 182-185. ISSN 1210-7921. x MARŠÁLEK, Petr - HAJNÝ, Marek - VOKURKA, Martin. Pathological Physiology of the Visual Pathway. Homonymous Visual Field Defects. 1. vyd. Nizozemsko: Springer, 2017, s. 17-29. ISBN 978-3-319-52282-1. výroční zpráva 2017 23

Ústav patologické fyziologie 1. LF UK 9Pracovníci ústavu k 31. 12. 2017 Profesoři: MUDr. Pavel Maruna, CSc. MUDr. RNDr. Petr Maršálek, Ph.D. MUDr. Emanuel Nečas, DrSc. MUDr. Tomáš Stopka, Ph.D. (BIOCEV) Emeritní profesor: Prof. MUDr. František Kornalík, DrSc. Docenti: MUDr. Jan Janota, Ph.D. MUDr. Pavel Klener, Ph.D. MUDr. Jiří Kofránek, CSc. MUDr. Karel Šulc, CSc. MUDr. Martin Vokurka, CSc. MUDr. Daniel Vyoral, CSc. MUDr. Jan Živný, Ph.D. Odborní asistenti a asistenti (vč. PGS): RNDr. Pavel Burda, Ph.D. RNDr. Nikola Čuřík, Ph.D. MUDr. Nina Dusílková (PGS) MUDr. Lenka Daumová (PGS) RNDr. Jana Frýdlová, Ph.D. MUDr. Iuliia Gurieva (PGS) MUDr. Marek Hajný (PGS) MUDr. Zuzana Humlová, Ph.D. MUDr. Jana Karolová (PGS) MUDr. Magdalena Klánová (PGS) MUDr. Hana Krejčí, Ph.D. Ing. Jan Krijt, Ph.D. MUDr. Jan Molinský, Ph.D. MUDr. Kamila Polgárová (PGS) Mgr. Vít Pospíšil, Ph.D. MUDr. Pavol Privitzer RNDr. Petr Přikryl, Ph.D. MUDr. Otakar Raška, Ph.D. MUDr. Kvido Smitka, Ph.D. 24

MUDr. Diana Tušková (PGS) RNDr. Karina Vargová, Ph.D. MUDr. Petra Vočková (PGS) Vědečtí pracovníci: RNDr. Zdeňka Jirásková Pavle Krsmanovič, MSc., Ph.D. Ing. Zdenka Kučerová, CSc. Ing. Eva Pokorná, CSc. prof. MUDr. Josef T. Prchal, DrSc. Ing. Dana Průková, Ph.D. Postgraduální studenti ve vědeckých pozicích: Ing. Tereza Březinová Ing. Tomáš Heizer Chia-Ling Chen, MSc. Mgr. Kateřina Faltusová Ing. Martin Molík Mgr. Petr Páral Mgr. Nicol Renešová Ing. Filipp Savvulidi Ing. Jan Šilar Ing. Martin Tribula Laboratorní pracovníci: Bc. Kamila Chramostová Alena Loužecká Sekretářka a dokumentátorka: Bc. Klára Jirásková Organizační pracovnice výuková asistentka: Radmila Korhoňová Správce sítě: Ing. Filip Ježek Oddělení biokybernetiky a počítačové podpory výuky Vedoucí: doc. MUDr. Jiří Kofránek, CSc. Vědečtí pracovníci: Mgr. Marek Mateják, Ph.D. výroční zpráva 2017 25

Interior photo JK1991 / istockphoto.com (p. 4, 14, 18, 19), nicolas_ / istockphoto.com (p. 6, 8, 9, 12), Pixtural / istockphoto.com (p. 10), gerenme / istockphoto.com (p. 11), anyaivanova / istockphoto.com (p. 17, 24, 25), jakkaje808 / istockphoto.com (p. 20, 23) Grafická úprava a sazba design studio maxdorf 2018

výroční zpráva 2017 Ústav patologické fyziologie 1. LF UK