Ministr 030 Odbor bezpečnostní 040 Odbor interního auditu a kontroly 070 Sekce vnějších vztahů 100 Sekce legislativně právní 300 Sekce dopravní 400 Sekce náměstka člena vlády neobsazeno 500 Sekce 1. náměstka 600 Sekce státního 800 Sekce náměstka člena vlády 077 Kabinet člena vlády 073 vládní a parlamentní agendy 120 Odbor pozemních komunikací 110 Odbor silniční dopravy 410 Odbor financí a ekonomiky 010 Odbor personální 072 Odbor komunikace 150 Odbor provozu silničních vozidel 130 Odbor dražní a vodní dopravy 430 Odbor fondů EU 060 Kancelář státního 170 BESIP 330 Odbor ICT. 160 Odbor agend řidičů 520 Odbor strategie 420 Odbor vnitřní správy 530 Odbor zahraničních vztahů a EU 510 Odbor legislativy 190 Odbor veřejné dopravy 710 Odbor ITS, kosmických aktivit a VaVal 810 Odbor právní 220 Odbor civilního letectví 910 Odbor infrastruktury a územního plánu 920 odvolacích řízení k liniovým stavbám
Ministr 030 Odbor bezpečnostní 040 Odbor interního auditu a kontroly 077 Kabinet člena vlády 031 krizového řízení 041 kontroly 033 bezpečnostní 042 interního auditu
070 Sekce vnějších vztahů 073 vládní a parlamentní agendy 072 Odbor komunikace 170 BESIP 530 Odbor zahraničních vztahů a EU 074 tiskové 531 koordinace záležitostí EU 075 komunikace s veřejností 533 zahraničních vztahů
100 Sekce legislativně právní 120 Odbor pozemních komunikací 150 Odbor provozu silničních vozidel 330 Odbor ICT 510 Odbor legislativy 810 Odbor právní 121 telematiky a zpoplatnění silniční sítě 151 registrace vozidel 331 provozu ICT 511 dopravní a vnější legislativy 812 právní pomoci 122 silničního správního úřadu 152 schvalování vozidel 332 projektového řízení 512 dopravní legislativy 813 podpory veřejných zakázek 153 správy agend registrů 513 rozkladové komise 814 náhrad škod 154 kontroly vozidel v provozu 514 agend EU
300 Sekce dopravní 110 Odbor silniční dopravy 130 Odbor dražní a vodní dopravy 160 Odbor agend řidičů 190 Odbor veřejné dopravy 220 Odbor civilního letectví 111 nákladní dopravy a státního dozoru 131 koncepcí a mezinárodní spolupráce na železnici 161 informačních systémů a řidičských oprávnění 191 státní správy 221 letecké dopravy 112 mezinárodní osobní dopravy 132 právních předpisů a státní správy ve věcech drah 162 správního řízení v silničním provozu 192 koncepce rozvoje 222 Infrastruktury letišť 113 správního řízení 133 rozvoje železniční a kombinované dopravy 163 kvalifikací řidičů státního odborného dozoru a koncepcí 224 leteckého provozu techniky a rozvoje 134 vnitrozemské plavby 135 námořní plavby
500 Sekce 1. náměstka 410 Odbor financí a ekonomiky 430 Odbor fondů EU 520 Odbor strategie 710 Odbor ITS, kosmických aktivit a VaVal 910 Odbor infrastruktury a územního plánu 920 odvolacích řízení k liniovým stavbám 412 ekonomiky a financování hospodářské sféry 431 metodik, koordinace a evaluace programu 521 dopravní politiky a čisté mobility 711 kosmických technologií a aplikací 911 infrastruktury pozemních komunikací a speciálního stavebního úřadu 413 ekonomiky a financování rozpočtové a příspěvkové sféry 432 přípravy projektů 522 dopravních analýz 712 ITS a výzkumu a vývoje. 914 územního plánu 414 účetnictví 433 plateb a monitoringu projetků 915 infrastruktury železnic a plavby 415 nakládání s majetkem státu a tarifů 434 kontrol a nesrovnalostí 416 vnitřního rozpočtu a zvláštního tarifu 435 technické pomoci a podpůrných činností operačních programů
600 Sekce státního 010 Odbor personální 060 Kancelář státního 420 Odbor vnitřní správy 011 personální práce a vzdělávání 421 správy majetku 012 systemizace a personálního marketingu 422 spisové a archivní služby 013 Dětská skupina Mašinka 423 správy budovy 424 autodopravy