Manuál laboratorních vyšetření Strana č.:/celkem stran: 1/12 Obsah 1. Klinická mikrobiologie informace o vyšetřeních... 1 2. Sérologie informace o vyšetřeních... 10 3. Vyšetření zajišťovaná v externích laboratořích... 12 1. Klinická mikrobiologie informace o vyšetřeních Legenda k tabulkám: odběr adjustace uchovávání transport čas - N čas - P stručný popis získání vzorku popis odběrového materiálu (položka uvedená kurzívou znamená alternativu optimálnímu postupu) výtěrovka sterilní výtěrovka (výtěrový tampón na plastové tyčince) výtěrovka d sterilní výtěrovka na drátě (výtěrový tampón na drátě) výtěrovka -TP sterilní výtěrovka ve zkumavce s transportní půdou výtěrovka d-tp sterilní výtěrovka na drátě ve zkumavce s transportní půdou tampon FLOQ sterilní nylonový tampon v papírovém obalu (pro vyšetření Chlamydia trachomatis a/nebo Neisseria gonorrhoeae z uretry nebo spojivkového vaku místo kartáčku přiloženého k odběrové soupravě OS-chlam/GO/HPV) kontejner P sterilní kontejner z průhledné umělé hmoty se šroubovacím víčkem kontejner O sterilní kontejner z průhledné umělé hmoty s odsávací výměnnou zátkou anaer S jednorázová sterilní injekční stříkačka po vytlačení vzduchu a s nasazenou sterilní záslepkou (stopper) lahvička FA aerobní hemokultivační lahvička (zelená nebo modrá - SA) lahvička FN anerobní hemokultivační lahvička (oranžová nebo fialová - SN) OS-mycoplasma odběrová souprava pro vyšetření urogenitálních mykoplasmat OS-chlam/GO/HPV odběrová souprava pro vyšetření Chlamydia trachomatis a/nebo Neisseria gonorrhoeae a/nebo lidských papillomavirů (HPV) genetickou sondou OS-trichomonas odběrová souprava pro kultivaci Trichomonas vaginalis způsob uchovávání vzorku před transportem (pouze pokud není možný okamžitý transport na příjem KMAS) Č (čas): maximální délka transportu (h - hodiny, m - minuty) T (teplota): pt (pokojová teplota: 15 30 C), cht (chladničková teplota: 2 8 C) podmínky transportu Č (čas): maximální délka transportu (h - hodiny, m - minuty) T (teplota): pt (pokojová teplota: 15-30 C), cht (chladničková teplota: 2 8 C); chb (chlazený přepravní box: teplota 2 20 C) pt/chb - v rámci NNH je vzorek transportován při pt, od externích klientů při chb (chlazené přepravní boxy s monitorováním teploty) nejkratší čas pro sdělení konečného negativního výsledku od dodání do laboratoře (d - dny, h - hodiny, m - minuty) průměrný časový interval pro sdělení pozitivního výsledku od dodání do laboratoře (d - dny, h - hodiny, m - minuty)
Strana č.:/celkem stran: 2/12 Horní cesty dýchací výtěr z krku (patrové výtěru z krku oblouky, tonsily, hltan) /chb Kultivační vyšetření výtěru z krku pro výtěr z krku (patrové výtěrovka surveillance v intenzivní péči oblouky, tonsily, hltan) Cílený kultivační průkaz výtěr z krku (patrové Arcanobacterium haemolyticum z výtěru z krku oblouky, tonsily, hltan) /chb Cílený kultivační průkaz Neisseria výtěr z krku (patrové gonorrhoae z výtěru z krku oblouky, tonsily, hltan) /chb Cílený kultivační průkaz výtěr z krku (patrové výtěrovka Staphylococcus aureus z výtěru z krku Cílený kultivační průkaz Staphylococcus aureus MRSA z výtěru z krku výtěru z nosohltanu výtěru z nosu Kultivační vyšetření výtěru z nosu pro surveillance v intenzivní péči Cílený kultivační průkaz Staphylococcus aureus z výtěru z nosu Cílený kultivační průkaz Staphylococcus aureus MRSA z výtěru z nosu klinického materiálu z paranazálních dutin Dolní cesty dýchací oblouky, tonsily, hltan) výtěr z krku (patrové oblouky, tonsily, hltan) výtěr ze zadní stěny nosohltanu výtěr z nosního vchodu a z nosní dutiny hluboký výtěr z nosu výtěr z nosního vchodu výtěr z nosního vchodu tekutina získaná punkcí nebo odsátím z paranazální dutiny výtěrovka výtěrovka d-tp výtěrovka výtěrovka výtěrovka výtěrovka anaer S /chb /chb /chb /chb /chb 2 d 2-6 d sputum získané kontejner P sputa vykašláním /chb endotracheální aspirát kontejner O
Strana č.:/celkem stran: 3/12 endotracheálního aspirátu bronchiálního aspirátu bronchoalveolární laváže výtěru z tracheostomie Mikroskopický průkaz acidorezistentních baktérií získaný odsátím z intubace / tracheostomie aspirát z bronchů získaný bronchoskopicky BAL výtěr z tracheostomie sekret z dolních cest dýchacích kontejner O kontejner P kontejner O výtěrovka kontejner P kontejner O /chb /chb /chb Č: 3h /chb 2 h 2 h Ucho výtěr ze zevního výtěru ze zevního zvukovodu zvukovodu /chb klinického materiálu ze středního ucha tekutina ze středouší získaná punkcí nebo po paracentéze, zachycená asepticky na tampon výtěrovka d-tp /chb Oko výtěr ze spojivkového výtěru ze spojivkového vaku vaku /chb Průkaz Chlamydia trachomatis ve razantní výtěr ze OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d 1-4 d 1-7 d výtěru ze spojivkového vaku genetickou sondou spojivkového vaku se zachycením buněk epitelu tampon FLOQ / pt /chb výtěr z rohovkového výtěru z rohovkového vředu klinického materiálu z nitroočního prostoru vředu tekutina z nitroočního prostoru získaná punkcí nebo peroperačně anaer S /chb /chb 2 d 2-6 d Zažívací ústrojí Základní kultivační vyšetření stolice výtěr z rekta výtěrovka
Strana č.:/celkem stran: 4/12 Cílený kultivační průkaz Campylobacter spp. ze stolice Cílený kultivační průkaz Escherichia coli O157 ze stolice Cílený kultivační průkaz patogenních vibrií ze stolice Cílený kultivační průkaz Yersinia spp. ze stolice Průkaz toxinu Clostridium difficile ve stolici Kultivační vyšetření stolice pro surveillance v intenzivní péči Základní kultivační vyšetření obsahu žlučových cest /chb výtěr z rekta /chb výtěr z rekta výtěrovka /chb výtěr z rekta /chb výtěr z rekta /chb stolice kontejner P /chb výtěr z rekta výtěrovka obsah žlučových cest anaer S získaný punkcí či aspirací, kontejner P /chb peroperačně, při ERCP, případně z drenáže 3 d 3-5 d 21 d 21-24 d 3-4 h 3-4 h statim statim 2 d 2-6 d Močové ústrojí střední proud moči, kontejner P 1 d 2-4 d moči cévkovaná moč, moč (5ml, min. 1 ml) /chb Průkaz urogenitálních mykoplasmat z moči Základní kultivační vyšetření výtěru z uretry Průkaz urogenitálních mykoplasmat z výtěru z uretry Průkaz Chlamydia trachomatis z výtěru z uretry genetickou sondou Průkaz Neisseria gonorrhoae z výtěru z uretry genetickou sondou Cílený kultivační průkaz Trichomonas vaginalis z výtěru z uretry z permanentního katétru střední proud moči, cévkovaná moč, moč z permanentního katétru kontejner P hluboký výtěr z uretry výtěrovka d-tp hluboký výtěr z uretry OS-mycoplasma Č:48 h T:pt nebo 72h cht hluboký výtěr z uretry s abrazí buněk epitelu OS-chlam/GO/HPV tampon FLOQ Č: 7 d /pt hluboký výtěr z uretry OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d s abrazí buněk epitelu tampon FLOQ / pt hluboký výtěr z uretry OS-trichomonas chb /chb /chb /chb /chb /chb 2 d 2-3 d
Strana č.:/celkem stran: 5/12 Pohlavní ústrojí muže sekretu prostaty výtěr z uretry po masáži prostaty per rectum /chb Průkaz urogenitálních mykoplasmat výtěr z uretry po masáži OS mycoplasma Č:48 h T:pt v sekretu prostaty prostaty per rectum nebo 72h cht /chb Průkaz Chlamydia trachomatis výtěr z uretry po masáži OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d v sekretu prostaty genetickou sondou prostaty per rectum / pt /chb Průkaz Neisseria gonorrhoae v sektretu prostaty genetickou sondou výtěr z uretry po masáži prostaty per rectum OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d / pt /chb ejakulátu ejakulát získaný masturbací kontejner P /chb Průkaz urogenitálních mykoplasmat ejakulát získaný OS mycoplasma Č:48 h T:pt v ejakulátu masturbací nebo 72h cht /chb Průkaz Chlamydia trachomatis ejakulát získaný OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d v ejakulátu genetickou sondou masturbací / pt /chb Průkaz Neisseria gonorrhoae v ejakulátu genetickou sondou ejakulát získaný masturbací OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d / pt /chb Pohlavní ústrojí ženy Mikroskopický obraz poševní poševní sekret zachycený na sterilní výtěrovku a podložní sklo v krabici pro Č: 48 h /chb 1-4 d statim 1-4 d statim válivým pohybem rozetřený na podlož. sklo mikroskopické preparáty výtěr z pochvy výtěru z pochvy Průkaz urogenitálních mykoplasmat ve výtěru z pochvy Cílený kultivační průkaz Trichomonas vaginalis ve výtěru z pochvy výtěru z děložního hrdla Průkaz urogenitálních mykoplasmat ve výtěru z děložního hrdla výtěr z pochvy OS mycoplasma Č:48 h T:pt nebo 72h cht výtěr z pochvy OS trichomonas výtěr z děložního hrdla výtěr z děložního hrdla OS mycoplasma Č:48 h T:pt s abrazí buněk epitelu nebo 72h cht /chb /chb /chb /chb Č: 3h /chb
Strana č.:/celkem stran: 6/12 Průkaz Chlamydia trachomatis výtěr z děložního hrdla OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d ve výtěru z děložního hrdla genetickou sondou s abrazí buněk epitelu / pt /chb Průkaz Neisseria gonorrhoae ve výtěru z děložního hrdla genetickou sondou výtěr z děložního hrdla s abrazí buněk epitelu OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d / pt /chb tekutina z Bartholinské anaer S 2 d 2-6 d sekretu z Bartholinské žlázy tekutiny z adnex Průkaz urogenitálních mykoplasmat z tekutiny z adnex Průkaz Chlamydia trachomatis z tekutiny z adnex genetickou sondou Průkaz Neisseria gonorrhoae z tekutiny z adnex genetickou sondou intauterinního tělíska Kůže žlázy získaná punkcí tekutina z adnex získaná při invazivním výkonu v malé pánvi tekutina z adnex získaná při invazivním výkonu v malé pánvi tekutina z adnex získaná při invazivním výkonu v malé pánvi tekutina z adnex získaná při invazivním výkonu v malé pánvi anaer S OS mycoplasma Č:48 h T:pt nebo Č:72h OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d / pt OS-chlam/GO/HPV Č: 7 d / pt /chb /chb /chb /chb /chb intrauterinní tělísko kontejner P nevhodné /chb 2 d 2-6 d 7 d 7-10 d stěr z kožní léze 2 d 2-6 d klinického materiálu z kožní léze /chb Rány a hluboké defekty klinického materiálu z rány výtěr z rány /chb 2 d 2-6 d klinického materiálu z hlubokého defektu výtěr z hlubokého defektu /chb 2 d 2-6 d
Strana č.:/celkem stran: 7/12 Centrální nervový systém lumbální punkce kontejner P 2-5 d 2-4 d mozkomíšního moku /chb Mikrobiologické vyšetření mozkomíšního moku v kultivačním analyzátoru lumbální punkce lahvička FA lahvička FN 5-7 d 2-10 d Mikrobiologické vyšetření mozkomíšního moku při monitorování zevních drenáží CNS Krev (hemokultura) likvor z drenáže kontejner P Hemokultivační vyšetření (odebírají se vždy nejméně dva odběry hemokultur po 10ml krve, každý odběr 5 ml do aerobní a 5 ml do anaerobní lahvičky) aseptická venepunkce (standardní odběr) odběr z cévního katétru (při podezření na katétrovou infekci) viz LP lahvička FA (5ml krve) lahvička FN (5ml krve) (nebo 37 C) 5-7 d 2-10 d Hnis a obsah patologických dutin punkce abscesu nebo anaer S 2-7 d 2-10 d hnisu nebo obsahu patologické dutiny patologické dutiny (lahvička FA/FN) /chb tkáně z patologické dutiny excize pyogenní membrány, atp. kontejner P nevhodné /chb 2-7 d 2-10 d Primárně sterilní tělesné tekutiny punkce pleurálního anaer S 5 d 2-7 d pleurální tekutiny prostoru (1-5ml) Mikrobiologické vyšetření pleurální punkce pleurálního lahvička FA 5-7 d 2-10 d tekutiny v kultivačním analyzátoru prostoru (1-5 ml) lahvička FN punkce peritoneálního anaer S 5 d 2-7 d peritoneální tekutiny prostoru (1-5ml) Mikrobiologické vyšetření peritoneální punkce peritoneálního lahvička FA 5-7 d 2-10 d
Strana č.:/celkem stran: 8/12 tekutiny v kultivačním analyzátoru prostoru (1-5ml) lahvička FN punkce ascitu (1-5ml) anaer S 5 d 2-7 d ascitu Mikrobiologické vyšetření ascitu punkce ascitu (1-5ml) lahvička FA 5-7 d 2-10 d v kultivačním analyzátoru lahvička FN punkce perikardiálního anaer S 5 d 2-7 d perikardiální tekutiny prostoru (1-5ml) Mikrobiologické vyšetření perikardiální punkce perikardiálního lahvička FA 5-7 d 2-10 d tekutiny v kultivačním analyzátoru prostoru (1-5ml) lahvička FN punkce kloubu (1-5ml) anaer S 5 d 2-7 d kloubní tekutiny /chb Mikrobiologické vyšetření kloubní punkce kloubu (1-5ml) lahvička FA 5-7 d 2-10 d tekutiny v kultivačním analyzátoru lahvička FN punkce Douglasova anaer S 5 d 2-7 d tekutiny z Douglasova prostoru prostoru (1-5ml) Mikrobiologické vyšetření tekutiny punkce Douglasova lahvička FA 5-7 d 2-10 d z Douglasova prostoru v kultivačním analyzátoru prostoru (1-5ml) lahvička FN aspirát peritoneálního anaer S 5 d 2-7d peritoneálního dialyzátu Mikrobiologické vyšetření peritoneálního dialyzátu v kultivačním analyzátoru Tkáně dialyzátu (5ml) aspirát peritoneálního dialyzátu (5ml) lahvička FA lahvička FN 5-7 d 2-10d kontejner P 2-5 d 2-10 d tkáně /chb srdeční chlopně kontejner P 10 d 2-14 d Cizorodý materiál (cévní katétry, elektrody, drény, implantáty) Mikrobiologické vyšetření cévních odstřižení 5cm špičky kontejner P - katétrů vyjmutého katétru
Strana č.:/celkem stran: 9/12 Mikrobiologické vyšetření kardiostimulačních elektrod Mikrobiologické vyšetření elektrod z centrálního nervového sytému Mikrobiologické vyšetření chirurgických drénů Mikrobiologické vyšetření drénů z centrálního nervového systému Mikrobiologické vyšetření likvorových shuntů Mikrobiologické vyšetření umělých chlopenních náhrad Mikrobiologické vyšetření biologických chlopenních náhrad Mikrobiologické vyšetření cévních protéz Mikrobiologické vyšetření čidel pro měření nitrolebního tlaku odstřižení 5cm koncové části elektrody kontejner P - odstřižení 5cm koncové kontejner P - části elektrody odstřižení 5cm koncové kontejner P - části drenu odstřižení 5cm koncové kontejner P - části drenu odstřižení jedné nebo více kontejner P - částí shuntu podle lokalizace infekce operační vyjmutí náhrady kontejner P - operační vyjmutí náhrady kontejner P - odstřižení části protézy kontejner P - vyjmutí intrakraniální kontejner P - části čidla 5 d 5-10 d 5 d 5-10 d 5 d 5-7 d 10 d 2-14 d 10 d 2-14 d 10 d 2-14 d Speciální vyšetření Průkaz antigenu Legionella pneumophila v moči enzymovou imunoanalýzou střední proud moči, cévkovaná moč, moč z permanentního katétru kontejner P /chb 3-5 h statim 3-5 h statim Průkaz antigenu Streptococcus pneumoniae v moči enzymovou imunoanalýzou Průkaz lidských onkogenních papilomavirů genetickou sondou střední proud moči, cévkovaná moč, moč z permanentního katétru abraze buněk děložního hrdla kontejner P OS-chlam/GO/HPV Č: 14 d /chb /chb 3-5 h statim 3-5 h statim 1-28 d 1-28 d
2. Sérologie informace o vyšetřeních Legenda k tabulkám: Strana č.:/celkem stran: 10/12 odběr adjustace uchovávání transport stručný popis získání vzorku popis odběrového materiálu způsob uchovávání vzorku před transportem (pouze pokud není možný okamžitý transport na příjem KMAS) Č (čas): maximální délka transportu (h - hodiny, m - minuty) T (teplota): pt (pokojová teplota: 15-30 C), cht (chladničková teplota: 2 8 C) podmínky transportu Č (čas): maximální délka transportu (h - hodiny, m - minuty) T (teplota): pt (pokojová teplota: 15-30 C), cht (chladničková teplota: 2-8 C); chb (chlazený přepravní box: teplota 5 20 C) pt/chb - v rámci NNH je vzorek transportován při pt, od externích klientů při chb (chlazené přepravní boxy s monitorováním teploty) Vyšetření odběr adjustace uchovávání transport dostupnost Kvantitativní stanovení Antistreptolysinu O [Antistreptolysin O] /chb 2x týdně Kvantitativní stanovení revmatoidního faktoru [Revmatoidní faktor] Kvantitativní stanovení C-reaktivního proteinu [C-reaktivní protein] Průkaz povrchového antigenu HBsAg viru hepatitidy B chemiluminiscenční imunoanalýzou [Hepatitis B - HBsAg] Průkaz protilátek proti povrchovému antigenu (antihbs) viru hepatitidy B chemiluminiscenční imunoanalýzou [Hepatitis B - antihbs protilátky kvantitativně] Průkaz antigenu HIV p24 a protilátek proti viru HIV 1+2 chemiluminiscenční imunoanalýzou [HIV 1+2 protilátky] /chb denně* / chb denně* /chb denně* /chb denně* /chb denně*
Strana č.:/celkem stran: 11/12 Vyšetření odběr adjustace uchovávání transport dostupnost Průkaz protilátek proti Treponema pallidum chemiluminiscenční /chb imunoanalýzou [Lues základní sérologie: Treponema pallidum protilátky] denně* Průkaz anti-kardiolipinových protilátek flokulačním testem - RPR [Lues - základní serologie: VDRL] Průkaz protilátek IgM proti viru hepatitidy A chemiluminiscenční imunoanalýzou [Hepatitis A anti HAV protilátky IgM] Průkaz protilátek IgG proti viru hepatitidy A chemiluminiscenční imunoanalýzou [Hepatitis A anti HAV protilátky IgG] Průkaz protilátek proti viru hepatitidy C chemiluminiscenční imunoanalýzou [Hepatitis C anti HCV protilátky] Průkaz heterofilních protilátek proti EBV- IM test [EBV heterofilní protilátky (IM test)] /chb denně* /chb /chb denně* denně* /chb denně* /chb Vysvětlivky: * sérologická vyšetření se během víkendu a svátků neprovádějí, vzorky krve se uchovávají při chladničkové teplotě denně*
Strana č.:/celkem stran: 12/12 3. Vyšetření zajišťovaná v externích laboratořích Informace o prováděných vyšetřeních a podrobné kontakty na externí laboratoře naleznete na jejich internetových stránkách (viz tabulka): laboratoř zaměření adresa konzultanti (kontakt) kontakty VIDIA Diagnostika Laboratoř parazitologická Zdravotní ústav se sídlem Ústí nad Labem Laboratoř mykologická Zdravotní ústav se sídlem Ústí nad Labem Odd. klinické mikrobiologie FN Bulovka Ústav imunologie a mikrobiologie NRL pro tkáňové helmintózy Oddělení tropické medicíny 1. LF UK Lékařské laboratoře s.r.o. virologie parazitologie mykologie (dermatofyta a vláknité houby) tuberkulosa mykobakteriologie trop. parazitár. infekce vyvolané helminty, trichinelóza, cysticerkóza a alveolární hydatidóza pneumocystóza autovakcíny Poliklinika Černý Most Generála Janouška 902 198 00 Praha 14 Sokolovská 60 186 00 Praha 8 Sokolovská 60 186 00 Praha 8 Budínova 2 180 00 Praha 8 Studničkova 7 128 00 Praha 2 Studničkova 7 128 00 Praha 2 Poznaňská 461 180 00 Praha 8 MUDr. Dana Hrubá tel.: 281 012 033 hruba@vidia-diagnostika.cz RNDr. Věra Tolarová tel.: 268 889 229 vera.tolarova@zuusti.cz RNDr. Zuzana Hůzová tel.: 286 591 542, 224 815 943 zuzana.huzova@zuusti.cz RNDr. Pavlína Lysková tel.: 222 310 578 pavlina.lyskova@zuusti.cz MUDr. Katarina Petrlová tel.: 608 536 618 petrlova.katarina@seznam.cz prof. RNDr. Libuše Kolářová, CSc. tel.: 224 968 589 parazit@vfn.cz RNDr. Eva Nohýnková, Ph.D. enohy@lf1.cuni.cz MUDr. Alena Tomešová tel.: 283 112 114 tomesova@leklab.cz telefony-laboratoř: 281 911 908-10 web: www.vidia-diagnostika.cz telefony-laboratoř: 286 591 542-3 web: www.zuusti.cz telefony-laboratoř: 234118505-6 web: www.zuusti.cz telefony-laboratoř: 266 082 525 web: www.fnb.cz telefony-laboratoř 224 968 589 web: uim.lf1.cuni.cz telefony-laboratoř 224 968 525 web: tropy.lf1.cuni.cz telefony-laboratoř 283 112 114 web: www.leklab.cz