PŘÍRUČKA K PRÁCI S DATABÁZÍ DESCRIPTIONS OF FUNGI AND BACTERIA Tatiana Oldřichová Srpen 2007 Příručka byla vytvořena v rámci projektu 1N04151 Informační zdroje pro zemědělský a potravinářský výzkum podporovaného Ministerstvem školství, mládeže a tělovýchovy
Descriptions of Fungi and Bacteria Popis databáze Descriptions of Fungi and Bacteria je databází popisů hlavních patogenních bakterií a mikroskopických hub. Je určena především pro patology a veterináře a lékaře mykology. Poskytuje integrovanou informaci umožňující identifikaci či potvrzení identifikace patologicky významných druhů spolu s údaji o míře patologie či ekonomickém významu. Popisy produkuje CABI Bioscience a každý popis je psán odborníkem na daný druh. Součástí každého záznamu je fotografická ilustrace a charakteristika druhu, hostitelé, způsob přenosu, vyvolané onemocnění a jeho příznaky, zeměpisné rozšíření a současné metody léčby. Součástí db je archiv vytvářený od roku 1964. Databáze se čtvrtletně rozrůstá o 10 záznamů, tj. 40 ročně. V současnosti obsahuje ca 1700 záznamů. Databáze Descriptions of Fungi and Bacteria je jednou z pěti databází z kolekce CAB Abstracts Plus, které jsou hyperlinky propojeny s databází CAB Abstracts. S db Descriptions of Fungi and Bacteria lze pracovat ve vyhledávacím prostředí CAB Direct nebo prostřednictvím db CAB Abstracts a vyhledávacího prostředí WebSpirs. Plné texty jsou k dispozici ve formátu PDF. Přístup do databáze Přístup do db Descriptions of Fungi and Bacteria je přímo z domovské stránky http://www.cababstractsplus.org/dfb/index.asp, nebo ze stránky CAB Abstracts Plus http://www.cababstractsplus.org/, anebo prostřednictvím db CAB Abstracts z URL http://www.infozdroje.cz 2
Domovská stránka Descriptions of Fungi and Bacteria Návody k vyhledávání K návodům na jednoduché a pokročilé vyhledávání v systému CAB Direct se uživatel dostane po kliknutí na Database Guide z menu na pravé straně. Listování K popisům hub a bakterií se lze dostat v režimu listování. Uživatel klikne na záložku Descriptions v horní liště, v menu na pravé straně si vybere prohlížení dle data Browse by date a z rozbaleného menu potom zvolí požadovaný rok. V závorce za rokem je uvedený počet záznamů, o které se ten který rok databáze rozrostla, a to od roku 1964. Na obrazovce se objeví přehled záznamů, z něhož po kliknutí na tlačítko PDF (v závorce uvedena velikost souboru), které je pod každým záznamem, se uživatel dostane k plnému textu popisu ve formátu PDF. Po kliknutí na titul v záznamu se uživateli zobrazí záznam s abstraktem, z něhož je rovněž link na plný text. 3
4
Po kliknutí na titul vybraného článku se zobrazí záznam s abstraktem, z něhož je rovněž link na plný text ve formátu PDF, popřípadě se podívat na náhled popisu v PDF či si vybrat formát vhodný k tisku citace s anotací. 5
Vyhledávání Po kliknutí na záložku Abstracts database v horní liště nebo na Search database v menu na pravé straně se uživateli nabídne obrazovka, kde může volit mezi funkcí browse, která slouží k listování v rejstřících a následnému výběru vhodných termínů, a režimů vyhledávání Quick search pro jednoduché vyhledávání (nastaven standardně), Advanced search pro vyhledávání ve více polích s nápovědou a Expert search pro pokročilé vyhledávání zadáním kombinace klíčových slov pomocí logických operátorů OR, AND a NOT. Při jednoduchém vyhledávání zapíšeme dotaz v podobě slova či fráze nebo kombinaci termínů do vyhledávacího pole. Vyhledávání je možné omezit na prohledání textu volbou Free text search nebo autora Author search a zadáním časového rozmezí vydání publikace Publication year. Nastavené limity se zruší kliknutím na tlačítko Clear limits. K selekci nejnovějších záznamů od poslední návštěvy databáze slouží uživateli políčko Latest records since, do něhož napíše dotyčné datum ve formátu RRRRMMDD. Pod ním je informace o datu poslední aktualizace db. 6
Při pokročilém vyhledávání je možné pomocí logických operátorů kombinovat celkem až čtyři termíny, které se mohou vyskytovat buď kdekoli v dokumentu nebo v určitém poli. Jednotlivá pole jsou obsažena v rozbalovacím menu. Vyhledávání je možné omezit nastavením roku zveřejnění, typem publikace a jazykem dokumentu, které je možné zvolit z rozbalovacího menu. Při expertním vyhledávání se do vyhledávacího pole zadá dotaz obsahující několik termínů spojených logickými operátory. Omezení rokem, typem a jazykem publikace se nastavuje stejně jako u pokročilého vyhledávání. 7
Historie vyhledávání Historie vyhledávání slouží k získání přehledu o jednotlivých krocích, které byly provedeny. Kliknutím na selekční termín je možné zobrazit výsledky dotazu, tlačítko Save umožňuje uložit dotaz ve formátu HTML, Delete odstraní dotaz. Zaškrtnutím dotazů v okénku, výběrem logických operátorů z menu a kliknutím na tlačítko Search lze dílčí dotazy kombinovat. V historii vyhledávání se dá zobrazit celkem 30 dotazů. V posledním řádku je aktuální údaj o počtu již provedených dotazů a volné kapacity pro další. Opakované využití uloženého dotazu Dotaz (profil) uložený ve formátu HTML lze funkcí Search History kdykoli znovu použít, a to kliknutím na tlačítko Load from file, výběrem patřičného souboru a zmáčnutím tlačítka Load Query. Tyto operace slouží k ukládání profilů SDI a realizaci průběžných rešerší z přírůstků databáze. 8
Vyhledávání v rejstřících Funkce Browse slouží k listování v rejstřících. Rozbalovací menu nabídne rejstříky autorský, zdrojů, ISSN, kódů CABI a registračních čísel CAS. Po volbě rejstříku se objeví nové okno, v němž lze zápisem hledaného termínu do vyhledávacího políčka a zmáčknutím tlačítka Browse, či z abecedního výběru postupně volit selekční termíny, mazat je a kombinovat operátory OR a AND. Po použití funkce View Record se v novém okně zobrazí záznamy vybrané podle zvolených selekčních prvků. 9
Výsledky dotazu Prohlížení Po zadání dotazu a kliknutí na tlačítko Search se na obrazovce objeví chronologicky sestupně řazené vyhledané záznamy, a to 25 na stránku. Pro snazší orientaci je selekční termín zobrazen červeně. Nad záznamy je uvedena informace o počtu vyhledaných záznamů. Po prokliknutí titulu se zobrazí záznam s anotací a deskriptory, z něhož zmáčknutím tlačítka CAB Full Text se uživatel dostane k plnému textu ve formátu PDF. Tlačítko Next record slouží k posunutí k dalšímu záznamu, tlačítko back to search results vrací zpět k seznamu vyhledaných záznamů. 10
Uchování Výsledky dotazu, tj. všechny vyhledané záznamy nebo jen záznamy vybrané, lze po zvolení rozsahu záznamu z rozbalovacího menu (full record, citation + abstract, citation only), formátu (HTML, tagged text, text) vytisknout, uložit do souboru nebo po zadání e-mailové adresy odeslat. Export záznamů Vyhledávací prostředí CAB Direct umožňuje též ukládat záznamy do referenčních a citačních systémů RefWorks, End Note, ProCite nebo Reference Manager. Tyto systémy umožňují vytvářet bibliografie nebo citace časopiseckých článků a knih. K exportu záznamů slouží tlačítko export. 11
Výběr záznamů k uchování se provádí zaškrnutím vybraných záznamů v okénku na levé straně záznamu, zmáčknutím tlačítka Add se výběr provede. Po použití tlačítka View si uživatel může prohlédnout seznam vybraných záznamů, z něhož po kliknutí na červený křížek lze nepotřebný záznam vyřadit. V posledním řádku je uveden počet vybraných záznamů, kapacita schránky a množství ještě volných míst. Hromadné zaškrtnutí všech vyhledaných záznamů, popřípadě hromadné zrušení tohoto výběru lze provést tlačítky select all a none. 12
Z jednou vybraných záznamů si uživatel opět může zvolit zaškrtnutím, popřípadě vymazáním ty, které si vytiskne, uloží, odešle či exportuje. 13
Vyladění dotazu Kdykoli v průběhu vyhledávání lze provést zúžení dotazu. Na obrazovce se seznamem vyhledaných dokumentů do políčka Refine search v dolní části obrazovky se zapíše další selekční termín, z rozbaleného menu se vybere pole, v němž se má termín vyskytovat, popřípadě se nastaví rok či časový rozsah vydání dokumentu a kliknutím na tlačítko Search se provede výběr ze souboru vyhledaných záznamů podle nově nastavených kriterií. Ukončení práce v databázi Ukončení práce v databázi se provede kliknutím na tlačítko Logout. Ze stránky oznamují ukončení práce se lze vrátit zpět na vyhledávání použitím tlačítka Back to Search Page, popřípadě na domovskou stránku prokliknutím Back to home page. 14